12 results on '"A. Pessino"'
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2. LA TEORÍA DE LA MIGRACIÓN SECUENCIAL Y LA EXPERIENCIA DEL PERÚ
- Author
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Pessino, Carola
- Published
- 1991
3. The configuration of Sociology as curricular content and a subject in education
- Author
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Elgueta, Martín, Ficcardi, Marcela, Lami, Liliana, Pessino, Patricia, Raimondi, Cecilia, and Mercado, Graciela
- Subjects
Espacio curricular en sociología ,Sociology subject ,Prácticas de residencias ,Pedagogical odeling ,Sociología ,Modelaciones pedagógicas ,Residency practices - Abstract
Este artículo tiene el propósito de compartir algunos hallazgos sobre la configuración de las disciplinas de las carreras como espacio o contenido escolar en el sistema educativo de la Provincia de Mendoza, en particular, las modelizaciones pedagógicas de las prácticas de residencia de la cohorte 2006 del profesorado de Sociología. Así, la unidad de indagación fueron nueve Portafolios y sus Memorias en los que se documentaron y narraron dieciocho experiencias de prácticas de residencias desarrolladas durante el ciclo lectivo 2006. Este aporte está organizado en cuatro apartados. En el primero, se describen los dispositivos de trabajo de la cátedra en torno a la organización de las experiencias de residencias de los estudiantes del profesorado (2004-2013). En el segundo, se caracterizan los rasgos de los Portafolios y Memorias de prácticas y cursantes de la cohorte 2006 del Profesorado de Sociología. En el tercer apartado, se ensaya una caracterización de las modelizaciones pedagógicas emergentes, y se presta especial atención a la descripción de sus rasgos. Finalmente, en el cuarto, se proponen una serie de reflexiones en torno a los hallazgos obtenidos y a algunas líneas de indagación emergentes. This article intends to share some findings about the configuration of certain courses’ disciplines as curricular content and subjects within the education system of Mendoza province, more specifically, the kind of pedagogical modeling used in the residence training of the Sociology Teacher Training student group in 2006. Nine Portfolios and their Memoirs were subjected to analysis in which, at the same time, eighteen experiences of residency training practices carried out during the 2006 academic year were documented and narrated. This collective work is organized into four sections. In the first one, we describe the working procedures of the professorship centering on the arrangement of the residency training experiences of the teacher training students (2004-2013). In the second section, we characterize the features of the Portfolios and Memoirs of the practices and students that were part of the teacher training in Sociology in 2006. In the third segment, we perform a characterization of the arising pedagogical modeling while paying particular attention to the description of its features. Finally, in the fourth and last section, we propose a number of considerations regarding the findings and some emerging lines of enquiry. Fil: Elgueta, Martín. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Políticas y Sociales Fil: Ficcardi, Marcela. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Políticas y Sociales Fil: Lami, Liliana. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Políticas y Sociales Fil: Pessino, Patricia. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Políticas y Sociales Fil: Raimondi, Cecilia. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Políticas y Sociales Fil: Mercado, Graciela. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Políticas y Sociales
- Published
- 2015
4. Social spending and income redistribution in Argentina during the 2000s: the rising role of noncontributory pensions
- Author
-
Lustig, Nora and Pessino, Carola
- Published
- 2012
5. Construction of a preliminary genetic linkage map of yerba mate (Ilex paraguariensis)
- Author
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Stein, Juliana, Luna, Claudia Verónica, Espasandin, Fabiana Daniela, Sartor, Maria Esperanza, Espinoza, Francisco, Ortiz, Juan Pablo Amelio, Sansberro, Pedro Alfonso, and Pessino, Silvina Claudia
- Subjects
MARCADORES MOLECUALRES ,MAPEO GENETICO ,CIENCIAS AGRÍCOLAS ,Biotecnología Agropecuaria ,Tecnología GM, clonación de ganado, selección asistida, diagnósticos, tecnología de producción de biomasa, etc ,purl.org/becyt/ford/4.4 [https] ,MEJORAMIENTO VEGETAL ,purl.org/becyt/ford/4 [https] - Abstract
