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The present work is aimed at analyzing and evaluating the contribution of sustainable fishing to the Bissau-Guinean economy, from the national and sub-regional perspective of fisheries management, considering the enormous potential that the country offers in terms of marine natural resources, including fishery resources, are considered as livelihoods of the population for most coastal states or small developing Island States that are highly dependent on fishing activity, which includes Guinea-Bissau, and does not significantly reflect on its economy, given the difficulties in implementing strategic resource management and conservation measures and the lack of appropriate operational means of surveillance, monitoring and control in the fishing zone, since these natural marine resources form the basis of the economy of these States, thereby serving food and nutritional security for the population. Given the exceptional biological and environmental diversity in terms of marine natural resources in the country, fishing represents the second-highest economic activity alongside agriculture, in contrast with the poverty of the Bissau-Guinean population, where the human development index is 0.424 (178º Low) out of 183 countries with 58.4% poverty rate, with GDP per inhabitant of 1367. In contrast, fishing does not constitute considerable budgetary weight in the Bissau-Guinean economy in relation to other sectors, its contribution has never exceeded 4% of GDP to the general state budget, stems from the financial compensation resulting from the successive fisheries agreements, in particular with the European Union, Zhongyou Seadfood Global Corporation (ZSGC), China, Republic of Senegal, Association of Large-Scale Tuna Freezers (AGAC), National Association of Owners of Tuna Freezer Vessels (ANABAC) and the revenue from fishing licenses. Nevertheless, the problematic of the sustainability of fisheries in national economies, particularly in coastal states, has been pointed out in the context of globalization. It is no longer a national or state-specific issue, but rather a regional or global one, due to the regionalization of concerted political, administrative and legal measures, as well as the characteristics of marine natural resources, with greater emphasis on transactional species or highly migratory species that do not know or obey the physical or geographical boundaries established by human laws governing our coexistence, political, social, economic and environmental. Therefore, the sustainability of fisheries in third world economies has been the subject of analysis and assessment in order to compare legislation on this matter. The sustainability of fisheries in the national economy, reveals crucial importance with the institutionalization of the National System of Protected Area/SNAP, in which we have eight (8) protected areas (marine (Orango Islands National Park, João Vieira and Poilão Marine National Park, Urok Islands Community Marine Protected Area) and terrestrial (Tarrafes de Cacheu Natural Park, Cufada Lagoons Natural Park, Cantanhez National Park, Boé National Park, Dulombi National Park) absorbing an area of 495. 510 hectares (corresponding to 13.75% of the land area and three (3) ecological corridors, of 456,617 hectares (corresponding to 12.63% of the land area), making a total of 26.38% of Guinea’s territory covered by protected areas, thereby following and surpassing the targets set by the 2030/UN agenda on Sustainable Development Goals (ODS-14), despite the fact that ecosystem services are not yet included in TOFE, a fact that should translate into economic, social and environmental gains, that is, having fishing as the product that provides income, trade and value chains. In summary, Guinea-Bissau, being a riparian country with abundant marine natural resources which with a participatory and inclusive public policy based on strategic plans, programs, policies and concrete projects that are biologically known, economically efficient, technically adequate, politically legitimized and scientifically founded, can make fishing and aquaculture a strategic product of the national economy. But institutional and political stability, supported by public or private investment in the fisheries sector, is essential to attain this goal. O presente trabalho de investigação tem como objeto analisar e avaliar a contribuição da pesca sustentável na economia guineense, vista numa perspetiva nacional e sub-regional da gestão das pescas, considerando enorme potencialidade que o país oferece em termos de recursos naturais marinhos, inclusive os recursos pesqueiros, e que são tidos como meios de subsistência da população para maioria dos Estados costeiros ou pequenos Estados insulares em desenvolvimento que são altamente dependentes da atividade pesqueira, no qual inclui a Guiné-Bissau, e que não reflete significativamente na sua economia, dada as dificuldades na implementação de medidas de gestão e conservação dos recursos e falta de meios operacionais apropriados de fiscalização, monitorização e controle na zona de pesca, uma vez que, estes recursos naturais marinhos constitui a base da economia destes Estados, servindo desta forma a segurança alimentar e nutricional para população. Com a excelente característica da diversidade biológica e ambiental em termos de recursos naturais marinhos no país, a pesca representa segundo maior atividade na produção de economia a par da agricultura, considerando esta realidade, o que se contrasta com a pobreza da população guineense, onde figura na lista dos países mais pobre do mundo, o índice do desenvolvimento humano, é de 0,424 (178º-Baixo) dos 183 países com 58,4% de taxa de pobreza, tendo Produto Interno Bruto/PIB por habitante 1367. Contrariamente, a pesca não constitui o peso orçamental considerável na economia guineense, devido a fraca participação na formação do Produto Interno Bruto/PIB, de forma ativa a par dos outros setores, a sua contribuição nunca ultrapassou 4% do PIB1, para orçamento geral do estado, pelo que, os rendimentos da pesca, advém das contrapartidas financeiras resultantes dos sucessivos acordos de pesca, particularmente, celebrados com a União Europeia, Zhongyou Seadfood Global Corporation (ZSGC) /China, República do Senegal, Associação dos Grandes Atuneiros e Congeladores (AGAC), Associação Nacional dos Armadores de Navios Atuneiros Congeladores (ANABAC) e das receitas de licenças de pesca. Entretanto, tem-se apontado a problemática de sustentabilidade das pescas na economia dos países, particularmente nos Estados ribeirinhos, pelo contexto da globalização deixa de ser questão de índole nacional ou especifico de um Estado e passa mais para questão da esfera, regional ou global, devido a regionalização das medidas politicas, administrativas e jurídicas concertadas, assim como, das características dos recursos naturais marinhos, com maior destaque para espécies transacionais ou espécies altamente migratórias que não conhecem e nem obedecem as fronteiras físicas ou geográficas estabelecidas pelas leis humanas que regem a nossa convivência, política, social, económica e ambiental. Por isso, a sustentabilidade das pescas na economia dos países terceiros foi objeto de análises e apreciação com finalidade de ver o direito comparado sobre a questão. A sustentabilidade das pescas na economia nacional, revela crucial importância com a institucionalização de Sistema Nacional de Área Protegida/SNAP, no qual temos oito (8) áreas protegidas (marinha (Parque Nacional das Ilhas de Orango, Parque Nacional Marinho de João Vieira e Poilão, Área Protegida Marinha Comunitária das Ilhas de Urok) e terrestre (Parque Natural dos Tarrafes de Cacheu, Parque Natural das Lagoas de Cufada, Parque Nacional de Cantanhez, Parque National do Boé,) Parque Nacional de Dulombi) absorvendo uma superfície 495.510 hectar (correspondendo 13,75% da superfície terrestre e três (3) corredores ecológicos, de 456.617 hectar (correspondendo 12,63% da superfície terrestre), totalizando assim, em 26,38% do território guineense coberto de áreas protegidas acompanhando e ultrapassando desta feita, as metas preconizadas pela agenda 2030/ONU, sobre Objetivos de Desenvolvimento Sustentável (ODS- 14), apesar dos serviços da ecossistema não estão ainda contabilizadas na TOFE, fato que deveria traduzir nos ganhos económicos, social e ambiental, ou seja, seria ter um produto da pesca que propícia, rendimento, comercio e cadeias de valores. Em suma a Guiné-Bissau, por ser um país ribeirinho com recursos naturais marinho abundante que com uma política pública participativa e inclusiva orientada com base nas estratégias, planos, programas, politicas e projetos concretos e exequível biologicamente conhecida, economicamente eficiente, tecnicamente adequada, politicamente legitimada e cientificamente fundada, pode fazer da pesca e aquacultura um produto estratégico da economia nacional. Mas para atingir esse desiderato é fundamental a estabilidade institucional e/ou política, corroborada com investimento público ou privado no setor das pescas.

In Biology teaching, it is common to observe lack of knowledge regarding the diversity of living beings, the differences between them and their own classification. In this sense, the goal was to identify the students' conceptions about the diversity and classification of living beings and the teaching and learning processes, linking the pedagogical practice with the students' daily life. The research has a qualitative approach, through the application of questionnaires to 65 high school students from the sisal region of Bahia. Discursive Textual Analysis was used for data analysis. Animals and Plants were the groups most remembered by students. Domestic animals were mentioned as belonging to the Caatinga biome, evidencing difficulties in identifying the native species of the biome. Thus, it is proposed the need to bring up educational practices about the living beings of the region and biome, sometimes forgotten, relating them to conservation efforts., En la enseñanza de la Biología es común observar falta de conocimiento sobre la diversidad de los seres vivos, las diferencias entre ellos y su propia clasificación. En este sentido, el objetivo fue identificar las concepciones de los estudiantes sobre la diversidad y clasificación de los seres vivos y los procesos de enseñanza y aprendizaje, vinculando la práctica pedagógica con el cotidiano de los estudiantes. La investigación tiene un enfoque cualitativo, a través de la aplicación de cuestionarios a 65 estudiantes de secundaria de la región de sisal de Bahía. Para el análisis de datos se utilizó el análisis textual discursivo. Animales y Plantas fueron los grupos más recordados por los estudiantes. Los animales domésticos fueron mencionados como pertenecientes al bioma Caatinga, evidenciando dificultades en la identificación de las especies nativas del bioma. Así, se propone la necesidad de plantear prácticas educativas sobre los seres vivos de la región y el bioma, a veces olvidados, relacionándolos con los esfuerzos de conservación., No ensino de Biologia é comum se observar desconhecimento em relação a diversidade de seres vivos, as diferenças entre eles e sua própria classificação. Neste sentido, objetivou-se identificar as concepções de estudantes sobre a diversidade e classificação dos seres vivos e os processos de ensino e aprendizagem, interligando a prática pedagógica com o cotidiano dos estudantes. A pesquisa possui abordagem qualitativa, através da aplicação de questionários para 65 estudantes do ensino médio, da região sisaleira da Bahia. A Análise Textual Discursiva foi utilizada para a análise dos dados. Os Animais e as Plantas foram os grupos mais recordados pelos estudantes. Os animais domésticos foram citados como pertencentes ao bioma Caatinga, evidenciando dificuldades em identificar as espécies nativas do bioma. Assim, propõem-se a necessidade de trazer à tona práticas educativas sobre os seres vivos da própria região e bioma, por vezes esquecidos, relacionando-os com os esforços pela conservação.

In Biology teaching, it is common to observe lack of knowledge regarding the diversity of living beings, the differences between them and their own classification. In this sense, the goal was to identify the students' conceptions about the diversity and classification of living beings and the teaching and learning processes, linking the pedagogical practice with the students' daily life. The research has a qualitative approach, through the application of questionnaires to 65 high school students from the sisal region of Bahia. Discursive Textual Analysis was used for data analysis. Animals and Plants were the groups most remembered by students. Domestic animals were mentioned as belonging to the Caatinga biome, evidencing difficulties in identifying the native species of the biome. Thus, it is proposed the need to bring up educational practices about the living beings of the region and biome, sometimes forgotten, relating them to conservation efforts., En la enseñanza de la Biología es común observar falta de conocimiento sobre la diversidad de los seres vivos, las diferencias entre ellos y su propia clasificación. En este sentido, el objetivo fue identificar las concepciones de los estudiantes sobre la diversidad y clasificación de los seres vivos y los procesos de enseñanza y aprendizaje, vinculando la práctica pedagógica con el cotidiano de los estudiantes. La investigación tiene un enfoque cualitativo, a través de la aplicación de cuestionarios a 65 estudiantes de secundaria de la región de sisal de Bahía. Para el análisis de datos se utilizó el análisis textual discursivo. Animales y Plantas fueron los grupos más recordados por los estudiantes. Los animales domésticos fueron mencionados como pertenecientes al bioma Caatinga, evidenciando dificultades en la identificación de las especies nativas del bioma. Así, se propone la necesidad de plantear prácticas educativas sobre los seres vivos de la región y el bioma, a veces olvidados, relacionándolos con los esfuerzos de conservación., No ensino de Biologia é comum se observar desconhecimento em relação a diversidade de seres vivos, as diferenças entre eles e sua própria classificação. Neste sentido, objetivou-se identificar as concepções de estudantes sobre a diversidade e classificação dos seres vivos e os processos de ensino e aprendizagem, interligando a prática pedagógica com o cotidiano dos estudantes. A pesquisa possui abordagem qualitativa, através da aplicação de questionários para 65 estudantes do ensino médio, da região sisaleira da Bahia. A Análise Textual Discursiva foi utilizada para a análise dos dados. Os Animais e as Plantas foram os grupos mais recordados pelos estudantes. Os animais domésticos foram citados como pertencentes ao bioma Caatinga, evidenciando dificuldades em identificar as espécies nativas do bioma. Assim, propõem-se a necessidade de trazer à tona práticas educativas sobre os seres vivos da própria região e bioma, por vezes esquecidos, relacionando-os com os esforços pela conservação.

