Search

Your search keyword '"Matet A"' showing total 28 results
Start Over Author "Matet A" Publisher hal ccsd
28 results on '"Matet A"'

1. Impact of integrating objective structured clinical examination into academic student assessment: Large-scale experience in a French medical school

Author

Matet, Alexandre, Fournel, Ludovic, Gaillard, François, Amar, Laurence, Arlet, Jean-Benoit, Baron, Stéphanie, Bats, Anne-Sophie, Buffel Du Vaure, Celine, Charlier, Caroline, de Lastours, Victoire, Faye, Albert, Jablon, Eve, Kadlub, Natacha, Leguen, Julien, Lebeaux, David, Malmartel, Alexandre, Mirault, Tristan, Planquette, Benjamin, Régent, Alexis, Thebault, Jean-Laurent, Dinh, Alexy Tran, Nuzzo, Alexandre, Turc, Guillaume, Friedlander, Gérard, Ruszniewski, Philippe, Badoual, Cécile, Ranque, Brigitte, Oualha, Mehdi, Courbebaisse, Marie, Institut Curie [Paris], Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université de Paris (UP), Toxicité environnementale, cibles thérapeutiques, signalisation cellulaire (T3S - UMR_S 1124), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), Université de Paris - UFR Médecine Paris Centre [Santé] (UP Médecine Paris Centre), Université de Paris (UP), Biologie des Infections - Biology of Infection, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service des Maladies infectieuses et tropicales [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP)-Université Sorbonne Paris Nord, Hôpital Robert Debré, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Paris-Centre de Recherche Cardiovasculaire (PARCC (UMR_S 970/ U970)), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP), Innovations thérapeutiques en hémostase (IThEM - U1140), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP), Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle (LVTS (UMR_S_1148 / U1148)), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Hôpital Beaujon [AP-HP], Institut de psychiatrie et neurosciences de Paris (IPNP - U1266 Inserm), Institut Necker Enfants-Malades (INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151)), Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Pharmacologie et évaluations thérapeutiques chez l'enfant et la femme enceinte (URP_7323), HAL-SU, Gestionnaire, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Université Paris Cité - UFR Médecine [Santé] (UPCité UFR Médecine), Université Paris Cité (UPCité), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Université Sorbonne Paris Nord, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), École Pratique des Hautes Études (EPHE), UFR Médecine [Santé] - Université Paris Cité (UFR Médecine UPCité), Innovations thérapeutiques en hémostase = Innovative Therapies in Haemostasis (IThEM - U1140), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur [Paris]

Subjects
Medical education, Students, Medical, Patients, Psychometrics, Science, Chi square tests, [SHS.EDU]Humanities and Social Sciences/Education, [SHS.EDU] Humanities and Social Sciences/Education, education, Cardiology, Social Sciences, Research and Analysis Methods, Geographical locations, Education, Mathematical and Statistical Techniques, Sociology, Medicine and Health Sciences, Psychology, Humans, European Union, Computer software, Statistical Methods, Statistical Hypothesis Testing, Schools, Medical, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Education, Medical, Statistics, Biology and Life Sciences, Teachers, Europe, Health Care, Professions, Aptitude Tests, People and Places, Physical Sciences, Medicine, Population Groupings, Clinical Competence, Educational Measurement, France, Medical Humanities, Mathematics, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Research Article
Abstract

PurposeObjective structured clinical examinations (OSCE) evaluate clinical reasoning, communication skills, and interpersonal behavior during medical education. In France, clinical training has long relied on bedside clinical practice in academic hospitals. The need for a simulated teaching environment has recently emerged, due to the increasing number of students admitted to medical schools, and the necessity of objectively evaluating practical skills. This study aimed at investigating the relationships between OSCE grades and current evaluation modalities.MethodsThree-hundred seventy-nine 4th-year students of University-of-Paris Medical School participated to the first large-scale OSCE at this institution, consisting in three OSCE stations (OSCE#1-3). OSCE#1 and #2 focused on cardiovascular clinical skills and competence, whereas OSCE#3 focused on relational skills while providing explanations before planned cholecystectomy. We investigated correlations of OSCE grades with multiple choice (MCQ)-based written examinations and evaluations of clinical skills and behavior (during hospital traineeships); OSCE grade distribution; and the impact of integrating OSCE grades into the current evaluation in terms of student ranking.ResultsThe competence-oriented OSCE#1 and OSCE#2 grades correlated only with MCQ grades (r = 0.19, P0.75). Conversely, the behavior-oriented OSCE#3 grades correlated with traineeship skill and behavior grades (r = 0.19, PConclusionThis large-scale French experience showed that OSCE designed to assess a combination of clinical competence and behavioral skills, increases the discriminatory capacity of current evaluations modalities in French medical schools.

