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1. Searching for markers of immunocompetence in blood: application to vaccination against Influenza A virus in pigs

Author: Blanc, Fany, Estellé, Jordi, Lemonnier, Gaëtan, Leplat, Jean Jacques, Bouguyon, Edwige, Billon, Yvon, Bouchez, Olivier, Pinard - Van Der Laan, Marie-Hélène, Rogel Gaillard, Claire, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Paris Saclay (COMUE), Unité de recherche Virologie et Immunologie Moléculaires (VIM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), GeT PlaGe, Genotoul, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité de recherche Virologie et Immunologie Moléculaires (VIM (UR 0892)), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Génome et Transcriptome - Plateforme Génomique (GeT-PlaGe), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Plateforme Génome & Transcriptome (GET), Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), European Project: 633184,H2020,H2020-SFS-2014-2,SAPHIR(2015), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], education, reproductive and urinary physiology, humanities, health care economics and organizations
Abstract: Searching for markers of immunocompetence in blood: application to vaccination against Influenza A virus in pigs . International Veterinary Immunology Symposium (IVIS)
Published: 2019

2. Towards the quantitative characterisation of piglets’ robustness to weaning: a modelling approach

Author: Revilla, Manuel, Friggens, Nicolas, Broudiscou, Laurent, Lemonnier, Gaetan, Blanc, Fany, Ravon, Laure, Mercat, M. J., Billon, Yvon, Rogel Gaillard, Claire, Le Floc'h, Nathalie, Estellé, Jordi, Muñoz-Tamayo, Rafael, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Modélisation Systémique Appliquée aux Ruminants (MoSAR), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut du porc and Alliance R&D, Institut du Porc, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut du Porc (IFIP), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Subjects: Diarrhea, perturbation, sevrage, [SDV]Life Sciences [q-bio], Weight Gain, Models, Biological, SF1-1100, dynamic modelling, modelling, body weight, modèle mathématique, robustesse des animaux, Animals, resilience, modélisation, Swine Diseases, weaning, pigs, swine, sucking pig, Animal culture, Female, Physiology and Functional Biology, porcelet, mathematical model, Research Article, porc
Abstract: Lien vers la version preprint déposée sur Biorxiv.org https://prodinra.inra.fr/record/447811; Weaning is a critical transition phase in swine production in which piglets must cope with different stressors that may affect their health. During this period, the prophylactic use of antibiotics is still frequent to limit piglet morbidity, which raises both economic and public health concerns such as the appearance of antimicrobial-resistant microbes. With the interest of developing tools for assisting health and management decisions around weaning, it is key to provide robustness indexes that inform on the animals’ capacity to endure the challenges associated with weaning. This work aimed at developing a modelling approach for facilitating the quantification of piglet resilience to weaning. A total of 325 Large White pigs weaned at 28 days of age were monitored and further housed and fed conventionally during the post-weaning period without antibiotic administration. Body weight and diarrhoea scores were recorded before and after weaning, and blood was sampled at weaning and 1 week later for collecting haematological data. A dynamic model was constructed based on the Gompertz–Makeham law to describe live weight trajectories during the first 75 days after weaning, following the rationale that the animal response is partitioned in two time windows (a perturbation and a recovery window). Model calibration was performed for each animal. Our results show that the transition time between the two time windows, as well as the weight trajectories are characteristic for each individual. The model captured the weight dynamics of animals at different degrees of perturbation, with an average coefficient of determination of 0.99, and a concordance correlation coefficient of 0.99. The utility of the model is that it provides biologically meaningful parameters that inform on the amplitude and length of perturbation, and the rate of animal recovery. Our rationale is that the dynamics of weight inform on the capability of the animal to cope with the weaning disturbance. Indeed, there were significant correlations between model parameters and individual diarrhoea scores and haematological traits. Overall, the parameters of our model can be useful for constructing weaning robustness indexes by using exclusively the growth curves. We foresee that this modelling approach will provide a step forward in the quantitative characterisation of robustness.
Published: 2019
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3. Effect of chronic and acute heat challenges on fecal microbiota composition, production, and thermoregulation traits in growing pigs

Author: Le Sciellour, Mathilde, Zemb, Olivier, Hochu, Isabelle, Riquet, Juliette, Gilbert, Hélène, Giorgi, Mario, Billon, Yvon, Gourdine, Jean-Luc, Renaudeau, David, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Plateforme Tropicale d'Expérimentation sur l'Animal (PTEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Unité de Recherches Zootechniques (URZ), ANR-12-ADAP-0015, European Project: 633531,H2020,H2020-SFS-2014-2,Feed-a-Gene(2015), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)
Subjects: Animal biology, stress thermique, Pig, climat, Microbiota, Climate, Performance, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, swine, performance animale, Enterotype, Heat stress, population bactérienne, heat stress, microbiote, composition, Biologie animale, porc
Abstract: The present study aimed at investigating the impact of heat challenges on gut microbiota composition in growing pigs and its relationship with pigs’ performance and thermoregulation responses. From a total of 10 F1 sire families, 558 and 564 backcross Large White × Créole pigs were raised and phenotyped from 11 to 23 wk of age in temperate (TEMP) and in tropical (TROP) climates, respectively. In TEMP, all pigs were subjected to an acute heat challenge (3 wk at 29 °C) from 23 to 26 wk of age. Feces samples were collected at 23 wk of age both in TEMP and TROP climate (TEMP23 and TROP23 samples, respectively) and at 26 wk of age in TEMP climate (TEMP26 samples) for 16S rRNA analyses of fecal microbiota composition. The fecal microbiota composition significantly differed between the 3 environments. Using a generalized linear model on microbiota composition, 182 operational taxonomic units (OTU) and 2 pathways were differentially abundant between TEMP23 and TEMP26, and 1,296 OTU and 20 pathways between TEMP23 and TROP23. Using fecal samples collected at 23 wk of age, pigs raised under the 2 climates were discriminated with 36 OTU using a sparse partial least square discriminant analysis that had a mean classification error-rate of 1.7%. In contrast, pigs in TEMP before the acute heat challenge could be discriminated from the pigs in TEMP after the heat challenge with 32 OTU and 9.3% error rate. The microbiota can be used as biomarker of heat stress exposition. Microbiota composition revealed that pigs were separated into 2 enterotypes. The enterotypes were represented in both climates. Whatever the climate, animals belonging to the Turicibacter–Sarcina–Clostridium sensu stricto dominated enterotype were 3.3 kg heavier (P < 0.05) at 11 wk of age than those belonging to the Lactobacillus-dominated enterotype. This latter enterotype was related to a 0.3 °C lower skin temperature (P < 0.05) at 23 wk of age. Following the acute heat challenge in TEMP, this enterotype had a less-stable rectal temperature (0.34 vs. 0.25 °C variation between weeks 23 and 24, P < 0.05) without affecting growth performance (P > 0.05). Instability of the enterotypes was observed in 34% of the pigs, switching from an enterotype to another between 23 and 26 wk of age after heat stress. Despite a lower microbial diversity, the Turicibacter–Sarcina–Clostridium sensu stricto dominated enterotype was better adapted to heat stress conditions with lower thermoregulation variations.
Published: 2019
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4. Testicular development, sex hormones and boar taint in pig lines divergent for residual feed intake

Author: Prunier, Armelle, Billon, Yvon, Ruesche, Julien, Ferchaud, Stéphane, Gilbert, Hélène, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: boar taint, puberty, consommation alimentaire résiduelle, stéroïde, puberte, [SDV]Life Sciences [q-bio], feed efficiency, steroid, efficience alimentaire, porc mâle entier, lignée divergente
Abstract: Improving feed efficiency and rearing entire male pigs are relevant strategies to reduce feed cost and environmental waste in pig production. The major constraint for rearing entire male pigs being boar taint, an experiment was performed to determine the consequences of a divergent selection on residual feed intake (RFI: low RFI = LRFI; high RFI = HRFI) on pubertal development and boar taint. Purebred French Large White male pigs from two divergent lines for RFI (9th generation of selection, n = 45 or 43 pigs/line from 33 litters) were reared in two batches (n = 19 to 24 pigs/line/batch). Blood samples were drawn at 15 and 166±1 days of age (mean±SD) and pigs were weighed. After slaughter at 167±1 days of age, a backfat sample was collected in the neck and the genital tract was removed for testis and epididymis weighing after tissue trimming. Percentages of testis and epididymis weight relatively to liveweight were calculated for statistical analyses. All data were analyzed by ANOVA using R, including line and batch as fixed effects and litter as a random effect. When necessary, a log transformation was applied before analysis and adjusted means were backcalculated. Before slaughter, LRFI pigs were lighter than HRFI pigs (100±2 vs 106±2 kg liveweight, P0.1). However, plasma oestradiol-17 before slaughter (9.0 vs 17.5 pg/ml), fat androstenone (0.22 vs 0.34 µg/g pure fat), testis (3.5 vs 4.4‰) and epidydimis (1.18 vs 1.62‰) relative weights were lower in HRFI than LRFI pigs (P
Published: 2018

5. D'un cadre conceptuel à un programme expérimental pour la gestion intégrée de la santéchez les monogastriques

Author: Lamothe, Laurence, Combes, Sylvie, Balmisse, Elodie, Brachet, Mathilde, Collin, Anne, Ferchaud, Stéphane, Germain, Karine, Girard, Agnès, Guilloteau, Laurence, Gunia-Jaquot, Mélanie, Méda, Bertrand, Montagne, Lucile, Pinard - Van Der Laan, Marie-Helene, Savietto, Davi, Schouler, Catherine, Le Floc'h, Nathalie, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], UE 1322 Pôle d'Expérimentation Cunicole TOULousain, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Pôle d'Expérimentation Cunicole TOULousain (PECTOUL), Elevage Alternatif et Santé des Monogastriques (UE EASM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Recherches Avicoles (SRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Infectiologie Animale et Santé Publique - IASP (Nouzilly, France), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Pôle d'Expérimentation Cunicole TOULousain (PECTOUL ), Unité de Recherches Avicoles (URA), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT)
Subjects: animal health, santé animale, [SDV]Life Sciences [q-bio], integrated management, poulet, système d'élevage, robustesse, gestion intégrée de la santé animale, mécanisme physiologique, gestion intégrée, animal, lapin, administration de médicament, monogastrique, porc
Abstract: D'un cadre conceptuel à un programme expérimental pour la gestion intégrée de la santéchez les monogastriques. Journées d'Animation Scientifique du département Phase (JAS Phase 2018)
Published: 2018

6. Towards a quantitative characterization of robustness of piglets at weaning period: An animal growth modelling approach

Author: Rafael Munoz Tamayo, Manuel Revilla Sanchez, Nicolas Charles Friggens, Laurent Broudiscou, Gaetan Lemonnier, Fany Blanc, Laure Ravon, Mercat, M. J., Yvon Billon, Claire Gaillard, Nathalie Le Floch, Jordi Estelle Fabrellas, Modélisation Systémique Appliquée aux Ruminants (MoSAR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), IFIP -Institut du porc and Alliance R&D, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ANR Pigletbiota, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (0558)., AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: sevrage, animal diseases, weaning, [SDV]Life Sciences [q-bio], sucking pig, résilience, modelling, modèle mathématique, robustesse des animaux, croissance animale, porcelet, mathematical model, animal growth, modélisation
Abstract: Towards a quantitative characterization of robustness of piglets at weaning period: An animal growth modelling approach. Journées d'Animation Scientifique du département PHASE
Published: 2018

