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ilustraciones, fotografías a color El número reducido de moléculas con actividad antifúngica y la aparición de aislamientos clínicos resistentes como las levaduras del género Candida spp., ha limitado la eficacia terapéutica de antifúngicos en los últimos años. En este trabajo examinamos los efectos de PAM quiméricos que contienen el motivo mínimo de LfcinB y BFII en C. albicans (CAAL), C. glabrata (CAGL) y C. auris (CAAU), con la evaluación de la concentración mínima inhibitoria (CMI) y concentración mínima fungicida (CMF), cinética de crecimiento y la combinación de la quimera QC2 con FLU. Nuestros resultados indicaron que las quimeras QC1 y QC2 exhibieron actividad fungistática y fungicida dependiente de la concentración contra Candida spp resistente, mayor actividad en comparación con el motivo mínimo de LfcinB, el palíndromo de BFII y las otras cinco quimeras estudiadas; y un efecto de aditividad con fluconazol contra CAAL256 (resistente a FLU), C. glabrata 2001 y C. auris 001. Estas quimeras pueden ser consideradas promisorias ya que además de presentar actividad antifúngica contra cepas de referencia y aislados clínicos de Candida spp, también se ha reportado que exhiben actividad antibacteriana, tanto en bacterias Gram positivas como Gram negativas(1). Los resultados sugieren que estas quimeras pueden ser de amplio espectro antimicrobiano. (Texto tomado de la fuente) The reduced number of molecules with antifungal activity and the appearance of resistant clinical isolates, such as yeasts of the genus Candida spp., have limited the therapeutic efficacy of antifungal agents in recent years. In this work, we examined the effects of chimeric PAMs containing the minimal motif of LfcinB and BFII in C. albicans (CAAL), C. glabrata (CAGL), and C. auris (CAAU), with the evaluation of minimum inhibitory concentration (MIC) and minimum fungicidal concentration (MFC), growth kinetics, and combination of QC2 chimera with FLU. Our results indicated that QC1 and QC2 chimeras exhibited concentration-dependent fungistatic and fungicidal activity against resistant Candida spp, higher activity compared to minimal motifs of LfcinB, BFII palindrome and other five chimeras studied, and an additivity effect with fluconazole against CAAL256 (resistant to FLU), C. glabrata 2001 and C. auris 001. In addition to present antifungal activity against reference strains and clinical isolates of Candida spp, they also presented antibacterial activity, both in Gram-positive and Gram-negative bacteria (1). These chimeras show a broad antimicrobial spectrum and can be considered as promising molecules for therapeutic applications. Maestría Magister en Ciencias--Microbiología

Objetivo. Determinar actividades amilolíticas, celulolíticas, lipolíticas, pectinolíticas y proteolíticas en 32 aislamientos de Fusarium spp. de origen humano, animal y vegetal. Materiales y métodos. Las actividades enzimáticas se determinaron a nivel cualitativo, por medio de la medición de halos de hidrólisis en placas de agar con el respectivo sustrato, y a nivel cuantitativo se realizó un cultivo líquido para determinar la degradación del respectivo sustrato por medio de técnicas colorimétricas. Resultados. Todos los aislamientos presentaron actividades enzimáticas a nivel cualitativo, excepto las amilolíticas y lipolíticas. La determinación a nivel cuantitativo fue posible para las enzimas evaluadas, a excepción de las lipasas. Conclusión. La determinación de los perfiles enzimáticos amilolíticos, celulolíticos, pectinolíticos y proteolíticos de cada uno de los aislamientos evaluados pertenecientes al género Fusarium sugirió su capacidad, indistintamente de su procedencia, de degradar estos sustratos. Objective. To determine amylolytic, cellulolytic, lipolytic, pectinolytic and proteolytic activities in 32 Fusarium spp. isolates from humans, animals and plants. Materials and methods. Qualitative determination of enzymatic activities was done by measuring hydrolysis halos in agar plates with their corresponding substrate. Quantitative determination was done by colorimetric techniques, using liquid culture supernatants to determine the respective substrate degradation. Results. All isolates showed enzymatic activities from a qualitative point of view, except