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The increase in the populations of root-knot nematode Meloidogyne enterolobii in various vegetables such as tomatoes grown under greenhouse conditions as well as increasing restrictions on the use of certain chemical nematicides have led to the search for new, effective management strategies, preferably ones that are sustainable biological alternatives. In this work, two formulations of the nematophagous fungus Metarhizium carneum, one concentrated suspension and one wettable powder, were evaluated under greenhouse conditions to reduce the M. enterolobii infestation in tomato plants. In addition, the effectiveness of the liquid formulation of M. carneum was compared with two biological and three chemical commercial nematicides. The results show that the two M. carneum formulations reduced the M. enterolobii population density by 78 and 66% in relation to the control treatment. In comparison, the liquid formulation of M. carneum and Purpureocillium lilacinum treatments reduced nematode population density by 72 and 43%, respectively, while for metam sodium preplanting applications followed by M. carneum applications during the tomato growth stage, the reduction was 96%. The alternate use of some chemical compounds plus the application of M. carneum as a biocontrol is a good starting strategy for managing M. enterolobii populations. These results confirm that M. carneum is a serious candidate for the short-term commercialization of an environmentally friendly biological nematicide.

Rice production in Southeast Asia is significantly affected by root-parasitic nematodes (RPN). The Green Revolution has encouraged new agricultural practices (e.g. intensive monoculture, high yielding rice variety) to respond to the high rice demand; however, these methods have promoted the spread of these pests. The recent banning of chemical nematicides resulted in a need for alternative sustainable control strategies. In the present study, we assessed the effects of a direct-seeding mulch-based cropping system (DMC) vs conventional plough-based tillages (CT) on soil properties, rice yield and RPN communities during a two-year trial in Cambodia. Our results show that on average the population densities of RPN were significantly higher in DMC than in CT. Molecular identification revealed only two RPN species associated with roots: Meloidogyne graminicola, not previously reported from Cambodia, was predominant and was present throughout the plant's development, whereas Hirschmanniella mucronata was only found at the tillering and milky stages. We conclude that DMC had a significant positive impact on rice yield, despite higher RPN short-term pressure. In order to increase the efficiency of such cropping systems, further studies and an evaluation of the long-term relationships between DMC, the nature of cover crops used, the soil biota including RPN, and rice yield should be conducted.

Rice production in Southeast Asia is significantly affected by root-parasitic nematodes (RPN). The Green Revolution has encouraged new agricultural practices (e.g. intensive monoculture, high yielding rice variety) to respond to the high rice demand; however, these methods have promoted the spread of these pests. The recent banning of chemical nematicides resulted in a need for alternative sustainable control strategies. In the present study, we assessed the effects of a direct-seeding mulch-based cropping system (DMC) vs conventional plough-based tillages (CT) on soil properties, rice yield and RPN communities during a two-year trial in Cambodia. Our results show that on average the population densities of RPN were significantly higher in DMC than in CT. Molecular identification revealed only two RPN species associated with roots: Meloidogyne graminicola, not previously reported from Cambodia, was predominant and was present throughout the plant's development, whereas Hirschmanniella mucronata was only found at the tillering and milky stages. We conclude that DMC had a significant positive impact on rice yield, despite higher RPN short-term pressure. In order to increase the efficiency of such cropping systems, further studies and an evaluation of the long-term relationships between DMC, the nature of cover crops used, the soil biota including RPN, and rice yield should be conducted.

Les ions orthophosphates (Pi) représentent les seules formes de phosphore (P) utilisable par les cultures. Dans les sols, ils sont généralement présents à de faibles concentrations dans la solution, en raison des nombreux processus géochimiques contraignant leur mobilité et disponibilité. Les plantes et les micro - organismes associés, au travers de relations rhizosphériques, symbiotiques et par la prédation des populations microbiennes, modifient considérablement la quantité de P que la plante est capable d'acquérir tout au long de sa croissance (biodisponibilité). Cette revue décrit les différents processus (modifications des racines, rôle du pH, des anions organiques, des enzymes, de la microfaune et de la macrofaune) qui peuvent modifier la biodisponibilité du P dans la rhizosphère. Des pistes pour mieux valoriser le potentiel intrinsèque des végétaux et de l'écologie des organismes du sol et optimiser l'acquisition de P des cultures à partir du sol sont proposées.

Le nématode du pin Bursaphelenchus xylophilus, originaire des Etats-Unis, est responsable de dépérissements massifs dans les forêts de pin des pays où il a été introduit. Il utilise comme vecteur un insecte du genre Monochamus, notamment M. galloprovincialis en Europe. L'objectif de cette thèse est de fournir des informations concernant les capacités de dispersion de ce coléoptère afin de mieux prédire le risque d'invasion. A l'aide d'expériences en manège de vol, nous avons montré que les adultes émergents, encore immatures, sont déjà en mesure de maintenir des vols soutenus. Ils peuvent parcourir une distance d'environ 500m par jour et les capacités de vol augmentent avec la prise de poids pendant la phase de maturation sexuelle. Il n'existe pas de compromis d'allocation de l'énergie entre fonctions de dispersion et de reproduction pendant cette période et nous proposons de qualifier ces insectes de "income breeder" et "capital disperser". A l'état mature M. galloprovincialis est capable de voler un total de 16km, avec des vols individuels d'environ 1km; ces performances augmentent avec l'âge et le poids des insectes. Le maintien des capacités de vol tout au long de la vie adulte de M. galloprovincialis conduit à proposer que les distances potentiellement parcourues dépendent surtout de la longévité de l'insecte. Dans une expérience d'élevage en conditions contrôlées nous avons montré que la vie adulte dure au moins 4 mois, augmentant quand les fluctuations thermiques sont atténuées. Ces résultats ont des implications pour la gestion de B. xylophilus en Europe puisqu'ils démontrent que la méthode d'éradication par coupe rase sur un rayon de 500m est probablement inopérante.