Published
2021

2. Les œdèmes maculaires: Mieux comprendre leurs mécanismes pour mieux les traiter

Author

Behar-Cohen, Francine, Zhao, Min, Gelize, Emmanuelle, Bousquet, Elodie, Daruich, Alejandra, Matet, Alexandre, Delaunay, Kimberley, Torriglia, Alicia, Berdugo-Polak, Marianne, Jaisser, Frédéric, de Kozak, Yvonne, Lassiaz, Patricia, Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université de Paris (UP), Physiologie rénale et tubulopathies = Renal Physiology and tubulopathies [CRC], Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université de Paris (UP)-École pratique des hautes études (EPHE), Service d'ophtalmologie [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

International audience; L’œdème maculaire est une augmentation de volume de la macula, zone centrale de la rétine, responsable de l’acuité visuelle. Des symptômes visuels handicapent la vie de millions de patients atteints d’œdème maculaire secondaire à une maladie chronique et parfois aiguë de la rétine. Les protéines qui neutralisent la voie du facteur de croissance de l’endothélium vasculaire (VEGF) ou les glucocorticoïdes, au prix d’injections intraoculaires répétées pendant des années, limitent les symptômes visuels. Mieux comprendre pourquoi et comment l’œdème se forme et comment les molécules thérapeutiques exercent un effet anti-œdémateux permettra de mieux prévenir la survenue de cette complication rétinienne handicapante et cécitante.

Published
2020

3. Les œdèmes maculaires

Author

Alejandra Daruich, Matet Alexandre, Elodie Bousquet, Min Zhao, Yvonne de Kozak, Alicia Torriglia, Francine Behar-Cohen, Marianne Berdugo-Polak, Emmanuelle Gelize, Frederic Jaisser, Patricia Lassiaz, Kimberley Delaunay, Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université de Paris (UP), Physiologie rénale et tubulopathies = Renal Physiology and tubulopathies [CRC], Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université de Paris (UP)-École pratique des hautes études (EPHE), Service d'ophtalmologie [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)

Subjects
medicine.medical_specialty, Visual acuity, [SDV]Life Sciences [q-bio], Disease, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Ophthalmology, Edema, Medicine, Macular edema, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, Retina, business.industry, Retinal, General Medicine, medicine.disease, 3. Good health, Vascular endothelial growth factor, medicine.anatomical_structure, chemistry, 030221 ophthalmology & optometry, medicine.symptom, business, Complication
Abstract

International audience; L’œdème maculaire est une augmentation de volume de la macula, zone centrale de la rétine, responsable de l’acuité visuelle. Des symptômes visuels handicapent la vie de millions de patients atteints d’œdème maculaire secondaire à une maladie chronique et parfois aiguë de la rétine. Les protéines qui neutralisent la voie du facteur de croissance de l’endothélium vasculaire (VEGF) ou les glucocorticoïdes, au prix d’injections intraoculaires répétées pendant des années, limitent les symptômes visuels. Mieux comprendre pourquoi et comment l’œdème se forme et comment les molécules thérapeutiques exercent un effet anti-œdémateux permettra de mieux prévenir la survenue de cette complication rétinienne handicapante et cécitante.

Published
2020

4. Les œdèmes maculaires

Author

Behar-Cohen, Francine, Zhao, Min, Gelize, Emmanuelle, Bousquet, Elodie, Daruich, Alejandra, Matet, Alexandre, Delaunay, Kimberley, Torriglia, Alicia, Berdugo-Polak, Marianne, Jaisser, Frédéric, de Kozak, Yvonne, Lassiaz, Patricia, Sciences, EDP, Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité), Physiologie rénale et tubulopathies = Renal Physiology and tubulopathies [CRC], Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité)-École pratique des hautes études (EPHE), Service d'ophtalmologie [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

International audience; L’œdème maculaire est une augmentation de volume de la macula, zone centrale de la rétine, responsable de l’acuité visuelle. Des symptômes visuels handicapent la vie de millions de patients atteints d’œdème maculaire secondaire à une maladie chronique et parfois aiguë de la rétine. Les protéines qui neutralisent la voie du facteur de croissance de l’endothélium vasculaire (VEGF) ou les glucocorticoïdes, au prix d’injections intraoculaires répétées pendant des années, limitent les symptômes visuels. Mieux comprendre pourquoi et comment l’œdème se forme et comment les molécules thérapeutiques exercent un effet anti-œdémateux permettra de mieux prévenir la survenue de cette complication rétinienne handicapante et cécitante.