amylolytic and lipolytic. Quantitative determination was possible for all the evaluated enzymes except lipases. Conclusion. The determination of amylolytic, cellulolytic, pectinolytic and proteolytic enzymatic profiles of each of the Fusarium isolates assessed suggests their capacity to degrade these substrates, irrespectively of their origin. Objetivo. Determinar as atividades amilolíticas, celulolíticas, lipolítica, pectinolíticas e proteolíticas em 32 isolamentos de Fusarium spp. de origem humana, animal e vegetal. Materiais e métodos. As atividades enzimáticas foram determinadas a nível qualitativo medindo os halos de hidrólise em placas de agar com o substrato respectivo e a nível quantitativo realizou-se uma cultura líquida para determinar a degradação do substrato respectivos por meio de técnicas colorimétricas. Resultados. Todos os isolados apresentaram uma atividade enzimática a nível qualitativo, exceto as amilolíticas e lipolíticas. A determinação a nível quantitativo foi possível para as enzimas testadas, exceto para as lipases. Conclusão. A determinação de perfis enzimáticos amilolíticos, celulolíticos, pectinolíticos e proteolíticos de cada um dos isolados testados pertencentes ao gênero Fusarium, sugeriu sua capacidade, independentemente da sua origem, para degradar estes substratos.

Durante el desarrollo de la enfermedad fúngica invasiva (EFI), los metales participan de manera importante en la interacción entre los hongos y las células del hospedero: el hierro y el cobre actúan como cofactores en múltiples reacciones enzimáticas. Estos metales en la célula fúngica se relacionan de manera importante con la expresión de factores de virulencia gobernados por metaloproteasas [1,2]. Por otro lado, en el hospedero, son esenciales en la respuesta eficiente de mecanismos efectores, por ejemplo, en las células del sistema inmunológico. Por lo tanto, el éxito en el establecimiento de la EFI pude depender de la capacidad para competir y adquirir metales del entorno del hospedero [3,4].La levadura ambiental C. neoformans forma parte del complejo de especies que causa la criptococosis, una micosis oportunista adquirida por la inhalación de propágulos fúngicos presentes en el ambiente. Es una infección potencialmente fatal que afecta los pulmones y el sistema nervioso central [5]. Esta levadura produce infecciones frecuentemente en individuos inmunocomprometidos, por ejemplo, en pacientes con SIDA, con trasplante de órganos o con terapias inmunosupresoras...

Texto ilustraciones, gráficas, tablas Los péptidos antimicrobianos (PAMs) constituyen una alternativa terapéutica para el desarrollo de tratamientos de enfermedades infecciosas, que podrían contrarrestar el ascendente número de microorganismos resistentes a antibióticos que han incrementado el problema de salud pública a nivel mundial. La OMS en el año 2018, reportó la aparición de cepas resistentes y multirresistentes, bacterias como Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii y Staphylococcus aureus, han desarrollado mecanismos de resistencia frente a los antibióticos de primera línea, evidenciando la ineficacia de los fármacos utilizados comúnmente. Como una estrategia para ampliar las alternativas terapéuticas los péptidos derivados de la Lactoferricina Bovina (LfcinB), que contienen el motivo mínimo de actividad antimicrobiana RRWQWR, han sido evaluados contra cepas de referencia Gram positivas y Gram negativas, esta investigación ha permitido enfocar el péptido tetramérico LfcinB (20-25)4 con actividad antibacteriana promisoria. Dando continuidad a esta investigación, en el presente trabajo se evaluó la actividad antibacteriana de LfcinB (20-25)4 contra aislados clínicos de S. aureus y E. coli los cuales presentan diferentes perfiles de resistencia. Se determinó que el péptido tetramérico presenta actividad contra los aislados clínicos evaluados, con Concentraciones Mínimas Inhibitorias (CMI) en el rango de 11 μM a 22 μM para bacterias Gram positivas y 5 μM a 22 μM para Gram negativas; estos resultados muestran que este péptido LfcinB (20-25)4 con actividad antibacteriana, tanto en cepas de referencia como en aislados clínicos, es una alternativa viable para el desarrollo de nuevos agentes terapéuticos. (Texto tomado de la fuente) Antimicrobial peptides (PAMs) are an alternative