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20 results on '"Chantal Missirian"'

1. Novel Exon-Skipping Therapeutic Approach for the DMD Gene Based on Asymptomatic Deletions of Exon 49

Author: Mario Abaji, Svetlana Gorokhova, Nathalie Da Silva, Tiffany Busa, Maude Grelet, Chantal Missirian, Sabine Sigaudy, Nicole Philip, France Leturcq, Nicolas Lévy, Martin Krahn, Marc Bartoli, Marseille medical genetics - Centre de génétique médicale de Marseille (MMG), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Intercommunal Toulon-La Seyne sur Mer - Hôpital Sainte-Musse, CIC Cochin Pasteur (CIC 1417), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôtel-Dieu-Groupe hospitalier Broca-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM], and Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: muscular dystrophy, therapy, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, Muscle Fibers, Skeletal, Exons, Oligonucleotides, Antisense, Dystrophin, Muscular Dystrophy, Duchenne, AON, genetics, pathological mechanisms, DMD, deletion, exon skipping, myopathy, Humans, Genetics (clinical)
Abstract: International audience; Exon skipping is a promising therapeutic approach. One important condition for this approach is that the exon-skipped form of the gene can at least partially perform the required function and lead to improvement of the phenotype. It is therefore critical to identify the exons that can be skipped without a significant deleterious effect on the protein function. Pathogenic variants in the DMD gene are responsible for Duchenne muscular dystrophy (DMD). We report for the first time a deletion of the in-frame exon 49 associated with a strikingly normal muscular phenotype. Based on this observation, and on previously known therapeutic approaches using exon skipping in DMD for other single exons, we aimed to extend the clinical use of exon skipping for patients carrying truncating mutations in exon 49. We first determined the precise genomic position of the exon 49 deletion in our patients. We then demonstrated the feasibility of skipping exon 49 using an in vitro AON (antisense oligonucleotide) approach in human myotubes carrying a truncating pathogenic variant as well as in healthy ones. This work is a proof of concept aiming to expand exon-skipping approaches for DMD exon 49.
Published: 2022

2. Developmental trajectories of neuroanatomical alterations associated with the 16p11.2 Copy Number Variations

Author: Alonso, Cárdenas-de-la-Parra, Sandra, Martin-Brevet, Clara, Moreau, Borja, Rodriguez-Herreros, Vladimir, S Fonov, Anne, M Maillard, Nicole, R Zürcher, 2 European Consortium, 16p11., Nouchine Hadjikhani 48, Jacques, S Beckmann 49, Alexandre Reymond 50, Bogdan Draganski 51, Sébastien Jacquemont 52, D Louis Collins 1, Marie-Claude Addor, 7, Joris Andrieux, 8, Benoît Arveiler, 9, Geneviève Baujatm 10, Frédérique Sloan-Bénan 11, Marco, Belfiore, Dominique Bonneau 12, Sonia Bouquillon 13, Odile Boute 14, Brusco, Alfredo, Tiffany Busa 16, Jean-Hubert Caberg 17, Dominique Campion 18, Vanessa Colombert 19, Marie-Pierre Cordier 20, Albert David 21, François-Guillaume Debray 22, Marie-Ange Delrue 23, Martine Doco-Fenzy 24, Ulrike Dunkhase-Heinl 25, Patrick Edery 20, Christina Fagerberg 26, Laurence Faivre 27, Francesca, Forzano, David Genevieve 29, Marion Gérard 30, Giachino, Daniela Francesca, Agnès Guichet 32, Olivier Guillin 33, Delphine Héron 34, Bertrand Isidor 21, Aurélia Jacquette 34, Sylvie Jaillard 35, Hubert Journel 19, Boris Keren 36, Didier Lacombe, 9, Sébastien Lebon 37, Cédric Le Caignec 38, Marie-Pierre Lemaître 39, James Lespinasse 40, Michèle Mathieu-Dramart 41, Sandra Mercier 21, Cyril Mignot 34, Chantal Missirian 16, Florence Petit 42, Kristina Pilekær Sørensen 26, Lucile Pinson 29, Ghislaine Plessis 30, Fabienne Prieur 43, Caroline Rooryck-Thambo 44, Rossi, Massimiliano, Damien Sanlaville 45, Britta Schlott Kristiansen 26, Caroline Schluth-Bolard 45, Marianne Till 20, Mieke Van Haelst 46, Lionel Van Maldergem, Centre Hospitalier Universitaire Vaudois [Lausanne] (CHUV), UNIROUEN - UFR Santé (UNIROUEN UFR Santé), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), McConnell Brain Imaging Centre (MNI), Montreal Neurological Institute and Hospital, McGill University = Université McGill [Montréal, Canada]-McGill University = Université McGill [Montréal, Canada], Ecophysiologie Végétale, Agronomie et Nutritions (EVA), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Athinoula A. Martinos Center for Biomedical Imaging, Massachusetts General Hospital [Boston]-Harvard Medical School [Boston] (HMS), Human Genetics, Université de Lausanne (UNIL), Service de génétique médicale, Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, EHESP-Irset (EHESP-Irset), École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP), CHU Pontchaillou [Rennes], National Institute of Child Health and Human Development, National Institute on Drug Abuse, 3388, MIRI Brain Canada, 201803PJT 400528 BSB, IVADO fund: a Canadian Institute of Health Research, Fonds de Recherche Nature et technologies du Québec, Roger De Spoelberch, Partridge Foundations, National Institute of Mental Health, N01-MH9-0002, National Institute of Neurological Disorders and Stroke, 33CS30-148401, National Science Foundation, MOP-111169, Canadian Institutes of Health Research, 31003A_160203, Schweizerischer Nationalfonds zur F&#x00F6, rderung der Wissenschaftlichen Forschung, Horizon 2020, Fondation Leenaards, and McGill University-McGill University
Subjects: Adult, Adolescent, DNA Copy Number Variations, Cognitive Neuroscience, Biology, computer.software_genre, 050105 experimental psychology, Imaging, White matter, Young Adult, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Neuroimaging, Voxel, Chromosome Duplication, Gene duplication, medicine, Genetics, Humans, 0501 psychology and cognitive sciences, Copy-number variation, Child, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 16p11.2 Copy number variants, Brain development, Neurodevelopmental disorders, Normative growth trajectories, [SCCO.NEUR]Cognitive science/Neuroscience, 05 social sciences, Brain, medicine.anatomical_structure, Neurology, Evolutionary biology, Child, Preschool, Endophenotype, Human genome, Chromosome Deletion, Insula, computer, Chromosomes, Human, Pair 16, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: Most of human genome is present in two copies (maternal and paternal). However, segments of the genome can be deleted or duplicated, and many of these genomic variations (known as Copy Number Variants) are associated with psychiatric disorders. 16p11.2 copy number variants (breakpoint 4–5) confer high risk for neurodevelopmental disorders and are associated with structural brain alterations of large effect-size. Methods used in previous studies were unable to investigate the onset of these alterations and whether they evolve with age. In this study, we aim at characterizing age-related effects of 16p11.2 copy number variants by analyzing a group with a broad age range including younger individuals. A large normative developmental dataset was used to accurately adjust for effects of age. We normalized volumes of segmented brain regions as well as volumes of each voxel defined by tensor-based morphometry. Results show that the total intracranial volumes, the global gray and white matter volumes are respectively higher and lower in deletion and duplication carriers compared to control subjects at 4.5 years of age. These differences remain stable through childhood, adolescence and adulthood until 23 years of age (range: 0.5 to 1.0 Z-score). Voxel-based results are consistent with previous findings in 16p11.2 copy number variant carriers, including increased volume in the calcarine cortex and insula in deletions, compared to controls, with an inverse effect in duplication carriers (1.0 Z-score). All large effect-size voxel-based differences are present at 4.5 years and seem to remain stable until the age of 23. Our results highlight the stability of a neuroimaging endophenotype over 2 decades during which neurodevelopmental symptoms evolve at a rapid pace.
Published: 2019

3. Prenatal findings in 1p36 deletion syndrome: New cases and a literature review

Author: Bérénice Hervé, Kamran Moradkhani, Marianne Till, François Vialard, Chantal Missirian, Nathalie Douet-Guilbert, Martine Doco-Fenzy, Clémence Jacquin, Pauline Jaeger, Anne-Claude Tabet, Valérie Malan, Sylvia Redon, Céline Dupont, Sarah Guterman, Claire Beneteau, centre hospitalier intercommunal de Poissy/Saint-Germain-en-Laye - CHIPS [Poissy], Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines - UFR Sciences de la santé Simone Veil (UVSQ Santé), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Hôpital Robert Debré Paris, Hôpital Robert Debré, Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Hospices Civils de Lyon (HCL), Gamètes, implantation, gestation (GIG), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), SFR CAP Santé (Champagne-Ardenne Picardie Santé), and Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)
Subjects: 0301 basic medicine, Adult, Pediatrics, medicine.medical_specialty, Microarray, Chromosome Disorders, 030105 genetics & heredity, 03 medical and health sciences, Young Adult, 0302 clinical medicine, Pregnancy, Retrognathia, Prenatal Diagnosis, medicine, Humans, Abnormalities, Multiple, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, Genetics (clinical), Retrospective Studies, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, 030219 obstetrics & reproductive medicine, 1p36 deletion syndrome, business.industry, Cytogenetics, Obstetrics and Gynecology, Retrospective cohort study, [SDV.BDLR]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology, medicine.disease, Microarray Analysis, 3. Good health, Chromosomes, Human, Pair 1, Karyotyping, Female, France, Abnormality, Chromosome Deletion, business, Ventriculomegaly
Abstract: International audience; Objective/Method 1p36 deletion syndrome is considered to be the most common deletion after 22q11.2 deletion. It is characterized by specific facial features, developmental delay, and organ defects. The primary objective of the present multicenter study was to survey all the cases of 1p36 deletion diagnosed prenatally by French cytogenetics laboratories using a chromosomal microarray. We then compared these new cases with the literature data. Results Ten new cases were reported. On average, the 1p36 deletion was diagnosed at 19 weeks of gestation. The size of the deletion ranged from 1.6 to 16 Mb. The 1p36 deletion was the only chromosomal abnormality in eight cases and was associated with a complex chromosome 1 rearrangement in the two remaining cases. The invasive diagnostic procedure had always been prompted by abnormal ultrasound findings: elevated nuchal translucency, structural brain abnormality, retrognathia, or a cardiac defect. Multiple anomalies were present in all cases. Discussion We conclude that 1p36 deletion is not associated with any specific prenatal signs. We suggest that a prenatal observation of ventriculomegaly, congenital heart defect, or facial dysmorphism should prompt the clinician to consider a diagnosis of 1p36 deletion syndrome.
Published: 2019

4. Chromosomal microarray analysis in fetuses with an isolated congenital heart defect: A retrospective, nationwide, multicenter study in France

