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Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2022-11-25T21:50:44Z No. of bitstreams: 1 Andreia Michelle Alves Cunha de Alcantara.pdf: 1637702 bytes, checksum: 8d2485dabe13c44ce817311426867171 (MD5) Made available in DSpace on 2022-11-25T21:50:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Andreia Michelle Alves Cunha de Alcantara.pdf: 1637702 bytes, checksum: 8d2485dabe13c44ce817311426867171 (MD5) Previous issue date: 2021-03-03 Coronavirus disease-2019 (COVID-19), a zoonosis resulting from infection by Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus-2 (SARS-CoV-2), continues to end lives. Despite the numerous studies carried out around the world, the information regarding the virus and the disease are inconclusive. There is no curative medication or vaccine available universally, so far. Under these circumstances, the aim of this research was to develop a literature review, covering the historical and epidemiological aspects of the disease, the viral cycle and pathogenesis of SARS-CoV-2, the development of vaccines, the protective measures adopted and the impact of COVID-19 in the world economy. The review was based on scientific publications and government platforms National Center for Biotechnology, National Institutes of Health, Centers for Disease Control and Prevention, World and Health Organization and Brazil, between 2003 and 2021. The research revealed that Coronaviruses represent a serious threat to global health, as previously evidenced by the Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus (SARS-CoV), the Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV) and, currently, SARS-CoV-2. COVID-19 emerged in December 2019, in China, and since then there has been a significant increase in the number of cases worldwide, causing the World Health Organization to declare it a pandemic, the effects of which have been collapsing the system and triggering a negative impact on the world economy. The transmission of COVID-19 occurs mainly through the airways, followed by binding of the SARS-CoV-2 spike protein to the human Angiotensin-Converting Enzyme (host receptor), with consequent viral fusion and establishment of infection. As the symptoms of COVID-19 are nonspecific, ranging from oligo-symptomatic to Acute Respiratory Discomfort Syndrome and / or Systemic Syndrome, the definitive diagnosis is obtained by molecular tests (detecting viral genetic material) and immunological tests (detecting host antibodies). Once the infection is confirmed, the treatment is symptomatic, aiming at easing the patient's suffering and, in critical cases, maintaining the functions of his vital organs. Due to absence of curative medication, the development and availability of vaccines can be decisive for to deal with the pandemic. Currently, more than 150 vaccines have been developed using traditional platforms (weakened or killed virus vaccines) and new generation (Deoxyribonucleic Acid vaccines; Ribonucleic Acid; viral protein; viral vector - human adenovirus or chimpanzee adenovirus) in an unprecedented short time. Among the platforms, it is worth highlighting the chimpanzee adenovirus platform, known for having a high degree of safety and immunogenicity in combating several infections, including infection by MERS-CoV, as demonstrated by the ChAdOx1-MERS vaccine. Immediately after the release of the SARS-CoV-2 genome, the ChAdOx1-MERS platform was adapted for the development of the ChAdOx1-nCoV-19 vaccine (against SARS-CoV-2), a safe and effective immunizer. Therefore, it is possible to conclude that knowledge about other Coronaviruses has been contributing to the development of vaccines against COVID-19, and that the capacity of the health system, the cooperation of the population and government intervention, are essential to face the pandemic, until there is more knowledge about the virus and availability of vaccines worldwide. A doença do Coronavírus-2019 (COVID-19), zoonose decorrente da infecção pelo Coronavírus da Síndrome Respiratória Aguda Severa-2 (SARS-CoV-2), continua cessando vidas. Apesar dos inúmeros estudos realizados em todo o mundo, as informações referentes ao vírus e à doença são inconclusivas, não havendo, até o momento, medicação curativa nem vacina disponibilizada universalmente. Diante do exposto, o objetivo da presente pesquisa foi desenvolver uma revisão de literatura, contemplando os aspectos