Le nématode du pin Bursaphelenchus xylophilus, originaire des Etats-Unis, est responsable de dépérissements massifs dans les forêts de pin des pays où il a été introduit. Il utilise comme vecteur un insecte du genre Monochamus, notamment M. galloprovincialis en Europe. L'objectif de cette thèse est de fournir des informations concernant les capacités de dispersion de ce coléoptère afin de mieux prédire le risque d'invasion. A l'aide d'expériences en manège de vol, nous avons montré que les adultes émergents, encore immatures, sont déjà en mesure de maintenir des vols soutenus. Ils peuvent parcourir une distance d'environ 500m par jour et les capacités de vol augmentent avec la prise de poids pendant la phase de maturation sexuelle. Il n'existe pas de compromis d'allocation de l'énergie entre fonctions de dispersion et de reproduction pendant cette période et nous proposons de qualifier ces insectes de "income breeder" et "capital disperser". A l'état mature M. galloprovincialis est capable de voler un total de 16km, avec des vols individuels d'environ 1km; ces performances augmentent avec l'âge et le poids des insectes. Le maintien des capacités de vol tout au long de la vie adulte de M. galloprovincialis conduit à proposer que les distances potentiellement parcourues dépendent surtout de la longévité de l'insecte. Dans une expérience d'élevage en conditions contrôlées nous avons montré que la vie adulte dure au moins 4 mois, augmentant quand les fluctuations thermiques sont atténuées. Ces résultats ont des implications pour la gestion de B. xylophilus en Europe puisqu'ils démontrent que la méthode d'éradication par coupe rase sur un rayon de 500m est probablement inopérante.

Plantains are among the crops that enhance food security in Cameroon. However, plantain yields remain low because of several constraints of parasites such as Radopholus similis, a nematode that can cause losses up to 75% in fields when no protection measures are taken. In most cases, the sensitivity of local plantain varieties to R. similis is unknown; which generally results to low yields despite the control technique used. This limits their up scaling in the country. This work was undertaken to study the sensitivity of two varieties, Essong and Big Ebanga, to R. similis. To this effect, the parasitic activity of R. similis on the varieties Essong and Big Ebanga was assessed in vivo. The variety Grande naine known to be very sensitive to R. similis was used as the control. According to the results obtained, local varieties Essong and Big Ebanga were found to be sensitive to R. similis with the variety Essong being the most sensitive.

Plantains are among the crops that enhance food security in Cameroon. However, plantain yields remain low because of several constraints of parasites such as Radopholus similis, a nematode that can cause losses up to 75% in fields when no protection measures are taken. In most cases, the sensitivity of local plantain varieties to R. similis is unknown; which generally results to low yields despite the control technique used. This limits their up scaling in the country. This work was undertaken to study the sensitivity of two varieties, Essong and Big Ebanga, to R. similis. To this effect, the parasitic activity of R. similis on the varieties Essong and Big Ebanga was assessed in vivo. The variety Grande naine known to be very sensitive to R. similis was used as the control. According to the results obtained, local varieties Essong and Big Ebanga were found to be sensitive to R. similis with the variety Essong being the most sensitive.

Dans un contexte de mutation rapide de l'agriculture, la conception de systèmes de culture répondants aux nouvelles exigences des agriculteurs et de la société est une nécessité. L'agriculture doit répondre au double enjeu : être productive et respecter l'environnement. La conception de systèmes de culture innovants repose à la fois sur i) des recherches cognitives, visant à comprendre les processus impliqués dans l'agroécosystème et ii) leur intégration dans des systèmes complexes et l'évaluation multicritère de ces systèmes. J'ai développé une approche de modélisation permettant d'intégrer les connaissances existantes sur le fonctionnement des agroécosystèmes à base de bananiers, d'identifier les connaissances manquantes, et de fournir des outils de pilotage afin de permettre la définition de systèmes de culture durables. Les outils de modélisation développés simulent le fonctionnement biophysique de l'agroécosystème, incluant certaines spécificités, comme la prise en compte d'un peuplement cultivé hétérogène (caractère semi-pérenne des bananiers) et la dynamique des bioagresseurs (nématodes phytoparasites et charançons). Ces modèles ont été couplés à des outils d'évaluation des risques environnementaux (risque de pollution par les pesticides), permettant in fine, d'évaluer systèmes de culture existants ou innovants sur la base de critères de performances agronomiques, économiques et environnementales. Afin d'assister le prototypage de systèmes de culture innovants, ces outils de modélisation ont été utilisés afin de tester un grand nombre de règles de décisions des agriculteurs et d'optimiser les combinaisons les plus prometteuses. Mon projet de recherche traite de la question du rôle de la diversité biologique dans la productivité et la stabilité des systèmes de culture. Je propose de mobiliser des modèles de réseaux trophiques afin de prendre en compte la complexification biologique des systèmes cultivés. Au niveau méthodologique, lier les modèles de culture ut

Les producteurs de banane antillais sont engagés en partenariat avec l'Institut Technique Tropical et le CIRAD dans une démarche de réduction de l'emploi des intrants chimiques. Les innovations accompagnant cette démarche reposent principalement sur des techniques alternatives à la lutte chimique pour le contrôle des nématodes phyto-parasites et du charançon du bananier. Ces techniques font appel à l'intégration dans le système de culture de plantes de service afin de restaurer des mécanismes de régulation biologique des bio-agresseurs, à un contrôle de l'assainissement des parcelles par des tests biologiques, à l'utilisation de matériel végétal sain (vitroplants) pour la replantation des bananeraies et à la mise en place de pièges attractifs à phéromones pour la capture du charançon du bananier. Ces techniques sont intégrés dans des prototypes de systèmes de culture mis au point et testés en milieu réel dans le cadre d'une démarche de conception et d'évaluation participative impliquant les producteurs, les services techniques et la recherche.