to the development of new antibacterial therapies, which could counteract the ascending number of antibiotic- resistant microorganisms that have increased the global public health problem. In the latest WHO reports in 2018, it indicates that bacteria such as Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii and Staphylococcus aureus, exhibit resistance against first-line antibiotics and are classified as resistant and multidrug-resistant strains, demonstrating the inefficiency of drugs worldwide. Within this context, peptides derived from Lactoferricin Bovina (LfcinB) containing the minimum motif, have been evaluated against Gram-positive and Gram-negative reference strains. In this work, the tetrameric peptide LfcinB (20- 25)4 was evaluated against clinical isolates of S. aureus and E. coli that have been classified as multidrug-resistant by the Institute of Cancerology of Bogota, with a new identification through MALDI TOF. The activity of this peptide was demonstrated against the clinical isolates evaluated, having a minimal inhibitory concentration (MIC) within the range of 11 – 22μM for Gram-positive bacteria and 5 – 22μM for Gram negatives. In addition, the activity in combination with ciprofloxacin was evaluated for one of the isolates with higher percentages of antibiotic resistance, resulting in an additive effect that maintained the concentration of the peptide. All these results show that the tetrameric peptide LfcinB (20-25)4 with antibacterial activity, is a viable alternative for the development of new therapeutic agents. (Text taken from source) Maestría Magíster en Ciencias - Microbiología Microbiología

Helicobacter pylori es una bacteria que presenta tropismo por las células del epitelio gástrico, se estima que el 60% de la población mundial está infectada por este microorganismo y Colombia presenta una prevalencia entre 70-78%. En el 100% de los infectados produce gastritis crónica y solo el 20% de estos progresará a patologías como úlceras gástricas, linfoma de tejido linfoide asociado a mucosa gástrica (MALT) y adenocarcinoma gástrico. Cerca de un 90% de los casos de cáncer gástrico se han asociado a la infección por H. pylori; motivo por el cual fue clasificado como un carcinógeno tipo 1 y se declaró que la erradicación de esta bacteria es la mejor estrategia en la prevención del cáncer gástrico. Sin embargo, la resistencia a los antibióticos se ha convertido en la principal causa del fracaso en el tratamiento y en el 2017, la Organización mundial de la salud declaró a H. pylori como una bacteria de alta prioridad para el desarrollo de nuevos tratamientos. El objetivo de este estudio fue evaluar la actividad antibacteriana de extractos hidroetanólicos y acuosos, obtenidos de tres especies del género Passiflora (P. edulis var. edulis, P. tarminiana y P. tripartita var. mollissima) frente a H. pylori, adicional a esto se realizó la búsqueda de bacteriófagos con actividad lítica en muestras ambientales (agua residual) y biológicas (heces y biopsias gástricas). Se determinó una concentración mínima inhibitoria (CMI) de 1000 µg/ml para los extractos hidroetanólicos de P. tripartita var mollisima y P. tarminiana. A pesar de que se identificó la presencia de H. pylori en el 32.2% de las muestras de heces (10/31) y el 64.5% de las muestras de biopsia gástrica (60/93), no se logró aislar ningún bacteriófago con actividad lítica frente a esta bacteria. Se identificaron placas de lisis en los cultivos de las cepas control de H. pylori que fueron enfrentados a los filtrados obtenidos a partir de una muestra del río Bogotá y dos del río Arzobispo; sin embargo, no se logró el aislamiento de ningún fago. Los resultados de este estudio aportan al conocimiento de la actividad antimicrobiana de extractos de plantas y búsqueda de bacteriófagos frente a H. pylori. Este estudio abre el camino para futuras investigaciones relacionadas con la evaluación de diferentes extractos de especies del género Passiflora, y evidencia la necesidad de realizar el análisis químico y el fraccionamiento de los extractos activos. Por otro lado, los resultados de este estudio evidencian la dificultad que existe en el aislamiento de bacteriófagos líticos de H. pylori; aunque la fagoterapia es una alternativa terapeútica que ha sido exitosa en diferentes modelos