A ocupação informal Santa Luzia, nas proximidades do Parque Nacional de Brasília, está inserida na microbacia hidrográfica da cabeceira do Córrego Cabeceira do Acampamento, a qual define seu Ecossistema Urbano. O Governo do Distrito Federal busca realocar a população ocupante da região com proposta de projeto de habitação social linear com 3,2 km de extensão como medida mitigatória, pressionado pelo Ministério Público do DF e Territórios que acusa o aumento de impactos ambientais na região. A fim de defender a manutenção da população no local foi realizado um inventário ecológico simplificado com dados espaciais acerca de aspectos sócio-econômico-ambientais da microbacia hidrográfica e foram indicadas melhorias segundo as Soluções Baseadas na Natureza. O mapeamento incluiu análises tipo NDVI; Tipo de Solos; Relevo; Declividade; Risco de perda do solo por erosão, Risco de contaminação; Tipos de vegetação; e Grau de impermeabilização do solo. O resultado do inventário demonstrou que o impacto ambiental gerado pela ocupação é menor que as áreas adjacentes, sendo um cenário positivo incluir a população no processo de regeneração com pequenas adequações e alterações, principalmente sensíveis à água baseadas na visão dos serviços ecossistêmicos ao tratamento de efluentes em nível paisagístico de tratamento; de fonte de recurso, adequação vegetação. The informal occupation Santa Luzia, near the Parque Nacional de Brasília, is inserted in the watershed of the headwaters of the Córrego Cabeceira do Acampamento, which defines its Urban Ecosystem.The Government of the Federal District seeks to reallocatethe occupying population of the region with a proposal for a 3.2 km long linear social housing project as a mitigation measure, pressured by the Ministério Público do DF e Territórios, which accuses the increase of environmental impacts in the region.In order thatdefend the maintenance of the population in the place, a simplified ecological inventory was carried out with spatial data about socio-economic-environmental aspects of the watershed and improvements were indicated according to the NatureBased Solutions.The mapping included NDVI; Soil Type; Relief; Declivity; Risk of soil loss through erosion, Risk of contamination; Vegetation types; and Degree of soil waterproofinganalysis.The result of the inventory showed that the environmental impact generated by the occupation is less than the adjacent areas, being a positive scenario to include the population in the regeneration process with minor adjustments and changes, mainly sensitive to water based on the vision of ecosystem services for the treatment of effluents at the landscape level of treatment; resource source, vegetation adequacy. La ocupación informal Santa Luzia, cerca del Parque Nacional Brasilia, inserta en la microcuenca hidrográfica a la cabeza del Córrego Cabeceira do Acampamento, que define su ecosistema urbano.El Gobierno del Distrito Federal busca reasignar la población ocupante de la región con una propuesta para un proyecto de vivienda social lineal de 3,2 km de largo como medida de mitigación, presionada por el Ministerio Público do DF e Territorios, que acusa al aumento de los impactos ambientales en la región.Para defender el mantenimiento de la población en el lugar, se realizó un inventario ecológico simplificado con datos espaciales sobre los aspectos socioeconómicos y ambientales de la cuenca eindicaron mejoras de acuerdo con las Soluciones basadas en la naturaleza.El mapeo incluyó análisis NDVI; Tipo de suelo; Relevo; Declividad; Riesgo de pérdida de suelo por erosión, Riesgo de contaminación; Tipos de vegetación; y Grado de impermeabilización del suelo.El resultado del inventario mostró que el impacto ambiental generado por la ocupación es menor que las áreas adyacentes, siendoescenario positivo para incluir la población en el proceso de regeneración con pequeños ajustes y cambios, principalmente sensibles al agua basados en la visión de los servicios del ecosistema para tratamiento de efluentesa nivel del paisaje del tratamiento; fuente de recursos, adecuación de vegetación.

Aim Wetland areas have high environmental complexity and support high biodiversity. Therefore, global efforts are required to preserve these areas. Here, we show the results of three decades of monitoring programs regarding macroinvertebrate species from the upper Paraná River floodplain, which is an important wetland conservation area in the neotropics. Methods We searched the literature from 1990 to 2020 and selected studies that addressed questions related to benthic or macrophyte-associated macroinvertebrates in the study area. Results We retained 92 articles that matched the criteria. We noticed that the number of publications increased after 2009, and most studies were related to lentic environments. Sediment was the most studied substrate, showing the highest taxa record and diversity, followed by aquatic macrophytes. We found records of 517 taxa, from which the families Chironomidae, Cyprididae, and Naididae presented the highest taxonomic richness. The taxa richness observed in our study was lower than the bootstrap richness estimated. Conclusions The lack of signs of curve stabilisation through time for both observed and estimated taxa richness could indicate the macroinvertebrate richness from the upper Paraná River floodplain must be underestimated. In this way, once most of the studies reported results related to long-term ecological research, we argue for the continuity of such studies in floodplains as a powerful tool to assess biodiversity, which can provide useful data for the creation of conservation strategies that enhance the maintenance of biodiversity in such areas. Resumo Objetivo Planícies de inundação apresentam elevada complexidade ambiental e sustentam a biodiversidade da região. Assim, esforços globais são necessários para preservar essas áreas. Este trabalho sumariza o resultado de três décadas de programas de monitoramento de espécies de macroinvertebrados da planície de inundação do alto rio Paraná, a qual é uma expressiva área de conservação neotropical. Métodos Foi realizada uma busca bibliográfica na literatura de 1990 a 2020 e foram selecionados os estudos que abordavam questões relacionadas a macroinvertebrados bentônicos ou associados às macrófitas aquáticas na área de estudo. Resultados Foram selecionados 92 artigos, os quais seguiam os critérios da busca. Observou-se que o número de publicações aumentou após o ano 2009, e a maioria dos estudos encontrados estava relacionada aos ambientes lênticos. Dentre os substratos analisados nos trabalhos, o sedimento foi o mais estudado, apresentando maior registro e diversidade de taxa, seguido pelas macrófitas aquáticas. No total foram encontrados registros de 517 taxa, sendo que as famílias Chironomidae, Cyprididae e Naididae foram as que apresentaram a maior riqueza taxonômica. A riqueza de taxa observada no estudo foi inferior à estimada pelo Bootstrap. Conclusões A falta de sinais de estabilização da curva ao longo do tempo para a riqueza de táxons observada e estimada pode indicar que a riqueza de macroinvertebrados da planície de inundação do alto rio Paraná deve estar subestimada. Dessa forma, uma vez que a maioria dos estudos reportou resultados relacionados a pesquisas ecológicas de longa duração, defendemos a continuidade de tais estudos em planícies de inundação como uma poderosa ferramenta para avaliar a biodiversidade, os quais podem fornecer dados úteis para a criação de estratégias de conservação que melhorem a manutenção da biodiversidade em tais áreas.

Starting from the theses of actions towards the environment are, for the most part, that we seek to reflect on the context in this work if socially inclusive positions are related to social environments about biological diversity. The possibility of associations between singularities has been built for some years by Pagan (2009; 2018; 2020), in which we have investigated the characteristics that make us unique and respect for the specifics of others, lead to less sexist, sexist, homophobic and meritocratic attitudes, and may also be living or practices of coexistence with the others. As a result of this concern, we ask ourselves: Are there sociocultural profiles that point to indicators on which teachers and students are sensitive to biodiversity? Starting from this question, we seek in this work related to aspects of biological diversity and cultural diversity, without the scope of training biology teachers. An electronic instrument was used as a data collection instrument, whose action knows the personal and conforming data profile of the respondents; Regarding the ideas of biological diversity, they are divided into four categories: anthropocentric, biocentric, integrating and disintegrating; and their sensitivity about the prejudice and discrimination of Brazilian minority groups. 112 responses were obtained from biology students and professionals from Brazilian universities, over eighteen years of age, who consented to participate, accepting the definitions proposed in the TCLE. The responses were tabulated and entered the statistical analysis program Statistical Package for the Social Sciences (SPSS). As main results, significant positive correlations were observed between the biocentric category of biological diversity and the socioeconomic and inclusion/exclusion categories, which shows us that people who are more sensitive to class diversity and socioeconomic inequality, as well as to inclusive issues from distinct racial and ethnic groups, people with disabilities and LGBTQIA+, tended to be more biocentric. This data suggests the confirmation of our hypothesis of approximation between perceptions about cultural and biological diversity, which is especially shown in the context of understanding equitable interspecific interactions. We conclude that these associations open the way to emphasize a training of biology teachers that recognizes the rights of other species on the planet and provides (re)connection, (re)integration and diplomatic coexistence. Partindo da tese de que ações perante o meio ambiente são, em sua maioria, influenciadas por contextos sociais, buscamos refletir neste trabalho se posicionamentos socialmente inclusivos, relacionam-se com percepções mais biocêntricas acerca da diversidade biológica. A busca por possíveis associações entre biodiversidade e singularidades vem sendo construída há alguns anos por Pagan (2009; 2018; 2020), na qual tem investigado se características que nos tornam únicos e o respeito às particularidades alheias, ensejam atitudes menos sexistas, machistas, homofóbicas e meritocráticas, podendo ainda direcionar percepções e práticas de coexistência equitativa com os demais seres vivos. Como desdobramento dessa preocupação, questionamonos: Existem perfis socioculturais que apontem indicadores sobre quais docentes e discentes apresentam maior ou menor sensibilidade à biodiversidade? Partindo dessa questão, buscamos neste trabalho relacionar os aspectos da diversidade biológica e da diversidade cultural, no âmbito da formação de professores de biologia. Como instrumento de coleta dos dados foi utilizado um questionário eletrônico, cuja conformação permitiu conhecer o perfil pessoal e acadêmico dos respondentes; suas ideias acerca de diversidade biológica, distribuídas em quatro categorias: antropocêntrica, biocêntrica, integradora e desintegradora; e a sensibilidade deles acerca do preconceito e discriminação de grupos minoritários brasileiros. Foram obtidas 112 respostas de estudantes e profissionais de biologia de universidades brasileiras, maiores de dezoito anos, que consentiram em participar, aceitando as definições propostas no TCLE. As respostas foram tabuladas e inseridas no programa de análise estatística Statistical Package for the Social Sciences (SPSS). Como principais resultados, observaram-se correlações positivas significativas entre a categoria biocêntrica de diversidade biológica e as categorias socioeconômica e de inclusão/exclusão, o que nos mostra que pessoas mais sensíveis com a diversidade de classes e a desigualdade socioeconômica, bem como às questões inclusivas de grupos raciais e étnicos distintos, pessoas com deficiência e LGBTQIA+, tenderam a ser mais biocêntricas. Este dado sugere a confirmação de nossa hipótese de aproximação entre percepções acerca da diversidade cultural e biológica, que se mostra especialmente no contexto da compreensão das interações interespecíficas equitativas. Concluímos, que estas associações abrem caminho para enfatizar uma formação de professores de biologia que reconheça os direitos das demais espécies do planeta e proporcione a (re)conexão, (re)integração e a convivência diplomática. São Cristóvão/SE

A implantação de uma pastagem perene no sub-bosque do sistema faxinal pode assegurar o seu papel produtivo no fornecimento de forragem para os animais e fomentar a preservação destes ambientes. O objetivo deste trabalho foi avaliar as mudanças ocorridas no estrato herbáceo de um sistema faxinal tipo 4 após a implantação da pastagem perene a partir de diferentes metodologias de preparo de solo.

