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En la provincia Bolívar se han tenido reportes de afectación del cultivo de fréjol (Phaseolus vulgaris L.) por la denominada mancha angular, ocasionada por Pseudocercospora griseola (Sacc.). En algunas regiones del mundo está enfermedad han llegado a causar hasta un 90% de pérdidas en la producción, convirtiéndose en una problemática de seguridad alimentaria. La situación expuesta motivó el objetivo de la investigación que fue determinar el impacto que causa la mancha angular en el cultivo de fréjol y su efecto sobre el rendimiento. El área experimental fue implementada en la Granja experimenta Naguan-UEB e incluyó a 17 accesiones de fréjol con el fin de evaluar su tolerancia a la enfermedad mediante la determinación de área bajo la curva de la enfermedad (ABCDE); además se evaluó el rendimiento de cada material vegetativo, así como los componentes de éste. Los resultados de esta investigación mostraron que 13 variedades tienen tolerancia hacia la mancha angular de las cuales las variedades Fréjol canario Chillanes, INIAP 428 Canario Guarandeño y Línea FMR2 presentaron una ABCDE menor. Con relación al rendimiento INIAP – 430 Portilla, INIAP – 480 Canario Rocha y Fréjol Canario Chillanes 2 presentaron altos rendimientos. En conclusión variedades como INIAP – 430 Portilla, INIAP 480 Canario, INIAP 428 Canario guarandeño y la línea FMR1 pueden ser incluidas dentro de los sistemas de producción tanto por su tolerancia a mancha angular, como por su rendimiento; mientras que la cualidad de ser más tolerante a la mancha angular del Fréjol canario Chillanes, pese a ser la que reporta el menor rendimiento, podría ser utilizada en futuros programas de fitomejoramiento.

Digital, Colletotrichum acutatum es uno de los agentes causales de la antracnosis que se caracteriza por lesiones en hojas y sobre todo en flores y frutos, de varios cultivos como los cítricos. El patógeno normalmente ataca a las flores, provocando graves lesiones. En condiciones muy favorables, puede afectar los botones florales y los frutos pequeños, provocando una pudrición completa y una caída prematura, lo que resulta en importantes pérdidas económicas en las cosechas. Los objetivos de este trabajo fueron: 1) identificar la diversidad de hongos endófitos en muestras vegetales de lima Tahití; 2) evaluar la capacidad antagonista de estos hongos frente al fitopatógeno Colletotrichum acutatum C-100 en pruebas duales; 3) evaluar la capacidad de diferentes especies de hongos endofíticos para controlar flores con antracnosis inducida y 4) identificar molecularmente las cepas fúngicas con mayor actividad inhibitoria para Colletotrichum acutatum. Se obtuvieron 138 aislados fúngicos a partir de 486 fragmentos de ramas, hojas y frutos; de las cuales se identificaron 15 morfoespecies. Se encontró una mayor frecuencia de morfoespecies en ramas y hojas, con un nivel de diversidad comparable con lo reportado en otras especies de cítricos. De las 15 morfoespecies, 5 se probaron contra Colletotrichum acutatum en pruebas de antagonismo, lo que resultó en un hallazgo de inhibición positiva. Solo 2 hongos endofíticos de las pruebas de antagonismo demostraron una alta inhibición del fitopatógeno, por lo que se utilizaron en pruebas in vivo con flores de lima Tahití, aplicadas en una solución de esporas. Estos hongos fueron identificados molecularmente como Xylaria adscendens y Trichoderma atroviride, los cuales redujeron considerablemente las lesiones provocadas por el fitopatógeno en estas pruebas in vivo. El hallazgo de que los endófitos reaccionaran de manera antagónica contra Colletotrichum acutatum, demuestra su capacidad y utilidad como biocontroladores de antracnosis, convirtiéndolos en especies promisorias para futuras investigaciones en campo y desarrollo biotecnológico, apuntando a una agroindustria que requiere sostenibilidad ambiental., Colletotrichum acutatum is one of the causative agents of anthracnose characterized by lesions on leaves and especially on flowers and fruits, of various crops such as citrus. The pathogen normally attacks flowers, causing serious injury. Under very favorable conditions, it can affect flower buds and small fruits, causing complete rot and premature fall, resulting in significant economic losses in crops. The objectives of this work were: 1) to identify the diversity of endophytic fungi in Tahiti lime plant samples; 2) evaluate the antagonistic capacity of these fungi against the phytopathogen Colletotrichum acutatum C-100 in dual tests; 3) evaluate the capacity of different species of endophytic fungi to control flowers with induced anthracnose and 4) molecularly identify the fungal strains with the highest inhibitory activity for Colletotrichum acutatum. 138 fungal isolates were obtained from 486 fragments of branches, leaves and fruits; of which 15 morphospecies were identified. A higher frequency of morphospecies was found in branches and leaves, with a level of diversity comparable to that reported in other citrus species. Of the 15 morphospecies, 5 were tested against Colletotrichum acutatum in antagonism tests, resulting in a positive inhibition finding. Only 2 endophytic fungi from the antagonism tests demonstrated high inhibition of the phytopathogen, which is why they were used in in vivo tests with Tahiti lime flowers, applied in a spore solution. These fungi were molecularly identified as Xylaria adscendens and Trichoderma atroviride, which considerably reduced the lesions caused by the phytopathogen in these in vivo tests. The finding that endophytes reacted in an antagonistic way against Colletotrichum acutatum, demonstrates their capacity and usefulness as anthracnose biocontrollers, making them promising species for future field research and biotechnological development, pointing to an agribusiness that requires environmental sustainability., Maestría, Magister en Biotecnología, 1 ed., 1. Introducción 14 2.Objetivos 17 2.1.General 17 2.2.Específicos 17 3.Marco Teórico 18 3.1.Generalidades de los Citricultivos 18 3.3.Agricultura sostenible y control biológico en cítricos 25 3.6.Control biológico contra especies de Colletotrichum usando hongos endófitos 36 4.Metodología 41 4.1.Área de estudio y colección de muestras vegetales 41 4.2.Aislamiento de hongos endófitos 42 4.3.Frecuencia de colonización y frecuencia relativa de aislamiento 43 4.5.Análisis de diversidad 44 4.7.Ensayos in vivo en flores de lima Tahití y estimación de severidad 46 4.8.Aislamiento de ADN de hongos e identificación molecular 50 5.Resultados y discusión 52 5.1.Aislamiento de hongos endófitos y frecuencia de colonización 52 5.2.Caracterización morfológica 53 5.3.Análisis de diversidad 58 5.5.Ensayos in vivo: inhibición de antracnosis en flores de lima Tahití 66 5.6.Identificación molecular de hongos endofíticos antagonistas 72 6.Conclusiones 77 Referencias Bibliográficas 79

