Considering the increase in toxic cyanobacterial blooms and the high cost of toxin removal using conventional systems of water treatment, monitoring cyanobacteria in the public supply springs is fundamental to evaluate the risks of a possible toxin-producing strain. The objectives of the present work were to identify and quantify cyanobacteria found in springs of water sources for the public supply system in the municipal district of Viçosa- MG; associate cyanobacterial cell density with limnological variables; identify seasonal patterns of cyanobacteria populations; isolate genera and species of cyanobacteria and store in culture bank and investigate the microcystin production in potentially toxic species using the ELISA Test (Enzime-Linked Immuno Sorbent Assay). Water samples were collected from the rivers São Bartolomeu and Turvo Sujo, both being sources for capturing water used for public supply in the city of Viçosa. The following physical, chemical and physicochemical water variables were analyzed: temperature, pH, dissolved oxygen, total nitrogen, total phosphorus, nitrate, ammonium and alkalinity. Monthly sample collections were carried out in four selected sites (P1, P2, P3 and P4) from September/05 to August/06. The samples for qualitative phytoplankton analysis were collected by horizontal towing a 20 μm plankton net through the surface of the water column. Subsurface crude water samples (20-cm depth) were collected with a flask for the quantitative analysis. The isolated species were kept in growth chamber under photoautotrophic conditions. During the period of study, 18 taxa were identified, totaling four orders: Chrooccocales (11.1%); Oscillatoriales (38.9%); Nostocales (44.4%) and Stigonematales (5.6%). Nostocales and Oscilatoriales were the orders with the largest numbers of representatives, with eight and seven taxa respectively, followed by the orders Chrooccocales (2) and Stigonematales (1). Three genera were identified in the order Nostocales, which were represented by the taxa Anabaena ambigua, A. inaequalis, Calotrhrix braunii, Nostoc cf. carneum, N. commune, N. microscopicum, N. cf. muscorum and Nostoc sp. The order Oscilatoriales had five genera identified, which were represented by the taxa: Geitlerinema splendidum, Limnothrix sp., Oscillatoria subbrevis, Phormudium granulatum, P. cf. retzii, Pseudanabaena galeata and P. catenata. The order Chrooccocales was represented by two genera with a single species in each genus; Synechococcus nidulans and Synechocystis cf. aquatilis. The order Stigonematales included only one genus (Stigonema), with non-identified species. The cyanobacterial cell densities found in the four sampled sites were below the determination of the Brazilian Ministry of Health s Directive 518 of 25 March 2004 on the monitoring the quality of water intended for human consumption. The species Nostoc cf. commune had positive result for microcystin in the sites P1, P2 and P3. The Canonical Correspondence Analysis through the Monte Carlo test showed that the analyzed variables had no significant influence on cyanobacterial cell densities. No regular pattern of cyanobacteria distribution was observed in the sampled sites during the period of study. Routine water source monitoring is recommended as part of ETA's operations, as a preventive measure for the occurrence of potentially toxic cyanobacterium strains. A manual for the identification of the cyanobacteria found in the studied water sources was developed to aid the work of the technicians in charge of the quality of water, which certainly will facilitate species recognition, making it possible the necessary measures in the public water treatment operation, in case an increase in cell density occurs, particularly of potentially toxic species. Considerando o aumento das florações tóxicas e o alto custo na remoção das toxinas pelos sistemas convencionais de tratamento de água, o monitoramento de cianobactérias nos mananciais de abastecimento público é fundamental para que possam ser avaliados os riscos de possível presença de cepa produtora de toxina. O presente trabalho teve como objetivos avaliar a ocorrência de cianobactérias em mananciais de abastecimento público do município de Viçosa, isolar, identificar e manter um banco de culturas com as espécies de cianobactérias encontradas nesses mananciais, correlacionar a densidade de células com os fatores ambientais, reconhecer os padrões temporais da comunidade de cianobactérias em função das estações do ano e detectar a produção de microcistina nas espécies potencialmente tóxicas por meio do Teste ELISA (Enzime-Linked Immuno Sorbent Assay). As amostras de água foram coletadas no Ribeirão São Bartolomeu e no Rio Turvo Sujo, principais redes de drenagem de águas fluviais no município, mananciais onde são feitas as captações de água para abastecimento público da cidade de Viçosa. Foram analisadas as seguintes variáveis físicas e químicas da água: temperatura, pH, oxigênio dissolvido (OD), nitrogênio total, fósforo total, nitrato, amônio e alcalinidade. Durante o período de setembro/05 a agosto/06, foram realizadas coletas mensais, em quatro pontos selecionados (P1, P2, P3 e P4). Para a análise qualitativa foi utilizada rede de fitoplâncton com abertura de malha de 20 bm, com a qual foram realizados arrastos horizontais na superfície da coluna d água. Para a análise quantitativa, foram realizadas coletas subsuperficiais através da passagem de frasco que permitiu coletar água bruta numa faixa de 20 cm de profundidade. As espécies isoladas foram mantidas em sala de crescimento, sob condições fotoautotróficas. Durante o período de estudo foram identificados 18 táxons, totalizando quatro ordens: Chrooccocales (11,1%); Oscillatoriales (38,9%); Nostocales (44,4%) e Stigonematales (5,6%). Nostocales e Oscilatoriales foram as ordens mais representadas, com oito e sete táxons, respectivamente, seguida da ordem Chrooccocales (2) e Stigonematales (1). Na ordem Nostocales, foram identificados três gêneros, representados pelos táxons: Anabaena ambigua, A. inaequalis, Calotrhrix braunii, Nostoc cf. carneum, N. commune, N. microscopicum, N. cf. muscorum e Nostoc sp. Para a ordem Oscilatoriales, foram identificados cinco gêneros representados pelos táxons: Geitlerinema splendidum, Limnothrix sp., Oscillatoria subbrevis, Phormudium granulatum, P. cf. retzii, Pseudanabaena galeata e P. catenata. A ordem Chrooccocales, foi representada por dois gêneros com uma espécie em cada gênero Synechococcus nidulans e Synechocystis cf.. aquatilis. Na ordem Stigonematales registrou-se apenas um gênero (Stigonema), com espécie não identificada. As densidades de células de cianobactérias encontradas nos quatro pontos amostrados ficaram abaixo do que determina a Portaria do Ministério da Saúde Nº 518, de 25 de março de 2004, que estabelece procedimentos para o monitoramento da qualidade da água para consumo humano. O resultado para microcistina foi positivo para a espécie Nostoc cf. commune, encontrada em P1, P2 e P3. O resultado da análise Canônica de Correspondência revelou por meio do teste de Monte Carlo, que estatisticamente, as variáveis analisadas não influenciaram na densidade de células de cianobactérias. Não foi observado um padrão regular na distribuição das cianobactérias nos pontos amostrados durante o período de estudo. Sugere-se que o monitoramento dos mananciais seja incluído na rotina das ETA s, como uma medida preventiva da ocorrência de cepas de cianobactérias potencialmente tóxicas. Como subsídio para os trabalhos desenvolvidos pelos técnicos responsáveis pela qualidade da água, foi elaborado um manual de identificação e caracterização das cianobactérias encontradas nos mananciais estudados, o que certamente facilitará o reconhecimento das espécies presentes, possibilitando a tomada de medidas necessárias na operação do sistema de tratamento de água, caso ocorra um aumento na densidade de células de cianobactérias, principalmente de espécies potencialmente tóxicas.