históricos e epidemiológicos da doença, o ciclo viral e patogenia do SARS-CoV-2, o desenvolvimento de vacinas, as medidas protetivas adotadas e o impacto da COVID-19 na economia mundial. A revisão fundamentou-se em publicações científicas e nas plataformas governamentais National Center for Biotechnology, National Institutes of Health, Centers for Disease Control and Prevention, World and Health Organization e Brasil, entre 2003 e 2021. A pesquisa revelou que os Coronavírus representam uma séria ameaça à saúde global, conforme evidenciado anteriormente pelo Coronavírus da Síndrome Respiratória Aguda Severa (SARS-CoV), pelo Coronavírus da Síndrome Respiratória do Oriente Médio (MERS-CoV) e, atualmente, pelo SARS-CoV-2. A COVID-19 emergiu em dezembro de 2019, na China e, desde então, vem ocorrendo um aumento expressivo do número de casos em todo o mundo, fazendo com que a Organização Mundial de Saúde a declarasse uma pandemia, cujos efeitos vêm colapsando o sistema de saúde e desencadeando um impacto negativo na economia mundial. A transmissão do SARS-CoV-2 ocorre, principalmente, através das vias respiratórias, sendo seguida da ligação da proteína de espícula do vírus à Enzima Conversora de Angiotensina humana (receptor hospedeiro), com consequente fusão viral e estabelecimento da infecção. Como os sintomas da COVID-19 são inespecíficos, variando de oligo-sintomáticos à Síndrome do Respiratória Aguda Grave e/ou Síndrome Sistêmica, o diagnóstico definitivo é obtido por testes moleculares (detectam material genético viral) e imunológicos (detectam anticorpos hospedeiros). Confirmada a infecção, o tratamento é sintomático, visando amenizar o sofrimento do paciente e, nos casos críticos, manter as funções de seus órgãos vitais. Ante a ausência de medicação curativa, o desenvolvimento e disponibilização de vacinas podem ser determinantes para o enfrentamento à pandemia. Atualmente, mais de 150 vacinas vêm sendo desenvolvidas através de plataformas tradicionais (vacinas de vírus enfraquecido ou morto) e de nova geração (vacinas de Ácido Desoxirribonucleico; Ácido Ribonucleico; proteína viral; vetor viral - adenovírus humano ou adenovírus de chimpanzé) em uma celeridade sem precedentes. Dentre as plataformas, torna-se válido destacar a plataforma de adenovírus de chimpanzé, conhecida por apresentar alto grau de segurança e imunogenicidade no combate a diversas infecções, inclusive infecção pelo MERS-CoV, conforme demonstrado pela vacina ChAdOx1-MERS. Imediatamente após a divulgação do genoma do SARS-CoV-2, a plataforma ChAdOx1-MERS foi adaptada para o desenvolvimento da vacina ChAdOx1-nCoV-19 (contra o SARS-CoV-2), imunizante seguro e eficaz. Portanto, é possível concluir que os conhecimentos sobre outros Coronavírus vêm contribuindo para o desenvolvimento de vacinas contra a COVID-19, e que a capacidade do sistema de saúde, a cooperação da população e a intervenção governamental, são essenciais para o enfrentamento à pandemia, até que haja maior conhecimento sobre o vírus e disponibilização de vacinas mundialmente.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2023-02-03T22:37:18Z No. of bitstreams: 1 Samantha Amorim Candido.pdf: 1264611 bytes, checksum: 4f9ab7280706c83746eae48d232b5ff9 (MD5) Made available in DSpace on 2023-02-03T22:37:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Samantha Amorim Candido.pdf: 1264611 bytes, checksum: 4f9ab7280706c83746eae48d232b5ff9 (MD5) Previous issue date: 2020-08-24 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES Parkinson's disease (PD) is the second most common neurodegenerative disorder among an elderly population, it has no cure and gold therapy for motor symptoms of the disease is levodopa (L-DOPA). In the long term, L-DOPA can lead to adverse symptoms, such as motor fluctuation, dyskinesia and visual hallucinations. And studies show a possible association between oxidative stress (OE) and L-DOPA therapy. The base excision repair (BER) pathway is responsible for controlling the damage caused by OE, the APE1 and XRCC1 proteins being fundamental in this process. Variations in the genes that encode these proteins can affect the efficiency of the repair, making the brain susceptible to damage caused by OE. Thus, the present study aimed to evaluate the relationship between the presence of polymorphisms in the Asp148Glu and Arg399Gln genes of the APE1 and XRCC1 genes, respectively, with the appearance of motor fluctuation, dyskinesia and visual hallucinations with response of the pharmacological response to L-DOPA, in PD patients. 