RESUMEN Los hongos como controladores biológicos son importantes en el desarrollo de bioproductos para una agricultura sostenible en el manejo de fitopatógenos como Sclerotinia sp., causante de la podredumbre blanca en cultivos de lechuga, puesto que la viabilidad infecciosa en el suelo dura hasta cinco años. El cultivo de lechuga es esencial en la economía agrícola de Colombia, y Sclerotinia sp. causa pérdidas hasta del 50% de los cultivos. El objetivo de este trabajo fue evaluar In vitro la capacidad antagónica de tres cepas de Trichoderma sp. Tr1, Tr2 y Tr3 y tres de Aspergillus sp. As1, As2 y As3 contra Sclerotinia sp Scl., individualmente y en consorcios. La recuperación, mantenimiento y evaluación de los hongos se realizó mediante los medios PDA, Jugo V8 y Miel-Avena. Las cepas controladoras -Tr1, Tr2, Tr3, As1, As2 y As3- se enfrentaron entre ellas y en consorcios contra el fitopatógeno con técnica dual. Los consorcios As1+As2+Tr2, As1+As2+Tr1, y As1+As2+Tr3 tuvieron un grado de inhibición sobre el fitopatógeno, siendo más eficiente la combinación As1+As2+Tr1 -85,1%-; e individualmente las cepas Tr2 y As1 con una eficiencia del 95,6% y 95,1%, respectivamente. Se corroboró que el crecimiento de Scl. empleando los consorcios no fue mayor al 14,9% en el mejor tratamiento. En ninguno de los enfrentamientos con los consorcios se evidenció la formación de esclerocios, la estructura de resistencia en el proceso de infección y persistencia en suelos a los diez días de evaluación. ABSTRACT Fungi as biological controllers are important in development of bioproducts for sustainable agriculture in the management of phytopathogens such as Sclerotinia sp., which causes white rot in lettuce, crops insomuch as infectious viability in soil lasts up until five years. Lettuce cultivation is essential in Colombia's agricultural economy, and Sclerotinia sp. causes losses until 50% of crops. The aim of this work was to evaluate in vitro the antagonistic capacity of three strains of Trichoderma sp. Tr1, Tr2 and Tr3 and, three strains of Aspergillus sp. As1, As2 and As3 against Sclerotinia sp Scl., individually and in consortia. Recovering, maintenance and evaluation of fungi was carried out by mediums as PDA, V8 Juice and Honey-Oat. The control strains -Tr1, Tr2, Tr3, As1, As2 and As3- were confronted among them and in consortia against the phytopathogen with dual technique. The consortia As1+As2+Tr2, As1+As2+Tr1, and As1+As2+Tr3 had a degree of inhibition on the phytopathogen, being more efficient the combination As1+As2+Tr1 -85,1%-; and individually the strains Tr2 and As1 with an efficiency of 95,6% and 95,1%, respectively. It was corroborated that the growth of Scl. using the consortia was not more than 14,9% in the best treatment. In none of the confrontations with the consortia was evidence of sclerotia formation, resistance structure for infection process and persistence in soils after to ten days of evaluation. RESUMO Os fungos, como controladores biológicos, são importantes no desenvolvimento de bioprodutos para a agricultura sustentável no manejo de fitopatógenos como Sclerotinia sp., que causa podridão branca nas culturas de alface, visto que a viabilidade infecciosa no solo dura até cinco anos. O cultivo da alface é essencial na economia agrícola da Colômbia e Sclerotinia sp. causa perdas até 50% das lavouras. O objetivo deste trabalho foi avaliar in vitro a capacidade antagônica de três linhagens de Trichoderma sp. Tr1, Tr2 e Tr3 e, três linhagens de Aspergillus sp. As1, As2 e As3 contra Sclerotinia sp Scl., individualmente e em consórcios. A recuperação, manutenção e avaliação de fungos foram realizadas por meios como PDA, Suco V8 e Aveia-Mel. As cepas de controle - Tr1, Tr2, Tr3, As1, As2 e As3 - foram confrontadas entre si e em consórcios contra o fitopatógeno com técnica dupla. Os consórcios As1 + As2 + Tr2, As1 + As2 + Tr1 e As1 + As2 + Tr3 apresentaram um grau de inibição no fitopatógeno, sendo mais eficiente a combinação As1 + As2 + Tr1 -85,1% -; e individualmente as linhagens Tr2 e As1 com uma eficiência de 95,6% e 95,1%, respectivamente. Foi corroborado que o crescimento de Scl. o uso dos consórcios não foi superior a 14,9% no melhor tratamento. Em nenhum dos confrontos com os consórcios houve evidência de formação de escleródios, estrutura de resistência ao processo de infecção e persistência no solo até dez dias de avaliação.

ilustraciones, diagramas, mapas, tablas Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc), es el agente causal de la enfermedad conocida como Marchitamiento por Fusarium en cultivos de musáceas. Es una de las mayores limitantes en la producción mundial de banano y plátano. En Colombia, es escasa la información genética sobre el fitopatógeno y tras la problemática presentada en los años 50 que afecto la variedad de cultivar Gros Michel, este trabajo tuvo como objeto hacer una caracterización morfológica y genética de diversos aislamientos de Fusarium adquiridos a partir de un muestreo de cultivos de banano y plátano en 11 departamentos de Colombia. Para ello, se procesaron 121 muestras sintomáticas de las que se obtuvieron 89 aislamientos que conformaron un banco de cepas, que se caracterizó morfológica y genéticamente, amplificando y secuenciando los genes (Espaciador Transcripto Interno) ITS, (Factor de Elongación 1 α) EF 1α y (Segunda subunidad larga de la RNA polimerasa) RPB2. De estos aislamientos, 88 presentaron estructuras de reproducción y resistencia, típicas del género Fusarium y la identidad genética de las cepas, se corroboro mediante la amplificación de un fragmento específico de la región ITS, con los cebadores ITS FU para el género de interés y simultáneamente, 54 aislamientos se determinaron como Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc). Además, las amplificaciones de los marcadores moleculares confirmaron que los hongos estaban relacionados con el género y el complejo de especie Fusarium oxysporum (FOSC) e incluso se encontraron los complejos de especie Fusarium fujikuroi (FFSC), Fusarium solani (FSSC) y Fusarium incarnatum-equiseti (FIESC). En el estudio solo se alcanzó a diferenciar entre complejos de especies comúnmente hallados en los cultivos de musáceas, debido a que los cebadores no son lo suficientemente informativos para discernir entre las razas referidas para la forma especial cubense, pero si para rastrear la presencia de 6 haplotipos de Foc genéticamentente diferentes distribuidos en Colombia, los cuales deberán ser evaluados mediante infección en plantas para establecer su patogenicidad. (Texto tomado de la fuente) Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc), is the causal agent of the disease known as Fusarium wilt in musaceous crops. It is one of the major limiting factors in the world production of banana and plantain. In Colombia, genetic information on the phytopathogen is scarce and after the problem presented in the 1950s that affected the cultivar Gros Michel, this work was aimed at making a morphological and genetic characterization of various isolates of Fusarium acquired from a sampling of banana and plantain crops in 11 departments of Colombia. For this purpose, 121 symptomatic samples were processed from which 89 isolates were obtained to form a bank of strains, which were morphologically and genetically characterized, amplifying and sequencing the genes (Internal Transcribed Spacer Internal Transcript) ITS, (Elongation Factor 1 α) EF 1α and (Second long subunit of RNA polymerase) RPB2. Of these isolates, 88 showed breeding and resistance structures typical of the genus Fusarium and the genetic identity of the strains was corroborated by amplification of a specific fragment of the ITS region with the ITS FU primers for the genus of interest and simultaneously, 54 isolates were determined as Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc). In addition, amplifications of the molecular markers confirmed that the fungi were related to the genus and the esecie complex Fusarium oxysporum (FOSC) and even the species complexes Fusarium fujikuroi (FFSC), Fusarium solani (FSSC) and Fusarium incarnatum-equiseti (FIESC) were found. The study was only able to differentiate between species complexes commonly found in musacaea cultures, because the primers are not sufficiently informative to discern between the races referred to for the cubense special form, but to trace the presence of 6 genetically different Foc haplotypes distributed in Colombia, which should be evaluated by infection in plants to establish their pathogenicity. Maestría Magister en Ciencias - Biotecnología Patógenos de banano Área Curricular Biotecnología