7. Proteomic analysis of adipose tissue during the last weeks of gestation in pure and crossbred Large White or Meishan fetuses gestated by sows of either breed

Author: Laurence Liaubet, Marie-Christine Père, H. Quesnel, Blandine Guével, Emmanuelle Com, Isabelle Louveau, Laurianne Canario, Yvon Billon, Florence Gondret, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Proteomics Core Facility (Protim), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université de Rennes (UNIV-RENNES), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, ANR Porcinet, UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Université de Rennes (UR)-Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université de Rennes (UR), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)
Subjects: 0301 basic medicine, Cytoskeleton organization, Adipose tissue, tissu adipeux, Biochemistry, Apoptotic cell clearance, 0302 clinical medicine, développement foetal, métabolite, protéome, large white, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, lcsh:SF1-1100, développement, Animal biology, 2. Zero hunger, lcsh:Veterinary medicine, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, truie, Breed, adipose tissue, 030220 oncology & carcinogenesis, génotype, Maturity grade, Autre (Sciences du Vivant), Biotechnology, [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], proteome, metabolite, Biology, Fatty acid-binding protein, Andrology, 03 medical and health sciences, Fetus, Biologie animale, Genetics, yelt, meishan, development, Research, Albumin, swine, 030104 developmental biology, fœtus amnion fetus yolk sac, lcsh:SF600-1100, Animal Science and Zoology, lcsh:Animal culture, fœtus, Purebred, Food Science, porc
Abstract: Background The degree of adipose tissue development at birth may influence neonatal survival and subsequent health outcomes. Despite their lower birth weights, piglets from Meishan sows (a fat breed with excellent maternal ability) have a higher survival rate than piglets from Large White sows (a lean breed). To identify the main pathways involved in subcutaneous adipose tissue maturation during the last month of gestation, we compared the proteome and the expression levels of some genes at d 90 and d 110 of gestation in purebred and crossbred Large White or Meishan fetuses gestated by sows of either breed. Results A total of 52 proteins in fetal subcutaneous adipose tissue were identified as differentially expressed over the course of gestation. Many proteins involved in energy metabolism were more abundant, whereas some proteins participating in cytoskeleton organization were reduced in abundance on d 110 compared with d 90. Irrespective of age, 24 proteins differed in abundance between fetal genotypes, and an interaction effect between fetal age and genotype was observed for 13 proteins. The abundance levels of proteins known to be responsive to nutrient levels such as aldolase and fatty acid binding proteins, as well as the expression levels of FASN, a key lipogenic enzyme, and MLXIPL, a pivotal transcriptional mediator of glucose-related stimulation of lipogenic genes, were elevated in the adipose tissue of pure and crossbred fetuses from Meishan sows. These data suggested that the adipose tissue of these fetuses had superior metabolic functionality, whatever their paternal genes. Conversely, proteins participating in redox homeostasis and apoptotic cell clearance had a lower abundance in Meishan than in Large White fetuses. Time-course differences in adipose tissue protein abundance were revealed between fetal genotypes for a few secreted proteins participating in responses to organic substances, such as alpha-2-HS-glycoprotein, transferrin and albumin. Conclusions These results underline the importance of not only fetal age but also maternal intrauterine environment in the regulation of several proteins in subcutaneous adipose tissue. These proteins may be used to estimate the maturity grade of piglet neonates. Electronic supplementary material The online version of this article (10.1186/s40104-018-0244-2) contains supplementary material, which is available to authorized users.
Published: 2018
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8. Responses of pigs divergently selected for cortisol level or feed efficiency to a challenge diet during growth

Author: Hélène Gilbert, Elena Terenina, Julien Ruesche, Laure Gress, Yvon Billon, Pierre Mormede, Catherine Larzul, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: pig, stress, [SDV]Life Sciences [q-bio], feed efficiency, dietary fibre, cortisol, genetic, ACTH
Abstract: Selection for feed efficiency is questioned as reducing the ability of farm animals to face stress and overcome challenges. The hypothalamic-pituitary-adrenocortical (HPA) axis activity, measured by the cortisol level in plasma after ACTH injection, has been proposed as an indicator of robustness. The objectives of this study were to evaluate 1. if a modified cortisol level in pigs alters their feed efficiency and their production performance, 2. if alternative dietary resources would affect these responses. Parallel trials including divergent lines for plasma cortisol 1 hour after ACTH injection and divergent lines for residual feed intake (RFI) were run during growth with a conventional diet and a diet with high fibres, low energy and low protein content. Selection for higher or lower plasma cortisol levels after stimulation of the adrenal gland did not impact growth and feed intake traits, but it had a significant impact on body composition and carcass yield, with improved composition in the high cortisol animals. The two lines had similar responses to an alternative diet, with decreased growth rate and feed intake, and increased feed conversion ratio. On the other hand, lines selected for divergent RFI had different responses to the alternative diet, the more efficient line having a more reduced growth rate with the diet with lower energy and AA contents. However, in terms of FCR it remained more efficient. The initial hypothesis of decreased efficiency associated to increased cortisol was not validated.
Published: 2018

9. Sélection divergente sur l’activité corticotrope chez le porc : étude des réponses aux stress d’élevage

Author: Larzul, Catherine, Terenina, Elena, Billon, Yvon, Ferchaud, Stephane, Gress, Laure, Rémignon, Hervé, Manse, Hélène, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: corticotrope, [SDV]Life Sciences [q-bio], sélection, bien-être animal, production, porc
Abstract: Notice à Reprendre avec Recueil des Proceedings; This experiment had the goal to analyze responses to various sources of stress (weaning, exposure to heat and pre-slaughter mixing) in the third generation of selection of two lines of pigs genetically selected on the basis of plasma cortisol levels (“high” or “low”) measured one hour after injection of adrenocorticotropin. This test assesses the activity of the adrenocortical axis, a major endocrine system of the stress response. Results show that the high line had a significantly lower post-weaning growth rate. However, its growth rate was higher in the late fattening period, so that the two lines had the same overall growth rate throughout their productive lives. Prolonged exposure to heat (29.9°C vs 26.1°C) during the late fattening period (D133-D158) reduced the growth rate of animals to the same extent in both lines. Group-mixing stress prior to slaughter increased cortisol levels measured in urine collected from the bladder as well as skin lesions on carcasses, and increased muscle pH measured 24h after slaughter. These consequences of pre-slaughter mixing, however, did not differ between lines. These results show that responses to different sources of stress are affected in different ways by the level of adrenocortical activity. Associated with production data, they will allow evaluation of the relevance of this selection criterion for increasing animal robustness.
Published: 2018

10. Integrated analysis of proteomic and transcriptomic data highlights late fetal muscle maturation process

Author: Voillet, Valentin, San Cristobal, Magali, Pere, Marie-Christine, Billon, Yvon, Canario, Laurianne, Liaubet, Laurence, Lefaucheur, Louis, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Subjects: Animal biology, muscle, maturation, Research, Gene Expression Profiling, transcriptomique, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, Muscle Proteins, swine, Muscle Development, caractérisation moléculaire, Fetal Development, Fetus, proteomics, Biologie animale, fœtus amnion fetus yolk sac, Animals, fœtus, protéomique, porc, métabolisme musculaire
Abstract: In pigs, the perinatal period is the most critical time for survival. Piglet maturation, which occurs at the end of gestation, is an important determinant of early survival. Skeletal muscle plays a key role in adaptation to extra-uterine life, e.g. motor function and thermoregulation. Progeny from two breeds with extreme neonatal mortality rates were analyzed at 90 and 110 days of gestation (dg). The Large White breed is a highly selected breed for lean growth and exhibits a high rate of neonatal mortality, whereas the Meishan breed is fatter and more robust and has a low neonatal mortality. Our aim was to identify molecular signatures underlying late fetal longissimus muscle development. First, integrated analysis was used to explore relationships between co-expression network models built from a proteomic data set (bi-dimensional electrophoresis) and biological phenotypes. Second, correlations with a transcriptomic data set (microarrays) were investigated to combine different layers of expression with a focus on transcriptional regulation. Muscle glycogen content and myosin heavy chain polymorphism were good descriptors of muscle maturity and were used for further data integration analysis. Using 89 identified unique proteins, network inference, correlation with biological phenotypes and functional enrichment revealed that mitochondrial oxidative metabolism was a key determinant of neonatal muscle maturity. Some proteins, including ATP5A1 and CKMT2, were important nodes in the network related to muscle metabolism. Transcriptomic data suggest that overexpression of mitochondrial PCK2 was involved in the greater glycogen content of Meishan fetuses at 110 dg. GPD1, an enzyme involved in the mitochondrial oxidation of cytosolic NADH, was overexpressed in Meishan. Thirty-one proteins exhibited a positive correlation between mRNA and protein levels in both extreme fetal genotypes, suggesting transcriptional regulation. Gene ontology enrichment and Ingenuity analyses identified PPARGC1A and ESR1 as possible transcriptional factors positively involved in late fetal muscle maturation.
Published: 2018
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11. Responses of pigs divergently selected for cortisol response or feed efficiency to an ACTH challenge

Author: Gilbert, Hélène, Mormede, Elena, Louveau, Isabelle, Ruesche, Julien, Gress, Laure, Billon, Yvon, Mormède, Pierre, Larzul, Catherine, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: endocrine system, genetique, [SDV]Life Sciences [q-bio], efficacité alimentaire, Cortisol, swine, robustness, robustesse, hormones, hormone substitutes, and hormone antagonists, porc
Abstract: Selection for feed efficiency can impair the animal’s ability to respond to stress. A key driver of this response is the hypothalamo-pituitary-adrenal (HPA) axis, which releases cortisol in response to stressors. Injection of a normalized dose of adrenocorticotropic hormone (ACTH) to stimulate cortisol release by the adrenal cortex is a standardized method to evaluate the activity of the HPA axis independently of the animal’s perception of stress. It has been used to select during three generations a highCortisol line and a lowCortisol line, that had divergent cortisol levels 1 h after ACTH injection (H1, peak of the response). A trial was set up to compare the responses to ACTH of these two lines and those of two other lines divergently selected for residual feed intake (RFI, measure of net feed efficiency) during nine generations. At 6 weeks of age, 48 pigs per line were tested. Blood samples were collected before and 1 (H1) and 4 h after injection (H4) when cortisol is expected to return to basal level. In the Cortisol lines, plasma cortisol was multiplied by 2 (P
Published: 2017