Las hojas de la yerba mate se utilizan para la preparación del mate, una infusión de profunda raigambre histórica, social y cultural en Sudamérica. Su cultivo reviste importancia estratégica para varios países de la región, especialmente Argentina, Brasil y Paraguay. Nuestro objetivo fue establecer una población segregante y construir un mapa de ligamiento genético preliminar de esta especie para facilitar la futura identificación de loci asociados con caracteres de interés agronómico. Dos genotipos genéticamente divergentes con comportamiento contrastante respecto a la tolerancia a sequía se seleccionaron como progenitores femenino y masculino. Mediante cruzamientos controlados y rescate de embriones, se estableció una población F tipo 1 “pseudo-test cross” de 700 individuos, con potencial para extenderse hasta 1900. Un subgrupo de 117 plantas fue empleado para construir un mapa genético marco. Se ensayaron 5 combinaciones de cebadores de AFLP y 16 cebadores de RAPDs, para generar 119 marcadores informativos, de los cuales el 68,9% se ajustó a los valores de segregación mendeliana esperados. El análisis de ligamiento se realizó con el programa JoinMap 3.0. Los marcadores originados en cada progenitor se analizaron independientemente para generar un mapa femenino formado por 11 grupos de ligamiento y otro masculino con 16 grupos. Las distancias genéticas cubiertas por los mismos fueron de 223 cM y 678 cM, respectivamente. Este trabajo permitió establecer una progenie de mapeo segregante para yerba mate y construir un mapa genético preliminar que podrá usarse como base para la futura identificación de marcadores ligados a genes de interés agronómico. Fil: Stein, Juliana. Universidad Nacional de Rosario; Argentina Fil: Luna, Claudia Verónica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentina Fil: Espasandin, Fabiana Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentina Fil: Sartor, Maria Esperanza. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentina Fil: Espinoza, Francisco. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentina Fil: Ortiz, Juan Pablo Amelio. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentina Fil: Sansberro, Pedro Alfonso. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentina Fil: Pessino, Silvina Claudia. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina
- Published
- 2014
6. Construcción de un mapa genético preliminar de yerba mate (Ilex paraguariensis): construction of a preliminary genetic linkage map of yerba mate (Ilex paraguariensis)
- Author
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Stein, Juliana, Luna, Claudia, Espasandin, Fabiana Daniela, Sartor, Maria Esperanza, Espinoza, Francisco, Ortiz, Juan Pablo Amelio, Sansberro, Pedro Alfonso, and Pessino, Silvina Claudia
- Subjects
MAPEO GENÉTICO ,purl.org/becyt/ford/1 [https] ,MARCADORES MOLECULARES ,Ciencias Biológicas ,Genética y Herencia ,CIENCIAS AGRÍCOLAS ,Agronomía, reproducción y protección de plantas ,purl.org/becyt/ford/4.1 [https] ,ILEX PARAGUARIENSIS ,purl.org/becyt/ford/1.6 [https] ,Agricultura, Silvicultura y Pesca ,MEJORAMIENTO VEGETAL ,purl.org/becyt/ford/4 [https] ,CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS - Abstract
Las hojas de la yerba mate se utilizan para la preparación del mate, una infusión de profunda raigambre histórica, social y cultural en sudamérica. Su cultivo reviste importancia estratégica para varios países de la región, especialmente Argentina, Brasil y Paraguay. Nuestro objetivo fue establecer una población segregante y construir un mapa de ligamiento genético preliminar de esta especie para facilitar la futura identificación de loci asociados con caracteres de interés agronómico. Dos genotipos genéticamente divergentes con comportamiento contrastante respecto a la tolerancia a sequía se seleccionaron como progenitores femenino y masculino. Mediante cruzamientos controlados y rescate de embriones, se estableció una población F tipo 1 ?pseudo-test cross? de 700 individuos, con potencial para extenderse hasta 1900. Un subgrupo de 117 plantas fue empleado para construir un mapa genético marco. Se ensayaron 5 combinaciones de cebadores de AFLP y 16 cebadores de RAPDs, para generar 119 marcadores informativos, de los cuales el 68,9% se ajustó a los valores de segregación mendeliana esperados. El análisis de ligamiento se realizó con el programa JoinMap 3.0. Los marcadores originados en cada progenitor se analizaron independientemente para generar un mapa femenino formado por 11 grupos de ligamiento y otro masculino con 16 grupos. Las distancias genéticas cubiertas por los mismos fueron de 223 cM y 678 cM, respectivamente. Este trabajo permitió establecer una progenie de mapeo segregante para yerba mate y construir un mapa genético preliminar que podrá usarse como base para la futura identificación de marcadores ligados a genes de interés