La uchuva (Physalis peruviana) es una especie frutal que ha cobrado gran importancia en Colombia por su potencial de exportación como fruta fresca. Las divisas generadas representan varios millones de dólares al año, lo que la sitúa en segundo lugar después del plátano. Además, también es considerada una fruta tropical exótica que genera interés en el mercado, esta importancia económica ha permitido una mayor atención al cultivo, sin embargo uno de los problemas más notorios es el relacionado con las enfermedades transmitidas por hongos fitopatógenos, especialmente el Fusarium oxysporum, que no solo afecta muchas investigaciones sino también la economía y producción del país. F. oxysporum es un patógeno difícil de controlar, ya que tiene la capacidad de diseminarse a través de fragmentos de plantas enfermas, material vegetal infectado y movimiento de suelo infestado con clamidosporas, las cuales pueden sobrevivir por más de 10 años, dichas características han permitido que los controles de este hongo sean mínimos y a la vez peligrosos para la salud humana, Por ello, este estudio busca incorporar el uso de moléculas biológicamente activas como las chalconas, aminoácidos como el triptófano, poniendo en práctica el uso de la síntesis química para potenciar la actividad antifúngica de dichas moléculas contra Fusarium oxysporum y al mismo tiempo reducir la incidencia de este fitopatógeno y ser amigable con el medio ambiente CAPÍTULO 1 5 REVISIÓN DE LITERATURA 5 Uchuva (Physalis peruviana L.) 6 Ecofisiología de P. peruviana 7 Temperatura 7 Suministro de agua al suelo 8 Luz 8 Altitud 9 Importancia ecológica de Physalis peruviana L 9 Importancia económica 9 Problemáticas del cultivo 10 Fusarium oxysporum 11 Generalidades 11 Formas especiales 13 Interacción planta-patógeno 14 Control frente a Fusarium oxysporum 16 Control químico 17 CAPITULO 2 20 INTRODUCCIÓN 20 OBJETIVOS 24 Objetivo general 24 Objetivos específicos 24 MATERIALES Y MÉTODOS 24 FASE LABORATORIO: 24 FASE INVERNADERO: 29 RESULTADOS Y DISCUSIÓN 33 CONCLUSIONES 52 OBSERVACIONES 53 BIBLIOGRAFIA 54 The cape gooseberry (Physalis peruviana) is a fruit species that has become very important in Colombia because of its potential for export as fresh fruit. The foreign exchange generated represents several million dollars a year, placing it in second place after bananas. In addition, it is also considered an exotic tropical fruit which generates interest in the market, this economic importance has allowed a greater focus on the crop, however one of the most notorious problems is related to diseases transmitted by phytopathogenic fungi, especially Fusarium oxysporum, which not only affects many investigations but also the economy and production of the country. F. oxysporum is a difficult pathogen to control, because it has the ability to spread through fragments of diseased plants, infected plant material and movement of soil infested with chlamydospores, which can survive for more than 10 years, such characteristics have allowed that the controls of this fungus are minimal and at the same time dangerous to human health, For this reason, this study seeks to incorporate the use of biologically active molecules such as chalcones, amino acids such as tryptophan, putting into practice the use of chemical synthesis to enhance the antifungal activity of such molecules against Fusarium oxysporum and at the same time reduce the incidence of this phytopathogen and be environmentally friendly Pregrado

Los frutos cítricos desempeñan un papel importante en la alimentación de millones de personas a nivel mundial, ya que son cultivos permanentes y poseen alta adaptabilidad a diversas condiciones climáticas. Existen numerosas enfermedades que afectan a los cítricos, de origen viral, fúngica, bacteriana o parasitaria. Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas) es una bacteria Gram negativa que tiene la capacidad de alojarse en los tubos del tamiz del floema, lo que le permite moverse por toda la planta, para ubicarse en órganos con alta demanda de nutrientes. CLas es trasmitida por el insecto vector Diaphorina citri por medio del cual logra afectar a diferentes cultivos pertenecientes a la familia Rutaceae y causar la enfermedad conocida como Huanglongbing (HLB) o “enfermedad del dragón amarillo”. CLas altera funciones metabólicas de los carbohidratos celulares en plantas de cítricos; lo que produce la acumulación de almidón, sacarosa y glucosa, afectando el flujo de nutrientes en toda la planta y disminuyendo su capacidad fotosintética. El problema fitosanitario central radica en la dificultad de cultivar a CLas, por ser una bacteria fastidiosa, generando una demanda especial atención de estudio y búsqueda de métodos de diagnóstico y control de la enfermedad HLB. Por este motivo, el objetivo de este trabajo fue conocer la biología de Candidatus Liberibacter asiaticus. Para ello se realizó una revisión sobre sobre CLas y la enfermedad en Colombia. Además, se realizó un análisis bioinformático de los genes 23S y 16S. A partir de este se determinó que según 23S existen similitudes entre Oricola thermophila y según 16S Devosia spp., que se observó en agrupamientos basados en diferentes métodos, donde se mantuvo siempre la estructura topológica de este clado. La información recopilada y las secuencias analizadas reafirman la necesidad de conocer mejor el estado etiológico del HLB, en particular la caracterización genética, que permita manejar y controlar esta enfermedad que ha afectado tanto la citricultura del mundo entero. Citrus fruits play an important role in the diets of millions of people worldwide, as they are permanent crops and are highly adaptable to various climatic conditions. There are numerous 2 diseases affecting citrus fruits, of viral, fungal, bacterial or parasitic origin. Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas) is a Gram-negative bacterium that has the ability to lodge in the sieve tubes of the phloem, which allows it to move throughout the plant, to locate in organs with high nutrient demand. CLas is transmitted by the insect vector Diaphorina citri through which it affects different crops belonging to the Rutaceae family and causes the disease known as Huanglongbing (HLB) or "yellow dragon disease". CLas alters metabolic functions of cellular carbohydrates in citrus plants, resulting in the accumulation of starch, sucrose and glucose, affecting the flow of nutrients throughout the plant and reducing its photosynthetic capacity. The central phytosanitary problem lies in the difficulty of cultivating CLas, as it is a fastidious bacterium, generating a special demand for study and search for methods of diagnosis and control of the HLB disease. For this reason, the objective of this work was to know the biology of Candidatus Liberibacter asiaticus. For this purpose, a review of CLas and the disease in Colombia was carried out. In addition, a bioinformatic analysis of the 23S and 16S genes was performed. From this, it was determined that according to 23S there are similarities between Oricola thermophila and 16S Devosia spp. according to 16S, which was observed in groupings based on different methods, where the topological structure of this clade was always maintained. The information gathered and the sequences analyzed reaffirm the need to better understand the etiological status of HLB, in particular the genetic characterization, which will allow the management and control of this disease that has affected citriculture worldwide.