bacterianos, para H. pylori se requiere una evaluación más amplia de las condiciones requeridas para el aislamiento de bacteriófagos. Minciencias Helicobacter pylori is a bacterium with tropism for gastric epithelium cells. It is estimated that this microorganism infects 60% of the world´s population. In Colombia, the prevalence is around 70-78%. The H. pylori infection produces chronic gastritis in 100% of patients, but around 20% of them will progress to pathologies such as gastric ulcers, lymphoid tissue lymphoma associated with gastric mucosa (MALT), and gastric adenocarcinoma. About 90% of gastric cancer cases have been associated with H. pylori infection. For this reason, H. pylori was classified as a type 1 carcinogen. It has been stated that eradicating this bacteria is the best strategy in the prevention of gastric cáncer. However, resistance to antibiotics has become the leading cause of treatment failure. In 2017, the World Health Organization declared H. pylori a high priority bacteria for developing new treatments. This study aimed to evaluate the antimicrobial activity of hydroethanolic and aqueous extracts, obtained from three genus Passiflora species (P. edulis var. edulis, P. tarminiana, and P. tripartita var. mollissima) against H. pylori. Additionally, a search was done for bacteriophages with lytic activity in environmental (wastewater) and biological samples (stool and gastric biopsies). A minimum inhibitory concentration (MIC) of 1000 µg / ml was determined for the hydroethanolic extracts of P. tripartita var mollisima, and P. tarminiana. Although the presence of H. pylori was identified in 32.2% of the stool samples (10/31) and 64.5% of the gastric biopsy samples (60/93), it was not possible to isolate any bacteriophage with lytic activity against this bacteria. Lysis zones were identified in the H. pylori control strains' cultures mixed to the filtrates obtained from one sample from the Bogota river and two from the Arzobispo river; however, the isolation of some bacteriophage was not achieved. This study's results contribute to the knowledge of plant extracts' antimicrobial activity and the search for bacteriophages against H. pylori. This study opens the way for future research to evaluate different extracts of species of the genus Passiflora. It shows the need to do chemical analysis and the fractionation of the active extracts. On the other hand, this study results show the difficulty in the isolation of lytic bacteriophages of H. pylori. Although, phage therapy is a therapeutic alternative that has been successful in different bacterial models, for H. pylori, a broader evaluation of the conditions is required for the isolation of bacteriophages. Magíster en Ciencias Biológicas Maestría https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0001840744

La exposición crónica a grandes cantidades de ácido palmítico (pal) causa daño celular y muerte, un fenómeno que se conoce como lipotoxicidad. La acumulación de pal en el cerebro induce las características distintivas de algunas enfermedades neurodegenerativas (NDs), y causa daño en los diferentes tipos de células cerebrales; particularmente los astrocitos reaccionan volviéndose reactivos e induciendo un bloqueo inicial de la autofagia que, acompañado de otras alteraciones como la inflamación o el estrés de retículo endoplásmico, disminuye la viabilidad de los astrocitos. Al tener diversas funciones en el sistema nervioso como captación de glutamato, soporte metabólico y estructural para el cerebro, liberación de factores neurotróficos y participación en la respuesta inmune en el cerebro, entre otras, es importante la búsqueda de estrategias que permitan proteger a los astrocitos del efecto lipotóxico de pal. Diferentes compuestos esteroidales han sido estudiados como agentes efectivos en el control de enfermedades inflamatorias, sin embargo, su prescripción es limitada debido a efectos adversos como el aumento de la incidencia de cáncer de útero y mama. Algunos esteroides sintetizados en el sistema nervioso llamados “neuroesteroides”, tienen propiedades neuroprotectoras, que son de particular interés en el tratamiento de enfermedades como demencia, isquemia, trauma cráneo encefálico, epilepsia, enfermedad de Alzheimer (EA) y Parkinson (EP). Debido a estos efectos protectores a