RESUME Depuis quelques decennies, Marseille est devenue la plus grande ville comorienne hors de l’archipel du fait des flux migratoires. Elle est aussi le siege d’une faculte de medecine qui a fait de l’infectiologie au sens large l’un de ses poles d’excellence. Cette conjonction a permis a la cite phoceenne d’etre au cours des deux dernieres annees a la pointe de la reponse de la France metropolitaine face a la crise generee par l’emergence de la fievre a virus Chikungunya dans l’Ocean Indien, en particulier a La Reunion et a Mayotte. L’Hopital d’instruc- tion des armees (HIA) Laveran a pris en charge une des plus grandes cohortes de patients de metropole. Ses equipes ont precise la grande richesse clinique de la maladie au stade tardif, decrivant notamment l’incidence elevee des tenosynovites et de la polyarthrite distale invalidante, la survenue d’un acro-syndrome transitoire aux deuxieme et troisieme mois chez pres d’un malade sur quatre. Elles ont egalement identifie la presence d’une cryoglobuline mixte chez plus de 90 % des patients, evoluant en parallele des symptomes cliniques et sensible a une corticotherapie generale. Cette decouverte ouvre des voies importantes de recherche pour une meilleure comprehension de la physiopathologie de la maladie. Le laboratoire de virologie tropicale de l’Institut de medecine tropicale du Service de sante des armees (IMTSSA), laboratoire associe au Centre national de reference (CNR) des arboviroses, a developpe de nouveaux outils de diagnostic en particulier en matiere de RT-PCR. Il est avec le CNR, le producteur et fournisseur d’antigenes pour la serologie du Chikungunya de toute la France metropolitaine et d’Outre-mer. Il a pris en compte la presence de cryoglobulines, susceptibles d’induire des faux negatifs chez les patients infectes, et adapte la technique serologique, permettant d’augmenter considerablement la rentabilite diagnostique. Ses recherches fondamentales sont axees sur la caracterisation genomique des variants du virus isoles chez l’homme et le vecteur et sur l’approche de l’expression proteasique du virus Chikungunya pour des etudes fonctionnelles et le criblage d’antiviraux. Il travaille en cooperation avec les equipes cliniques reunionnaises et metropolitaines sur la reponse immunitaire humorale et cellulaires des patients et la description des formes cliniques. Le Departement d’epidemiologie et de sante publique de l’IMTSSA a realise l’etude epidemiologique d’une population particuliere constituee de l’integralite des gendarmes en poste a La Reunion a la fin de l’epidemie (juin 2006). Cette etude, menee en partenariat avec le laboratoire de virologie tropicale et le CNRS, permet de completer la description clinique des patients victimes de l’epidemie, sur une population non biaisee. Elle debouchera en 2007 sur une etude de cohorte prospective visant a suivre ces patients pendant plusieurs annees pour mieux decrire la phase chronique de la maladie dans une population de patients beneficiant d’un haut niveau d’accessibilite aux soins. Enfin ce departement a fourni aux autorites civiles une expertise et un renfort dans la conduite des operations de lutte a La Reunion. Dans cette participation a la gestion de crise, la place de la communication a ete importante, montrant combien il est devenu indispensable aux acteurs de sante de develop- per une expertise dans ce domaine loin de la pratique clinique. Dans cette tâche, le Service de sante des armees a Marseille n’a jamais ete isole ni coupe de ses partenaires universitai- res, qu’il s’agisse de collaborations cliniques entre l’HIA Laveran et le CHU Nord (Assis- tance Publique des Hopitaux de Marseille) ou virologiques entre les laboratoires de l’IMTSSA et de l’Etablissement francais du sang (EFS), cette experience augurant bien du partenariat que renforce la creation a Marseille d’un Reseau thematique de recherche de soins (RTRS) consacre aux maladies infectieuses emergentes et aux maladies tropicales.