Contextualization: Fusarium graminearum is a field microorganism that affects grasses and causes great losses, particularly to rice crops. To counter these phytosanitary problems, excessive amounts of pesticides are applied, causing damage to health and the environment. An alternative is to plant extracts with a high content of bioactive compounds. Knowledge gap: The pyrogallol tannins contained in Caesalpinia spinosa pods have biological properties, Fusarium graminearum's micellial growth inhibition is effective at low concentrations of UFC/ml. Purpose: Therefore, the objective in this research was to determinate in vitro the antifungal activity of tare phenolic compounds (Caesalpinia spinosa) against Fusarium graminearum. Methodology: Firstly, the phenolic compounds extracted by maceration and heating (60 °C) through water and ethanol-water mix, the phenolic compounds content in the extracts determined by Folin-Ciocalteu method. Secondly, a Fusarium strain obtained from a rice culture isolated and identified by taxonomic keys, after cell suspensions made with concentrations 10⁷ and 10⁶ UFC/ml. For in vitro evaluation, a disc with an inoculum of each suspension placed in a culture medium containing C. spinosa extract. Results and conclusions: Consequently, the aqueous extract by heating with a content of 5.88 g gallic acid/100 g dry sample inhibited 30 and 70% of mycelial growth of Fusarium graminearum with a concentration of 10⁷ and 10⁶ UFC/ml. Phenolic compounds of Caesalpinia spinosa have properties of interest for the control of Fusarium graminearum and can be tested in vivo, in the greenhouse. Contextualización: Fusarium graminearum es un microorganismo de campo que afecta a gramíneas y causa grandes pérdidas, particularmente a cultivos de arroz. Para contrarrestar estos problemas fitosanitarios se aplican cantidades excesivas de plaguicidas, lo que causa daños a la salud y el ambiente. Una alternativa son los extractos vegetales con alto contenido de compuestos bioactivos. Vacío de conocimiento: los taninos tipo pirogalol contenidos en las vainas de Caesalpinia spinosa poseen propiedades biológicas, la inhibición del crecimiento micelial de Fusarium graminearum es efectiva en concentraciones bajas de UFC/ml. Propósito del estudio: el objetivo de esta investigación fue determinar in vitro la actividad antifúngica de los compuestos fenólicos de la tara (Caesalpinia spinosa) frente a Fusarium graminearum. Metodología: en primer lugar, se extrajeron los compuestos fenólicos por maceración y calentamiento (60 °C) mediante agua y una mezcla agua-etanol. Se determinó el contenido de compuestos fenólicos en los extractos mediante el método de Folin-Ciocalteu. En segundo lugar, se aisló una cepa de Fusarium obtenida de un cultivo de arroz y se identificó por claves taxonómicas; después, se realizaron suspensiones celulares con concentraciones 10⁷ y 10⁶ UFC/ml. Para la evaluación in vitro, un disco con inóculo de cada suspensión se colocó en medio cultivo agar papa dextrosa que contenía extracto de Caesalpinia spinosa. Resultados y conclusiones: el extracto acuoso por calentamiento con un contenido de 5,88 g ácido gálico/100 g muestra seca inhibió 30 y 70% de crecimiento micelial de Fusarium graminearum a una concentración de 10⁷ y 10⁶ UFC/ml respectivamente. Compuestos fenólicos de Caesalpinia spinosa presentaron propiedades de interés para el control de Fusarium graminearum y pueden ser ensayados in vivo e invernadero.

Introduction. In the last decades, there has been an increased on the interest of Tabasco Chilli pepper cultivation in Colombia; however, production limitation has been observed due to phytosanitary problems. Species of thegenus Fusarium cause root and stem rots with large losses for farmers; whereby, it is important to find alternatives to vascular wilt management caused by Fusarium spp. Objective. The objective of this research was to isolate and characterize endophytic foliar bacteria with in vitro antagonistic potential against Fusarium spp. in Tabasco Chili pepper (Capsicum frutescens) plants. Materials and methods. In the period between February 2014 and February 2016, the in vitro antagonistic capacity of 68 bacterial endophytes of leaf tissue C. frutescens, from two municipalities of Valle del Cauca, Colombia, was evaluated. The isolated bacteria were confronted with six pathogenic isolates of Fusarium spp. by dual growth method. Results. Fifty of the bacterial isolates showed percentages of inhibition against at least one Fusarium isolate, and of these sixteen had percentages of inhibition above 40 %. The morphology, biochemical profile and molecular characterization allowed to determine that the isolates identified as Bacillus subtillis and Pseudomonas aeruginosa showed inhibition averages between 62 and 89%, high averages compared to those previously reported in other studies. In addition, stand out as new findings of bacteria associated with endophytic plant tissue of C. frutescens, in Valle del Cauca, Colombia, the Enterobacter cloacae, Microbacterium arborescens, and Stenotrophomonas maltophilia species. Conclusion. These results constitute a potential source for pathogen management and productivity improvement in tabasco chili pepper in Colombia. Introducción. En las últimas décadas se ha incrementado el interés por el cultivo de ají tabasco en Colombia, sin embargo, se han observado limitantes en la producción, debido a problemas fitosanitarios. Especies del género Fusarium ocasionan pudriciones de raíz y tallo con pérdidas cuantiosas para los agricultores, por lo cual es importante encontrar alternativas de manejo a la marchitez vascular ocasionada por Fusarium spp. Objetivo. El objetivo de este trabajo fue aislar y caracterizar bacterias endófitas, con potencial antagónico in vitro frente a Fusarium spp., en plantas de ají tabasco (Capsicum frutescens var. Tabasco). Materiales y métodos. En el periodo entre febrero de 2014 a febrero de 2016, se evaluó la capacidad antagónica in vitro de 68 aislados bacterianos endófitos de tejido foliar C. frutescens, provenientes de dos municipios del Valle del Cauca, Colombia. Las bacterias aisladas fueron enfrentadas a seis aislamientos patogénicos de Fusarium spp, mediante el método de crecimiento dual. Resultados. Cincuenta de los aislados bacterianos presentaron porcentajes de inhibición frente al menos un aislado de Fusarium y de estos, dieciséis presentaron porcentajes de inhibición por encima del 40 %. La morfología, perfil bioquímico y caracterización molecular, permitieron determinar que los aislados identificados como Bacillus subtillis y Pseudomonas aeruginosa, mostraron promedios de inhibición entre 62 y 89 %, altos con respecto a los reportados anteriormente en otros estudios. Además, se destacan como nuevos hallazgos de bacterias asociadas al tejido vegetal endófito de C. frutescens, en el Valle del Cauca, Colombia, a las especies Enterobacter cloacae, Microbacterium arborescens, y Stenotrophomonas maltophilia. Conclusión. Estos resultados constituyen una fuente potencial para el manejo de patógenos y mejoramiento de la productividad en el ají tabasco en Colombia.