agronómico. The “yerba mate” leaves are used to make an infusion named “mate tea”, which is deeply rooted in the historical, social and cultural tradition of South America. Its sustainable use is of strategic significance to several countries of this region, particularly Argentina, Brazil and Paraguay. Our objective was to establish a segregating population and build a framework genetic map, in order to contribute to the future identification of loci associated with desirable traits. Two genetically divergent genotypes with contrasting drought tolerance capacity were selected as female and male parents. A “pseudo-test cross” F1 population of 700 individuals, with potential to be extended to 1900 individuals, was produced after controlled crossing followed by embryo rescue. A subset of 117 plants was used to produce a framework genetic map. Five AFLP primer combinations and 16 RAPD primers generated 119 informative markers, out of which 68.9% showed the expected Mendelian segregation values. Linkage analyses were carried out by using Joinmap 3.0. Markers originated from each progenitor were independently evaluated to generate a female map including 11 linkage groups and a male one with 16 linkage groups. Total genetic distances covered by the female and male maps were 223 cM and 678 cM, respectively. This work allowed the establishment of a yerba mate segregating population and the construction of a preliminary genetic map, which will be used as a framework for the future identification of markers linked to genes of interest. Fil: Stein, Juliana. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina Fil: Luna, Claudia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste (i); Argentina Fil: Espasandin, Fabiana Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste (i); Argentina Fil: Sartor, Maria Esperanza. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste (i); Argentina Fil: Espinoza, Francisco. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste (i); Argentina Fil: Ortiz, Juan Pablo Amelio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste (i); Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina Fil: Sansberro, Pedro Alfonso. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste (i); Argentina Fil: Pessino, Silvina Claudia. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina
- Published
- 2014
7. Long-term response of puma (Puma concolor) to a population decline of the plains vizcacha (Lagostomus maximus) in the Monte desert, Argentina
- Author
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Pessino, Marcelo E.M., Sarasola, José H., Wander, Claudio, and Besoky, Nestor
- Abstract
El presente trabajo tuvo como objetivo examinar la dieta del puma (Puma concolor) en el área del Parque Nacional Lihue Calel, durante los períodos 1994.1997 y 2000. La muestra analizada consistió en 198 heces a partir de las cuales se identificaron 244 individuos presa, resultando el 97% mamíferos, el 2% aves y el 1% reptiles. En términos de biomasa relativa las grandes presas (> 20 kg) representaron el 40.6%, las presas medianas (1-20 kg) el 59.1% y las presas pequeñas (< 1 kg) el 0.3%. Entre 1994 y 1996 las vizcachas (Lagostomus maximus) fueron la principal presa del puma, a pesar de estar sufriendo una disminución de sus poblaciones. Este proceso quedó evidenciado en la dieta por una notable reducción y la posterior desaparición de esta presa. Paralelamente se incrementó el consumo de otras presas medianas, especialmente armadillos (Chaetophractus villosus y Zaedyus pichiy) y ungulados (Sus scrofa y Lama guanicoe). Durante el período de estudio los valores de amplitudes de nicho trófico y peso promedio de presas fueron, en general, superiores a los registrados para el área en trabajos previos. We examined puma (Puma concolor) food habits between 1994.1997 and 2000 in Lihue Calel National Park area. Using fecal analysis we identified 244 prey items in 198 feces. Mammalian species accounted for 97% of all prey items, birds 2% and reptiles 1%. In terms of relative biomass, large preys (> 20 kg) made up 40.6% of the diet, medium preys (1-20 kg) 59.1% and small preys (< 1 kg) 0.3%. From 1994 to 1996 plains vizcachas (Lagostomus maximus) were the staple prey of pumas, even though they were declining. This process was evidenced in the reduction and subsequent disappearance of vizcachas in pumas diet. Parallelly, there was an increase of other medium-sized preys, especially armadillos (Chaetophractus villosus and Zaedyus pichiy), and ungulates (Sus scrofa and Lama guanicoe). During the study period, both the breadth of diet and the mean weight of vertebrate prey were generally higher than those recorded during previous studies in the same area.
