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El vuelo es una actividad asociada a una diversa cantidad de comportamientos como por ejemplo, la búsqueda de alimentos y pareja o la huida de depredadores. Dada la complejidad de dicho carácter es necesario abordar su estudio desde diferentes perspectivas para comprenderlo de una manera completa. Bajo esta premisa la presente tesis propone, por un lado, evaluar la relación entre diferentes aspectos morfológicos y la capacidad de vuelo en distintas especies de Drosophila y, por otro lado, contribuir a la caracterización de la arquitectura genética de la capacidad de vuelo. Para esto último se buscará identificar y caracterizar aquellos genes que contribuyen a la expresión fenotípica del carácter. Como una aproximación a la capacidad de vuelo se utilizó la proporción de tiempo en vuelo (PTV) en experimentos de dos minutos. A su vez, se indagó la relación entre la PTV y diferentes variables morfológicas (wing loading, wing:thorax, wing aspect, entre otras), las cuales han sido postuladas como predictores de la capacidad de vuelo reiteradamente en diferentes trabajos. En la primera parte de la tesis se estudiaron dos pares de especies hermanas (D. melanogaster/D. simulans y D. buzzatii/D. koeferae) de hábitos ecológicos diferenciados provenientes de una misma localidad (Valle Fértil, San Juan, Argentina). Se observó una mayor PTV en D. simulans, D. koepferae y machos en comparación con D. melanogaster, D. buzzatii y hembras, respectivamente. Asimismo, la asociación entre los estimadores morfológicos obtenidos para los pares de especies hermanas varió de manera contrapuesta, sugiriendo la ausencia de una relación general entre la morfología y la capacidad de vuelo. En la segunda parte, se estudiaron los mismos caracteres en líneas isogénicas de D. melanogaster derivadas de una población de Carolina del Norte (Estados Unidos) de genoma conocido. Los análisis de asociación entre la PTV y la morfología realizados en esta parte mostraron diferencias con respecto a los de la primera parte, sugiriendo que la relación varía entre poblaciones de una misma especie. En relación al abordaje de la arquitectura genética de la capacidad de vuelo, se detectó la existencia de variación genética para la PTV y para su coeficiente de variación (CV), el cual es una medida de la robustez del carácter. La capacidad de vuelo presentaría una base poligénica y sexo-específica, la cual diferiría entre distintos estimadores (PTV y CV), ya que los mismos compartirían únicamente un gen. Particularmente, se encontró una asociación con 133 polimorfismos distribuidos en 69 genes, los cuales fueron sexo-específicos, ya que se encontraron asociados únicamente a uno de los sexos. En relación a los genes candidatos detectados, algunos ya habían sido relacionados con el vuelo (Bru-1, Dscam4, fru, fas,Fas3), mientras que otros constituyen el primer reporte para funciones asociadas al mismo. La mayoría de los genes candidatos se asoció a funciones vinculadas al sistema nervioso y en menor medida al desarrollo muscular. A modo de conclusión, los resultados expuestos en la presente tesis proporcionan información acerca de la relación entre la capacidad de vuelo y la morfología de manera comparativa entre 4 especies, sugiriendo que la misma posee una relevancia menor a la esperada en relación a la capacidad de vuelo. Adicionalmente, se aportó información novedosa acerca de la arquitectura genética de dicho complejo carácter, incluyendo una lista de genes candidatos cuyo rol en relación a la capacidad de vuelo podrá ser abordado en mayor profundidad en futuros estudios. Flight is an activity related to several behaviors, such as searching for food and a mate or escaping from predators. Given the complexity of this character, it is necessary to approach its study from different perspectives to understand it completely. Under this premise, this thesis proposes, on the one hand, to evaluate the association between different morphological aspects and flight capacity in different species of Drosophila and, on the other hand, to contribute to the characterization of the genetic architecture of the flight capacity. For the latter, we propose to identify and characterize those genes that contribute to the phenotypic expression of the character under study. As an approximation to flight capacity, the proportion of time in flight (PTF) was used in two-minutes experiments. In turn, the association between PTF and different morphological variables (wing loading, wing:thorax, wing aspect, among others) was investigated, as they have been repeatedly postulated as predictors of flight capacity in different studies. In the first part of this thesis, two pairs of sibling species (D. melanogaster/D. simulans and D. buzzatii/D. koeferae) with different ecological habits from the same locality (Valle Fértil, San Juan, Argentina) were comparatively studied. We detected a higher PTF in D. simulans, D. koepferae, and males than in D. melanogaster, D. buzzatii, and females, respectively. Likewise, the association between the morphological estimators obtained for the sibling species pairs was the opposite, suggesting the absence of a general relationship between morphology and flight capacity. In the second part, the same traits were studied in isogenic lines of D. melanogaster derived from a population of North Carolina (United States) with a known genome. The association analyses between PTF and morphology carried out in this part showed differences respect to the first part of this thesis, suggesting that the association varies between populations of the same species. Concerning the genetic architecture of flight capacity, we were able to detect the existence of genetic variation both for the PTF and the coefficient of variation of this trait, which represents a measure of the robustness of this character. Flight capacity seems to have a polygenic and sex-specific basis, which would differ between different estimators (PTF and CV), since they would share only one gene. Particularly, we found an association with 133 polymorphisms distributed in 69 sex-specific genes, specific since they were only associated with one of the sexes. Regarding the candidate genes detected, some of them had been linked to flight (Bru-1, Dscam4, fru, fas, Fas3) while, for others, this is the first report of a flight-related function. Most of the candidate genes were associated with functions related to the nervous system and, to a lesser extent, muscular development. In conclusion, this thesis provides further insight into the relationship between flight capacity and morphology from a comparative point of view among four species. Our results suggest that the morphology has less relevance than expected concerning flight capacity. Additionally, we provided novel information regarding the genetic architecture of this complex trait, including a list of candidate genes whose role in flight capacity should be addressed in greater depth in future studies. Fil: Flaibani, Nicolás. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina.