Author: Chantal Missirian, Sylvie Jaillard, Valérie Malan, Marianne Till, Paul Kuentz, Claire Beneteau, Brigitte Simon-Bouy, Marguerite Hureaux, François Vialard, Nathalie Marle, Nicolas Gruchy, Bérénice Hervé, Laurent Salomon, Morgane Plutino, Fabienne Prieur, Lucie Tosca, Caroline Rooryck, Céline Dupont, Charles Coutton, Caroline Schluth-Bolard, Sarah Guterman, Mylène Valduga, Damien Sanlaville, Sylvie Redon, Jacques Puechberty, CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines - UFR Sciences de la santé Simone Veil (UVSQ Santé), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Service de gynécologie et obstétrique [CHI Poissy-Saint Germain], CHI Poissy-Saint-Germain, Gamètes, implantation, gestation (GIG), centre hospitalier intercommunal de Poissy/Saint-Germain-en-Laye - CHIPS [Poissy], Hospices Civils de Lyon (HCL), CHU Pontchaillou [Rennes], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Centre Hospitalier Universitaire de Nancy (CHU Nancy), Laboratoire de Génétique Chromosomique [CHU de Grenoble], CHU Grenoble, Pôle Couple-Enfant, Département de Génétique et Procréation, Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne), Centre Hospitalier Versailles, 78000 Le Chesnay, France, parent, Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), CHU Bordeaux [Bordeaux], CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Laboratoire de Génétique Chromosomique et Moléculaire [CHU Dijon], Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), AP-HP - Hôpital Antoine Béclère [Clamart], Hôpital Robert Debré Paris, Hôpital Robert Debré, CHU Montpellier, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), and Université Sorbonne Paris Cité (USPC)
Subjects: 0301 basic medicine, Adult, Heart Defects, Congenital, medicine.medical_specialty, Microarray, DNA Copy Number Variations, Prenatal diagnosis, 030105 genetics & heredity, ULTRASOUND FINDINGS, FREQUENCY, Chromosomes, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Fetus, Pregnancy, Internal medicine, Prenatal Diagnosis, Alagille syndrome, medicine, Humans, Copy-number variation, Genetic Testing, PRENATAL-DIAGNOSIS, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, Genetics (clinical), Kleefstra Syndrome, Retrospective Studies, Chromosome Aberrations, Comparative Genomic Hybridization, 030219 obstetrics & reproductive medicine, business.industry, ABNORMALITIES, Obstetrics and Gynecology, Chromosome, Karyotype, [SDV.BDLR]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology, Syndrome, medicine.disease, Microarray Analysis, 3. Good health, COPY NUMBER, [SDV.GEN.GH]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics, Karyotyping, Female, France, business, HYBRIDIZATION
Abstract: International audience; Objectives Congenital heart defects (CHDs) may be isolated or associated with other malformations. The use of chromosome microarray (CMA) can increase the genetic diagnostic yield for CHDs by between 4% and 10%. The objective of this study was to evaluate the value of CMA after the prenatal diagnosis of an isolated CHD. Methods In a retrospective, nationwide study performed in France, we collected data on all cases of isolated CHD that had been explored using CMAs in 2015. Results A total of 239 fetuses were included and 33 copy number variations (CNVs) were reported; 19 were considered to be pathogenic, six were variants of unknown significance, and eight were benign variants. The anomaly detection rate was 10.4% overall but ranged from 0% to 16.7% as a function of the isolated CHD in question. The known CNVs were 22q11.21 deletions (n = 10), 22q11.21 duplications (n = 2), 8p23 deletions (n = 2), an Alagille syndrome (n = 1), and a Kleefstra syndrome (n = 1). Conclusion The additional diagnostic yield was clinically significant (3.1%), even when anomalies in the 22q11.21 region were not taken into account. Hence, patients with a suspected isolated CHD and a normal karyotype must be screened for chromosome anomalies other than 22q11.21 duplications and deletions.
Published: 2019

5. Whole genome paired-end sequencing elucidates functional and phenotypic consequences of balanced chromosomal rearrangement in patients with developmental disorders

Author: Brigitte Gilbert-Dussardier, Patrick Edery, Flavie Diguet, Géraldine Joly-Hélas, Fanny Morice-Picard, Nicolas Chatron, Jeanne Amiel, Fabienne Prieur, Jérome Toutain, Sandra Whalen, Marine Lebrun, Gwenaël Nadeau, Sylvie Jaillard, Céline Pebrel-Richard, Annabelle Chaussenot, Bénédicte Demeer, Florence Demurger, Sophie Dupuis-Girod, Marianne Till, Nicole Philip, Jacques Puechberty, Laurent Pasquier, Pierre-Antoine Rollat-Farnier, Claire Bardel, Anne-Marie Guerrot, Anne-Claude Tabet, Sylvie Odent, Annick Toutain, Alain Verloes, Jean-Michel Dupont, Christine Coubes, Aziza Lebbar, Yline Capri, Bertrand Isidor, James Lespinasse, Didier Lacombe, Julie Masson, Sophie Blesson, Marine Houlier, Véronique Paquis-Flucklinger, Michèle Mathieu-Dramard, Florence Amblard, Patrick Callier, Jonathan Levy, Chantal Missirian, Véronique Satre, Marie-France Portnoï, Cyril Mignot, Stéphanie Valence, Catherine Sarret, Sébastien Moutton, Françoise Devillard, Alice Masurel-Paulet, Caroline Schluth-Bolard, Patrick Collignon, Jean-Pierre Siffroi, Marie-Pierre Cordier, Renaud Touraine, Marlène Rio, Céline Dupont, Cédric Le Caignec, Damien Sanlaville, Audrey Putoux, Morgane Plutino, Valérie Kremer, Valérie Malan, Martine Doco-Fenzy, Alexandra Afenjar, Caroline Rooryck-Thambo, Massimiliano Rossi, Linda Pons, Gaetan Lesca, Laurence Faivre, Laboratoire de Biologie Moléculaire de la Cellule (LBMC), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center (CRNL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Génétique [CHU Lyon] (Centre de pathologie de l'Est), Hospices civils de Lyon (HCL), CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Département de génétique et procréation, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Hôpital Couple-Enfant, Service de Génétique Médicale [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Département de génétique [Robert Debré], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris], Service de Génétique Médicale, Centre Hospitalier Intercommunal, Toulon, Hôpital Femme Mère Enfant [CHU - HCL] (HFME), Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Service de génétique médicale, CHU Amiens-Picardie, Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement (IRCAN), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA), Génétique médicale [Centre Hospitalier de Vannes], Centre hospitalier Bretagne Atlantique (Morbihan) (CHBA), Pôle Couple-Enfant, Département de Génétique et Procréation, Centre de génétique et Centre de référence maladies rares et anomalies du développement et syndromes malformatifs du Centre Est, Département de Génétique et Procréation UF-Hôpital Couple Enfant de Grenoble-CHU Grenoble, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Cochin [AP-HP], Service de Génétique, Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hôpital Louis Pradel [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Groupe Hospitalier Est, Génétique Médicale, Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers)-Centre de Référence Anomalies du Développement Ouest, CHU Rouen, Normandie Université (NU), Service de génétique médicale - Unité de génétique clinique [Nantes], Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), CHU Pontchaillou [Rennes], Service de génétique [Rouen], Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Université de Bordeaux (UB), Service de Génétique Clinique Chromosomique et Moléculaire, CHU Saint-Etienne, Université de Lyon, Département de Génétique Chromosomique, Bâtiment Hôtel Dieu - Centre Hospitalier de Chambéry, École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes), Laboratoire Histologie Embryologie Cytogénétique [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM], Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Marseille medical genetics - Centre de génétique médicale de Marseille (MMG), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Service de Cytogénétique, Centre hospitalier de Valence, CHU Clermont-Ferrand, Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université Nice Sophia Antipolis - Faculté de Médecine (UNS UFR Médecine), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA), Dept of Immunology, Genetics and Pathology, Service de Génétique Clinique (CHU de Saint-Etienne), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne), Institut de génétique humaine (IGH), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de néphrologie pédiatrique [CHU Necker], CHU Bordeaux [Bordeaux], Institut Pascal (IP), SIGMA Clermont (SIGMA Clermont)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Service de génétique et embryologie médicales [CHU Trousseau], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service de cytogénétique constitutionnelle, Hospices Civils de Lyon (HCL)-CHU de Lyon-Centre Neuroscience et Recherche, Service de génétique, CHU Saint-Etienne-Hôpital nord, Service de génétique [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau, Physiopathologie et neuroprotection des atteintes du cerveau en développement, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de génétique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), French National Agency for Research, French Ministry of Health, École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Maladies génétiques d'expression pédiatrique (U933), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Trousseau [APHP], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université d'Angers (UA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU), Hôpital Bretonneau-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU TOURS), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), and Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)
Subjects: Adult, Male, 0301 basic medicine, Candidate gene, Adolescent, DNA Copy Number Variations, Developmental Disabilities, 030105 genetics & heredity, Genome, Translocation, Genetic, Structural variation, Chromosome Breakpoints, Structure-Activity Relationship, Young Adult, 03 medical and health sciences, symbols.namesake, position effect, Genetics, Humans, Child, Gene, Genetic Association Studies, Genetics (clinical), Paired-end tag, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, chromosomal rearrangements, Chromosome Aberrations, Gene Rearrangement, Whole genome sequencing, Sanger sequencing, whole genome sequencing, biology, structural variation, Infant, NFIX, Phenotype, 030104 developmental biology, [SDV.GEN.GH]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics, intellectual disability, Child, Preschool, biology.protein, symbols, Female, Biomarkers
Abstract: BackgroundBalanced chromosomal rearrangements associated with abnormal phenotype are rare events, but may be challenging for genetic counselling, since molecular characterisation of breakpoints is not performed routinely. We used next-generation sequencing to characterise breakpoints of balanced chromosomal rearrangements at the molecular level in patients with intellectual disability and/or congenital anomalies.MethodsBreakpoints were characterised by a paired-end low depth whole genome sequencing (WGS) strategy and validated by Sanger sequencing. Expression study of disrupted and neighbouring genes was performed by RT-qPCR from blood or lymphoblastoid cell line RNA.ResultsAmong the 55 patients included (41 reciprocal translocations, 4 inversions, 2 insertions and 8 complex chromosomal rearrangements), we were able to detect 89% of chromosomal rearrangements (49/55). Molecular signatures at the breakpoints suggested that DNA breaks arose randomly and that there was no major influence of repeated elements. Non-homologous end-joining appeared as the main mechanism of repair (55% of rearrangements). A diagnosis could be established in 22/49 patients (44.8%), 15 by gene disruption (KANSL1, FOXP1, SPRED1, TLK2, MBD5, DMD, AUTS2, MEIS2, MEF2C, NRXN1, NFIX, SYNGAP1, GHR, ZMIZ1) and 7 by position effect (DLX5, MEF2C, BCL11B, SATB2, ZMIZ1). In addition, 16 new candidate genes were identified. Systematic gene expression studies further supported these results. We also showed the contribution of topologically associated domain maps to WGS data interpretation.ConclusionPaired-end WGS is a valid strategy and may be used for structural variation characterisation in a clinical setting.
Published: 2019

6. Risk estimation of uniparental disomy of chromosome 14 or 15 in a fetus with a parent carrying a non‐homologous Robertsonian translocation. Should we still perform prenatal diagnosis?