110 patients were obtained from L-DOPA therapy over a period of 5 years. Patients were stratified into two groups according to the daily dosage of L-DOPA, group I taking ≤ 600mg / day and group II taking> 600mg / day. The Asp148Glu and Arg399Gln polymorphisms of the APE1 and XRCC1 genes were performed using the qPCR and PCR-RFLP technique, respectively. The analysis of logistic regression association with longer duration of therapy with L-DOPA (PR 1.1; CI -1.1-1.19; p = 0.001), appearance of motor fluctuation (PR 1.7; CI 1.3-2 , 2; p = 0.001) and the presence of the polymorphic genotype AA of the XRCC1 gene (PR 1.54; CI 1.04-2.27; p = 0.028). In addition to the presence of the GA genotype for the XRCC1 gene providing protection in patients treated with high doses of L-DOPA (PR 0.7; CI 0.5-0.9; p = 0.022). Our data occurred that this variation in the XRCC1 gene can influence the pharmacological response of L-DOPA in patients with PD, whereas the variation in the APE1 gene does not seem to influence the treatment. doença de Parkinson (DP) é a segunda desordem neurodegenerativa mais comum entre a população idosa, não possui cura e a terapia ouro para os sintomas motores da doença é a levodopa (L-DOPA). A longo prazo a L-DOPA pode levar ao surgimento de sintomas adversos, como flutuação motora, discinesia e alucinações visuais. E estudos demonstram uma possível associação entre o estresse oxidativo (OE) e a terapia com L-DOPA. A via de reparo por excisão de bases (BER) é responsável por controlar os danos causados pelo OE, sendo as proteínas APE1 e XRCC1 fundamentais neste processo. Variações nos genes que codificam estas proteínas podem influenciar na eficiência do reparo, tornando o cérebro suscetível aos danos causados pelo OE. Desta forma, o presente estudo objetivou avaliar a relação entre a presença dos polimorfismos nos genes Asp148Glu e Arg399Gln dos genes APE1 e XRCC1, respectivamente, com o surgimento de flutuação motora, discinesia e alucinações visuais decorrentes da resposta farmacológica a L-DOPA, em pacientes com a DP. Foram avaliados 110 pacientes submetidos à terapia com L-DOPA por um período de 5 anos. Os pacientes foram estratificados em dois grupos de acordo com a dosagem diária de L-DOPA, grupo I tomando ≤ 600mg/dia e o grupo II tomando >600mg/dia. Os polimorfismos Asp148Glu e Arg399Gln dos genes APE1 e XRCC1, foram analisados através da técnica de qPCR e PCR-RFLP, respectivamente. A análise de regressão logística demonstrou associação com maior duração da terapia com L-DOPA (PR 1,1; IC -1,1-1,19; p = 0,001), surgimento de flutuação motora (PR 1.7; IC 1,3- 2,2; p = 0,001) e a presença do genótipo polimórfico AA do gene XRCC1 (PR 1,54; IC 1,04-2,27; p = 0,028). Além da presença do genótipo GA para o gene XRCC1 conferindo proteção em pacientes tratados com altas doses de L-DOPA (PR 0,7; IC 0,5-0,9; p =0,022). Nossos dados sugerem que esta variação no gene XRCC1 pode influenciar na resposta farmacológica da L-DOPA em pacientes com a DP, enquanto que a variação no gene APE1 não parece influenciar no tratamento.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-03-13T12:28:29Z No. of bitstreams: 1 Jamilly Lopes de Macedo.pdf: 2811894 bytes, checksum: 04624f3f27eca1f1b30e84a908c08df6 (MD5) Made available in DSpace on 2018-03-13T12:28:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jamilly Lopes de Macedo.pdf: 2811894 bytes, checksum: 04624f3f27eca1f1b30e84a908c08df6 (MD5) Previous issue date: 2017-09-18 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES Synthetic mesoionic compounds, belonging to the 1,3-thiazolium-5-thiolate group, have an excellent ability to cross cell membranes and interact with several biological molecules with distinct affinities. The present work aimed to evaluate the antineoplastic potential of new mesoionic compounds of the 1,3-thiazolium-5-thiolate group, with or zinc enrichment, and their possible mechanisms of action. For this, the compounds were initially subjected to chemical characterization by obtaining the calibration curve, ultraviolet and visible spectrophotometry (UV-vis), optical emission spectrometry (ICP-OS), photoluminescence spectroscopy, nuclear magnetic resonance, infrared spectroscopy (FT-IR), X-ray and thermogravimetric analysis (TGA). In vitro experimental studies using cervical carcinoma (HEp-2) cell