Search

International audience

Since 2007, national public health laboratories in the WHO Eastern Mediterranean Region (EMR) have participated in a regional external quality assessment scheme in bacteriology to improve testing proficiency.To assess laboratory performance in bacteriology in the EMR between 2011 and 2019 using the regional external quality assessment scheme.We analysed the accuracy of participant-reported data in bacterial identification, Gram stain microscopy, and antimicrobial susceptibility testing. For each category, we assessed the performance over time, the performance on multiple organisms, and whether a laboratory repeatedly failed to attain satisfactory results.Between 2011 and 2019, 70% of laboratories achieved satisfactory performance for bacterial identification and antimicrobial susceptibility testing, and 85% performed satisfactory Gram stain microscopy. Testing did not improve on multiple organisms and results were consistently low for some pathogens and test categories. Twenty-nine percent of laboratories underperformed throughout the study period.The unchanged performance over time and underperformance of laboratories highlight the need for improvements in the regional external quality assessment scheme. Participating laboratories and WHO need to work more actively to strengthen the problem areas.التقييم الخارجي لجودة أداء المختبرات المتخصصة في علم الجراثيم في إقليم شرق المتوسط، 2011–2019.همايون أصغر، كارين نهابتيان، أماني غنيم، فرانك كونينجز، أمينة الجرداني.منذ عام 2007 ، شاركت مختبرات الصحة العامة الوطنية في إقليم شرق المتوسط في مخطط إقليمي للتقييم الخارجي للجودة في علم الجراثيم لتحسين كفاءة الاختبارات.هدفت هذه الدراسة الى تقييم أداء المختبرات في مجال علم الجراثيم في إقليم شرق المتوسط بين عامَي 2011 و 2019 ، باستخدام النظام الإقليمي للتقييم الخارجي للجودة.حللنا دقة البيانات التي أبلغ بها المشاركون فيما يخص تحديد الجراثيم، والفحص المجهري لصبغة جرام، واختبار الحساسية لمضادات الميكروبات. وبالنسبة إلى كل فئة، قيمنا الأداء مع مرور الزمن، والأداء على كائنات حية متعددة، وما إذا كان المختبر قد فشل مرارًا في تحقيق نتائج مُرضية.بين عامَي 2011 و 2019 ، حقق 70 ٪ من المختبرات أداءً مُرضيًا في التعرف على الجراثيم وتحديدها واختبار الحساسية لمضادات الميكروبات، ونفذ 85 ٪ منها الفحصَ المجهري لصبغة جرام تنفيذًا مُرضيًا. ولم يتحسن مستوى الاختبار على كائنات حية متعددة، وكانت النتائج منخفضة باستمرار فيما يخص بعض مسببات الأمراض وفئات الاختبارات. وكان أداء 29 ٪ من المختبرات دون المستوى خلال فترة الدراسة.إن عدم تغيُُّّر الأداء بمرور الوقت والأداء القاصر للمختبرات يبرزان الحاجة إلى إدخال تحسينات على الخطة الإقليمية للتقييم الخارجي للجودة. لذا، يتعيََّّن على المختبرات المشارِكة و المختبرات المشاركة ومنظمة الصحة العالمية بحاجة إلى العمل بشكل أكثر نشاطا لتقوية مناطق المشاكل.Évaluation externe de la qualité des performances des laboratoires en bactériologie dans la Région de la Méditerranée orientale, 2011-2019.Depuis 2007, les laboratoires de santé publique nationaux de la Région OMS de la Méditerranée orientale ont participé à un système régional d'évaluation externe de la qualité en bactériologie afin d'améliorer la bonne exécution des analyses.Évaluer les performances des laboratoires en bactériologie dans la Région de la Méditerranée orientale entre 2011 et 2019 à l'aide du système régional d'évaluation externe de la qualité.Nous avons analysé l'exactitude des données communiquées par les participants concernant l'identification bactérienne, la microscopie après coloration de Gram et les tests de sensibilité aux antimicrobiens. Pour chaque catégorie, nous avons évalué la performance au fil du temps, la performance sur plusieurs micro-organismes et avons vérifié si un laboratoire n'a pas obtenu des résultats satisfaisants à plusieurs reprises.Entre 2011 et 2019, 70 % des laboratoires ont obtenu des résultats satisfaisants pour l'identification bactérienne et les tests de sensibilité aux antimicrobiens, et 85 % ont effectué une microscopie après coloration de Gram satisfaisante. Les tests ne se sont pas améliorés sur plusieurs micro-organismes et les résultats étaient systématiquement faibles pour certains agents pathogènes et certaines catégories de tests. Vingt-neuf pour cent des laboratoires ont eu des résultats insuffisants tout au long de la période d'étude.Les performances inchangées au cours du temps et les résultats insuffisants des laboratoires soulignent la nécessité d'améliorer le système régional d'évaluation externe de la qualité. Les laboratoires participants et l'OMS doivent collaborer plus activement pour renforcer les domaines qui posent problème.