Fundação de Apoio a Pesquisa e à Inovação Tecnológica do Estado de Sergipe - FAPITEC/SE Among the consequences of the interactions of organisms with the environment are several patterns of coexistence of multiple distinct organisms in space or patterns of communities. Of these patterns, those related to how many and which organisms compose these communities remain under debate. These two issues are expressed in terms of species diversity and composition. Historically, these studies have emphasized division by spatial scales, particularly locally within the community – or alpha diversity – and between communities – or beta diversity. Recently, studies on these patterns have contemplated different aspects of biodiversity, beyond to the traditional approach based on taxonomy, but including their evolutionary relationships and their characteristics, that is, phylogenetic and functional aspects. However, there is still no consensus on their causes, specifically when they involve specific biological groups in specific environmental contexts, either because of their inherent complexity or because of the systematic scarcity of information about the species. This is the case of plants in tropical coastal environments, such as Restinga vegetation. In this study, challenging different types of information gaps about coastal plant species in Brazil, we investigate the spatial patterns and processes involved in the diversity and composition of these communities. In the first chapter, after considering the level of knowledge regarding plant sampling efforts, we investigated geographic patterns and tested different ecological hypotheses for variation in species richness. Our results revealed that despite knowledge gaps in more than 3/4 of the area, we found that species richness appears to be best explained by habitat heterogeneity, soil properties and water constraints. In the second chapter, we investigate the compositional patterns, evaluating assembly rules of the functional and phylogenetic structure patterns of the assemblages and the role of different environmental predictors. We show that, under greater water constraint, assemblages with species functionally similar and pre-adapted to Restinga conditions predominated. In sites associated with megadiverse rainforest ecosystems, the composition of the assemblages tends to more stochastic arrangements or with more distinct species in terms of their phenotypic and phylogenetic similarities. Water constraints were the main responsible for causing variation in these patterns of phylogenetic and functional structure. Finally, in the third chapter, we evaluate the relative contribution of the beta diversity components, i.e., turnover and nestedness, if these processes result from stochastic dispersion and which environmental predictors account for the dissimilarity patterns between assemblages. Patterns of taxonomic beta diversity do not correspond to stochastic dynamics, unlike phylogenetic and functional dissimilarity patterns. Water availability appears to be the determining factor in the spatial patterns of dissimilarity of the three aspects of beta diversity. The three perspectives evaluated revealed a complex pattern of interaction between regional patterns of diversity – where adjacent ecosystems that are sources of species contributed in different ways – and different degrees of restriction on species colonization due to environmental factors, specifically water availability. Our study was the first to describe the patterns and drivers of Restinga plant assemblages, contributing to the understanding of the origin and dynamics of this ecosystem and patterns in contexts and specific environmental systems. Despite gaps in biodiversity information, these limitations should not impede our ability to investigate these patterns at a geographic scale. Dentre as consequências das interações dos organismos com o meio estão diversos padrões de coexistência de múltiplos organismos distintos no espaço ou padrões de comunidades. Desses padrões, aqueles relacionados a quantos e quais organismos compõem essas comunidades permanecem sendo debatidos. Essas duas questões são expressas em termos de diversidade e composição de espécies. Historicamente, esses estudos têm enfatizado a divisão por escalas espaciais, sobretudo localmente dentro da comunidade – ou diversidade alfa – e entre comunidades – ou diversidade beta. Recentemente, estudos sobre esses padrões têm contemplado diferentes aspectos da biodiversidade, além da abordagem tradicional baseada na taxonomia, mas incluindo suas relações evolutivas e suas características, ou seja, aspectos filogenéticos e funcionais. Contudo, ainda não há consenso sobre suas causas, especificamente quando envolvem grupos biológicos específicos em contextos ambientais específicos, seja pela sua complexidade inerente, seja pela escassez sistemática de informações sobre as espécies. Esse é o caso de plantas em ambientes costeiros tropicais, como a vegetação de Restinga. Neste estudo, desafiando diferentes tipos de lacunas de informação sobre as espécies de plantas litorâneas do Brasil, investigamos os padrões espaciais e os processos envolvidos na diversidade e composição dessas comunidades. No primeiro capítulo, após considerar o nível de conhecimento relativo à amostragem de plantas, investigamos os padrões geográficos e testamos diferentes hipóteses ecológicas para a variação na riqueza de espécies. Nossos resultados revelaram que, apesar das lacunas de conhecimento em mais de 3/4 da área, apontamos que a riqueza de espécies parece ser melhor explicada pela heterogeneidade de habitat, propriedades do solo e restrições de água. No segundo capítulo, investigamos os padrões de composição, avaliando regras de montagem dos padrões de estrutura funcional e filogenética das assembleias e o papel de diferentes preditores ambientais. Mostramos que, sob maior restrição hídrica, predominaram assembleias com espécies funcionalmente similares e pré-adaptadas as condições da Restinga. Em áreas associadas a ecossistemas megadiversos de florestas tropicais pluviais, a composição das assembleias tende a arranjos mais estocásticos ou com espécies mais distintas quanto as suas similaridades fenotípica e filogenética. Restrições de água foram os principais responsáveis em causar variação nesses padrões de estrutura filogenética e funcional. Por fim, no terceiro capítulo, avaliamos a contribuição relativa dos componentes da diversidade beta, i.e., substituição e aninhamento, se esses processos resultam de dispersão estocástica e que preditores ambientais respondem pelos padrões de dissimilaridade entre assembleias. Os padrões de diversidade beta taxonômica não correspondem a uma dinâmica estocástica, ao contrário dos padrões de dissimilaridade filogenética e funcional. A disponibilidade de água parece ser o fator determinante dos padrões espaciais de dissimilaridade dos três aspectos da diversidade beta. As três perspectivas avaliadas revelaram um padrão complexo de interação entre padrões regionais de diversidade – em que ecossistemas adjacentes doadores de espécies contribuíram de forma distinta – e diferentes graus de restrição à colonização de espécies devido a fatores ambientais, especificamente a disponibilidade de água. Nosso estudo foi o primeiro a descrever os padrões e determinantes das assembleias de plantas de Restinga, contribuindo para o entendimento da origem e dinâmica desse ecossistema e padrões em sistemas e contextos ambientais específicos. Apesar das lacunas de informações sobre a biodiversidade, essas limitações não devem impedir nossa capacidade de investigar esses padrões em escala geográfica. São Cristóvão, SE

Agência 1 Os Parques Nacionais são Unidades de Conservação (UCs) que podem ser palco de conflitos socioambientais devido às suas restrições de acesso e uso dos recursos naturais e a ausência de participação social em sua gestão. O Parque Nacional da Serra da Bocaina, na divisa entre os estados de São Paulo e Rio de Janeiro, foi criado em 1971 e vem, ao longo dos anos, vivenciando conflitos que podem prejudicar sua gestão e impedir que seus objetivos conservacionistas sejam atingidos, com destaque para a Vila de Trindade, em Paraty-RJ. Desse modo, o objetivo geral deste trabalho é analisar a apropriação das metodologias participativas pelos gestores do Parque Nacional da Serra da Bocaina, visando minimizar os conflitos socioambientais na Vila de Trindade. Para tal, foram aplicados questionários para avaliar a percepção ambiental e a vivência de conflito da população local, aplicando-se testes de hipótese de t-student e Teste de Tukey para determinar as características socioeconômicas que influenciam a experiência de conflito na região, além de entrevistas semiestruturadas para identificar as percepções e expectativas dos gestores do parque e da comunidade local acerca das metodologias participativas aplicadas no local do estudo. Estes dados foram, por fim, analisados através da Matriz FOFA. Como resultado destaca-se a percepção ambiental média encontrada para a população da Vila de Trindade, em contrapartida com um grande desconhecimento sobre a definição de UCs e suas localizações. Ainda, foi encontrado que as populações com mais de 45 anos e que residem há mais de 20 anos no local vivenciam, estatisticamente, mais conflitos socioambientais com o Parque. Por fim, concluiuse que há uma concordância entre população e Parque sobre a necessidade de conservação ambiental da área, entretanto, para a minimização dos conflitos socioambientais locais, é de suma necessidade o desenvolvimento e aplicação mais amplos de metodologias participativas voltadas para a realidade local, com presença frequente do órgão gestor na área do Parque. National Parks are Conservation Units (UCs) that can be the scene of socioenvironmental conflicts due to their restrictions on access and use of natural resources and the lack of social participation in their management. The Serra da Bocaina National Park, on the border between the states of São Paulo and Rio de Janeiro, was created in 1971 and has, over the years, experienced conflicts that can harm its management and prevent its conservationist objectives from being achieved, with highlight to the Vila de Trindade, in Paraty-RJ. Thus, the general objective of this work is to analyze the appropriation of participatory methodologies by the managers of the Serra da Bocaina National Park, aiming to minimize socioenvironmental conflicts in Vila de Trindade. To this end, questionnaires were applied to assess the environmental perception and experience of conflict of the local population, applying hypothesis tests to determine the socioeconomic characteristics that influence the experience of conflict in the region, in addition to semi-structured interviews to identify perceptions and expectations of park managers and the local community about participatory methodologies applied at the study site. These data were finally analyzed using the SWOT Matrix. As results obtained, the average environmental perception found for the population of Vila de Trindade stands out, in contrast to a great lack of knowledge about the definition of UCs and their locations. In addition, it was found that, at the study site, populations over 45 years old and who have lived there for more than 20 years experience, statistically, more socio-environmental conflicts with the Park. Finally, it was concluded that there is an agreement between the population and the Park on the need for environmental conservation of the area, however, for the minimization of local socio-environmental conflicts, the broader development of participatory methodologies focused on the local reality is extremely necessary, with frequent presence of managers in the Park area.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES Our main goal in this research is to dicuss how the emancipatory knowledges present in active methodologies (AMs) can influence the concepts of biodiversity developed by future teachers of Natural Sciences. The present study was embodie with the participation of students from the Interdisciplinary Degree course in Natural Sciences and its Technologies (IDNST), from the Federal University of Southern Bahia (UFSB). Therefore, our objective was to analyze the concepts of biodiversity for future teachers of Natural Sciences in undergraduate courses at IDNST, based on active methodologies, in the context of UFSB, located in the Northeast Region of Brazil. Data collection was divided into two phases: document analysis and application of ten semi-structured interviews with students from different four-month periods active in the course. The data produced were processed and analyzed according to the assumptions of Bardin's content analysis, through thematic categorization built a priori and a posteriori, based on the speeches of the participants. In the area of active methodologies, three categories or dimensions emerged: 1) logistical and pedagogical barriers to the use of active methodologies; 2) active methodologies as innovative elements that favor learning, protagonism and motivation, and 3) curricular component of pedagogical practices as an articulating axis of the curriculum and of the conections between university, school and community. In the area of biodiversity, four categories emerged: 1) biodiversity in an ecological perspective; 2) biodiversity from a biocultural perspective; 3) biodiversity in a biocentric view, and 4) biodiversity, teaching and learning Biology. In a third moment, we seek to relate characteristics of active methodologies with the concepts of biodiversity developed by the students through a comparative inference in the statements of the interviewees of the initial and final quarters. Regarding the analysis of the interviews, we realized that the category of axis one, active methodologies as innovative elements that favor learning, protagonism and motivation, was the one that had the most frequency in the speech of the participants, which allows to identify that the students recognize the emancipatory characteristics in AMs, however it is worth mentioning that pedagogical and logistical barriers were also mentioned in their application. In axis two, we perceive that the statements are more associated with the category biodiversity in an ecological view, which shows us the predominance of a conception that highlights the supremacy of scientific knowledge over traditional ones. In our analyzes, we infer that this ecological trend is especially defended by professors in the technical area who work in the course and in the way the topic is discussed in this context, which, despite being carried out with active methodologies that have an emancipatory feature, goes through a serious of factors that start from the individual understanding. Buscamos discutir, nesta pesquisa, de que forma os saberes emancipadores presentes nas metodologias ativas (MAs) podem influenciar nas concepções de biodiversidade desenvolvidas por futuros professores de Ciências da Natureza. O presente estudo foi construído com a participação de discentes do curso de Licenciatura Interdisciplinar em Ciências da Natureza e suas Tecnologias (LICNT), da Universidade Federal do Sul da Bahia (UFSB). Diante disso, o nosso objetivo foi analisar as concepções sobre biodiversidade para futuros professores de Ciências da Natureza na graduação em LICNT, baseada nas metodologias ativas, no contexto da UFSB, situada na Região Nordeste do Brasil. A coleta de dados foi dividida em duas fases: análise documental e aplicação dez entrevistas semiestruturadas com discentes de diferentes quadrimestres ativos no curso. Os dados produzidos foram processados e analisados seguindo os pressupostos da análise de conteúdo de Bardin, por meio de categorização temática construída a priori e posteriori, com base nas falas dos participantes. No eixo sobre metodologias ativas, surgiram três categorias ou dimensões: 1) barreiras logísticas e pedagógicas para o uso das metodologias ativas; 2) metodologias ativas como elementos inovadores que favorecem a aprendizagem, o protagonismo e a motivação, e 3) componente curricular de práticas pedagógicas como eixo articulador do currículo e das relações entre universidade, escola e comunidade. No eixo sobre biodiversidade, surgiram quatro categorias: 1) biodiversidade em uma visão ecológica; 2) biodiversidade sob uma perspectiva biocultural; 3) biodiversidade em uma visão biocêntrica, e 4) biodiversidade e ensino e aprendizado de Biologia. Em um terceiro momento, buscamos relacionar características das metodologias ativas com as concepções de biodiversidade desenvolvidas pelos discentes mediante uma inferência comparativa nas falas dos entrevistados dos quadrimestres iniciais e finais. No que se refere às análises das entrevistas, percebemos que a categoria do eixo um, metodologias ativas como elementos inovadores que favorecem a aprendizagem, o protagonismo e a motivação, foi a que teve maior frequência na fala dos participantes, o que permite identificar que os discentes reconhecem as características emancipadoras presente nas MAs, porém cabe ressaltar que também foram citadas barreiras pedagógicas e logísticas na sua aplicação. No eixo dois, percebemos que as falas estão mais associadas à categoria biodiversidade em uma visão ecológica, o que nos mostra a predominância de uma concepção que evidencia a supremacia dos saberes científicos sobre os tradicionais. Em nossas análises, inferimos que esta tendência ecológica é especialmente defendida pelos docentes da área técnica que atuam no curso e na maneira como o tema é discutido nesse contexto que, apesar de ser realizada com metodologias ativas que apresentam um caráter emancipador, passa por uma séria de fatores que partem do entendimento individual. São Cristóvão, SE