- Published
- 2001
8. Study of the PN_TGS1 function in plant reproductive development
- Author
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Colono, Carolina, Pessino, Silvina, and Permingeat, Hugo
- Subjects
Genes ,Paspalum notatum ,Reproducción asexual ,Apomixis - Abstract
Paspalum notatum es una gramínea modelo utilizada para estudiar la apomixis, un tipo de reproducción asexual por semillas que permite la formación de progenies clonales idénticas a la planta madre. En trabajos anteriores nuestro grupo determinó que el gen PN_TGS1-like (similar a TRIMETILGUANOSINA SINTASA 1) se expresa en óvulos de plantas sexuales de P. notatum, pero está reprimido en plantas apomícticas. TGS1 codifica una metiltransferasa con rol dual, que promueve la biogénesis de sn(o) ARNs trimetilados en el proceso de splicing, y actúa como coactivador transcripcional. La eliminación de su función produce pérdida de la estructura nucleolar y deficiencias en el procesamiento de pre-rARNs y mARNs. Mientras que en levaduras y animales existe una sola copia del gen (TGS1), en plantas se detectan dos (TGS1 y TGS1-like). En P. notatum, la expresión de la copia exclusiva de plantas (TGS1-like) se correlaciona negativamente con la expresividad de la apomixis. Nuestro objetivo fue estudiar el rol de TGS1-like en el desarrollo reproductivo de la especie apomíctica apospórica P. notatum. Para ello, caracterizamos la estructura genómica y las variantes de expresión del gen, usando bases de datos construidas en nuestro laboratorio, y determinamos que existe una sola copia genómica del mismo, que muestra dos variantes de transcriptos florales. Luego, transformamos callos indiferenciados de una planta sexual con una construcción antisentido (pAct1-F1as) que silencia específicamente a TGS1-like. Las plantas antisentido desarrollaron tricomas en la superficie adaxial de la hoja y formación ocasional de óvulos gemelos. El análisis del desarrollo reproductivo en la antesis reveló que las líneas antisentido presentaban un 12,93-15,79% de los óvulos con sacos embrionarios de tipo apospórico (similares a SEA), y un 8,42-9,52% con una combinación de sacos meióticos y apospóricos. Además, en premeiosis/meiosis, el 32,5% de los óvulos mostraban células similares a iniciales de la aposporía (IAs) rodeando a la célula madre de la megáspora (CMM) o a las díadas meióticas derivadas de CMM. Estas IAs no iniciaban divisiones meióticas, por lo que podría inferirse que los sacos embrionarios supernumerarios detectados en antesis eran de tipo “no reducidos”. Las líneas antisentido producían una cantidad de polen y un conjunto de semillas viables equivalentes a las controles después de la autopolinización. Los análisis de citometría de flujo en cariopses derivados de líneas antisentido revelaron que todas las semillas viables se habían originado por sexualidad. Además, al comparar las líneas antisentido con los controles, detectamos una reducción de un 25,55% en el porcentaje de germinación. Para analizar si TGS1-like afectaba al proceso de clivado y empalme, comenzamos por seleccionar en nuestras bases transcriptómicas (454/Roche FLX +) los 316 transcriptos con mayor expresión diferencial en flores de plantas apomícticas y sexuales (nótese que ambos tipos de plantas expresan diferencialmente al gen TGS1-like en flores) (FDR < 6,74E-10). Luego analizamos cuáles de estos transcriptos diferenciales podrían corresponder a posibles variantes de splicing. Así, detectamos que una variante de splicing de CHLOROPHYLL A-B BINDING PROTEIN 1B-21 (CHLORO, isotig 23387) presentaba menor representación en el transcriptoma de plantas apomícticas con respecto a sexuales. La expresión diferencial de dicha variante de splicing fue validada en varios individuos con diferente modo de reproducción mediante qRT-PCR. Además, un análisis del procesamiento de CHLORO en las líneas antisentido tgs1-like confirmó que la expresión de esa misma variante de splicing está disminuida respecto a los controles, lo que confirma que la actividad de TGS1-like es necesaria para su formación. A partir de estos resultados, concluimos que CHLORO es uno de los blancos de TGS1-like. Además, identificamos un grupo numeroso de transcriptos relacionados con el splicing, que están diferencialmente representados en órganos reproductivos de plantas de P. notatum, y determinamos que conforman una red de interacciones junto con TGS1-like. En conjunto, nuestros resultados sugieren que, durante el proceso de reproducción sexual, TGS1-like se expresa en la nucela del óvulo e inhibe la formación de sacos embrionarios múltiples. La inhabilitación de la función TGS1-like provoca la aparición de células