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Background: The complexity of the subject content, and its 3D orientation in anatomy makes students difficult to learn, assimilate, and recapitulate the topics. There is a need for innovative teaching methods in anatomy for better understanding of the subject and improved performance of students. In this context, an attempt is made to use concept maps as a tool for learning anatomy. Material and methods: After obtaining ethical committee approval and informed consent, 128 first-term MBBS students were divided into 2 groups, 64 in the study and the control group. After the lecture on each topic from anatomy (radial nerve, median nerve, and ulnar nerve), a pre-test was conducted on 128 MBBS students. Post-test multiple-choice questions-based assessment was conducted for both groups after 1 week of each lecture. Difference in knowledge by comparing the assessment scores of the study group and control group. A feedback form with a 5-point Likert scale was administered to all students at the end of 3 sessions. Mann–Whitney U-test and Wilcoxon signed-rank test were applied to check the significance (p≤.01) of the results. Results: There was a statistically significant difference between the 2 groups during the pre-test for cognition, and total scores and the post-test for recall, cognition, and total scores. 98% of students perceived that the concept map-based approach helped better retain the topic. Conclusions: Concept maps promote comprehensive learning and applying knowledge in new situations. From this study, we recommend that concept mapping can be a pedagogical tool in Anatomy. Resumen: Antecedentes: La complejidad del contenido de la asignatura y su orientación 3D en Anatomía dificulta que los estudiantes aprendan, asimilen y recapitulen los temas. Existe la necesidad de métodos de enseñanza innovadores en Anatomía para una mejor comprensión de la materia y un mejor rendimiento de los estudiantes. En este contexto, se intenta utilizar los mapas conceptuales como herramienta para el aprendizaje de Anatomía. Material y métodos: Después de obtener la aprobación del comité ético y el consentimiento informado, 128 estudiantes de primer semestre de MBBS se dividieron en 2 grupos, 64 en el estudio y el grupo control. Después de la conferencia sobre cada tema de Anatomía (nervio radial, nervio mediano y nervio cubital), se realizó una prueba previa a 128 estudiantes de MBBS. Se realizó una evaluación posterior a la prueba basada en MCQ para ambos grupos después de una semana de cada conferencia. Diferencia en el conocimiento al comparar las puntuaciones de evaluación entre el grupo de estudio y el grupo de control. Se administró a todos los estudiantes un formulario de retroalimentación con una escala Likert de cinco puntos al final de 3 sesiones. Se aplicaron la prueba U de Mann Whitney y la prueba de rangos con signo de Wilcoxon para comprobar la significancia (p ≤ 0,01) de los resultados. Resultados: Hubo una diferencia estadísticamente significativa entre los dos grupos durante la prueba previa de cognición y puntuaciones totales y la prueba posterior de memoria, cognición y puntuaciones totales. El 98% de los estudiantes percibió que el enfoque basado en mapas conceptuales ayudó a retener mejor el tema. Conclusiones: Los mapas conceptuales promueven el aprendizaje integral y la aplicación del conocimiento en situaciones nuevas. A partir de este estudio, recomendamos que los mapas conceptuales pueden ser una herramienta pedagógica en Anatomía.