Published
2020

5. Organisation nucléaire et expression génique lors du développement chez le porc

Author

Lahbib Mansais, Yvette, Marti-Marimon, Maria, Vialaneix, Nathalie, Foissac, Sylvain, Bouissou-Matet, Martine, Liaubet, Laurence, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and ANR-09-GENM005, Internet3D (GA division), SCALES (CNRS)

Subjects
[SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], [MATH]Mathematics [math]
Abstract

National audience; L'intégration de l'information génétique dans l’environnement cellulaire et nucléaire est cruciale pour comprendre comment fonctionne le génome et comment les phénotypes sont élaborés. Ces dernières années, toutes les connaissances de séquence et de régulation moléculaire accumulées ont fourni de nombreux indices pour démêler les mécanismes impliqués dans la régulation de l'expression génique. Toutefois ces connaissances sont insuffisantes pour expliquer toutes les différences phénotypiques observées. L’architecture nucléaire, la structure de la chromatine ont aussi été démontrées comme étant impliquées dans la régulation de l'expression des gènes. Notre objectif est d'explorer plus finement les relations entre l'organisation du génome en 3D et l'expression des gènes dans les conditions physiologiques. Dans un premier temps, nous avons utilisé le modèle de l’empreinte génomique et concentré notre analyse sur les gènes IGF2 et DLK1/MEG3 impliqués au cours du développement. Nos approches cellulaires (3D FISH et microscopie confocale) sur des tissus fœtaux porcins suggèrent que des associations inter-chromosomiques ont lieu entre ces gènes dans les cellules de foie et de muscle et, que ces associations entre gènes sont liées à leur statut d’expression. En effet, les allèles exprimés de 3 gènes soumis à empreinte y sont préférentiellement impliqués (Lahbib-Mansais et al, 2016). Convaincus de l’importance de ces contacts entre des régions distantes du génome sur le fonctionnement du génome, nous avons proposé d’approfondir l’étude de ces interactions entre gènes dans le modèle musculaire. Nous avons profité des résultats du projet ANR PORCINET portant sur l'étude de la fin de gestation en lien avec la survie néonatale. Les données transcriptome obtenues sur le muscle de fœtus (90 et 110 jours de gestation) à partir de deux lignées génétiques extrêmes (Large White et Meishan) pour la mortalité à la naissance ont permis de construire des réseaux de gènes différentiellement exprimés et co-régulés (Voillet et al, 2014). En combinant les données de co-localisation nucléaire de gènes et les données d'expression, nous avons développé une approche innovante de réseau de co-expression. Il s'agissait de coupler, au moyen d'un processus itératif, une nouvelle méthode statistique d'inférence graphique avec des données de co-localisation spatiale de gènes (3D DNA FISH) afin de construire un réseau plus pertinent regroupant des gènes co-exprimés et colocalisés. Cette modélisation utilisant l’inférence de graphes autour d’IGF2 illustre le développement musculaire en fin de gestation chez le porc. L’intégration de données d’architecture nucléaire et d’expression génique nous a permis de suggérer des interactions géniques dans l'espace nucléaire, jamais observées auparavant, entre des gènes régulés au cours du développement musculaire comme celles entre IGF2, DLK1 et une myosine embryonnaire MYH3 (Marti-Marimon et al, 2018). Nous avons ensuite évalué la conformation globale du génome dans les cellules musculaires de fœtus Large White à 90 et 110 jours de gestation en utilisant la méthode de capture de conformation de chromatine à haut débit (Hi-C) couplée au séquençage. Cette étude a permis d'identifier des milliers de régions génomiques présentant des différences significatives dans la conformation 3D entre les deux âges gestationnels ; des clusters de régions télomériques de plusieurs chromosomes préférentiellement à 90 jours ou encore des changements de la structure du génome associés de manière significative à des variations d'expression géniques entre le 90ème et le 110ème jour de gestation. L’intégration de ces 3 approches devraient nous permettre de révéler de nouveaux processus biologiques liés à la mise en place de la maturité musculaire fœtale, essentielle pour la survie à la naissance. Voillet V, et al. 2014. BMC Genomics. 15:797. doi: 10.1186/1471-2164-15-797. Lahbib-Mansais Y, et al. 2016. BMC Cell Biol. 17:35. doi: 10.1186/s12860-016-0113-9. Marti-Marimon M, et al. 2018. Sci Rep. 8: 10150. doi: 10.1038/s41598-018-28173-8.