12. A conceptual framework to promote integrated health management in monogastrics

Author: Lamothe, Laurence, Combes, Sylvie, Balmisse, Elodie, Collin, Anne, Ferchaud, Stéphane, Germain, Karine, Pinard - Van Der Laan, Marie-Helene, Schouler, Catherine, Le Floc'h, Nathalie, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], UE 1322 Pôle d'Expérimentation Cunicole TOULousain, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Pôle d'Expérimentation Cunicole TOULousain (PECTOUL), Recherches Avicoles (SRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Elevage Alternatif et Santé des Monogastriques (UE EASM), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Infectiologie Animale et Santé Publique - IASP (Nouzilly, France), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Pôle d'Expérimentation Cunicole TOULousain (PECTOUL ), Unité de Recherches Avicoles (URA), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: animal health, santé animale, [SDV]Life Sciences [q-bio], integrated management, système d'élevage, gestion intégrée, approche systémique, monogastrique, traitement antimicrobien, pratique d'élevage
Abstract: Rimel; Reduce the use of antimicrobial compounds in livestock production is necessary to limit antimicrobial resistance development and to protect the health of animals, humans and ecosystems. This complex task may only be accomplished via the implementation of a systemic approach, which takes into account the management of animal health as a whole, avoiding simplistic strategies. To that purpose, 15 scientists working on different domestic monogastric species (pig, poultry, rabbit) formed the consortium ‘RIMEL’. We propose an interdisciplinary conceptual framework for the evaluation and management of animal health. This conceptual framework listed 11 fundaments of animal health organized in two main dimensions. The first one, physical health, refers to the association of barriers (skin, mucosae and microbiota) and defenses (innate and acquired immunity, and nervous and endocrine systems). The second one considers the psycho-social health (mother-young interactions or amongst relatives, the expression of the innate behavioral repertoire, and the respect of circadian rhythm). We identified critical periods for health in each species related to the maturation dynamics of each fundament. Then, we associate these fundaments with various indicators of health status (zootechnical performance, behavior, metabolic or hormonal markers, etc.). Finally, the framework takes into account more than 30 practices applied in the long- or in the short-term to drive health in livestock systems (genetics, reproduction strategy and renewal management, feeding, hygiene and prophylaxis, living environment, etc.). We organized all the elements to describe the biological relays, to distinguish levers and risks, and to build a representation that took into account the lag between actions and results on a targetedpopulation. This framework is a tool to (1) help and structure research on integrated management of animal health (2) characterize and analyze existing systems, (3) design and evaluate innovative practices and systems. Our ultimate goal is to support the transition of animal production towards systems with low antimicrobial inputs.
Published: 2017

13. Evaluation of steroid concentrations in the saliva of pre-pubertal gilts for the identification of biomarkers of the pubertal stage of maturity

Author: Goudet-Guitton, Ghylène, Liere, Philippe, Douet, Cécile, SAVOIE, Jonathan, STAUB, Christophe, Venturi, Eric, Ferchaud, Stephane, Maupertuis, Florence, ROINSARD, Antoine, BOULOT, Sylviane, Prunier, Armelle, Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), U1195, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Unité Expérimentale de Physiologie Animale de l‘Orfrasiére (Unité Expérimentale de Physiologie Animale de l‘Orfrasiére - UE PAO), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Chambre Régionale d'Agriculture des Pays de la Loire, Institut Technique de l'Agriculture Biologique (ITAB), Institut du Porc, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ProdInra, Archive Ouverte, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur] (IFCE)-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité Expérimentale de Physiologie Animale de l‘Orfrasiére (UE PAO), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut du Porc (IFIP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Subjects: puberty, saliva, prepuberte, [SDV]Life Sciences [q-bio], cochette, dhea, truie, 17 beta œstradiol, [SDV] Life Sciences [q-bio], hydroxyandrostenone, puberte, yelt, prepuberty, biomarker, biomarqueur, salive
Abstract: Estrus synchronization is important for optimal management of gilt reproduction in farms. Synthetic progestogens are used for this purpose, but there is growing demand for non-hormonal alternatives. Before puberty, gilts exhibit a “waiting period”, related to ovarian development and gonadotrophin secretions, during which external stimulation, such as boar exposure, could induce and synchronize first ovulation. Practical non-invasive tools for identification of this period in farms are lacking. During this period, urinary estrone levels are high, but urine sampling is difficult in group-housed females. Our aim was to search for steroidal biomarkers of this “waiting period” from immature to pubertal gilts through saliva monitoring. Six 144-to 147-day-old Large White gilts were subjected to ultrasound puberty diagnosis 3 times a week until first ovulation. Urine and saliva samples were collected at the same frequency for estrone assay and steroidome analysis respectively. Data were analyzed using the R software (nonparametric permutation test). Urinary estrone concentration significantly increased 2 weeks before puberty (detected at 182–192 days). Steroidome analysis quantified 28 steroids in saliva. Significant variations were detected within 2 weeks before puberty for dehydroepiandrosterone (decrease) and estradiol-17b (increase). These steroids could be biomarkers of the “waiting period”. These results confirm that non-invasive salivary sampling could allow the identification of the physiological status of the gilts and presumably the optimal time for application of the boar effect.
Published: 2017

14. Genetic individual variability of vaccine responses in pigs

Author: Fany BLANC, Gaetan Lemonnier, Jean Jacques Leplat, Edwige Bouguyon, Yvon Billon, Jordi Estelle, Claire Gaillard, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Université Paris-Saclay, DRF/IRCM/SREIT/LREG, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Unité de recherche Virologie et Immunologie Moléculaires (VIM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), European Project: 633184, Unité de recherche Virologie et Immunologie Moléculaires (VIM (UR 0892)), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), and AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], education, health care economics and organizations
Abstract: Genetic individual variability of vaccine responses in pigs. 36. Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG)
Published: 2017

15. Late Fetal Blood Transcriptomic Approach To Get Insight Into Biology Related To Birth Survival

Author: Liaubet, Laurence, Voillet, Valentin, Lippi, Yannick, Iannuccelli, Nathalie, Lascor, Christine, Billon, Yvon, San Cristobal, Magali, Canario, Laurianne, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Transcriptomic impact of Xenobiotics (E23 TRiX), ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Plateforme Génome & Transcriptome (GET), Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), ANR-09-GENM-0005,PORCINET,Approche intégrée de la maturité des porcelets(2009), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Plateforme Génome & Transcriptome (GET), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse - ENVT (FRANCE), Ecole d'Ingénieurs de Purpan - EIP (FRANCE), Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE), Institut National de la Recherche Agronomique - INRA (FRANCE), Université Toulouse III - Paul Sabatier - UT3 (FRANCE), Institut National Polytechnique de Toulouse - INPT (FRANCE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and ANR-09-GENM-005 PORCINET
Subjects: pig, Pig, [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], Blood, Autre, blood, Fetal maturity, microarray, fetal maturity, Microarray, Génétique animale, Autre (Sciences du Vivant)
Abstract: In recent decades, improvement of prolificacy and body composition has been accompanied by a substantial increase in the mortality of piglets before weaning. The most critical period is the perinatal period, mostly during the first 24-48 hours following birth. The maturity of piglets, defined as the state of full development for survival at birth, is an important determinant of early mortality. The objective of our project is to take advantage of current knowledge about two pig breeds, Large White (LW) pigs selected for prolificacy and body composition and Meishan (MS) pigs being more robust. Maturity of several tissues and metabolite profiles of various fluids are analyzed on the fetuses (LW, MS and reciprocal F1) at day 90 or 110 of gestation (birth at day 114). Here we presented the transcriptomic analysis done on total blood samples (N=63). We did two different statistical analyses, a supervised one to reveal differential pathways for the interaction between gestational stages and genotypes and an unsupervised analysis (hclust and differential analyses) to identify potential predictors of a lesser maturity at birth. All p-values were adjusted with a Bonferroni correction < 1%. The 265 genes differential for the interaction (Bonferroni 1%) in blood samples revealed many genes for mitochondrial ATP synthesis, transcriptional regulation, and response to hypoxia (overexpressed in LW at day 110 of gestation).
Published: 2017

16. Juvenile IGF-I response in INRA RFI selection lines partly reflects changes in post-weaning attributes

Author: Gilbert, H., Louveau, I., Billon, Y., Kim Bunter, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Animal Genetics and Breeding Unit (AGBU), University of New England (UNE), Contrat de recherche Primego (Australie) + ANR PIG_FEED, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), and Animal Genetics and Breeding Unit, University of New England (AGBU)
Subjects: pig, residual feed intake, weaning, [SDV]Life Sciences [q-bio], food and beverages, selection, sense organs, skin and connective tissue diseases, IFG-I
Abstract: Juvenile IGF-I response in INRA RFI selection lines partly reflects changes in post-weaning attributes. Association for the Advancement of Animal Breeding and Genetics
Published: 2017

17. Use of near-infrared (NIR) reflectance spectroscopy to predict mohair quality in greasy fleece samples of Angora goats

Author: Allain, Daniel, Brenot, Sylvie, Auvinet, Gerard, Pena-Arnaud, Berengere, Martin, Pierre, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Capgènes, UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: Use of near-infrared (NIR) reflectance spectroscopy to predict mohair quality in greasy fleece samples of Angora goats.. 7. European symposium on South American Camelids and 3rd European meeting on Animal Fibre
Published: 2017

18. Placenta and adrenal adaptation according to piglet genetic potential for maturity at birth

Author: Marine Dizabeau, Agnes Bonnet, Lisa Bluy, Aurelie Secula, Raphaël Comte, Annie Boulliou-Robic, Laurianne Canario, Yvon Billon, Pascale Chavatte-Palmer, Laurence Liaubet, Anne Couturier-Tarrade, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA), Université Paris-Saclay, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Biologie du Développement et Reproduction (BDR), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Biologie du développement et reproduction (BDR), and École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: fluids and secretions, integumentary system, gestation, animal diseases, embryonic structures, education, adaptation, porcelet, maturité, génétique, [SDV.BDLR.RS]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology/Sexual reproduction
Abstract: Placenta and adrenal adaptation according to piglet genetic potential for maturity at birth. 10. International Conference on Pig Reproduction (ICPR)
Published: 2017

19. An intestinal transcriptome analysis in fetal pigs reveals genes involved in glucose and lipid metabolism and immunity as valuable clues of maturity at birth

Author: Yao, Ying, Voillet, Valentin, Jégou, Maëva, San Cristobal, Magali, Dou, Samir, Rome, Véronique, Lippi, Yannick, Billon, Yvon, Pere, Marie-Christine, Boudry, Gaëlle, Gress, Laure, Iannuccelli, Nathalie, Mormède, Pierre, Quesnel, Helene, Canario, Laurianne, Liaubet, Laurence, Le Huërou-Luron, Isabelle, Nutrition, Métabolismes et Cancer (NuMeCan), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Sichuan Agricultural University, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Transcriptomic impact of Xenobiotics (E23 TRiX), ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Plateforme Génome & Transcriptome (GET), Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Plateforme Génome & Transcriptome (GET), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Plateforme Génome & Transcriptome (GET), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Animal biology, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, Biologie animale
Abstract: International audience; An intestinal transcriptome analysis in fetal pigs reveals genes involved in glucose and lipid metabolism and immunity as valuable clues of maturity at birth. 50. Annual Meeting of the European Society for Pediatric Gastroenterology, Hepatology and Nutrition (ESPGHAN)
Published: 2017

20. Evaluation of salivary metabolome and steroidome for the identification of biomarkers of the pubertal stage of maturity in gilts

Author: Goudet-Guitton, Ghylène, Nadal-Desbarats, Lydie, Lière, Philippe, Douet, Cécile, SAVOIE, Jonathan, STAUB, Christophe, Venturi, Eric, Ferchaud, Stéphane, Maupertuis, Florence, ROINSARD, Antoine, BOULOT, Sylviane, Prunier, Armelle, Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Imagerie et cerveau, Université de Tours-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), U 1195, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Sud (Paris 11), Unité Expérimentale de Physiologie Animale de l‘Orfrasiére (Unité Expérimentale de Physiologie Animale de l‘Orfrasiére - UE PAO), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Chambre d'agriculture de la Loire Atlantique (CDA), Institut Technique de l'Agriculture Biologique (ITAB), Institut du Porc, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Crédit Incitatif PHASE, Agribio4, CIAB, INRA, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Imagerie et cerveau (iBrain - Inserm U1253 - UNIV Tours ), Unité Expérimentale de Physiologie Animale de l‘Orfrasiére (UE PAO), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut du Porc (IFIP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université François Rabelais (Tours). Tours, FRA. Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), FRA., Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université de Tours (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: pig, saliva, puberty, [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], [SDV.BDLR]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology, porcine, steroidome, sexual maturity, femelle, maturité sexuelle, biomarker, metabolome, porcin, biomarqueur
Abstract: Evaluation of salivary metabolome and steroidome for the identification of biomarkers of the pubertal stage of maturity in gilts. 2. Journées du GdR 3606 Repro
Published: 2017

