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Abstract Planctopirus limnophila belongs to the bacterial phylum Planctomycetes, a relatively understudied lineage with remarkable cell biology features. Here, we report a genome-wide analysis of essential gene content in P. limnophila. We show that certain genes involved in peptidoglycan synthesis or cell division, which are essential in most other studied bacteria, are not essential for growth under laboratory conditions in this species. We identify essential genes likely involved in lipopolysaccharide biosynthesis, consistent with the view of Planctomycetes as diderm bacteria, and highlight other essential genes of unknown functions. Furthermore, we explore potential stages of evolution of the essential gene repertoire in Planctomycetes and the related phyla Verrucomicrobia and Chlamydiae. Our results provide insights into the divergent molecular and cellular biology of Planctomycetes.

Sterols play essential functions in eukaryotic cell membranes, but are produced by few bacterial species. Here, the authors show that they are essential for growth of the planctomycete bacterium Gemmata obscuriglobus.

Knowing the structure of conserved structural RNAs is important to elucidate their function and mechanism of action. However, predicting a conserved RNA structure remains unreliable, even when using a combination of thermodynamic stability and evolutionary covariation information. Here we present a method to predict a conserved RNA structure that combines the following three features. First, it uses significant covariation due to RNA structure and removes spurious covariation due to phylogeny. Second, it uses negative evolutionary information: basepairs that have variation but no significant covariation are prevented from occurring. Lastly, it uses a battery of probabilistic folding algorithms that incorporate all positive covariation into one structure. The method, named CaCoFold (Cascade variation/covariation Constrained Folding algorithm), predicts a nested structure guided by a maximal subset of positive basepairs, and recursively incorporates all remaining positive basepairs into alternative helices. The alternative helices can be compatible with the nested structure such as pseudoknots, or overlapping such as competing structures, base triplets, or other 3D non-antiparallel interactions. We present evidence that CaCoFold predictions are consistent with structures modeled from crystallography.

Bacteria from the Planctomycetes, Verrucomicrobia and Chlamydiae (PVC) superphylum are exceptions to the otherwise dominant mode of division by binary fission, which is based on the interaction between the FtsZ protein and the peptidoglycan (PG) biosynthesis machinery. Some PVC bacteria are deprived of the FtsZ protein and were also thought to lack PG. How these bacteria divide is still one of the major mysteries of microbiology. The presence of PG has recently been revealed in Planctomycetes and Chlamydiae, and proteins related to PG synthesis have been shown to be implicated in the division process in Chlamydiae, providing important insights into PVC mechanisms of division. Here, we review the historical lack of observation of PG in PVC bacteria, its recent detection in two phyla and its involvement in chlamydial cell division. Based on the detection of PG-related proteins in PVC proteomes, we consider the possible evolution of the diverse division mechanisms in these bacteria. We conclude by summarizing what is known and what remains to be understood about the evolutionary cell biology of PVC division modes.

A fundamental task in sequence analysis is to calculate the probability of a multiple alignment given a phylogenetic tree relating the sequences and an evolutionary model describing how sequences change over time. However, the most widely used phylogenetic models only account for residue substitution events. We describe a probabilistic model of a multiple sequence alignment that accounts for insertion and deletion events in addition to substitutions, given a phylogenetic tree, using a rate matrix augmented by the gap character. Starting from a continuous Markov process, we construct a non-reversible generative (birth-death) evolutionary model for insertions and deletions. The model assumes that insertion and deletion events occur one residue at a time. We apply this model to phylogenetic tree inference by extending the program dnaml in phylip. Using standard benchmarking methods on simulated data and a new "concordance test" benchmark on real ribosomal RNA alignments, we show that the extended program dnamlepsilon improves accuracy relative to the usual approach of ignoring gaps, while retaining the computational efficiency of the Felsenstein peeling algorithm.