similares a IAs en la nucela, y luego sacos embrionarios supernumerarios, con morfología similar a los sacos embrionarios apospóricos, y posiblemente no reducidos. Sin embargo, la desregulación de PN_TGS1 no es suficiente para inducir la formación de progenie materna, ya que estos gametofitos extra no son capaces de llevar a cabo la partenogénesis y/o desarrollar endospermo viable. Además, la desregulación de PN_TGS1-like está asociada a defectos en la germinación de las semillas, aún de aquellas formadas por sexualidad, por lo que no descartamos un rol durante la embriogénesis y/o el desarrollo del endospermo. La regulación ejercida por PN_TGS1-like en la nucela del óvulo está enmarcada (al menos parcialmente) en un control del proceso de clivado y empalme, siendo la proteína cloroplástica de codificación nuclear CHLORO uno de sus genes blanco. Por otra parte, varios otros genes relacionados con la actividad de la maquinaria de splicing muestran una actividad diferencial durante la apomixis, y podrían integrar una red de interacciones funcionales junto con TGS1-like. En trabajos futuros deberán identificarse las relaciones funcionales entre los miembros de dicha malla, así como también la correspondencia entre el control ejercido por TGS1 sobre el cloroplasto y el splicing. Paspalum notatum is a grass model used to study apomixis. In previous work we determined that PN_TGS1-like (TRIMETILGUANOSINE SYNTHASE 1-like) is repressed in ovules of apomictic P. notatum plants. TGS1 encodes a RNA methyltransferase, which promotes the biogenesis of trimethylated sn (o) RNAs necessary for RNA splicing and acts as a transcriptional coactivator. TGS1 downregulation causes loss of nucleolar structure and deficiencies in pre-rRNAs and mRNAs processing. In yeasts and animals there is only one copy of TGS1, but two copies are detected in plants (TGS1 and TGS1-like). In P. notatum, the expression of the plant-specific copy (TGS1-like) negatively correlates with expressivity of apomixis. Our objective was to study the role of TGS1-like in the P. notatum reproductive development. First, we determined that Paspalum has a single genomic copy and two floral splice variants of TGS1-like. Then, we transformed sexual P. notatum with a TGS1-like antisense construction (pAct1-F1as). Phenotypic analysis revealed trichomes in leaves, and occasional formation of twin ovules. While control plants displayed a single meiotic embryo sac per ovule, antisense lines showed 12.93–15.79% of ovules bearing aposporous-like embryo sacs (AES-like), while 8.42–9.52% showed both meiotic and aposporous-like sacs. Besides, at early developmental stages, 32.5% of the ovules displayed nucellar cells resembling apospory initials (AIs) surrounding the megaspore mother cell (MMC) or the MMC-derived meiotic products. Flow cytometry analyses of caryopses in antisense lines revealed that full seeds originated only by sexuality. A reduction of 25.55% in the germination percentage was detected in antisense lines. To analyze whether TGS1-like affects the splicing, we selected 316 transcripts differentially expressed in flowers of apomitic and sexual plants, with values of FDR
- Published
- 2020
9. Respuesta a largo plazo del puma (Puma concolor) a una declinación poblacional de la vizcacha (Lagostomus maximus) en el desierto del Monte, Argentina
- Author
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Marcelo E. M. Pessino, José H. Sarasola, Claudio Wander, and Nestor Besoky
- Subjects
Environmental sciences ,GE1-350 ,Ecology ,QH540-549.5 - Abstract
El presente trabajo tuvo como objetivo examinar la dieta del puma (Puma concolor) en el área del Parque Nacional Lihue Calel, durante los períodos 1994-1997 y 2000. La muestra analizada consistió en 198 heces a partir de las cuales se identificaron 244 individuos presa, resultando el 97% mamíferos, el 2% aves y el 1% reptiles. En términos de biomasa relativa las grandes presas (> 20 kg) representaron el 40.6%, las presas medianas (1-20 kg) el 59.1% y las presas pequeñas (< 1 kg) el 0.3%. Entre 1994 y 1996 las vizcachas (Lagostomus maximus) fueron la principal presa del puma, a pesar de estar sufriendo una disminución de sus poblaciones. Este proceso quedó evidenciado en la dieta por una notable reducción y la posterior desaparición de esta presa. Paralelamente se incremento el consumo de otras presas medianas, especialmente armadillos (Chaetophractus villosus y Zaedyus pichiy) y ungulados (Sus scrofa y Lama guanicoe). Durante el período de estudio los valores de amplitudes de nicho trófico y peso promedio de presas fueron, en general, superiores a los registrados para el área en trabajos previos.