lines, human rectal colon carcinoma (HT-29), human acute promyelocytic leukemia (HL-60), human mammary adenocarcinoma (MCF7), carcinoma human breast cancer (T-47D), rat breast cancer (4T1) and a lineage of healthy transformed cells of murine peritoneal macrophages (RAW 264.7). For the staining with propidium iodide, in flow cytometry, the cell viability in the HL-60 strain was evaluated. For the mitochondrial depolarization test, rhodamine 123 was used and for the evaluation of the cell death pattern, Annexin V was used. Cell cycle analysis and DNA fragmentation were performed with the Guava® cell cycle kit. Subsequently, RNA extraction with Trizol was obtained, cDNA was obtained with ImProm-II ™ Reverse Transcription System (PROMEGA) and expression analysis of BAX, BCL2, CASPASE 3, CASPASE 9 and GAPDH genes as reference control. The results showed that, considering the time of exposure of the cells to the compounds, the lowest IC50 concentration and the best selectivity index (IS), the mesoionic compounds MIH 2.4Bl [3.5 μg / mL (3.0-4.0)] and MIH 2.4Zn [5.0 μg / mL (4.5-5.5)] showed better activity in the HL-60 cell line, in 48 h time, promoting inhibition of the growth of cancer cells with lower toxicity in healthy cells (RAW 264.7). The compounds promoted mitochondrial depolarization in the tested lineage (HL-60), cell death by apoptosis and cell cycle arrest in G2 phase. However, the tested concentrations of the compounds did not promote DNA fragmentation. Regarding the analysis of gene expression, it was observed that the BAX gene presented significant difference only when compared to the expression in the sample BLC1 (MIH 2.4Bl; 3.5 μg / mL) vs. BLC2 (MIH 2.4Bl; 7.0 μg / mL) (p

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-03-13T12:46:16Z No. of bitstreams: 1 Nadja Vanessa de Almeida Ferraz.pdf: 3712654 bytes, checksum: 1e8a0352c936ec5f0a59501129591a88 (MD5) Made available in DSpace on 2018-03-13T12:46:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Nadja Vanessa de Almeida Ferraz.pdf: 3712654 bytes, checksum: 1e8a0352c936ec5f0a59501129591a88 (MD5) Previous issue date: 2017-09-18 Glutathione (GSH) is the major low molecular weight thiol found in human cells, whose function is related to the biotransformation and elimination of xenobiotics, and protection of cells against oxidative stress. It has been found that a decrease in their physiological levels may be indicative of several diseases, standing out as an important biomarker. Several techniques are used to detect glutathione, as in the case of liquid chromatography. However, the electrochemical sensors method has been of increasing interest. Recently, the contribution of nanomaterials in the manufacture of these devices has been translated into an increase in the reproducibility and reach of low detection limits, highlighting themselves as promising tools for clinical diagnosis. In this work, two different sensors based on nanomaterials were developed for the detection of the GSH. The first sensor was composed of a gold electrode modified with a film based on the metal-organic framework copper (II) -benzene-1,3,5-tricarboxylate (CuBTC) and the acrylamide sodium acrylate copolymer (CuBTC/EAu). Electrochemical measurements were performed using the cyclic voltammetry method in an electrochemical cell, using silver/silver chloride (Ag/AgCl(KClsat)) as a reference electrode, platinum wire as an auxiliary electrode, and the CuBTC/EAu sensor as the working electrode. According to the results, the developed sensor exhibited a good electrocatalytic activity for the glutathione oxidation, in a potential of 0,41 V, with a low detection limit (0,03 μmol L-1), and a linear range operating range of 0,05 – 2 μmol L-1 of GSH and a response time of 15 minutes. The second sensor deals with the electrosynthesis of a nanocomposite based on CuBTC and gold nanoparticles stabilized with PVP, which was denominated Au@CuBTC. The morphological and structural characteristics of the new compound were investigated by scanning electron microscopy (SEM), thermal gravimetric analysis (TGA), diffraction Xray powder (XRPD) and absorption spectroscopy in the infrared region (FTIR) and its application as an electrochemical sensor for GSH quantification was evaluated by square wave voltammetry. In accordance with the results, it was observed that the use of nanoparticles in the structure of the metal-organic framework significantly increased