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Introduction: Shigella spp. is a growing global health concern due to increasing multiple drug resistance, commonly resulting in therapeutic failure. Integrons are gene expression systems run by integrase genes. The aims of this study were detection of class I, II and III integrons and assessment of antimicrobial resistance in Shigella spp. isolated from acute pediatric diarrhea patients.Materials and methods: From January to December 2015, 16 Shigella spp. were isolated from 310 non-duplicative diarrheal stool samples in Children's Medical Center, Tehran, Iran. The isolates were analyzed for their antibiotic susceptibility using CLSI guidelines M100-S14. Multiplex PCR was used for amplification of I, II and III integron-associated integrase (intl ) genes.Results: Of 310 stool samples, 16 (5.2%) were positive for Shigella spp., in 7 of them S. sonnei and in 9 of them S. flexneri were identified. Results of the antimicrobial susceptibility test showed that 6.2%, 50%, 31.2%, 6.2%, 81.2%, 56.2% and 31.2% of the isolates were resistant to gentamicin, chloramphenicol, nalidixic acid, ciprofloxacin, tetracycline, ampicillin and trimethoprim-sulfamethoxazole, respectively. Multiplex PCR results revealed that 6.2% (1/16), 31.2% (5/16), 50% (8/16) of Shigella isolates carried intl I, intl II and both intl I/intl lI genes. No class 3 integrons were detected.Discussion: In this study, multidrug resistance was seen in Shigella isolates similar to that in isolates from other geographical areas. This is possible due to inappropriate use of antimicrobials. Furthermore, prevalence of multidrug resistance was significantly linked to the presence of integrin genes. Conclusion: A class 2 integron plays a role in presence of multidrug resistance in Shigella spp. It is vital to prevent the spread of antibiotic resistance through continuous monitoring., Hintergrund: Die Zunahme multiresistenter Shigella spp. ist ein globales Gesundheitsproblem wachsender Bedeutung. Integrons sind Genexpressionssysteme, die von Integrase-Genen gesteuert werden. Zielsetzung der Studie war die Detektion von Klasse 1, 2 und 3 Integrons und die Bestimmung der antimikrobiellen Resistenz von Shigella spp., die von pädiatrischen Patienten mit Diarrhoe isoliert wurden. Material und Methoden: Von Januar bis Dezember 2015 wurden 16 Shigella spp. aus 310 nicht-duplikativen Durchfall-Stuhlproben im Children's Medical Center, Tehran, gemäß Guideline des Clinical and Laboratory Standards Institute isoliert. Zur Amplifikation der I, II und III Integron-assoziierten Integrase(intl )-Gene wurde die Multiplex PCR eingesetzt.Ergebnisse: In 16 (5,2%) der 310 Stuhlproben wurden 7-mal S. sonnei und 9-mal S. flexneri isoliert. 6,2%, 50%, 31,2%, 6,2%, 81,2%, 56,2% bzw. 31,2% der Isolate waren resistent gegen Gentamicin, Chloramphenicol, Nalidixinsäure, Ciprofloxacin, Tetracycline, Ampicillin und Trimethoprim-Sulfamethoxazol. Mittels Multiplex PCR wurde nachgewiesen, dass 6,2% (1/16), 31,2% (5/16), 50% (8/16) der Shigella Isolate intl I, intl II bzw. beide Gene trugen. Klasse III Integrons wurden nicht detektiert.Diskussion: Bei Shigella -Isolaten wurde ähnlich zu anderen geographischen Regionen Multiresistenz nachgewiesen. Das wird begünstigt durch nicht Leitlinien gerechten Einsatz von Antibiotika. Die Prävalenz der Multiresistenz war signifikant mit dem Vorhandensein von Integrin-Genen assoziiert.Schlussfolgerung: Das Klasse 2 Integron ist von Bedeutung für die Multiresistenz von Shigella spp. Es ist wichtig, die Ausbreitung von Antibiotikaresistenzen durch kontinuierliche Überwachung zu verhindern.