Published
2019

6. Scales with various kinds of good points

Author

Pierre Matet, Laboratoire de Mathématiques Nicolas Oresme (LMNO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), and Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)

Subjects
010101 applied mathematics, [MATH.MATH-LO]Mathematics [math]/Logic [math.LO], 010102 general mathematics, Calculus, 0101 mathematics, 01 natural sciences, Mathematics
Abstract

International audience; We study variants of (more or less) known square‐like principles obtained by replacing equality with covering. We show that these weaker principles are still strong enough to yield scales with many good (or even better) points. Such scales can be used to construct large pseudo‐Kurepa families.

Published
2018

7. The nonstationary ideal on Pκ(λ) for λ singular

Author

Matet, Pierre, Shelah, Saharon, Laboratoire de Mathématiques Nicolas Oresme (LMNO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), and The Hebrew University of Jerusalem (HUJ)

Subjects
Mathematics::Logic, [MATH.MATH-LO]Mathematics [math]/Logic [math.LO], Mathematics::General Topology
Abstract

International audience; We give a new characterization of the nonstationary ideal on (Formula presented.) in the case when (Formula presented.) is a regular uncountable cardinal and (Formula presented.) a singular strong limit cardinal of cofinality at least (Formula presented.).

Published
2017

8. Cofinality of normal ideals on [λ]<κ I

Author

Matet, Pierre, Péan, Cédric, Shelah, Saharon, Laboratoire de Mathématiques Nicolas Oresme (LMNO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), and The Hebrew University of Jerusalem (HUJ)

Subjects
Mathematics::Logic, [MATH.MATH-LO]Mathematics [math]/Logic [math.LO]
Abstract

International audience; An ideal J on \([\lambda ]^{

Published
2016

9. 3D nuclear organization of theCMHcomplex in control and LPS-activated porcine and human macrophages

Author

Mompart, Florence, Robelin, David, Gaillard, Claire, Bouissou-Matet Yerle, Martine, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]

Subjects
pig, [SDV]Life Sciences [q-bio], education, macrophage
Abstract

3D nuclear organization of theCMHcomplex in control and LPS-activated porcine and human macrophages. 22. International Colloquim on Animal Cytogenetics and Genomics (ICACG)

Published
2016

10. 3D nuclear organization of the CMH complex in control and LPS-activated porcine and human macrophages

Author

Mompart, Florence, Robelin, David, Gaillard, Claire, Bouissou-Matet Yerle, Martine, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées

Subjects
pig, human macrophage, [SDV]Life Sciences [q-bio], education, 3d nuclear, respiratory system, genetic
Abstract

3D nuclear organization of the CMH complex in control and LPS-activated porcine and human macrophages. 22. International Colloquim on Animal Cytogenetics and Genomics (ICACG)

Published
2016

11. Fracture and atypical migration of an implantable central venous access device

Author

Pascal Matet, Magali Vernet, Mirela Mery, Romaric Loffroy, Violaine Cherblanc, Stéphanie Palengat, Département de Chirurgie générale, Hôpital Philippe le Bon, Beaune, Hôpital Philippe le Bon, Beaune, Laboratoire Electronique, Informatique et Image ( Le2i ), Université de Bourgogne ( UB ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Department vascular, oncologic ans interventional radiology (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Département de radiologie, Hôpital Philippe le Bon, Beaune, Laboratoire Electronique, Informatique et Image [UMR6306] (Le2i), Université de Bourgogne (UB)-École Nationale Supérieure d'Arts et Métiers (ENSAM), Arts et Métiers Sciences et Technologies, HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-Arts et Métiers Sciences et Technologies, HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Arts et Métiers (ENSAM), and HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement

Subjects
medicine.medical_specialty, Central venous access, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, Central catheter, Distal embolization, Abdominal ct, education, Case Report, [SDV.IB.MN]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Nuclear medicine, [SDV.MHEP.CHI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Surgery, migration, [ SDV.IB.MN ] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Nuclear medicine, surgery, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, 030225 pediatrics, medicine, Radiology, Nuclear Medicine and imaging, [ SDV.IB ] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, [ SDV.MHEP.CHI ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Surgery, Vein, [ SDV.IB.IMA ] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, pinch-off syndrome (POS), business.industry, 3. Good health, Surgery, Venous access, Catheter, medicine.anatomical_structure, 030220 oncology & carcinogenesis, [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, Radiology, business, Complication, Subclavian vein
Abstract

International audience; Distal embolization of a fractured indwelling central catheter is a rare complication. The pinch-off syndrome (POS) should be known, prevented and early detected. We present a case in which further radiological exams were required to find the fragmented catheter with an atypical migration, requiring local surgery for removing. After chest and abdominal CT scan, neck X-ray, and heart echography, the catheter was found on the lower limbs X-ray on the internal side of right knee corresponding to a location of saphenous vein. Implanted catheters should be removed after completion of treatment and the integrity of the system should be monitored. To avoid POS, a catheter must be inserted into the subclavian vein as laterally as possible.