the sensitivity and the response time of the electrode. The analytical curve of the sensor showed a linear response range between 10 - 40 μmol L-1 of GSH, and a detection limit of 0,3 μmol L-1, with response time of 60 seconds. The proposed sensors are presented as an innovative technology and open paths for applications of metal organic frameworks in electrocatalysis and the construction of attractive sensors for the detection of glutathione in biological fluids. A glutationa (GSH) é o principal tiol de baixo peso molecular encontrado nas células humanas, cuja função está relacionada à biotransformação e eliminação de xenobióticos e a defesa das células contra o estresse oxidativo. Tem sido estabelecido que uma redução nos seus níveis fisiológicos pode ser indicativa de diversas doenças, destacando-se como um importante biomarcador. Várias técnicas são utilizadas para detecção da gluatationa, a exemplo da cromatografia líquida, entretanto, o método dos sensores eletroquímicos tem despertado interesse crescente. Recentemente, a contribuição de nanomateriais na fabricação desses dispositivos, tem se traduzido no aumento na reprodutibilidade e alcance de baixos limites de detecção, destacando-se como ferramentas promissoras para diagnóstico clínico. Neste trabalho foram desenvolvidos dois sensores a base de nanomaterias para a detecção de GSH. O primeiro sensor foi constituído por um eletrodo de ouro modificado com um filme baseado na rede metal-orgânica cobre(II)–benzeno-1,3,5–tricarboxilato (CuBTC) e o copolímero acrilamida acrilato de sódio (CuBTC/EAu). As medidas eletroquímicas foram realizadas pelo método da voltametria cíclica numa célula eletroquímica, utilizando-se como eletrodo de referência prata/cloreto de prata (Ag/AgCl(KClsat)), um eletrodo auxiliar de fio de platina e como eletrodo de trabalho o sensor CuBTC/EAu. De acordo com os resultados, o sensor desenvolvido obteve uma boa atividade eletrocatalítica para a oxidação da glutationa, no potencial de 0,41 V, com baixo limite de detecção (0,03 μmol L-1), faixa de trabalho linear de 0,05 - 2 μmol L-1 de GSH e um tempo de resposta de 15 minutos. O segundo sensor aborda a eletrossíntese de um nanocompósito baseado no CuBTC e nanopartículas de ouro estabilizadas com PVP, o qual foi denominado Au@CuBTC. As características morfológicas e estruturais do novo composto foram investigadas por microscopia eletrônica de varredura (MEV), análise termogravimétrica (TGA), difração de raios-X de pó (XRPD) e espectroscopia de absorção na região do infravermelho com transformada de Fourier (FTIR) e sua aplicação como sensor eletroquímico para quantificação da GSH foi avaliada pela voltametria de onda quadrada. De acordo com os resultados obtidos, foi observado que o uso das nanopartículas na estrutura da rede metal-orgânica aumentou significativamente a sensibilidade e o tempo de resposta do eletrodo. A curva analítica do sensor mostrou uma faixa de resposta linear entre 10 - 40 μmol L-1 de GSH e um limite de detecção de 0,3 μmol L-1, com tempo de resposta de 60 segundos. Os sensores propostos apresentam-se como tecnologias inovadoras e abre caminhos para aplicações das redes metal orgânicas na eletrocatálise e na construção de sensores atrativos para a detecção de glutationa em fluidos biológicos.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-06-17T13:30:57Z No. of bitstreams: 1 Erinaldo Ubirajara Damasceno dos Santos.pdf: 5711027 bytes, checksum: 05684bbb6abc042b66317984510ed3df (MD5) Made available in DSpace on 2016-06-17T13:30:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Erinaldo Ubirajara Damasceno dos Santos.pdf: 5711027 bytes, checksum: 05684bbb6abc042b66317984510ed3df (MD5) Previous issue date: 2016-02-23 Cervical cancer (CC) affects about half a million women each year worldwide. The main etiological agent that can lead to the development of the CC is the human papillomavirus (HPV). However, not all women infected with HPV will have a progression to cancer, since the neoplastic development involves immune, genetic and environmental factors. Chemokine receptors play an important role in immune response, and progression of cervical intraepithelial neoplasia (CIN) for CC. Genetic variations related to the genes of these receptors may lead to the formation of cervical neoplasia. This study aimed to associate polymorphisms in genes of CCR2-64I chemokine receptor (rs1799864) and CCR5-Δ32 (rs333) with susceptibility