nivel cerebral, la investigación se ha centrado en fármacos que generen esos efectos protectores de los estrógenos, pero sin aumentar la incidencia de cáncer de útero y mama, entre estos fármacos se han destacado los (SERMs) por su sigla en inglés Selective Estrogen Receptor Modulators y los (STEARs) por su sigla en inglés Specific Tissue Estrogenic Activity Regulators. Entre estos últimos se resalta la tibolona, un fármaco que cuenta con amplios estudios de sus efectos en la salud y siendo promisorio como agente neuroprotector. A pesar de que existen amplias investigaciones en neurodegeneración y al tener en cuenta que son enfermedades que pueden activar diferentes vías de señalización haciendo necesarios estudios menos reduccionistas para entender estas enfermedades. Hasta la fecha no se tienen suficientes aproximaciones que evalúen desde una perspectiva holística los cambios a nivel de productos funcionales de proteoma que tienen lugar durante el daño lipotóxico por pal, que nos permitan identificar biomarcadores y proteínas o rutas metabólicas como posibles blancos de terapias, o que 11 analicen la respuesta a compuestos que potencialmente tienen actividad neuroprotectora con el objetivo de identificar proteínas y sus rutas metabólicas asociadas, relevantes en el proceso de neuroprotección. Asimismo, en la actualidad son escasos los medicamentos o tratamientos efectivos para los procesos neurodegenerativos típicos de estas lesiones, y más allá, es limitado el entendimiento del daño lipotóxico y la respuesta protectora de la tibolona en los diferentes tipos de células del cerebro (neuronas, oligodendrocitos, microglía y astrocitos), haciendo relevante su estudio como posible agente neuroprotector ante un daño lipotóxico inducido por pal. En general, existe la necesidad de mejorar la calidad de vida de dichos pacientes, aliviar los costos asociados tanto a los diferentes proveedores de salud y las familias que asumen gran parte de los cuidados y del soporte económico. Considerando este panorama que impone un claro problema de investigación, en este estudio se realizó un análisis proteómico exhaustivo del daño lipotóxico desencadeno por pal y la evaluación del efecto neuroprotector del esteroide sintético tibolona, en una línea celular de astrocitos humanos. Los resultados indican la expresión diferencial de proteínas no consideradas anteriormente como las principales causas de daño por pal en los astrocitos humanos. También, se identificaron 27 proteínas expresadas diferencialmente con alto grado de conectividad. A partir del desarrollo del presente estudio, se encontró que pal alteró la expresión de proteínas vinculadas a la síntesis y transporte de proteínas, respuesta viral, y la tibolona moduló la expresión de algunas de esas proteínas a niveles similares a los del control, evito disrupciones de la autofagia y redujo la expresión de proteínas vinculadas a señales proapoptóticas, demostrando así que la tibolona podría revertir algunas de las alteraciones a nivel de proteínas generada por pal en los astrocitos humanos. Colciencias Pontificia Universidad Javeriana Chronic exposure to large amounts of palmitic acid (pal) causes cell damage and death, a phenomenon known as lipotoxicity. The accumulation of pal in the brain induces the distinctive characteristics of some neurodegenerative diseases (NDs) and causes damage in the different types of brain cells; particularly astrocytes that become reactive and inducing an initial block of autophagy that, accompanied by other alterations such as inflammation or endoplasmic reticulum stress, decrease the viability of astrocytes. As it has various functions in the nervous system such 12 as glutamate uptake, metabolic and structural support for the brain, the release of neurotrophic factors, and participation in the immune response in the brain, among others, it is important to search for strategies to protect astrocytes of the lipotoxic effect of pal. Different steroidal compounds have been studied as effective agents in the control of inflammatory diseases, however, their prescription is limited due to adverse effects such as the increase in the incidence of uterine and breast cancer. Some steroids synthesized in the nervous system called "neurosteroids" have neuroprotective properties, which are of particular