Instituto de Investigaciones Agropecuarias y Forestales. Facultad de Biología. Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia. Facultad de Agrobiología. Facultad de Químico Farmacobiología. Programa Institucional de Maestría en Ciencias Biológicas Colletotrichum lindemuthianum is a hemibiotrophic fungus that secretes a cocktail of hydrolytic enzymes that participate in the degradation process of the plant cell wall (PCV). The hemicellulose of PCV requires for its complete degradation a complex mixture of hemicellulases, such as endoxylanases, β-xylosidases, endoglucanases, endomannanases, mannosidases α-arabinofuranosidases and galactosidases. In this work the bxyloA gene coding for a β-xilosidase of races 0 and 1472 of C. lidemuthianum was isolated, identified and analyzed. The bxyloA sequence consists of a structural region of 1860 bp with three introns and four exons. The transcript of bxyloA with a UTR5'of 199 bp has a reading frame of 1709 bp which codes for 570 residues with a stop codon and a UTR3' of 237 nt. In silico analysis of β-xylosidase (BXYLOA) showed a signal peptide cleavage site between S17I18 that generates a mature protein of 553 aa with five possible N-glycosylation sites at N132, 192, 258, 468,502. The 3D model of BXYLOA revealed the typical characteristics of the β-xilosidases GH43. The comparison with 26 sequences of putative β-xylosidases of genomes of Colletotrichum spp. showed a group with high percentages of similarity and identity (98-84 and 97-76%) and another group with low percentages (69-34 and 65-23%), indicating a high diversity. The residues of the BXYLOA catalytic site were located in D12D125E187, and are conserved in most of the β-xylosidases of Colletotrichum spp. The transcription profile by qPCR of bxyloA showed a significant increase of the transcript of the gene in the pathogenic race 1472 from the first minutes and towards 6 h, after induction with PCV of Phaseolus vulgaris. Colletotrichum lindemuthianum es un hongo hemibiotrófico que secreta un coctel de enzimas hidrolíticas que participan en el proceso de degradación de la pared celular vegetal (PCV). La hemicelulosa de la PCV requiere para su degradación completa de una mezcla compleja de hemicelulasas, tales como endoxilanasas, β-xilosidasas, endoglucanasas, endomannanasas, manosidasas α-arabinofuranosidasas y galactosidasas. En este trabajo se aisló, identificó y analizó el gen bxyloA que codifica para una β-xilosidasa de las razas 0 y 1472 de C. lidemuthianum. La secuencia bxyloA consta de una región estructural de 1860 pb con tres intrones y cuatro exones. El transcrito de bxyloA con un UTR5´de 199 pb presenta un marco de lectura de 1709 pb que codifica para 570 residuos con un codón de detención y un UTR3´ de 237 nt. El análisis in silico de la β-xilosidasa (BXYLOA) mostró un sitio de corte del péptido señal entre S17I18 que genera una proteína madura de 553 aa con cinco posibles sitios de N-glicosilación en N132, 192, 258, 468,502. El modelo 3D de BXYLOA reveló las características típicas de las β-xilosidasas GH43. La comparación con 26 secuencias de β-xilosidasas putativas de genomas de Colletotrichum spp. mostró un grupo con altos porcentajes de similitud e identidad (98-84 y 97-76%) y otro grupo con bajos porcentajes (69-34 y 65-23%), indicando una alta diversidad. Los residuos del sitio catalítico de BXYLOA se localizaron en D12D125E187, y son conservados en la mayoría de las β-xilosidasas de Colletotrichum spp. El perfil de transcripción por qPCR de bxyloA mostró un importante incremento del transcrito del gen en la raza patógena 1472 desde los primeros minutos y hacia las 6 h, después de inducción con PCV de Phaseolus vulgaris.

El cultivo comercial de hortensias para flor de exportación ocupa un renglón importante en el sector económico del oriente antioqueño, por ser fuente de empleo y de desarrollo en la zona. La hortensia (Hydrangea macrophylla) es afectada por numerosos organismos fitopatógenos, entre ellos, nematodos del género Aphelenchoides, los que ocasionan, en el follaje, lesiones necróticas angulares, malformación de flor, enanismo y un daño indirecto en la tasa fotosintética, demeritando los parámetros de calidad para exportación. El objetivo de este estudio fue identificar, molecularmente, las especies del nematodo Aphelenchoides asociadas al cultivo de hortensias de color, en los municipios de Medellín (Santa Elena), La Ceja y Rionegro, siendo este el primer reporte para Colombia, de las especies de este género. Para la ejecución del estudio, se realizaron 10 muestreos en cultivos comerciales, distribuidos entre los tres municipios mencionados. Los nematodos extraídos, se sometieron a pruebas basadas en el análisis de ADN, haciendo uso del marcador ribosomal 18S. Los análisis filogenéticos practicados mostraron la presencia de la especie Aphelenchoides ritzemabosi en cultivos de hortensias, del corregimiento de Santa Elena y, de A. fragarie, en los municipios de La Ceja y Rionegro. Hydrangeamacrophylla commercial crops have an import-ant economic significance for the eastern region of the de-partment of Antioquia, Colombia, due to its impact on em-ployment and local development. This flowering plant can be attacked by several phytopathogens among them nem-atodes of the genus Aphelenchoides; which can produce necrotic lesions on the plant leaves as well decreased photo-synthetic rate, dwarfism, and flower malformation. Addition-ally, this pathogen is considered a regulated pest and limits the international commercialization of the flower. The aim of this study was to molecularly identify the Aphelenchoidesspecies associated with infected H.macrophylla plants in crops the municipalities of Medellín, La Ceja, and Rionegro. This is the first report of the species of this phytopathogen for Colombia. The sampling activities were performed in ten commercial crops locate at the three municipalities. The isolated nematodes were subject to DNA-based tests were the 18S rDNA gene was amplified, sequenced and analyzed using phylogenetic methods. The obtained results showed the infection of Aphelenchoides ritzemabosi within the Santa Elena (Medellin) area in crops and A. fragarie within the mu-nicipalities of La Ceja, and Rionegro. Incluye referencias bibliográficas

1 recurso en línea (páginas 425-434) : ilustraciones color., El cultivo de cacao, está afectado por el fitopatógeno Moniliophthora roreri, que causa gran pérdida en la producción en Norte de Santander. Este estudio muestra los resultados obtenidos utilizando AFLPs de M. roreri. Con el kit para sistema de análisis II, estandarizado y aplicado a 56 muestras de M. roreri, aisladas de nueve municipios. La combinación que presentó mayor número de polimorfismos fue E-ACC/ M-CAA, con 100 bandas y un número menor de alelos (6), con la combinación E-ACG/ M-CAA se obtuvieron 90 bandas y un número de alelos mayor (23), y con la combinación E-AAC/ M-CAA se presentaron 94 bandas y alelos (12). El análisis de datos se realizó según el dendrograma de similitud o distancias genéticas de Nei, obteniéndose cinco grupos con una alta variabilidad entre las muestras, del 6,5 al 58%. Al combinar la información morfológica y molecular se determinó el nivel de diversidad genética de Moniliophthora roreri., Cacao cultivation is affected by the Moniliophthora roreri phytopathogen, which causes large production losses in Norte de Santander. This study shows the results obtained using the AFLPs of M. roreri. The kit for analysis system II was standardized and applied to 56 samples of M. roreri, isolated from nine municipalities. The combination with the highest number of polymorphisms was E-ACC/M-CAA. With 90 bands and a smaller number of alleles (6), the E-ACG/M-CAA combination yielded 90 bands and a larger number of alleles (23); the E-AAC/M-CAA combination had 94 bands and alleles (12). The data analysis was carried out according to the dendrogram of similarity or genetic distances of Nei, obtaining five groups with a high variability between samples, from 6.5 to 58%. By combining the morphological and molecular information, the level of genetic diversity in Moniliophthora roreri was determined., Bibliografía: páginas 432-434

Trichoderma harzianum es un hongo de gran importancia a nivel agrícola gracias a su acción antagonista para el ataque de fitopatógenos causantes de enfermedades de importancia económica, como es el caso de Phytophthora infestans. En el presente estudio se evaluó el efecto de la Dosis de Trichoderma harzianum Rifai en el control de Phytophthora infestans (Mont) de Bary y rendimiento en 3 variedades de papa (Solanum tuberosum L.) en condiciones edafoclimaticas de mayobamba ,2016. El diseño de la investigación fue de Bloques Completos al Azar. La metodología empleada fue la evaluación de la severidad expresada en el área debajo de la curva del progreso (AUDPC) y la estimación del rendimiento por hectárea del cultivo. Los resultados del experimento fue: la dosis de 115 kg/ha de T. harzianum en la variedad Yungay fue el que mejor controló la enfermedad al obtener el menor valor de AUDPC que fue de 244.50; las dosis de 86 y 115 kg/ha de T. harzianum en la variedad Yungay obtuvieron los más altos rendimientos en el cultivo de papa con 12 496.50 y 12 774.20 kg/ha respectivamente; y el uso de la dosis de 115 kg/ha de Trichoderma harzianum sobre las variedades de papa Canchán, Tomasa y Yungay produjo altos índices de rentabilidad (49, 52 y 46%) y ratios B/C (1.57, 1.60 y 1.53) Tesis