Motorized trawl fishing is considered highly predatory due to the accidental capture of numerous organisms. Based on the context and due to the need for knowledge about the malacofauna associated with industrial fishing in the Amazonian Platform, the present study aims to characterize the accompanying malacofauna. The samples were collected in 2016, 2017 and 2018, 250 trawls were monitored. 30 and 80 meters in 22 fisheries, 4,834 molluscs were collected, distributed in five classes (Bivalvia, Cephalopoda, Gastropoda, Polyplacophora and Scaphopoda), and 81 species. The class that presented the greatest diversity was the gastropod followed by the bivalves in relation to abundance. The species that stood out were the cephalopods Doryteuthis sp. e Lolliguncula brevis, the gastropods Hydatina physis; Marsupina bufo; Tonna galea; Turbinella laevigata; Stigmaulax cayenensis; Calyptraea centralis; Conasprella janowskyae and Polystira coltrorum, the abundance model that characterizes the region and the geometric type, where few species are dominant and the other rare species. The area studied is important in terms of conservation of marine biodiversity given the presence of species of economic interest and the existence of a wide diversity of species A pesca de arrasto motorizado é considerada altamente predatória devido à captura acidental de inúmeros organismos. Partindo desse contexto e devido à necessidade de co nhecimento sobre a malacofauna associada à pesca industrial na plataforma amazônica, o presente estudo visa caracterizar a malacofauna acompanhante da pesca de arrasto cama roeiro em coletas realizadas nos anos de 2016, 2017 e 2018, monitorando 250 arrastos, com profundidade entre 30 e 80 metros em 22 pesqueiros. Ao todo foram coletados 4.834 mo luscos, distribuídos em cinco classes (Bivalvia, Cephalopoda, Gastropoda, Polyplacophora e Scaphopoda) e representados por 81 espécies. A classe que apresentou maior diversidade foi a Gastropoda, seguida pela Bivalvia. As espécies que se destacaram como mais abun dantes foram os cefalópodes Doryteuthis sp. e Lolliguncula brevis, os gastrópodes Hydatina physis; Marsupina bufo, Tonna galea, Turbinella laevigata, Stigmaulax cayennensis, Calyptraea centralis, Conasprella janowskyae e Polystira coltrorum. O modelo de abundância que caracte riza a região é do tipo geométrico, onde poucas espécies são dominantes e as demais espé cies, raras. A área estudada é importante em termos de conservação da biodiversidade marinha dadas a presença de espécies de interesse econômico e a existência de uma ampla diversidade de espécies.

The state of São Paulo has a history of habitat loss and fragmentation in endemic areas with projects that threaten its biodiversity. Therefore, this study analyzed how the Environmental Impact Statements (EISs) of mining activities of the state of São Paulo (2005-2016) considered the biodiversity theme in different chapters. To analyze the ten selected EISs, we used the Index of Biodiversity Inclusion (IBI), which reflects the analysis of environmental indicators (from 0 to 1), depending on the commitment presented in each of the indicators. The IBI values ranged from 0.25 to 0.67 with significant variation among EISs. Most of them partially met the criteria, which was a profile similar to other countries, representing information gaps in most of the chapters covering biodiversity. The shortcomings were data limitation, impact analysis, and inadequate mitigation measures, in which the study highlights the need for a better scoping definition previous to Environmental Impact Assessment. Resumen El estado de São Paulo tiene una historia de pérdida y fragmentación del hábitat, con proyectos que amenazan su biodiversidad. Así, este estudio analizó cómo los Estudios de Impacto Ambiental (EIAs) de las actividades minerales del estado de São Paulo (2005-2016) consideraron el tema de la biodiversidad en sus diferentes capítulos. Para analizar los diez EIAs seleccionadas, se utilizó el Índice de Inclusión de la Biodiversidad (IIB), que consideró los indicadores ambientales (0 a 1), dependiendo del compromiso presentado en cada indicador. Los valores del IIB varió de 0.25 a 0.67, con variación significativa entre ellos. La mayoría de ellos cumplieron parcialmente los criterios, perfil similar al de otros países, representando lagunas de información en la mayoría de los capítulos. Las principales deficiencias apuntan a la limitación de datos, análisis de impacto y medidas de mitigación inadecuadas, apuntando a la necesidad de una mejor definición en la fase previa al EIA. Resumo O estado de São Paulo apresenta histórico de perda e fragmentação de habitats, com empreendimentos que ameaçam sua biodiversidade. Assim, este trabalho buscou analisar como os Estudos de Impacto Ambiental (EIAs) paulistas das atividades de mineração (2005-2016) consideraram o tema biodiversidade em seus diferentes capítulos. Para avaliar os dez EIAs selecionados, foi utilizado o Índice de Inclusão da Biodiversidade (IIB), que reflete a análise dos indicadores ambientais (0 a 1), dependendo do compromisso apresentado em cada um dos indicadores. Os valores de IIB foram de 0,25 a 0,67, com uma variação significativa entre os EIAs. A maioria contemplou parcialmente os critérios, perfil similar ao de outros países, representando lacunas de informações em grande parte dos capítulos que contemplavam a biodiversidade. As maiores deficiências referiram-se à limitação dos dados, análise dos impactos e insuficiência das medidas mitigadoras, apontando a necessidade de uma melhor definição previamente à elaboração do EIA.

