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Crop models are useful tools to investigate climate change impacts and suitable adaptations strategies on crops. In order to evaluate the impact of climate change on peanut yield in Senegal, a solution of the SIMPLACE crop modelling framework using the Lintul5 crop model together with a Tc model and FAO-56 based approach to simulate evapotranspiration was used with consideration of Tc versus Ta in driving heat stress with output from four regional climate models (RCMs) and two climate change scenarios (RCP4.5 and RCP8.5). Results from six field experiments at two sites (Bambey and Nioro) in Senegal in the dry seasons of 2014 and 2015 and the rainy season of 2014, were used for calibration and evaluation for two peanut varieties. Our calibration and evaluation exercise revealed that simulation skill was markedly improved when Tc was considered under irrigated, dry season conditions during which time the plants were subject to periodic heat stress. Under future climatic conditions, positive changes of up to 2.4% for RCP4.5 and 8.3% for RCP8.5 for seed yield were found when increasing [CO2] is taken into account for the period 2016–2045 in dry season. While, in rainy season seed yield increased by 11.0% for RCP4.5 and 19.0% for RCP8.5. The effect of climate change on seed yield was negative in the dry season where maximum Ta is often higher than 38 °C compared to the rainy season in particular when Ta is used for simulating heat stress effects. It is concluded that climate change could have limited negative impacts on peanut yield in Senegal due to the effect of elevated [CO2]. However, simulated Tc should be used instead of Ta to accurately account for heat stress impact on peanut especially during the dry season.

Introduction La gale est une maladie tropicale negligee (MTN) qui touche entre 150 a 200 millions de personnes au monde. Nos objectifs etaient d’evaluer l’impact de la gale sur la qualite de vie (QDV) et d’evaluer le retentissement psychologique, social, professionnel et scolaire de la gale chez des patients consultant dans des services de dermatologie a Dakar. Materiel et methodes Il s’agit d’une etude longitudinale multicentrique prospective qui a ete menee du 18 aout au 19 decembre 2020, aux services de Dermatologie-Venereologie de l’Institut d’Hygiene Sociale, du Centre Hospitalier National Aristide Le Dantec, et du Centre Hospitalier National d’Enfant Albert Royer. Le diagnostic de gale etait retnu sur les criteres de l’IACS (International Alliance for the Control of Scabies) 2020. Les questionnaires Dermatology Life Quality Index (DLQI) et Child Dermatology Life Quality Index (CDLQI) etaient utilises. La saisie et l’analyse des donnees etaient effectuees grâce aux logiciels “IBM SPSS Statistics” version 26. Les tests du Khi 2 ou de Fischer etaient utilises dans leurs conditions d’applicabilite(p Resultats Nous avons inclus 104 patients atteints de gale âges de 2 mois a 80 ans (60 adultes et 26 enfants). Le sex-ratio etait de 0,8. Les troubles du sommeil etaient presents chez 81,3 % des patients. Le score moyen du CDLQI etait de 7,8 ± 3,49 (7–15). Le score moyen du DLQI etait de 8,1 ± 4,75 (6 et 16). Plus de la moitie des adultes avaient un effet modere a important sur la QDV. Le retentissement psychologique concernait aussi bien les enfants que les adultes (sentiments de tristesse chez 84,6 % des enfants et de gene et d’embarras chez 70 % des adultes). Chez les enfants, le retentissement concernait aussi la qualite du sommeil (80,8 %), et les activites de loisirs (53,8 %). Les femmes avaient un retentissement plus important que les hommes sur les relations sociales (60,5 % vs 18,2 %), les habitudes vestimentaires (57,9 % vs 18,2 %) et les activites quotidiennes (57,9 % vs 36,4 %) et de loisirs (52,6 % vs 45,5 %). Le retentissement sur les activites scolaires et professionnelles concernait plus les hommes que les femmes (54,5 % vs 29 %). Des liens statistiquement significatifs ont ete trouves entre la severite du score DLQI et le revenu mensuel moyen (p = 0,03), les troubles du sommeil (p = 0,002) et la depigmentation cosmetique volontaire (p = 0,04). La presence de consultations prealables etait significativement associee a la severite des scores CDLQI et DLQI (p = 0,04). Discussion Les troubles du sommeil etaient presents chez la grande majorite des patients. Le score moyen du CDLQI montrait que la moitie des patients avaient un effet modere a important sur la QDV. Plus des 2/3 des adultes avaient un score moyen du DLQI qui correspondait a un effet modere a important sur la QDV.

