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We used a compiled data set from a monitoring network of oyster production coordinated by IFREMER (the French Research Institute for the Exploitation of the Sea). This network monitors the growth and mortality of the Pacific oyster Crassostrea gigas along French coasts since 1993. The archive, although publicly available, has been challenging to use due to changes in protocols and little information on metadata. Here, we describe data collection for almost 30 years, cleaning and processing. For 13 locations, we modeled growth and mortality of spat (less than one-year-old individuals) and half-grown oysters (between one and two-year-old individuals) as a function of time to cope with changes in data acquisition frequency, and produced standardized annual growth and cumulative mortality indicators to improve data usability. This improved database is expected to be used by ecologists interested in the evolution of life-cycle indicators of a marine species under the influence of climate change. It can also be valuable for epidemiologists because mortality data traces the emergence and spread of a massive epizootic.

In recent decades, marine reserves have been established to provide refuges for many exploited and non-exploited species to find habitats unaffected by fishing. They may also contribute to certain forms of fishing that benefit from the emigration of individuals to surrounding unprotected areas. The objective of this study is to estimate the effects of a no-fishing zone in front of the Flamanville nuclear power plant to protect a shellfish community. It is based on a particularly rich series of data that takes into account the spatio-temporal variability of natural origin, over 33 years and 16 sampling points. Eighteen years after the creation of the reserve, lobsters have colonised the entire ecological niche previously occupied by the crustacean community. The results suggest that the creation of the reserve has contributed significantly to the resilience of the lobster population through increases in abundance, size and proportion of ovigerous females. Increased abundance in the protected area has encouraged emigration of young individuals out of the reserve, and has probably supported the local fishery and increased its productivity over time. The results also suggest that other species have not benefited from the creation of the box, or in the case of edible crab, have suffered greatly from the increase in the lobster population. It is likely that the strong territoriality of this species has caused the competitive exclusion of edible crab and velvet crab, which have declined in abundance and size., Au cours des dernières décennies, des réserves marines ont été créées afin de fournir des refuges à de nombreuses espèces exploitées ou non qui peuvent y trouver des habitats non impactés par la pêche. Elles peuvent également contribuer à certaines formes de pêcheries qui bénéficient de l’émigration des individus vers les zones environnantes non protégées. Cette étude a pour objectif d'estimer les effets d’un cantonnement situé devant le CNPE de Flamanville visant à protéger une communauté de crustacés. Elle s’appuie sur une série de données particulièrement riche qui permet de prendre en compte la variabilité spatio-temporelle d’origine naturelle, sur 33 années et 16 points d’échantillonnage. Dix-huit années après la mise en place du cantonnement, le homard a colonisé l’ensemble de la niche écologique auparavant occupée par la communauté des crustacés. Les résultats suggèrent que la création de la réserve a largement contribué à accroître la résilience de la population de homard au travers de l’augmentation de l’abondance, de la taille, et de la proportion de femelles ovigères. L’augmentation de l’abondance dans le périmètre protégé a favorisé l’émigration de jeunes individus vers l’extérieur de la réserve, et a sans doute permis de soutenir la pêcherie locale et d’augmenter sa productivité au fil du temps. Les résultats suggèrent également que les autres espèces n’ont pas profité de la création de ce cantonnement, voire, dans le cas du tourteau, ont fortement pâti de l’augmentation de la population de homard. Il est probable que la forte territorialité de cette espèce ait provoqué l’exclusion compétitive du tourteau et de l’étrille dont l’abondance et la taille ont diminué.

Depuis 2014, des épisodes de mortalité anormale affectent les cheptels mytilicoles tant adultes que juvéniles. Dès l’année 2015, une étude spécifique cofinancée par la DPMA et réalisée par l’Ifremer a été initiée, l’action de recherche MORBLEU (Mortalité des moules Bleues). Les années 2015- 2017 ont permis de dégager des éléments de connaissance et des pistes relatifs aux facteurs biotiques et abiotiques qui semblent intervenir dans le phénomène de hausse de mortalité des moules depuis 2014. Pour l’année 2018, les actions d’observation et de suivis du milieu et des moules ont été fortement réduites et trois axes principaux ont été poursuivis : i) l’étude de la relation entre l’évolution des équilibres microbiens planctoniques et l’apparition de mortalités de moules en lien avec le contexte environnemental du phénomène, ii) étude du lien entre la caractérisation génétique, histologique et cytogénétique de moules et la néoplasie disséminée (recherche du chimérisme génétique dans les populations de moules en France par deux approches de génotypage, suivi individuel de l’évolution du profil cytométrique et relation avec le profil histologique,) iii) : Caractériser le potentiel adaptatif de populations de moules face aux épisodes de mortalité (tests in situ et étude de la sensibilité de familles de moules à une infection bactérienne expérimentale).