Dissertação (mestrado) — Universidade de Brasília, Centro de Desenvolvimento Sustentável, Programa de Pós-Graduação em Desenvolvimento Sustentável, 2020. A recreação na natureza pode gerar impactos para a biodiversidade, reconfigurando a composição e estrutura de comunidades e alterando hábitos de espécies que devem ser monitoradas para que esses impactos sejam medidos e minimizados. O presente estudo apresenta uma análise de registros da mastofauna do Parque Nacional da Chapada dos Veadeiros, feitos por meio de armadilhas fotográficas em três áreas que estão sob diferentes intensidades de fluxo de pessoas. No primeiro capítulo foi analisada a composição da mastofauna dessas áreas. Com o índice de diversidade de Shannon construímos uma curva de acúmulo de espécies e testamos a diferença entre a abundância relativa das espécies. Com 10.560 câmeras-noite obtivemos 2.183 registros independentes de 27 espécies. Apesar de termos registrado a mesma riqueza nas áreas 0 (sem visitação) e 2 (com alto fluxo de pessoas), identificamos diferenças significativas na composição da comunidade e na abundância relativa de algumas espécies. O animal mais abundante na área 2 foi de Cerdocyon thous, indicando uma atração pelo alto fluxo de visitantes, por causa do seu perfil generalista. Isso, somado à fisionomia da vegetação, gerou um baixo número de registros de Lycalopex vetulus. Cervídeos como Mazama spp. utilizam amplamente a área 2, que contou com poucos registros de seus predadores, o que pode estar beneficiando-as. Espécies exóticas registradas parecem estar associadas com a presença humana. Adicionalmente, foi analisado o horário de atividade das espécies, para verificar se houve alteração para se adequar à visitação. Foram gerados histogramas circulares da distribuição do horário de atividade das espécies e verificado se há diferença entre as áreas, por intermédio do teste estatístico Mardia-Watson-Wheeler. Observou-se que C. thous altera seu horário para mais próximo do horário de visitação e que os cervídeos se tornaram mais noturnos na área 2 e 1 para evitarem sobreposição de horário com a visitação, resultando em aumento da sobreposição com seus predadores. Os resultados dessa dissertação sugerem que algumas espécies podem se beneficiar ou serem afastadas das áreas com alto fluxo de pessoas causando uma alteração nas relações interespecíficas predador-presa. Com esses dados, decisões quanto ao manejo podem ser ajustadas para minimizar o impacto do turismo na mastofauna e suas repercussões. Recreation in nature can generate impacts for biodiversity, reconfiguring the composition and structure of communities and changing habits of species that must be monitored so that these impacts are measured and minimized. This study presented data from the records of the mastofauna of the Chapada dos Veadeiros National Park made using camera traps in three areas that are under different intensities of flow of people. They are classified as area 0, in which there is no tourist visitation, 1 with low and 2 with a high flow of people. In the first chapter, the composition of the mastofauna in these areas was analyzed. For this purpose, diversity was assessed using the Shannon diversity index. We constructed a species accumulation curve and tested the relative abundance of species with the Kruskal-Wallis statistical test. With 10,560 cameras-night we obtained 2,183 independent records of 27 species. Although we recorded the same richness in areas 0 and 2 and the species accumulation curve did not indicate significant differences between the richness of the areas, we identified significant differences in the composition of the community and in the relative abundance of some species. The abundance of Cerdocyon thous was the largest in area 2, indicating an attraction for the high flow of visitors because of its generalist profile. This, added to the physiognomy of the vegetation, generated a low record of Lycalopex vetulus. Deer like Mazama spp. widely use area 2, which had few records of their predators, which may be benefiting these species. Registered exotic species appear to be associated with human presence. In Chapter 2, the period of activity of the species was analyzed to see if it is altered to fit to the visitation. Circular histograms of the period of activity distribution of species were generated and verified if there are differences between areas, using the Mardia-Watson-Wheeler statistical test. It was observed that C. thous changes its period of activity to one closer to the visitation period and that the deer became more nocturnal in areas 2 and 1 to avoid overlapping its period of activity with the visitation, resulting in an increase in the overlap with their predators. The results of this dissertation suggest that some species may benefit or be removed from areas with a high flow of people, causing a change in interspecific predator-prey relationships, so that such data must be taken into account in the management of environmental protection areas that allow tourist visitation. With these data, management decisions can be adjusted to minimize the impact of tourism on mastofauna and its repercussions.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2020. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) e Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq). O gênero Begomovírus é o maior e mais importante grupo de vírus infectando tomateiros em todo o mundo. Atualmente, dois begomovírus predominam no Brasil, são eles tomato severe rugose virus (ToSRV) e tomato mottle leaf curl virus (ToMoLCV). Por representar a principal e mais eficiente forma de controle, o uso de cultivares resistentes a begomovírus tem sido cada vez mais frequente. Com base em estudos de diversidade de espécies, tem se observado ao longo dos anos a mudança no panorama da diversidade de espécies de begomovírus no Brasil. Em vista dessa observação o principal objetivo desse trabalho de tese foi realizar a avaliação e a análise da diversidade de espécies de begomovírus em tomateiros resistentes e suscetíveis, em amostras coletadas em duas regiões produtoras no Distrito Federal, ao longo de 14 anos. Os temas de trabalho foram dividos em três capítulos. O capítulo 1 foi destinado a revisão bibliográfica. O capítulo 2 descreve o estudo temporal da diversidade de espécies de begomovírus em duas micro-regiões agrícolas. O capítulo 3 foi destinado ao estudo da capacidade replicativa de três espécies de begomovírus em tomateiros suscetíveis e resistente. No estudo da diversidade de begomovírus, utilizou-se amostras coletadas entre os anos de 2003 a 2016 que foram divididas em três grupos, grupo 1 (G1, 2003-2005), grupo 2 (G2, 2009-2011) e grupo 3 (G3, 2014-2016). O DNA viral presente nas amostras foi amplificado e submetido a análises preliminares da diversidade de espécies de begomovírus por meio da técnica de RCA/RFLP. Como resultado, observou-se uma diminuição da quantidade de diferentes perfis de restrição virais em amostras do G1 ao G3. A partir daí as amostras foram submetidas a sequenciamento de alto desempenho de modo a obter dados mais precisos da diversidade de espécies. Assim, as análises de sequenciamento de alto desempenho confirmaram a diminuição temporal da riqueza de begomovírus. Por exemplo, foram detectadas seis espécies no G1, enquanto somente três espécies no G2 e G3. Essa diminuição da diversidade de espécies de begomovírus foi acompanhada pelo aumento do uso de cultivares resistentes na área de estudo desse trabalho. Por esta razão, é discutida a possibilidade do uso de cultivares resistentes estar influenciado a diversidade de espécies de begomovírus. Entre os principais resultados obtidos foi a prevalência de isolados dos begomovírus ToSRV e ToMoLCV nos três grupos de amostras avaliados. Isolados de tomato golden mosaic virus (TGVV) predominaram no grupo 1 e não foram mais detectados nos demais grupos, demonstrando seu desaparecimento da área onde este estudo foi realizado. A partir desses resultados, além da possível influência do uso de cultivares resistentes na prevalência de espécies, no capítulo 3 foi estudada a aptidão replicativa dos begomovírus ToSRV, ToMoLCV e TGVV em cultivares suscetíveis e resistente a begomovírus. Para o estudo, foram estabelecidos tratamentos com infecção simples de cada vírus a partir de clones infecciosos, infecção mista com inoculação simultânea e não simultânea. Como resultado, foi observada uma capacidade replicativa semelhante entre ToSRV e ToMoLCV em cultivares suscetíveis e maior capacidade replicativa de ToMoLCV em relação ToSRV na cultivar resistente. Além disso, determinou-se a baixa capacidade replicatica de TGVV em relação ToSRV e ToMoLCV, independentemente da cultivar. Verificou-se também uma maior chance de infecção mista em cultivares suscetíveis do que na cultivar resistente. Os resultados em conjunto contribuem para uma melhor compreensão do processo de evolução dos begomovírus levantandos, a importância de se conhecer a diversidade de espécies dos begomovírus e os possíveis fatores relacionados as mudanças na diversidade ao longo dos anos. The genus Begomovirus is the largest and most important group of viruses infecting tomato plants worldwide. Today, two begomoviruses predominate in Brazil, tomato severe rugose virus (ToSRV) and tomato mottle leaf curl virus (ToMoLCV). It is frequent the use resistant cultivars to begomoviruses, being this the most popular and eficient control method. Based on species diversity studies, changes in the panorama of begomoviruses have been observed over the years. Thus, the main objective of this thesis was to conduct, an evaluation and analyses of the begomovirus species diversity in resistant and susceptible tomato plants, from samples collected in two producing regions in the Federal District over 14 years. The topics were divided in three chapters. Chapter 1 is a bibliographic review. Chapter 2 describes the temporal study of the diversity of begomovirus species in two agricultural micro-region. Chapter 3 is dedicated to the study of the replicative abilility of three species of begomovirus in susceptible and resistant tomatoes. In the begomovirus diversity study, the samples collected between 2003 and 2016 were divided into three groups, group 1 (G1, 2003-2005), group 2 (G2, 2009-2011) and group 3 (G3, 2014- 2016). The viral DNA present in the samples was amplified and subjected to a preliminary analysis of the diversity of begomovirus species. This analysis was performed by employing the RCA/RFLP method. As a result, a decrease in the amount of distinctive viral restriction profiles was observed in samples from G1 to G3. Then, the samples were subjected to high performance sequencing in order to obtain more accurate data on the species diversity. Thus, high- throughput sequecing analyses confirmed the temporal decrease in the begomovirus richness. For example, six species were detected in G1, while only three species in G2 and G3. This decrease in the diversity of begomovirus species occurred simultaneously to an increase in the use of resistant cultivars. Therefore, we discuss the possible effects of the use of resistant cultivars in the overall virus diversity. One of the major results was the confirmation of the prevalence of the begomovirus ToSRV and ToMoLCV indicating its disappearance from the area where this study was conducted. Based on these results, and in addition to the possible influence of the use of resistant cultivars on the prevalence of species, in chapter 3 the replicative ability of the begomovirus ToSRV, ToMoLCV and TGVV in cultivars susceptible and resistant to begomovirus was studied. For this purpose, tested treatments included simple infection of each virus using infectious clones, and mixed infection with simultaneous and non-simultaneous inoculation. As a result, a similar replicative capacity was observed for ToSRV and ToMoLCV in susceptible cultivars, and a higher replicative capacity of ToMoLCV in relation to ToSRV in the resistant cultivar. In addition, the low replicative capacity of TGVV in relation to ToSRV and ToMoLCV was observed, independent of the cultivar. Also, mixed infection was more frequent in susceptible cultivars than in the resistant one. The onset of results obtained in this study contributed for a better comprehention of the evolution process of begomoviruses, highlighting the importance of understanding the diversity of begomoviruses and the possible factors related to its changes over the years.

