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No presente estudo, objetivou-se avaliar a divergência genética de indivíduos de quatro populações de fáfia [Pfaffia glomerata (Spreng.) Pedersen] coletadas na região do rio Paraná por meio de estudos de caracteres morfológicos associados à produção de β-ecdisona. A divergência foi avaliada entre 64 indivíduos utilizando 14 caracteres morfológicos quantitativos, incluindo o teor de β-ecdisona. Os dados foram interpretados pelas médias dos caracteres, índice de dissimilaridade de Mahalanobis, agrupamento pelo método UPGMA e correlação simples de Pearson. Os resultados demonstraram maiores valores de divergência entre indivíduos pertencentes a diferentes populações e menores, entre indivíduos da mesma população. Os indivíduos pertencentes à população 1, coletados à margem do rio Ivaí, destacaram-se pelos altos valores de β-ecdisona, predominando o seguinte perfil: matéria seca da raiz abaixo da média geral (135,1 g planta-1); antese precoce em relação a média geral (135,8 dias); dias para ocorrer a senescência de 90% das folhas abaixo da média geral (201,4 dias); e intervalo entre antese e senescência acima da média (65,6 dias). Os caracteres avaliados demonstraram significativa variação entre os indivíduos, no entanto, não foi possível observar dados que evidenciam a correlação entre a produção de β-ecdisona e caracteres morfológicos avaliados no presente estudo. The present study aimed to evaluate the genetic divergence among individuals from four Pfaffia glomerata populations collected in the region of Paraná River, Brazil, based on the study of morphological characters associated with β-ecdysone production. The divergence among 64 individuals was estimated using 14 quantitative morphological characters, including -ecdysone content. Data were evaluated considering general mean of the characters, Mahalanobis dissimilarity index, UPGMA grouping method, and Pearson correlation. Results indicated higher divergence among individuals from different populations and lower divergence among those from the same population. Individuals from population 1, collected at the shore of Ivaí River, had high β-ecdysone content, with predominance of the following profile, compared to the general mean: lower root dry matter (135.1 g plant-1); earlier anthesis (135.8 days); smaller number of days to senescence of 90% of the leaves (201.4 days); and longer interval between anthesis and senescence (65.6 days). The evaluated characters significantly varied among individuals; nevertheless, the correlation between β-ecdysone production and the evaluated morphological characters could not be evidenced.