21. Mesure des concentrations de stéroïdes dans la salive de cochettes immatures, pré-pubères et pubères

Author: Goudet-Guitton, Ghylène, Liere, Philippe, SAVOIE, Jonathan, STAUB, Christophe, Venturi, Eric, Ferchaud, Stephane, BOULOT, Sylviane, Prunier, Armelle, Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), U1195, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Sud (Paris 11), Unité Expérimentale de Physiologie Animale de l‘Orfrasiére (UE PAO), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut du Porc (IFIP), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Expérimentale de Physiologie Animale de l‘Orfrasiére (Unité Expérimentale de Physiologie Animale de l‘Orfrasiére - UE PAO), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut du Porc, AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: puberty, saliva, prepuberte, [SDV]Life Sciences [q-bio], cochette, dhea, truie, 17 beta œstradiol, hydroxyandrostenone, puberte, prepuberty, yelt, biomarker, biomarqueur, salive
Abstract: Synchronizing oestrus in gilts is an important tool for pig producers to optimize the management of reproduction. Synthetic progestogens are used routinely in pig farms for this purpose, but there is a need for alternative non-hormonal breeding tools. Before puberty, gilts exhibit a “waiting period”, related to ovarian development and gonadotrophin secretions, during which an external stimulation, such as boar exposure, could induce and synchronize the first ovulation. Our aim was to characterize this “waiting period” and search for biomarkers of this period using non-invasive tools. During this period, an increase of urinary oestrone concentration has been observed, but urinary sampling is difficult in group-housed females. Salivary samples are non-invasive and easier to perform. Thus, the aim of this study was to evaluate steroid concentrations in the saliva of immature to pubertal gilts in order to search for biomarkers of the “waiting period”. Trans-abdominal ultrasonographies were performed over a period of 5 weeks on six 140-day-old Large White gilts until puberty detection. Urinary samples were collected for oestrone assay to detect the “waiting period”. Salivary samples were collected for steroidome analysis using gas chromatography coupled with tandem mass spectrometry to detect potential biomarkers of the “waiting period”. Urinary oestrone concentration increased 2 weeks before puberty. Steroidome analysis allowed the quantification of 28 steroids, 13 of them showing significant differences between weeks. Dehydroepiandrosterone concentrations decreased and estradiol-17 concentrations increased significantly just before the “waiting period”. These steroids could be biomarkers of this period. Present results confirm that non-invasive salivary samples could allow the identification of the physiological status of the gilts and the optimal time for application of the boar effect.
Published: 2017

22. Réponses au sevrage de porcs de lignées divergentes pour l’efficacité alimentaire en fonction de l’aliment

Author: Gilbert, Hélène, Ruesche, Julien, Billon, Yvon, Muller, Nelly, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Unité Expérimentale de Testage de Porcs, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), European Project: 613574, École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Unité expérimentale de testage de porcs, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)
Subjects: stress, sevrage, [SDV]Life Sciences [q-bio], efficacité alimentaire, sélection, génétique
Abstract: La sélection pour l’efficacité alimentaire peut affecter la capacité des porcs à répondre au stress. La réponse au sevrage a été étudiée dans deux lignées de porcs divergentes pour la consommation moyenne journalière résiduelle (CMJR). Un total de 132 porcs par lignée, placés en loges collectives, ont reçu un régime en post-sevrage conventionnel (deux phases) ou sécurisant (trois phases). Les poids vifs et diarrhées ont été enregistrés au sevrage (28 jours, J0), à J1, J2, J6, J12, J19, J26 et en fin de post-sevrage (J42). L’ingéré par loge a été enregistré. Aucun antibiotique n’a été distribué. Les porcs de la lignée à CMJR réduite (CMJR–, plus efficaces) étaient plus lourds au sevrage, avec moins de diarrhées à J1 et J2 que les porcelets de la lignée à CMJR haute (CMJR+) (P
Published: 2017

23. Estimation of the effects of selection on French Large White sow and piglet performance during the suckling period

Author: Silalahi, Parsaoran, Tribout, Thierry, Billon, Yvon, Gogué, Jean-Marcel, Bidanel, Jean Pierre, Bogor Agricultural University - IPB (INDONESIA), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Université Paris-Saclay, UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Domaine expérimental Bourges-La Sapinière (BOURGES), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Action innovante du Ministère de l'Agriculture, and Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI)
Subjects: Male, Swine, Colostrum, animal diseases, [SDV]Life Sciences [q-bio], Stillbirth, Animals, Suckling, Eating, Random Allocation, Milk, fluids and secretions, Pregnancy, Animals, Birth Weight, Female, Semen Preservation
Abstract: Autre unité expérimentale impliquée : INRA, UE332 Domaine Expérimental de Bourges; The effects of 21 yr of selection were estimated for sow and piglet performance during the suckling period in a French Large White (LW) pig population using frozen semen. Two experimental groups (EXP = L77 and L98) were produced by inseminating LW sows with either stored frozen semen from 17 LW boars born in 1977 (EXP = L77) or with fresh semen from 23 LW boars born in 1998 (EXP = L98). Seventy-four L77 and 89 L98 randomly chosen females were mated to 15 L77 and 15 L98, respectively, randomly chosen boars for 6 successive parities. They produced 2,796 L77 progeny (G77) and 3,529 L98 progeny (G98) piglets including stillbirths. To disentangle direct and maternal effects on piglet growth, a 2 × 2 factorial design was set by cross-fostering half-litters across genetic groups the day after farrowing, resulting in mixed G77/G98 litters nursed by either L77 or L98 sows. Piglet traits investigated included individual weight at birth (IWB), at 21 d of age (IW21d), and at weaning at 4 wk of age (IWW) and ADG from birth to 21 d of age (ADG21d) and from birth to weaning (ADGBW) as well as probability of stillbirth, probability of mortality on the first day after farrowing and from d 2 to weaning. Sow traits analyzed included weight before farrowing and at weaning, feed intake, milk production, colostrum, and milk composition. The variability of performance across genetic groups and litters was also investigated. The data were analyzed using generalized (piglet mortality) or linear mixed models (other traits). Results showed an increase in IWB (+240 ± 72 g in 21 yr for IWB adjusted for total number born), and a negative maternal genetic trend was observed on piglet growth during the suckling period (e.g., +33 ± 13 g/d in 21 yr for ADG21d, that is, 14% of the mean), whereas direct genetic effects remained unchanged. Piglets from L98 litters also had a 40% larger probability of being stillborn and a 28% larger probability of dying on d 1 and had a more heterogeneous IWB (358 vs. 336 g; P < 0.001) and growth during the suckling period (60 vs. 56 g/d; P < 0.001). Sows from L77 and L98 experimental groups did not differ in weight, feed intake, colostrum, and milk composition. These results give evidence of negative correlated effects of selection for piglet traits related to robustness. These adverse effects are at least partly of maternal origin.
Published: 2017
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24. Preventive GC7 reduces brain death-induce renal injuries in a preclinical porcine model

Author: Giraud, S., Kerforne, T., Couturier, Philippine, Inal, S., Hannaert, P., Tauc, M., Hauet, T., Université de Poitiers - Faculté de Médecine et de Pharmacie, Université de Poitiers, Ischémie Reperfusion en Transplantation d’Organes Mécanismes et Innovations Thérapeutiques ( IRTOMIT), Université de Poitiers-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Biochimie, Département d’Anesthésie-Réanimation, Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Fédération Hospitalo-universitaire SUrvival oPtimization in ORgan Transplantation (FHU SUPORT), Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU TOURS)-Anti-infectieux : supports moléculaires des résistances et innovations thérapeutiques (RESINFIT), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges-Ciblage individuel et prévention des risques de traitements immunosupresseurs et de la transplantation (IPPRITT), CHU Limoges-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)- Ischémie Reperfusion en Transplantation d’Organes Mécanismes et Innovations Thérapeutiques ( IRTOMIT), Université de Poitiers-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Poitiers-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Cellules Dendritiques, Immunomodulation et Greffes, Université de Tours-Université de Tours, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UMR 7370 Laboratoire de Physio-Médecine Moléculaire (LP2M), Université de Nice Sophia-Antipolis (UNSA), MOPICT GenESI, Groupement d'Interet Scientifique - Infrastructures en Biologie Sante et Agronomie ( IBISA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Poitiers, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Poitiers-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Poitiers-Cellules Dendritiques, Immunomodulation et Greffes, Laboratoire de PhysioMédecine Moléculaire (LP2M), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA), ProdInra, Archive Ouverte, Université de Poitiers-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Poitiers-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Anti-infectieux : supports moléculaires des résistances et innovations thérapeutiques (RESINFIT), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-Cellules Dendritiques, Immunomodulation et Greffes, Université de Tours (UT)-Université de Tours (UT)-Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers)-Ciblage individuel et prévention des risques de traitements immunosupresseurs et de la transplantation (IPPRITT), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Anti-infectieux : supports moléculaires des résistances et innovations thérapeutiques (RESINFIT), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-Ciblage individuel et prévention des risques de traitements immunosupresseurs et de la transplantation (IPPRITT), Université de Tours (UT)-Université de Tours (UT), CHU Limoges-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), and Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)- Ischémie Reperfusion en Transplantation d’Organes Mécanismes et Innovations Thérapeutiques ( IRTOMIT)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: N1-guanyl-1,7-diaminoheptane (GC7), an inhibitor of eIF5A, exhibits anti-inflammatory features and promotes anoxic/ischemic tolerance. Thus, GC7 pretreatment could be useful in order to protect organs submitted to ischemia before transplantation in heart-beating donors. Methods: Using a pig brain death donation preclinical model, we carried out the in vivo evaluation of GC7 pre-treatment (3 mg/kg iv bolus), after brain death, at the beginning of the 4 h-reanimation, after which one kidney was collected, cold-stored (18-h in UW), and allo-transplantated in a doublenephrectomized recipient. Groups were defined as follows (n = 6 per group): healthy (Control), untreated Brain death (BD) and GC7-treated BD (GC7). Results: R1. At the end of 4 h-reanimation, GC7 decreased (80–100%, p < 0.05) BD-increased markers: (i) eIF5A hypusination, (ii) tissue levels of reactive oxygen species markers (CellRox staining and Aconitase), (iii) tissue levels of nitrotyrosine, and (iv) the mitochondrial-dependent apoptosis pathway (Bax/Bcl-2 proapoptotic ratio, Caspase-9). In addition, GC7 increased (2 to 6- fold, p < 0.05) the expression of anti-oxidant proteins (SOD2 and HO-1, as well as PGC-1a, Nrf2, and total & p-Sirtuin1 & 3). R2. At the end of cold storage, GC7 treatment normalized BD-dependent decrease of SOD2 and HO-1 proteins expression (p < 0.05). In addition, GC7 significantly restored the BDdependent increase of the Bax/Bcl-2 (proapoptotic) ratio (p < 0.05). Conclusion: After the reanimation phase, preventively given GC7 proved protective for kidneys against brain death-induced injuries; during the cold storage phase, GC7 appeared to preserve antioxidant defences and to protect mitochondria. Early and long-term, post-transplantation propagation of observed protective effects are currently evaluated.
Published: 2016
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25. Handling missing rows in multi-omics data integration: multiple imputation in multiple factor analysis framework