RESUMEN El cultivo de cacao, está afectado por el fitopatógeno Moniliophthora roreri, que causa gran pérdida en la producción en Norte de Santander. Este estudio muestra los resultados obtenidos utilizando AFLPs de M. roreri. Con el kit para sistema de análisis II, estandarizado y aplicado a 56 muestras de M. roreri, aisladas de nueve municipios. La combinación que presentó mayor número de polimorfismos fue E-ACC/ M-CAA, con 100 bandas y un número menor de alelos (6), con la combinación E-ACG/ M-CAA se obtuvieron 90 bandas y un número de alelos mayor (23), y con la combinación E-AAC/ M-CAA se presentaron 94 bandas y alelos (12). El análisis de datos se realizó según el dendrograma de similitud o distancias genéticas de Nei, obteniéndose cinco grupos con una alta variabilidad entre las muestras, del 6,5 al 58%. Al combinar la información morfológica y molecular se determinó el nivel de diversidad genética de Moniliophthora roreri. ABSTRACT Cacao cultivation is affected by the Moniliophthora roreri phytopathogen, which causes large production losses in Norte de Santander. This study shows the results obtained using the AFLPs of M. roreri. The kit for analysis system II was standardized and applied to 56 samples of M. roreri, isolated from nine municipalities. The combination with the highest number of polymorphisms was E-ACC/M-CAA. With 90 bands and a smaller number of alleles (6), the E-ACG/M-CAA combination yielded 90 bands and a larger number of alleles (23); the E-AAC/M-CAA combination had 94 bands and alleles (12). The data analysis was carried out according to the dendrogram of similarity or genetic distances of Nei, obtaining five groups with a high variability between samples, from 6.5 to 58%. By combining the morphological and molecular information, the level of genetic diversity in Moniliophthora roreri was determined.

Resumen La rizosfera comprende el volumen de suelo que se encuentra bajo la influencia de las raíces vegetales. Dicha región presenta una extraordinaria diversidad y actividad microbiana; principalmente debido al alto contenido en nutrientes que proceden de los exudados radiculares. Entre las bacterias colonizadoras de la rizosfera (rizobacterias) algunas pueden promover el crecimiento vegetal o actuar como agentes de biocontrol protegiendo frente a múltiples patógenos vegetales. En este artículo se contempla la producción de metabolitos secundarios bioactivos (antibióticos) como uno de los principales mecanismos a través de los cuales las rizobacterias pueden proteger a las plantas frente a enfermedades o patógenos potenciales. A su vez, se discute la utilización de dichos agentes de biocontrol como biopesticidas en estrategias de agricultura sostenible. Abstract The rhizosphere comprises the volume of soil that is under the influence of plant roots. This region presents an extraordinary diversity and microbial activity; mainly due to the high nutrient content that comes from the root exudates. Among the bacteria colonizing the rhizosphere (rhizobacteria) some can promote plant growth or act as biocontrol agents protecting against multiple plant pathogens. This article contemplates the production of bioactive secondary metabolites (antibiotics) as one of the main mechanisms through which rhizobacteria can protect plants against potential diseases or pathogens. In turn, the use of these biocontrol agents as biopesticides in sustainable agriculture strategies is discussed., {"references":["Hiltner L. Uber neuere Erfahrungen und Problem auf dem Gebiete der Bodenbakteriologie unter besonderden berucksichtigungund Brache. Arb Dtsch Landwirtsch Gesellschaft 1904; 98: 59-78.","Lugtenberg B., Kamilova F. Plant-growth- promoting rhizobacteria. Annu Rev Microbiol 2009; 63: 541-56.","Ishikawa C.M., Bledsoe C.S. 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[EN] So far, Caenorhabditis elegans has been used as model organism in many different fields of study, but seldom used as experimental host in virology studies. The present work seeks to evaluate the potential of the nematode to support the replication of the thrip-transmitted plant ambisense ssRNA virus Tomato spotted wilt virus (TWSV; genus Tospovirus, family Bunyaviridae). The choice of this phytopathogenic virus is due to its ability to persistently replicate inside its thrips vector. In order to test TSWV infectivity, several strains of C. elegans were inoculated with plant extracts infected with the strain PVR of the virus. Along with the wild type nematode strain N2, which is commonly used in the laboratory, the JU1580 and RB2519 strains were also evaluated. These two strains are deficient in the RNA interference (RNAi) machinery, which plays an essential role in the antiviral response of the worm. A reduction in lifespan and an increase in mortality were observed in worms treated with virus-containing plant extracts in comparison with worms treated with extracts from healthy plants, suggesting that TSWV might replicate inside the nematode with a concomitant virulence. This effect is stronger in RNAi-deficient strains JU1580 and RB2519 than in wild type N2. To confirm this point, an qRT-PCR protocol is being optimized and applied. The capacity of TSWV successfully infecting C. elegans opens a wide range of possibilities for the study of host-virus interactions: (i) from the evolution of host-range in RNA viruses, to (ii) the establishment of the molecular mechanisms driving this novel hostvirus interaction and to (iii) the interplay between viral infection and cell differentiation and organismal development, among many others, El objetivo de este estudio es analizar y comprender la interacción entre virus de plantas, sus huéspedes vegetales y sus vectores artrópodos; en particular para virus que incorporan una fase de replicación en el vector y que desde un punto de vista ecológico presentan la gama de huéspedes más amplia descrita hasta la fecha: plantas y animales. Para ello, se estudiará el potencial de replicación del arbovirus fitopatógeno Tomato spotted wilt virus (TSWV; género Tospovirus, familia Bunyaviridae), un virus con genoma tripartito de ssRNA de polaridad negativa, en el huésped experimental Caenorhabditis elegans. Se testarán y optimizarán diversas condiciones experimentales en las que TSWV pueda potencialmente ser capaz de infectar al nematodo: modificando el grado de purificación del inóculo viral de partida, los tiempos de incubación (adquisición) con el nematodo, la extracción de RNA toral de éste y la puesta a punto de un método sensible y específico para detectar en el mismo el RNA viral mediante RT-PCR cuantitativa. Además, se utilizarán distintas cepas de Caenorhabditis elegans mutantes en la ruta de defensa mediada por el RNA de interferencia (RNAi), que pudieran resultar más susceptibles a la infección viral en comparación con la cepa salvaje que se considera un genotipo más resistente. En caso de obtener infección en alguna de las condiciones reseñadas, procederíamos a realizar un experimento de evolución mediante pases seriados de 10 linajes independientes del virus en su nuevo huésped. Este tipo de ensayo permitiría determinar si alguna propiedad virológica (infectividad específica, carga viral y virulencia) cambia en el nuevo huésped.

