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Additional file 5: Table S11. Gene variants differential expressed between CVT and CVO groups.

Agrarlandschaften beherbergen einen erheblichen Teil der biologischen Vielfalt Deutschlands. Der Schutz und die Förderung dieser Vielfalt ist ein gesellschaftlich anerkanntes Ziel. Denn erstens hat sich Deutschland national und international verpflichtet, die biologische Vielfalt im Sinne des Naturschutzes zu erhalten. Zweitens sichert die biologische Vielfalt Genpools, die für die Ökosystemfunktionen (Produktion, Klima-, Boden- und Gewässerschutz) in genutzten Landschaften unter sich ändernden Bedingungen, etwa des Klimawandels, wichtig werden können. Drittens können genutzte (Kulturarten, Sorten) und begleitende Vielfalt (z.B. Beikräuter, Bodenorganismen, oberirdische Insekten) dazu beitragen, die Leistungsfähigkeit von Agrarlandschaften unter extremen Bedingungen länger bzw. in einem höheren Maße zu erhalten. In den zurückliegenden Dekaden hat es einen erheblichen und bis heute anhaltenden Verlust an biologischer Vielfalt in den Agrarlandschaften gegeben. Die Ursachen liegen maßgeblich in den Änderungen der Landnutzung und der Landschaftsstruktur. Der fortschreitende Klimawandel stellt ein weiteres, bislang noch wenig beachtetes Risiko für die biologische Vielfalt dar. Der Wissenschaftliche Beirat für Biodiversität und Genetische Ressourcen sieht daher einen dringenden Bedarf, dieses Risiko wirksam in die Gestaltung der Agrarpolitik und insbesondere der Agrarumweltpolitik einzubeziehen. Allerdings ist die Wirkung der sich ändernden Klimafaktoren auf die biologische Vielfalt und auf die davon abhängigen Ökosystemleistungen der Agrarlandschaft sehr komplex. Präzise Voraussagen zu zukünftigen klimawandelbedingten Veränderungen sind daher mit erheblichen Unsicherheiten behaftet. Das bedeutet, dass die Wirksamkeit physischer und politischer Gegenmaßnahmen derzeit nicht sicher prognostiziert werden kann. Sicher ist dagegen, dass der Klimawandel die biologische Vielfalt und deren Funktionen zusätzlich zu der aktuellen Art der Landnutzung gefährdet, und dass es Möglichkeiten gibt, dieses Gefährdungsrisiko zu senken. Daher empfiehlt der Beirat, die Agrarpolitik so weiterzuentwickeln, dass die klimabedingten Risiken für die biologische Vielfalt in Agrarlandschaften deutlich verringert werden. Der Beirat fasst den politischen Handlungsbedarf in zehn Leitprinzipien zusammen, die als Orientierung für die künftige Agrar- und Agrarumweltpolitik dienen sollen. Sie adressieren fünf Themenbereiche: (i) Deutlich verstärkte Anstrengungen in Forschung und Monitoring sowie Foresight-Prozesse sollen dazu beitragen, den Gestaltungs- und Anpassungsspielraum zu erhöhen und die Wirksamkeit von Maßnahmen mit größerer Zuverlässigkeit zu prognostizieren. (ii) Stärkere Ausrichtung der Agrarpolitik auf die Verbesserung der Resilienz der vielfältigen Funktionen der Agrarlandschaft. Dazu bedarf es einer ‚lernenden Politik‘, die durch Feedback-Schleifen bei Entscheidungsprozessen gekennzeichnet ist, die partizipativ ist, und die Erkenntnisfortschritte kontinuierlich einbezieht. (iii) Agrarpolitische und agrarumweltpolitische Instrumente sollten einem konsequenten ‚Klimawandelcheck‘ unterzogen werden. Es muss also sichergestellt werden, dass deren Wirkung der notwendigen Anpassung an den Klimawandel nicht entgegensteht, sondern diese unterstützt. (iv) Prioritäre Handlungsfelder für den Erhalt der biologischen Vielfalt im Klimawandel sind ein Aufhalten der Fragmentierung und Homogenisierung der Agrarlandschaft durch die Förderung vielfältiger Agrarlandschaften und die wirksame Stärkung artenreicher Agrarsysteme. (v) Handlungsoptionen, die der derzeitige Regelungsrahmen der Gemeinsamen Europäischen Agrarpolitik schon jetzt bietet, sollten konsequent genutzt werden. Maßnahmen mit multiplen positiven Wirkungen (win-win-win-Lösungen) sollten priorisiert werden., Berichte über Landwirtschaft - Zeitschrift für Agrarpolitik und Landwirtschaft, Sonderheft 232, Dezember 2020