Author: Ignacio González, Laurence Liaubet, Philippe Besse, Valentin Voillet, Magali San Cristobal, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Institut de Mathématiques de Toulouse UMR5219 (IMT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Université de Toulouse (UT), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], and Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI)
Subjects: Male, Proteomics, 0301 basic medicine, Multivariate statistics, Multivariate analysis, multiple imputation, Computer science, [SDV]Life Sciences [q-bio], computer.software_genre, Biochemistry, Missing individuals, multivariate factor analysis, Structural Biology, [MATH.MATH-ST]Mathematics [math]/Statistics [math.ST], Neoplasms, canonical correlation-analysis, Tumor Cells, Cultured, Imputation (statistics), [MATH]Mathematics [math], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Methodology Article, Applied Mathematics, fully conditional specification, Genomics, Analgesics, Non-Narcotic, multiple omics data integration, missing individual, hot-deck imputation, discrete, package, Computer Science Applications, Variable (computer science), Data Interpretation, Statistical, Data mining, Chemical and Drug Induced Liver Injury, Canonical correlation, Row, Data integration, 03 medical and health sciences, Multiple factor analysis, Animals, Humans, [INFO]Computer Science [cs], Rats, Wistar, Molecular Biology, Acetaminophen, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, Reproducibility of Results, Missing data, Rats, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, 030104 developmental biology, Gene Expression Regulation, Multivariate Analysis, Factor Analysis, Statistical, Focus (optics), computer
Abstract: Background In omics data integration studies, it is common, for a variety of reasons, for some individuals to not be present in all data tables. Missing row values are challenging to deal with because most statistical methods cannot be directly applied to incomplete datasets. To overcome this issue, we propose a multiple imputation (MI) approach in a multivariate framework. In this study, we focus on multiple factor analysis (MFA) as a tool to compare and integrate multiple layers of information. MI involves filling the missing rows with plausible values, resulting in M completed datasets. MFA is then applied to each completed dataset to produce M different configurations (the matrices of coordinates of individuals). Finally, the M configurations are combined to yield a single consensus solution. Results We assessed the performance of our method, named MI-MFA, on two real omics datasets. Incomplete artificial datasets with different patterns of missingness were created from these data. The MI-MFA results were compared with two other approaches i.e., regularized iterative MFA (RI-MFA) and mean variable imputation (MVI-MFA). For each configuration resulting from these three strategies, the suitability of the solution was determined against the true MFA configuration obtained from the original data and a comprehensive graphical comparison showing how the MI-, RI- or MVI-MFA configurations diverge from the true configuration was produced. Two approaches i.e., confidence ellipses and convex hulls, to visualize and assess the uncertainty due to missing values were also described. We showed how the areas of ellipses and convex hulls increased with the number of missing individuals. A free and easy-to-use code was proposed to implement the MI-MFA method in the R statistical environment. Conclusions We believe that MI-MFA provides a useful and attractive method for estimating the coordinates of individuals on the first MFA components despite missing rows. MI-MFA configurations were close to the true configuration even when many individuals were missing in several data tables. This method takes into account the uncertainty of MI-MFA configurations induced by the missing rows, thereby allowing the reliability of the results to be evaluated. Electronic supplementary material The online version of this article (doi:10.1186/s12859-016-1273-5) contains supplementary material, which is available to authorized users.
Published: 2016
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26. Transcriptome profiling to predict piglet early development and vitality from umbilical cord blood

Author: Canario, Laurianne, Voillet, Valentin, Iannuccelli, Nathalie, Lippi, Yannick, Billon, Yvon, San Cristobal, Magali, Liaubet, Laurence, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), ANR PORCINET - DGA PENELOPE, École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Transcriptomic impact of Xenobiotics (E23 TRiX), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Plateforme Génome & Transcriptome (GET), Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Plateforme Génome & Transcriptome (GET), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: animal diseases, [SDV.BDD.MOR]Life Sciences [q-bio]/Development Biology/Morphogenesis
Abstract: The objective was to identify molecular predictors of piglet level of vitality and development at birth. The parental genetic influences on early-life traits were analyzed with comparison of purebred and crossbred piglets born in the same litter, from Meishan (MS) or Large White (LW) sows. We used mixed semen from the 2 breeds to inseminate first parity sows. Phenotypes included growth, body mass indexes and indicators of vitality, i.e., reactivity scores, with repeated measurements. The study included litters from 8 LW sows and 9 MS sows producing a total of 245 piglets. Blood samples were collected at birth from the umbilical cord in PAXgene Blood RNA Tube. Transcriptome analyses were carried out with the Agilent 60K microarray on 3 to 8 newborn piglets from each litter, resulting in a total of 21 LWLW, 19 MSLW, 22 LWMS and 19 MSMS samples. Statistical analyses were carried out with restricted maximum likelihood methodology, differential and discriminant analyses. Crossbred piglets from LW sows had a higher early growth than their purebred counterparts (P
Published: 2016

27. Responses to weaning in two pig lines divergently selected on residual feed intake depending on diet

Author: Gilbert, Hélène, Ruesche, Julien, Muller, Nathalie, Billon, Yvon, Robert, F., ROGER, L., Montagne, Lucile, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), CCPA,Centrale Coopérative de Productions Animales (CCPA), European Project: 613574, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Groupe CCPA, École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Subjects: pig, stress, weaning, [SDV]Life Sciences [q-bio], feed efficiency, genetics
Abstract: Responses to weaning in two pig lines divergently selected on residual feed intake depending on diet. 67. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP)
Published: 2016

28. Meiotic pairing and gene expression disturbance in germ cells from an infertile boar with a balanced reciprocal autosome-autosome translocation

Author: Harmonie Barasc, Annabelle Congras, Nicolas Mary, Lidwine Trouilh, Valentine Marquet, Stéphane Ferchaud, Isabelle Raymond-Letron, Anne Calgaro, Anne-Marie Loustau-Dudez, Nathalie Mouney-Bonnet, Hervé Acloque, Alain Ducos, Alain Pinton, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés (LISBP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), STROMALab, Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement Français du Sang-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Etablissement Français du Sang-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement Français du Sang-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: 0301 basic medicine, Male, endocrine system, X Chromosome, [SDV]Life Sciences [q-bio], Sus scrofa, reciprocal translocation, Gene Expression, meiotic, Translocation, Genetic, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Spermatocytes, Testis, Genetics, Animals, meiosis, 030212 general & internal medicine, chromosome, gene, Infertility, Male, Sex Chromosome Aberrations, urogenital system, msci distrubance, genetic, Spermatozoa, recombination, [SDV] Life Sciences [q-bio], Chromosome Pairing, 030104 developmental biology, msuc, Erratum, infertility
Abstract: Individuals carrying balanced constitutional reciprocal translocations generally have a normal phenotype, but often present reproductive disorders. The aim of our research was to analyze the meiotic process in an oligoasthenoteratospermic boar carrying an asymmetric reciprocal translocation involving chromosomes 1 and 14. Different multivalent structures (quadrivalent and trivalent plus univalent) were identified during chromosome pairing analysis. Some of these multivalents were characterized by the presence of unpaired autosomal segments with histone γH2AX accumulation sometimes associated with the XY body. Gene expression in spermatocytes was studied by RNA-DNA-FISH and microarray-based testis transcriptome analysis. Our results revealed a decrease in gene expression for chromosomes 1 and 14 and an up-regulated expression of X-chromosome genes for the translocated boar compared with normal individuals. We hypothesized that the observed meiotic arrest and reproductive failure in this boar might be due to silencing of crucial autosomal genes (MSUC) and disturbance of meiotic sex chromosome inactivation (MSCI). Further analysis revealed abnormal meiotic recombination (frequency and distribution) and the production of a high rate of unbalanced spermatozoa.
Published: 2016
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29. Microbiote intestinal chez le porc : paramètres génétiques de sa composition et liens avec des caractères immunitaires

Author: Estellé, Jordi, Larzul, Catherine, Mach Casellas, Nuria, Levenez, Florence, Ramayo-Caldas, Yuliaxis, MEURENS, François, Mercat, Marie-José, Lemonnier, Gaëtan, Denis, Catherine, Billon, Yvon, Oswald, Isabelle, Doré, Joël, Berri, El Mostafa, Lepage, Patricia, Rogel Gaillard, Claire, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Infectiologie Animale et Santé Publique - IASP (Nouzilly, France), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut du Porc, UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), Institut du Porc (IFIP), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Biosynthèse & Toxicité des Mycotoxines (ToxAlim-BioToMyc), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: Microbiote intestinal chez le porc : paramètres génétiques de sa composition et liens avec des caractères immunitaires. 48. Journées de la Recherche Porcine
Published: 2016

30. Interactions génotype x environnement (climat tempéré vs. tropical) sur les caractères de production et de thermorégulation chez le porc en croissance

Author: Rose, Roseline, Gilbert, Hélène, Renaudeau, David, Giorgi, Mario, Billon, Yvon, Ferchaud, Stephane, Riquet, Juliette, Gourdine, Jean-Luc, Unité de Recherches Zootechniques (URZ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Plateforme Tropicale d'Expérimentation sur l'Animal (PTEA), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), ANR PigHeaT, ANR-12-ADAP-0015, INRA, Département de Génétique animale (A02012 PhenoHeat), La Région Guadeloupe, Europe, FSE, AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Plateforme Tropicale d'Expérimentation sur l'Animal, UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]
Subjects: interaction génotype x environnement, analyse phénotypique, tropical climate, [SDV]Life Sciences [q-bio], climat tempéré, performance de croissance, porc creole, étude comparative, thermotolérance, temperate climate, climat tropical, production, comparative study, porc
Abstract: The aim of this study was to evaluate the effect of two climatic environments (temperate, TEMP vs. tropical humid, TROP) on production and thermoregulation traits. A backcross design with Large White (LW, heat sensitive) and Creole (CR, heat tolerant) pigs was performed. Ten F1 LW x CR boars were mated with 65 LW sows per environment. A total of 1,253 backcross pigs (TEMP: n = 601 pigs from 11 batches; TROP: n =652 pigs from 12 batches) were phenotyped for body weight (every 15 days from week 11 to week 23), feed intake (DFI, from week 11 to 23), backfat thickness (BFT, at weeks 19 and 23), cutaneous temperature (CT, at weeks 19 and 23) and rectal temperature (RT, at weeks 19, 21 and 23). Feed conversion ratio (FCR) was computed for the test period (11 to 23 weeks). The calculation of the temperature-humidity index (THI), which combines the effects of temperature and humidity, showed on average a difference from 2 to 3°C between TEMP and TROP. The ADG and DFI were higher in TEMP than in TROP (830 vs 760 g/d, 2.23 vs 1.83 kg/d, respectively, P < 0.001). Body temperatures were higher in TROP than in TEMP (35.9 vs 34.8°C for CT and 39.5 vs 39.4°C for RT, respectively, P
Published: 2016

31. Etude de la capacité immunitaire chez le porc Large White : recherche de marqueurs génétiques liés à l'expression des gènes dans le sang