Author: Sébastien Schmitt, Philippe Vago, Marie-Laure Maurin, Gregory Egea, Denise Molina Gomes, Emmanuelle Haquet, Marine Lebrun, Jacques Puechberty, François Vialard, Olivier Pichon, Perrine Malzac, Philippe Jonveaux, Martine Doco-Fenzy, Paul Kuentz, Sandra Chantot-Bastaraud, Kamran Moradkhani, Jean-Paul Bonnefont, Caroline Janel, Jean-Michel Dupont, Pierre Boisseau, Jean-Pierre Siffroi, Cédric Le Caignec, Anne-Laure Fauret-Amsellem, Damien Sanlaville, Chantal Missirian, Carole Goumy, Agnès Guichet, Marie-Christine Manca-Pellissier, Renaud Touraine, Laurence Cuisset, Pascale Saugier-Veber, Nicolas Gruchy, Houda Hamdi-Rozé, Bénédicte Duban-Bedu, Bruno Delobel, N. Joye, Isabelle Creveaux, Ines Harzallah, Frédéric Bilan, Philippe Gosset, Marie-Pierre Audrézet, Laboratoire de cytogénétique [CHU Nantes] (Service de génétique médicale), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Depatment Biochemical Genetics, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Physiopathologie et pharmacologie cellulaires et moléculaires, Université de Nantes (UN)-IFR26-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Gatonero SA, Service de Génétique Clinique Chromosomique et Moléculaire, Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), CHU Pontchaillou [Rennes], Service d'histologie, embryologie et cytogénétique [Béclère], Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Antoine Béclère [Clamart], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Laboratoire de cytogénétique prénatale [CHU Caen], Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Espace éthique méditerranéen, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Service de Génétique, Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Génétique, génomique fonctionnelle et biotechnologies (UMR 1078) (GGB), EFS-Université de Brest (UBO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), Université de Brest (UBO), Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques (GPMCND), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de génétique [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Hôpital Robert Debré, Hôpital Robert Debré-Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Laboratoire de génétique chromosomique [Hôpital de la Timone - APHM], Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Service de parasitologie et mycologie [CHRU de Besançon], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Université Grenoble Alpes - UFR Pharmacie (UGA UFRP), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Service de génétique [Angers], Université d'Angers (UA)-Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Laboratoire de Biochimie, Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA), CHU Clermont-Ferrand, Histologie Embryologie Cytogénétique, Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Faculté de Médecine, CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut de génétique humaine (IGH), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Montpellier, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Maladies génétiques d'expression pédiatrique (U933), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Centre de Génétique Chromosomique [Hôpital Saint Vincent de Paul], Hôpital Saint Vincent de Paul-Groupement des Hôpitaux de l'Institut Catholique de Lille (GHICL), Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL), Centre de Génétique Chromosomique, Génétique Médicale, CHU Clermont-Ferrand-CHU Estaing [Clermont-Ferrand], Imagerie Moléculaire et Stratégies Théranostiques (IMoST), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Département de biologie de la reproduction et de gynécologie [CHIPS, Poissy], Centre hospitalier intercommunal de Poissy/Saint-Germain-en-Laye - CHIPS [Poissy], CHI Poissy-Saint-Germain, Gamètes, implantation, gestation (GIG), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Cochin [AP-HP], Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux (NGERE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Hémostase et Remodelage Vasculaire Post-Ischémie (HERVI - EA 3801), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA), Laboratoire de Cytogénétique Constitutionnelle [Hospices civils de Lyon], Hospices Civils de Lyon (HCL), Service de génétique médicale - Unité de génétique clinique [Nantes], Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), CHU Saint-Etienne, Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne), CHU Saint-Etienne-Hôpital Nord - Saint-Etienne, Service de génétique et embryologie médicales [CHU Trousseau], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), centre hospitalier intercommunal de Poissy/Saint-Germain-en-Laye - CHIPS [Poissy], Physiopathologie des maladies génétiques d'expression pédiatrique (UMRS_933), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), Université de Brest (UBO)-Université de Brest (UBO)-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), GHICL-Hôpital Saint Vincent de Paul, Hôpital Saint Vincent de Paul-GHICL, Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de Biologie de la Reproduction, and Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Adult, Male, 0301 basic medicine, medicine.medical_specialty, congenital, hereditary, and neonatal diseases and abnormalities, Robertsonian translocation, Chromosomal translocation, Prenatal diagnosis, 030105 genetics & heredity, [SDV.MHEP.GEO]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Gynecology and obstetrics, medicine.disease_cause, Risk Assessment, Translocation, Genetic, Miscarriage, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Pregnancy, Prenatal Diagnosis, medicine, Humans, Genetics (clinical), Retrospective Studies, Chromosomes, Human, Pair 14, Chromosomes, Human, Pair 15, Fetus, 030219 obstetrics & reproductive medicine, Obstetrics, business.industry, Obstetrics and Gynecology, Chromosome, Uniparental Disomy, medicine.disease, Uniparental disomy, 3. Good health, [SDV.GEN.GH]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics, Female, business
Abstract: International audience; Objective: Uniparental disomy (UPD) testing is currently recommended during pregnancy in fetuses carrying a balanced Robertsonian translocation (ROB) involving chromosome 14 or 15, both chromosomes containing imprinted genes. The overall risk that such a fetus presents a UPD has been previously estimated to be around ~0.6‐0.8%. However, because UPD are rare events and this estimate has been calculated from a number of studies of limited size, we have reevaluated the risk of UPD in fetuses for whom one of the parents was known to carry a nonhomologous ROB (NHROB).Method: We focused our multicentric study on NHROB involving chromosome 14 and/or 15. A total of 1747 UPD testing were performed in fetuses during pregnancy for the presence of UPD(14) and/or UPD(15).Result: All fetuses were negative except one with a UPD(14) associated with a maternally inherited rob(13;14).Conclusion: Considering these data, the risk of UPD following prenatal diagnosis of an inherited ROB involving chromosome 14 and/or 15 could be estimated to be around 0.06%, far less than the previous estimation. Importantly, the risk of miscarriage following an invasive prenatal sampling is higher than the risk of UPD. Therefore, we do not recommend prenatal testing for UPD for these pregnancies and parents should be reassured.
Published: 2019

7. Further delineation of the MECP2 duplication syndrome phenotype in 59 French male patients, with a particular focus on morphological and neurological features

Author: Sophie Scheidecker, Françoise Devillard, Gaetan Lesca, Maryline Carneiro, Christèle Dubourg, Ganaëlle Remerand, Catherine Badens, Odile Boespflug-Tanguy, Nathalie Marle, Serge Romana, Nadia Bahi-Buisson, Jean-Paul Bonnefont, Hubert Journel, Bénédicte Duban-Bedu, Brigitte Gilbert-Dussardier, Mathilde Nizon, Nathalie Perreton, Sophie Julia, Cyril Goizet, Delphine Héron, Véronique Satre, Marguerite Miguet, Joris Andrieux, Pierre-Simon Jouk, Laurence Perrin, Renaud Touraine, Ghislaine Plessis, Dominique Martin-Coignard, Caroline Rooryck, Catherine Vincent-Delorme, Laurence Faivre, Salima El Chehadeh, Thierry Bienvenu, Jean-Luc Alessandri, Anne-Claude Tabet, Laurent Pasquier, Martine Raynaud, Réseau AChro-Puce, Marjolaine Willems, Bruno Leheup, Marianne Till, Jeanne Amiel, Jacqueline Vigneron, Nicole Philip, Valérie Kremer, Massimiliano Rossi, Boris Keren, Annick Toutain, Fabienne Prieur, Bertrand Isidor, Séverine Drunat, Marilyn Lackmy-Port-Lis, Albert David, Christel Thauvin-Robinet, Damien Sanlaville, Laetitia Lambert, Lydie Burglen, Klaus Dieterich, Catherine Sarret, Anne Moncla, Didier Lacombe, Fanny Laffargue, Kim Maincent, Marlène Rio, Clarisse Baumann, Mathilde Lefebvre, Sabine Sigaudy, Laurent Guibaud, Adeline Vigouroux, Valérie Malan, Patrick Callier, Chantal Missirian, Christophe Philippe, Christine Francannet, Anne-Laure Mosca-Boidron, Valérie Cormier-Daire, Cédric Le Caignec, Vincent des Portes, Charles Coutton, Alexandra Afenjar, Sandrine Chantot-Bastaraud, Julien Thevenon, Mylène Béri-Dexheimer, Hilde Van Esch, Bernard Echenne, Jean-Marie Cuisset, Jean-Michel Pedespan, Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), FHU TRANSLAD (CHU de Dijon), Service de Génétique Médicale [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de Génétique Clinique (CHU de Saint-Etienne), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne), Service de Génétique Clinique [CHU Rennes] (Réseau de Génétique et Génomique Médicale), Hôpitaux Universitaires du Grand Ouest, Laboratoire de Génétique Moléculaire & Génomique [CHU Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Service de génétique médicale [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Image Guided Clinical Neurosciences and Connectomics (IGCNC), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA), Service de Génétique Médicale [CHU Clermont-Ferrand], CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Service de neuropédiatrie et maladies métaboliques [CHU Robert-Debré], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré, Service de génétique médicale - Unité de génétique clinique [Nantes], Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Service de Génétique Médicale [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Laboratoire de Génétique Médicale (CHU de Nancy), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Service de neuro-pédiatrie (CHRU de Lille), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Laboratoire de Génétique Médicale, Hopital Jeanne de Flandre, Service de Génétique [CHU Caen], Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Service de génétique [Tours], Hôpital Bretonneau-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Service de Radiologie [Hôpital Femme Mère Enfant - HCL], Hôpital Femme Mère Enfant [CHU - HCL] (HFME), Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Service de génétique clinique [CHU Necker], Département de neurologie pédiatrique [CHRU Montpellier], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Génétique médicale [Centre Hospitalier de Vannes], Centre hospitalier Bretagne Atlantique (Morbihan) (CHBA), Service de génétique et embryologie médicales [CHU Trousseau], CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Biochimie et biologie moléculaire, Hôpital Cochin [AP-HP], Service de génétique clinique [Debré], Dynamique Cellulaire et Tissulaire- Interdisciplinarité, Modèles & Microscopies (TIMC-IMAG-DyCTiM), Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble - UMR 5525 (TIMC-IMAG), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Maladies rares, génétique et métabolisme / Rare Diseases, Genetics and Metabolism, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École de sage femme - Groupe hospitalier Pellegrin - CHU de Bordeaux, Service de Génétique Médicale du CHU de Bordeaux, Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM], Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de génétique chromosomique [Hôpital de la Timone - APHM], Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Laboratoire de Biologie Moléculaire (MARSEILLE - Biolo Moléculaire), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), CIC 1407, Hospices Civils de Lyon (HCL), Service de neurologie pédiatrique [CHU de Bordeaux], CHU de Bordeaux Pellegrin [Bordeaux], Clinique de Génétique médicale Guy Fontaine [CHRU LIlle], Centre de Génétique Chromosomique [Hôpital Saint Vincent de Paul], GHICL-Hôpital Saint Vincent de Paul, Service de Neuropédiatrie [CHU Necker - Enfants Malades], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion (CHU La Réunion), Laboratoire de génétique médicale et cytogénétique [Le Mans], Centre Hospitalier Le Mans (CH Le Mans), Service de Génétique [HCL Groupement Hospitalier Est], Groupement hospitalier Lyon-Est, Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Génétique Moléculaire [CHU Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Laboratoire de Génétique Chromosomique et Moléculaire [CHU Dijon], Sarcomes osseux et remodelage des tissus calcifiés - Phy-Os [Nantes - INSERM U1238] (Phy-Os), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Université Bretagne Loire (UBL), Laboratoire de Cytogénétique Constitutionnelle [Hospices civils de Lyon], Service de Neurologie Pédiatrique [CHU Lyon], Service Génétique Médicale [CHU Poitiers], Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Service de génétique médicale [Montpellier], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Hôpital Arnaud de Villeneuve, Centre for Human Genetics, University Hospitals Leuven [Leuven], Institut des Sciences cognitives Marc Jeannerod - Laboratoire sur le langage, le cerveau et la cognition (L2C2), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, Centre de référence des déficiences intellectuelles de causes rares (Hospices Civils de Lyon), Hospices civils de Lyon (HCL), Equipe GAD (LNC - U1231), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), Service de génétique clinique [Rennes], Université de Rennes (UR)-CHU Pontchaillou [Rennes]-hôpital Sud, Laboratoire de génétique moléculaire et génomique médicale [CHU Rennes], Service Génétique Médicale [CHU Toulouse], Institut Fédératif de Biologie (IFB), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau, Dynamiques Cellulaire et Tissulaire - Interdisciplinarité, Modélisation & Microscopie (TIMC-IMAG-DyCTiM2), Hôpital Saint Vincent de Paul-Groupement des Hôpitaux de l'Institut Catholique de Lille (GHICL), Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL), Groupement Hospitalier Lyon-Est (GHE), Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center (CRNL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Bretagne Loire (UBL)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU TOURS)
Subjects: 0301 basic medicine, Pediatrics, medicine.medical_specialty, MECP2 duplication syndrome, MECP2gene, Scoliosis, MECP2duplication syndrome, 03 medical and health sciences, Epilepsy, 0302 clinical medicine, Gene duplication, Genetics, medicine, Spasticity, Genetics (clinical), X-linked, Vasomotor, business.industry, facial dysmorphism, medicine.disease, Gait, Hypotonia, 3. Good health, 030104 developmental biology, Xq28 duplication, [SDV.GEN.GH]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics, medicine.symptom, business, 030217 neurology & neurosurgery, genetic counselling
Abstract: The Xq28 duplication involving theMECP2gene (MECP2duplication) has been mainly described in male patients with severe developmental delay (DD) associated with spasticity, stereotypic movements and recurrent infections. Nevertheless, only a few series have been published. We aimed to better describe the phenotype of this condition, with a focus on morphological and neurological features. Through a national collaborative study, we report a large French series of 59 affected males with interstitialMECP2duplication. Most of the patients (93%) shared similar facial features, which evolved with age (midface hypoplasia, narrow and prominent nasal bridge, thick lower lip, large prominent ears), thick hair, livedo of the limbs, tapered fingers, small feet and vasomotor troubles. Early hypotonia and global DD were constant, with 21% of patients unable to walk. In patients able to stand, lower limbs weakness and spasticity led to a singular standing habitus: flexion of the knees, broad-based stance with pseudo-ataxic gait. Scoliosis was frequent (53%), such as divergent strabismus (76%) and hypermetropia (54%), stereotypic movements (89%), without obvious social withdrawal and decreased pain sensitivity (78%). Most of the patients did not develop expressive language, 35% saying few words. Epilepsy was frequent (59%), with a mean onset around 7.4 years of age, and often (62%) drug-resistant. Other medical issues were frequent: constipation (78%), and recurrent infections (89%), mainly lung. We delineate the clinical phenotype ofMECP2duplication syndrome in a large series of 59 males. Pulmonary hypertension appeared as a cause of early death in these patients, advocating its screening early in life.
Published: 2018