Published
2016

12. Fragments of strong compactness, families of partitions and ideal extensions

Author

Laura Fontanella, Pierre Matet, Einstein Institute of Mathematics, The Hebrew University of Jerusalem (HUJ), Laboratoire de Mathématiques Nicolas Oresme (LMNO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), and Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)

Subjects
Discrete mathematics, Mathematics::Logic, [MATH.MATH-LO]Mathematics [math]/Logic [math.LO], Algebra and Number Theory, Ideal (set theory), Compact space, 010102 general mathematics, 0101 mathematics, 16. Peace & justice, 01 natural sciences, Mathematics
Abstract

International audience; We investigate some natural combinatorial principles related to the notion of mild ineffability, and use them to obtain new characterizations of mild ineffable and weakly compact cardinals. We also show that one of these principles may be satisfied by a successor cardinal. Finally, we establish a version for Pκ(λ) of the canonical Ramsey theorem for pairs.

Published
2016

13. Somatic cell hybrids as a model to study genomic imprinting and genome imprinting of pig chromosomes in the development of pre-clinical large animal models

Author

Bouissou-Matet Yerle, Martine, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées

Subjects
genomic, pig, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, [SDV]Life Sciences [q-bio], somatic cell hybrid, [INFO]Computer Science [cs], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2015

14. Guessing more sets

Author

Pierre Matet, Laboratoire de Mathématiques Nicolas Oresme (LMNO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), and Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)

Subjects
Successor cardinal, Discrete mathematics, Logic, 16. Peace & justice, Cofinality, Diamond principle, [MATH.MATH-LO]Mathematics [math]/Logic [math.LO], Almost disjoint sets, Stationary set, Uncountable set, Two-cardinaldiamond, Limit cardinal, Ideal (ring theory), SSH, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Mathematics
Abstract

Let κ be a regular uncountable cardinal, and λ a cardinal greater than κ with cofinality less than κ. We consider a strengthening of the diamond principle ⋄ κ , λ that asserts that any subset of some fixed collection of λ + elements of P κ ( λ ) can be guessed on a stationary set. This new principle, denoted by ⋄ κ , λ [ λ + ] , implies that the nonstationary ideal on P κ ( λ ) is not 2 ( λ + ) -saturated. We establish that if λ is large enough and there are no inner models with fairly large cardinals, then ⋄ κ , λ [ λ + ] holds. More precisely, it is shown that if 2 ( κ ℵ 0 ) ≤ λ + and both Shelah's Strong Hypothesis SSH and the Almost Disjoint Sets principle ADS λ hold, then ⋄ κ , λ [ λ + ] holds. The paper also contains ZFC results. Suppose for example that 2 κ ≤ λ + , there is a strong limit cardinal τ with cf ( λ ) τ ≤ κ , and either κ is a successor cardinal greater than ρ + 3 , where ρ is the largest limit cardinal less than κ, or κ is a limit cardinal and σ κ λ ( σ κ ) + κ for some cardinal σ ≥ 2 . Then ⋄ κ , λ [ λ + ] holds.

Published
2015

15. Systemic adalimumab induces peripheral corneal infiltrates: a case report

Author

Alexandre Matet, Alejandra Daruich, Jean-Louis Bourges, Jacques Cosnes, Talal Beydoun, Department of Ophthalmology, Jules Gonin Hospital, Service d'ophtalmologie [Hôtel-Dieu - Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôtel-Dieu, Service de Gastroentérologie et nutrition [CHU Saint-Antoine], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)

Subjects
Pathology, Administration, Topical, Anti-Inflammatory Agents, Case Report, Inflammatory bowel disease, Dexamethasone, Corneal Diseases, Etanercept, Cornea, 0302 clinical medicine, Crohn Disease, Recurrence, skin and connective tissue diseases, Crohn's disease, [PHYS.PHYS.PHYS-OPTICS]Physics [physics]/Physics [physics]/Optics [physics.optics], Drug Substitution, General Medicine, 3. Good health, Rheumatoid arthritis, Female, 030211 gastroenterology & hepatology, medicine.symptom, medicine.drug, Adult, musculoskeletal diseases, medicine.medical_specialty, Topical Corticosteroid Therapy, Injections, Subcutaneous, Peripheral infiltrate, 03 medical and health sciences, Tumor necrosis factor-alpha inhibitor, Pregnadienes, medicine, Adalimumab, Humans, Glucocorticoids, Tumor Necrosis Factor-alpha, business.industry, Adverse effects, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, medicine.disease, Dermatology, Infliximab, Ophthalmology, 030221 ophthalmology & optometry, Ophthalmic Solutions, Red eye, business
Abstract