Author: Tatiana Maroilley, Ballester Devis, Maria, Lemonnier, Gaetan, Mercat, Marie‐josé, Billon, Yvon, Moroldo, Marco, Rogel-Gaillard, Claire, Estelle Fabrellas, Jordi, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, BIOPORC, Institut du Porc, UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut du Porc (IFIP), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: genomic, qtl, [SDV]Life Sciences [q-bio], snp, production, transcriptome, génétique, porc
Abstract: Combining animal production performances and health traits is a main issue in livestock farming. Blood is emerging as a source of biological information linked to the health and physiological state of each individual. Furthermore, it is an interesting sur rogate tissue for animal phenotyping because its sampling is almost non-invasive and reproducible. We have already shown that several immune parameters are heritable and that the blood transcriptome is informative to quantify some of them. In this study, our aim was to identify genetic markers associated with gene expression variations in the blood, based on an expression genome-wide association study (eGWAS) using 243 Large White pigs at 60 days of age. Each pig was genotyped with the Illumina iSelect 60K Chip and the blood transcriptome analysis was performed by using a custom gene expression 8X60K microarray (Agilent Technologies). 4,591 significant associations between one SNP and one probe were found, including 62% cis-associations (the associated SNP is in a window of 2Mb surrounding the probe). Among the 3,419 probes with at least one associated SNP (eQTL), 70% had a cis-eQTL and 89% could be assigned to a porcine gene. The eQTLs were found to be linked with the expression of one to 51 genes. The genomic regions surrounding the eQTLs correspond to candidate regions to further study thegenetic architecture of immunity trait variations in pigs, and contribute to paving the way towards a qualification of the individual immune capacity for tran slational research in precision pig farming.
Published: 2016

32. Analyse génétique de la réponse à l'ACTH chez le porc, relation avec des caractères de robustesse

Author: Pierre Mormede, Elena Mormede, Laure Gress, Yvon Billon, Stéphane Ferchaud, Catherine Larzul, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI)
Subjects: pig, [SDV]Life Sciences [q-bio], sélection, génétique, cortisol, concentration plasmatique
Abstract: L'axe corticotrope est une composante majeure des régulations métaboliques et des mécanismes biologiques de l'adaptation. L'activité de l'axe corticotrope et sa fonction sont fortement influencées par des facteurs génétiques. Les expériences présentes ont été conçues pour tester l'hypothèse que la sélection génétique pour un axe corticotrope plus actif peut améliorer la robustesse des porcs. Les expériences ont été faites avec des porcs Large White en race pure. Nous avons d'abord confirmé que la réponse du cortisol à l'ACTH est hautement héritable (h2 = 0,68 ± 0,12) dans cette population et peut donc être utilisée pour réaliser une expérience de sélection divergente. Dès la deuxième génération, de grandes différences dans le caractère de sélection ont été obtenues (concentration plasmatique de cortisol post-ACTH : 84,8 vs 127,5 ng/ml dans les lignées basse et haute, respectivement, P < 10-16), mais aussi dans les caractères de reproduction (35% de spermatozoïdes en plus par éjaculat (P = 3.10-4), un taux de mise bas de 11 points de plus (P > 0,10) et 1,5 porcelet vivant de plus par portée (P = 0,06) dans la lignée haute de reproducteurs G1). Les concentrations élevées de cortisol ont eu une influence négative sur la croissance en post-sevrage (418 vs 394 g/jour, P = 0,0013) et en engraissement (799 vs 754 g/jour, P < 0,0001), mais favorable sur la composition de carcasse (TVM : 58,8 vs 60,4%, lignée basse vs lignée haute, P < 0,001). Ces résultats confirment que l’axe corticotrope a des effets contrastés sur les caractères fonctionnels et de production. Ils devront être confirmés dans la 3° génération de sélection en cours et un bilan global sera réalisé avant de pouvoir proposer le test à l’ACTH comme critère de sélection pour obtenir des animaux plus robustes., The adrenocortical axis is a major component of metabolic regulation and biological adaptation processes. Its activity and functions are strongly influenced by genetic factors. The present experiments were designed to address the hypothesis that genetic selection for a more active adrenocortical axis could improve robustness. They were carried out with purebred Large White pigs. We first confirmed that the cortisol response to ACTH is highly heritable (h2 = 0.68 ± 0.12) in this population and can therefore be used for a divergent selection experiment. As early as the second generation of selection, large differences were obtained in the selection trait (post-ACTH plasma cortisol concentration: 84.8 vs 127.5 ng/mL in the low and high lines, respectively, P < 10-16); differences were also obtained in several reproduction traits (35 % more sperm per ejaculate (P = 3.10-4), 11 points higher pregnancy rate (P > 0.10), and 1.5 more piglets born alive per litter (P = 0.06) in the high line). Higher cortisol concentrations had a negative influence on growth rate during both post-weaning (418 vs 394 g/jour, P = 0.0013) and fattening (799 vs 754 g/jour, P < 0.0001) but improved carcass composition (lean%: 58.8 vs 60.4, low vs high line P < 0,001). These results confirm that the adrenocortical axis activity has a contrasted influence on functional and production traits. They have to be confirmed in the third generation for a comprehensive evaluation of the interest of selecting a more active adrenocortical axis to obtain animals that are more robust.
Published: 2016

33. Estimation of the effects of selection on French Large White reproductive performance using frozen semen

Author: Armelle Prunier, Parsaoran Silalahi, J. Gogué, Thierry Tribout, Yvon Billon, Jean Pierre Bidanel, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Bogor Agricultural University - IPB (INDONESIA), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Domaine expérimental Bourges-La Sapinière (BOURGES), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Actions innovantes du Ministère de l'agriculture, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Subjects: Male, 0301 basic medicine, Litter (animal), pig, Litter Size, media_common.quotation_subject, [SDV]Life Sciences [q-bio], Population, frozen semen, Semen, genetic trend, robustness, Breeding, Biology, Andrology, reproduction, 03 medical and health sciences, Animal science, Human fertilization, Pregnancy, Genetics, Animals, Birth Weight, Weaning, porcin, education, Ovulation, Insemination, Artificial, media_common, Cryopreservation, Estrous cycle, education.field_of_study, Body Weight, 0402 animal and dairy science, swine, 04 agricultural and veterinary sciences, General Medicine, 040201 dairy & animal science, robustesse, 030104 developmental biology, sperme congelé, Female, Animal Science and Zoology, Reproduction, Semen Preservation, Food Science
Abstract: Genetic trends for male and female sexual development and components of litter size and weight at birth (LB) as well as traits related to sow lifetime productivity were estimated in a French Large White (LW) pig population using frozen semen. Two experimental groups (EXP = L77 and L98) were produced by inseminating LW sows with either stored frozen semen from 17 LW boars born in 1977 (EXP = L77) or with semen from 23 LW boars born in 1998 (EXP = L98). In each group, about 100 males were measured for testicular development and bulbo-urethral gland development, and 90 gilts were checked for puberty, among which about 50 gilts were measured for their first ovulation rate at puberty (ORP). The females were then mated to 15 randomly chosen males for each group for 6 successive parities and measured for total number born (TNB), number born alive (NBA), litter weight at birth (LWB), and interval from weaning to first estrus as well as ovulation rate at fertilization (ORF = ovulation rate of gestating sows) on a subset of litters. The data were analyzed using mixed linear models including the fixed effects of EXP, of finishing (sexual development traits) or farrowing group, and parity (LB traits); the random effects of birth litter (sexual development traits) or sow (LB traits); and, when relevant, age or BW as covariates. The homogeneity of residual variances across EXP was also tested. For each trait, the genetic trend was estimated as twice the difference between L98 and L77. Limited differences were observed for sexual development traits, except for ORF, which increased by 0.17 ± 0.06/yr. The residual SD of NBA (2.7 vs. 2.0; P = 0.004) and LWB (3.1 vs. 2.5; P = 0.03) were larger in L98 sows than in L77 sows. Positive trends were observed for all litter traits (0.22 ± 0.07 ova, 0.12 ± 0.04 piglet, 0.09 ± 0.04 piglet, and 0.23 ± 0.06 kg/yr for ORF, TNB, NBA, and LWB, respectively) but at the expense of a degradation of prenatal and farrowing survival. A negative trend was also observed for length of productive life (−8.9 ± 3.9 d/yr). These results suggest that gains in productivity were associated with a loss of robustness.
Published: 2016
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34. Influence of the kinetic of brain death (BD) on hemodynamic in a preclinical porcin model

Author: Kerforne, Thomas, Pinsard, Michel, Hebrard, William, Debaene, Bertrand, Mimoz, Olivier, Hauet, Thierry, Ischémie Reperfusion en Transplantation d’Organes Mécanismes et Innovations Thérapeutiques ( IRTOMIT), Université de Poitiers-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Université de Poitiers, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI)
Subjects: animal model, education, heart rate, animal modèle, cerveau, médecine humaine, swine, deces, social sciences, rythme cardiaque, [SDV.MHEP.UN]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Urology and Nephrology, health care economics and organizations, porc
Abstract: Influence of the kinetic of brain death (BD) on hemodynamic in a preclinical porcin model. 17. Congress of the European Society for Organ Transplantation
Published: 2015
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35. Temperate and tropical conditions impact on production and thermoregulatory traits in growing pigs

Author: Rose, Roseline, Gilbert, Hélène, Renaudeau, David, Riquet, Juliette, Giorgi, Mario, Billon, Yvon, Mandonnet, Nathalie, Gourdine, Jean-Luc, Unité de Recherches Zootechniques (URZ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Plateforme Tropicale d'Expérimentation sur l'Animal, UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), ANR PigHeaT, École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Plateforme Tropicale d'Expérimentation sur l'Animal (PTEA), and Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI)
Subjects: pig, région tropicale, croisement d'espèces, climat, [SDV]Life Sciences [q-bio], production animale, livestock farms, race porcine creole, région tempérée, swine, effet de l'environnement, thermotolerance, facteur milieu, température, thermorégulation, large white, porc
Abstract: The aim of the study was to evaluate the effects of two environment (temperate TEMP vs tropical humid TROP) on production trait and thermoregulatory response of genetically linked growing pigs. Large white (LW) pigs were crossed with tropical pigs from the Creole breed (CR), which is less productive but more thermotolerant than LW. A total of 1,296 half-sib backcross, from 10 (LW x CR) boars and about 65 LW sows in each environment were reared in TROP (n=667) and in TEMP (n=629). TROP was characterized by an average daily ambient temperature (T) of 26.0±0.3 °C and an a'erage daily relative humidity (RH) of 84.5±0.5%. The corresponding values for TEMP were 25.1±0.6 °C and 61.2±3.8% respectively. Live body weight (BW) was measured at the beginning of test (week 11), at weeks 19 and 21, and at the end of test (week 23). Backfat thickness (BT) and cutaneous temperature (CT) were measured at weeks 19 and 23. Rectal temperature (RT) was recorded at weeks 19, 21 and 23. Under TROP, the average daily gain (ADG) during the test and BT were lower than under TEMP (718 vs 813 g/d and 14 vs 18 mm, P
Published: 2015

36. Effects of selection on the efficiency and variability of sow reproduction and maternal ability

Author: Silalahi, Parsaoran, Tribout, Thierry, Gogué, J., Billon, Yvon, Bidanel, Jean Pierre, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Bogor Agricultural University - IPB (INDONESIA), Domaine expérimental Bourges-La Sapinière (BOURGES), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, and Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI)
Subjects: reproduction, [SDV]Life Sciences [q-bio], selection, genetic, performance
Abstract: Effects of selection on the efficiency and variability of sow reproduction and maternal ability. 66. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP)
Published: 2015