8. The role of CNVs in the etiology of rare autosomal recessive disorders: the example of TRAPPC9-associated intellectual disability

Author: Yannis Duffourd, Chantal Missirian, Dominique P. Germain, Jacques Puechberty, Damien Sanlaville, Christine Coubes, Tiffany Busa, Laurent Villard, Jérémie Mortreux, Hélène Tevissen, Nicole Philip, Pierre Cacciagli, Vincent Gatinois, JM Pinard, Gwenaël Nadeau, Marseille medical genetics - Centre de génétique médicale de Marseille (MMG), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM], Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Raymond Poincaré [AP-HP], Service de Cytogénétique, Centre hospitalier de Valence, Institut de génétique humaine (IGH), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Génétique Clinique, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), CHU Montpellier, FHU TRANSLAD (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Equipe GAD (LNC - U1231), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Service de neurologie pédiatrique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Raymond Poincaré [AP-HP], Centre Hospitalier de Valence (CH DE VALENCE), Service de Cytogénétique (HFME), Hôpital Femme Mère Enfant [CHU - HCL] (HFME), Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), We thank the families for their cooperation. We also thank all the lab technicians involved in this research. Affymetrix microarrays were processed in the Microarray Core Facility of the Institute in Regenerative Medicine and Biotherapy, CHRU-INSERM-UM Montpellier, http://irmb.chu-montpellier.fr., Villard, Laurent, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU), Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), and Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Adult, Male, 0301 basic medicine, MESH: Intellectual Disability/genetics, medicine.medical_specialty, Microcephaly, DNA Copy Number Variations, [SDV]Life Sciences [q-bio], Genes, Recessive, [SDV.GEN] Life Sciences [q-bio]/Genetics, Brief Communication, MESH: Abnormalities, Multiple/genetics, 03 medical and health sciences, Cytogenetics, Intellectual Disability, Intellectual disability, Genetics, medicine, Humans, Abnormalities, Multiple, [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Allele, Child, Gene, Genetics (clinical), [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, business.industry, Medical genetics, Neurodevelopmental disorders, Syndrome, medicine.disease, Phenotype, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], 030104 developmental biology, Child, Preschool, Etiology, Intercellular Signaling Peptides and Proteins, Female, MESH: DNA Copy Number Variations, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Carrier Proteins, business, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: IF 3.636 (2017); International audience; IntroductionA large number of genes involved in autosomal recessive forms of intellectual disability (ID) were identified over the past few years through whole-exome sequencing (WES) or whole-genome sequencing in consanguineous families. Disease-associated variants in TRAPPC9 were reported in eight multiplex consanguineous sibships from different ethnic backgrounds, and led to the delineation of the phenotype. Affected patients have microcephaly, obesity, normal motor development, severe ID, and language impairment and brain anomalies.PatientsWe report six new patients recruited through a national collaborative network.ResultsIn the two patients heterozygous for a copy-number variation (CNV), the phenotype was clinically relevant with regard to the literature, which prompted to sequence the second allele, leading to identification of disease-associated variants in both. The third patient was homozygote for an intragenic TRAPPC9 CNV. The phenotype of the patients reported was concordant with the literature. Recent reports emphasized the role of CNVs in the etiology of rare recessive disorders.ConclusionThis study demonstrates that CNVs significantly contribute to the mutational spectrum of TRAPPC9 gene, and also confirms the interest of combining WES with CNV analysis to provide a molecular diagnosis to patients with rare Mendelian disorders.
Published: 2018

9. Interphase FISH for BCR-ABL1 rearrangement on neutrophils: A decisive tool to discriminate a lymphoid blast crisis of chronic myeloid leukemia from a de novo BCR-ABL1 positive acute lymphoblastic leukemia

Author: Estelle Balducci, Hélène Zattara, Gérard Michel, Chantal Missirian, Emilie Alazard, Marie Loosveld, Ilhem Rahal, Marina Lafage-Pochitaloff, John Boudjarane, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy (CIML), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU), Aix-Marseille Université - Faculté de médecine (AMU MED), Aix Marseille Université (AMU), Marseille medical genetics - Centre de génétique médicale de Marseille (MMG), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM], Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Franche-Comté Électronique Mécanique, Thermique et Optique - Sciences et Technologies (UMR 6174) (FEMTO-ST), Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Génétique, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU)
Subjects: Cancer Research, Blast Crisis, lymphoid blast crisis, Lymphoblastic Leukemia, acute lymphoblastic leukemia, Biology, 03 medical and health sciences, Bcr abl1, 0302 clinical medicine, neutrophils, chronic myeloid leukemia, hemic and lymphatic diseases, medicine, fluorescence in situ hybridization, medicine.diagnostic_test, Myeloid leukemia, Blood neutrophils, Hematology, General Medicine, BCR-ABL1, Oncology, [SDV.GEN.GH]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics, 030220 oncology & carcinogenesis, Cancer research, %22">Fish , Interphase, 030215 immunology, Fluorescence in situ hybridization
Abstract: Discrimination between lymphoid blast crisis of chronic myeloid leukemia (CML) and de novo BCR-ABL1 positive acute lymphoblastic leukemia (ALL) represents a diagnostic challenge because this distinction has a major incidence on the management of patients. Here, we report an uncommon pediatric case of ALL with cryptic ins(22;9)(q11;q34q34) and p190-type BCR-ABL1 transcript. We performed interphase fluorescence in situ hybridization (FISH) for BCR-ABL1 rearrangement on blood neutrophils, which was positive consistent with the diagnosis of lymphoid blast crisis of CML. This case illustrates the major interest of interphase FISH for BCR-ABL1 rearrangement on blood neutrophils as a decisive method to discriminate a lymphoid blast crisis of CML from a de novo BCR-ABL1 positive ALL.
Published: 2018