El presente estudio tuvo como objetivo evaluar in vitro la actividad antimicrobiana del extracto de hojas de Mascagnia macrodena (DC) Mied, sobre cepas del hongo del género Colletotrichum gloeosporioides, causante de la enfermedad de la antracnosis, en el cultivo del ñame, en Colombia. Inicialmente, mediante extracción por el método Soxhlet, se obtuvieron extractos totales en etanol de hojas de M. macrodena y, a partir de éste, se prepararon fracciones líquido-líquido con éter de petróleo (E. petrol) y acetato de etilo (AcOEt). El extracto total etanólico y las dos fracciones fueron preparadas a diferentes concentraciones (ppm) y evaluadas in vitro sobre cepas del hongo C. gloeosporioides. La cepa que mostró mayor susceptibilidad a los extractos fue C040, en relación a C279, C853 y C507, que mostraron mayor resistencia. Los hongos presentaron mayor susceptibilidad al extracto total etanólico, seguido de la fracción acetato de etilo a concentraciones de 50, 75 y 100ppm, respectivamente. El screen fitoquímico realizado, reveló la presencia de metabolitos secundarios tipo taninos, antocianinas y alcaloides. Este estudio preliminar muestra el efecto potencial de los extractos de hojas de M. macrodena, sobre la inhibición in vitro del crecimientos de hongos causante de la enfermedad de la antracnosis en el cultivo de ñame. The objective of this study was to evaluate the in vitro antimicrobial activity of leaf extract the Mascagnia macrodena (DC) Mied, on fungi of the genus Colletotrichum, causative of the anthracnose disease of yam cultivation in Colombia. Initially, using the Soxhlet method, total extracts in ethanol of leaves of M. macrodena were obtained and from these liquid-liquid fractions with petroleum ether (E. petrol) and ethyl acetate (AcOEt) were prepared. The total ethanolic extract and two fractions were prepared in different concentrations (ppm) and evaluated in vitro on strains of the fungus C. gloeosporioides. The strain that showed the highest susceptibility to the extracts was C040 compared with C853, C279 and C507, which showed the highest resistance. The fungi showed increased susceptibility to the total ethanol extract, followed by the ethyl acetate fraction at concentrations of 50, 75 and 100 ppm, respectively. The phytochemical screen, revealed the presence of secondary metabolites of tannin, anthocyanin and alkaloid types. This preliminary study showed the potential effect M. macrodena leaf extracts on inhibition in vitro of the growth of fungi causing anthracnose in yam cultivation.

El presente estudio tuvo como objetivo evaluar in vitro la actividad antimicrobiana del extracto de hojas de Mascagnia macrodena (DC) Mied, sobre cepas del hongo del género Colletotrichum gloeosporioides, causante de la enfermedad de la antracnosis, en el cultivo del ñame, en Colombia. Inicial-mente, mediante extracción por el método Soxhlet, se obtu-vieron extractos totales en etanol de hojas de M. macrodenay, a partir de éste, se prepararon fracciones líquido-líquido con éter de petróleo (E. petrol) y acetato de etilo (AcOEt). El extracto total etanólico y las dos fracciones fueron pre-paradas a diferentes concentraciones (ppm) y evaluadas in vitro sobre cepas del hongo C. gloeosporioides. La cepa que mostró mayor susceptibilidad a los extractos fue C040, en relación a C279, C853 y C507, que mostraron mayor resis-tencia. Los hongos presentaron mayor susceptibilidad al ex-tracto total etanólico, seguido de la fracción acetato de etilo a concentraciones de 50, 75 y 100ppm, respectivamente. El screen fitoquímico realizado, reveló la presencia de meta-bolitos secundarios tipo taninos, antocianinas y alcaloides. Este estudio preliminar muestra el efecto potencial de los extractos de hojas de M. macrodena, sobre la inhibición in vitro del crecimientos de hongos causante de la enfermedad de la antracnosis en el cultivo de ñame. The objective of this study was to evaluate the in vitroantimicrobial activity of leaf extract the Mascagnia macrodena (DC) Mied, on fungi of the genus Colletotrichum, causative of the anthracnose disease of yam cultivation in Colombia. Initially, using the Soxhlet method, total extracts in ethanol of leaves of M. macrodena were obtainedand from these liquid-liquid fractions with petroleum ether (E. petrol) and ethyl acetate (AcOEt) were prepared. The total ethanolic extract and two fractions were prepared in different concentrations (ppm) and evaluated in vitro on strains of the fungus C. gloeosporioides. The strain that showed the highest susceptibility to the extracts was C040 compared with C853, C279 and C507, which showed the highest resistance. The fungi showed increased susceptibility to the total ethanol extract, followed by the ethyl acetate fraction at concentrations of 50, 75 and 100 ppm, respectively. The phytochemical screen, revealed the presence of secondary metabolites of tannin, anthocyanin and alkaloid types. This preliminary study showed the potential effect M. macrodena leaf extracts on inhibition in vitro of the growth of fungi causing anthracnose in yam cultivation Incluye referencias bibliográficas

Resumen: En el presente trabajo, los fenilpropanoides safrol y apiol (dillapiol) se obtuvieron de fuentes naturales, puntualmente desde las especies Piper auritum Kunth. (Pa) y Piper holtonii C.DC. (Ph); respectivamente. Además, se realizó una evaluación previa de la actividad antifúngica in vitro mediante la técnica del agar envenenado, contra el hongo fitopatógeno Botryodiplodia theobromae, tanto de estos metabolitos como de extractos de diferente polaridad provenientes de ambas especies. Los análisis de composición química de los extractos revelaron que la mayor inhibición está posiblemente relacionada con el contenido de safrol en P. auritum (56,88 % en el extracto hexánico, EH; y 64,54 % en el aceite esencial, AE) y apiol en P. holtonii (57,20 % en EH y 64,24 % en AE). Ambos compuestos se purificaron por métodos cromatográficos, y sus estructuras se confirmaron por resonancia magnética nuclear (RMN) de protón y carbono 13; y con ayuda de los fragmentos obtenidos de la espectrometría de masas. Adicionalmente, se analizó el metabolismo de safrol y apiol por parte del hongo B. theobromae incubado en el medio Czapeck Dox durante 216 h; como productos mayoritarios de la biotransformación se aislaron e identificaron los correspondientes dioles vecinales sobre la cadena lateral. Otros metabolitos minoritarios también se detectaron por cromatografía de gases. Para observar el progreso del proceso metabólico se hizo un estudio en el curso del tiempo mediante CG-EM cada 12 h hasta las 120 h, y luego cada 48 h hasta las 316 h. De estos estudios se observó que para el safrol, donde la actividad antifúngica es moderada, la capacidad de metabolización es baja; mientras que para el apiol, que presentó una actividad relativamente alta, este microorganismo consigue después de 60 h iniciar el proceso de transformación; proceso que continuó durante el tiempo restante del ensayo. A partir de estos resultados se postula una posible ruta metabólica. Por último, se prepararon algunos derivados del safrol y apiol (por nitración del anillo aromático y reducción del grupo nitro hasta amino) y se evaluaron contra el hongo fitopatógeno; esto con el fin de establecer el efecto de las variaciones estructurales sobre la actividad antifúngica in vitro. Estos resultados brindan información importante acerca de la bioquímica de la interacción entre los hongos fitopatógenos y los fenilpropanoides. Información que puede ser utilizada en el desarrollo racional de nuevas y mejoradas sustancias antifúngicas. Abstract: In the present work, the phenylpropanoids safrole and apiol (dillapiol) was obtained from natural sources, punctually from Piper auritum Kunth. (Pa) and Piper holtonii C.DC. (Ph) species; respectively. Moreover, a previous in vitro antifungal activity was realized by the poisoned agar technique, against phytopathogenic fungi Botryodiplodia theobromae, both the metabolites as the different polarity extracts of both species. The chemical composition analysis of the extracts reveals that the major inhibition was likely related with safrole content in P. auritum (56,88 % in hexanic extract, HE; and 64,54 % in the essential oil, EO). Both compounds were purified by chromatographic means, and their structures were confirmed by proton and 13 carbon nuclear magnetic resonance (NMR); and using the fragments obtained from mass spectrometry. Furthermore, the metabolism of safrole and apiol by the fungus B. theobromae cultured in Czapeck Dox media during 216 h was analyzed; as the major products from the biotransformation, the corresponding vicinal diols upon the lateral chain were analyzed and identified. Other minor metabolites were also detected by gas chromatography. To observe the metabolic process progress, a time course analysis by GC-MS was done, each 12 h until 120 h, and then each 45 h to the 316 h. from these studies was observed that for safrole, where the antifungic activity is moderate, the metabolic capability is low. While for apiol, which showed a relatively high activity, this microorganism gets start the biotransformation process after 60 h; process that continues for the remainder of the assay. From these results a plausible metabolic pathway is postulated. Finally, some derivatives for safrole and apiol were prepared (by nitration of the aromatic ring and reduction of the nitro group to amino) and were tested against the phytopathogenic fungus; this, with the aim of establishes the structural variation effect on the in vitro antifungal activity. These results offer valuable information about the biochemistry of the interaction between phytopathogenic fungi and the phenylpropanoids. Maestría