Sin resumen

PURPOSESurveys to assess patient and family experiences of pediatric cancer care have been primarily developed and validated in high-income Western settings with English-speaking participants. However, 90% of children with cancer live in low- and middle-income countries. We sought to develop a survey focused on pediatric cancer communication for use in a low-literacy population in Guatemala, including adaptation of many previously validated items.METHODSA multidisciplinary team developed a quantitative survey on the basis of a theoretical model of important components and influences on pediatric cancer communication. The original survey included established items previously used in high-income settings and novel questions designed for this study. The survey was translated into Spanish and pilot tested with parents of children receiving treatment at Unidad Nacional de Oncologia Pediatrica in Guatemala City, Guatemala, from April-June 2019. Cognitive interviews were used during pilot testing, and the survey was iteratively revised throughout this process.RESULTSEarly in testing, Guatemalan parents tended to choose answers at the extreme ends of response categories and socially desirable responses. Ultimately, a visual aid was developed to accompany three-item Likert scale response options. This allowed for successful administration of the survey instrument, resulting in moderate variation of response options and similar proportions to those generated when the original five-item responses were used in parent populations from the United States.CONCLUSIONAppropriately adapted surveys are necessary to understand patient-centered communication among pediatric oncology populations in low- and middle-income countries. Eventual validation of such tools will enable cross-cultural studies and comparative analysis of results.

To submerge oneself into the philosophical richness of the literary work of José Martí demands that we find, within his literary-artistic assumptions, a philosophical discourse of humanistic and political-cultural character that results in an understanding of the world which cannot be reduced to its ontological, epistemological or anthropological contents. Such an endeavor, which reveals the dimension and philosophical scope of Martí's literature, must conceive the philosophical knowledge within new perspectives. This is the theme treated in this article. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

La esencia de la gestión universitaria es apuntalar y beneficiar el desarrollo eficaz de los procesos académicos y administrativos, por ello, en esta investigación se indaga la gestión universitaria bajo la premisa de las organizaciones inteligentes. La metodología utilizada fue un diseño bibliográfico de tipo documental, descriptivo. Se concluye que las instituciones educativas universitarias deben aprovechar el conocimiento, las potencialidades, las herramientas tecnológicas y su talento humano para el desarrollo organizacional. Es por eso que todos los individuos adscritos a la organización son importantes y deben aportar su visión. Este enfoque enfatiza el aprender a aprender, fomenta el cambio permanente e invita a repensar el avance organizacional en el marco de la sociedad del conocimiento.

El presente artículo científico, es resultado de una investigación cualitativa, sobre la enseñanza del inglés en primaria de la institución San Isidro de Ibagué-Colombia. El bilingüismo es una política de Estado que se visibilizó y comprometió a la comunidad académica. Esta decisión respondió a exigencias de la sociedad contemporánea desde la globalización, apertura de economía sin fronteras, comunicación intercultural, avances científico-tecnológicos y, particularmente, la imposición del desarrollo comunicativo en lenguas extranjeras. A pesar de que el Ministerio de Educación Nacional-MEN ha pretendido dar respuesta a la iniciativa del idioma extranjero-inglés desde la estrategia del Bilingüismo, los estándares básicos de inglés y la adopción del Marco Común Europeo de Referencia para las Lenguas-MCERL, han sido insuficientes el despliegue y las orientaciones pedagógicas y metodológico-didácticas para la enseñanza-aprendizaje en instituciones de educación superior, secundaria y con mayor desnivel en primaria; pues los resultados se encuentran lejos de metas propuestas. La Institución San Isidro de Ibagué está inmersa en esta problemática de bajos niveles de inglés de estudiantes de primaria, además de sus docentes. Para solucionar el problema y transformar el objeto de estudio se planteó como objetivo, proponer una estrategia didáctica que contribuya a mejorar la enseñanza-aprendizaje del inglés en estudiantes de grado 5º. Se establecieron soluciones luego del reconocimiento de las necesidades educativas de la población mediante diseño y aplicación de una estrategia didáctica desarrolladora basada en talleres lúdicos. Después de su aplicación para la potenciación de la competencia comunicativa (procesos interlingual e intercultural) demostró su efectividad a partir de sus contenidos, lo que permite ser fundamento teórico y metodológico para la preparación en lengua inglesa desde una perspectiva desarrolladora centrada en la actividad lúdica, a partir de los estándares básicos y lineamientos del MCER.