interest in the treatment of diseases such as dementia, ischemia, head trauma, epilepsy, Alzheimer's disease (AD), and Parkinson's disease (PD). Due to these protective effects at the brain level, research has focused on drugs that generate these protective effects of estrogens, but without increasing the incidence of uterine and breast cancer, among these drugs the Selective Estrogen Receptor Modulators (SERMs) and the Specific Tissue Estrogenic Activity Regulators (STEARs) have been highlighted. Among the latter, tibolone stands out, a drug that has extensive studies of its effects on health and is promising as a neuroprotective agent. Even though there is extensive research in neurodegeneration and considering that they are diseases that can activate different signaling pathways, making less reductionist studies necessary to understand these diseases. To date, there are not enough approaches that evaluate from a holistic perspective the changes at the level of functional proteome products that take place during lipotoxic damage by pal, which allow us to identify biomarkers and proteins or metabolic pathways as possible targets for therapies, or that analyze the response to compounds that potentially have a neuroprotective activity to identify proteins and their associated metabolic pathways, relevant in the neuroprotection process. Likewise, effective drugs or treatments for the neurodegenerative processes typical of these lesions are currently scarce, and the understanding of lipotoxic damage and the protective response of tibolone in different types of brain cells (neurons, oligodendrocytes, microglia, and astrocytes), making its study relevant as a possible neuroprotective agent against lipotoxic damage induced by pal. In general, there is a need to improve the quality of life of these patients, alleviate the costs associated with both the different health providers and the families that assume a large part of the 13 care and financial support. Considering this panorama that imposes a clear research problem, in this study an exhaustive proteomic analysis of the lipotoxic damage triggered by pal and the evaluation of the neuroprotective effect of the synthetic steroid tibolone, in a human astrocyte cell line, was carried out. The results indicate the differential expression of proteins not previously considered as the main causes of pal damage in human astrocytes. Also, 27 differentially expressed proteins with a high degree of connectivity were identified. From the development of the present study, it was found that pal altered the expression of proteins linked to protein synthesis and transport, viral response, and tibolone modulated the expression of some of these proteins at levels similar to those of the control, avoiding disruptions of autophagy and reduced the expression of proteins linked to pro-apoptotic signals, thus demonstrating that tibolone could reverse some of the protein-level alterations generated by pal in human astrocytes. Magíster en Ciencias Biológicas Maestría https://orcid.org/0000-0003-1531-3862 https://scholar.google.com/citations?user=cRxUANEAAAAJ&hl=es https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0001656241

84 p, La Criptococosis es una micosis oportunista, adquirida por la inhalación de propágulos fúngicos presentes en el ambiente, siendo una infección potencialmente fatal que afecta los pulmones y el sistema nervioso central, tanto en personas inmunosuprimidas como inmunocompetentes, causada por dos especies patógenas para humanos. El Grupo Colombiano para el estudio de la Criptococosis ha reportado aislamientos de Cryptococcus neoformans y C. gattii tanto a partir de muestras clínicas como ambientales en la ciudad de Cúcuta, considerado un municipio relevante respecto al reporte de casos de ambas especies, en encuestas nacionales. El objetivo de este estudio fue establecer la concordancia entre relación genética y proteómica de aislados clínicos y ambientales de C. neoformans y C. gattii en la ciudad de Cúcuta, se colectaron un total 1300 muestras de 446 árboles de 10 especies diferentes a partir de 10 zonas públicas; adicionalmente, se obtuvieron 6 aislamientos clínicos de C. neoformans durante junio de 2016 a junio de 2017, provenientes de la Empresa Social del Estado Hospital Universitario Erasmo Meoz, los