1. Biodechlord : à la recherche de traces de dégradation microbienne du chlordécone dans les sols contaminés des Antilles
- Author
-
Fabrice Martin, Chloé Merlin, Stéphane Vuilleumier, Imfeld, G., Timothy Vogel, Sébastien Cecillon, Achouak, W., Pierre Benoit, Laure Mamy, Christian Mougin, Dominique Patureau, Chovelon, J. M., Stéphane Pesce, Edgardo Ugarte, Denis Le Paslier, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Génétique moléculaire, génomique, microbiologie (GMGM), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UMR 7156 GMGM, Ampère, Département Bioingénierie (BioIng), Ampère, École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement [Narbonne] (LBE), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon, Milieux aquatiques, écologie et pollutions (UR MALY), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), ProdInra, Archive Ouverte, Ampère (AMPERE), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-École Centrale de Lyon (ECL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, École Centrale de Lyon ( ECL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ), Environnement et Grandes Cultures ( EGC ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Santé des plantes et environnement ( S.P.E. ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés ( PESSAC ), UR 0050 Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement, Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement [Narbonne] ( LBE ), Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Microbiologie et Chaîne Alimentaire ( MICA ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Milieux aquatiques, écologie et pollutions ( UR MALY ), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] ( GENOSCOPE ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,chlordecone ,contamination ,[ SDV ] Life Sciences [q-bio] ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,French West Indies ,microbial degradation - Abstract
Session 5 - Milieux impactés / Impacted mediaSession 5 - Milieux impactés / Impacted media; Objectives: Chlordecone was intensively used in the French West Indies (FWI) to control the banana weewil. Recent surveys showed that arable soils cropped with banana, representing up to 20,000 ha, are contaminated this insecticide with concentrations ranging between 0.2 and 37.4 mg kg−1. Chlordecone was classified as a persistent organic pollutant in May 2009. It is not only contaminating soil resources but also water resources where it is often detected. This insecticide is bioaccumulated in different plant and animals thereby contaminating the food chain causing an important human health. This contaminant is recalcitrant to biodegradation and very few information is available on microbial degradation of chlordecone in soils and almost nothing in the soil of the French West Indies. In this context, the program of research Biodechlord funded by the INRA (National Institute of Agronomical Research) in the framework the National Plan for Chlordecone (PNAC), was aiming at searching for traces of chlordecone microbial degradation in FWI soils. This project relied on a multidisciplinary approach developed by a broad scientific consortium involving researchers from CEA, Ecole Centrale Lyon, INRA, Irstea, Strasbourg and Lyon Universities. This program was made of several approaches consisting in (i) in silico analyses aiming at (ia) classifying chlordecone and its known metabolites using the QSAR Typol in order to define hypotheses on possible degradation pathways (ib) searching for microbial genes coding deshalogenases in genomic databank that could be used to dechlorinate chlordecone; (ii) chemical analyses aiming at (iia) optimizing approaches to quantify chlordecone and its main metabolites in soils, (iib) identify chemical processes (photodegradation and photocatalysis) that can be used to transform chlordecone; (iii) search for microbes tolerant to chlordecone able to grow on it under aerobic or anaerobic conditions; (iv) characterize the impact of chlordecone on soil microbial communities using soil metagenomics. A synthesis of the work carried out in the framework of Biodechlord will be presented. Innovative nature of the proposed topic: Very little information is available on the processes involved in the transformation of chlordecone in the contaminated soils of the French West Indies. Regarding to the environmental and the human health problems caused by the pollutant there is an urgent to document this question. The Biodechlord project proposed to search for chemical and microbial processes possibly involved in chlordecone transformation in the contaminated soils of the French West Indies. Among the results accumulated by the Biodechlord project, results about the isolation of microbial cultures tolerant to chlordecone will be highlighted.
- Published
- 2014