Das Diskussionspapier „Ackerbaustrategie 2035 – Perspektiven für einen produktiven und vielfältigen Pflanzenbau“ des BMEL zeigt anhand von sechs Leitlinien und zwölf dazugehörigen Handlungsfeldern Optionen für die Verbesserung des deutschen Ackerbaus auf. Es enthält viele sinnvolle Ansätze. Allerdings greift das Papier bezüglich des Erhalts und der Förderung der Biodiversität in der deutschen Landwirtschaft zu kurz. Der WBBGR formuliert und erläutert daher 10 Empfehlungen für eine ganzheitliche Betrachtung von landwirtschaftlicher Produktion und biologischer Vielfalt sowie für die Förderung der Biodiversität in der Agrarlandschaft: 1. Biodiversität in der Landwirtschaft mit Zielbildern und zügig umzusetzenden Maßnahmen ganzheitlich betrachten 2. Mehr biodiversitätsfördernde Ziele konkret hinsichtlich Inhalt und Umfang sowie Zeitraum benennen sowie den Grad der Zielerreichung zu späteren Zeitpunkten messbar machen 3. Biodiversität beeinträchtigende Zielkonflikte der Maßnahmen benennen und Lösungsvorschläge entwickeln 4. Mehr biodiversitätsfördernde Maßnahmen ausgestalten 5. Inhaltliche und zeitliche Umsetzung biodiversitätsfördernder Maßnahmen präzisieren 6. Klares Bekenntnis zu mehr Fördermitteln für Gemeinwohlleistungen (durch den Ackerbau) bei der zukünftigen GAP abgeben 7. Inwertsetzung von Biodiversität und Ökosystemleistungen fördernden Maßnahmen der Landwirte1 über den Markt vorantreiben 8. Ressort- und strategieübergreifende Ziele und Maßnahmen identifizieren sowie Zuständigkeiten frühzeitig abstimmen und festlegen 9. Mehr Weiterbildungsmaßnahmen zur Biodiversitätsförderung für alle an der Aus- und Weiterbildung von Landwirten beteiligten Personen verpflichtend machen 10. Forschungsaktivitäten zur Biodiversität verstärken und Innovationen fördern. Biodiversität und eine ebenso effiziente wie effektive landwirtschaftliche Produktion sollten bei der Umsetzung der Ackerbaustrategie nicht als Gegensätze („Produktion oder Biodiversität“), sondern als Teile eines sich gegenseitig fördernden Systems („Produktion und Biodiversität“) behandelt werden., Berichte über Landwirtschaft - Zeitschrift für Agrarpolitik und Landwirtschaft, Sonderheft 231, November 2020

Supplemental Material for LPS-induced expression of CD14 in the TRIF pathway is epigenetically regulated by sulforaphane in porcine pulmonary alveolar macrophages by Qin Yang, Maren J Pröll, Dessie Salilew-Wondim, Rui Zhang, Dawit Tesfaye, Huitao Fan, Mehmet U Cinar, Christine Große-Brinkhaus, Ernst Tholen, Mohammad A Islam, Michael Hölker, Karl Schellander, Muhammad J Uddin and Christiane Neuhoff in Innate Immunity

Table S1. Sequence specific primers used for pmirGLO and 3´-UTR amplification of the SMAD7 and ACVR2A gene harboring binding site for miR-424-5p and miR-503-5p. Table S2. Sequence specific primers used for analysis of the relative expression of genes. (PDF 83 kb)

Figure S2. The circos plot representing the overall methylation levels in the in different blastocyst groups. Positive and negative fold-changes represent the level of hypermethylation and hypomethylation. (PDF 19412 kb)

Table S1. The list of primers used to validate DMRs in blastocysts of different groups using bisulfite sequencing. (DOCX 15 kb)

Figure S3. Genomic distribution of exclusively differentially methylated regions in the 2C_Flush, 8C_Flush or 16C_Flush blastocyst group. (PDF 47 kb)

Table S2. The list of primers used for validation of the differentially expressed genes using qPCR. (DOC 33 kb)

List of primers used for validation of the miR-130b target genes. (DOCX 15Â kb)

List of primers used for quantification of the mRNA abundance level using qPCR. (DOCX 16Â kb)

Satellite cells, the muscle stem cells, play a critical role in muscle growth, maintenance, and regeneration. A lot of muscle diseases result from defective function of satellite cells. Porcine satellite cells are a good model for studying the role of satellite cells in muscle development. Sulforaphane (SFN), a natural molecule rich in cruciferous vegetables, is a potent inducer for the NF-E2-related factor 2 (Nrf2) signaling and also inhibits the activity of histone deacetylases (HDAC). Our previous study found that SFN epigenetically suppressed the transcription of myostatin in porcine satellite cells. However, the effects of SFN on the proliferation of porcine satellite cells and the related mechanisms are far from understood. In the present study, we report that SFN enhanced the proliferation of the porcine satellite cells and modified the expression myogenic regulatory factors. SFN altered the expression of HDACs and inhibited the activity of HDACs. The activity of TGF-? signaling was suppressed by SFN treatment, which was accompanied with up-regulated Smad7, an endogenous suppressor of TGF-? signaling. Furthermore, we found that SFN increased the mRNA expression of Smad7’s transcription factors and decreased the expression of miRNAs targeting Smad7. The DNA methylation of a studied fragment in Smad7 promoter was not influenced by SFN treatment. SFN has received substantial attention because of its potential application in cancer therapy. The present study, forthe first time, investigated the effects of SFN on the proliferation of porcine satellite cells and the underlying mechanism. We found that both mRNA and protein level of Smad7 were greatly increased by SFN. Thus, besides reducing TGF-?1 protein abundance, SFN also inhibits the activity of TGF-? signaling by increasing expression of Smad7. It has been shown that overexpression of Smad7 led to enhanced skeletal muscle differentiation and cellular hypertrophy. In summary, our studies state that SFN enhances the proliferation of porcine satellite cells by suppressing TGF-? signaling through activation of Smad7.

Microarray and qRT- PCR expression values obtained for the five selected genes for the validation of microarray results. Two house keeping genes (GAPDH and ACTB) were used for normalization of the expression values. (PDF 20 kb)

Microarray-based expression profiles of selected cell surface markers, (cluster of differentiation (CD)) in PBMCs of vaccinated group (A), and unvaccinated group (B). (PDF 213 kb)