Many open questions and unresolved issues surround the topic of bias correction (BC) in climate change impact studies (CCIS). One question relates to the contribution of downscaling of climate change scenarios on the uncertainties in results obtained using impact models for agriculture. In particular, for large area or regional agricultural impact assessments, the question of bias correction is of high relevance. Relatively few studies exist looking at the quantification of the impacts of BC methods in general circulation model (GCM) and regional climate model (RCM) data on results of such impact studies. Here, we quantify the impact of different BC methods on temperature (T) and precipitation (P) from different CORDEX GCM-RCM combinations, and how the debiased T&P signal may propagate through agricultural impact models. Specifically, we estimate the impact of BC on (i) an empirical P- and fuzzy rule-based algorithm to estimate the crop planting date, and (ii) a mechanistic T&P-based approach to quantify the crop suitability index (CSI) for the main staple crops in West Africa (i.e. groundnut, maize, pearl millet, sorghum). Both approaches serve as a proxy for more complex process-based ecophysiological crop models. Depending on the choice of the BC method, the uncertainties in the assessment of the CSI can be more than twice as high compared to the uncertainties from the GCM-RCM model selection. Comparing the estimated CSI values with observed harvest area, it is found that BC generally improves the performance for models with low hit rates ( 30 –35%), but decreases the performance for models with relatively high hit rates ( > 35 %). Such consequences can also be expected for process-based crop models, which are developed to operate on field-scale but are driven by coarser scale RCMs. It is concluded that such agriculturally oriented climate impact models as investigated here should be interpreted with great caution if applied without BC or relying on a single BC approach only. Rather, we suggest to include different BC approaches in the generation of climate projections for CCIS and quantify their uncertainties following a super-ensemble probabilistic assessment.

Resume Introduction Au Senegal, les leishmanioses cutanees sont souvent dues a l’espece Leishmania major . L’immunodepression liee a l’infection par le virus de l’immunodeficience humaine (VIH) contribuerait a l’emergence de la leishmaniose chez l’homme et faciliterait l’infection de la peau par des especes a tropisme visceral. Nous rapportons la premiere observation senegalaise de leishmaniose cutanee opportuniste a Leishmania infantum sur un terrain d’infection par le VIH. Observation Un garcon de 5 ans avait depuis deux mois des ulcerations crouteuses du cuir chevelu et de l’avant-bras gauche, ainsi que des adenopathies cervicales et axillaires. L’examen parasitologique des lesions du cuir chevelu, du bras et des liquides de cytoponction ganglionnaire et medullaire mettait en evidence a l’examen direct des formes amastigotes de leishmanies. La technique d’amplification genomique pratiquee sur les substrats cutane, ganglionnaire et medullaire identifiait L. infantum comme l’espece responsable. La serologie retrovirale de l’enfant etait positive pour le VIH1. Le traitement antiretroviral combine a celui de la leishmaniose permettait d’obtenir une amelioration clinique. Discussion La co-infection leishmaniose cutanee a L. infantum et VIH constitue une association complexe de par ses enjeux therapeutiques. Les modalites evolutives, cliniques et biologiques de la co-infection dependent de la restauration de l’immunite ainsi que de l’efficacite, de la tolerance et de la disponibilite des medicaments anti-leishmaniens.

