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ABSTRACT: Objectives: Extended-spectrum β-lactamase (ESBL)–producing Enterobacter cloacae complex (ECC) members have been a leading cause of severe infections in hospital setting and have lately been recognized as important pathogens for animals. In this article, we report phylogenomic data of a multidrug-resistant and CTX-M-15–positive E. hormaechei belonging to ST78 isolated from a calf with omphalitis. Methods: Genomic DNA was extracted and sequenced using the Illumina NextSeq platform. De novo assembly was performed by Unicycler and in silico prediction accomplished by curated bioinformatics tools. Single nucleotide polymorphism (SNP)-based comparative phylogenomic analysis was conducted by using publicly available ECC genomes belonging to ST78. Results: The genome size was calculated at 3 8465 40 bp, comprising 4717 total genes, 3 rRNAs, 43 tRNAs, 7 ncRNAs, and 74 pseudogenes. The animal-associated E. hormaechei (ECBEZ strain) ST78 harboured the blaCTX-M-15 ESBL gene in addition to other critically important resistance genes conferring resistance to β-lactams, aminoglycosides, fosfomycin, phenicol, quinolones, sulphonamides, tetracyclines, and trimethoprim. Phylogenetic analysis revealed that ECBEZ is closely related to human-isolated strains from Asian and African countries. Conclusion: Phylogenomic analysis of CTX-M-15-producing E. hormaechei from animal infection reveals that ST78 is a successful One Health clone among ECC members. Furthermore, data presented in this study reinforce the urgent need to monitor ESBL-producing ECC members in veterinary settings.

Resumo: As afecções umbilicais merecem destaque entre as enfermidades que acometem bezerros no primeiro mês de vida, pela alta incidência durante essa fase da vida dos neonatos e pelas relevantes perdas econômicas, decorrentes da mortalidade, custos de tratamento e atendimento veterinário, além de sequelas que poderão determinar menores ganho de peso e produção leiteira. O diagnóstico dessas enfermidades muitas vezes é prejudicado pela dificuldade em se detectar os acometimentos das estruturas intra-abdominais do umbigo, o que afetará negativamente a escolha do tratamento mais adequado e o estabelecimento do real prognóstico para cada animal. No presente estudo, realizou-se a análise ultrassonográfica dos animais com inflamação/infecção dos componentes umbilicais sendo possível observar algumas características em relação a mensurações e ecogenicidade, presentes nos componentes umbilicais acometidos. A partir dessas avaliações concluiu-se que a medida mais adequada para identificar animais com possíveis processos inflamatórios nos componentes umbilicais é a espessura da parede dos vasos umbilicais quando comparada ao diâmetro dos mesmos. Ainda, o estudo possibilitou verificar algumas particularidades do comportamento dos componentes do cordão umbilical em bezerros sadios da raça Holandesa, bem como determinar que os vasos umbilicais intra-abdominais iniciam uma involução em porção mais interna e progridem para as extremidades próximas ao anel umbilical com o evoluir da idade. Destaca-se que o confronto desses resultados com aqueles poucos descritos na literatura disponível mostrou-se com notáveis diferenças.