Search

espanolLas cabras constituyen el mayor grupo de ganado rumiante en Nigeria y desempenan un papel estrategico en el aporte de proteina animal y en la mejora de la economia de los hogares rurales. Se investigo acerca de la region hipervariable 1 (HVR1) del genoma mitocondrial caprino con el fin de comprender mejor la importancia de la diversidad genetica para mejorar la seleccion en los programas de mejora y conservacion animal. Se secuencio y se analizo la region hipervariable 1 del ADN mitocondrial (HVR1) en 291 cabras autoctonas de Nigeria no relacionadas (Enana de Africa Occidental (EAO), Roja de Sokoto (RS) y Sahel (S)), seleccionadas aleatoriamente a lo largo del pais y comparadas con las secuencias HVR1 de 336 cabras indias y con otras 12 secuencias de 5 especies diferentes del generoCapra (C. falconeri, C. ibex nubiana, C. aegagrus, C. cylindricornis yC. sibirica). Un total de 139 sitios polimorficos de 291 individuos se concentraron en 204 haplotipos. La variacion intra- e interpoblacional fue de 77,25 por ciento y de 22,74 por ciento, respectivamente. Las cabras nigerianas mostraron una elevada diversidad genetica (0,87) y unos valores de FST elevados, distintos de los de las cabras indias y de los de las otras especies salvajes. De acuerdo con los haplogrupos, la cabra EAO se desliga de poblaciones concomitantes de RS y S con una historia demografica diferente. Se identifico una estructura genetica clara entre las razas caprinas de Nigeria, con una variacion apreciable en la region HVR1 del ADN mitocondrial. Este estudio agrupo las razas caprinas nigerianas en dos grupos principales, sugiriendo asi dos origenes demograficos distintos para las razas septentrionales y meridionales. El alto grado de mezcla genetica denota origenes maternos distintos, a diferencia de lo observado en cabras del Levante y Asia Central, donde se domesticaron originalmente las cabras. Palabras clave: diversidad genetica, cabras, region hipervariable, ADN mitocondrial, Nigeria EnglishGoats make up the largest group of ruminant livestock in Nigeria and are strategic in bridging animal protein supply gap and improving the economy of rural households. The hypervariable region 1 (HVR1) of the caprine mitochondrial genome was investigated to better understand genetic diversity important for improving selection for animal breeding and conservation programs. We sequenced and analysed the mitochondrial DNA (mtDNA) HVR1 in 291 unrelated indigenous Nigerian goats (West African Dwarf (WAD), Red Sokoto (RSO) and Sahel (SAH)), randomly sampled from around the country, and compared them with the HVR1 sequences of 336 Indian goats and 12 other sequences in five different species in the genusCapra (C. falconeri, C. ibex nubiana, C. aegagrus, C. cylindricornis andC. sibirica). A total of 139 polymorphic sites from 291 individuals were captured in 204 haplotypes. Within and among population variations were 77.25 and 22.74 percent, respectively. Nigerian goats showed high genetic diversity (0.87) and high FST values, and separate from Indian goats and other wild species. Haplogroups in WAD separates it from RSO and SAH concomitant with a differentdemographic history. Clear genetic structure was found among Nigerian goat breeds with appreciable variation in mtDNA HVR1 region. This study grouped Nigerian goat breeds into two major groups suggesting two different demographic origins for Northern and Southern breeds. High genetic admixing denotes different maternal origins and in contrast to evidence from goats from Levant and Central Asia, where goats were originally domesticated. Keywords: genetic diversity, goats, hypervariable region, mitochondrial DNA, Nigeria francaisLes caprins constituent le plus grand groupe de ruminants domestiques au Nigeria et jouent un role strategique dans l’approvisionnement en proteines animales et dans l’amelioration de l’economie des menages ruraux. Une recherche a ete menee a propos de la region hypervariable 1 (HVR1) du genome mitochondrial caprin dans le but de mieux comprendre l’importance de la diversite genetique pour ameliorer la selection dans les programmes d’amelioration genetique et de conservation des animaux. La region hypervariable 1 de l’ADN mitochondrial (HVR1) a ete sequencee et analysee chez 291 chevres indigenes du Nigeria, sans rapport entre elles (Naine d’Afrique Occidentale (NAO), Rouge de Sokoto (RS) et Sahel (S)), echantillonnees de maniere aleatoire a travers le pays et comparees avec les sequences HVR1 de 336 chevres indiennes et avec 12 autres sequences de 5 especes differentes du genre Capra (C. falconeri, C. ibex nubiana, C. aegagrus, C. cylindricornis et C. sibirica). Un total de 139 sites polymorphes de 291 individus a ete rassemble en 204 haplotypes. La variation intra- et inter-populationnelle a ete de 77,25 pour cent et de 22,74 pour cent, respectivement. Les caprins nigerians ont montre une grande diversite genetique (0,87) et des valeurs de FST elevees et differentes de celles des chevres indiennes et de celles des autres especes sauvages. D’apres les haplogroupes, la chevre NAO serait a separer des populations concomitantes de RS et S avec une histoire demographique differente. Une structure genetique claire a ete decelee entre les races caprines du Nigeria, avec une variation substantielle dans la region HVR1 de l’ADN mitochondrial. Cette etude a regroupe les races caprines nigerianes en deux groupes principaux, ce qui suggere deux origines demographiques differentes pour les races du Nord et du Sud. Le fort degre de melange genetique denote des origines maternelles differentes, contrairement a ce qui a ete observe chez les chevres du Levant et d’Asie Centrale, ou les caprins furent d’abord domestiques. Mots-cles: diversite genetique, caprins, region hypervariable, ADN mitochondrial, Nigeria