to the development of cervical lesions (CIN or CC) in women from the State of Pernambuco, Brazil. The study population consisted of 139 women with cervical lesions (patients) and 151 healthy women (controls). The CCR2-64I and CCR5-Δ32 polymorphisms were analyzed by the technique of PCR-RFLP. The HPV detection was performed using the standard PCR technique. A protective effect for individuals carriers of a mutant genotypes (GA or AA) for individuals with cervical injury to the polymorphism in CCR2-64I gene (OR = 0.37, p = 0.0008). The same was observed for the A allele (OR = 0.39, P = 0.0002). In contrast, no association to the polymorphism in the CCR5-Δ32 gene was observed (p> 0.05). The prevalence of HPV types showed that 38.8% of patients were infected with HPV16; 22.3% HPV 18; HPV31 2.9%; 3.6% HPV 33; and 14.4% for other types of HPV. For multiple infection 18% of patients were co-infected with types 16 and 18. When we analyzed the association of HPV type with CCR2-64I polymorphism in the gene between individuals of the group of patients there is an effect protector of infection for HPV 16 (OR = 0.35, p = 0.0184). Moreover, when patients were stratified according to the severity of cervical lesions, 28.78% (40/139) had CIN I (low grade lesion), 62.58% (87/139) had CIN II or III (high-grade lesions) and 8.63% (12/139) had CC. In summary, our study showed CCR2-64I polymorphism protective effect of both susceptibility to infection with HPV 16 and for the development of cervical lesions (CIN and CC). O câncer cervical (CC) afeta cerca de meio milhão de mulheres a cada ano em todo o mundo. O principal agente etiológico que pode levar ao desenvolvimento do CC é a infecção por Papillomavírus humano (HPV). Porém, nem todas as mulheres infectadas pelo HPV terão uma progressão para o câncer, visto que, o desenvolvimento neoplásico envolve fatores imunológicos, genéticos e ambientais. Os receptores de quimiocinas desempenham um importante papel na resposta imunológica e progressão de neoplasia intraepitelial cervical (NIC) para o CC. Variações genéticas relacionados com os genes destes receptores podem levar a formação de neoplasia cervical. O presente estudo teve como objetivo associar polimorfismos nos genes receptores das quimiocinas CCR2-64I (rs1799864) and CCR5-Δ32 (rs333) com a susceptibilidade para o desenvolvimento de lesão cervical (NIC ou CC) em mulheres residentes no Estado Pernambuco-Brasil. A população de estudo consistiu de 139 mulheres com lesões cervicais (pacientes) e 151 mulheres saudáveis (controles). Os polimorfismos CCR2-64I e CCR5-Δ32 foram analisados pela técnica da PCR-RFLP. A detecção do HPV foi realizada através da técnica de PCR convencional. Um efeito protetor foi observado para indivíduos carreadores de um dos genótipos mutantes (GA ou AA) em relação aos indivíduos com lesão cervical para o polimorfismo no gene CCR2-64I (OR = 0,37, p= 0,0008). O mesmo foi observado para o alelo A (OR = 0,39, P = 0,0002). Contrariamente, nenhuma associação para o polimorfismo no gene CCR5-Δ32 foi observada (p> 0,05). A prevalência dos tipos de HPV mostrou que 38,8% dos pacientes estavam infectados pelo HPV16; 22,3% HPV 18; 2,9% HPV31; 3,6% HPV 33; e 14,4% por outros tipos de HPV. Em relação a infecção múltipla, 18% dos pacientes foram co-infectados pelos tipos 16 e 18. Quando analisada a associação do tipo de HPV com o polimorfismo no gene CCR2-64I, entre os indivíduos do grupo de pacientes, observou-se um efeito protetor da infecção para o HPV 16 (OR = 0,35, p = 0,0184). Além disso, quando os pacientes foram estratificados de acordo com a gravidade das lesões cervicais, 28,78% (40/139) apresentaram NIC I (lesão de baixo grau), 62,58% (87/139) tinham NIC II ou III (lesão de alto grau) e 8,63% (12/139) tiveram CC. Em resumo, nosso estudo mostrou um efeito protetor do polimorfismo CCR2-64I tanto para susceptibilidade para a infecção pelo HPV 16 como para o desenvolvimento de lesões cervicais (CIN e CC).

