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TropGENE DB is a database that manages genetic and genomic information about tropical crops studied by Cirad. The database is organised into crop specific modules. Three modules will soon be on line including one about sugarcane. Each module includes data on genetic ressources (agro-morphological data, parentages, allelic diversity), information on molecular markers, genetic maps, results of QTL analyses, data from physical mapping, sequences, genes... Aimed for internet, TropGENE was used internally until the development of the Web version in 2002. TropGENE DB was developed using the ACEDB[1] system, ACEDB is an objectoriented system capable of storing and retrieving complex biological information. ACEDB is currently used by many databases (thirty one plant-related databases available from the UK Crop Plant Bioinformatics Network WWW site[2]). ACEDB provides an intuitive objectoriented view of biological data, and a graphical user interface with many specialized data visualization tools, such as genetic map viewer and a sequence annotation display. A set of Perl CGI scripts (AceBrowser, WebAce) have been yet implemented to allow to any ACEDB databases to be browsed via World Wide Web pages. (Texte intégral)

Ce rapport comprend quatre parties distinctes. La première partie est un compte-rendu du projet INPhO de création d'un réseau international d'information sur les oprérations post-récolte, projet dont le CIRAD est le cofondateur avec la FAO et le GTZ. La deuxième partie, concerne le séminaire 1998 organisé par le GASGA sur le thème "La post-récolte : CGIAR et GASGA, un travail pour un système post-récolte". La troisième partie est un compte-rendu de la réunion annuelle du GASGA sur les activités du groupe. Enfin, la quatrième partie regroupe l'ensemble des contacts établis à l'occasion de cette mission à Rome. Plusieurs annexes, correspondant aux différentes parties, sont jointes à ce rapport

Cette mission à Porto Alegre, au Brésil a deux objectifs : - participer au 1er séminaire sur le riz rouge en Amérique Latine, - présenter le projet de cédérom des adventices du riz en Amérique Latine. Ce séminaire a rassemblé 250 personnes venant de différents pays d'Amérique Latine, des Etats Unis et de France et représentant les universités, les centres de recherche internationaux et nationaux, les organismes de développement liés à la production rizicole, ainsi que les firmes phytosanitaires et producteurs de semences. Il a permis de cerner l'importance du problème que représente le riz rouge en culture de riz irrigué. Un pays comme l'Uruguay est quasiment indemne tandis que le Rio Grande do Sul, au Brésil, est totalement infesté. Nous avons fait le point sur l'état de connaissances, tant sur l'origine, la génétique, la physiologie du riz rouge que sur la production de semences et les méthodes de luttes depuis les itinéraires culturaux, jusqu'à l'utilisation de variétés résistantes aux herbicides, transgéniques ou non. Finalement, nous avons envisagé les perspectives de recherche dans ce domaine, compte tenu de l'importance des besoins en riz prévue dans les 20 prochaines années. Ce séminaire fut l'occasion de présenter le projet de développement d'un cédérom sur les adventices du riz en Amérique Latine et de faire une démonstration du procédé utilisé dans Adventrop, qui servira de base à ce logiciel. De nombreuses personnes rencontrées ont été intéressées à collaborer scientifiquement ou financièrement au projet. La mise en place d'un important programme de malherbologie du riz au CIAT, en février 1999, avec un malherbologue, doit permettre de lancer la phase de réalisation du projet.

Ce rapport présente un projet de recherche relatif à la mise au point d'un outil de suivi-évaluation permettant d'améliorer la gestion des périmètres irrigués collectifs autogérés situés autour des villes de Petrolina et Juazeiro. Il devrait être mis en oeuvre dans le cadre de la coopération entre l'EMBRAPA SEMI ARIDO et le CIRAD.