cuales fueron cultivados en agar semillas de Guizottia abysinica para identificación fenotípica por pruebas bioquímicas y se realizó tipificación genética por PCR-huella digital, RFLP-URA5 y caracterización proteómica empleando MALDI TOF MS. Se obtuvieron 19/446 (4,3%) árboles positivos para aislamiento de C. neoformans y 1/446 (0,2%) para C. gatti en la población arbórea evaluada para un total de 21 aislamientos (dos de un mismo individuo), de los cuales 10/21 (47,6%), correspondientes a C. neoformans, provenían del Parque Santander y el único aislado de C. gattii provenía del parque Mercedes Ábrego. Con relación a los aislamientos clínicos 6/6(100%) fueron identificados como C. neoformans var. grubii VNI., Cryptococosis is an opportunistic mycosis, acquired by the inhalation of fungal propagules present in the environment, being a potentially fatal infection that affects the lungs and the central nervous system, is that affects immunocompetent and immunodeficient individuals, caused by two pathogenic species for humans. The Colombian Group for the study of Criptococosis has reported isolates of Cryptococcus neoformans and C.gattii in both clinical and environmental samples in the city of Cúcuta. considered a relevant city regarding the reporting of cases of both species, in national surveys. The objective of this study las to establish the concordance between the genetic and proteomic relationship of clinical and environmental isolates of Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii in the city of Cúcuta. A total of 1300 samples were collected from 446 trees of 10 different species from 10 public areas; additionally, they were obtained 6 clinical isolates of Cryptococcus neoformans. were obtained during June 2016 to June 2017, from Hospital Universitario Erasmo Meoz were cultivated in Guizottia abysinica medium and were then biochemically identified and genetic typing by Fingerprinting PCR, RFLP of the URA5 gene and proteomics by MALDI TOF MS. This yielded 19/446 (4.3%) positive trees for isolation of C. neoformans and 1/446 (0.2%) for C. gatti, the tree population evaluated for a total of 21 isolates (two from the same individual), of which 10/21 (47.6%), corresponding to C. neoformans, came from the Santander Park and the only one isolated from C. gattii came from the Mercedes Ábrego Park. In relation to clinical isolates 6/6 (100%) were identified as C. neoformans var. grubii VNI., Maestría, Magister en Investigación en enfermedades Infecciosas, INTRODUCCIÓN 1 2.MARCO TEÓRICO 4 2.1 CICLO BIOLOGICO Cryptococcus neoformans/C. gattii 4 2.2 FACTORES DE VIRULENCIA Y EVASIÓN DEL SISTEMA INMUNE 5 2.3 TAXONOMIA Cryptococcus neoformans/C. gattii 6 2.4 CRIPTOCOCCOSIS 8 2.5 IDENTIFICACION MOLECULAR 10 2.5.1 PCR para la identificación de hongos patógenos a nivel de especie 11 2.5.2 Identificación genotípica de tipos moleculares de C. neoformans y C. gattii 13 2.5.3 Identificación proteómica de tipos moleculares de C. neoformans y C. gattii 15 3.OBJETIVOS 18 3.1 OBJETIVO GENERAL 18 3.2 OBJETIVOS ESPECÍFICOS 18 4.MATERIALES Y MÉTODOS 19 4.1. POBLACIÓN 19 4.2 PROCESAMIENTO DE MUESTRAS AMBIENTALES 20 4.3 PROCESAMIMENTOS DE AISLADOS CLÍNICOS 23 4.4 EXTRACCIÓN DE ADN 23 4.5 DETERMINACIÓN DE PATRÓN MOLECULAR PCR-HUELLA DIGITAL 24 4.6 DETERMINACIÓN DEL PATRÓN MOLECULAR POR RFLP- GEN URA5 25 4.7 CARACTERIZACIÓN PROTEOMICA POR MALDI TOF 26 4.8 ANÁLISIS MOLECULAR: 28 5. RESULTADOS 30 5.1 CARACTERIZACIÓN DE MUESTRAS AMBIENTALES 30 5.2 CARACTERIZACIÓN DE MUESTRAS CLÍNICAS 33 5.3 RELACIÓN GENÉTICA ENTRE LOS AISLADOS DE c. neoformans 35 6. DISCUSIÓN 37 7. CONCLUSIONES 44 8. RECOMENDACIONES 45 BIBLIOGRAFIA 46 ANEXOS 49, Ej. 1

