1. Drug-Disease-Networks: Innovatives PubPharm-Recherchetool
- Author
-
Draheim, C, Wawrzinek, J, Wulle, S, Balke, WT, Draheim, C, Wawrzinek, J, Wulle, S, and Balke, WT
- Abstract
In the Specialised Information Service Pharmacy, the cooperation between the University Library and the Institute for Information Systems at Technische Universität Braunschweig results in innovative data retrieval services. Based on basic information technology research, prototypes are developed and evaluated by focus groups of the pharmaceutical research community. Upon successful prototype optimisation, services are implemented in the freely available search platform PubPharm (https://www.pubpharm.de). Recent artificial intelligence models (in detail neural networks) can automatically determine associations between pharmaceutical entities (i.e. clearly definable concepts such as active ingredients, diseases and genes) based on research literature. This research activity at the Institute for Information Systems resulted already in a web service for PubPharm: listing contextualised substances, diseases or genes when searching for active substances or diseases/symptoms. The Drug-Disease-Networks complement this suggestion function and visualise the partly complex entity relationships supporting their interpretation. Links to external data sources, e.g., Comparative Toxicogenomics Database and DrugBank, provide further information., In enger Zusammenarbeit zwischen der Universitätsbibliothek und dem Institut für Informationssysteme der Technischen Universität Braunschweig im Fachinformationsdienst Pharmazie entstehen innovative Recherchetools, die neue Zugriffspfade für unterschiedliche Informationsressourcen bieten. In der informatorischen Grundlagenforschung werden Prototypen entwickelt und diese von Fokusgruppen der Fachcommunity evaluiert. Erfolgreiche Services werden anschließend in die frei verfügbare Rechercheplattform PubPharm (https://www.pubpharm.de) implementiert. Mithilfe von künstlicher Intelligenz, im Detail mit neuronalen Netzen, können Beziehungen zwischen pharmazierelevanten Entitäten, d.h. klar abgrenzbaren Konzepten wie Wirkstoffen, Erkrankungen und Genen, auf Basis von Forschungsliteratur ermittelt werden. Aus dieser Forschungstätigkeit am Institut für Informationssysteme ist bereits eine Funktion in PubPharm eingegangen: die Anzeige von Vorschlagslisten kontextähnlicher, verwandter Substanzen, Erkrankungen/Symptome und Gene bei einer Suche nach Wirkstoffen bzw. Erkrankungen. Eine Erweiterung dieser Funktion sind die neu integrierten Drug-Disease-Networks. Durch Visualisierung der z.T. komplexen Beziehungen zwischen den Entitäten können diese leichter interpretiert werden. Weiterführende Informationen können über Verlinkungen zu externen Datenquellen (u.a. Comparative Toxicogenomics Database und DrugBank) erhalten werden.
- Published
- 2021