PURPOSEAlthough > 90% of children with cancer live in low- and middle-income countries, little is known about communication priorities and experiences of families in these settings. We examined communication priorities and the quality of information exchange for Guatemalan caregivers of children with cancer during diagnostic communication.METHODSA cross-sectional survey including items used in pediatric communication studies from high-income countries and novel questions was verbally administered to 100 caregivers of children with cancer in Guatemala.RESULTSGuatemalan caregivers prioritized communication functions of exchanging information (99%), fostering healing relationships (98%), decision making (97%), enabling self-management (96%), and managing uncertainty (94%) over responding to emotions (66%) and cultural awareness (48%). Almost all caregivers wanted as many details as possible about their child's diagnosis and treatment (96%), likelihood of cure (99%), and late effects (97%). Only 67% were always given the information they needed without asking for it, and most caregivers sometimes (56%) or always (18%) had questions they wanted to discuss but did not. Approximately half of the caregivers (54%) correctly identified their child's diagnosis, primary site, disease extent (localized v metastatic), proposed treatment length, and treatment intent (curative v palliative). Caregivers of children with leukemia were more likely to correctly identify all attributes than those whose children had solid tumors (P < .001).CONCLUSIONCaregivers in Guatemala prioritize many of the same aspects of diagnostic communication as parents in the United States, and experience similar challenges. Shared communication values offer potential for adaptation of communication interventions across settings with varying resources and diverse cultures.

El presente trabajo está dirigido a contrarrestar las causas que han provocado las insuficiencias que presentan los docentes en formación del municipio Banes - Cuba; en el desarrollo de las cualidades laborales con énfasis en ser responsable y autoridad profesional. Para ello se ha trazado como objetivo la elaboración de actividades para favorecer el desarrollo de las referidas cualidades. El proceso investigativo, ha tenido como soporte la aplicación de métodos teóricos como el análisis y síntesis, inductivo-deductivo, histórico-lógico, y sistémico estructural funcional, así como otros de carácter empíricos; entre ellos, el análisis documental, entrevistas y encuestas a docentes en formación, tutores y miembros de familias, organizaciones, organismos, instituciones y entidades comunitarias. El resultado del pre-experimento aplicado demostró la validez de las actividades, con transformaciones sustanciales en las dimensiones cognitivas, conductuales y contextuales, que expresan el modo de actuación de los docentes en formación del territorio en relación con estas cualidades. Así mismo ha constituido una herramienta para el desarrollo y crecimiento profesional de los docentes de la Educación Superior Pedagógica, en problemas profesionales como diagnóstico, proyección, dinámica y evaluación en el proceso de Gestión y Desarrollo de la Formación Laboral. PALABRAS CLAVE: formación laboral; personalidad; cualidades; cualidades laborales. ACTIVITIES FOR LABOR TRAINING IN HIGHER PEDAGOGICAL EDUCATION ABSTRACT The present work deals with the process and development of the job training of the personality and in particular of the pedagogical job training from a psychological perspective, taking into account the sustenance and link of this science with the others that serves as theoretical support for this subject, presents a synthetic analysis of it based on the vision and analysis of different students of psychology and its link to the training of professionals. It also establishes some relationships of this science, Sociology and Pedagogy as a point of convergence to support the training of education professionals based on the potential of the process for the management and development of job qualities, also provide an example some moments of the process where such correspondence of its components is evidenced. KEYWORDS: Alternative, job training, personality, qualities, job qualities.

Introducción: El objetivo de este estudio fue caracterizar los estilos de vida saludables de niños y niñas en etapa inicial atendidos en la Fundación Guardería Infantil La Alquitrana del Ministerio del Poder Popular de Petróleo, Distrito Capital, Venezuela y establecer relaciones entre los factores que influyen en los estilos de vida del grupo. Métodos: Es una investigación de campo, descriptiva, prospectiva, transversal y analítica, realizada durante el periodo febrero-marzo 2018. Se diseñó un instrumento para recolectar la información a través de preguntas abiertas y cerradas. Se tomaron las mediciones antropométricas. Resultados: Según valores del IMC, se tiene que 91,03% de los niños está en el rango de Normalidad; mientras que 8,97% tiene Riesgo de sobrepeso y Obesidad. La evaluación semicuantitativa del consumo de alimentos, revela que 67,26%, tiene una dieta Adecuada, 21,98% tienen una dieta inadecuada por exceso y sólo 10,76% una dieta inadecuada por déficit. La frecuencia de consumo revelo mayor consumo de carnes, huevos, frutas, evidenciándose una dieta variada, pero baja en consumo de pescado y lácteos. 67,26% no realiza ninguna actividad física. Se obtuvieron altas correlaciones: entre Peso-Talla, Peso-Kcal/día y Talla-Kcal/día (r>0,82); diferencias significativas, por sexo, entre Peso (t =1,85 > 1,65 = t1;0,05) y Talla (t = 1,69 < t1;0,05). Además, hay asociación entre Estrato social-Ingreso, Estrato social-Actividad Física, Estrato social-Lactancia materna y Estado Nutricional con Lactancia materna, Actividad Física y Momento de comida (p < 0,001). Conclusiones: El estilo de vida de estos niños esta caracterizado por: Estrato social, ingreso, lactancia materna, actividad física y estado Nutricional.