Dans un contexte de mutation rapide de l'agriculture, la conception de systèmes de culture répondants aux nouvelles exigences des agriculteurs et de la société est une nécessité. L'agriculture doit répondre au double enjeu : être productive et respecter l'environnement. La conception de systèmes de culture innovants repose à la fois sur i) des recherches cognitives, visant à comprendre les processus impliqués dans l'agroécosystème et ii) leur intégration dans des systèmes complexes et l'évaluation multicritère de ces systèmes. J'ai développé une approche de modélisation permettant d'intégrer les connaissances existantes sur le fonctionnement des agroécosystèmes à base de bananiers, d'identifier les connaissances manquantes, et de fournir des outils de pilotage afin de permettre la définition de systèmes de culture durables. Les outils de modélisation développés simulent le fonctionnement biophysique de l'agroécosystème, incluant certaines spécificités, comme la prise en compte d'un peuplement cultivé hétérogène (caractère semi-pérenne des bananiers) et la dynamique des bioagresseurs (nématodes phytoparasites et charançons). Ces modèles ont été couplés à des outils d'évaluation des risques environnementaux (risque de pollution par les pesticides), permettant in fine, d'évaluer systèmes de culture existants ou innovants sur la base de critères de performances agronomiques, économiques et environnementales. Afin d'assister le prototypage de systèmes de culture innovants, ces outils de modélisation ont été utilisés afin de tester un grand nombre de règles de décisions des agriculteurs et d'optimiser les combinaisons les plus prometteuses. Mon projet de recherche traite de la question du rôle de la diversité biologique dans la productivité et la stabilité des systèmes de culture. Je propose de mobiliser des modèles de réseaux trophiques afin de prendre en compte la complexification biologique des systèmes cultivés. Au niveau méthodologique, lier les modèles de culture ut

Les producteurs de banane antillais sont engagés en partenariat avec l'Institut Technique Tropical et le CIRAD dans une démarche de réduction de l'emploi des intrants chimiques. Les innovations accompagnant cette démarche reposent principalement sur des techniques alternatives à la lutte chimique pour le contrôle des nématodes phyto-parasites et du charançon du bananier. Ces techniques font appel à l'intégration dans le système de culture de plantes de service afin de restaurer des mécanismes de régulation biologique des bio-agresseurs, à un contrôle de l'assainissement des parcelles par des tests biologiques, à l'utilisation de matériel végétal sain (vitroplants) pour la replantation des bananeraies et à la mise en place de pièges attractifs à phéromones pour la capture du charançon du bananier. Ces techniques sont intégrés dans des prototypes de systèmes de culture mis au point et testés en milieu réel dans le cadre d'une démarche de conception et d'évaluation participative impliquant les producteurs, les services techniques et la recherche.

Les nématodes parasites des plantes sont de minuscules vers qui vivent principalement dans le sol et les racines. Dans les cultures de bananiers, les espèces provoquant le plus de ravages passent la plus grande partie de leur cycle biologique dans les tissus racinaires et dans ceux du rhizome des bananiers. La prolifération de ces nématodes perturbe l'alimentation en eau et en nutriments, retarde la croissance et cause la verse des plants de bananiers parasités. Jusqu'à présent, la plupart des méthodes conventionnelles pour lutter contre les nématodes du bananier reposaient sur l'utilisation de nématicides chimiques. La plupart de ces produits ont progressivement été interdits en Europe. Ce guide passe en revue les principales étapes pour une gestion intégrée et alternative des nématodes parasites des bananiers aux Antilles. Cette démarche intègre i) des mesures d'assainissement du sol vis-à-vis des nématodes foreurs Radopholus similis telles que la mise en jachère améliorée, la création de fossés d'isolation hydrique permettant d'évacuer les eaux contaminées pour protéger les jachères et les parcelles assainies d'un risque de recontamination, ainsi que l'utilisation de culture de plantes non-hôtes incluant des cultures de rente, des graminées fourragères et des légumineuses. ii) un diagnostic de la qualité d'assainissement du sol vis-à-vis des nématodes avant la plantation de nouvelles cultures de bananiers. iii) l'utilisation de matériel de plantation sain, principalement des plants issus de culture in-vitro. iv) l'utilisation de variétés tolérantes aux nématodes et, à moyen terme, celles de variétés résistantes aux nématodes. v) une intégration plus poussée de ces stratégies et la réintroduction d'une plus grande biodiversité pour favoriser un contrôle durable de ces nématodes.

Au cours de mon expérience, je me suis intéressé à différents aspects de l'écologie des bioagresseurs allant de l'étude de leurs traits de vie jusqu'à leurs interactions avec l'agroécosystème. Les organismes que j'ai étudiés sont variés : depuis différentes espèces de mouches des fruits, d'aleurodes, de nématodes phytophages jusqu'au charançon du bananier. Deux axes principaux ont structuré mes recherches : un premier concernant la biodémographie et le comportement des bioagresseurs, et un second sur les interactions entre espèces en étudiant en particulier plusieurs espèces envahissantes. Dans le premier axe, j'ai conduit une série de travaux dans lesquels j'ai étudié les traits de vie de différentes espèces au laboratoire et mis en évidence sur le terrain leurs relations avec certains facteurs environnementaux (température, pluviosité, gamme et type de plantes hôtes, type de sol...). Une partie des travaux de ce premier axe a également porté sur la mise au point de systèmes de piégeage contre certains de ces bioagresseurs, et l'étude des biais en termes de structure en âge des populations capturées par ces systèmes. Enfin, des études sur les comportements liés à dispersion du charançon du bananier ont été menées. Dans le second axe, j'ai étudié le lien entre les traits de vie de ravageurs envahissants (mouches des fruits et biotypes d'aleurode) et leur aptitude à l'invasion dans une communauté résidente. Certains traits de vie comme une durée de vie plus longue, une plus grande taille des adultes et des oeufs, permettent une meilleure aptitude à la compétition interspécifique (par exploitation et interférence). L'étude de la distribution géographique de différentes espèces en compétition (mouches des fruits, aleurodes et nématodes phytophages) en fonction des différents facteurs environnementaux a permis de caractériser leurs niches écologiques. Celles-ci conditionnent les possibilités de coexistence des espèces, notamment pour les espèces de bioagresseurs envahis