This study aimed at using a multivariate approach to describe the body structure of Djallonke sheep in northern Ghana and to determine which approach explains better the variation in body composition. Live weight (LW) and linear body measurements including heart girth (HG), neck girth (NG), chest depth (CD), height at withers (HW), rump height (RH), body length (BL) and pin-bone width (PBW) were obtained from 172 sheep aged between two and three years. The fixed effects of sex and age were tested using the general linear model (GLM) while the Nearest Neighbor method of Hierarchical Cluster Analysis was used to group body traits into clusters. Principal Component Factor Analysis was used to describe the variation in body traits where extracted factors were varimax rotated to enhance interpretability. The analysis of variance revealed significant (P 0.05). Age had no significant influence (P > 0.05) on the body traits. The sheep weighed 26.92 ± 0.89 kg averagely and had averages of other body measurements to be: 71.74 ± 1.23, 40.52 ± 0.79, 27.73 ± 0.52, 60.72 ± 0.86, 59.61 ± 0.87, 58.87 ± 1.06 and 12.81 ± 0.23 cm for HG, NG, CD, HW, RH, BL and PBW, respectively. The product moments of correlation were positive and significant (P

Este estudio examina la capacidad para distinguir los rasgos morfologicos y de tolerancia al calor en pavos autoctonos, exoticos y cruzados en Nigeria mediante el analisis discriminante multivariado. Un total de 228 pavos de 20 semanas de edad fueron utilizados en el estudio. Los parametros corporales medidos fueron el peso corporal (BW), diametro longitudinal (BL), longitud del tarso (SL), longitud del muslo (TL), longitud de quilla (KL), perimetro toracico (BG), temperatura rectal (RT), frecuencia del pulso (PR), frecuencia respiratoria (FR) y el indice de estres termico (HI). El analisis de la varianza revelo que los pavos exoticos mostraban valores significativamente ( p < 0,05) mayores que los pavos autoctonos de Nigeria y que los cruzados para todos los rasgos morfologicos, con la excepcion de la TL. Sin embargo, los pavos autoctonos y los cruzados parecian tener mas capacidad de adaptacion que los exoticos en base a valores de HI mas bajos. El dimorfismo sexual se observo solo en los caracteres morfologicos, donde los machos presentaron de forma significativa ( p < 0,05) un mayor BW, BL, SL, TL y KL que en las hembras. Sin embargo, el analisis discriminante por pasos revelo que BW, TL y HI, fueron las variables mas discriminantes a la hora de separar los tres grupos geneticos. La mayor distancia de Mahalanobis se observo entre los pavos autoctonos y exoticos (36,68), mientras que la distancia mas corta se registro entre los pavos autoctonos y los cruzados (7,97). El diagrama canonico puso de manifiesto la heterogeneidad de las poblaciones de pavo, agrupando las aves por separado. En el nivel de asignacion mas cercano del analisis discriminante, el 100,00%, el 98,73%y el 96,43%de pavos exoticos, cruzados y autoctonos fueron asignados correctamente en sus grupos de origen genetico. Los presentes hallazgos podrian ayudar a la implementacion de una estrategia de conservacion y mejora de los pavos autoctonos hacia el desarrollo sostenible de los recursos zoogeneticos.