La cutícula vegetal es la capa más externa que cubre los órganos aéreos de las plantas y los protege de la pérdida de agua y del ataque de patógenos, además de determinar rasgos de calidad de fruto como el agrietado o la vida post cosecha. Recientemente identificamos dos regiones QTL en el cromosoma 3 asociadas a la cantidad de cutícula del fruto (cm3.1 y cm3.2) en una población RIL de un cruzamiento de la especie cultivada con el silvestre Solanum pimpinellifolium acc. TO-937. Además, una IL con una introgresión de TO-937 que contiene cm3.1 y cm3.2 (sp3-3) presentaba menor cantidad de cutícula que la línea parental de tomate cultivado ‘Moneymaker’ (MM). Con el objetivo de identificar genes candidatos para estos QTLs, la expresión de genes situados en las regiones próximas a los picos de los QTLs fue analizada mediante RT-qPCR a partir de extracciones de ARN de piel de frutos en cuatro estadios de desarrollo en las líneas sp3-3 y en MM. Se estudió la anotación de los genes en las regiones genómicas de ambos QTLs y se analizó la expresión de 42 de ellos. Los genes que presentaban mayores diferencias en sus perfiles de expresión entre las líneas sp3-3 y MM fueron analizados de nuevo empleando dos subILs obtenidas por selección asistida por marcadores que presentaban introgresiones acortadas de cm3.1 y cm3.2 e individualizadas, permitiendo así aislar los efectos de los dos QTLs y evitando posibles interferencias para la deposición de cutícula de otros QTLs conocidos que se sitúan en una región próxima a cm3.2 que también está presente en sp3-3. Los resultados obtenidos de este segundo análisis fueron consistentes con los anteriores y permitieron plantear 2-3 genes candidatos para cada uno de los dos QTLs, que serán estudiados próximamente mediante análisis funcional y que arrojarán luz sobre los mecanismos genéticos que subyacen a las diferencias observadas en la deposición de cutícula en diferentes cultivares de tomate. Universidad de Málaga. Campus de Excelencia Internacional Andalucía Tech.

Bud dormancy is a genotype-dependent mechanism observed in Prunus species in which bud growth is inhibited, and the accumulation of a specific amount of chilling (endodormancy) and heat (ecodormancy) is necessary to resume growth and reach flowering. We analyzed publicly available transcriptome data from fifteen cultivars of four Prunus species (almond, apricot, peach, and sweet cherry) sampled at endo- and ecodormancy points to identify conserved genes and pathways associated with dormancy control in the genus. A total of 13,018 genes were differentially expressed during dormancy transitions, of which 139 and 223 were of interest because their expression profiles correlated with endo- and ecodormancy, respectively, in at least one cultivar of each species. The endodormancy-related genes comprised transcripts mainly overexpressed during chilling accumulation and were associated with abiotic stresses, cell wall modifications, and hormone regulation. The ecodormancy-related genes, upregulated after chilling fulfillment, were primarily involved in the genetic control of carbohydrate regulation, hormone biosynthesis, and pollen development. Additionally, the integrated co-expression network of differentially expressed genes in the four species showed clusters of co-expressed genes correlated to dormancy stages and genes of breeding interest overlapping with quantitative trait loci for bloom time and chilling and heat requirements.