Les nématodes parasites des plantes sont de minuscules vers qui vivent principalement dans le sol et les racines. Dans les cultures de bananiers, les espèces provoquant le plus de ravages passent la plus grande partie de leur cycle biologique dans les tissus racinaires et dans ceux du rhizome des bananiers. La prolifération de ces nématodes perturbe l'alimentation en eau et en nutriments, retarde la croissance et cause la verse des plants de bananiers parasités. Jusqu'à présent, la plupart des méthodes conventionnelles pour lutter contre les nématodes du bananier reposaient sur l'utilisation de nématicides chimiques. La plupart de ces produits ont progressivement été interdits en Europe. Ce guide passe en revue les principales étapes pour une gestion intégrée et alternative des nématodes parasites des bananiers aux Antilles. Cette démarche intègre i) des mesures d'assainissement du sol vis-à-vis des nématodes foreurs Radopholus similis telles que la mise en jachère améliorée, la création de fossés d'isolation hydrique permettant d'évacuer les eaux contaminées pour protéger les jachères et les parcelles assainies d'un risque de recontamination, ainsi que l'utilisation de culture de plantes non-hôtes incluant des cultures de rente, des graminées fourragères et des légumineuses. ii) un diagnostic de la qualité d'assainissement du sol vis-à-vis des nématodes avant la plantation de nouvelles cultures de bananiers. iii) l'utilisation de matériel de plantation sain, principalement des plants issus de culture in-vitro. iv) l'utilisation de variétés tolérantes aux nématodes et, à moyen terme, celles de variétés résistantes aux nématodes. v) une intégration plus poussée de ces stratégies et la réintroduction d'une plus grande biodiversité pour favoriser un contrôle durable de ces nématodes.

Au cours de mon expérience, je me suis intéressé à différents aspects de l'écologie des bioagresseurs allant de l'étude de leurs traits de vie jusqu'à leurs interactions avec l'agroécosystème. Les organismes que j'ai étudiés sont variés : depuis différentes espèces de mouches des fruits, d'aleurodes, de nématodes phytophages jusqu'au charançon du bananier. Deux axes principaux ont structuré mes recherches : un premier concernant la biodémographie et le comportement des bioagresseurs, et un second sur les interactions entre espèces en étudiant en particulier plusieurs espèces envahissantes. Dans le premier axe, j'ai conduit une série de travaux dans lesquels j'ai étudié les traits de vie de différentes espèces au laboratoire et mis en évidence sur le terrain leurs relations avec certains facteurs environnementaux (température, pluviosité, gamme et type de plantes hôtes, type de sol...). Une partie des travaux de ce premier axe a également porté sur la mise au point de systèmes de piégeage contre certains de ces bioagresseurs, et l'étude des biais en termes de structure en âge des populations capturées par ces systèmes. Enfin, des études sur les comportements liés à dispersion du charançon du bananier ont été menées. Dans le second axe, j'ai étudié le lien entre les traits de vie de ravageurs envahissants (mouches des fruits et biotypes d'aleurode) et leur aptitude à l'invasion dans une communauté résidente. Certains traits de vie comme une durée de vie plus longue, une plus grande taille des adultes et des oeufs, permettent une meilleure aptitude à la compétition interspécifique (par exploitation et interférence). L'étude de la distribution géographique de différentes espèces en compétition (mouches des fruits, aleurodes et nématodes phytophages) en fonction des différents facteurs environnementaux a permis de caractériser leurs niches écologiques. Celles-ci conditionnent les possibilités de coexistence des espèces, notamment pour les espèces de bioagresseurs envahis

Cette technique d'élevage s'applique aux nématodes migrateurs (par exemple, aux espèces de Pratylenchus et à Radopholus similis) pour une production de masse des nématodes à des fins expérimentales, pour leur conservation, et pour des études de leur multiplication ou de leurs mécanismes de reproduction. Le principe de la méthode appliquée, les principaux avantages, le matériel végétal nécessaire et le temps requis sont présentés. Matériel et méthodes. Le matériel de laboratoire nécessaire, ainsi que le détail des neuf étapes nécessaires à la préparation des disques de carotte, la préparation des nématodes, l'inoculation des nématodes et la récupération des nématodes hors des boîtes de Pétri sont décrits. Les problèmes potentiels sont répertoriés. Résultats. Plusieurs milliers de nématodes peuvent être extraits à partir d'un disque de carotte après 6-8 semaines de culture, selon l'espèce et la population considérées.

Introduction. La technique de centrifugation-flottaison permet de séparer toutes les espèces de nématodes, à tous les stades de développement, des particules de sol restant et des débris de racine pour faciliter leur observation. Le principe de la méthode appliquée, les principaux avantages, le matériel végétal nécessaire et le temps requis sont présentés. Matériel et méthodes. Le matériel de laboratoire nécessaire, ainsi que le détail des 19 étapes utilisées pour extraire les nématodes à partir du tissu végétal avant dénombrement et détermination sont décrits. Les problèmes potentiels sont répertoriés.

CIRAD (Montpellier, France) develops research activities centered on tropical and sub-tropical agricultural systems. Among others crops, cotton is the fucus of a series of research programs in different disciplines from economics to breeding. Major areas in genetics and breeding relate to (1) genetic diversity, (2) cultivar development through classical and molecular breeding, and (3) applied genomics. An important but under-exploited reservoir of genetic diversity exists within the genus Gossypium. With over 3000 accessions CIRAD has one of the few important gene banks worldwide. It includes cultivars, landraces , and wild Gossypiurn species. DNA molecular markeTs have shawn their usefulness and validity for fingerprinting plant resources and for structuring diversity of large collections. In our case, after a preliminary step centered on the screening of microsatellite markers over a limited set of accessions of the gene bank (a genotyping kit has been proposed) , our future plans include the use of high-throughput methods of genotyping (a DArT platform will soon be available in our unit). Opportunities for exploiting this large diversity relate to the development core-collections and of genetic association studies for a given set of traits (fiber quality, stress response) . After a past and fruitful period of collaboration in different tropical countries (varieties co-obtained by ClRAD are cultivated on over 2. 5 million hectares worldwide), CIRAD has more recently engaged research programs in molecular genetics. Focus has initially been on fiber quality as a target trait and on markerassisted interspecific breeding for introgressing fiber quality traits from G. barbadense into G. hirsutUtn. Achievements in this area (genetic maps, fiber quality QTLs) have been published and are posted on the web. The database of CIRAD, TropGene DB (available at http, lltropgenedb. cirad. h l ) is regularly updated and presently displays various genetic maps as well as QTL data.

