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Human intestinal mucus essentially consists of a network of Mucin2 glycoproteins embedded in many lower molecularweight proteins. This paper contributes to the proteomic study of human intestinal mucus by comparing two sample collectionmethods (transanal irrigation and brush cytology during proctosigmoidoscopy) and analysis techniques (electrophoresis anddigestion in solution). The entire sample collection and treatment process is explained, including protein extraction, digestion anddesalination and peptide characterisation using a nanoAcquity UPLC chromatograph coupled to an HDMS spectrometer equipped with a nanoESI source. Collecting mucus via transanal irrigation provided a larger sample volume and protein concentration from a single patient. The proctosigmoidoscopy sample could be analysed via digestion in solution after depleting albumin. The analysisindicates that a simple mucus lysis method can evaluate the electrophoresis and digestion in solution techniques. Studying human intestinal mucus complexes is important because they perform two essential survival functions for humans as the first biochemical and physical defences for the gastrointestinal tract and a habitat for intestinal microbiota, which are primarily hosted in the colon and exceeds the human genetic information and cell number 100- and 10-fold (1). Human intestinal mucus essentially consistsof a network of Mucin2 glycoproteinsembedded in many lower molecularweight proteins. This paper contributes tothe proteomic study of human intestinalmucus by comparing two sample collectionmethods (transanal irrigation and brushcytology during proctosigmoidoscopy) andanalysis techniques (electrophoresis anddigestion in solution). The entire samplecollection and treatment process is explained,including protein extraction, digestion anddesalination and peptide characterisationusing a nanoAcquity UPLC chromatographcoupled to an HDMS spectrometer equippedwith a nanoESI source. Collecting mucus viatransanal irrigation provided a larger samplevolume and protein concentration from asingle patient. The proctosigmoidoscopysample could be analysed via digestion insolution after depleting albumin. The analysisindicates that a simple mucus lysis methodcan evaluate the electrophoresis and digestionin solution techniques. Studying humanintestinal mucus complexes is importantbecause they perform two essential survivalfunctions for humans as the first biochemicaland physical defences for the gastrointestinaltract and a habitat for intestinal microbiota,which are primarily hosted in the colon andexceeds the human genetic information andcell number 100- and 10-fold (1).

Introducción. Los programas de visualización permiten profundizar el conocimiento teórico sobre la estructura proteica. Este trabajo tiene por finalidad familiarizar al alumno con el manejo del programa de visualización molecular RasMol v. 2.7.2 para el análisis de proteínas, ya que integra conocimientos previos y persigue otros objetivos generales de la formación universitaria. Materiales y métodos. El trabajo se contextualizó considerando el eje integrador de las materias. Además, se articuló con los contenidos conceptuales y procedimentales de la temática "Niveles estructurales de las proteínas". En primer lugar, se seleccionaron actividades que permitieran evaluar aspectos vinculados con la formación general pretendida para este nivel de la enseñanza formal, como expresión escrita y oral, interpretación de textos científicos en idioma inglés y manejo de base de datos bibliográficos. Resultados y conclusiones. El 70% de los alumnos pudo realizar las actividades de manera satisfactoria. La mayoría de los grupos enfatizó tanto las cuestiones teóricas como las netamente inherentes al manejo del programa. El 30% tuvo problemas de expresión oral y escrita. Se notaron algunas dificultades en la interpretación de los modelos teóricos planteados y en la interpretación del idioma inglés, pero también hubo desconocimiento previo de la temática y falta de iniciativa para la búsqueda de material complementario. Se propone la inclusión de algunas revisiones en idioma nativo, sin perjuicio de los textos en inglés, y ejemplos más sencillos de manera introductoria para los programas de visualización, con una paulatina incorporación de ejemplos más complejos que requieran lectura complementaria. Introduction. Visualizations programs allow to analyze deeply theoretical knowledge of protein structure. The aim of this work was to familiarize the students with the molecular visualization program RasMol v. 2.7.2 for protein analysis, integrating previous concepts and pursuing other general objectives of university formation. Materials and methods. The work was contextualized considering the integrative axis of the subjects, articulating it with conceptual and procedural contents of the topic "Protein Structure Levels". Activities were selected in order to evaluate different aspects of the general formation pretended at this level of teaching, like oral and written expression, interpretation of scientific papers in English, and bibliographic database search. Results and conclusions. 80% of the students were able to do the proposed activities with acceptable quality. Most of the students equally emphasized both the theoretical and practical procedures. 30% of the students have shown problems with oral or written expression. We noticed some difficulties in the interpretation of the proposed theoretical models and interpretation of the scientific papers in English. Additionally students did not show previous knowledge of the topics and did not look up for complementary bibliography. We propose to include some reviews in native language and simpler examples to serve as an introduction to the visualization program, with gradual incorporation of more complex models that require complementary bibliography reading.