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-06-13T12:38:16Z No. of bitstreams: 1 Juliana Ribeiro de Albuquerque.pdf: 1578907 bytes, checksum: ec8f261d099fa3465b9219c1ef3dbb95 (MD5) Made available in DSpace on 2016-06-13T12:38:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Juliana Ribeiro de Albuquerque.pdf: 1578907 bytes, checksum: ec8f261d099fa3465b9219c1ef3dbb95 (MD5) Previous issue date: 2015-06-15 Currently, there have been search for molecular markers in animal selection programs which could help in the classic selection, anticipating the evaluations of the animals and optimizing the genetic selection system focused on production. The hormone leptin and its receptors are mainly expressed in adipocytes and related to the control of food intake, energy use and indicator of nutritional conditions of the body that influence the actions of other physiological systems, such as milk production. Thus the present study aims to investigate the existence of LEP 1620 polymorphism (A / C) in the gene encoding the hormone leptin in buffaloes and their possible association with milk production in the Northeast region of Brazil. DNA was extracted from blood samples collected from the tails of animals. Blood samples were collected from 139 buffaloes from two farms in the Pernambuco and Alagoas. After DNA extraction, the samples were genotyped by PCR-RFLP technique. The AA, AG, GG were found. Since the AG genotype was associated with a higher milk production for the farm A when compared to farm Pernambuco. However, the genotypes presented in this study were not associated with variables for days in milk and average daily production. However, other leptin gene polymorphisms can be studied with a view to search for a marker, since there are few studies associated with this type buffalo. Atualmente, tem havido busca por marcadores moleculares a serem utilizados em programas de seleção para que atuem de forma complementar a seleção clássica, o que permite uma antecipação das avaliações nos animais, otimizando o sistema de seleção genética voltada à produção animal. O hormônio leptina e seus receptores são expressos principalmente nos adipócitos e estão relacionados com o controle da ingestão de alimentos, uso da energia e indicador da condição nutricional do organismo que influenciam em ações de outros sistemas fisiológicos, como produção de leite. Diante disso foi objetivado investigar a existência do polimorfismo LEP-1620 (A/G) no gene que codifica o hormônio da leptina em búfalas e suas possíveis associações com a produção leiteira em dois estados do Nordeste do Brasil, Pernambuco e Alagoas. O DNA foi extraído a partir de amostras de sangue coletado por venopunção da veia coccigea dos 139 búfalas das duas fazendas da região Nordeste. Após a extração de DNA, essas amostras foram genotipadas pela técnica PCR-RFLP. Foram encontrados os genótipos AA(21%), AG(50%), GG(29%). Sendo que o genótipo AG associado com uma maior produção de leite para a fazenda Alagoas quando comparada com a fazenda Pernambuco (p= 0,001). Porém, os genótipos apresentados neste estudo, não foram associados às variáveis analisadas para dias de lactação e produção média diária.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-06-09T13:34:24Z No. of bitstreams: 1 Alex Paulino da Silva.pdf: 1396065 bytes, checksum: da02f6043581303f3bb054d24fced4ae (MD5) Made available in DSpace on 2016-06-09T13:34:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Alex Paulino da Silva.pdf: 1396065 bytes, checksum: da02f6043581303f3bb054d24fced4ae (MD5) Previous issue date: 2015-02-12 Cervical cancer (CC) is a disease that affects approximately 1.5 million women in the world and has as a causing agent the human papillomavirus (HPV). Proteins associated with the immune response are essential for viral elimination. However, variations in their genes, such as IL-10 [(A-1082G) (rs1800896)] and TNF-α [(G-308A) (rs1800629)] may predispose individuals to various diseases such as lupus, rheumatoid arthritis, AIDS, as well as some forms of cancer. In the present study, we aimed to investigate the possible association of the single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the regions rs1800896 and rs1800629 with the predisposition to develop cervical squamous intraepithelial lesions and cervical adenocarcinoma. In addition, we wanted to match them with sociodemographic profiles and different habits of the patients. We used DNA samples from 240 women with HPV infection (168 vaginal secretion samples and 72 paraffin-embedded samples) and 169 healthy control DNA samples (HPV negative). Analysis of each polymorphism was performed by ARMS-PCR. Our results showed a positive association of the polymorphism rs1800896 of the IL-10 gene with susceptibility to develop cervical disease (p < 0.05). However, there was no association in relation to the polymorphism rs1800629 on the TNF-α gene (p > 0.05). On