En México la avena es uno de los cereales que en los últimos años ha acrecentado su superficie de siembra de manera importante, sustituyendo a cultivos tradicionales como maíz, frijol, trigo y cebada, alcanzando las 942 mil hectáreas en 2010(SIAP,2010).Sinembargo,suproducciónseveafectada por enfermedades fungosas mismas que en algunos casos no han sido identificadas y que son un peligro potencial para la producción de este cereal en siembras de temporal. Este estudio tuvo como objetivo identificar los agentes causales de enfermedades fungosas en el cultivo de avena sembrada bajo temporal durante el ciclo primavera-verano 2009, en tres regiones productoras del Estado de México. Se realizaron colectas de hojas con síntomas de diferentes enfermedades de las variedades Chihuahua, Cuauhtémoc y Ópalo que fueron sembradas en los ensayos del Programa de Mejoramiento Genético de Avena del INIFAP. Se identificaron los hongos fitopatógenos: Helminthosporium sativum, H. victoriae, H. avenae, Puccinia coronata, P. graminis f. sp. avenae, Curvularia sp., y los saprófitos Alternaria sp., y Phoma sp. La enfermedad con mayor incidencia en las tres regiones de estudio fue Puccinia graminis f. sp. avenae.

This study evaluates the effect of the genus Bacillus sp as biological control of fungal phytopathogens in plants, mostly through antagonistic relations that induce cell death in natural way. Fusarium oxysporum is well-known pathogen related with vascular wilt and root rot in a variety of plants; colonizing the vessels and blocking them to cause yellowing of leaves due to the impossibility in the transport of nutrients, causal of serius economic loss in national agriculture. Several mechanisms have been established to control this filamentous fungi within which are the extensive and variable use of agrochemicals and pesticides, but due its harmful effects to the environment, has begun to replace by the use of the genus Bacillus.Its biocontrol effect is mediated by the biochemical profile, as they produce multiple biologically active metabolites; Bacillus subtilis produces fengycin and iturin A, and Bacillus brevis and gramicidin S (1-5), able of inhibit the normal growth and development of other organisms, this suggest its use as a biocontrol of pests to strengthen the current environmental quality standards. El romero es una de las plantas aromáticas más importantes dentro del mercado de exportación colombiano. El cultivo de esta planta se ve afectado por marchitez vascular producida por Fusarium spp. El objetivo principal de este trabajo fue establecer en el romero el efecto biocontrolador de Bacillus spp., frente a Fusarium spp., bajo condiciones de invernadero. Para ello se seleccionaron Bacillus liqueniformis (B1), Bacillus subtilis (B2), Bacillus megaterium (B14), Bacillus brevis (E2), aislados de rizósfera de plantas aromáticas, a los cuales se les realizaron pruebas de viabilidad, identificación enzimática manual y automatizada, y pruebas de antagonismo in vitro en medio PDA frente a Fusarium acuminatum aislado de las plantas de romero, comprobando la patogenicidad del hongo por postulados de Koch.El ensayo se realizó con 30 plántulas de romero, un control negativo y uno positivo, bioensayos con sólo Bacillus spp., y tratamientos con Bacillus spp., más el patógeno. Para evaluar la severidad del patógeno y el comportamiento de las bacterias cada ensayo se realizó por triplicado y bajo condiciones de invernadero. En las pruebas de antagonismo in vitro B1 y B2 presentaron entre el 70–100% de inhibición del micelio y B14 y E2 entre el 40–69%. Los Bacillus spp., disminuyeron la severidad de la marchitez vascular en todos los ensayos; por la producción de sustancias antifúngicas facilitaron el aumento del peso seco de las hojas de las plantas al permitir la obtención de nutrientes y B14 aumentó la longitud de la raíz y el tallo. Se precisa secuenciar el aislamiento de Fusarium, para confirmar la especie.

The present work of investigation was carried out in the city of Lamas, in the horticultural farm house The Hope. The work was carried out in 2 stages: First it was realised in the field, where a pursuit to a parcel became of lettuce culture Great Lakes variety, this in order to evaluate the agronomic workings that realize, symptoms of the disease was described, collected the samples of ill plants, evaluated the incidence and severity of the disease of leaf spot, using the method of Stover modified by Gauhl and With the collected data of severity, the curve of progress of the disease was realised, using 3 mathematical models epidemiologists: Logistic, Monomolecular and Gompertz. The second stage was developed in the vegetal medical laboratory of the National University of San Martin - Tarapoto, where it evaluated the test of phatogenicid, characterization of the fitophatógen and test of poisoned food. The obtained results determined: the pathogen Cercospora longissima is the causal agent of leaf spot in the culture of Lettuce. The mathematical model of Gompertz described in graphical form the curve of progress of the disease and formulated products: Mancozeb + Metalaxil 3g. /L., Tiofanate Metil + Thiram 3g. /L., Mancozeb + Metalaxil 2g. /L., they reduced to the growth and development of the fungus in laboratory. El presente trabajo de investigación se llevó a cabo en la ciudad de Lamas, en el fundo hortícola La Esperanza y se llevó a cabo en 2 etapas: La primera se realizó en el campo, donde se hizo un seguimiento a una parcela de cultivo de lechuga variedad Great Lakes, para evaluar las labores agronómicas que realizaron, describir la sintomatología de la enfermedad, recolectar muestras de plantas enfermas y evaluar la incidencia y severidad de la enfermedad de la mancha foliar utilizando el método de Stover modificado por Gauhl y con los datos obtenidos de severidad se realizó la curva de progreso de la enfermedad, empleando 3 modelos matemáticos epidemiológicos: Logístico, Monomolecular y Gompertz. La segunda etapa se desarrolló en el laboratorio de sanidad vegetal de la Universidad Nacional de San Martín – Tarapoto. Se evaluó la prueba de patogenicidad, caracterización del fitopatógeno y prueba de alimento envenenado. Los resultados obtenidos determinaron: Cercospora longissima es el agente causal de la mancha foliar en el cultivo de lechuga. El modelo matemático de Gompertz describió en forma gráfica la curva de progreso de la enfermedad y los productos formulados: mancozeb + Metalaxil 3g./L. , Tiofanate Metil + Thiram 3g./L. , Mancozeb + Metalaxil 2g./L. , redujeron el crecimiento y desarrollo del hongo en laboratorio.