37. Resistome of pig and rabbit gut microbiota using high-troughput sequencing and qPCR approaches

Author: Achard, Caroline, Dupouy-Guiraute, Véronique, RAMAYO CALDAS, Yuliaxis, Gabinaud, Beatrice, Denis, Catherine, Ballester, Maria, Dile, Benoit, Boucher, Samuel, Chatellier, Stéphane, Le Normand, Bernadette, Manceau, Patrick, Ferchaud, Stephane, Chaubet, Adeline, Esquerre, Diane, Combes, Sylvie, Le Floc'h, Natalie, Bousquet-Mélou, Alain, Zemb, Olivier, Estelle, Jordi, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, LABOVET Conseil, Réseau Cristal, Clinique Vétérinaire des Marchés de Bretagne, UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Département Génétique Animale (DEPT GA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], biochemical phenomena, metabolism, and nutrition, digestive system, humanities
Abstract: Resistome of pig and rabbit gut microbiota using high-troughput sequencing and qPCR approaches. 6. Symposium on Antimicrobial Résistance in Animals and the Environment (ARAE)
Published: 2015

38. Effect of high ambient temperature and genotype on thermoregulatory responses and gene expressionin various tissues in growing pigs

Author: Renaudeau, David, Gourdine, Jean-Luc, Liaubet, Laurence, Gilbert, Hélène, Riquet, Juliette, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Unité de Recherches Zootechniques (URZ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], heat stress, pig, genotype, [SDV]Life Sciences [q-bio], gene expression, thermoregulatory responses
Abstract: Heat stress (HS) in pig production is a critical problem intemperate countries during summer but also in tropical areaswhere pig production dramatically increased over the past 2decades. Physiological and metabolic adjustments resultingfrom the thermoregulatory responses to HS have negative consequenceson pig productivity and health. The objectives of thisexperiment were to improve knowledge on the mechanismsunderlining heat tolerance by comparing thermoregulatoryresponses in 3 different pig genotypes (G). This experimentwas performed on a total of 36 castrated male pigs: 1 genotypesensitive to HS (Large White [LW]), 1 genotype tolerant toHS (Créole [CR]), and a cross between LW and CR pigs. Pigswere housed at 24°C for 10 d and thereafter at 32°C for 5 d.The temperature (T) transition from 24 to 32°C occurred on d0 at a constant rate of 2°C/h. Pigs had free access to water andfeed. Body T and respiratory rate were measured on d –7, –4,and –3 at 24°C and on d 1, 2, 3, 4, and 5 at 32°C. Eighteen pigs(6 per G) were slaughtered on d –2 (before the T transition) andon d 5. At slaughter, blood and 3 tissue samples (backfat [BF],longissimus dorsi [LD], and liver [LI]) were collected. A transcriptomeanalysis was performed on blood and tissues usinga semicustom 60K microarray (GPL16524). Blood hormonesand metabolites were also measured. The T × G interactionwas not significant (P > 0.05) for feed intake and thermoregulatoryresponses (except for skin T). Whatever the G, HS hada significant negative effect on voluntary feed intake (–200 g/don average). The T increase resulted in an increased rectal andskin T and respiratory rate within the first 24 to 72 h of exposureand in a subsequent recovery phase characterized bya rapid decrease of these thermoregulatory responses. Plasmaglucose, lactate, glycerol, and albumin concentrations weresignificantly reduced under HS but creatine concentration increasedat 32°C. Thyroid hormone (triiodothyronine and thyroxine)concentrations were reduced at 32°C. Irrespective tothe G, a considerable number of differentially expressed genes(false discovery rate < 0.05) were found by comparing blood(13,807), LD (6,261), BF (5,236), and LI (435) samples collectedat 24°C with those collected at 32°C. A first functionalanalysis revealed that most of the significantly differentiallyexpressed genes especially in BF and LD were involved in theregulation of the oxidative phosphorylation pathway.
Published: 2015

39. Adaptation to heat in pig production: the genetic pathway

Author: Gourdine, Jean-Luc, Renaudeau, David, Riquet, Juliette, Billon, Yvon, Ferchaud, Stephane, Anais, Caroline, Giorgi, Mario, Gilbert, Hélène, Unité de Recherches Zootechniques (URZ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Plateforme Tropicale d'Expérimentation sur l'Animal (PTEA), ANR-12-ADAP-0015, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: Heat stressed pigs reduce their feed intake which impair their growth or reproduction performances. Managementsolutions are available to attenuate the effect of heat stress on pigs, such as environmental solutions (water orfeeding management). However, these solutions are technically and economically difficult to implement. Thegenetic selection for improving environmental adaptation in pig production is the most promising long termoption.The PigHeaT project aims 1) at identifying QTLs for heat adaptation, by examining direct responses to find genesinvolved in metabolic ways, indirect responses to find genes affecting growth or robustness to environmentalvariations, 2) at better understanding the physiological mechanisms underlying heat adaptation. The PigHeaTproject (http://www6.inra.fr/pigheat_eng/) is based on original biological resources and original experimentalfacilities. The studied population will be a backcross between Large White pigs, productive but poorlythermotolerant breed, and Creole pigs, low productive but highly thermotolerant breed. The progeny issued fromthis backcross will express all possible levels of thermal tolerance and production performances when submitted toheat stress, depending on the alleles received from their parents. High throughput phenotyping, metabolomics onall the progeny, and transcriptomics on a subset of extreme pigs selected on thermal tolerance response, will beapplied. The design benefits from the unique combination of experimental facilities available at INRA: the firstpart of the project will rely on the backcross population raised in the experimental facilities located in the WestIndies (Guadeloupe, tropical environment). The concomitant production of the same population in theexperimental facilities available in temperate France (Charente Maritime) will allow the detection of genetic byenvironment (GxE) effects for the QTL detected in Guadeloupe.The first phenotypic results confirm the effect of environment on zootechnical and thermoregulatory pigperformance. A significant effect of the production environment has been observed on pig’s growth rate, with adifference of about 100 g / d for the temperate environment (820 vs 720 g / d in the tropics) and lower bodytemperatures (39.4 and 34.8 ° C for rectal and skin temperatures vs. 39.5 and 35.9 ° C in the tropics).
Published: 2015

40. Evaluation des effets de la sélection sur l’efficacité reproductive et la variabilité des performances des truies

Author: Silalahi, Parsaoran, Tribout, Thierry, Gogué, Jean-Marcel, Billon, Yvon, Solihin, Dedy Duryadi, Setiadi, Mohamad Agus, Bidanel, Jean Pierre, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Bogor Agricultural University - IPB (INDONESIA), Domaine expérimental Bourges-La Sapinière (BOURGES), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: Evaluation des effets de la sélection sur l’efficacité reproductive et la variabilité des performances des truies. 47. Journées de la Recherche Porcine
Published: 2015

41. Gut microbiota in swine: composition, genetic parameters, and links with immunity and production traits

Author: Estelle Fabrellas, Jordi, Mach Casellas, Nuria, Larzul, Catherine, Berri, El Mostafa, RAMAYO CALDAS, Yuliaxis, Billon, Yvon, Dore, Joel, Lepage, Patricia, Gaillard, Claire, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], UR Infectiologie animale et Santé publique (UR IASP), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], microbiota, swine, genetics, immunity
Abstract: absent
Published: 2015

42. Time course of the response to ACTH in pig: biological and transcriptomic study

Author: Valérie Sautron, Nathalie Villa-Vialaneix, Laure Gress, Laurence Liaubet, Catherine Larzul, Elena Terenina, Yannick Lippi, Yvon Billon, Pierre Mormède, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Transcriptomic impact of Xenobiotics (E23 TRiX), ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Plateforme Génome & Transcriptome (GET), Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT INRA), ANR-12-ADAP-0008,SUSoSTRESS,Génétique moléculaire des réponses de stress et robustesse chez le Porc(2012), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris 13 ( UP13 ), GenPhySE - UMR 1388 ( Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-ENVT, Toxicologie Alimentaire ( UTA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Génétique animale ( G.A. ) -Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage ( PHASE ) -Génétique, Expérimentation et Système Innovants ( GenESI ), Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse ( MIAT INRA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), ANR-12-ADAP-0008,SUSoSTRESS,Génétique moléculaire des réponses de stress et robustesse chez le Porc ( 2012 ), Université Paris 13 (UP13), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Toxicologie Alimentaire (UTA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech
Subjects: Male, medicine.medical_specialty, endocrine system, Microarray, Hydrocortisone, Swine, Time-course, Adrenocorticotropic hormone, Biology, [ SDV.BA ] Life Sciences [q-bio]/Animal biology, Stress, Cortisol, Transcriptome, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Glucocorticoid receptor, Adrenocorticotropic Hormone, Stress, Physiological, Internal medicine, Gene expression, medicine, Genetics, Animals, Hypothalamic-pituitary-adrenal (HPA) axis, 030304 developmental biology, 2. Zero hunger, 0303 health sciences, Pig, Microarray analysis techniques, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, Systems biology, MESSENGER-RNA EXPRESSION, PORCINE GLUCOCORTICOID-RECEPTOR, PITUITARY-ADRENAL AXIS, MEAT QUALITY TRAITS, GENE-EXPRESSION, SYNERGISTIC INTERACTIONS, MOLECULAR-GENETICS, PERIPHERAL-BLOOD, CANDIDATE GENES, IMMUNE-SYSTEM, Kinetics, Endocrinology, Female, FKBP5, 030217 neurology & neurosurgery, hormones, hormone substitutes, and hormone antagonists, medicine.drug, Research Article, Biotechnology
Abstract: Background HPA axis plays a major role in physiological homeostasis. It is also involved in stress and adaptive response to the environment. In farm animals in general and specifically in pigs, breeding strategies have highly favored production traits such as lean growth rate, feed efficiency and prolificacy at the cost of robustness. On the hypothesis that the HPA axis could contribute to the trade-off between robustness and production traits, we have designed this experiment to explore individual variation in the biological response to the main stress hormone, cortisol, in pigs. We used ACTH injections to trigger production of cortisol in 120 juvenile Large White (LW) pigs from 28 litters and the kinetics of the response was measured with biological variables and whole blood gene expression at 4 time points. A multilevel statistical analysis was used to take into account the longitudinal aspect of the data. Results Cortisol level reached its peak 1 h after ACTH injection. White blood cell composition was modified with a decrease of lymphocytes and monocytes and an increase of granulocytes (FDR
Published: 2015
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43. Gut microbiota composition in swine: genetic parameters and links with immunity traits

Author: Estelle Fabrellas, Jordi, Mach Casellas, Nuria, RAMAYO CALDAS, Yuliaxis, Levenez, Florence, Lemonnier, Gaetan, Denis, Catherine, Dore, Joel, Billon, Yvon, Mercat, Marie-José, Larzul, Catherine, Lepage, Patricia, Gaillard, Claire, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Pôle génétique, Institut du Porc (IFIP), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut du Porc, and AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: pig, microbiote, gut microbiota, [SDV]Life Sciences [q-bio], immunity, genetic parameters, porcin, paramètre génétique, immunité
Abstract: absent
Published: 2014

