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Large-scale next-generation sequencing (NGS) germline testing is technically feasible today, but variant interpretation represents a major bottleneck in analysis workflows. This includes extensive variant prioritization, annotation, and time-consuming evidence curation. The scale of the interpretation problem is massive, and variants of uncertain significance (VUSs) are a challenge to personalized medicine. This challenge is further compounded by the complexity and heterogeneity of the standards used to describe genetic variants and the associated phenotypes when searching for relevant information to support clinical decision making. To address this, all five Swiss academic institutions for Medical Genetics joined forces with the Swiss Institute of Bioinformatics (SIB) to create SwissGenVar as a user-friendly nationwide repository and sharing platform for genetic variant data generated during routine diagnostic procedures and research sequencing projects. Its aim is to provide a protected environment for expert evidence sharing about individual variants to harmonize and upscale their significance interpretation at the clinical grade according to international standards. To corroborate the clinical assessment, the variant-related data will be combined with consented high-quality clinical information. Broader visibility will be achieved by interfacing with international databases, thus supporting global initiatives in personalized healthcare. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Resumen Objetivo Método Resultados Interpretación Para facilitar los estudios multicéntricos y la investigación clínica internacional, este estudio pretende identificar de forma consensuada los elementos de datos estandarizados para la artrogriposis múltiple congénita (AMC).Estudio de métodos mixtos de grupos de discusión y tres rondas de encuestas Delphi modificadas para llegar a un consenso utilizando dos escalas de clasificación por niveles.En total, 45 expertos clínicos y adultos con experiencia vivida (incluidos 12 miembros de un consorcio de AMC) participaron en este estudio procedentes de 11 países: Norteamérica, Europa y Australia. Los CDEs incluyen 321 elementos de datos y 19 medidas estandarizadas en varios dominios desde el desarrollo fetal hasta la edad adulta. Los elementos de datos relativos a los rasgos fenotípicos del CDEs se mapearon de acuerdo con la Ontología de Fenotipos Humanos. Se identificaron como principales facilitadores la estructura de gobernanza universal, protocolos operados de forma local y los planes de sostenibilidad, mientras que los principales obstáculos observados son la capacidad limitada para compartir datos y la necesidad de una infraestructura informática federada.La recopilación de datos sistemáticos sobre la AMC mediante CDEs permitirá investigar las vías etiológicas, describir el perfil epidemiológico y establecer correlaciones genotipo‐fenotipo de forma estandarizada. Los CDEs propuestos facilitarán las colaboraciones multidisciplinares internacionales mejorando los estudios a gran escala y las oportunidades para compartir datos, translación de conocimiento y difusión. [ABSTRACT FROM AUTHOR]