Breeders develop an increasing number of new crop varieties with potentially interesting characteristics in regards to their resistance or tolerance to pests. Nevertheless, the long-term assessment often requires heavy multi-local in-field measurements. Furthermore, the interactions between two or more pest many limit the relevance of field results on the long-term. Here, we present a methodology that use cropping system model to evaluate both the long-term evolution of the pest dynamics and the overall sustainability of the cropping systems based on include new varieties. We illustrate our method with the case of the new synthetic banana hybrid FB920 (Musa spp., AM group) - plant-parasitic nematodes complex. FB920 was designed to be resistant to the Sigatoka Disease and Black Leaf Streak Disease, caused respectively by Mycosphaerella musicola and Mycosphaerella fijiensis. Herein, we used the SIMBA model (a model to simulate phenology, growth, and plant-parasitic nematode/banana interactions) to examine the population dynamics of plant-parasitic nematodes in cropping systems with this new synthetic hybrid FB920 in various initial conditions. We used short term experiments to calibrate the SIMBA model to account for the growth and the development of the FB920 variety and to simulate the dynamics of the burrowing nematode (Radopholus similis) and the spiral nematode (Helicotylenchus multicinctus). Results from simulations show that in the long term the spiral nematode populations can overtake the burrowing nematode populations and that nematodes populations are smaller than in Cavendish banana fields. (Texte intégral)

CIRAD (Montpellier, France) develops research activities centered on tropical and sub-tropical agricultural systems. Among others crops, cotton is the fucus of a series of research programs in different disciplines from economics to breeding. Major areas in genetics and breeding relate to (1) genetic diversity, (2) cultivar development through classical and molecular breeding, and (3) applied genomics. An important but under-exploited reservoir of genetic diversity exists within the genus Gossypium. With over 3000 accessions CIRAD has one of the few important gene banks worldwide. It includes cultivars, landraces , and wild Gossypiurn species. DNA molecular markeTs have shawn their usefulness and validity for fingerprinting plant resources and for structuring diversity of large collections. In our case, after a preliminary step centered on the screening of microsatellite markers over a limited set of accessions of the gene bank (a genotyping kit has been proposed) , our future plans include the use of high-throughput methods of genotyping (a DArT platform will soon be available in our unit). Opportunities for exploiting this large diversity relate to the development core-collections and of genetic association studies for a given set of traits (fiber quality, stress response) . After a past and fruitful period of collaboration in different tropical countries (varieties co-obtained by ClRAD are cultivated on over 2. 5 million hectares worldwide), CIRAD has more recently engaged research programs in molecular genetics. Focus has initially been on fiber quality as a target trait and on markerassisted interspecific breeding for introgressing fiber quality traits from G. barbadense into G. hirsutUtn. Achievements in this area (genetic maps, fiber quality QTLs) have been published and are posted on the web. The database of CIRAD, TropGene DB (available at http, lltropgenedb. cirad. h l ) is regularly updated and presently displays various genetic maps as well as QTL data.

Breeders develop an increasing number of new crop varieties with potentially interesting characteristics in regards to their resistance or tolerance to pests. Nevertheless, the long-term assessment often requires heavy multi-local in-field measurements. Furthermore, the interactions between two or more pest many limit the relevance of field results on the long-term. Here, we present a methodology that use cropping system model to evaluate both the long-term evolution of the pest dynamics and the overall sustainability of the cropping systems based on include new varieties. We illustrate our method with the case of the new synthetic banana hybrid FB920 (Musa spp., AM group) - plant-parasitic nematodes complex. FB920 was designed to be resistant to the Sigatoka Disease and Black Leaf Streak Disease, caused respectively by Mycosphaerella musicola and Mycosphaerella fijiensis. Herein, we used the SIMBA model (a model to simulate phenology, growth, and plant-parasitic nematode/banana interactions) to examine the population dynamics of plant-parasitic nematodes in cropping systems with this new synthetic hybrid FB920 in various initial conditions. We used short term experiments to calibrate the SIMBA model to account for the growth and the development of the FB920 variety and to simulate the dynamics of the burrowing nematode (Radopholus similis) and the spiral nematode (Helicotylenchus multicinctus). Results from simulations show that in the long term the spiral nematode populations can overtake the burrowing nematode populations and that nematodes populations are smaller than in Cavendish banana fields. (Texte intégral)

Cette technique d'élevage s'applique aux nématodes migrateurs (par exemple, aux espèces de Pratylenchus et à Radopholus similis) pour une production de masse des nématodes à des fins expérimentales, pour leur conservation, et pour des études de leur multiplication ou de leurs mécanismes de reproduction. Le principe de la méthode appliquée, les principaux avantages, le matériel végétal nécessaire et le temps requis sont présentés. Matériel et méthodes. Le matériel de laboratoire nécessaire, ainsi que le détail des neuf étapes nécessaires à la préparation des disques de carotte, la préparation des nématodes, l'inoculation des nématodes et la récupération des nématodes hors des boîtes de Pétri sont décrits. Les problèmes potentiels sont répertoriés. Résultats. Plusieurs milliers de nématodes peuvent être extraits à partir d'un disque de carotte après 6-8 semaines de culture, selon l'espèce et la population considérées.

Introduction. La technique de centrifugation-flottaison permet de séparer toutes les espèces de nématodes, à tous les stades de développement, des particules de sol restant et des débris de racine pour faciliter leur observation. Le principe de la méthode appliquée, les principaux avantages, le matériel végétal nécessaire et le temps requis sont présentés. Matériel et méthodes. Le matériel de laboratoire nécessaire, ainsi que le détail des 19 étapes utilisées pour extraire les nématodes à partir du tissu végétal avant dénombrement et détermination sont décrits. Les problèmes potentiels sont répertoriés.

Le nématode réniforme Rotylenchulus reniformis Linford et Oliveira est en passe de devenir le nématode le plus redoutable de la culture cotonnière en Amérique du Nord et du Sud. Dans le but d'introgresser chez la principale espèce de cotonnier cultivé Gossypium hirsutum L. la résistance à ce parasite à partir de l'espèce diploïde sauvage G. longicalyx, l'hybride trispécifique G. hirsutum x G. thurberi x G. longicalyx a été créé selon la méthode pseudophylétique d'introgression. La triple hybridité du matériel produit a été mise en évidence au moyen de marqueurs microsatellites et confirmée par le comptage des chromosomes. Trois plantes hybrides évaluées en conditions d'inoculation contrôlée ont révélé un niveau de résistance à R. reniformis élevé et équivalent à celui de l'espèce diploïde donneuse.