Background Tumor necrosis factor-alpha inhibitors are widely used agents in the treatment of immune disorders such as rheumatoid arthritis and inflammatory bowel disease. Despite their anti-inflammatory action, paradoxical drug-induced inflammatory events have been occasionally associated with the use of infliximab, etanercept, and in a lesser extent adalimumab. However, eye involvement is uncommon and anterior uveitis is the only reported ocular adverse manifestation. It can be induced by etanercept, but has also been described during adalimumab therapy. We present here the first report of recurrent peripheral corneal infiltrates following subcutaneous injections of adalimumab. Case presentation A 34 year-old Caucasian woman with Crohn’s disease presented to the emergency department with bilateral red eyes and discomfort 36 hours after she received her bimonthly dose of subcutaneous adalimumab. Examination revealed bilateral peripheral corneal infiltrates with characteristic features of immune infiltrates. Symptoms and infiltrates regressed after topical corticosteroid therapy, but recurred after each adalimumab injection over the following weeks. Conclusion Paradoxical immune reactions associated with tumor necrosis factor-alpha inhibitors may result either from hypersensitivity mechanisms, or from immune-complex deposition via anti-adalimumab antibodies. Both mechanisms could explain this newly described manifestation. Care should be taken to search for corneal infiltrates in the event of red eye symptoms during adalimumab therapy since they respond to topical corticosteroids and do not necessarily prompt the discontinuation of the immunosuppressive therapy. Electronic supplementary material The online version of this article (doi:10.1186/s12886-015-0047-6) contains supplementary material, which is available to authorized users.

Published
2015

16. Ideals on Pκ(λ) associated with games of uncountable length

Author

Matet, Pierre, Laboratoire de Mathématiques Nicolas Oresme (LMNO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), and Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)

Subjects
[MATH.MATH-LO]Mathematics [math]/Logic [math.LO], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2015

17. Two-cardinal diamond and games of uncountable length

Author

Pierre Matet, Laboratoire de Mathématiques Nicolas Oresme (LMNO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), and Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)

Subjects
Logic, 010102 general mathematics, ♢κ, 0102 computer and information sciences, Pκ(λ), Lambda, 01 natural sciences, Diamond principle, Combinatorics, Mathematics::Logic, Philosophy, [MATH.MATH-LO]Mathematics [math]/Logic [math.LO], 010201 computation theory & mathematics, Inner model, Calculus, Uncountable set, Ideal (ring theory), 0101 mathematics, Algebra over a field, λ, Games, Mathematics
Abstract

Let $${\mu, \kappa}$$ μ , ? and $${\lambda}$$ ? be three uncountable cardinals such that $${\mu = {\rm cf} (\mu) < \kappa = {\rm cf} (\kappa) < \lambda.}$$ μ = cf ( μ ) < ? = cf ( ? ) < ? . The game ideal $${NG_{\kappa,\lambda}^\mu}$$ N G ? , ? μ is a normal ideal on $${P_\kappa (\lambda)}$$ P ? ( ? ) defined using games of length $${\mu}$$ μ . We show that if $${2^{(\kappa^{\mu})} \leq \lambda}$$ 2 ( ? μ ) ≤ ? and there are no (fairly) large cardinals in an inner model, then the diamond principle $${\diamondsuit_{\kappa,\lambda} [{NG}_{\kappa,\lambda}^\mu]}$$ ? ? , ? [ N G ? , ? μ ] holds. We also show that if $${\diamondsuit_\kappa (S)}$$ ? ? ( S ) holds, where S is a stationary subset of $${\kappa}$$ ? , then $${\diamondsuit_{\kappa,\lambda} (\{ a\in P_\kappa (\lambda) : a \cap \kappa \in S\})}$$ ? ? , ? ( { a ? P ? ( ? ) : a ? ? ? S } ) holds.