- Published
- 2001
10. Caracterización de fragmentos génicos desconocidos que fueron asociados con la apomixis y/o la poliploidía en Paspalum notatum
- Author
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Ochogavía, Ana Claudia and Pessino, Silvina Claudia
- Subjects
Genómica ,Paspalum notatum ,Apomixis ,Poliploidía - Abstract
La apomixis es una forma de reproducción asexual vía semillas frecuentemente asociada a la poliploidía. El objetivo de este trabajo fue inferir la función de 58 transcriptos desconocidos, que participan de los procesos de apomixis y/o poliploidización en Paspalum notatum. Utilizando amplificaciones rápidas de los extremos del cDNA se obtuvieron las secuencias completas de varios candidatos, que resultaron similares a elementos repetitivos portadores de segmentos génicos transduplicados o a precursores de miRNA de plantas. Para ambos tipos de secuencias se propuso un posible rol regulatorio, y se determinaron in silico los blancos putativos. Se eligieron secuencias representativas de cada uno de estos grupos, y se realizaron estudios experimentales para lograr una anotación funcional inequívoca. Para ello se analizó el número de copias genómicas, la posición en el genoma, la expresión cuantitativa durante el desarrollo reproductivo y la localización in situ de la actividad génica. También se realizaron análisis de display diferencial específicos para aislar retrotransposones con segmentos transduplicados relacionados y estudios de clivado específico de los blancos regulatorios de los miRNAs. Los resultados presentados en esta tesis aportan las primeras evidencias acerca del rol regulatorio que los retrotransposones y los miRNAs podrían estar desempeñando durante el desarrollo apomíctico. Apomixis is an asexual mode of reproduction via seeds commonly associated with polyploidy. The objective of this research work was to ascribe a functional identity to 58 unknown transcripts related to apomixis and/or polyploidization in Paspalum notatum. We used rapid amplification of cDNA ends to obtain full sequences for several candidates, which resulted homologous to retrotransposons carrying transduplicated gene segments or plant miRNA precursors. For both sequence types a regulatory role was proposed, and the identities of the putative targets were determined in silico. Representative sequences were selected to carry out experiments in order to achieve positive functional annotation. We analyzed gene copy numbers, positions in the genome, quantitative expressions at different developmental stages, and in situ localization of gene activity. Specific differential display analysis were conducted to isolate related retroelements containing gene transduplicated segments. Specific clivage analysis of the miRNA putative targets was also performed. Results presented here provide evidence on the regulatory role that both retrotransposons and miRNAs could be performing in apomixis development. Ochogavía, Ana Claudia. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina Ochogavía, Ana Claudia. CONICET; Argentina
- Published
- 2011
11. Transferencia de marcadores EST-SSR y COS desde especies modelo a Paspalum notatum y estudios de mapeo comparativo
- Author
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Siena, Lorena Adelina, Ortiz, Juan Pablo, and Pessino, Silvina
- Subjects
Mapas genéticos ,Marcadores genéticos ,Paspalum notatum - Abstract
Paspalum es un género perteneciente a la familia de las Poaceae que cuenta con más de 300 especies. Las mismas muestran una gran variación en los niveles de ploidía y modos de reproducción. En general, los citotipos diploides son sexuales y los poliploides sexuales o apomícticos. Dada su complejidad, el género ha sido dividido en subgéneros y grupos informales. Varias especies representan importantes recursos forrajeros de las regiones tropicales y subtropicales de América. En particular, P. notatum Flüggé es una gramínea rizomatosa perenne cuyas razas tetraploides se reproducen casi exclusivamente por apomixis de tipo apospórica. La aposporía en P. notatum está controlada por un locus simple dominante con segregación distorsionada. Trabajos previos posibilitaron el desarrollo de mapas genéticos al nivel tetraploide y la identificación de la región genómica responsable de la aposporía. A partir de los proyectos de secuenciación masiva de genomas se han desarrollado distintos tipos de marcadores moleculares de secuencia conocida. Los microsatélites génicos (EST-SSR) derivan de secuencias expresadas que contienen repeticiones microsatélites (SSR) internas. Los marcadores COS provienen de genes que contienen regiones conservadas entre especies poco relacionadas. Estos tipos de marcadores son relativamente simples de desarrollar y han mostrado un alto nivel de polimorfismo y transferibilidad entre especies. Los objetivos de este trabajo de tesis fueron transferir marcadores de secuencia conocida (EST-SSR, SSR genómicos