Le nématode réniforme Rotylenchulus reniformis Linford et Oliveira est en passe de devenir le nématode le plus redoutable de la culture cotonnière en Amérique du Nord et du Sud. Dans le but d'introgresser chez la principale espèce de cotonnier cultivé Gossypium hirsutum L. la résistance à ce parasite à partir de l'espèce diploïde sauvage G. longicalyx, l'hybride trispécifique G. hirsutum x G. thurberi x G. longicalyx a été créé selon la méthode pseudophylétique d'introgression. La triple hybridité du matériel produit a été mise en évidence au moyen de marqueurs microsatellites et confirmée par le comptage des chromosomes. Trois plantes hybrides évaluées en conditions d'inoculation contrôlée ont révélé un niveau de résistance à R. reniformis élevé et équivalent à celui de l'espèce diploïde donneuse.

L'auteur est sélectionneur café en Amérique Centrale dans le cadre de la coopération Cirad / PROMECAFE / IICA. Il a effectué, en mars 2005, une visite au Brésil, et visité successivement le IAPAR (Parana) puis l'IAC (Sao Paolo). La culture du café dans ces deux états du Brésil se fait dans un contexte très différent de l'Amérique Centrale. La mécanisation y est relativement développée. Le gel (Parana) et la sécheresse (Sao Paolo) ont des incidences très fortes sur la productivité. Les attaques parasitaires sont importantes, comme celles du scolyte au Parana et de la mineuse au Sao Paolo. L'amélioration génétique y répond par la recherche et l'utilisation par croisement de sources de résistance dans les espèces non cultivées disponibles dans les collections. La biologie moléculaire café est assez avancée, tant au niveau des états qu'au niveau fédéral : Projet EST, études des gène impliqués dans la maturation (IAPAR/CIRAD), recherche de gènes de résistance aux aléas biotiques et abiotiques. Seul le Parana résiste, par ses lois, au développement des OGM. Si la recherche agronomique est propre à chaque état, elle repose aussi en partie sur l'organisation fédérale Embrapa, et sur le financement par un consortium national café, qui finance des projets de recherche communs. On constate une relative distance entre les améliorateurs ("chercheurs de terrain") et les chercheurs en biologie moléculaire ("chercheurs de labo"), ainsi qu'avec les chercheurs des autres disciplines. La coopération avec le Cirad (nématologiste à I'IAC, améliorateur au IAPAR) pourrait contribuer à les rapprocher.

L'auteur est sélectionneur café en Amérique Centrale dans le cadre de la coopération Cirad / PROMECAFE / IICA. Il a effectué, en mars 2005, une visite au Brésil, et visité successivement le IAPAR (Parana) puis l'IAC (Sao Paolo). La culture du café dans ces deux états du Brésil se fait dans un contexte très différent de l'Amérique Centrale. La mécanisation y est relativement développée. Le gel (Parana) et la sécheresse (Sao Paolo) ont des incidences très fortes sur la productivité. Les attaques parasitaires sont importantes, comme celles du scolyte au Parana et de la mineuse au Sao Paolo. L'amélioration génétique y répond par la recherche et l'utilisation par croisement de sources de résistance dans les espèces non cultivées disponibles dans les collections. La biologie moléculaire café est assez avancée, tant au niveau des états qu'au niveau fédéral : Projet EST, études des gène impliqués dans la maturation (IAPAR/CIRAD), recherche de gènes de résistance aux aléas biotiques et abiotiques. Seul le Parana résiste, par ses lois, au développement des OGM. Si la recherche agronomique est propre à chaque état, elle repose aussi en partie sur l'organisation fédérale Embrapa, et sur le financement par un consortium national café, qui finance des projets de recherche communs. On constate une relative distance entre les améliorateurs ("chercheurs de terrain") et les chercheurs en biologie moléculaire ("chercheurs de labo"), ainsi qu'avec les chercheurs des autres disciplines. La coopération avec le Cirad (nématologiste à I'IAC, améliorateur au IAPAR) pourrait contribuer à les rapprocher.

The interaction between the burrowing nematode Radopholus similis and the endomycorrhizal fungus Glomus sp. on banana was studied in a pot-experiment. Two different populations were used, an aggressive population originating form Ivory Coast (CIV) and a less aggressive population originating from Australia (AUS). No increase in plant growth was observed when mycorrhiza were inoculated. The number of nematodes per gram of roots inoculated with CIV was significantly higher than in roots inoculated with AUS. These results correspond to the aggressivity of the populations. Nematodes did not affect the mycorrhizal colonization. In a short term pot-experiment, the initial penetration of two R. similis populations with a different aggressivity was investigated after 24 hours and 48 hours. Again a population with a high aggressivity (Cameroon, CMR 12) and a less aggressive population were used. Because of a too low number of nematodes that penetrated the roots, no observation could be made. To have a better understanding in how mycorrhiza can have an influence on the penetration of nematodes in the roots of banana, more controlled conditions were developed. For the third experiment, excised roots placed in a Petri dish with sand were studied. This experimental setup made it possible to have a closer view on the initial penetration of the nematodes in the roots. Different treatments were performed and different experimental parameters were checked. This experimental setup seemed to have some shortcomings so it needs further development.