Published
2015

18. Two-cardinal versions of weak compactness: Partitions of triples

Author

Toshimichi Usuba, Pierre Matet, Laboratoire de Mathématiques Nicolas Oresme (LMNO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), and Kobe University

Subjects
Discrete mathematics, weakly compact cardinal, Weakly compact cardinal, partition relation, General Mathematics, 010102 general mathematics, 0102 computer and information sciences, Pκ(λ), 16. Peace & justice, 01 natural sciences, 03E02, [MATH.MATH-LO]Mathematics [math]/Logic [math.LO], Compact space, 03E55, 010201 computation theory & mathematics, TheoryofComputation_ANALYSISOFALGORITHMSANDPROBLEMCOMPLEXITY, 0101 mathematics, $P_\kappa(\lambda)$, Mathematics
Abstract

Let κ be a regular uncountable cardinal, and λ be a cardinal greater than κ. Our main result asserts that if (λ< κ)< κ) = λ< κ, then (pκ, λ(NInκ, λ< κ))+ $\longrightarrow$ ((NSκ, λ[λ]< κ)+, NSκ, λs+)3 and (pκ, λ(NAInκ, λ< κ))+ $\longrightarrow$ (NSκ, λs+)3, where NSκ, λs (respectively, NSκ, λ[λ]< κ) denotes the smallest seminormal (respectively, strongly normal) ideal on Pκ (λ), NInκ, λ< κ (respectively, NAInκ, λ< κ) denotes the ideal of non-ineffable (respectively, non-almost ineffable) subsets of Pκ(λ< κ), and pκ, λ: Pκ(λ< κ) → Pκ (λ) is defined by pκ, λ(x) = x ∩ λ.

Published
2015

19. 3D nuclear organization of the CMH complex in control and LPS-activated porcine macrophages

Author

Mompart, Florence, Robelin, David, Gaillard, Claire, Bouissou-Matet Yerle, Martine, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées

Subjects
pig, [SDV]Life Sciences [q-bio], 3d nuclear
Abstract

absent

Published
2014

20. Reprogrammation and fertility in presence of chromosomal abnormalities in the pig

Author

Congras, Annabelle, Delcros, Chantal, Afanasieff, M., Vignoles, Florence, Bouchez, Olivier, Bouissou-Matet Yerle, Martine, Laboratoire de Génétique Cellulaire (LGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut cellule souche et cerveau (U846 Inserm - UCBL1), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Université de Lyon

Subjects
fertility, pig, [SDV]Life Sciences [q-bio], genetic, dna, chromosomal, epigenetic, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2012

21. 3D organization of telomeres in control and LPS-activated neutrophils

Author

Mompart, Florence, Robelin, David, Delcros, Chantal, Bouissou-Matet Yerle, Martine, Laboratoire de Génétique Cellulaire (LGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], telomeres, neutrophils, 3D FISH, LPS-activation, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2012

22. 3D organization of telomeres in control and LPS-activated porcine neutrophils

Author

Mompart, Florence, Robelin, David, Delcros, Chantal, Bouissou-Matet Yerle, Martine, Laboratoire de Génétique Cellulaire (LGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2012

23. Meiotic analysis of a teratospermic boar

Author

Barasc, Harmonie, Mary, Nicolas, Ferchaud, Stéphane, Letron, Raymond, Calgaro, Anne, Dudez, Anne-Marie, Bonnet, Nathalie, Bouissou-Matet Yerle, Martine, Ducos, Alain, Pinton, Alain, Laboratoire de Génétique Cellulaire (LGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Insémination Caprine et Porcine (ICP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2012

24. Contrôle chromosomique des populations porcines en France: bilan 2007-2010

Author

Pinton, Alain, Calgaro, Anne, Bonnet, Nathalie, Mary, Nicolas, Dudez, Anne-Marie, Barasc, Harmonie, Plard, Christophe, Bouissou-Matet Yerle, Martine, Ducos, Alain, Laboratoire de Génétique Cellulaire (LGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT)

Subjects
ANOMALIES, [SDV]Life Sciences [q-bio], CHROMOSOMIQUE, CONTROLE
Abstract

National audience; Chromosomal control of pig populations in France: 2007–2010 survey Chromosomal control activities of pig populations in France have been widely developed during the last ten years. Up to now, more than 24000 individuals have been karyotyped in our laboratory. Ninety percent were young purebred boars controlled before service in artificial insemination centers.One hundred and forty one structural chromosomal rearrangements have been identified to date, including 44 since 2007. Among these, 40 were reciprocal translocations , 2 peri- or paracentric inversions, 1 rearrangement involving one chromosome N°3 (not yet characterized), and 1 Robertsonian translocation Rob (15;18). Two out of the 40 reciprocal translocations involved the Y chromosome and one autosome.The prevalence of balanced structural chromosomal rearrangements estimated in a sample of more than 16000 young boars controlled before service between 2002 and 2010 was 0.46%. The results presented in this communication indicate that the continuation of the chromosomal control program is essential

