Search

ilustraciones, diagramas En humanos la infección por P. aeruginosa es controlada por múltiples factores de virulencia y es una de las causas más recurrentes y graves de infecciones asociadas a la atención en salud. Por lo tanto, el objetivo general de este estudio fue caracterizar los perfiles genómicos de virulencia en aislados clínicos de Pseudomonas aeruginosa provenientes de un hospital universitario de Bogotá- Colombia, utilizando la tecnología de secuenciación de genoma completo (WGS). Este estudio prospectivo se realizó durante los años 2019 y 2021, en donde se secuenciaron 54 aislamientos provenientes de 37 pacientes de los servicios de UCI, hospitalización y Unidad quirúrgica, utilizando las plataformas illumina y Oxford Nanopore. En los genomas se encontraron un total de 246 genes de virulencia, encontrando la presencia de genes de gran importancia en la virulencia de esta bacteria, como el gen pilA que se detectó en el 48,1% de los aislamientos y el gen algD en el 100%. Para las toxinas la prevalencia fue para exoU de (16,6%), exoT (92,5%), exoS (79,6%) y exoY (88,8%). Adicionalmente se encontró la presencia de 16 secuencio-tipos (ST) ya reportados y se encontraron 13 ST nuevos. En conclusión, el uso de tecnologías como WGS permitió determinar el perfil de virulencia de aislados clínicos de P. aeruginosa, logrando un acercamiento global a los perfiles de virulencia de los aislamientos clínicos de esta bacteria en el país, siendo el primer reporte de la prevalencia de más de 200 genes de virulencia en Colombia para P. aeruginosa. (Texto tomado de la fuente) In humans, P. aeruginosa infection is controlled by multiple virulence factors and is one of the most recurrent and serious causes of healthcare-associated infections. The aim of this study was to characterize the virulence genomic profiles in clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa from a hospital in Bogotá-Colombia, using whole genome sequencing (WGS) technology. A prospective study was carried out during the years 2019 and 2021, where 54 isolates from 37 patients from both the ICU and hospitalization services, and operating rooms were sequenced, using the illumina and Oxford Nanopore platforms. A total of 246 virulence genes were found in the genomes, finding the presence of genes of great importance in the virulence of this bacterium, such as the pilA gene that was detected in 48.1% of the isolates and the algD gene that found in the 100% of them. For toxins, the prevalence was for exoU de (16.6%), exoT (92.5%), exoS (79.6%) and exoY (88.8%). Additionally, the presence of 16 sequence-types (ST) already reported and 13 new ST were found. In conclusion, the use of technologies such as WGS made it possible to determine the virulence profile of clinical isolates of P. aeruginosa, achieving a global approach to the virulence profiles of the clinical isolates of this bacterium in the country, being the first report of the prevalence of more than 200 virulence genes in Colombia for P. aeruginosa. Maestría Magíster en Ciencias - Microbiología Biología molecular de agentes infecciosos

ilustraciones, gráficas, tablas Staphylococcus aureus es una bacteria de gran importancia clínica, caracterizada por ser la especie más virulenta dentro de su género y causante de infecciones muy diversas que pueden amenazar la vida de quienes las padecen. Sin embargo, su importancia no radica únicamente en las enfermedades que causa, sino en la alta capacidad que ha evidenciado para presentar resistencia a múltiples antibióticos dentro de los que se encuentran los βlactámicos, ejemplificada por la resistencia a meticilina. Los aislamientos resistentes a meticilina son un problema de salud pública mundial, que inicialmente se atribuían a ambientes hospitalarios, pero que con el paso del tiempo han comenzado a reportarse cada vez con más frecuencia en la comunidad. Adicional a esto, se ha observado resistencia a otros antibióticos con blancos terapéuticos diferentes. Lo anterior hace necesario la búsqueda de nuevas alternativas que permitan controlar el crecimiento bacteriano de aislamientos que no pueden tratarse mediante los antimicrobianos existentes actualmente. Este trabajo tiene como objetivo determinar el efecto de péptidos derivados de catelicidina en el crecimiento y la morfología de aislamientos clínicos de S. aureus procedentes de la ciudad de Bogotá D.C. Para ello, realizaremos la caracterización molecular respecto al gen de resistencia a meticilina mecA, la proteína A (spa) y pvl , causante de la presencia de leucocidina Panton-Valentine, e identificaremos los perfiles de sensibilidad a compuestos antibióticos de 57 aislamientos clínicos de S. aureus. Adicionalmente, evaluaremos la actividad de péptidos de catelicidina, LL-37 y ATRA-1, y daptomicina sobre los aislamientos clínicos caracterizados. Finalmente, identificaremos los cambios en la morfología bacteriana de S. aureus, por acción de los péptidos de catelicidina, mediante microscopía electrónica