El incremento de arbovirosis en los últimos años por la co-circulación de los mosquitos Aedes aegypti y A. albopictus ha facilitado la diseminación de nuevos virus en zonas donde los recursos para el diagnóstico son limitados. En México, el Dengue es considerado endémico, el primer brote de Chikungunya fue en el 2015, seguido de un brote de Zika en el 2016, dificultando el diagnóstico por la similitud de los síntomas y la reactividad cruzada entre flavivirus. Actualmente en México, la confirmación del diagnóstico se realiza en los laboratorios de referencia, mediante una RT-qPCR trioplex o una ELISA, por lo que es necesario implementar métodos de detección menos costosos, rápidos y accesibles como lo es la amplificación isotérmica mediada por “asa” (LAMP). LAMP amplifica a una temperatura constante a partir de DNA o RNA, ya que emplea una Bst DNA polimerasa que puede actuar como retrotranscriptasa y posee actividad de desplazamiento de cadena, la especificidad del ensayo es debido al diseño de cuatro primers que flanquean seis regiones diferentes del genoma. El objetivo de este trabajo fue establecer dos sistemas de detección del genoma viral mediante RT-LAMP para Dengue y Chikungunya, la estandarización se llevó a cabo bajo condiciones controladas a 65ºC, el tiempo de la reacción se estableció en 45 min para CHIKV y 1h para DENV, se incluyó al ZIKV como control de especificidad de primers para DENV, los productos amplificados se visualizaron en un gel de agarosa. Los ensayos de RT-LAMP fueron evaluados por duplicado en 95 muestras de plasma obtenidos de pacientes con sospecha de infección por DENV o CHIKV en Veracruz durante septiembre-octubre de 2015. Como estándar de oro se empleó un ensayo de RT-qPCR que incluía los 4 serotipos de DENV, ZIKV, CHIKV, Virus de la fiebre amarilla (YFV) y al Virus del Oeste del Nilo (WNV). También se empleó una RT-PCR de punto final y se realizó la serología para detección de IgM de DENV y CHIKV en las muestras. El resultado por RT-LAMP y RT-qPCR para DENV fueron 2/95 muestras positivas, para CHIKV por RT-qPCR se obtuvieron 41/95 muestras positivas para CHIKV y por RT-LAMP fueron 45/95 muestras positivas, de las cuales 13/95 son falsos positivos y 9/95 son falsos negativos. La sensibilidad y especificidad del ensayo de RT-LAMP para DENV fue del 100%, no se detectó hibridación inespecífica entre DENV y ZIKV. El ensayo de RT-LAMP para CHIKV tuvo una sensibilidad del 78% y una especificidad del 75% comparado con el ensayo de RT-qPCR. La detección de IgM para DENV se encontró en 4/95 muestras y la IgM para CHIKV en 36/95 muestras. El resultado conjunto de las pruebas moleculares y serológicas demuestran que 66/95 pacientes tuvieron infección por CHIKV. No se detectó Zika en ninguna de las muestras. El ensayo de RT-LAMP, demostró su utilidad para detectar el genoma de DENV y CHIKV en muestras de pacientes, permitiendo así implementar otra herramienta para el diagnóstico temprano en los sitios que se presentan los brotes epidémicos.