Fil: Martínez Amador, Luisa Fernanda. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Medicina; Argentina. Fil: Parra Giraldo, Claudia Marcela. Pontificia Universidad Javeriana; Colombia. Fil: Rosso, Fernando. Fundación Valle del Lili; Colombia. Fil: Martínez Amador, Luisa Fernanda. Fundación Valle del Lili; Colombia. Candida parapsilosis complex ocupa el segundo lugar en frecuencia entre las especies de Candida aisladas en la Fundación Valle del Lili (FVL), hospital universitario, afiliado a la Facultad de Ciencias de la Salud de la Universidad Icesi, ubicado en Cali-Colombia. Tratar las infecciones ocasionadas por esta Candida, en algunos casos es complicado por la sensibilidad disminuida a las equinocandinas y por la tasa de resistencia al Fluconazol (FCZ), lo cual incrementa los días de estancia hospitalaria y los costos de atención en salud. Este es un estudio observacional prospectivo, donde se caracterizó microbiológicamente 55 aislamientos de C. parapsilosis complex, obtenidos de 55 pacientes hospitalizados en la FVL; se caracterizó clínicamente la población y se establecieron los desenlaces clínicos teniendo encuenta el perfil de sensibilidad de los aislamientos al FCZ. La identificación de las especies se realizó usando el equipo MALDI® TOF MS Bruker, librería Biotyper 3.1; la concentración mínima inhibitoria (CMI) frente al FCZ se determinó por el método de microdilución en caldo, método de referencia siguiendo la guía M27 A3 de CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute) y se comparó con la metodología automatizada Vitek®2. Se realizó un análisis estadístico univariado utilizando STATA® (Version 15.0, StataCorp LP, College Station, TX). La concordancia entre aislamientos sensibles y resistentes al FCZ por Vitek®2 y microdilución fue 96.23; la especie del complejo aislada con más frecuencia fue C. parapsilosis s.s.; el porcentaje de resistencia al FCZ fue del 36%; los factores de riesgo para resistencia de C. parapsilosis complex al FCZ fueron: terapia con Ciprofloxacina, Vancomicina y uso de antifúngicos previos FCZ, CAS (caspofungina) y AMB (anfotericina); entre los pacientes con C. parapsilosis complex sensible o resistente al FCZ no se encontraron diferencias estadísticamente significativas para la condición de egreso muerte; el promedio de los días de estancia hospitaria fue de57.6 y la mortalidad de 27.3%. En la población estudiada las fungemias por C. parapsilosis complex estuvieron relacionadas en un 50% con las muertes de menores de 18 años que recibieron nutrición parenteral entre noviembre de 2016 y diciembre de 2017 en la FVL.

Candida albicans es una levadura comensal capaz de causar diferentes patologías tanto en individuos sanos como en individuos inmunocomprometidos. Esta levadura posee un genoma diploide y carece de un ciclo sexual completo, lo cual ha dificultado el uso de aproximaciones genéticas convencionales. A pesar de esto, en los últimos años se han desarrollado herramientas y estrategias alternas para avanzar en el conocimiento de sus mecanismos de colonización e infección, así como para establecer su distribución epidemiológica. En este trabajo, se propuso evaluar las relaciones filogenéticas estableciendo la clonalidad de aislamientos de Candida albicans obtenidos a partir de procesos de candidiasis vulvovaginal por la técnica MLST. Se evaluaron 15 aislamientos de C. albicans, obtenidos a partir de frotis vaginales de pacientes de cuatro municipios del departamento de Cundinamarca: Faca, Chía, Madrid y Cáqueza. Luego de identificar su clonalidad por MLST, se establecieron las relaciones filogenéticas por medio de la comparación con tres conjuntos de aislamientos obtenidos de la base de datos MLST C. albicans consenso, los cuales incluyen aislamientos de Colombia y Latinoamérica, así como aislamientos vaginales de todo el mundo, lo cual permitió explorar la técnica MLST y tres herramientas de agrupamiento para el análisis de datos obtenidos por esta técnica: eBURST, goeBURST y UPGMA. Se obtuvieron 15 perfiles alélicos (DST?s) únicos no reportados en la base de datos y se determinó una población no clonal. Al evaluar las relaciones filogenéticas se encontró que existen relaciones cercanas entre ellas y que es posible que se hayan derivado de un ancestro único. Así mismo, algunos de los aislamientos reportados en este estudio se relacionan con aislamientos incluidos dentro del clado I/complejo clonal 1 descrito por Odds y colaboradores en 2007, lo que sugiere propiedades especiales que facilitan los procesos de colonización e infección y el desarrollo de resistencia a la flucitosina. Este trabajo constituye un primer paso en la exploración de la metodología MLST para C. albicans en Colombia, la cual cuenta con un gran potencial que puede ser utilizado en diferentes áreas de la salud contribuyendo a la toma de decisiones en cuanto al control y la prevención de patologías causadas por C. albicans. Magíster en Ciencias Biológicas Maestría