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11 results on '"Périn, Christophe"'

1. Precise editing of a target base in Grapevine genome

Author

HERBERT, Léo, Laucou, Valerie, MEUNIER, Anne-Cécile, LECUNFF, Loic, Lauvergeat, Virginie, Chatelet, Philippe, LIGOUT, Théo, Périn, Christophe, This, Patrice, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Pôle Matériel Végétal, UMT Géno-Vigne, IFV Pôle Rhône-Méditerranée, Ecophysiologie et Génomique Fonctionnelle de la Vigne (UMR EGFV), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB)-Institut des Sciences de la Vigne et du Vin (ISVV)-Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine (Bordeaux Sciences Agro), Université de Bordeaux (UB)-Institut des Sciences de la Vigne et du Vin (ISVV)-Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine (Bordeaux Sciences Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [SDV.SA] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2018

2. An automated image-processing pipeline for high-throughput analysis of root architecture in OpenAlea

Author

Diener, Julien, Nacry, Phillipe, Périn, Christophe, Diévart, Anne, Draye, Xavier, Boudon, Frédéric, Gojon, Alain, Muller, Bertrand, Pradal, Christophe, Godin, Christophe, Modeling plant morphogenesis at different scales, from genes to phenotype (VIRTUAL PLANTS), Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (CRISAM), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Biochimie et Physiologie Moléculaire des Plantes (BPMP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Earth and Life Institute [Louvain-La-Neuve] (ELI), Université Catholique de Louvain = Catholic University of Louvain (UCL), Écophysiologie des Plantes sous Stress environnementaux (LEPSE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Agropolis Fondation contrat OpenAlea, Risto Sievänen and Eero Nikinmaa and Christophe Godin and Anna Lintunen and Pekka Nygren, Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (CRISAM), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Université de Montpellier (UM)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Catholique de Louvain (UCL), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)

Subjects
Image processing, Analysis pipeline, OpenAlea, High-throughput, [INFO.INFO-MO]Computer Science [cs]/Modeling and Simulation, Root architecture
Abstract

ISBN 978-951-651-408-9; International audience; FSPM analysis of root systems requires structural data obtained on large data set. This paper describes a processing pipeline developed to extract automatically the architecture of root system from images databases.

Published
2013

3. In-depth molecular and phenotypic characterization in a rice insertion line library facilitates gene identification through reverse and forward genetics approaches

Author

Lorieux, Mathias, Blein, Mélisande, Lozano, Jaime, Bouniol, Mathieu, Droc, Gaétan, Diévart, Anne, Périn, Christophe, Mieulet, Delphine, Lanau, Nadège, Bès, Martine, Rouvière, Claire, Gay, Céline, Piffanelli, Pietro, Larmande, Pierre, Michel, Corinne, Barnola, Isabelle, Biderre-Petit, Corinne, Sallaud, Christophe, Perez, Pascual, Bourgis, Fabienne, Ghesquière, Alain, Gantet, Pascal, Tohme, Joe, Morel, Jean Benoit, Guiderdoni, Emmanuel, Diversité, adaptation, développement des plantes (UMR DIADE), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Biologie et Génétique des Interactions Plante-Parasite (UMR BGPI), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Développement et amélioration des plantes (UMR DAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie du développement des espèces pérennes cultivées (UMR BEPC), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement (LMGE), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biogemma, Chappes, France, BIOGEMMA, Biogemma Clermont-Ferrand, Laboratoire Génome et développement des plantes (LGDP), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), French plant genomics collaborative programme Genoplante, National Research Agency (ANR) [ANR-GNP-05086G], ANR-05-GPLA-0026,CAGRILL,Characterization of mutants and seed Amplification in the Génoplante Rice Insertion Line Library(2005), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)

Subjects
DNA, Bacterial, Génétique moléculaire, DNA, Plant, Phénotype, Oryza sativa, Descendance, Genes, Plant, F30 - Génétique et amélioration des plantes, reverse genetics, Transformation, Genetic, Expression des gènes, H20 - Maladies des plantes, Gene Library, Plant Diseases, rice, food and beverages, Oryza, Sequence Analysis, DNA, forward genetics, Magnaporthe, Mutagenesis, Insertional, Phenotype, insertion mutagenesis, Collection de matériel génétique, Mutation, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Caractère agronomique, Plasmids
Abstract