Resume Justificatif Les donnees relatives a la pneumonie a Pneumocystis en Afrique sub-saharienne ne sont pas bien connues. La faiblesse du plateau technique et l’utilisation d’outils de diagnostic biologique peu sensibles sont parmi les raisons evoquees. L’objectif de cette etude est de reactualiser les donnees de l’affection au centre hospitalier universitaire de Fann a Dakar et d’evaluer les methodes de diagnostic biologique utilisees. Materiel et methodes Une etude prospective descriptive est realisee du 5 janvier 2009 au 31 octobre 2011 au service de parasitologie-mycologie du centre hospitalier universitaire de Fann a Dakar. Les prelevements du liquide de lavage broncho-alveolaire recus au laboratoire sont examines au microscope par immunofluorescence indirecte ou apres coloration au Giemsa ou au bleu de toluidine O pour la mise en evidence de Pneumocystis jirovecii. Resultats Cent quatre-vingt-trois prelevements de liquide de lavage broncho-alveolaire provenant de 183 patients sont recus au laboratoire. Seize sont positifs pour la recherche de P. jirovecii , soit une frequence de 9 %. Quatre parmi eux sont infectes par le VIH. L’immunofluorescence indirecte a permis de retrouver P. jirovecii chez les 16 patients alors que la coloration au Giemsa n’a detecte P. jirovecii que chez un seul patient. Aucun cas n’est diagnostique par le bleu de toluidine O. Conclusion La pneumonie a Pneumocystis au laboratoire de parasitologie-mycologie du centre hospitalier universitaire de Fann a Dakar est majoritairement diagnostiquee chez des patients infectes par le VIH.

Highlights • Antibody dynamics and role in young the infants’ low susceptibility to febrile malaria were investigated. • No evidence for association of antibody titres with clinical protection was found. • Evidence for consistently low antibody titres in high and low transmission areas. • Other antibodies, other antibody-mediated mechanisms or other protecting factors may be operating., Background Young infants have reduced susceptibility to febrile malaria compared with older children, but the mechanism for this remains unclear. There are conflicting data on the role of passively acquired antibodies. Here, we examine antibody titres to merozoite surface antigens in the protection of children in their first two years of life in two settings with differing malaria transmission intensity and compare these titres to previously established protective thresholds. Methods Two cohorts of children aged four to six weeks were recruited in Banfora, Burkina and Keur Soce, Senegal and followed up for two years. Malaria infections were detected by light microscopic examination of blood smears collected at active and passive case detection visits. The titres of antibodies to the Plasmodium falciparum recombinant merozoite proteins (AMA1-3D7, MSP1-19, MSP2-Dd2, and MSP3-3D7) were measured by enzyme-linked immunosorbent assay at 1–6, 9, 12, 15 and 18 months of age and compared with the protective thresholds established in Kenyan children. Results Antibody titres were below the protective thresholds throughout the study period and we did not find any association with protection against febrile malaria. Antibodies to AMA1 and MSP1-19 appeared to be markers of exposure in the univariate analysis (and so associated with increasing risk) and adjusting for exposure reduced the strength and significance of this association. Conclusion The antibody levels we measured are unlikely to be responsible for the apparent protection against febrile malaria seen in young infants. Further work to identify protective antibody responses might include functional assays and a wider range of antigens.

Resume En milieu hospitalier, la maitrise de la qualite de l’air ambiant des services d’hospitalisation est un element primordial. En effet, les champignons aeroportes constituent un reel danger pour les patients heberges dans les services a risque d’infections fongiques nosocomiales notamment les immunodeprimes. Objectifs Determiner la composition qualitative de la flore fongique de l’environnement des services a risque d’infections fongiques au CHU Le Dantec. Materiels et methodes Entre avril et mai 2013, 73 echantillons ont ete preleves de 45 compartiments au sein de sept services a risque infectieux fongique (RIF) au CHU Aristide Le Dantec (Dakar). Les prelevements ont ete realises en une seule fois par la methode de sedimentation et le pourcentage de cultures positives est de 100 %. Les especes les plus representees etaient Cladosporium spp. (91,1 %), Aspergillus spp. (86,6 %), Penicillium spp. 71,1 % et Candida spp. (57,7 %). Les especes Aspergillus fumigatus et Candida albicans ont ete isolees respectivement a 15,5 % et 11,1 %. Les services ont ete classes en fonction du nombre d’especes retrouvees avec par ordre decroissant, 11 especes a l’oncologie pediatrique, 10 especes a la chirurgie pediatrique/neonatalogie et a la reanimation, 9 especes a la cancerologie, 8 especes a la chirurgie generale et a la dermatologie, et enfin 4 especes a la medecine interne. Conclusion Cette etude demontre que les especes fongiques susceptibles de provoquer des infections fongiques nosocomiales sont presentes dans les services hebergeant les patients a RIF et que la surveillance des infections fongiques doit etre incluse dans le programme des comites de lutte contre les infections nosocomiales (CLIN).