Published
2012

25. DNA methylation analysis in sperm from boar with bad sperm quality

Author

Acloque, Hervé, Ferchaud, Stephane, Bouissou-Matet Yerle, Martine, Laboratoire de Génétique Cellulaire (LGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Insémination Caprine et Porcine (ICP), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
endocrine system, urogenital system, acceptabilité, [SDV]Life Sciences [q-bio], adn, [INFO]Computer Science [cs], semence, SPERMATIQUE, méthylation
Abstract

National audience; DNA methylation analysis in sperm from boar with bad sperm quality Infertility problems are an increasing health challenge in human and animal populations. They can be explained by genetic or hormonal causes but also by aging or life‐style causes. In farm animals high inbreeding levels, exposure to atmosphere, food and water contaminants, also lead to a significant decrease of animal fertility and are beginning to be a real problem. For example, nearly 50% of boars selected on agronomical criteria (like growth or alimentary efficiency, muscle fat content…) are culled for bad sperm quality (including concentration, morphology and motility). In the present work we decided to focus our study on DNA methylation levels in sperm from boars with bad semen quality. DNA methylation is a direct modification of cytosine residues that can affect gene expression and chromatin organization. In infertile patients, sperm DNA methylation is affected at some particular loci especially those submitted to parental imprinting. Using the genomic and bioinformatics facilities available in our laboratory, we started to perform genome‐wide methylome maps from sperm DNA of fertile animals. At the same time, we looked at the methylation status of imprinted loci in sperm from animals with bad sperm quality using immunoprecipitation and real time PCR analysis of methylated DNA. Methylation of blood genomic DNA will also be analyzed at these loci to test for the presence of a positive correlation between DNA methylation defects in somatic and germinal cells. We hope to develop an easy diagnostic method to detect, in immature animals, future reproductive limitations.

Published
2012

26. Psychanalyse et cryptologie : conversation avec Jacques Stern

Author

Miller, Jacques-Alain, Stern, Jacques, Lazarus-Matet, Catherine, Ripoll, Olivier, La section clinique, Université Paris 8 Vincennes-Saint-Denis (UP8), and Shtalbi, Haki

Subjects
ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2010

27. Localization of beta-galactoside alpha2,6-sialyltransferase gene on pig chromosome 13q4.1

Author

Saint Oyant-Hibrand, L., Gaillard, Claire, RENARD, Christine, Julien, Raymond, Bouissou-Matet Yerle, Martine, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UMR GMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Limoges (UNILIM), Laboratoire de radiobiologie et d'étude du génome (LREG), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Laboratoire de Génétique Cellulaire (LGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA), Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, CARTOGRAPHIE DES GENES
Abstract

RésuméChantier qualité spécifique "Auteurs Externes" département de Génétique animale : uniquement liaison auteur au référentiel HR-Access; absent

Published
1997

28. 3D genome conformation and gene expression in fetal pig muscle at late gestation

Author

Marti-Marimon, Maria, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université de Toulouse, and Martine Bouissou-Matet, Directrice de thèse - Sylvain Foissac co-directeur

Subjects
pig, [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], gestation, genetic, genome, these, Autre (Sciences du Vivant)
Abstract

In swine breeding industry, sows have been selected for decades on their prolificacy in order to maximize meat production. However, this selection is associated with a higher mortality of newborns. In this context, the skeletal fetal muscle is essential for the piglet’s survival, as it is necessary for motor functions and thermoregulation. Besides, the three-dimensional structure of the genome has been proven to play an important role in gene expression regulation. Thus, in this project, we have focused our interest on the 3D genome conformation and gene expression in porcine muscle nuclei at late gestation. We have initially developed an original approach in which we combined transcriptome data with information of nuclear locations (assessed by 3D DNA FISH) of a subset of genes, in order to build gene co-expression networks. This study has revealed interesting nuclear associations involving IGF2, DLK1 and MYH3 genes, and highlighted a network of muscle-specific interrelated genes involved in the development and maturity of fetal muscle. Then, we assessed the global 3D genome conformation in muscle nuclei at 90 days and 110 days of gestation by using the High-throughput Chromosome Conformation Capture (Hi-C) method. This study has allowed identifying thousands of genomic regions showing significant differences in 3D conformation between the two gestational ages. Interestingly, some of these genomic regions involve the telomeric regions of several chromosomes that seem to be preferentially clustered at 90 days. More important, the observed changes in genome structure are significantly associated with variations in gene expression between the 90th and the 110th days of gestation.

Published
2018

Catalog

Books, media, physical & digital resources
See catalog results