y COS) a P. notatum y caracterizar los grupos de ligamiento de la especie por medio de análisis comparativos. Asimismo, se realizaron estudios para determinar la utilidad de estos marcadores en otras especies del género y su aptitud para la realización de estudios de filogenia. Como material vegetal se emplearon los genotipos tetraploides de P. notatum Q4188 (sexual) y Q4117 (apomíctico) y una población F1, derivada de ambos. Además fueron incluidas 33 accesiones correspondientes a 11 especies y seis grupos taxonómicos diferentes. Marcadores EST-SSR de trigo y SSR genómicos de P. notatum fueron ensayados sobre los genotipos Q4188 y Q4117. Paralelamente se desarrollaron marcadores COS a partir de genes asociados a componentes de la apomixis en gramíneas. Los marcadores obtenidos fueron localizados en los mapas de Q4188 y Q4117 utilizando los programas de mapeo Mapmaker 3.0/exp y JoinMap 3.0. Cuarenta y cuatro y 66 nuevos marcadores fueron integrados a los mapas de Q4188 y Q4117, respectivamente. Los marcadores Resumen x incorporados extendieron las distancias genéticas cubiertas por ambos mapas y posibilitaron la identificación de nuevos grupos de ligamiento. Las secuencias de varios EST-SSR de P. notatum mostraron similitudes con los clones originales de trigo (de los cuales derivan) y confirmaron la identificación de secuencias ortólogas entre ambas especies. Paralelamente un análisis de mapeo in silico permitió determinar la localización de los marcadores empleados en los genomas de arroz y maíz. Los estudios comparativos detectaron varios segmentos cromosómicos conservados entre P. notatum, arroz y maíz. En especial, se determinó que 12 marcadores resultaron asociados a los grupos de ligamiento relacionados con la aposporía. Los marcadores Ksum206dd y Ksum219bd fueron localizados a ambos lados del locus responsable del carácter. La utilidad de los marcadores EST-SSR y SSR genómicos en otras especies del género y su capacidad para realizar estudios de filogenia fueron analizadas. Como control externo se utilizó trigo pan (Triticum aestivum L.) cv. Federal. Los marcadores EST-SSR generaron 166 fragmentos con un promedio de 6,16 fragmentos polimórficos por grupo. Los SSR genómicos produjeron 104 fragmentos totales con un promedio de 4,39 fragmentos polimórficos por grupo. Los análisis de agrupamiento permitieron discriminar entre grupos taxonómicos y especies dentro de cada grupo. Los resultados presentados en esta tesis demuestran la factibilidad de transferir marcadores EST-SSR y COS a P. notatum y contribuyen al conocimiento de la estructura genómica de las razas tetraploides de la especie. En particular, la identificación de secuencias ortólogas entre P. notatum, arroz y maíz permitió detectar varios segmentos cromosómicos conservados en las tres especies e iniciar estudios de mapeo comparativo. La localización de varios marcadores en los grupos de ligamiento asociados a la aposporía permitió una mejor caracterización de esta región genómica y la definición de un segmento del genoma de arroz que contendría genes candidatos a controladores del carácter. Se demostró asimismo la posibilidad de emplear estos marcadores en varias especies del género y su utilidad para la realización de estudios de filogenia. Paspalum is a genus of the grass family with more than 300 species. Due to its taxonomic complexity, it has been divided in several subgenera and informal groups. Many Paspalum species consist of sexual-diploid and apomictic-polyploid cytotypes, and several have arisen through hybridization. Moreover, some members of the genus are important natural forages for tropical and subtropical regions of America. In particular, tetraploid race of P. notatum (bahiagrass) reproduces by aposporous apomixis. Apospory in the species is controlled by a single dominant locus with a distorted segregation ratio. Previous research reported the construction of a genetic linkage map for the species and the localization of the genomic region responsible for apospory (ASGR). The objectives of this study were i) to transfer molecular markers of known sequences (EST-SSR, genomic SSR and COS) to P. notatum and characterize the genome of the species by a comparative analysis, and ii) to determine the usefulness of these kind of markers for taxonomic studies in the genus Paspalum. As plant material the tetraploid genotypes Q4188 (sexual) and Q4117 (apomicts) and a F1 mapping population derived from them were used. Moreover, 33 accessions belonging to 11 species and six informal taxonomic groups were included. Hexaploid wheat (Triticum aestivum L.) was used as external control. Sequences of both wheat EST-SSR and P. notatum genomic SSR markers were retrieved from public databases. COS markers were developed from genes associated with components of apospory. All markers tested showed a high rate of transferability and a good level of polymorphism. Sequence of several EST-SSR markers isolated