Las lipasas son enzimas que catalizan la hidrolisis y la síntesis de ésteres formados a partir de glicerol y ácidos grasos, están presentes en diferentes organismos, sin embargo, las lipasas microbianas son de mayor interés comercial. Estas son altamente usadas en industrias como la alimenticia, papelera y farmacéutica, aplicabilidad que se limita por la poca evaluación de microorganismos productores de lipasas para procesos específicos, el alto costo de producción y problemas asociados al uso sistémico de las enzimas. El fundamento de este estudio es seleccionar a partir de un grupo de microorganismos de los géneros Aspergillus, Penicillium, Fusarium, Trichoderma y Botrytis, un microorganismo capaz de producir enzimas lipídicas en un medio complejo con un sustrato de bajo costo, como un residuo agroindustrial. Para ello se evaluó el crecimiento radial de los microorganismos en un medio sólido definido con aceite de oliva como única fuente de carbono y energía, se seleccionaron aquellos con mayor crecimiento para determinar los parámetros cinéticos y actividad lipídica en un cultivo sumergido con un medio graso definido, y evaluar el crecimiento y producción de enzimas lipídicas en un medio complejo cuyo sustrato graso fue la pulpa residual de la industria del aceite de palma. Entre los microorganismos evaluados, se encontró que los géneros Aspergillus y Penicillium produjeron lipasas permitiendo su crecimiento en medios definidos con lípidos como única fuente de carbono y energía, adicionalmente, las lipasas producidas por Aspergillus flavus presentan mayor actividad en comparación con las producidas por Penicillium, sin embargo, este microorganismo presento una baja actividad lipídica por microgramo de proteína que tuvo, en el cultivo en medio complejo que fue de 5,12x10-3 U/mg respecto a la obtenida en medio definido de 1,94x10-2 U/mg, Lipases are enzymes that catalyze the hydrolysis and synthesis of esters formed from glycerol and fatty acids. fatty acids, are present in different organisms, however, microbial lipases are of greater interest commercial. These are highly used in industries such as food, paper and pharmaceutical, applicability that is limited by the little evaluation of lipase-producing microorganisms for specific processes, the high production cost and problems associated with the systemic use of enzymes. The rationale for this study is to select from a group of microorganisms of the genera Aspergillus, Penicillium, Fusarium, Trichoderma and Botrytis, a microorganism capable of producing lipid enzymes in a complex medium with a low-cost substrate, as an agro-industrial residue. For this, the radial growth of microorganisms in a solid medium defined with olive oil was evaluated. as the only source of carbon and energy, those with the highest growth were selected to determine the kinetic parameters and lipid activity in a submerged culture with a defined fatty medium, and evaluate the and production of lipid enzymes in a complex medium whose fatty substrate was the residual pulp of the palm oil industry. Among the microorganisms evaluated, it was found that the genera Aspergillus and Penicillium produced lipases. following its growth in defined media with lipids as the only source of carbon and energy, In addition, the lipases produced by Aspergillus flavus have higher activity compared to those produced by Penicillium, however, this microorganism has low lipid activity due to microgram of protein that it had, in the culture in complex medium that was 5.12x10-3 U/mg with respect to the obtained in defined medium of 1.94x10-2 U/mg

La melanopsina és una proteïna d'un tipus específic de cèl·lules ganglionars de la retina que és activada per la llum i té un paper rellevant en el rellotge biològic que regula els ritmes circadians i el son.Treball bibliogràfic de 6 crèdits.

En este trabajo se propone utilizar una Red Neuronal Artificial (RNA) Perceptrón Multicapa (PMC) para simular la variación de la concentración de proteína de acuerdo con el tiempo y también para determinar la hora final del procedimiento, además de los parámetros óptimos del proceso de biodegradación de las proteínas de un efluente de matadero. Para eso, han sido utilizadas las papaínas, presentes en el látex de la papaya (Carica papaya) con el objetivo de disminuir la concentración de proteínas de un efluente de matadero a pH (5 y 7) con una temperatura de (25 y 30° C) controlada. Los resultados mostraron que las papaínas redujeron de 82% a 91% la concentración de proteína en 30 y 40 h de proceso. Las simulaciones con la RNA apuntaron que las condiciones perfectas fueron obtenidas a pH 5, con 30 °C y en 35 h, en el cual se ha alcanzado una reducción de 91% de la concentración de proteínas. In this paper, the use of a multilayer perceptron (MLP) artificial neural network (ANN) is proposed to simulate the variation of protein concentration according to the time and also to determine the end and optimal conditions of the biodegradation process of wastewater from meat industry. To reduce the protein concentration, papains from Carica papaya latex have been used at controlled condition of pH (5 and 7) and temperature (25 and 30 °C). Results showed that a reduction of 82 to 91% of protein concentration by the action of papains for 30 to 40 h of process time. Simulations showed that the best condition of the process occurred at pH 5, 30 °C and 35 h, in which a maximum biodegradation of 91% was obtained.

Les proteïnes són macromolècules formades per cadenes lineals d'aminoàcids. Un aminoàcid, com el seu nom indica, és una molècula orgànica amb un grup amino (-NH2) i un grup carboxil (-COOH; àcid). Les proteïnes ocupen un paper fonamental en els éssers vius i són les biomolècules més versàtils i diverses. Realitzen una enorme quantitat de funcions diferents: estructural, reguladora, transportadora, defensiva, enzimàtica, contràctil, etc. Les proteïnes de tot ésser viu estan determinades majoritàriament pel seu genètica, és a dir, la informació genètica determina en gran mesura quines proteïnes té una cèl·lula, un teixit i un organisme. Se sintetitzen depenent de com es trobin regulats els gens que les codifiquen. Per tant, són susceptibles a senyals o factors externs. Aquest projecte està enfocat des del punt de vista experimental cap a la investigació, amb l'objectiu de posar a punt un protocol per a clonar, expressar i purificar una proteïna reguladora del metabolisme del glicogen denominada glicogen sintasa. Per a això utilitzarem tècniques bàsiques de biologia molecular i tècniques cromatogràfiques amb FPLC. La glicogen sintasa és una proteïna de gran interès per a investigadors, ja que la seva funció en l'organisme és clau per a la síntesi del glicogen, reserva d'energia cel·lular, i la seva inactivitat provoca malalties com la diabetis mellitus entre unes altres. Si assolim l'objectiu de purificar l'enzim actiu, es podran realitzar experiments per a determinar la seva estructura. El coneixement de l'estructura de proteïnes, llança llum sobre el seu centre catalític i interaccions amb la resta d'enzims i metabòlits.