International audience; We report here the molecular and phenotypic features of a library of 31,562 insertion lines generated in the model japonica cultivar Nipponbare of rice (Oryza sativa L.), called Oryza Tag Line (OTL). Sixteen thousand eight hundred and fourteen T-DNA and 12,410 Tos17 discrete insertion sites have been characterized in these lines. We estimate that 8686 predicted gene intervals--i.e. one-fourth to one-fifth of the estimated rice nontransposable element gene complement--are interrupted by sequence-indexed T-DNA (6563 genes) and/or Tos17 (2755 genes) inserts. Six hundred and forty-three genes are interrupted by both T-DNA and Tos17 inserts. High quality of the sequence indexation of the T2 seed samples was ascertained by several approaches. Field evaluation under agronomic conditions of 27,832 OTL has revealed that 18.2% exhibit at least one morphophysiological alteration in the T1 progeny plants. Screening 10,000 lines for altered response to inoculation by the fungal pathogen Magnaporthe oryzae allowed to observe 71 lines (0.7%) developing spontaneous lesions simulating disease mutants and 43 lines (0.4%) exhibiting an enhanced disease resistance or susceptibility. We show here that at least 3.5% (four of 114) of these alterations are tagged by the mutagens. The presence of allelic series of sequence-indexed mutations in a gene among OTL that exhibit a convergent phenotype clearly increases the chance of establishing a linkage between alterations and inserts. This convergence approach is illustrated by the identification of the rice ortholog of AtPHO2, the disruption of which causes a lesion-mimic phenotype owing to an over-accumulation of phosphate, in nine lines bearing allelic insertions.

Published
2012

4. Susceptibility to sulfur dusting and inheritance in melon

Author

Perchepied, Laure, Périn, Christophe, Giovinazzo, Nathalie, Besombes, Didier, Dogimont, Catherine, Pitrat, Michel, Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2004

5. Genetic control of fruit quality and maturation traits in melon

Author

Périn, Christophe, Gomez-Jimenez, M.C., Hagen, Lynda, Dogimont, Catherine, Pech, J.C., Latche, Alain, Lelievre, Jean-Marc, Pitrat, Michel, Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UMR INRA / INPT-ENSAT : Biologie Moléculaire et Physiologie de la Maturation des Fruits, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], and ProdInra, Migration

Subjects
[SPI.GPROC] Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, [SDV.IDA] Life Sciences [q-bio]/Food engineering, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2001

6. Recherches sur le melon

Author

Pitrat, Michel, Dogimont, Catherine, Périn, Christophe, Hagen, Lynda, Burget, E., Gomez Jimenez, M.C., Mohamed, E.T.I., Yousif, M.T., Riffaud, C., Rode, J.C., Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and INRA, Centre d'Avignon - Unité de Génétique et d'Amélioration des Fruits et Légumes, Montfavet (FRA)

Subjects
WMV, [SDV]Life Sciences [q-bio], CMV, WMCSV, ZYMV
Abstract

* INRA Documentation, Domaine St Paul, Site Agroparc, 84914 Avignon cedex 9 Diffusion du document : INRA Documentation, Domaine St Paul, Site Agroparc, 84914 Avignon cedex 9; National audience

Published
2001

7. Construction of a reference genetic map of melon

Author

Périn, Christophe, Hagen, Lynda, Dogimont, Catherine, de Conto, Véronique, Lecomte, L., Pitrat, Michel, Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2000

8. Construction d'une carte génétique de référence du melon (Cucumis melo L.) et étude du contrôle génétique du développement et de la maturation du fruit

Author

Périn, Christophe, Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Université Paul Cézanne (Aix Marseille 3)

Subjects
RAPD, [SDV]Life Sciences [q-bio], these
Abstract

* INRA Documentation, Domaine St Paul, Site Agroparc, 84914 Avignon cedex 9 Diffusion du document : INRA Documentation, Domaine St Paul, Site Agroparc, 84914 Avignon cedex 9 Diplôme : Dr. d'Université

Published
2000

9. Genetic mapping of disease resistance genes in melon (Cucumis melo L.)

Author

Dogimont, Catherine, Périn, Christophe, Hagen, Lynda, Bardin, Marc, Pitrat, Michel, Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Unité de Pathologie Végétale (PV)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
1999

10. Contrôle génétique et éco-physiologique de l'élaboration de la qualité chez le melon Cucumis melo L

Author

Périn, Christophe, Gomez, M.C., Lelievre, Jean-Marc, Valentin, M., Vaissière, Bernard, Gary, Christian, Dogimont, Catherine, Causse, Mathilde, Pech, J.C., Pitrat, Michel, Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UMR INRA / INPT-ENSAT : Biologie Moléculaire et Physiologie de la Maturation des Fruits, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Unité mixte de recherche Ecologie des invertébrés (UAPV), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Avignon Université (AU), Unité de bioclimatologie, G. Abagnac, P. Colonna, G. Doussinault, R. Habib, INRA, Paris, and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDE] Environmental Sciences, [SPI.GPROC] Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, [SDE]Environmental Sciences, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, [SDV.IDA] Life Sciences [q-bio]/Food engineering
Abstract

* INRA Centre d'Avignon, Documentation, Domaine St Paul, Site Agroparc, 84914 Avignon cedex 9 Diffusion du document : INRA Centre d'Avignon, Documentation, Domaine St Paul, Site Agroparc, 84914 Avignon cedex 9; National audience

Published
1999

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