Influenza viruses must be amplified in cell culture for detailed antigenic analysis and for phenotypic assays assessing susceptibility to antiviral drugs or for other assays. Following on from the first external quality assessment (EQA) for isolation and identification of influenza viruses using cell culture techniques in 2016, a follow up EQA was performed in 2019 for National Influenza Centres (NICs) in the World Health Organization (WHO) South East Asia and Western Pacific Regions. Nineteen WHO NICs performed influenza virus isolation and identification techniques on an EQA panel comprising 16 samples, containing influenza A or B viruses and negative control samples. One sample was used exclusively to assess capacity to measure a hemagglutination titer and the other 15 samples were used for virus isolation and subsequent identification. Virus isolation from EQA samples was generally detected by assessment of cytopathic effect and/or hemagglutination assay while virus identification was determined by real time RT-PCR, hemagglutination inhibition and/or immunofluorescence assays. For virus isolation from EQA samples, 6/19 participating laboratories obtained 15/15 correct results in the first EQA (2016) compared to 11/19 in the follow up (2019). For virus identification in isolates derived from EQA samples, 6/19 laboratories obtained 15/15 correct results in 2016 compared to 13/19 in 2019. Overall, NIC laboratories in the Asia Pacific Region showed a significant improvement between 2016 and 2019 in terms of the correct results reported for isolation from EQA samples and identification of virus in isolates derived from EQA samples (p=0.01 and p=0.02, respectively).