10. FOXC1 haploinsufficiency due to 6p25 deletion in a patient with rapidly progressing aortic valve disease

Author: Emilie Faure, Nicole Philip, Tiffany Busa, Caroline Ovaert, Loïc Macé, Mathieu Milh, Florent Paoli, Chantal Missirian, Stéphane Zaffran, Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle (GMGF), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM], Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de pédiatrie et neurologie pédiatrique, Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Heart Defects, Congenital, 0301 basic medicine, Aortic valve disease, Aortic valve, medicine.medical_specialty, Heart Valve Diseases, Haploinsufficiency, 6p25 deletion, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Bicuspid Aortic Valve Disease, Aortic valve replacement, Internal medicine, medicine, Humans, Abnormalities, Multiple, genetics, Eye Abnormalities, Genetics (clinical), Cardiac lesion, Genetics, biology, business.industry, Forkhead Transcription Factors, aortic valve disease, medicine.disease, Facial appearance, Phenotype, 030104 developmental biology, medicine.anatomical_structure, Gene Expression Regulation, [SDV.GEN.GH]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics, Aortic Valve, Child, Preschool, cardiovascular system, 030221 ophthalmology & optometry, Cardiology, biology.protein, Chromosomes, Human, Pair 6, Female, FOXC1, Chromosome Deletion, business, FOXC2, Aortic valve dysplasia
Abstract: International audience; 6p25 deletion is a rare but well-known entity. The main clinical features include an abnormal facial appearance, developmental delay, and ocular anomalies. Cardiac anomalies are frequently seen but remain poorly delineated. We describe a 4-year-old girl with 6p25.3 deletion, which includes the FOXC1 gene, typical dysmorphic features associated with developmental delay and oculo-motor anomalies. Aortic valve dysplasia was diagnosed early in life. The cardiac lesion progressed very rapidly between the age of 3 and 4 years requiring aortic valve replacement. Genomic analysis of blood and excised valve tissue showed down-regulation of FOXC1 but also FOXC2 expression in the diseased aortic valve. This allows us to speculate on the potential role of FOXC1 in aortic valve anomalies.
Published: 2017

11. A framework to identify contributing genes in patients with Phelan-McDermid syndrome

Author: Anne-Claude Tabet, Thomas Rolland, Marie Ducloy, Jonathan Lévy, Julien Buratti, Alexandre Mathieu, Damien Haye, Laurence Perrin, Céline Dupont, Sandrine Passemard, Yline Capri, Alain Verloes, Séverine Drunat, Boris Keren, Cyril Mignot, Isabelle Marey, Aurélia Jacquette, Sandra Whalen, Eva Pipiras, Brigitte Benzacken, Sandra Chantot-Bastaraud, Alexandra Afenjar, Delphine Héron, Cédric Le Caignec, Claire Beneteau, Olivier Pichon, Bertrand Isidor, Albert David, Laila El Khattabi, Stephan Kemeny, Laetitia Gouas, Philippe Vago, Anne-Laure Mosca-Boidron, Laurence Faivre, Chantal Missirian, Nicole Philip, Damien Sanlaville, Patrick Edery, Véronique Satre, Charles Coutton, Françoise Devillard, Klaus Dieterich, Marie-Laure Vuillaume, Caroline Rooryck, Didier Lacombe, Lucile Pinson, Vincent Gatinois, Jacques Puechberty, Jean Chiesa, James Lespinasse, Christèle Dubourg, Chloé Quelin, Mélanie Fradin, Hubert Journel, Annick Toutain, Dominique Martin, Abdelamdjid Benmansour, Claire S. Leblond, Roberto Toro, Frédérique Amsellem, Richard Delorme, Thomas Bourgeron, AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Génétique humaine et fonctions cognitives - Human Genetics and Cognitive Functions (GHFC (UMR_3571 / U-Pasteur_1)), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Sorbonne Paris Cité (USPC), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Hôpital Jean Verdier [AP-HP], CHU Trousseau [APHP], Service de génétique médicale - Unité de génétique clinique [Nantes], Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), AP-HP - Hôpital Cochin Broca Hôtel Dieu [Paris], CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, Laboratoire de cytogénétique (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), CHU Dijon, Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM], Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hospices Civils de Lyon (HCL), Service de génétique [Hôpial Louis Pradel - HCL], Hôpital Louis Pradel [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Service de génétique médicale, Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Service de génétique médicale [Montpellier], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Hôpital Arnaud de Villeneuve, Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes), Institut des Biomolécules Max Mousseron [Pôle Chimie Balard] (IBMM), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Métropole Savoie [Chambéry], Service de génétique clinique [Rennes], Université de Rennes (UR)-CHU Pontchaillou [Rennes]-hôpital Sud, Hôpital Chubert, Service de génétique [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau, Centre Hospitalier Le Mans (CH Le Mans), Service de psychopathologie de l'enfant et de l'adolescent, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), This work was funded by the Institut Pasteur, the Bettencourt-Schueller Foundation, Centre National de la Recherche Scientifique, University Paris Diderot, the Conny-Maeva Charitable Foundation, the Cognacq Jay Foundation, the Orange Foundation, the FondaMental Foundation, the GenMed Labex and the BioPsy Labex. The research leading to these results has received funding from the ERA-Net NEURON Cofund Programme under 'Horizon 2020' (SynPathy project), the ANR SynDivAutism, the Human Brain Project, and from the Innovative Medicines Initiative Joint Undertaking under grant agreement no. 115300, resources of which are composed of financial contribution from the European Union’s Seventh Framework Program (FP7/2007-2013) and EFPIA companies’ in kind contribution., We are grateful to the families for participating in this study. We thank Isabelle Cloëz-Tayarani, Ksenia Bagrintseva and Gaël Millot for helpful discussions and careful reading of the manuscript. This study was funded by a French partnership between the Clinical Research Department of the AP-HP Institution and the Institut Pasteur. It was also supported by the PMS French association (Mrs Meunier), ANR-10-LABX-0013,GENMED,Medical Genomics(2010), ANR-11-IDEX-0004,SUPER,Sorbonne Universités à Paris pour l'Enseignement et la Recherche(2011), ANR-13-SAMA-0006,SynDivAutism,Diversité Synaptique dans l'autisme(2013), European Project: 291840,EC:FP7:HEALTH,FP7-ERANET-2011-RTD,ERA-NET NEURON II(2012), European Project: 115300,EC:FP7:SP1-JTI,IMI-JU-03-2010,EU-AIMS(2012), Institut Pasteur [Paris]-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Génétique Cytogénétique et Embryologie [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service de génétique et embryologie médicales [CHU Trousseau], Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CHU Pontchaillou [Rennes]-hôpital Sud, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Montpellier (UM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM), Hôpital Bretonneau-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Département de génétique [Robert Debré], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris], Service de génétique, cytogénétique, embryologie [Pitié-Salpétrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Service Histologie-embryologie-cytogénétique, Université Paris 13 (UP13)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Marseille medical genetics - Centre de génétique médicale de Marseille (MMG), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU), Laboratoire de Cytogénétique Constitutionnelle [Hospices civils de Lyon], CHU de Lyon, Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Universitaire Carémeau [Nîmes] (CHU Nîmes), Centre Hospitalier de Chambéry (C.H.de Chambéry), Génétique médicale [Centre Hospitalier de Vannes], Centre hospitalier Bretagne Atlantique (Morbihan) (CHBA), Service Psychiatrie de l'Enfant et de l'Adolescent, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré, Herrada, Anthony, Medical Genomics - - GENMED2010 - ANR-10-LABX-0013 - LABX - VALID, Sorbonne Universités à Paris pour l'Enseignement et la Recherche - - SUPER2011 - ANR-11-IDEX-0004 - IDEX - VALID, Santé Mentale et Addictions - Diversité Synaptique dans l'autisme - - SynDivAutism2013 - ANR-13-SAMA-0006 - SAMENTA - VALID, Network of European funding for Neuroscience research - ERA-NET NEURON II - - EC:FP7:HEALTH2012-01-01 - 2015-12-31 - 291840 - VALID, European Autism Interventions - A Multicentre Study for Developing New Medications - EU-AIMS - - EC:FP7:SP1-JTI2012-04-01 - 2017-03-31 - 115300 - VALID, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pasteur [Paris]-Université de Paris (UP), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: lcsh:Genetics, lcsh:QH426-470, [SDV.GEN.GH]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], lcsh:R, Neurodevelopmental disorders, lcsh:Medicine, [SDV.BBM.GTP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], Clinical genetics, [SDV.GEN.GH] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics
Abstract: International audience; Phelan-McDermid syndrome (PMS) is characterized by a variety of clinical symptoms with heterogeneous degrees of severity, including intellectual disability (ID), absent or delayed speech, and autism spectrum disorders (ASD). It results from a deletion of the distal part of chromosome 22q13 that in most cases includes theSHANK3gene.SHANK3is considered a major gene for PMS, but the factors that modulate the severity of the syndrome remain largely unknown. In this study, we investigated 85 patients with different 22q13 rearrangements (78 deletions and 7 duplications). We first explored the clinical features associated with PMS, and provide evidence for frequent corpus callosum abnormalities in 28% of 35 patients with brain imaging data. We then mapped several candidate genomic regions at the 22q13 region associated with high risk of clinical features, and suggest a second locus at 22q13 associated with absence of speech. Finally, in some cases, we identified additional clinically relevant copy-number variants (CNVs) at loci associated with ASD, such as 16p11.2 and 15q11q13, which could modulate the severity of the syndrome. We also report an inheritedSHANK3deletion transmitted to five affected daughters by a mother without ID nor ASD, suggesting that some individuals could compensate for such mutations. In summary, we shed light on the genotype-phenotype relationship of patients with PMS, a step towards the identification of compensatory mechanisms for a better prognosis and possibly treatments of patients with neurodevelopmental disorders.
Published: 2017