La presente disertación propone como línea base la validación de la sistematización de experiencias en procesos pedagógicos e interdisciplinarios para la inclusión educativa en Colombia como una nueva forma de investigación, por cuanto han dejado huellas para la resignificación de teorías alrededor de nuevas maneras de pensar y actuar frente a los desafíos que depara el desarrollo de propuestas pedagógico-didácticas en el marco de una política pública educativa inclusiva del Ministerio de Educación Nacional (MEN), mediante decreto 1421 de 2017, que anuló la presencia de centros de educación especial, y responsabilizó a instituciones escolares regulares, que carecen de profesores capacitados, modelo pedagógico y currículo adecuado para atender diferencias individuales de estilos y ritmos de aprendizajes; con esta ausencia de condiciones, las instituciones justifican la no aceptación de estudiantes con necesidades específicas de apoyo educativo diferenciado. En este sentido, es preciso indagar la iniciativa de aulas para la inclusión mediante la formación profesoral e innovación didáctica que pretende lograr el aprendizaje de todos, convirtiéndose en posibilidad válida de un proceso de intervención educativa.

Estimados lectores: Hasta el número anterior, nuestra revista publicaba solamente ocho artículos. A partir de este número 3, correspondiente al volumen 35 del año 2014, se comenzará a publicar más de ocho artículos teniendo en cuenta la cantidad y calidad del material recibido, por lo que cada publicación no siempre tendrá la misma extensión. En este número aparecerán quince artículos. Agradeciendo a todos de antemano por su colaboración. Comité Editorial

La formación de maestros de la básica primaria colombiana no cuenta con la asignatura de Literatura infantil en el currículo, por lo que se consideró necesario realizar una investigación pedagógica que tuvo como propósito desarrollar una Estrategia de Superación para la preparación postgraduada de estos docentes en el tratamiento metodológico de un canon de literatura infantil para grado segundo. Este artículo tiene como objetivo exponer sus aspectos más significativos. La estrategia se sustenta en el enfoque cognitivo, comunicativo y sociocultural para la enseñanza de la lengua y la literatura en interrelación con los lineamientos curriculares y estándares de competencia de la legislación educativa colombiana. Considera tres dimensiones: conceptual, procedimental y actitudinal. Su desarrollo siguió los pasos de diagnóstico, planeación, ejecución, control y evaluación; se aplicaron métodos e instrumentos de investigación como: entrevista, encuesta, observación a clases, pretest y postest. La validación se realizó mediante el criterio de especialistas y el pre-experimento que permitió constatar el crecimiento cuantitativo y cualitativo de las dimensiones e indicadores que se determinaron en la estrategia. ABSTRACT: The studies of the elementary school teachers in Colombia haven’t got children literature course in the curriculum. For that reason was considered to realized a pedagogical research that had as purpose develop a Strategy of Superation for the post graduated preparation of these teachers on the methodology treatment from a canon on children literature for second degree. This article has as objective to expander the most important aspects. The strategy is emphasized from a cognitive, communicative and sociocultural Cuban approach for the language and literature teaching in interaction with curriculum guidelines and standards of competence of the Colombian educational legislation. In teacher training three dimensions are considered: conception, processing and attitude. It had the following steps: diagnosis, planning, implementation, monitoring and evaluation. Research instruments: interview, poll, class observation, pretest and posttest. The validation of the strategy was monitored through the criteria of specialists on literature and the pre-experiment which revealed the quantitative and qualitative growth of the dimensions and indicators that were identified in the strategy.