from P. notatum showed similarity with the corresponding wheat clones from which they derived, and thus, confirmed the identification of orthologous sequences between the two species. The localization of markers in the genetic maps of Q4188 and Q4117 extend the genetic coverage of both maps and allowed the recognition of several chromosome segments conserved between bahiagrass, wheat and rice. Two markers at both sides of the ASGR were identified. Assays of markers on Paspalum accessions confirmed they capability for detecting polymorphic loci. Moreover, markers specific of species and groups were detected. Clustering analysis was in agreement with previous reports. Results presented in this work proved the transferability of EST-SSR markers to Paspalum species and contribute to the genetic characterization of the P. notatum genome. Moreover, a new set of markers for phylogenetic analysis in the genus is presented. Fil: Apellido, Nombre. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina Fil: Siena, Lorena Adelina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina
- Published
- 2011
12. Molecular Mechanisms of Expression of Components of Plant Respiratory Complex
- Author
-
Comelli, Raúl Nicolás, González, Daniel Héctor, Pessino, Silvia Claudia, Podestá, Florenccio Esteban, and Bártoli, Carlos Guillermo
- Subjects
COX5B subunit ,Genes nucleares ,Arabidopsis thaliana ,Mitocondrial respiratory chain ,Complejo iv ,Promoter analysis ,Cadena respiratorio mitocondrial ,Complex iv ,Subunidad cox5b ,Nuclear genes ,Análisis de promotores - Abstract
Fil: Comelli, Raúl Nicolás. Universidad Nacional del Litoral. Facultad de Bioquímica y Ciencias Biológicas; Argentina. La biogénesis de la maquinaria respiratoria mitocondrial de plantas requiere la síntesis y el ensamblado en forma coordinada de los productos de más de cien genes localizados en el núcleo y dentro de la organela. La citocromo c oxidasa (COX), enzima terminal de la cadena respiratoria mitocondrial, está compuesta por al menos diez polipéptidos diferentes, tres de ellos codificados en el genoma mitocondrial y los restantes en el genoma nuclear. Entonces, es lógico asumir que el correcto ensamblado de COX requiere la expresión coordinada de los genes codificantes para las diferentes subunidades de la mencionada enzima, o al menos de la mayoría de ellos. En este Trabajo de Tesis, se ha caracterizado la expresión de los dos genes nucleares de Arabidopsis codificantes para la subunidad 5b de la citocromo c oxidasa, la subunidad de codificación nuclear más conservada. En los dos capítulos iniciales se describe el análisis de la región promotora de los genes COX5b-1 (At3g15640) y COX5b-2 (At1g80230) mediante la utilización de plantas transformadas en forma estable con fragmentos mutados de promotor fusionados al gen reportero gus. Se determinaron los patrones de expresión conducidos por cada promotor y se identificaron numerosos elementos de ADN y agentes metabólicos regulatorios. En el siguiente capítulo se presentan los factores de transcripción identificados mediante ensayos de simple híbrido en levaduras y en el último capítulo se analiza la presencia en el genoma de Arabidopsis de los dos genes estudiados en función de las hipótesis planteadas por el modelo DDC de duplicación de genes. The biogenesis of the plant mitochondrial respiratory chain needs the coordinated synthesis and assembly of the products of more than 100 genes located in the nucleus and within the organelle. This regulation operates at the transcriptional level through ele-ments present in the promoter regions of respiratory chain component genes. Cytochrome c oxidase (COX), the terminal enzyme of the mitochondrial respiratory chain, is composed of at least ten different polypeptides encoded either in the mitochondrial genome or the nuclear genome. Then, it is logical to assume that correct COX assembly requires the co-ordinated expression of the genes that encode its different subunits, or at least most of them. In this thesis we have characterized the expression of the two Arabidopsis nuclear genes encoding cytochrome c oxidase subunit 5b (COX5b), the most conserved nuclear-encoded subunit. In the first chapters, the promoter regions of COX5b-1 (At3g15640) and COX5b-2 (At1g80230) genes were analyzed using plants stably transformed with mutagenized promoter fragments fused to the gus reporter gene. We determine expression patterns driven by each promoter and we identified several DNA regulatory elements and meta-bolic agents. In the next chapter, we present the transcription factors identified using yeast one-hybrid assays. In the last chapter, we analyzed if the presence in the Arabidopsis genome of the two COX5b genes could be explained by the DDC model for gene duplication. Universidad Nacional del Litoral Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica
- Published
- 2010
Catalog
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