12. Clinical and Molecular Findings in 39 Patients with KBG Syndrome Caused by Deletion or Mutation of ANKRD11

Author: Aurélia Jacquette, Alice Goldenberg, Thierry Frebourg, Julien Thevenon, David Geneviève, Anne-Marie Guerrot, Andrée Delahaye-Duriez, Yline Capri, Bruno Leheup, François Lecoquierre, Florence Riccardi, Tiffany Busa, Laurent Villard, Pierre Cacciagli, Vincent Gatinois, Julien Mancini, Chantal Missirian, Lionel Van Maldergem, Massimiliano Rossi, Laurence Perrin, Catherine Vincent-Delorme, Pascale Saugier-Veber, Philippe Khau Van Kien, Gwenaël Nadeau, Annick Toutain, Alain Verloes, Sandrine Marlin, Rolph Pfundt, Elise Schaefer, Arthur Sorlin, Vincent Michaud, Christel Thauvin-Robinet, Philippe Parent, Cyril Mignot, Charles Coutton, Nicole Philip, Véronique Satre, Aude Tessier, Service de génétique [Rouen], CHU Rouen-Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle ( GMGF ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Department of Human Genetics, Département de génétique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Hôpital Jean Verdier, Génétique du cancer et des maladies neuropsychiatriques ( GMFC ), Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), CHU Rouen, Cellules souches mésenchymateuses, environnement articulaire et immunothérapies de la polyarthrite rhumatoide, Université Montpellier 1 ( UM1 ) -IFR3-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service de Génétique Cytogénétique et Embryologie [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nîmes ( CHRU Nîmes ), Service de Génétique Médicale [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy ( CHRU Nancy ), CHU Trousseau [APHP], Physiopathologie et neuroprotection des atteintes du cerveau en développement, Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), École Supérieure des Géomètres et Topographes ( ESGT CNAM ), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] ( CNAM ), Laboratoire de Géodésie et de Géomatique ( L2G ESGT CNAM ), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] ( CNAM ) -Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] ( CNAM ) -Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] ( CNAM ), Service de Cytogénétique, Centre hospitalier de Valence, Centre de Référence des Déficiences Intellectuelles de Causes Rares, Centre Interdisciplinaire de Nanoscience de Marseille ( CINaM ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre de recherche en neurosciences de Lyon ( CRNL ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de génétique [Tours], Hôpital Bretonneau-CHRU Tours, Service de Génétique, Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), AGeing and IMagery ( AGIM ), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 ( UPMF ) -Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de génétique [Robert Debré], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Centre de Maladies Rares, Anomalies du Développement Nord de France-CH Arras - CHRU Lille, Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale ( SESSTIM ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -ORS PACA-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Institut Paoli Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC), Biostatistique et technologies de l'information et de la communication (BioSTIC) - [Hôpital de la Timone - APHM] ( BiosTIC ), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale ( SESSTIM ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -ORS PACA-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -ORS PACA-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle (GMGF), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Radboud University Medical Center [Nijmegen], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Génétique du cancer et des maladies neuropsychiatriques (GMFC), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU de Bordeaux Pellegrin [Bordeaux], Centre Interdisciplinaire de Nanoscience de Marseille (CINaM), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), AGeing and IMagery (AGIM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF), Département de génétique [Robert Debré], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris], Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U912 INSERM - Aix Marseille Univ - IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU), Institut Paoli-Calmettes, Biostatistique et technologies de l'information et de la communication (BioSTIC) - [Hôpital de la Timone - APHM] (BiosTIC ), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center (CRNL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Gall, Valérie, Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-École pratique des hautes études (EPHE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Hôpital Bretonneau-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), and Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)
Subjects: Male, 0301 basic medicine, 030105 genetics & heredity, medicine.disease_cause, Bioinformatics, Intellectual disability, Child, Genetics (clinical), Genetics, Comparative Genomic Hybridization, Mutation, Middle Aged, KBG syndrome, Phenotype, [ SDV.BBM.GTP ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], Child, Preschool, [SDV.BBM.GTP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], Female, Chromosome Deletion, medicine.symptom, Haploinsufficiency, Adult, Adolescent, Biology, Malignancy, Short stature, ANKRD11, Young Adult, 03 medical and health sciences, Intellectual Disability, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], medicine, Humans, Precocious puberty, Abnormalities, Multiple, long-term prognosis, Alleles, Genetic Association Studies, Aged, Retrospective Studies, Bone Diseases, Developmental, Neurodevelopmental disorders Donders Center for Medical Neuroscience [Radboudumc 7], Tooth Abnormalities, 16q24.3 deletion, Point mutation, Facies, Infant, medicine.disease, haploinsufficiency, Repressor Proteins, Amino Acid Substitution, Autism, Chromosomes, Human, Pair 16
Abstract: Item does not contain fulltext KBG syndrome, due to ANKRD11 alteration is characterized by developmental delay, short stature, dysmorphic facial features, and skeletal anomalies. We report a clinical and molecular study of 39 patients affected by KBG syndrome. Among them, 19 were diagnosed after the detection of a 16q24.3 deletion encompassing the ANKRD11 gene by array CGH. In the 20 remaining patients, the clinical suspicion was confirmed by the identification of an ANKRD11 mutation by direct sequencing. We present arguments to modulate the previously reported diagnostic criteria. Macrodontia should no longer be considered a mandatory feature. KBG syndrome is compatible with autonomous life in adulthood. Autism is less frequent than previously reported. We also describe new clinical findings with a potential impact on the follow-up of patients, such as precocious puberty and a case of malignancy. Most deletions remove the 5'end or the entire coding region but never extend toward 16q telomere suggesting that distal 16q deletion could be lethal. Although ANKRD11 appears to be a major gene associated with intellectual disability, KBG syndrome remains under-diagnosed. NGS-based approaches for sequencing will improve the detection of point mutations in this gene. Broad knowledge of the clinical phenotype is essential for a correct interpretation of the molecular results. (c) 2016 Wiley Periodicals, Inc.
Published: 2016

13. Epileptic patients with de novo STXBP1 mutations: Key clinical features based on 24 cases

Author: Alexandra Afenjar, Mathieu Milh, Pierre Cacciagli, Marine Lebrun, Catherine Badens, Cecilia Altuzarra, Agnès Gautier, Mondher Chouchane, Brigitte Chabrol, Gaetan Lesca, Nathalie Villeneuve, S. Marignier, Audrey Riquet, Julia Metreau, Anne de Saint Martin, Alexandra Perez, Nicole Philip, Affef Abidi, Bertrand Isidor, Claude Cances, Dorothée Ville, Cécile Laroche, Florence Renaldo-Robin, Caroline Lacoste, Laurent Villard, Christelle Rougeot, Chantal Missirian, Marie Husson, Chloé Di Meglio, Agathe Roubertie, Service de pédiatrie et neurologie pédiatrique, Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center (CRNL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle (GMGF), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM], Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de pédiatrie [CHRU Besançon], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Hôpital Lapeyronie [Montpellier] (CHU), Institut des Neurosciences de Montpellier (INM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Service de Neuropédiatrie [CHU Trousseau], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Service de génétique médicale - Unité de génétique clinique [Nantes], Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), CHU Bordeaux [Bordeaux], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre), Service de Pédiatrie médicale [CHU Limoges], CHU Limoges, Service de pédiatrie (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Hôpital Louis Pradel [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Hôpital Femme Mère Enfant [CHU - HCL] (HFME), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne), Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Service de Neuro-pédiatrie[Lille], Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre de référence maladie rare Thalassémie, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Villard, Laurent, Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Neurosciences de Montpellier - Déficits sensoriels et moteurs (INM), Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Toulouse [Toulouse], CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), and Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E)
Subjects: Male, Ohtahara syndrome, Pathology, medicine.medical_specialty, Pediatrics, [SDV]Life Sciences [q-bio], Epilepsies, Myoclonic, [SDV.GEN] Life Sciences [q-bio]/Genetics, Electroencephalography, Syntaxin binding, Epilepsy, Munc18 Proteins, medicine, STXBP1, Humans, [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Ataxic Gait, Age of Onset, Child, Retrospective Studies, Sequence Deletion, Comparative Genomic Hybridization, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, medicine.diagnostic_test, business.industry, Brain, Infant, medicine.disease, Magnetic Resonance Imaging, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], Neurology, Child, Preschool, Mutation, Female, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Neurology (clinical), Abnormality, Age of onset, business, Spasms, Infantile, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: Summary Objective Mutations in the syntaxin binding protein 1 gene (STXBP1) have been associated mostly with early onset epileptic encephalopathies (EOEEs) and Ohtahara syndrome, with a mutation detection rate of approximately 10%, depending on the criteria of selection of patients. The aim of this study was to retrospectively describe clinical and electroencephalography (EEG) features associated with STXBP1-related epilepsies to orient molecular screening. Methods We screened STXBP1 in a cohort of 284 patients with epilepsy associated with a developmental delay/intellectual disability and brain magnetic resonance imaging (MRI) without any obvious structural abnormality. We reported on patients with a mutation and a microdeletion involving STXBP1 found using array comparative genomic hybridization (CGH). Results We found a mutation of STXBP1 in 22 patients and included 2 additional patients with a deletion including STXBP1. In 22 of them, epilepsy onset was before 3 months of age. EEG at onset was abnormal in all patients, suppression-burst and multifocal abnormalities being the most common patterns. The rate of patients carrying a mutation ranged from 25% in Ohtahara syndrome to
Published: 2015

14. Incomplete penetrance and phenotypic variability of 6q16 deletions including SIM1

Author: Christelle Dubourg, Joris Andrieux, Stanislas Lyonnet, Pietro Palumbo, Chantal Missirian, Alice Masurel, Brigitte Benzacken, Alain Verloes, Nathalie Marle, Anne Lise Delezoide, Clarisse Baumann, Aimé Ravel, Valérie Malan, Anne Claude Tabet, Laila El Khattabi, Muriel Holder-Espinasse, Serge Romana, Mylène Valduga, Laurence Faivre, Anne Moncla, Hélène Dessuant, Sylvie Jaillard, Jean Michel Dupont, Sonia Bouquillon, Alexandre Moerman, Séverine Drunat, Fabien Guimiot, Hubert Journel, Bruno Delobel, Massimo Carella, Sylvie Odent, Florence Demurger, Céline Dupont, Eva Pipiras, Andrée Delahaye, Marie Vermelle, Orazio Palumbo, Service de Biologie du Développement, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Robert Debré, Service Histologie-embryologie-cytogénétique, Université Paris 13 ( UP13 ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Jean Verdier, Laboratoire de Génétique Clinique, Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Université de Lille, Droit et Santé-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Département de Génétique Médicale, Systèmes de Référence Temps Espace ( SYRTE ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Observatoire de Paris-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ), Centre de Génétique Chromosomique, Hôpital Saint Vincent de Paul-GHICL, Service de Cytogénétique et de Biologie Cellulaire, Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Département de génétique, Institut de Génétique et Développement de Rennes ( IGDR ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Service de génétique clinique, Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Service de Génétique Médicale [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement ( Inserm U781 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service de génétique, CHU Dijon, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ) -Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) -Aix Marseille Université ( AMU ), Service de Génétique clinique, Laboratoire de Génétique Chromosomique, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ), Centre de Référence ' Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs Sud - Est PACA ', Universita degli studi di Napoli 'Parthenope' [Napoli], INSERM EMI0210 ( EMI0210 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Laboratoire Histologie Embryologie Cytogénétique [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Instituto di Ricovero e Cura a Carattere Scientifico, Physiopathologie et neuroprotection des atteintes du cerveau en développement, Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), AP HP, Reprod Biol Unit CECOS, Centre Hospitalier Universitaire Jean Verdier, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré, Université Paris 13 (UP13)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Université de Lille, Droit et Santé-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Systèmes de Référence Temps Espace (SYRTE), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Hôpital Saint Vincent de Paul-Groupement des Hôpitaux de l'Institut Catholique de Lille (GHICL), Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement (Inserm U781), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Università degli Studi di Napoli 'Parthenope' = University of Naples (PARTHENOPE), INSERM EMI0210 (EMI0210), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris 13 (UP13)-Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Robert Debré, Université Paris 13 (UP13)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Jean Verdier [Bondy], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), PSL Research University (PSL)-PSL Research University (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU)
Subjects: Adult, Male, Adolescent, [SDV]Life Sciences [q-bio], Penetrance, Bioinformatics, Polymorphism, Single Nucleotide, Article, Pregnancy, GRIK2, Basic Helix-Loop-Helix Transcription Factors, Genetics, Humans, SNP, Obesity, Child, Gene, Genetic Association Studies, Genetics (clinical), Comparative Genomic Hybridization, biology, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Infant, Phenotype, Repressor Proteins, Child, Preschool, Aborted Fetus, SIM1, biology.protein, Chromosomes, Human, Pair 6, Female, Haploinsufficiency, Prader-Willi Syndrome, Comparative genomic hybridization
Abstract: International audience; 6q16 deletions have been described in patients with a Prader-Willi-like (PWS-like) phenotype. Recent studies have shown that certain rare single-minded 1 (SIM1) loss-of-function variants were associated with a high intra-familial risk for obesity with or without features of PWS-like syndrome. Although SIM1 seems to have a key role in the phenotype of patients carrying 6q16 deletions, some data support a contribution of other genes, such as GRIK2, to explain associated behavioural problems. We describe 15 new patients in whom de novo 6q16 deletions were characterised by comparative genomic hybridisation or single-nucleotide polymorphism (SNP) array analysis, including the first patient with fetopathological data. This fetus showed dysmorphic facial features, cerebellar and cerebral migration defects with neuronal heterotopias, and fusion of brain nuclei. The size of the deletion in the 14 living patients ranged from 1.73 to 7.84 Mb, and the fetus had the largest deletion (14 Mb). Genotype-phenotype correlations confirmed the major role for SIM1 haploinsufficiency in obesity and the PWS-like phenotype. Nevertheless, only 8 of 13 patients with SIM1 deletion exhibited obesity, in agreement with incomplete penetrance of SIM1 haploinsufficiency. This study in the largest series reported to date confirms that the PWS-like phenotype is strongly linked to 6q16.2q16.3 deletions and varies considerably in its clinical expression. The possible involvement of other genes in the 6q16.2q16.3-deletion phenotype is discussed.
Published: 2014