44. Systems biology of piglet maturity with focus on muscle metabolism

Author: Voillet, Valentin, Lefaucheur, Louis, Canario, Laurianne, Pere, Marie-Christine, Paris, Alain, Billon, Yvon, Lippi, Yannick, Quesnel, Hélène, San Cristobal, Magali, Liaubet, Laurence, GenPhySE - UMR 1388 ( Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-ENVT, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] ( PEGASE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Génétique animale ( G.A. ) -Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage ( PHASE ) -Génétique, Expérimentation et Système Innovants ( GenESI ), Toxicologie Alimentaire ( UTA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, ANR-09-GENM005, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Toxicologie Alimentaire (UTA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, ProdInra, Archive Ouverte, École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: In recent decades, there has been improvement of sow prolificacy and body composition but the genetic progress has been accompanied by a substantial increase in piglet mortality before weaning. The most critical period is the first 48 hours after birth. The maturity of piglets, defined as the state of full development for survival at birth, is an important determinant of early mortality. The objective of our project is to take advantage of current knowledge about two pig breeds, Large White piglets with increased mortality and Meishan piglets being more robust at birth. Maturity of several tissues and metabolite profiles of various fluids were analyzed on the fetuses (LW, MS and reciprocal F1) at day 90 and 110 of gestation (birth at day 114).As example, the results of muscle tissue obtained by an integrative approach (with transcriptomic, proteomic and physiological data) will be presented. Muscle tissue plays a key role at birth, not only to provide immediate locomotion particularly to reach the teats, but also because it is involved in thermoregulation through mobilization of energy reserves (especially glycogen).In this context, we identified 5,739 genes (annotated and unique) and 241 differential protein spots using a linear mixed model (Bonferroni adjusted p-value 1%) from which 1,120 genes and 27 proteins are influenced by the interaction between the genotype and the gestational stage. The analysis of the interaction highlighted genes and functions involved in the different neonatal maturity observed between Large White and Meishan. In particular, key genes for gluconeogenesis/glycolysis were over-expressed in Meishan. Furthermore, the analysis revealed that 367 genes were differentially expressed between the reciprocal crossbred fetuses and most of them (288 genes) exhibited a paternal preferential expression.Moreover, we expect to identify biomarkers related to the determinism of the maturity in order to develop a strategy in quantitative genetics.
Published: 2014

45. Des approches multi-omiques pour caractériser la fin du développement foetal et mieux comprendre le déterminisme de la maturité à la naissance en lien avec la survie néonatale

Author: Liaubet , Laurence, Voillet , Valentin, Paris , Alain, Luron , Isabelle, Louveau , Isabelle, Gondret , Florence, Lefaucheur , Louis, Jégou , Maëva, Mormede , Elena, Yammine , Sami, Lippi , Yannick, Canlet , Cecile, Martin , Pascal, Lascor , Christine, Iannuccelli , Nathalie, Billon , Yvon, Canario , Laurianne, San Cristobal , Magali, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Nutrition, Métabolismes et Cancer (NuMeCan), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Toxicologie Alimentaire (UTA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ANR‐09‐GENM005 PORCINET, INRA, Région Midi‐Pyrénées., Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), ProdInra, Archive Ouverte, GenPhySE - UMR 1388 ( Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-ENVT, UR 1341 Alimentation et adaptations digestives, nerveuses et comportementales, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Alimentation Humaine ( ALIM.H ) -Alimentation et adaptations digestives, nerveuses et comportementales ( ADNC ), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] ( PEGASE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Toxicologie Alimentaire ( UTA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Génétique animale ( G.A. ) -Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage ( PHASE ) -Génétique, Expérimentation et Système Innovants ( GenESI )
Subjects: métabolome, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], prédicteur, [SDV]Life Sciences [q-bio], haut débit, identification de gènes, [SDV] Life Sciences [q-bio], développement foetal, fœtus, porcelet, mécanisme biologique, protéome, transcriptome, porc
Abstract: Session : Génétique et qualitéSession : Génétique et qualité; National audience; Selection for high prolificacy and lean growth rate in swine has been associated with a substantial increase in piglet mortality. The first 24‐48 hours after birth represent a critical period for survival. A major determinant for early survival is piglet maturity at birth which relies greatly on the process of tissue maturation during the last month of gestation. The objective of this study was to compare the progenies from Large White (LW) and Meishan (MS) breeds which differ for piglet survival and neonatal mortality.This project proposes multi‐disciplinary and multi‐omic approaches to identify the molecular and genetic basis related to maturity and perinatal survival. The metabolome was analyzed on plasma, urine, and amniotic liquid on 612 fetuses: it displayed higher heterogeneity at the end of gestation. The transcriptome of adrenal glands, muscle, liver, subcutaneous adipose tissue, and small intestine and the proteome of muscle and adipose subcutaneous tissue were analyzed on 64 fetuses. The first analyses identified the biological processes involved in development and maturity, and key genes that may explain the differences observed between LW and MS.
Published: 2014

46. Exhaustive comparison of gene expression along pig small Intestine and in Peyer’s patches performed by RNA-Seq

Author: Mach Casellas, Nuria, Berri, El Mostafa, Esquerre, Diane, Chevaleyre, Claire, Lemonnier, Gaetan, Billon, Yvon, Lepage, Patricia, Oswald, Isabelle P., Dore, Joel, Gaillard, Claire, Estelle Fabrellas, Jordi, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UR Infectiologie animale et Santé publique (UR IASP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Toxicologie Alimentaire (UTA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, UR Infectiologie animale et Santé publique ( UR IASP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), GenPhySE - UMR 1388 ( Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-ENVT, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Génétique animale ( G.A. ) -Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage ( PHASE ) -Génétique, Expérimentation et Système Innovants ( GenESI ), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé humaine ( MICALIS ), Toxicologie Alimentaire ( UTA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, ProdInra, Archive Ouverte, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: absent
Published: 2014

47. Selection for residual feed intake in growing pigs: Effects on sow performance in a tropical climate

Author: Renaudeau, David, Gourdine, Jean-Luc, Fleury, Jérôme, Ferchaud, Stephane, Billon, Yvon, NOBLET, Jean, Gilbert, Hélène, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherches Zootechniques (URZ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Plateforme Tropicale d'Expérimentation sur l'Animal (PTEA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), PIGFEED, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Subjects: pig, residual feed intake, [SDV]Life Sciences [q-bio], tropical environment, lactating sow, thermal stress
Abstract: The aim of the study was to evaluate the consequences of a divergent selection for residual feed intake (RFI) during growth in a temperate environment (TEMP) on sow performance in a tropical environment (TROP). Sows came from a selection experiment conducted at INRA in which 2 lines were selected for larger (RFI(+)) or smaller (RFI(─)) feed intake than predicted from performance. In the first analysis, a subsample of data obtained in TROP conditions (49 lactations) was compared to those obtained in TEMP on their sibs mated with the same boars (54 lactations). In the second analysis, data obtained in the TROP environment (82 lactations) were analyzed for testing the effect of season (warm vs. hot) and line on sow performance. Except for the lactation length, the interaction between line and climatic environment was not significant for the others traits (P > 0.05). The ADFI expressed per kilogram of litter BW gain tended to be higher in the RFI(+) line bred in the TROP environment (P = 0.080), together with piglet BW at weaning, which tended to be lower (P = 0.080). The ADFI was lower in TROP than in TEMP (4.56 vs. 5.86 kg/d; P = 0.003), with negative consequence on litter BW gain and maternal BW loss. The RFI(-) sows tended to eat less feed than RFI(+) sows during lactation (4.55 vs. 5.86 kg/d; P = 0.099). Litter BW at weaning was higher in the RFI(─) line. The RFI(─) sows ate significantly less feed to produce 1 kg of litter than the RFI(+) sows and tended to lose a larger amount of BW during lactation than the RFI(+) sows (2.40 vs. 3.02 kg/kg and -0.66 vs. -0.39 kg/d, respectively, P < 0.10). Whatever the line, ADFI was reduced by about 21% in the hot season (P < 0.05). Litter BW gain was depressed (P < 0.05) in the hot season (1.72 vs. 2.08 kg/d in the warm season; P = 0.023). Lactation maternal BW loss tended to increase in the hot season (1.10 vs. 0.71 kg/d in the warm season; P = 0.016), but back fat loss remained constant (P = 0.295). In the TROP environment, the amount of feed required to produce 1 kg of litter was not influenced by the line in the warm season (2.53 kg/kg on average; P = 0.99), but it tended to be lower in the RFI(─) line when compared to the RFI(+) line in the hot season (2.06 vs. 3.45 kg/kg; P = 0.050). This higher apparent efficiency in RFI(─) sows was mainly related to greater maternal body reserve mobilization (i.e., BW and back fat losses). In conclusion, selection for low RFI during growth in a TEMP environment did not impair sow and litter performance in tropical conditions.
Published: 2014
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48. Mise au point d'outils simples pour qualifier le comportement des truies de types génétiques alternatifs

Author: Ferchaud, Stephane, DUBOIS, Aude, Meunier-Salaun, Marie-Christine, Boulot, Sylviane, ROINSARD, Antoine, MAUPERTUIS, Florence, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ferme expérimentale des Trinottières, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut du Porc (IFIP), Institut Technique de l'Agriculture Biologique (ITAB), Chambre d'Agriculture de Loire-Atlantique (CA 44), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut du Porc
Subjects: Animal biology, Truies, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, Biologie animale, Environmental and Society, types génétiques, comportement, œstrus, tests comportementaux, Environnement et Société, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society
Abstract: Le comportement de truies de types génétiques alternatifs a été évalué à l’aide de 3 tests reproductibles et généralisables. Les résultats obtenus (bonne manifestation de l’œstrus, absence d’agressivité envers l’homme) montrent que ces truies sont utilisables en élevages. Partenaires impliqués : Chambre Régionale d’agriculture des pays de la Loire, Florence Maupertuis, Aude Dubois - Chambre d’agriculture de Maine et Loire, Ferme expérimentale des Trinottières, Denis Olivier - INRA GenESI, Stéphane Ferchaud, Patrick Manceau, Yoann Bailly - INRA Senah, Marie-Christine Meunier-Salaün - IFIP, Sylviane Boulot, Valérie Courboulay[br/] Projets et programmes de recherche dans lequel/lesquels le projet s’intègre : DUROC plein air bio, Région Pays de La Loire - Crédit incitatif INRA Phase, Film d’illustration du comportement maternel de la truie
Published: 2013

49. Successful training of AI boars is associated with specific behavioural patterns

Author: Ferchaud, Stephane, Fazilleau, Quentin, Furstoss, Vincent, Courboulay, V., Salaun, Marie-Christine, Boulot, S., UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), UE 1373 Fourrages Environnement Ruminants Lusignan, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Biologie et Amélioration des Plantes (BAP)-Fourrages Environnement Ruminants Lusignan (FERLUS), Institut du Porc, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Fourrages Environnement Ruminants Lusignan (FERLUS), Institut du Porc (IFIP), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], behavioural patterns, boars
Abstract: absent
Published: 2013

50. Extensive comparison of genome wide transcription along pig small intestine and in Peyer’s patces by RNA-seq

Author: Mach Casellas, Nuria, Berri, El Mostafa, Esquerre, Diane, Lemonnier, Gaetan, Billon, Yvon, Lepage, Patricia, Oswald, Isabelle, Dore, Joel, Gaillard, Claire, Estelle Fabrellas, Jordi, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UR Infectiologie animale et Santé publique (UR IASP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Toxicologie Alimentaire (UTA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, UR Infectiologie animale et Santé publique ( UR IASP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), GenPhySE - UMR 1388 ( Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-ENVT, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Génétique animale ( G.A. ) -Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage ( PHASE ) -Génétique, Expérimentation et Système Innovants ( GenESI ), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé humaine ( MICALIS ), Toxicologie Alimentaire ( UTA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: absent
Published: 2013

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