Tese (doutorado)—Univesidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2020. Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico e Fundação de Apoio a Pesquisa do Distrito Federal (FAP/DF). O tomateiro (Solanum lycopersicum L.) é uma das principais hortaliças cultivadas no Brasil. Até o início década de 1990, a ocorrência de doenças causadas por espécies de Begomovirus (família Geminiviridae) era esporádica no país. Entretanto, a partir deste período, um complexo extremamente diverso de espécies de begomovírus emergiu no cultivo do tomateiro, coincidindo com a ampla dispersão geográfica do vetor Bemisia tabaci MEAM 1 (Middle East-Asian Minor 1= biótipo B). A maioria dos begomovírus apresenta genoma bipartido e apresentam níveis variados de eficiência de transmissão pelo vetor. A utilização mais intensa de híbridos resistentes/tolerantes (principalmente com o gene Ty–1) é um potentical fator no processo de evolução deste grupo de vírus no Brasil. A metagenômica aliada ao Next-Generation Sequencing – NGS é uma das ferramentas mais eficientes para analisar, em larga escala, a diversidade de populações virais em diferentes condições ambientais. Neste contexto, o objetivo geral do presente trabalho foi conduzir estudos de metagenômica sobre a diversidade de begomovírus em tomateiro no Brasil. Os objetivos específicos foram: (a) conduzir estudos comparativos da diversidade de begomovírus infectando tomateiros com e sem o gene Ty–1 e (b) catalogar as espécies virais predominantes e/ou novas espécies de Begomovirus ocorrendo em tomateiros com e sem o gene Ty–1. Para isto, 107 amostras foram coletadas em campos de produção em Goiás (n=56), Distrito Federal (n=27) e Minas Gerais (n=24) entre os anos de 2002 e 2016. O DNA total das amostras foi extraído e submetido a PCR usando primers para detecção de begomovírus e também com primers para região genômica ligada ao gene Ty–1. Posteriormente as amostras foram submetidas a um enriquecimento via RCA (Rolling Circle Amplification) e divididas em dois pools: tomateiros sem o gene Ty–1 (n=64) e com o gene Ty–1 (n=43). Os dois pools foram sequenciados em uma plataforma Illumina HiSeq2500. As sequências obtidas foram montadas no programa CLC Genomics Workbench 11.0 e analisadas no Geneious 10.1. As sequências então foram comparadas com sequências virais presentes no GenBank utilizando o algoritmo BLASTn. Pares de primers específicos foram desenhados visando recuperar o genoma completo e confirmar a presença dos vírus em amostras individuais dentro de cada pool. Os resultados destas análises estão descritos no capítulo 2. Foi observada uma maior diversidade de espécies virais (n=14) no pool de amostras sem o gene Ty–1 em comparação com aquelas obtidas de plantas com gene Ty–1 (n=6). Observou-se uma aparente filtragem entre as espécies detectadas nos dois pools. Foi também observada uma grande frequência de infecções mistas nas amostras, tendo casos da ocorrência simultânea de até cinco espécies em uma única amostra. Três potenciais novas espécies foram detectadas, duas em amostras sem o gene Ty– 1 (MG-378 e GO-169) e uma em amostras contendo o gene Ty–1 (DF-640). Além disso, uma espécie do gênero Gemycircularvirus e um novo Alfasatélite foram detectados. Tomato golden vein virus (TGVV) foi uma das espécies amplamente detectadas nessas análises. Estudos conduzidos no capítulo 3, mostraram que TGVV e Tomato yellow vein streak virus (ToYVSV) estão intimamente relacionados como indicado por análises empregando Sequence Demarcation Tool (SDT) e alinhamento MUSCLE. Dois grupos bem definidos foram identificados, consistentes com os critérios atuais para demarcação de espécies de Begomovirus, sendo também identificado um conjunto distinto características genômicas, biológicas e ecológicas específicas para cada espécie viral. Uma reavaliação dos isolados de TGVV e ToYVSV disponíveis no GenBank mostrou que uma grande fração está erroneamente classificada ao nível de espécie. A espécie Bean golden mosaic virus (BGMV) foi detectada em associação com tomateiro nas análises conduzidas no capítulo 1. No capítulo 4 a diversidade de 161 isolados classificados como BGMV foi catalogada comparando suas sequências completas com o DNA–A e DNA–B do isolado de referência. Análises filogenéticas e com SDT indicaram que os isolados descritos coletivamente como BGMV compreendem, de fato, duas espécies distintas: uma que engloba isolados de BGMV de Phaseolus vulgaris e de uma ampla gama de hospedeiros (incluindo o tomateiro) e uma espécie estreitamente relacionada (com identidade variando de 89 a 91% em comparação com o isolado de referência de BGMV) principalmente associada ao feijão-lima (P. lunatus). O capítulo 5 descreve as características moleculares de um Gemycircularvirus (2.189 nucleotídeos) identificado em associação com o tomateiro no Brasil Central. As análises mostraram que a espécie identificada compartilhou 99% de identidade com um vírus provisoriamente denominado como Plant-associated genomovirus 12 de Larrea tridentata. O capítulo 6 descreve duas novas espécies de Begomovirus que foram identificadas em amostras de Minas Gerais e Goiás. Os genomas virais completos foram clonados, sequenciados via Sanger e provisoriamente denominados Tomato golden net virus – ToGNV (2.649 nucleotídeos) e Tomato yellow net virus – ToYNV (2.636 nucleotídeos). Ambos os vírus exibiram a organização do DNA–A com características típicas das espécies de begomovírus do Novo Mundo. No entanto, nenhum componente cognato do DNA–B foi encontrado, indicando que ToGNV e ToYNV provavelmente compreendem um grupo peculiar de begomovírus neotropicais monopartidos. Tomato (Solanum lycopersicum L.) is one of the main vegetable crops cultivated in Brazil. Until the early 1990s, the occurrence of diseases caused by Begomovirus species (family Geminiviridae) was sporadic in the country. However, from this period on, an extremely diverse complex of begomoviruses emerged in tomato fields, coinciding with the wide geographical dispersion of the Bemisia tabaci MEAM 1 (Middle East-Asian Minor 1 = biotype B). Most begomoviruses have a bipartite genome and have varying levels of transmission efficiency by the vector. The more intense use of resistant/tolerant hybrids (mainly with the Ty–1 gene) is a potentical factor in the evolution process of this group of viruses in Brazil. Metagenomics combined with Next-Generation Sequencing (NGS) is one of the most efficient tools for large scale analysis of the diversity of viral populations in different environmental conditions. In this context, the general objective of the present work was to conduct metagenomics studies on the diversity of begomoviruses in tomatoes in Brazil. The specific objectives were: (a) to carry out comparative studies of the begomovirus diversity infecting tomato plants with and without the Ty– 1 gene and (b) to catalog the predominant viral species and/or new begomoviruses occurring in tomato plants with and without the Ty–1 gene. For this, 107 samples were collected in production fields in Goiás (n = 56), Distrito Federal (n = 27) and Minas Gerais (n = 24) between the years 2002 and 2016. The total DNA of the samples was extracted and submitted to PCR using primers to detect begomovirus and also with primers for the genomic region linked to the Ty–1 gene. Subsequently, the samples were subjected to enrichment via RCA (Rolling Circle Amplification) and divided into two pools: tomatoes without the Ty–1 gene (n = 64) and with the Ty–1 gene (n = 43). The two pools were sequenced on an Illumina HiSeq 2500 platform. The obtained sequences were assembled using the CLC Genomics Workbench 11.0 program and analyzed in Geneious 10.1. The sequences were then compared to viral sequences present on GenBank using the BLASTn algorithm. Specific primer pairs were designed to recover the complete genome and confirm the presence of viruses in individual samples within each pool. The results of these analyzes are described in Chapter 2. A greater diversity of viral species (n = 14) was observed in the sample pool without the Ty – 1 gene compared to those obtained from plants with the Ty – 1 gene (n = 6). It was observed an apparent filtering effect among viral species detected in the two pools. A high frequency of mixed infections was also observed in the samples, with cases of the simultaneous occurrence of up to five species in a single sample. Three potential new species were detected, two in samples without the Ty–1 gene (MG-378 and GO-169) and one in samples containing the Ty–1 gene (DF-640). In addition, a species of the genus Gemycircularvirus and a new alpha-satellite were detected. Tomato golden vein virus (TGVV) was one of the species widely detected in these analyzes. Studies conducted in Chapter 3 have shown that TGVV and Tomato yellow vein streak virus (ToYVSV) are closely related as indicated by analyzes using Sequence Demarcation Tool (SDT) and MUSCLE alignment. Two well-defined clusters were identified, consistent with the current criteria for demarcation of Begomovirus species. In addition, a distinct set of genomic, biological and ecological characteristics specific to each viral species was identified. A reassessment of the TGVV and ToYVSV isolates available on GenBank showed that a large fraction of them is erroneously classified at the species level. Bean golden mosaic virus (BGMV) was also detected in association with tomato in the analyzes carried out in Chapter 1. In Chapter 4 the diversity of 161 isolates classified as BGMV was cataloged by comparing their complete sequences with the DNA–A and DNA–B components of reference isolate. Phylogenetic and SDT analyzes indicated that the isolates collectively described as BGMV actually comprise two distinct species: one that encompasses isolates of BGMV from Phaseolus vulgaris and from a wide range of hosts (including tomato) and a closely related species (with identity ranging from 89 to 91% compared to the reference BGMV isolate), which were mainly associated with lima beans (P. lunatus). Chapter 5 describes the molecular characterization of a Gemycircularvirus (2,189 nucleotides) identified in association with tomato in Central Brazil. The analyzes showed that the gemycircularvirus shared 99% of identity with a virus tentatively named as Plant-associated genomovirus 12 of Larrea tridentata. Chapter 6 describes two new Begomovirus species that were identified in samples from Minas Gerais and Goiás states. The complete viral genomes were cloned, sequenced via Sanger and tentatively named as Tomato golden net virus – ToGNV (2,649 nucleotides) and Tomato yellow net virus – ToYNV (2,636 nucleotides). Both viruses exhibited DNA–A organization with typical features of the New World begomovirus species. However, no cognate components of DNA–B were found, indicating that ToGNV and ToYNV might comprise a peculiar group of monopartite neotropical begomoviruses.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Tecnologia, Departamento de Engenharia Florestal, Programa de Pós-Graduação em Ciências Florestais, 2020. Matas de galeria são faixas estreitas de florestas tropicais que ocorrem ao longo dos cursos d’água na região do Brasil central e são de extrema relevância, pois, atuam como zonas de amortecimento, protegem as cabeceiras dos cursos hídricos e controlam os processos de erosão. Este estudo foi realizado com o objetivo de caracterizar a vegetação lenhosa em dois trechos de mata de galeria no Distrito Federal e investigar os efeitos dos fatores ambientais (declividade do terreno, distância dos cursos hídricos, textura e fertilidade dos solos) sobre a diversidade de espécies, padrões de distribuição florística e estrutura arbórea. Em cada trecho de mata de galeria foi amostrada uma área de 0,5 ha (50 m x 100 m), subdividida em 50 parcelas contíguas de 10 m x 10 m, onde foram mensuradas todas as árvores com DAP ≥ 5 cm. Para cada mata foram realizadas análises fitossociológicas, investigados os padrões de distribuição diamétrica e hipsométrica e analisados os índices de diversidade. A similaridade na estrutura arbórea entre as unidades amostrais foi avaliada utilizando a análise de agrupamento hierárquico (cluster) e análise de ordenação Non Metric Multidimensional Scaling (NMDS), usando o índice de Bray Curtis. Os efeitos dos fatores ambientais na variação da estrutura arbórea foram avaliados através de análise de redundância (RDA) e partição de variância. Foram mensurados 1.571 indivíduos lenhosos, pertencentes a 150 espécies, dentre as quais, 94 foram registradas na mata do Ribeirão (MR) e 96 na mata do Pitoco (MP). Apenas 40 espécies (26,7%) ocorreram em ambas as matas, evidenciando a elevada diversidade Beta destas formações. Esta variação acentuada é ainda mais evidente quando se compara as famílias de maior importância em cada uma das áreas: na MR, as principais famílias botânicas foram Fabaceae, Myrtaceae, Vochysiaceae, Chrysobalanaceae e Rubiaceae; na MP foram Fabaceae, Lauraceae, Myrtaceae, Rubiaceae e Annonaceae. A riqueza de espécies das duas matas está acima da média observada em outras matas de galeria no Brasil. Por outro lado, a densidade está próxima aos valores comumente encontrados e a dominância em área basal na MR é considerada baixa. A distribuição diamétrica de ambas as matas apresentou padrão de J invertido, sugerindo comunidades com regeneração satisfatória. Análises de agrupamento apontaram dois grupos principais de unidades amostrais que representam comunidades de borda e interior da mata e as condições ambientais foram muito distintas entre os trechos estudados. A variação da composição florística e estrutura arbórea entre as matas foi explicada pela declividade do terreno, teor de matéria orgânica e distância geográfica. No interior das matas, a variação é explicada pela distância ao curso hídrico, fertilidade dos solos e saturação de alumínio. A análise de partição de variância evidenciou que 5% da variação estrutural nas matas é explicada pela distância geográfica e 4% pelas variáveis ambientais. Em síntese, diferenças florísticas e estruturais entre e dentro das matas, bem como a elevada riqueza encontrada, sugerem grande heterogeneidade biológica, em resposta às distintas condições ambientais dentro de cada trecho. Em particular, a importância da distância espacial como estruturadora da comunidade arbórea, sugere limitação na dispersão entre áreas. Estes resultados reforçam a importância da manutenção dos corredores ecológicos para facilitar o fluxo gênico e a dispersão de espécies entre as diferentes áreas de matas de galeria. Gallery forests are narrow strips of tropical forests that occur along water courses in the central region of Brazil. These forests are extremely relevant because they act as buffering zones, protect the water courses and control erosion processes. This study was carried out to characterize woody vegetation in two gallery forest in the Federal District and to investigate the effects of environmental factors (slope, distance from water courses, texture and soil fertility) on species diversity, floristic distribution and tree structure. In each gallery forest, an area of 0.5 ha (50 m x 100 m), subdivided into 50 contiguous plots of 10 m x 10 m was sampled. All individual trees with DBH (Diameter at Brest Height) ≥ 5 cm were measured. For each forest, phytosociological analyzes were performed, patterns of diametric and hypsometric distribution were investigated, and diversity indexes were analyzed. The similarity in the tree structure between the sampling units was evaluated using hierarchical cluster analysis (cluster) and Non-Metric Multidimensional Scaling (NMDS), using the Bray Curtis distance. The effects of environmental factors on tree structure were assessed through redundancy analysis (RDA) and variance partitioning. I measured 1,571 woody individuals, belonging to 150 species, being 94 recorded in the Ribeirão forest (MR) and 96 in Pitoco (MP). Only 40 species (26.7%) occurred in both forests, showing high Beta diversity in these formations. This marked variation is more evident when comparing the most important families. Most important botanical families in MR were Fabaceae, Myrtaceae, Vochysiaceae, Chrysobalanaceae and Rubiaceae, whereas the most representative families in MP were Fabaceae, Lauraceae, Myrtaceae, Rubiaceae and Annonaceae. Species richness of these two forests is above the average observed in other gallery forests. On the other hand, observed density is similar to values commonly found, whilst dominance in basal area in the RM is characteristically low. Diametric distribution of both forests showed an inverted J pattern, suggesting communities with satisfactory regeneration. Environmental conditions varied widely among these two forests and cluster analyzes showed two main groups, represented by edge and interior communities. Among forests, floristic composition and tree structure variation were mainly associated with slope, organic matter content and the geographical distance. Whereas, within forests, variation was associated with distance to the water course, soil fertility and aluminum saturation. Variation partitioniong analyses showed that 5% of the structural variation in the forests is explained by the geographical distance and 4% by the environmental variables. In turn, floristic and structural differences between and within forests, coupled with the high species richness, suggest high biological heterogeneity, which is likely associated with different environmental conditions within each gallery forest sampled in here. Particularly, the importance of spatial distance for determining community structure, may suggest dispersal limitation between areas. These results reinforce the importance of maintaining ecological corridors to promote gene flow and species dispersion between different gallery forests.

Submitted by jualmei@stj.jus.br (jualmei@stj.jus.br) on 2020-12-17T21:49:19Z No. of bitstreams: 2 desmatamento_queimadas_brasil_mendes.pdf: 876049 bytes, checksum: 117a5ee905f2cef44d45781b101da8ea (MD5) license.txt: 1239 bytes, checksum: c9b4c351324448672315a00808efb725 (MD5) Approved for entry into archive by betanial@stj.jus.br (betanial@stj.jus.br) on 2020-12-18T17:33:17Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license.txt: 1239 bytes, checksum: c9b4c351324448672315a00808efb725 (MD5) desmatamento_queimadas_brasil_mendes.pdf: 876049 bytes, checksum: 117a5ee905f2cef44d45781b101da8ea (MD5) Made available in DSpace on 2020-12-18T17:33:17Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1239 bytes, checksum: c9b4c351324448672315a00808efb725 (MD5) desmatamento_queimadas_brasil_mendes.pdf: 876049 bytes, checksum: 117a5ee905f2cef44d45781b101da8ea (MD5) Previous issue date: 2020

Submitted by Maria Fernanda Leite (leitem@stj.jus.br) on 2020-06-04T03:59:48Z No. of bitstreams: 2 criacao_mercados_servicos_altmann.pdf: 189674 bytes, checksum: 4381a663aaa82c162c339aa51f3a56d8 (MD5) license.txt: 1239 bytes, checksum: c9b4c351324448672315a00808efb725 (MD5) Rejected by rsmoira@stj.jus.br (rsmoira@stj.jus.br), reason: on 2020-06-04T22:45:02Z (GMT) Submitted by Maria Fernanda Leite (leitem@stj.jus.br) on 2020-06-05T22:39:59Z No. of bitstreams: 2 criacao_mercados_servicos_altmann.pdf: 189674 bytes, checksum: 4381a663aaa82c162c339aa51f3a56d8 (MD5) license.txt: 1239 bytes, checksum: c9b4c351324448672315a00808efb725 (MD5) Approved for entry into archive by betanial@stj.jus.br (betanial@stj.jus.br) on 2020-06-09T22:32:29Z (GMT) No. of bitstreams: 2 criacao_mercados_servicos_altmann.pdf: 189674 bytes, checksum: 4381a663aaa82c162c339aa51f3a56d8 (MD5) license.txt: 1239 bytes, checksum: c9b4c351324448672315a00808efb725 (MD5) Made available in DSpace on 2020-06-09T22:32:29Z (GMT). No. of bitstreams: 2 criacao_mercados_servicos_altmann.pdf: 189674 bytes, checksum: 4381a663aaa82c162c339aa51f3a56d8 (MD5) license.txt: 1239 bytes, checksum: c9b4c351324448672315a00808efb725 (MD5) Previous issue date: 2020