La légumineuse #Arachis pintoi# L. (perennial peanut ou arachide sauvage) est utilisée depuis de nombreuses années comme plante de couverture dans divers pays de la zone intertropicale, notamment en Amérique centrale (Kerridge 1993). Son comportement vis-à-vis des nématodes est encore peu documenté. La possible résistance du cv. Amarillo vis-à-vis de #Meloidogyne# spp. est mentionnée en Australie (Cook etal. 1990). Au Mexique une réduction sensible des attaques de #Meloidogyne# sur tomates a été observée dans un essai de cultures associées (Marban Mendoza et al. 1992). Au Costa Rica, une expérimentation au champ a montré qu'#Arachis pintoi# serait un bon hôte de #Radopholus similis# (Cobb 1893, Thorne 1949) avec une infestation concomitante moyenne d'environ 30 individus par g de racine (Araya 1996). Au Costa Rica encore, des essais conduits en culture de bananiers et de bananiers plantain auraient montré une incidence positive de l'arachide sauvage utilisée comme plante de couverture en réduisant la densité de #Radopholus similis# dans les bananiers adjacents (Vargas 1998). Enfin en 1999, Jonathan et al. ont montré après un essai d'inoculation artificielle que la légumineuse #Arachis pintoi# n'était pas hôte de différentes espèces de #Meloidogyne# Goeldi 1892 (#M. incognita#, #M. arenaria#, #M. javanica#) ni de #Rotylenchulus reniformis# Lindford & Oliveira 1940. Avant d'expérimenter et peut-être de recommander l'emploi d'#Arachis pintoi# comme éventuelle plante de couverture en bananeraie, nous avons voulu vérifier son comportement vis-à-vis des nématodes du bananier à la Martinique. Un essai d'inoculations contrôlées des principales espèces présentes (#Radopholus similis#, #Pratylenchus coffeae#, #Hoplolaimus seinhorsti#, #Meloidogyne incognita#) ainsi que de #Meloidogyne mayaguensis#, une espèce très pathogène à la Martinique bien que non encore observée sur bananier, a donc été conduit en chambre climatique au laboratoire de Nématologie de l'IRD en préalabl

The specific characterization of nematodes, like all other plant pests, is a major stake to develop efficient and durable control strategies. Recent studies showed that P. coffeae, causing important damages on banana and coffee plants in the neotropical region, in fact regrouped a specie complex very difficult to identify by classical taxonomy tools. Studies have been undertaken on some isolates of Pratylenchus spp. taken on these two crops, to precise their pathogenicity and try to define some characterization tools as acurrate as possible. A biochemical approach has been undertaken by the study of esterase diversity with the isoelectric focusing technique. This study has allowed to reveal an important diversity between isolates but still stay insufficient at this steps to clarify their taxonomic status. Studies in planta confirmed an important negative correlation between the nematode population development in roots (agressivity) and the amount damage (roots weight), on banana as well as coffee plant. Chlorophyll rate in banana leaves was also negatively correlated to the nematode number. On the other hand, this parameter was not considered on coffee plant, the plantlets, too young, presenting not sufficient chlorophyllian pigments. Isolates showed a large range of agressivity, and therefore, damage on studied plants. Moreover, the isolates taken on coffee plant were not able to develop on banana plant. In contrast, isolates taken on banana plant were able to develop on coffee plant. This result is not in agreement with the use of banana and coffee plant as intercrop on some countries. Isolates take on plantain were not able to develop neither on banana nor coffee plant. All results confirmed the important diversity between all Pratylenchus isolates. These data also showed the complexity of traditional populations regrouped under the name P. coffeae. They supported the necessity to find acurrate tools to clarify this specific complex and to adapt pest control. Amo

The interaction between the burrowing nematode Radopholus similis and the endomycorrhizal fungus Glomus sp. on banana was studied in a pot-experiment. Two different populations were used, an aggressive population originating form Ivory Coast (CIV) and a less aggressive population originating from Australia (AUS). No increase in plant growth was observed when mycorrhiza were inoculated. The number of nematodes per gram of roots inoculated with CIV was significantly higher than in roots inoculated with AUS. These results correspond to the aggressivity of the populations. Nematodes did not affect the mycorrhizal colonization. In a short term pot-experiment, the initial penetration of two R. similis populations with a different aggressivity was investigated after 24 hours and 48 hours. Again a population with a high aggressivity (Cameroon, CMR 12) and a less aggressive population were used. Because of a too low number of nematodes that penetrated the roots, no observation could be made. To have a better understanding in how mycorrhiza can have an influence on the penetration of nematodes in the roots of banana, more controlled conditions were developed. For the third experiment, excised roots placed in a Petri dish with sand were studied. This experimental setup made it possible to have a closer view on the initial penetration of the nematodes in the roots. Different treatments were performed and different experimental parameters were checked. This experimental setup seemed to have some shortcomings so it needs further development.

La légumineuse #Arachis pintoi# L. (perennial peanut ou arachide sauvage) est utilisée depuis de nombreuses années comme plante de couverture dans divers pays de la zone intertropicale, notamment en Amérique centrale (Kerridge 1993). Son comportement vis-à-vis des nématodes est encore peu documenté. La possible résistance du cv. Amarillo vis-à-vis de #Meloidogyne# spp. est mentionnée en Australie (Cook etal. 1990). Au Mexique une réduction sensible des attaques de #Meloidogyne# sur tomates a été observée dans un essai de cultures associées (Marban Mendoza et al. 1992). Au Costa Rica, une expérimentation au champ a montré qu'#Arachis pintoi# serait un bon hôte de #Radopholus similis# (Cobb 1893, Thorne 1949) avec une infestation concomitante moyenne d'environ 30 individus par g de racine (Araya 1996). Au Costa Rica encore, des essais conduits en culture de bananiers et de bananiers plantain auraient montré une incidence positive de l'arachide sauvage utilisée comme plante de couverture en réduisant la densité de #Radopholus similis# dans les bananiers adjacents (Vargas 1998). Enfin en 1999, Jonathan et al. ont montré après un essai d'inoculation artificielle que la légumineuse #Arachis pintoi# n'était pas hôte de différentes espèces de #Meloidogyne# Goeldi 1892 (#M. incognita#, #M. arenaria#, #M. javanica#) ni de #Rotylenchulus reniformis# Lindford & Oliveira 1940. Avant d'expérimenter et peut-être de recommander l'emploi d'#Arachis pintoi# comme éventuelle plante de couverture en bananeraie, nous avons voulu vérifier son comportement vis-à-vis des nématodes du bananier à la Martinique. Un essai d'inoculations contrôlées des principales espèces présentes (#Radopholus similis#, #Pratylenchus coffeae#, #Hoplolaimus seinhorsti#, #Meloidogyne incognita#) ainsi que de #Meloidogyne mayaguensis#, une espèce très pathogène à la Martinique bien que non encore observée sur bananier, a donc été conduit en chambre climatique au laboratoire de Nématologie de l'IRD en préalabl