15. Intragenic rearrangements in X-linked intellectual deficiency: Results of a-CGH in a series of 54 patients and identification of TRPC5 and KLHL15 as potential XLID genes

Author: André Mégarbané, Nancy Choucair, Cécile Mignon-Ravix, Laurent Villard, Sophie Julia, Sabine Sigaudy, Chantal Missirian, Tiffany Busa, Nadine Girard, Catherine Badens, Mathieu Milh, Pierre Cacciagli, Cornel Popovici, Nicole Philip, Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle (GMGF), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Cancérologie expérimentale, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM], Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Epilepsie et ischémie cérébrale, Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Unité de génétique médicale, Université Saint-Joseph de Beyrouth (USJ)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Epidémiologie et analyses en santé publique : risques, maladies chroniques et handicaps (LEASP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Centre de référence maladie rare Thalassémie, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Service de Génétique, and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Male, DNA Copy Number Variations, X-linked intellectual disability, [SDV]Life Sciences [q-bio], Genome-wide association study, Biology, X-inactivation, Translocation, Genetic, MECP2, 03 medical and health sciences, Exon, 0302 clinical medicine, Genes, X-Linked, X Chromosome Inactivation, Intellectual Disability, Gene duplication, Genetics, medicine, Humans, Genetics (clinical), ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, TRPC Cation Channels, 0303 health sciences, Chromosomes, Human, X, Comparative Genomic Hybridization, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, Microfilament Proteins, Chromosome Mapping, medicine.disease, FMR1, Genetic Loci, Child, Preschool, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], 030217 neurology & neurosurgery, Gene Deletion, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Comparative genomic hybridization, Genome-Wide Association Study
Abstract: High-resolution array comparative genomic hybridization (a-CGH) enables the detection of intragenic rearrangements, such as single exon deletion or duplication. This approach can lead to the identification of new disease genes. We report on the analysis of 54 male patients presenting with intellectual deficiency (ID) and a family history suggesting X-linked (XL) inheritance or maternal skewed X-chromosome inactivation (XCI), using a home-made X-chromosome-specific microarray covering the whole human X-chromosome at high resolution. The majority of patients had whole genome array-CGH prior to the selection and we did not include large rearrangements such as MECP2 and FMR1 duplications. We identified four rearrangements considered as causative or potentially pathogenic, corresponding to a detection rate of 8%. Two CNVs affected known XLID genes and were therefore considered as causative (IL1RAPL1 and OPHN1 intragenic deletions). Two new CNVs were considered as potentially pathogenic as they affected interesting candidates for ID. The first CNV is a deletion of the first exon of the TRPC5 gene, encoding a cation channel implicated in dendrite growth and patterning, in a child presenting with ID and an autism spectrum disorder (ASD). The second CNV is a partial deletion of KLHL15, in a patient with severe ID, epilepsy, and anomalies of cortical development. In both cases, in spite of strong arguments for clinical relevance, we were not able at this stage to confirm pathogenicity of the mutations, and the causality of the variants identified in XLID remains to be confirmed.
Published: 2014

16. Mosaic 15q13.3 deletion including CHRNA7 gene in monozygotic twins

Author: Anne Moncla, Nicole Philip, Tiffany Busa, Mathieu Milh, Cornel Popovici, Chantal Missirian, Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle (GMGF), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Génétique Chromosomique, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Centre de Référence ' Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs Sud - Est PACA ', Service de pédiatrie et neurologie pédiatrique, Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Part of this work was supported by the Direction Générale de l'Organisation des Soins (DGOS) from French Ministère, and Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Male, alpha7 Nicotinic Acetylcholine Receptor, Language delay, Buccal swab, Monozygotic twin, CHRNA7, 03 medical and health sciences, Seizures, Intellectual Disability, Genetics, Humans, Child, Gene, Genetics (clinical), Normal range, 030304 developmental biology, Gene Rearrangement, Chromosomes, Human, Pair 15, Comparative Genomic Hybridization, 0303 health sciences, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, biology, 030305 genetics & heredity, Twins, Monozygotic, General Medicine, twins, Phenotype, Temper tantrums, mosaicism, 15q13.3 deletion, biology.protein, Chromosome Deletion, Lymphocyte Culture Test, Mixed
Abstract: International audience; Deletions in 15q13.3 belong to the most frequently identified recurrent CNVs, and lead to mental retardation, seizures and minor dysmorphism. We report on two monozygotic twin boys with a mosaic 1.5 Mb deletion in 15q13.3, including CHRNA7. The growth parameters were in the normal range for both twins. Both had language delay with hyperactivity, temper tantrums and poor social interaction but attended regular school. The percentage of abnormal cells was 40% on lymphocytes, and 25 and 35% on buccal smear in the first and second twins, respectively. The mosaicism for the 15q13.3 deletion can explain the milder phenotype observed in these two boys.
Published: 2013

17. Disruption of the ATP8A2 gene in a patient with a t(10;13) de novo balanced translocation and a severe neurological phenotype

Author: Laurent Villard, Bilal El-Waly, Cécile Mignon-Ravix, Brigitte Chabrol, Anne Moncla, Marie-Reine Haddad, Pierre Cacciagli, Chantal Missirian, Aix-Marseille Université - Faculté de médecine (AMU MED), and Aix Marseille Université (AMU)
Subjects: Candidate gene, [SDV]Life Sciences [q-bio], Population, atp8a2, Short Report, Translocation Breakpoint, Chromosomal translocation, Biology, mental retardation, Translocation, Genetic, 03 medical and health sciences, Mice, 0302 clinical medicine, Gene mapping, Pregnancy, Genetics, Animals, Humans, Genetic Testing, Phospholipid Transfer Proteins, education, Gene, Genetics (clinical), 030304 developmental biology, Adenosine Triphosphatases, 0303 health sciences, education.field_of_study, Chromosomes, Human, Pair 13, Chromosomes, Human, Pair 10, Gene Expression Profiling, Infant, Newborn, Infant, Phenotype, chromosome aberrations, Child, Preschool, Mutation, Female, Nervous System Diseases, Haploinsufficiency, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: International audience; Mental retardation is a frequent condition that is clinically and genetically highly heterogeneous. One of the strategies used to identify new causative genes is to take advantage of balanced chromosomal rearrangements in affected patients. We characterized a de novo t(10;13) balanced translocation in a patient with severe mental retardation and major hypotonia. We found that the balanced translocation is molecularly balanced. The translocation breakpoint disrupt the coding sequence of a single gene, called ATP8A2. The ATP8A2 gene is not ubiquitously expressed but it is highly expressed in the brain. In situ hybridization performed in mouse embryos at different stages of development with the mouse homologue confirms this observation. 38 patients with a similar phenotype were screened for mutations in the ATP8A2 gene but no mutations were found. The balanced translocation identified in this patient disrupts a single candidate gene highly expressed in the brain. Although this chromosomal rearrangement could be the cause of the severe phenotype of the patient, we were not able to identify additional cases. Extensive screening in the mentally retarded population will be needed to determine if ATP8A2 haploinsufficiency or dysfunction causes a neurological phenotype in humans.
Published: 2010

18. Periventricular heterotopia, mental retardation, and epilepsy associated with 5q14.3-q15 deletion

Author: Laurent Villard, Orsetta Zuffardi, Francesca Novara, Carlos Cardoso, Ingrid E. Scheffer, Brigitte Chabrol, E. Pallesi, Sabrina Khantane, Sabrina Giglio, Anne Moncla, Enrico Bertini, Cécile Mignon-Ravix, Ellena Parrini, Jacinta M McMahon, Chantal Missirian, Renzo Guerrini, Howard R. Slater, Amber Boys, Institut de Neurobiologie de la Méditerranée [Aix-Marseille Université] (INMED - INSERM U1249), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM], Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Victorian Clinical Genetics Services, Pediatric Neurology & Neurogenetics Unit and Laboratories, Università degli Studi di Firenze = University of Florence (UniFI)-Children's Hospital A. Meyer, Departments of Medicine and Paediatrics, University of Melbourne-Austin Health, Department of Laboratory Medicine, IRCCS Ospedale Pediatrico Bambino Gesù [Roma], Unit of Molecular Medicine, IRCCS, Genetica Medica, Università degli Studi di Pavia = University of Pavia (UNIPV), Medical Genetics Unit, Service de pédiatrie et neurologie pédiatrique, Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU), Università degli Studi di Firenze = University of Florence [Firenze] (UNIFI)-Children's Hospital A. Meyer, Università degli Studi di Pavia, and Tyzio, Roman
Subjects: Male, Microcephaly, Candidate gene, Epilepsy, Lateral ventricles, 0302 clinical medicine, Periventricular Nodular Heterotopia, MESH: Mental Retardation, MESH: Periventricular Nodular Heterotopia, FLNA, MESH: Syndrome, Genetics, MESH: Aged, 0303 health sciences, Comparative Genomic Hybridization, MESH: Middle Aged, Chromosome Mapping, Syndrome, Middle Aged, MESH: Young Adult, MESH: Epilepsy, Chromosomes, Human, Pair 5, Female, Psychology, Adult, MESH: Chromosomes, Human, Pair 5, Adolescent, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, 03 medical and health sciences, Young Adult, Fetus, Intellectual Disability, medicine, Humans, [SDV.BC] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, 030304 developmental biology, Aged, MESH: Adolescent, MESH: Humans, Genetic heterogeneity, MESH: Adult, MESH: Fetus, medicine.disease, MESH: Male, Xq28, MESH: Comparative Genomic Hybridization, MESH: Gene Deletion, Neurology (clinical), MESH: Chromosome Mapping, Neuroscience, MESH: Female, 030217 neurology & neurosurgery, Gene Deletion, Comparative genomic hybridization
Abstract: International audience; BACKGROUND: Periventricular heterotopia (PH) is an etiologically heterogeneous disorder characterized by nodules of neurons ectopically placed along the lateral ventricles. Most affected patients have seizures and their cognitive level varies from normal to severely impaired. At present, two genes have been identified to cause PH when mutated. Mutations in FLNA (Xq28) and ARFGEF2 (20q13) are responsible for X-linked bilateral PH and a rare autosomal recessive form of PH with microcephaly. Chromosomal rearrangements involving the 1p36, 5p15, and 7q11 regions have also been reported in association with PH but the genes implicated remain unknown. Fourteen additional distinct anatomoclinical PH syndromes have been described, but no genetic insights into their causes have been gleaned. METHODS: We report the clinical and imaging features of three unrelated patients with epilepsy, mental retardation, and bilateral PH in the walls of the temporal horns of the lateral ventricles, associated with a de novo deletion of the 5q14.3-15 region. We used microarray-based comparative genomic hybridization to define the boundaries of the deletions. RESULTS: The three patients shared a common deleted region spanning 5.8 Mb and containing 14 candidate genes. CONCLUSION: We identified a new syndrome featuring bilateral periventricular heterotopia (PH), mental retardation, and epilepsy, mapping to chromosome 5q14.3-q15. This observation reinforces the extreme clinical and genetic heterogeneity of PH. Array comparative genomic hybridization is a powerful diagnostic tool for characterizing causative chromosomal rearrangements of limited size, identifying potential candidate genes for, and improving genetic counseling in, malformations of cortical development.
Published: 2009