Background: The pickle, a traditional fermented product, is popular among Iranians. Much research has been conducted worldwide on this food group. Due to a lack of related data in Iran, this study was conducted to isolate and identify dominant lactic acid bacteria (LAB) in pickles and salted pickles.Materials and methods: Seventy samples were collected from different regions of Iran. The isolated bacteria were identified as LAB by Gram staining and catalase by using MRS agar. Then, those strains were identified at the species level by physiological tests (e.g., gas production from glucose, arginine hydrolysis, CO2 production from glucose in MRS broth, carbohydrate fermentation) and growth at temperatures of 15°C, 30°C, and 45°C in MRS broth for 3 days. The probiotic characteristics of these bacteria were studied using acid and bile tolerance. The corresponding results were verified using PCR analyses of the 16S rDNA region. Results: 114 presumptive lactic acid bacteria (LAB) with Gram-positive and catalase-negative properties were obtained from the samples. The results revealed that all isolated bacteria were identfied as Lactobacillus (L.) plantarum , L. brevis , L. pentosus , L. casei , L. paracasei and Leuconostoc mesenteroides . The predominant LAB in these pickles was L. plantarum , which was isolated from most of the samples. Among the 114 LAB, 7 isolated species have probiotic potential. Six out of seven were recognized as L. plantarum and one remained unidentifiable by biochemical testing. PCR analysis and sequencing of the 16S rDNA region using 27f and 1522r primers showed that all of the probiotic strains were L. plantarum .Conclusion: The results of this study showed that the dominant LAB in traditional Persian pickled vegetables are L. plantarum , L. brevis , L. pentosus , L. casei , L. paracasei, and Leuconostoc mesenteroides . Moreover, L. plantarum was recognized as a probiotic species in pickled vegetables. The raw data obtained from this study can b, Hintergrund: Das Essiggemüse, ein traditionelles vergorenes Produkt, ist bei der iranischen Bevölkerung sehr beliebt. Es wurden weltweit bereits viele Forschungsarbeiten zu diesem Lebensmittel durchgeführt. Bisher sind die Ergebnisse jedoch nur unzusammenhängend. Daher soll im Rahmen dieser Studie die Vielfalt der dominanten Milchsäurebakterien in Essig- und Salzgurken isoliert und identifiziert werden.Material und Methoden: Es wurden 70 Proben aus verschiedenen Regionen des Irans analysiert. Die isolierten Bakterien wurden durch Gram-Färbung und Katalase-Testung sowie unter Verwendung von MRS-Agar als Milchsäurebakterien (LAB) identifiziert. Die Spezies dieser Stämme wurde durch physiologische Tests gesichert, wie Gasbildung von NH3 aus Arginin und von CO2 aus Glukose in Durham-Röhrchen mit MRS-Bouillon, das Wachstum bei Temperaturen von 15°C, 30°C und 45°C in MRS-Bouillon für 3 d sowie die Kohlenhydratfermentation. Die probiotischen Eigenschaften dieser Bakterien wurden unter Beobachtung ihrer Säure- und Gallentoleranz erfasst. Die Ergebnisse wurden mittels PCR-Analyse der 16S-rDNA Region verifiziert.Ergebnisse: Durch experimentelle Untersuchungen wurden insgesamt 114 mutmaßliche LAB mit Gram-positiven und Katalase-negativen Eigenschaften identifiziert. Die Ergebnisse zeigten, dass alle isolierten Bakterien als Lactobacillus (L). plantarum , L. brevis , L. pentosus , L. casei , L. paracasei und Leuconostoc mesenteroides identifiziert wurden. In dem Gemüse wurde aus den meisten Proben überwiegend L. plantarum isoliert. Von den 114 LAB haben 7 isolierte Bakterien probiotisches Potenzial. Sechs von sieben wurden als L. Plantarum identifiziert, eine Spezies konnte nicht durch biochemische Untersuchungen detektiert werden. PCR-Analyse und Sequenzierung der 16S-rDNA-Region unter Verwendung von 27f- und 1522r-Primern zeigten, dass alle probiotischen Stämme L. plantarum zugeordnet werden können. Schlussfolgerung: Die Ergebnisse zeigen, dass in traditionellem persischen Es

Aim: Shigella infection is an important global health problem in developing countries where hygiene is poor and hence shigellosis is a main cause of diarrhoea-associated mortality and morbidity, particularly in children under the age of five. The bacterial entry into colon and rectal epithelial cells has been named 'bacterium-directed phagocytosis'. This term highlights that the bacteria actively stimulate their own uptake into non-professional phagocytes. The aim of this study was to demonstrate the invasion of HEp-2 cells by Shigella spp. isolated from acute pediatric diarrhea in Tehran, Iran.Methods: Three-hundred and ten non-duplicative diarrheal stool samples were collected from the children admitted to Children's Medical Center in Tehran, Iran. Samples were cultured and suspected colonies were identified by routine microbiological and biochemical tests. The invasion of the two isolated Shigella spp. to HEp-2 cells was studied.Results: Of 310 stool samples, 16 (5.2%) Shigella spp. were isolated, including seven (43.7%) S. sonnei and nine (56.3%) S. flexneri . Four (44.4%) S. sonnei and seven (42.8%) S. flexneri showed invasive phenotype to HEp-2.Conclusion: Shigella sonnei and S. flexneri are reported as the most prevalent Shigella spp. in nature which infect humans. Invasion of various cell lines gives the chance of survival to Shigella spp. This ability causes more virulent infections in the host. Despite costly and time consuming cell culture techniques, the current method described in this paper is reliable for detecting invasive behavior of Shigella spp. Results have also shown that not all the Shigella spp. are able to invade intestinal epithelial cells.