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El síndrome de Sjögren (SS) es una enfermedad de tipo autoinmune con importante afectación ocular. Su etiología es aún desconocida con un numero de factores elevados como posibles generadores de la enfermedad. El cambio en la microbiota intestinal ha sido reportado como un factor diferencial entre los sujetos sanos y los sujetos con SS. Diferencias en la microbiota intestinal han sido reportadas en otras patologías sistémicas autoinmunes. Para no tener factores de confusión entre otras patologías sistémicas autoinmunes se ha realizado un estudio en pacientes estrictamente seleccionados y con ausencia de otras alteraciones inmunitarias, siendo seleccionados solo los pacientes con síndrome de Sjögren primario (SSP). Los objetivos de esta tesis doctoral han sido la caracterización de microbiota fecal en pacientes con SSP comparados con pacientes sanos, la determinación de parámetros inflamatorios en plasma de pacientes con SSP comparados con pacientes sanos y su relación con microbiota fecal, así como la determinación de permeabilidad intestinal a través de zonulina plasmática. En esta tesis doctoral se ha realizado un estudio de pacientes con SSP para poder establecer si los cambios en la microbiota intestinal son asociados a la presencia de esta enfermedad de forma aislada, o bien si en el SSP no existen diferencias con los sujetos sanos. De este modo podríamos centrar investigaciones posteriores en otras patologías autoinmunes como la artritis reumatoide (AR) y el lupus eritematosis sistémico (LES), entre otras. Algunos autores han estudiado patologías autoinmunes encontrando diferencias en la microbiota intestinal lo que nos ha llevado a profundizar en el estudio del SSP como entidad aislada sin otras enfermedades autoinmunes asociadas que nos lleven a posibles confusiones. Se han estudiado parámetros de inflamación y de permeabilidad intestinal para intentar establecer relaciones entre estos parámetros y los cambios de la microbiota intestinal, así como se ha intentado establecer o aportar información sobre la etiopatogenia de la enfermedad. Los resultados obtenidos muestran que la microbiota intestinal de los pacientes con SSP difieren tanto a nivel taxonómico como a nivel funcional con respecto a controles sanos. El perfil de microbiota intestinal de nuestros pacientes con SSP presento una menor diversidad y riqueza siendo el filo Bacteroidetes el grupo más representado. Se ha encontrado un aumento de la producción de citoquinas proinflamatorias y la disminución de la liberación de citoquinas antiinflamatorias (IL-10). Se necesitan mas estudios para comprender mejor la realidad del impacto de la disbiosis en el curso del SSP y para concebir estrategias preventivas o terapéuticas para contrarrestar la inflamación impulsada por el microbioma. Sjögren's syndrome (SS) is an autoimmune disease with significant ocular involvement. Its etiology is still unknown with a high number of factors as possible generators of the disease. The change in the gut microbiota has been reported as a differential factor between healthy subjects and subjects with SS. Differences in the intestinal microbiota have been reported in other autoimmune systemic pathologies. In order to avoid confounding factors between other autoimmune systemic pathologies, our study has been carried out in strictly selected patients and with the absence of other immune alterations, only selecting patients with primary Sjögren's syndrome (SSP). The objectives of this doctoral thesis have been the characterization of the fecal microbiota in patients with SSP compared to healthy patients, the determination of inflammatory parameters in plasma in SSP patients compared to healthy patients and their relationship with fecal microbiota as well as the determination of intestinal permeability through plasma zonulin. In this doctoral thesis, a study of patients with SSP has been carried out in order to establish if changes in the intestinal microbiota are associated with the presence of this disease in isolation, or if there are no differences in SSP with healthy subjects. In this way, we could focus further research on other autoimmune diseases such as rheumatoid arthritis (AR) and systemic lupus erythematosis (LES), among others. Some authors have studied autoimmune pathologies finding differences in the intestinal microbiota, which has led us to delve into the study of SSP as an isolated entity without other associated autoimmune diseases that lead us to possible confusion. Inflammation and intestinal permeability parameters have been studied to try to establish relationships between these parameters and changes in the intestinal microbiota, as well as attempts to establish or provide information on the etiopathogenesis of the disease. The results obtained show that the intestinal microbiota of patients with SSP differ both taxonomic level and functional level with respect to healthy controls. The intestinal microbiota profile of our patients with SSP presented less diversity and richness, the Bacteroidetes phylum was the most represented group An increase in the production of pro-inflammatory cytokines and a decrease in the release of anti-inflammatory cytokines (IL-10) have been found. More studies are needed to understand the impact of dysbiosis on the course of SSP and to devise preventive or therapeutic strategies to counter microbiome-driven inflammation.