OBJECTIVE Onychomycosis are a mycose of nail due to fungi. According to published data, they stands for half of all nail abnormalities. This survey was carried out to determine the frequency and the fungi involved in onychomycosis in Dakar. MATERIAL AND METHODS This study was carried out at the laboratory of parasitology and mycology at Le Dantec Hospital, in Senegal from January 2008 to December 2012 and includes 507 patients. RESULTS Onychomycosis were mycologically proved in 58.78% (298/507) of patients. Patient's age varies between 02 years to 82 years with a mean of 34.24 years. Women were more infected than men (sex-ratio was 2.38). Onychomycosis due to dermatophyte represented 37.92% (113/298) of patients and were essentially located on toes (60.71%). Distal and lateral subungual onychomycosis was the most frequent clinical form. Trichophyton rubrum and Trichophyton interdigitale were isolated respectively in 53.6% and 26.1% on toes. Yeasts represented 59.06% (176/298) of onychomycosis and were essentially located on fingernails (80.11%). Candida albicans represented 90.86% of isolated yeasts. Molds were isolated in nine cases (3.02%) and predominated in toenails. CONCLUSION Among 507 patients with onychopathy, this study identified 298 cases of onychomycosis. T. rubrum was the main dermatophytes and was isolated on toenails whereas on fingernails C. albicans was more often observed.

Resume Introduction Les dermatophyties sont des atteintes dues a des dermatophytes, champignons filamenteux septes adaptes a la keratine humaine et animale, colonisant et parasitant la peau et les phaneres de l’homme. L’objectif de cette etude etait d’identifier les especes de dermatophytes responsables de dermatophyties a Dakar chez des patients venus en consultation. Materiel et methodes Cette etude a interesse 2026 patients recenses au laboratoire de parasitologie et mycologie de l’hopital Aristide Le Dantec, a Dakar, au Senegal durant la periode allant de juin 2007 a decembre 2011. Resultats Parmi les 2026 patients, 796 etaient atteints de dermatophyties chez qui 1044 prelevements ont ete positifs avec un examen direct positif et/ou une culture positive. L’âge des patients variait de trois mois a 89 ans avec une moyenne d’âge de 25,5 ans et un indice d’infestation de 39,3 %. La tranche d’âge comprise entre 20–29 ans etait la plus infestee (15,3 %), suivie de celle 10–19 ans (9,1 %), 0–9 ans (8,7 %), 30–39 ans (2,7 %), 40–49 ans (1,5 %), 50–59 ans (1,3 %), 60–69 ans (0,4 %), 70–79 ans (0,2 %), et 80–89 ans (0,1 %). Les dermatophyties etaient plus retrouvees chez les femmes (77 %) que chez les hommes (23 %). Les especes les plus isolees etaient : Trichophyton soudanense (52,78 %), Trichophyton rubrum (30,94 %), Microsporum canis (4,89 %), Trichophyton mentagrophytes var. interdigitale (4,50 %), Microsporum langeronii (3,54 %), Trichophyton mentagrophytes var. mentagrophytes (1,82 %). D’autres especes ont ete retrouvees a une tres faible prevalence. Plusieurs types de dermatophytoses isolees ou associees ont ete identifiees. Les atteintes retrouvees etaient surtout les teignes du cuir chevelu (66,09 %), les onychomycoses (9,00 %), les lesions plantaires et palmaires (9,00 %), et les lesions erythemato-squameuses (3,07 %). Conclusion Cette etude montre que les dermatophyties sont des affections endemiques au Senegal, touchant surtout les jeunes femmes. Les atteintes du cuir chevelu sont les plus retrouvees.