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, Programa de Pós-Graduação em Biologia Microbiana, 2016. A mensuração da diversidade microbiana é um dos maiores desafios do campo microbiológico, principalmente por problemas metodológicos. Com o avanço de novas metodologias foi possível observar que a diversidade de microrganismos era maior do que se pensava, assim, possibilitando o estudo desse conjunto de microrganismos. O estudo dos genomas de diversos microrganismos contidos em um dado ambiente é denominado de metagenômica. A metagenômica pode ser utilizada para o estudo de diversos tipos de ambientes, como solo, ar, corpo humano, intestino de cupim, entre outros. Dentro dos ambientes estudados pela metagenômica, o ambiente aquático vem sendo alvo de diversos estudos. Apesar de apresentar diversos estudos descrevendo diferentes profundidades e até mesmo diferentes hábitats (esponja, corais por exemplo), ainda existem inúmeros hábitats no ambiente marinho que ainda não possuem estudos focados sobre a microbiota. Diferente do ambiente marinho, trabalhos focados na descrição da microbiota de água doce são escassos. Além disso, apesar de toda sua importância ecológica, diversos desses corpos d’água estão sendo perturbados por atividades antropogênicas, levando à alteração da microbiota. Alguns trabalhos focaram na detecção de biossensores capazes de detectar impactos antropogênicos no meio ambiente. O objetivo de presente trabalho foi contribuir na descrição da comunidade microbiana em ambientes aquáticos. Para atingir essa meta foram realizados dois estudos, o primeiro estudo foi realizar a análise taxonômica e funcional da comunidade bacteriana do rio Paraguaçú na estação de chuva e seca, além de avaliar o efeito de proteção do Parque Nacional da Chapada Diamantina (PNCD) sobre a qualidade da água e da diversidade da microbiota do rio Paraguaçú. Outro estudo realizado foi o primeiro trabalho metagenômico focado em poças de maré. Esse trabalho deu enfoque na descrição do perfil taxonômico e funcional da microbiota das poças de maré situados em Ocean Beach, San Diego, CA, EUA. Ambos ambientes trabalhados possuem um grande potencial biotecnológico e se apresentaram como fundamentais na determinação do perfil da microbiota encontrada. No rio Paraguaçú foi possível observar uma predominância de genes relacionados à degradação de pesticidas (como o Benzoato), enquanto nas poças de maré foi possível observar uma maior abundância de genes relacionados à tolerância a ambientes com alta concentração salina. Novos estudos devem ser realizados para ambos ambientes buscando elucidar melhor os processos que ocorrem nesses ambientes. Determining the true diversity in a microbial community is one of the biggest challenges in microbiology. The development of new techniques has revealed a higher microbial diversity than what was previously thought and provided a new way to study these organisms. Metagenomics, the study of microbial DNA recovered from specific environments, allows the study of microbial communities in soil, air, human body, and termite gut. Among the environments studied using this approach, water is one of the most important. Each of the two types of water environments (seawater and freshwater) has a specific microbial community. Although previous studies have described microbial communities in different water layers and habitats (e.g. sponge, coral), the microbial communities of several seawater habitats have not been studied, and studies describing microbial communities in freshwater environments are rare. Moreover, ecologically important freshwater environments are being disturbed by anthropogenic activity, which can change the microbial profile. Previous studies have focused on identifying biosensors that can detect anthropogenic impacts on the environment. The aim of this work was to characterize the microbial communities in two water environments, and this objective was developed in two separate studies. The first described taxonomic and functional analyses of the bacterial community in the Paraguaçú River during both wet and dry seasons. Additionally, we evaluated the protective effect of Parque Nacional da Chapada Diamantina (PNCD) on water quality and microbial diversity in this river. The second study was the first metagenomic study of tide pools, in which we described the taxonomic and functional profiles of microbial communities in tide pools at Ocean Beach, San Diego, CA, USA. Both studies describe environments with great biotechnological potential and showed themselves as fundamental factors shaping the microbial communities. For example, in the Paraguaçú River we observed a high abundance of genes encoding enzymes capable of degrading pesticides such as emamectin benzoate, whereas tide pools showed a high abundance of halotolerance genes. Further studies are needed to elucidate processes in both environments.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2022-12-28T13:05:22Z No. of bitstreams: 1 Andre dos Santos Souza.pdf: 1257004 bytes, checksum: 58fd77b324fb67db8f98f4603693435d (MD5) Made available in DSpace on 2022-12-28T13:05:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Andre dos Santos Souza.pdf: 1257004 bytes, checksum: 58fd77b324fb67db8f98f4603693435d (MD5) Previous issue date: 2019-02-19 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES This thesis presents an approach on the relationship between the biological and utilitarian richness of plant species in tropical forests, applying ecological models and lines of thought that seek to understand the product resulting from this interaction. In terms of the environment, we carried out two studies with tropical forests: in the first approach, we used two areas of tropical forest, one in a rainforest environment with vegetation characteristic of a semideciduous forest and the other a caatinga environment with a seasonally dry forest ; already in the second study, we used a dry forest area with considerable relief elevations, where pluviometric regimes change considerably along a precipitation gradient. In order to study the patterns of species richness and utilization in tropical forests, we have used the hypothesis of versatility and the Utilitarian Redundancy Model as a support to understand the resource selection strategies in these environments. We performed phytosociological surveys in all selected areas, as well as collecting botanical material for herbarium identification. This collection process was necessary to compose the checklist interview, a visual stimuli method widely used in ethnobiological studies. All species identified in herbarium were presented together with photos of the living plant to all residents of the communities. In the first study, to test the first hypothesis, we used the chi-square test to verify the proportion of species and useful species richness, to analyze the second hypothesis on the versatility of the environments, a T test was used, and in the third hypothesis the Kruskal-Wallis test to verify the utilitarian redundancy of the environments. For the second study, we used the same hypotheses from the previous study, using the chi-square test for the first one, Kruskal-Wallis for the second and the third hypothesis, using an ANOVA from an intracategory perspective and a test of Kruskal- Wallis in the perspective of intercategory. The results of the first study demonstrated that the two areas are relatively similar in the proportion of species and species richness used, leading us to suggest that other studies that aim to verify patterns of richness and useful species, carry out their approaches in more physiognomically distinct environments , most probably because the fragment of rainforest, which should have a greater wealth than the dry forest, suffered considerable disturbance and loss of species over time due to the monoculture of sugarcane, which may have had a direct influence on its growth. wealth. The remarkable similarity etween the proportion of total richness and richness of useful species of the areas may also have influenced the results of the Utilitarian Redundancy Model, where we can not observe significant differences with respect to the quantity of species that perform the same use within a system , which makes us believe how the availability of species in the environment directly influences the choices of plant resources by local populations. As for the versatility, we have been able to corroborate our hypothesis by demonstrating that the species of the environment with low richness suffer a relatively higher use pressure than the environment represented by a greater species richness. In the second approach at the rainfall gradient level, we find a significant relation with the environmental richness and richness of useful species, demonstrating that in environments with a greater species richness, they present a greater amount of useful species. ANOVA proved to be significant for testing the versatility of species, but we found that the most versatile environment was the one with the highest rainfall indexes, which can be explained by the greater availability of plant resources throughout the year, since in the absence of water, many structures such as folas and fruits disappear. Decreasing the intensity of the deciduous phenomenon has enabled people to experiment and test a greater amount of resources, which may have given this environment a greater versatility of uses for plants. For the third hypothesis, we did not find significant relation with any of the categories of use verified, with respect to the Utility Redundancy. Bringing our findings to a conservationist approach, we recommend a greater attention and investment of management and conservation strategies for environments that have a low species richness, considering that the extinction of species can happen more sharply in these places. Esta tese apresenta uma abordagem sobre a relação entre a riqueza ambiental e utilitária de espécies vegetais em florestas tropicais, aplicando modelos ecológicos, com o intuito de compreender o produto resultante dessa interação. Em termos de ambiente, realizamos dois estudos com florestas tropicais: na primeira abordagem, utilizamos duas áreas de floresta tropical, uma inserida em um ambiente de floresta úmida com vegetação característica de uma floresta semidecidual e a outra em um ambiente de caatinga com floresta sazonalmente seca. No segundo estudo, utilizamos uma área de floresta seca com consideráveis elevações no relevo, onde os regimes pluviométricos mudam consideravelmente ao longo de um gradiente de precipitação. Para estudar os padrões de riqueza e utilização de espécies nas florestas tropicais, utilizamos a hipótese da versatilidade e o Modelo da Redundância Utilitária como suporte para compreender as estratégias de seleção de recursos nesses ambientes. Realizamos levantamentos fitossociológicos em todas áreas selecionadas, como também coletamos material botânico para identificação em herbário. Esse processo de coleta foi necessário para compor o checklist entrevista, um método de estímulo visual amplamente utilizado em estudos etnobiológicos. Todas as espécies identificadas em herbário foram apresentadas juntamente com fotos da planta viva a todos os moradores das comunidades. No primeiro estudo, para testar a primeira hipótese, utilizamos o teste de qui-quadrado para verificar a proporção de riqueza de espécies e espécies úteis, para analisar segunda hipótese sobre a versatilidade dos ambientes, utilizou-se um teste T, e na terceira hipótese o teste de Kruskal-Wallis para verificar a redundância utilitária dos ambientes em uma perspectiva intracategoria e um teste T na perspectiva intercategoria. Para o segundo estudo, tivemos as mesmas hipóteses, do estudo anterior. Utilizamos novamente o teste de qui-quadrado para a primeira, Kruskal-Wallis para a segunda, e na terceira hipótese, utilizou-se uma ANOVA em uma perspectiva de intracategoria e um teste de Kruskal-Wallis na perspectiva de intercategoria. Os resultados do primeiro estudo demonstraram que as duas áreas são relativamente semelhantes na proporção de riqueza de espécies e espécies utilizadas, nos levando a sugerir que outros estudos que tenham como objetivo verificar padrões de riqueza e espécies úteis, realizem suas abordagens em ambientes mais distintos fitofisionomicamente, muito provavelmente porque o fragmento de floresta úmida, que deveria apresentar uma maior riqueza do que a floresta seca, sofreu consideráveis perturbações e perda de espécies ao longo do tempo, devido à monocultura da cana de açúcar, o que pode ter influenciado diretamente na composição de espécies. A notável semelhança entre a proporção de riqueza total e riqueza de espécies úteis das áreas, também pode ter influenciado nos resultados do Modelo da Redundância Utilitária, onde não conseguimos observar diferenças significativas com relação a quantidade de espécies que desempenham o mesmo uso dentro de um sistema, o que nos faz acreditar como a disponibilidade de espécies no ambiente pode influenciar diretamente nas escolhas dos recursos vegetais por populações locais. Quanto a versatilidade, conseguimos corroborar a nossa hipótese ao demonstrar que as espécies do ambiente com baixa riqueza, sofrem uma pressão de uso relativamente maior do que o ambiente representado por uma maior riqueza de espécies. Na segunda abordagem a nível de gradiente de pluviosidade, não encontramos uma relação significativa com a riqueza ambiental e riqueza de espécies úteis, de certa forma que a proporção da riqueza total/espécies úteis não pôde ser estatisticamente comprovada. A ANOVA também não se mostrou significativa para testar a versatilidade de espécies, e verificamos que o ambiente mais versátil foi aquele que apresentou índices pluviométricos maiores, o que pode ser explicado pela maior disponibilidade de recursos vegetais ao longo do ano, uma vez que na falta de água, muitas estruturas como folhas e frutos desaparecem. Sendo assim, diminuição da intensidade do fenômeno da caducifólia, fez com que as pessoas pudessem experimentar e testar uma maior quantidade de recursos, o que pode ter conferido a este ambiente, uma maior versatilidade de usos para as plantas. Para a terceira hipótese, não encontramos relação significativa com nenhuma das categorias de uso verificadas, no que se diz respeito à Redundância Utilitária. Trazendo nossos achados para uma abordagem conservacionista, recomendamos uma maior atenção e investimento de estratégias de manejo e conservação para ambientes que possuem uma baixa riqueza de espécies, tendo em vista que a extinção e redução de espécies pode acontecer de forma mais acentuada nesses locais.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Planaltina , Programa de Pós-Graduação em Ciências Ambientais, 2019. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) e Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq). Compreender a dinâmica biológica (como ele se comporta no ambiente, a sua composição) diante de diferentes padrões ambientais, locais, e de desmatamento em regiões próximas a corpos hídricos, é relevante para o avanço da compreensão dos impactos antrópicos sobre os diversos ecossistemas aquáticos. Além disso, a distribuição de espécies depende de interações (e.g. bióticas, abióticas, históricas, fatores biogeográficos), ambientais e espaciais, determinantes da colonização e extinção dos organismos, e moldam a estrutura da comunidade. Por isso, avaliamos (i) o efeito da complexidade espacial sobre a riqueza de espécies, densidade de organismos e composição do zooplâncton aderido a macrófitas aquáticas artificiais; (ii) a influência da paisagem e das características ambientais (limnológicas e estruturais) sobre a dinâmica da distribuição espacial da comunidade zooplanctônica diante da variação em dois períodos hidrológicos (cheia e estiagem). Cada objetivo se desmembrou em um capítulo. No primeiro, foi realizado um experimento em uma lagoa natural com intuito de avaliar a colonização dos organismos em plantas aquáticas artificiais com dois fatores de complexidade e dois tipos de arranjo. No segundo, investigamos a influência da cobertura florestal e de características físicoquímicas de riachos sobre comunidades zooplanctônicas no sudeste da Amazônia. Com isso, verificamos que (i) a composição dos grupos zooplanctônicos apresentou variação em correspondência a cada tratamento. Apesar disso, os arranjos de folhas complexas simples e colonial apresentaram composições similares para todos os grupos. Em média, folhas complexas apresentaram maiores valores de densidade e riqueza de organismos. Mostrando que a variabilidade dentro do ambiente pode ser determinante na riqueza, abundância e densidade de organismos zooplanctônicos; (ii) As variáveis ambientais e espaciais não tiveram efeito significativo na estrutura das comunidades zooplanctônicas de riachos, o que pode indicar a forte influência de fatores estocásticos. Understanding the biological dynamics (how it behaves in the environment, its composition) in face of different environmental, local, and deforestation patterns in regions close to water bodies are relevant for advancing the understanding of the anthropic impacts on the various aquatic ecosystems. In addition, species distribution depends on interactions (e.g. biotic, abiotic, historical, biogeographic factors), environmental and spatial, determinants of colonization and extinction of organisms, and shape the structure of the community. Therefore, it was evaluated (i) the effect of spatial complexity on species richness, organism density and zooplankton composition adhered to artificial aquatic macrophytes; (ii) the influence of landscape and environmental (limnological and structural) characteristics on the dynamics of the spatial distribution of the zooplankton community in relation to the variation in two hydrological periods (flood and drought). Each objective was dismembered in a chapter. In the first chapter, an experiment was carried out in a natural lagoon with the purpose of evaluating the colonization of the organisms in artificial aquatic plants with two complexity factors and two types of arrangement. In the second chapter, we investigated the influence of forest cover and physicochemical characteristics of streams on zooplankton communities in southeastern Amazonia. With this, we verified that (i) the composition of the zooplankton groups presented variation in correspondence to each treatment. Despite this, simple and colonial complex leaf arrangements presented similar compositions for all groups. Generally, complex leaves had higher values of density and richness of organisms. Showing that variability within the environment can be determinant in the richness, abundance, and density of zooplanktonic organisms; (ii) Environmental and spatial variables did not have a significant effect on the structure of zooplankton communities in streams, which may indicate the strong influence of stochastic factors.