19. TCF4 deletions in Pitt-Hopkins Syndrome

Author: Jacqueline Arfi, Julia Rankin, Michel Goossens, Gilles Morin, Laurent Villard, Anne Moncla, Pierre Sarda, Chantal Missirian, Tessa Fredriksen, Jean Claude Lambert, Brigitte Chabrol, Thierry Gaillon, Michèle Mathieu-Dramard, Dominique Martin-Coignard, Irina Giurgea, Nicole Philip, Fabienne Giuliano, Sandra Whalen, Christèle Dubourg, Pierre Cacciagli, Institut Mondor de recherche biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM], Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Department of Clinical Genetics, Royal Devon and Exeter NHS Foundation Trust, Service de génétique médicale, CHU Amiens-Picardie, Service de génétique, Centre Hospitalier Le Mans (CH Le Mans), Service de biologie moléculaire, Hôpital Pontchaillou, Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de pédiatrie et neurologie pédiatrique, Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Hôpital l'Archet, Unité de Génétique Médicale et Foetopathologie, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Hôpital Arnaud de Villeneuve, De Villemeur, Hervé, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Université de Rennes 1 (UR1), and Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Male, Developmental Disabilities, DNA Mutational Analysis, Pitt–Hopkins syndrome, MESH: Codon, Terminator, Gene mutation, MESH: Hyperventilation, MESH: Mental Retardation, MESH: Child, Hyperventilation, MESH: Syndrome, MESH: DNA Mutational Analysis, Child, Genetics (clinical), Sequence Deletion, [INFO.INFO-BI] Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], Genetics, Comparative Genomic Hybridization, 0303 health sciences, [SDV.BIBS] Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], 030305 genetics & heredity, Syndrome, MESH: Sequence Deletion, Phenotype, [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], Stop codon, 3. Good health, Child, Preschool, Codon, Terminator, Female, TCF Transcription Factors, Haploinsufficiency, Transcription Factor 7-Like 2 Protein, MESH: Abnormalities, Multiple, MESH: Mutation, Adolescent, Locus (genetics), Biology, MESH: Phenotype, 03 medical and health sciences, Intellectual Disability, medicine, Humans, Abnormalities, Multiple, Gene, 030304 developmental biology, MESH: Adolescent, MESH: Humans, Point mutation, MESH: Child, Preschool, medicine.disease, Molecular biology, MESH: Male, MESH: Comparative Genomic Hybridization, MESH: Karyotyping, MESH: Developmental Disabilities, Karyotyping, Mutation, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], Chromosomes, Human, Pair 18, MESH: Chromosomes, Human, Pair 18, MESH: Female, MESH: TCF Transcription Factors
Abstract: International audience; Pitt-Hopkins syndrome (PHS) is a probably underdiagnosed, syndromic mental retardation disorder, marked by hyperventilation episodes and characteristic dysmorphism (large beaked nose, wide mouth, fleshy lips, and clubbed fingertips). PHS was shown to be caused by de novo heterozygous mutations of the TCF4 gene, located in 18q21. We selected for this study 30 unrelated patients whose phenotype overlapped PHS but which had been initially addressed for Angelman, Mowat-Wilson, or Rett syndromes. In 10 patients we identified nine novel mutations (four large cryptic deletions, including one in mosaic, and five small deletions), and a recurrent one. So far, a total of 20 different TCF4 gene mutations have been reported, most of which either consist in deletion of significant portions of the TCF4 coding sequence, or generate premature stop codons. No obvious departure was observed between the patients harboring point mutations and large deletions at the 18q21 locus, further supporting TCF4 haploinsufficiency as the molecular mechanism underling PHS. In this report, we also further specify the phenotypic spectrum of PHS, enlarged to behavior, with aim to increase the rate and specificity of PHS diagnosis.
Published: 2008

20. Use of a set of highly polymorphic minisatellite probes for the identification of cryptic 1p36.3 deletions in a large collection of patients with idiopathic mental retardation

Author: Laurence Taine, Dominique Aubert, Fabienne Giraudeau, Dominique Bonneau, Bruno Delobel, Valérie Biancalana, Annick Toutain, Gilles Vergnaud, Marie Geneviève Mattei, Albert David, Hubert Journel, Hervé Avet Loiseau, Yolande Hauck, Chantal Missirian, Didier Lacombe, Philippe Parent, Marie Françoise Croquette, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Génétique Chromosomique, Hôpital Saint Vincent de Paul-GHICL, Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU), Service de génétique médicale, Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Mitochondrie : Régulations et Pathologie, Université d'Angers (UA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de génétique, Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Centre Interdisciplinaire de Nanoscience de Marseille (CINaM), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Formation et de Recherche sur les Environnements Méditérranéens (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de génétique et microbiologie [Orsay] (IGM), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Echanges Côte-Large (ECOLA), Laboratoire d'études en Géophysique et océanographie spatiales (LEGOS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de génétique [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau, Parc Naturel National Loire-Anjou-Touraine, Conseil régional des Pays de la Loire, CHU Bordeaux [Bordeaux], MLab, Dauphine Recherches en Management (DRM), Université Paris Dauphine-PSL, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Dauphine-PSL, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École Nationale Supérieure de Techniques Avancées (ENSTA Paris), Hôpital Saint Vincent de Paul-Groupement des Hôpitaux de l'Institut Catholique de Lille (GHICL), Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Hôpital Bretonneau-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)
Subjects: Male, [SDV]Life Sciences [q-bio], Population, Biology, Genetic determinism, 03 medical and health sciences, Polymorphism (computer science), Intellectual Disability, Intellectual disability, Genetics, medicine, Humans, Letters to the Editor, education, In Situ Hybridization, Fluorescence, Genetics (clinical), ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, education.field_of_study, Polymorphism, Genetic, 030305 genetics & heredity, Chromosome, DNA, medicine.disease, Developmental disorder, Blotting, Southern, Minisatellite, Chromosomes, Human, Pair 1, Mutation (genetic algorithm), Female, Chromosome Deletion, DNA Probes, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Microsatellite Repeats
Abstract: Editor—Mental retardation is a component of a large number of syndromes, most of which qualify individually as rare genetic diseases. Altogether, mental retardation affects 2-3% of the population and is unexplained in 40% of cases. According to Knight et al ,1 subtle telomeric chromosomal rearrangements are responsible for approximately 1% of unexplained mental retardation (with the proportion being highest, 7.4%, in the subclass of unexplained moderate to severe mental retardation). The identification of the genes responsible will require the precise delimitation of minimum deletion regions, which relies upon the collection of a large number of cases. Because of the low expected frequency of each telomeric deletion in mental retardation, the procedure to be applied should allow the screening of many patients at a low cost. It is not yet clear whether all chromosome ends are associated with mental retardation syndromes with similar frequency. Distal chromosome 1p36 deletions were initially detected cytogenetically because of an associated segmental imbalance.2-5 This syndrome results from both interstitial and terminal deletions of varying sizes and different breakpoints6 and the severity of the phenotype is related to the extent of the deletion.7 Clinical examination can efficiently detect a large proportion of cases, so that the number of reports of 1p36 deletions has increased significantly in the past few years which may give the false impression that this is a relatively frequent syndrome. We show here how highly polymorphic minisatellites located within a short region can provide an efficient prescreening of samples without the need for parental samples at the initial stage. The procedure was tested here using 1p36 minisatellites and provides an estimate of the frequency of 1p36 deletions in mentally retarded patients. A selection of five highly polymorphic minisatellite probes was used to search for 1p36.3 deletions in a …
Published: 2001

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1. Novel Exon-Skipping Therapeutic Approach for the DMD Gene Based on Asymptomatic Deletions of Exon 49

2. Developmental trajectories of neuroanatomical alterations associated with the 16p11.2 Copy Number Variations

3. Prenatal findings in 1p36 deletion syndrome: New cases and a literature review

4. Chromosomal microarray analysis in fetuses with an isolated congenital heart defect: A retrospective, nationwide, multicenter study in France

5. Whole genome paired-end sequencing elucidates functional and phenotypic consequences of balanced chromosomal rearrangement in patients with developmental disorders

6. Risk estimation of uniparental disomy of chromosome 14 or 15 in a fetus with a parent carrying a non‐homologous Robertsonian translocation. Should we still perform prenatal diagnosis?

7. Further delineation of the MECP2 duplication syndrome phenotype in 59 French male patients, with a particular focus on morphological and neurological features

8. The role of CNVs in the etiology of rare autosomal recessive disorders: the example of TRAPPC9-associated intellectual disability

9. Interphase FISH for BCR-ABL1 rearrangement on neutrophils: A decisive tool to discriminate a lymphoid blast crisis of chronic myeloid leukemia from a de novo BCR-ABL1 positive acute lymphoblastic leukemia

10. FOXC1 haploinsufficiency due to 6p25 deletion in a patient with rapidly progressing aortic valve disease

11. A framework to identify contributing genes in patients with Phelan-McDermid syndrome

12. Clinical and Molecular Findings in 39 Patients with KBG Syndrome Caused by Deletion or Mutation of ANKRD11

13. Epileptic patients with de novo STXBP1 mutations: Key clinical features based on 24 cases

14. Incomplete penetrance and phenotypic variability of 6q16 deletions including SIM1

15. Intragenic rearrangements in X-linked intellectual deficiency: Results of a-CGH in a series of 54 patients and identification of TRPC5 and KLHL15 as potential XLID genes

16. Mosaic 15q13.3 deletion including CHRNA7 gene in monozygotic twins

17. Disruption of the ATP8A2 gene in a patient with a t(10;13) de novo balanced translocation and a severe neurological phenotype

18. Periventricular heterotopia, mental retardation, and epilepsy associated with 5q14.3-q15 deletion

19. TCF4 deletions in Pitt-Hopkins Syndrome

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