Resume Introduction Les mycetomes sont des pseudotumeurs inflammatoires des tissus mous sous-cutanes et eventuellement osseux. Ils sont le plus souvent polyfistulises et evoluent sur un mode chronique. Patients et methodes Cette etude a interesse 113 patients recenses au laboratoire de parasitologie et mycologie de l’hopital Aristide Le Dantec, de Dakar, au Senegal durant la periode allant de juin 2008 a juillet 2010. Resultats Les patients, provenant de differentes regions du Senegal et de la sous region, sont referes au niveau du laboratoire apres suspicion de mycetome. Parmi 250 patients, 113 se sont reveles positifs a l’examen direct et apres culture soit un indice d’infestation de 45,2 %. L’âge moyen des patients varie de 13 ans a 73 ans avec une moyenne d’âge de 33,9 ans. La tranche d’âge comprise entre 20–39 ans est la plus touchee (27,34 %), suivie de celle entre 40–59 ans (25,2 %), 60 ans et plus (4,5 %), 30–39 ans (16,64 %), 13–19 ans (7,2 %). Les hommes sont plus atteints que les femmes avec respectivement 79,6 % et 20,4 %. Les cultivateurs sont les plus representes avec 48,7 %, suivis des eleveurs (42,5 %). Les atteintes du pied sont les plus retrouvees (72,5 %), suivies de la jambe (12,3 %), du genou (7,1 %), du cuir chevelu (2,7 %), de la main (1,8 %). Les autres localisations sont retrouvees avec moins de 1 %, dos, cuisse, poitrine et ganglion inguinal. Les mycetomes fongiques sont plus retrouves que les mycetomes actinomycosiques avec respectivement 70 % et 30 % ; les especes les plus retrouvees sont : Madurella mycetomatis (53,1 %), Actinomadura pelletieri (23 %), Leptosphaeria senegalensis (9,7 %), Streptomyces somaliensis (2,6 %), Actinomadura madurae (2,6 %), Pseudallescheria boydii (1,8 %), Nocardia spp. (1,8 %), Scedosporium apiospermum (0,9 %), Fusarium solani (0,9 %). Nous avons retrouves des agents de dermatophytes : Microsporum langeronii (1,8 %), et Trichophyton mentagrophytes (0,9 %). Conclusion Cette etude montre que les mycetomes sont des affections endemiques au Senegal, handicapant a la longue, et touchent particulierement les personnes vivant en zone rurale.

Resume Introduction Les teignes du cuir chevelu sont des affections dues a des dermatophytes qui sont des champignons filamenteux septes adaptes a la keratine humaine et animale colonisant et parasitant la peau et les phaneres de l’homme. Materiels et methodes Cette etude a concerne 607 cas de teignes du cuir chevelu diagnostiques au laboratoire de parasitologie et mycologie de l’hopital Aristide-Le-Dantec, a Dakar, au Senegal durant la periode allant de juin 2005 a juin 2007. Resultats Les patients au nombre de 1309 sont enregistres au niveau du laboratoire apres suspicion de teigne du cuir chevelu a la consultation. Parmi ces patients, 607 se sont reveles positifs a l’examen direct et a la culture soit un indice d’infestation de 45,84 %. L’âge des patients varie entre trois mois a 69 ans avec une moyenne d’âge de 25 ans. La tranche d’âge comprise entre dix a 19 ans est la plus infestee (27,34 %), suivie de celle entre 20 a 29 ans (26,20 %), zero a neuf ans (22,57 %), 30 a 39 ans (16,64 %), 40 a 49 ans (5,43 %), 50 a 59 ans (1,81 %) et 60 a 69 ans (0,16 %). Nous avons trouve une prevalence des teignes plus elevee chez les sujets de sexe masculin avec 57,56 % contre 41,84 % chez le sexe feminin. Six especes ont ete isolees : Trichophyton soudanense qui est l’espece la plus retrouvee avec 55,19 %, suivie de Microsporum langeroni 28,84 %, Trichophyton rubrum (14,82 %), Microsporum canis (0,67 %), Trichophyton mentagrophytes (0,32 %) et Trichophyton violaceum (0,16 %). Conclusion Cette etude montre que les teignes du cuir chevelu sont des affections endemiques au Senegal et touchent particulierement les enfants entre dix et 19 ans.