de barrido. Determinamos que existe una importante prevalencia de aislamientos resistentes a meticilina, y que además, existen aislamientos con discordancias en el perfil de sensibilidad a estos antibióticos en S. aureus, por otra parte se evidencia una tasa alta de sensibilidad a antibióticos con mecanismos de acciones diferentes a meticilina. Comprobamos que los péptidos LL-37 y ATRA-1 presentan capacidad antimicrobiana frente a este patógeno y que existen diferencias entre la actividad de estos compuestos y el perfil de sensibilidad a meticiilina. Finalmente, comprobamos que estos péptidos generan cambios en la morfología superficial como uno de sus mecanismos de acción, sin embargo, no se descarta que presenten efectos intracelulares que potencien su actividad antimicrobiana. Con este trabajo, buscamos contribuir a la vigilancia de la resistencia bacteriana en la ciudad de Bogotá, promover el desarrollo de nuevas alternativas terapéuticas que permitan controlar la resistencia bacteriana en nuestra región, así como aportar en la caracterización de la actividad de péptidos antimicrobianos sintéticos en S. aureus. (Texto tomado de la fuente) Staphylococcus aureus is a bacterium of great clinical importance. It is the most virulent species within its genus and the cause of very diverse infections that can threaten the lives of those who suffer from them. More importantly, it has shown resistance to multiple antibiotics, including β-lactam antibiotics, like Methicillin resistance. Methicillin-resistant isolates are a worldwide public health problem, attributed initially to hospital environments, but it has begun to be reported more and more frequently in the community. In addition to this, resistance to other antibiotics with different therapeutic targets has been observed. That makes it necessary to search for new alternatives to control the bacterial growth of isolates that cannot be treated with existing antibiotics. This work aims to determine the effect of cathelicidin-derived peptides on the growth and morphology of S. aureus clinical isolates from Bogotá D.C. city. We performed molecular characterization of the methicillin resistance mecA gene, protein A (spa), and pvl genes, and we identified the sensitivity profiles to the antibiotics of 57 S. aureus clinical isolates. Additionally, we evaluated the antimicrobial activity of LL-37, ATRA-1, and daptomycin on the characterized clinical isolates. Finally, we identified the changes in S. aureus bacterial morphology by peptides’ action using scanning electron microscopy (SEM). We determined that there is an important prevalence of resistant isolates to Methicillin. Some of them with discordances in the methicillin sensitivity in S. aureus. However, a high sensitivity rate to antibiotics with mechanisms of action different from methicillin is evidenced. We found that LL-37 and ATRA-1 peptides have antimicrobial capacity against this pathogen and are differences between the activity of these compounds and the sensitivity of the Methicillin profile. Finally, we proved that these peptides generate Surface changes in morphology as one of their mechanisms; however, it is not excluded that they present intracellular effects that potentiate its antimicrobial action. With this work, we are looking to contribute to the surveillance of bacterial resistance in Bogotá city, promote the development of new therapeutic strategies to control bacterial resistance in our region, and contribute to the characterization of the activity of synthetic antimicrobial peptides against S. aureus. Maestría Magíster en Ciencias - Microbiología Caracterización de aislamientos de S. aureus Perfil de sensibilidad antibiótica En este estudio se incluyeron 57 aislamientos proporcionados por el Grupo para el Control de la resistencia bacteriana en Bogotá (GREBO) y el laboratorio de Biofísica de la Universidad de los Andes (ver Anexo A). A partir de estos aislamientos se realizaron cultivos iniciales de 24 h a 37°C en medio solido tripticasa de soya (TSA) (Scharlau Chemie, España). La sensibilidad oxacilina se evalúo empleando el método microdilución en caldo conforme a lo descrito en la norma CLSI M07 (Clinical and Laboratory Standards Institute, 2018) y a cefoxitina, gentamicina, eritromicina, clindamicina, ciprofloxacina y trimetoprima-sulfametoxazol empleando el método difusión en agar conforme a lo descrito en la normar CLSI M02 (Clinical and Laboratory Standards Institute, 2018). Como controles se emplearon las cepas Staphylococcus aureus subsp. aureus (ATCC® 25923™), Staphylococcus aureus subsp. aureus (ATCC® 29213™) y Staphylococcus aureus subsp. aureus (ATCC® 33591™) (American Type Culture Collection, Virginia, USA) y los aislamientos clínicos 1631 sensible a daptomicina y 1634 resistente a daptomicina, proporcionados por el laboratorio de Biofísica de la Universidad de los Andes (ver anexo A). Todos los ensayos se realizaron por triplicado. Microbiología médica Biología molecular de agentes infecciosos