The specific characterization of nematodes, like all other plant pests, is a major stake to develop efficient and durable control strategies. Recent studies showed that P. coffeae, causing important damages on banana and coffee plants in the neotropical region, in fact regrouped a specie complex very difficult to identify by classical taxonomy tools. Studies have been undertaken on some isolates of Pratylenchus spp. taken on these two crops, to precise their pathogenicity and try to define some characterization tools as acurrate as possible. A biochemical approach has been undertaken by the study of esterase diversity with the isoelectric focusing technique. This study has allowed to reveal an important diversity between isolates but still stay insufficient at this steps to clarify their taxonomic status. Studies in planta confirmed an important negative correlation between the nematode population development in roots (agressivity) and the amount damage (roots weight), on banana as well as coffee plant. Chlorophyll rate in banana leaves was also negatively correlated to the nematode number. On the other hand, this parameter was not considered on coffee plant, the plantlets, too young, presenting not sufficient chlorophyllian pigments. Isolates showed a large range of agressivity, and therefore, damage on studied plants. Moreover, the isolates taken on coffee plant were not able to develop on banana plant. In contrast, isolates taken on banana plant were able to develop on coffee plant. This result is not in agreement with the use of banana and coffee plant as intercrop on some countries. Isolates take on plantain were not able to develop neither on banana nor coffee plant. All results confirmed the important diversity between all Pratylenchus isolates. These data also showed the complexity of traditional populations regrouped under the name P. coffeae. They supported the necessity to find acurrate tools to clarify this specific complex and to adapt pest control. Amo

Des maladies de toute nature sont transmises ou favorisées par les insectes. Ils sont indispensables dans le cas de maladies à agents pathogènes intraphloémiques : les phytoplasmes, certains virus, les bactéries et les trypanosomides. Les insectes peuvent jouer un rôle dans la vection ou dans le développement d'autres organismes tels que les nématodes, voire les champignons. La mise en évidence puis l'étude de ces divers vecteurs sont d'une grande importance car, dans la majorité des cas, ils entrent dans la politique générale de lutte contre les maladies. La lutte peut se faire de différentes manières grâce à des traitements chimiques bien ciblés et souvent par des moyens strictement biologiques à l'aide de parasitoïdes. Des techniques culturales peuvent permettre de réduire, voire d'éliminer, un vecteur. Le piégeage des insectes vecteurs peut contribuer également pour une large part à la réduction de l'impact d'une maladie

Les champignons pathogènes ont été les premiers organismes reconnus responsables des maladies des plantes. Ils sont nombreux à l'origine des maladies de feuilles, de racines, de fruits ou des maladies systémiques provoquant des dépérissements généralisés. L'identification des champignons a longtemps reposé sur des critères morphologiques, ce qui était insuffisant. Des critères plus fins ainsi que des critères physiologiques ou la compatibilité sexuelle ont permis d'affiner la distinction des espèces fongiques. La variabilité génétique, incluant la variabilité du pouvoir pathogène, au sein d'une même espèce est d'un intérêt de plus en plus grand. Les maladies bactériennes n'ont été découvertes que bien plus tard, de même que les maladies à phytoplasmes, à virus et encore plus récemment à viroïdes. Les nématodes comptent aussi parmi les agents pathogènes des maladies des cultures pérennes tropicales. Enfin, des dépérissements dont on a tout lieu de penser qu'ils sont des maladies en raison de leur symptomatologie et de leur schéma de propagation, restent encore d'étiologie inconnue. Outre cette diversité d'agents pathogènes eux-mêmes, il est intéressant de noter la variabilité au sein de chaque espèce, variabilité biologique, sérologique, moléculaire, se traduisant souvent par des variations de l'agressivité. Les études étiologiques doivent s'accompagner de recherche sur les modes de propagation du parasite, en particulier quand la vection se fait par un insecte, un nématode ou encore un champignon

De nombreux changements ont eu lieu en pathologie de la canne à sucre au cours des dix dernières années. De nouvelles connaissances sont apparues sur des maladies connues, de nouvelles maladies ont été décrites et identifiées et, grâce aux progrès de la biologie moléculaire, de nouvelles techniques de diagnostic ont été mises au point. C'est pourquoi la section pathologie de la Société internationale des technologues de la canne à sucre (ISSCT) a décidé de publier un nouveau livre sur les maladies de la canne à sucre. Son objectif est de fournir une information actualisée relative aux connaissances scientifiques et aux aspects pratiques de la lutte, sans pour autant décrire de façon exhaustive les maladies. Chaque maladie fait l'objet d'un chapitre illustré de nombreuses photographies en couleurs, dans lequel sont rassemblées des données sur son agent causal, sa distribution géographique, ses symptômes, sa transmission, son spectre d'hôtes, son épidémiologie et son importance économique. Des informations concernant les souches de l'agent pathogène, le diagnostic et la lutte ainsi qu'une bibliographie complètent chacun de ces chapitres.

Les champignons pathogènes ont été les premiers organismes reconnus responsables des maladies des plantes. Ils sont nombreux à l'origine des maladies de feuilles, de racines, de fruits ou des maladies systémiques provoquant des dépérissements généralisés. L'identification des champignons a longtemps reposé sur des critères morphologiques, ce qui était insuffisant. Des critères plus fins ainsi que des critères physiologiques ou la compatibilité sexuelle ont permis d'affiner la distinction des espèces fongiques. La variabilité génétique, incluant la variabilité du pouvoir pathogène, au sein d'une même espèce est d'un intérêt de plus en plus grand. Les maladies bactériennes n'ont été découvertes que bien plus tard, de même que les maladies à phytoplasmes, à virus et encore plus récemment à viroïdes. Les nématodes comptent aussi parmi les agents pathogènes des maladies des cultures pérennes tropicales. Enfin, des dépérissements dont on a tout lieu de penser qu'ils sont des maladies en raison de leur symptomatologie et de leur schéma de propagation, restent encore d'étiologie inconnue. Outre cette diversité d'agents pathogènes eux-mêmes, il est intéressant de noter la variabilité au sein de chaque espèce, variabilité biologique, sérologique, moléculaire, se traduisant souvent par des variations de l'agressivité. Les études étiologiques doivent s'accompagner de recherche sur les modes de propagation du parasite, en particulier quand la vection se fait par un insecte, un nématode ou encore un champignon