Resume Objectif L’objectif general de cette etude etait de faire l’etat des lieux sur les essais cliniques realises a Dakar afin de formuler des recommandations pour la realisation d’essais cliniques de qualite au Senegal. Methode Nous avons effectue une enquete de mars a mai 2007 aupres des investigateurs des deux plus grands hopitaux universitaires du Senegal et au niveau de la direction de la pharmacie et du comite d’ethique. Resultats Nos principaux resultats ont montre : 1) un faible taux de participation des enseignants aux essais cliniques (11 sur 37 interroges); 2) que l’industrie pharmaceutique est le principal promoteur des essais cliniques; 3) que la plupart des investigateurs n’ont pas de diplome en essais cliniques; 4) que les principales pathologies concernees sont le paludisme et le SIDA; 5) qu’il existe des textes regissant les essais cliniques au Senegal. Conclusion Cette etude montre la necessite d’integrer, au Senegal, les essais cliniques dans les curricula de formation des etudiants.

Resume Objectif Cette etude avait pour objectif d’evaluer les connaissances et attitudes des medecins generalistes du prive a Dakar, par rapport a la prescription des benzodiazepines, en vue de proposer, eventuellement, des recommandations pour leur usage rationnel. Methode Il s’agit d’une enquete realisee en 2005 avec un echantillon representatif de 55 medecins. Les medecins ont rempli eux-memes le questionnaire qui portait surtout sur les principales indications des benzodiazepines, celles prescrites et leurs regles de prescription. Resultats Les principales indications etaient l’anxiete, les convulsions, l’epilepsie et l’insomnie, et les benzodiazepines prescrites en premiere intention etaient le prazepam devant l’anxiete et l’insomnie et le diazepam devant les convulsions et l’epilepsie. Pratiquement 17 % des medecins ignoraient l’existence d’une duree limite d’utilisation des benzodiazepines et 70,9 % des medecins consideraient leur formation sur les benzodiazepines insuffisante. Conclusion Ces resultats montrent la necessite d’asseoir des formations continues pour ces medecins sur la pharmacologie des benzodiazepines.

Mitragyna inermis is used in the Senegal traditional medicine for treating stomach and intestinal disorders. At concentrations of 0.5, 0.75 and 1 mg/ml, the aqueous extract of M. inermis bark (AEMIB) significantly induced a decrease of the ileal basal tonus, respectively, from 37+/-1, 51+/-1 and 75+/-2% (P0.05; n=5), compared to the baseline values. As well as atropine, AEMIB inhibited submaximal contractions induced by 0.01 mg/ml ACh with IC(50) value of approximately 0.75 mg/ml (n=5). These results show that AEMIB possesses both myorelaxant and antispasmodic actions in the ileum. This may justify the pharmacological basis for the popular use of Mitragyna for the treatment of gastrointestinal disorders.

Prescription and use of benzodiazepins were evaluated with a patients survey. Direct interview were conducted with 150 patients in ten pharmacies in the city of Saint-Louis, Senegal from January to June 2002. Ten of the 15 retail pharmacies in this city agreed to participate in the survey. All patients gave their agreement to participate to the study; the questionnaire contained essentially closed questions. Writers of prescriptions were general practitioners (38.67%), specialists (34.67%), nurses (18%) and midwifes (8.66%). The most prescribed benzodiazepins were prazepam, dipotassic clorazepate, lorazepam and diazepam. Use of these drugs during night is most recommended. Nevertheless, 26.67% of the prescriptions indicated the drug should be use during the day. The period of use was between one and three Months for 33.99% of patients and three Months or more in 42%. Benzodiazepins were used by 66.67% for insomnia, alone or associated with another condition, for anxiety by 14.6% and for epilepsy by 10%. Prescriptions were for benzodiazepins alone in 47.37% of the patients and in combination with other psychotropic drugs for 19.33%. Somnolence and dependence were the most reported side effects.