O presente trabalho aborda a questão dos ecossistemas e o reflorestamento para a restauração ecológica e a preservação da biodiversidade.

Bancos de sementes do solo trazem informações sobre a flora atual e permitem cenários futuros sobre as comunidades vegetais. O objetivo deste trabalho foi determinar o percentual de germinação ex situde um banco de sementes em diferentes níveis de luminosidade. A amostragem ocorreu em floresta primária explorada sob pousio no município de Moju, estado do Pará, Brasil. Foram coletadas 10 amostras compostas por quatro amostras simples em 10 parcelas da camada superficial do solo (5 cm). As amostras foram mantidas em casa de vegetação e distribuídas aleatoriamente em bandejas de isopor sob três condições de luminosidade: Sombra (casa de vegetação + 70% de sombrite); Sombra Média (casa de vegetação + 30% de sobrite) e Pleno Sol, com cinco repetições cada. Após 120 dias, o banco de sementes apresentou 414 plântulas de 61 espécies, 48 gêneros e 34 famílias. Deste total, 27,78% dos indivíduos germinaram nos três ambientes analisados. O ambiente com maior germinação de indivíduos foi Sombra Média (F = 140,25; p = 0,0001; CV = 3,60%), o qual também incluiu 48,15% das espécies germinadas. O banco de sementes apresentou alta diversidade florística com predominância de espécies arbóreas, pioneiras e zoocóricas. Desta forma, condições ambientais determinam a germinação do banco de sementes, com destaque ao ambiente Sombra Médiae às famílias Fabaceae, Rubiaceae e Urticaceae. Made available in DSpace on 2021-09-22T14:00:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cordeiro-2021-Floristica-germinacao-bco-de-sementes.pdf: 180570 bytes, checksum: bfe8214758e3ca582ac5fe893ad744de (MD5) Previous issue date: 2021

Submitted by Iury Batista (iurys@stj.jus.br) on 2019-04-10T18:40:14Z No. of bitstreams: 2 constituicao_ecologica_nalini.pdf: 105472 bytes, checksum: ebf999c346982261a2da49dfbdd8fb0e (MD5) license.txt: 1239 bytes, checksum: c9b4c351324448672315a00808efb725 (MD5) Approved for entry into archive by betanial@stj.jus.br (betanial@stj.jus.br) on 2019-04-11T14:46:05Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license.txt: 1239 bytes, checksum: c9b4c351324448672315a00808efb725 (MD5) constituicao_ecologica_nalini.pdf: 105472 bytes, checksum: ebf999c346982261a2da49dfbdd8fb0e (MD5) Made available in DSpace on 2019-04-11T14:46:05Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1239 bytes, checksum: c9b4c351324448672315a00808efb725 (MD5) constituicao_ecologica_nalini.pdf: 105472 bytes, checksum: ebf999c346982261a2da49dfbdd8fb0e (MD5) Previous issue date: 2019

Resumo: A compreensão da biodiversidade como decorrente do processo evolutivo é fundamental para a formação dos educandos. Teve-se como objetivo apresentar uma aula prática complementar à sugerida pelo Currículo do Estado de São Paulo no que tange ao ensino de filogenia, a partir da utilização de manequins confeccionados com materiais reutilizáveis. Utilizou-se como método a aplicação de questionários estruturados aplicados a 30 alunos da 3ª série do Ensino Médio de uma escola pública, antes e depois das aulas práticas. Conclui-se que, quando as aulas são concebidas com materiais táteis e tridimensionais, os alunos apresentam maior grau de envolvimento que no desafio impresso, aguçando a curiosidade e aumentando o grau de envolvimento na construção do saber. Esse envolvimento em aulas práticas denota melhora de resultados em provas modelo ENEM, uma vez que trabalham habilidades básicas. Ainda assim, requerem maior tempo de investimento com relação a conceitos básicos da filogenia.Palavras-chave: Ensino médio. Aulas práticas. Diversidade biológica. Sistemática filogenética. Abstract: The understanding of the resulting biodiversity of an evolutionary process is fundamental for the learners’ formation. Therefore, this work aims to present an additional practice to the one suggested by the Curricular Proposal of São Paulo when it comes to phylogeny teaching. Besides bringing the elaboration of the hypothetical manikins composed of reusable materials, it also shows the results of structured questionnaires applied to the students in the 3rd grade of a public High School. The research has concluded that when the classes are generated with tactile and tridimensional materials, the students convey a higher degree of engagement than in the challenge when printed, sharpening their curiosity and increasing the engagement in the learning build-up. The engagement during practical classes demonstrates an improvement on the results on tests, such as ENEM due to the basic skills which are explored. Even so, such classes demand longer time of investment regarding the basic principles of phylogeny.Keywords: High School. Practical classes. Biological diversity. Phylogenetic system.

The understanding of the resulting biodiversity of an evolutionary process is fundamental for the learners’ formation. Therefore, this work aims to present an additional practice to the one suggested by the Curricular Proposal of São Paulo when it comes to phylogeny teaching. Besides bringing the elaboration of the hypothetical manikins composed of reusable materials, it also shows the results of structured questionnaires applied to the students in the 3rd grade of a public High School. The research has concluded that when the classes are generated with tactile and tridimensional materials, the students convey a higher degree of engagement than in the challenge when printed, sharpening their curiosity and increasing the engagement in the learning build-up. The engagement during practical classes demonstrates an improvement on the results on tests, such as ENEM due to the basic skills which are explored. Even so, such classes demand longer time of investment regarding the basic principles of phylogeny., A compreensão da biodiversidade como decorrente do processo evolutivo é fundamental para a formação dos educandos. Teve-se como objetivo apresentar uma aula prática complementar à sugerida pelo Currículo do Estado de São Paulo no que tange ao ensino de filogenia, a partir da utilização de manequins confeccionados com materiais reutilizáveis. Utilizou-se como método a aplicação de questionários estruturados aplicados a 30 alunos da 3ª série do Ensino Médio de uma escola pública, antes e depois das aulas práticas. Conclui-se que, quando as aulas são concebidas com materiais táteis e tridimensionais, os alunos apresentam maior grau de envolvimento que no desafio impresso, aguçando a curiosidade e aumentando o grau de envolvimento na construção do saber. Esse envolvimento em aulas práticas denota melhora de resultados em provas modelo ENEM, uma vez que trabalham habilidades básicas. Ainda assim, requerem maior tempo de investimento com relação a conceitos básicos da filogenia.

Global strategies under the scope of CBD are important in guiding policies and resources for the conservation of biological diversity. This paper emphasized the need to develop actions under the Global Strategy for Plant Conservation (GSPC) with measurable results up to 2020, regarding the status and perspectives related to Targets 12 and 13, focusing on the Brazilian context in order to identify gaps and actions to achieve the goals for conservation and sustainable use of plants. It should be noted that Target 12 also covers logging, not necessarily directly related to indigenous peoples and traditional communities, but may threaten their livelihoods. In Brazil, scientific knowledge about the ecological effects of the harvesting of non-timber forest products is still limited, and few studies have contributed to the establishment of legal regulations for collection and management. With regard to target 13, which concerns traditional and indigenous knowledge about plant use and the dependence of these peoples on plants, there are still a lack of integrative and effective policy initiatives. However, considering the negative political context of recent decades and exacerbated in recent years in relation to biodiversity conservation and indigenous peoples and local communities, profound changes are necessary in the Brazilian scenario, with strong support and recognition for indigenous peoples and local communities, so that any objective related to the achievement of the goals of the GSPC is minimally achieved. Resumo As estratégias globais no âmbito da CDB são importantes para orientar políticas e recursos para a conservação da diversidade biológica. Este artigo enfatizou a necessidade de desenvolver ações no âmbito da Estratégia Global para a Conservação de Plantas (GSPC) com resultados mensuráveis até 2020, no que se refere ao status e as perspectivas relacionadas às metas 12 e 13, com foco no contexto brasileiro, visando identificar lacunas e ações para alcançar os objetivos para conservação e o uso sustentável das plantas. Salienta-se que a meta 12 abrange também a exploração madeireira, não necessariamente de relação direta com povos indígenas e comunidades tradicionais, porém pode vir a ameaçar seus meios de subsistência. No Brasil, o conhecimento científico sobre os efeitos ecológicos da coleta de produtos florestais não madeireiros ainda é limitado e poucos estudos contribuíram para o estabelecimento de regulamentações legais para coleta e manejo. Com relação à meta 13, que diz respeito aos conhecimentos tradicionais e indígenas sobre o uso de plantas e à dependência desses povos pelas plantas, ainda faltam iniciativas de políticas integradoras e eficazes. No entanto, considerando o contexto político negativo das últimas décadas e exacerbado nos últimos anos, em relação à conservação da biodiversidade e aos povos indígenas e comunidades locais são necessárias mudanças profundas no cenário brasileiro, com forte apoio e reconhecimento para os povos indígenas e comunidades locais, para que qualquer objetivo relacionado ao alcance das metas da GSPC seja minimamente perseguido.