Los recursos ganaderos autoctonos son de caracter estrategico en los aspectos socioeconomicos de los sistemas agricolas para garantizar la seguridad alimentaria en los paises de escasos recursos. Por lo tanto, conocer mejor la importancia de la variabilidad genetica es vital para su futura utilizacion, por medio de la conservacion. Se presenta el primer analisis de la diversidad genetica en ovejas de Nigeria basado en la region de control (D-loop) del Ovis aries del genoma mitocondrial, utilizando 1.179 bases entre las posiciones 15.437 y 16.616 de pares de bases. Una muestra de 290 animales, compuesta por las razas Balami, West African Dwarf (WAD), Uda y Yankasa, fue tomada al azar de toda Nigeria. Se observaron noventa y seis (96) haplotipos, con una alta diversidad media en cuanto a estos de 0,899 ± 0,148. La diversidad genetica fue mayor en la raza Uda (0,921 ± 0,021) y menor en la raza WAD (0,852 ± 0,061). Los indices de poblacion especificos FST variaron de 0.00133 en la raza Uda a 0,00335 en la razaWAD. La raza Yankasa presento el mayor numero de posiciones polimorficas (201), mientras que el menor lo mostro la raza Uda (96). Analisis de la varianza molecular revelo que 0,23% de la variacion se encuentra entre las poblaciones, en comparacion con el 99,77% de variacion que se encuentra dentro de las poblaciones. El arbol filogenetico indica que los linajes mitocondriales de las razas ovinas partieron de un origen comun en conformidad con la primera divergencia de la raza Yankasa, seguida por WAD, mientras que las razas Balami y Uda se encuentran mas estrechamente relacionadas. Estos resultados demuestran que la divergencia evolutiva de las poblaciones ovinas de Nigeria, basados en el ADN mitocondrial de la region control, puede coincidir con la distribucion geografica en Nigeria e indican una tasa importante de cruzamiento entre ellas. Esto podria tener ventajas desde el punto de vista de la gestion de la mejora y las estrategias de conservacion y preservacion a largo plazo de las ovejas autoctonas de Nigeria.

To better understand natural genetic variation in indigenous livestock resources, as well as formulate conservation policies, better genetic characterization is required to balance the competing needs of genetic improvement and conservation of native germplasm, primarily in rural agricultural systems in developing countries. Genetic diversity of goats in southern Nigeria was assessed using 295 indigenous goats with ten microsatellite DNA markers. The breeds are West African Dwarf (WAD), Red Sokoto (RS) and Sahel (SA) sampled from farms, market places and rural homesteads. The mean expected heterozygosity (HE) ranged from 0.608 to 0.784 in two sub-populations of WAD goats. Deviations from Hardy�Weinberg equilibrium (HWE) were statistically significant ( p < 0.05) indicating that these populations are under various forces stemming from the management choices of rural dwellers. Polymorphic information content of these markers averaged 0.803 and mean GST index was 0.176. The measure of genetic distance between pairs of breeds indicated that the lowest distance was between WAD and RS (0.268) and the highest distance was between WAD and SA (0.662) goats, respectively. The estimated dendogram clustered these Nigerian goats into nine sub-populations and two major genetic groups. The study suggests that indigenous goat populations in southern Nigeria may be collapsed from three breeds into two distinct genetic groups, possibly due to extensive cross-breeding and gene flow between them, which are symptomatic of uncontrolled crossing across much of the country.

Fueron tomadas muestras de sangre para el analisis proteico en tres variedades de gallinas autoctonas nigerianas (de plumaje normal, de plumaje rizado y de cuello desnudo) y una variedad exotica (Anak Titan). Cada una de estas poblaciones representa un genotipo. Se usaron muestras de sangre de 50 animales por genotipo para valorar la diversidad genetica de las gallinas autoctonas nigerianas. Fueron observados un total de 18 grupos a partir de las cuatro variedades durante la resolucion de la proteina utilizando electroforesis en gel de poliacrilamida con dodecilsulfato sodico (pagina de SDS). El dendograma desarrollado desde los diferentes grupos observados revelo que las variedades se encontraban claramente separadas unas de otras y con una semejanza genetica media entre las cuatro variedades del 55 percent, siendo la variedad de cuello desnudo las mas separada.