The emergence and re-emergence of viral haemorrhagic fevers (VHFs) is a growing concern worldwide. They are associated with major epidemics with an estimated 51-101 million cases each year, of which around 67 000 are fatal. In 2007, 13 countries in the Eastern Mediterranean Region reported VHF cases.The main purpose of the study was to review the epidemiological situation in the Region vis-à-vis VHFs to obtain baseline epidemiological information for the establishment of the Emerging Dangerous Pathogen Laboratory Network (EDPLN).A literature search was performed using PubMed, ProMED-Mail and GIDEON databases. Reported data included disease burden (reported cases and deaths), human prevalence (general population, high-risk groups), vectors and reservoirs. A scoring method was employed to divide countries into 4 groups (very highly, highly, medium and low affected countries).Very highly affected countries were Afghanistan, Egypt, Islamic Republic of Iran, Saudi Arabia and Sudan. Highly affected countries were Djibouti, Morocco, Oman, Pakistan, Tunisia and Yemen. Medium affected countries were Iraq, Somalia and United Arab Emirates. Low affected countries were Bahrain, Jordan, Lebanon, Libya, Palestine, Qatar and Syrian Arab Republic.This study contributes in prioritizing countries to be part of EDPLN and in addressing specific needs related to outbreak investigations, surveillance and research.التعرُّف على مواقع الخطر للحميات النزفية الفيروسية في إقليم شرق المتوسط: وجهات نظر نحو إنشاء شبكة مختبرات لكشف مسببات الأمراض المستجدة والخطيرة.ماثياس ألتمان، كارين نهابيتيان، همايون أصغر.تثير الحُمَّيات النزفية الفيروسية المستجدَّة والمعاودة للظهور قلقًا متزايدًا في جميع أرجاء العالم. إذ تسبب أوبئة ضخمة يصل تعداد المصابين بها كل عام إلى 51-101 مليون شخص، ينتهي ما يقرب من 67 ألفًا منهم بالموت. وفي عام 2007 ، أبلغ 13 بلدًا من إقليم شرق المتوسط عن حالات مصابة بالحُمَّيات النزفية الفيروسية.تمثل الهدف الرئيسي من هذه الدراسة في مراجعة الأوضاع الوبائية في الإقليم للحُمَّيات النزفية الفيروسية للحصول على المعلومات الأساسية الوبائية لتأسيس شبكة مختبرات مسببات الأمراض المستجدة الخطيرة.أجرى الباحثون بحثًا شاملاً في قواعد البيانات PubMed و ProMED-Mail و GIDEON، وشملت البيانات التي تضمنتها التقارير عبء المرض (عدد الحالات وعدد الوفيات التي أُبْلِغ عنها) ومعدل الانتشار بين البشر (في مجمل السكان وفي المجموعات المعرضة لمخاطر عالية)، ونواقل الأمراض ومستودعاتها. واستخدم الباحثون طريقة لتعيين الدرجات، لتقسيم البلدان إلى 4 مجموعات (بلدان مرتفعة التضرر جدًا، وبلدان مرتفعة التضرر، وبلدان متوسطة التضرر، وبلدان خفيفة التضرر).كانت البلدان المرتفعة التضرر جدًا هي: أفغانستان ومصر وجمهورية إيران الإسلامية والمملكة العربية السعودية والسودان. وكانت البلدان المرتفعة التضرر هي: جيبوتي والمغرب وعُمَن وباكستان وتونس واليمن. وكانت البلدان المتوسطة التضرر هي: العراق والصومال والإمارات العربية المتحدة. وكانت البلدان الخفيفة التضرر هي: البحرين والأردن ولبنان وليبيا وفلسطين وقطر والجمهورية العربية السورية.تساهم هذه الدراسة في وضع البلدان وفق أولويتها لتكون جزءًا من شبكة مختبرات مسببات الأمراض المستجدة الخطيرة، وفي معالجة الاحتياجات المحددة ذات الصلة بعمليات استقصاء الأوبئة، وترصدها، وبحثها.Identification des foyers de transmission de fièvres hémorragiques virales dans la Région de la Méditerranée orientale : perspectives pour le Réseau des laboratoires travaillant sur les agents pathogènes émergents et dangereux (EDPLN).L’émergence et la réémergence des fièvres hémorragiques virales (FHV) est une préoccupation mondiale croissante. Ces fièvres sont associées à la survenue d’épidémies majeures. On estime qu’entre 51 et 101 millions de cas surviennent chaque année, dont environ 67 000 sont mortels. En 2007, 13 pays de la Région de la Méditerranée orientale ont rapporté des cas de FHV.Le principal objectif de la présente étude était d’examiner la situation épidémiologique dans la Région eu égard aux FHV afin d’obtenir des informations épidémiologiques de base pour la mise en place du Réseau des laboratoires travaillant sur les agents pathogènes émergents et dangereux (EDPLN).Une recherche documentaire a été réalisée sur les bases de données PubMed, ProMED-Mail et GIDEON. Les données fournies incluaient la charge de morbidité (cas et décès signalés), la prévalence humaine (population générale, groupes à haut risque), les vecteurs et les réservoirs. Une méthode de notation a été utilisée pour diviser les pays en quatre groupes (pays très gravement touchés, gravement touchés, moyennement touchés et faiblement touchés).Les pays très gravement touchés étaient l’Afghanistan, l’Arabie saoudite, l’Égypte, la République islamique d’Iran et le Soudan. Les pays gravement touchés étaient Djibouti, le Maroc, Oman, le Pakistan, la Tunisie et le Yémen. Les pays moyennement touchés étaient les Émirats arabes unis, l’Iraq et la Somalie. Les pays faiblement touchés étaient Bahreïn, la Jordanie, le Liban, la Libye, la Palestine, le Qatar et la République arabe syrienne.La présente étude aide à classer par ordre de priorité les pays destinés à faire partie de l’EDPLN et à répondre à des besoins spécifiques en lien avec les investigations des flambées, la surveillance et la recherche.

AimsThe aim of the current study was to assess the proteolytic activities of collectin-bound MASP-1 and MASP-2 in the blood of patients with ischaemic stroke, as well as the association of their six genetic polymorphisms (rs3203210, rs28945070, rs28945073 inMASP1gene and rs2273343, rs12711521, rs147270785 inMASP2gene) with this pathology.MethodsIn total, 250 patients and 300 healthy subjects were involved in this study. MBL-associated serine protease (MASP)-1 and MASP-2 activities were measured using in-house developed immunofluorescent and enzyme-linked immunosorbent assays, respectively. Sequence specific primer PCR was used to study the association ofMASP1andMASP2genetic polymorphisms with ischaemic stroke.ResultsThe results obtained demonstrate that the activities of collectin-bound MASP-1 and MASP-2 in patients with ischaemic stroke are significantly higher than those in healthy subjects (pMASP1gene and the rs147270785 polymorphism in theMASP2gene are associated with ischaemic stroke (pConclusionsIn conclusion we suggest that the complement lectin pathway serine proteases, MASP-1 and MASP-2, can be associated with ischaemic stroke development risk and may participate in pathological events leading to post-ischaemic brain damage. Moreover rs3203210 and rs147270785 single nucleotide polymorphisms in theMASP1andMASP2genes, respectively, are strongly associated with ischaemic stroke, and the minor rs3203210*C and rs147270785*A alleles of these polymorphisms may be considered as protective factors for ischameic stroke, at least in the Armenian population.