the other hand, for the latter SNP, a positive correlation was found for the following characteristics: age > 35 years, early age of first sexual intercourse, use of oral contraceptive, smoking, African ancestry and co-infection by Chlamydia trachomatis (p < 0.05). Our study showed that the IL-10 and TNF-α genes are strong candidates to be used as molecular biomarkers in the preventive screening of patients susceptible to cervical disease in the study population. O câncer cervical (CC) é uma doença que acomete aproximadamente 1,5 milhões de mulheres no mundo e possui como agente etiológico o Papilomavirus humano (HPV). Proteínas ligadas à resposta imune são essenciais para a eliminação viral. Entretanto, as variações em seus genes, tais como IL-10 [(A-1082G) (rs1800896)] e TNF-α [(G-308A) (rs1800629)] podem predispor os indivíduos ao surgimento de várias doenças como lúpus, artrite reumatoide, AIDS, assim como algum tipo de câncer. No presente estudo, objetivamos investigar a possível associação dos polimorfismos de base única (SNP) nas regiões rs1800896 e rs1800629 com a susceptibilidade ao desenvolvimento de lesões escamosas cervicais e adenocarcinoma uterino. Além disso, associá-los com dados clínicos das pacientes. Foram utilizadas 240 amostras de DNA de mulheres infectadas por HPV (168 de secreção vaginal, oriundas de lesão cervical escamosa, e 72 de material parafinado, proveniente de adenocarcinoma uterino) e 169 amostras de DNA de controle saudável (HPV e lesões negativas). A análise do polimorfismo foi realizada pela técnica ARMS-PCR. Nossos resultados mostraram associação do polimorfismo rs1800896 do gene IL-10 com a susceptibilidade às doenças cervicais (p0,05). Por outro lado, em relação a este último, encontramos associação dos genótipos GA/GG somados com as características: idade >35anos, idade precoce da coitarca, uso de contraceptivos orais, fumo, derivação africana e co-infecção por Chlamydia trachomatis (p

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-06-13T15:00:48Z No. of bitstreams: 1 Kilma Cristiane Silva Neves.pdf: 2678760 bytes, checksum: 781a39173a3ab80aeb45daef6f49b148 (MD5) Made available in DSpace on 2016-06-13T15:00:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Kilma Cristiane Silva Neves.pdf: 2678760 bytes, checksum: 781a39173a3ab80aeb45daef6f49b148 (MD5) Previous issue date: 2014-03-19 Fungal species are already available in the market and the mushrooms have been reported as producers of milk coagulating enzymes for cheese production. The objective of this study was to investigate the growth of Pleurotus florida DPUA 1534 and Pleurotus ostreatus DPUA 1533 in vegetable substrate to select a species with potential proteolytic coagulant for the application in the food industry. The results of vertical mycelial growth, although P. florida DPUA 1534 and P. ostreatus DPUA 1533 have colonized natural residues tested, P. florida DPUA 1534 was the species that showed a significant increase (p> 0.05) after 15 days given that determined the choice of this species for the production of the mushroom. In producing the substrate formulated based on cupuaçu bark supplemented with rice bran 20%, 20 mycelial inoculum discs (Ø = 10 mm) resulted in better biological efficiency (14.2%) and the remaining analyzes were performed with P. florida DPUA 1534 produced under those conditions. The analysis showed the mushroom highlighted in the following nutritional characteristics P. florida DPUA 1534 proteins (25.94%), carbohydrate (49.72%), iron (89.82%) and zinc (85.08%) and the presence of all essential amino acids. In the crude extract of the mushroom P. florida DPUA 1534 to coagulant activity and the AUC ratio was 67.68 and 2.15, respectively. Optimum activity was shown at pH 7.0 at 40 ° C. The enzyme extract was stable between 25 ° C and 40 ° C and at pH between 4 and 10 showed about 80 to 90% of activity in the first 90 minutes of incubation. The enzymatic extract showed susceptibility to inhibitors of the serine protease class (90%), metalloprotease (93%), cysteine proteases (92%) and aspartic protease (94%). The most effective compound was Pepstatin A, suggesting the presence of aspartic protease enzymes showing aspartic residues in the active site, indicating the possibility of its application in the dairy industry. Regarding toxicity results showed that P. florida DPUA 1534 produces proteases with biological activity on Artemia salina (LC50 = 25,5μg) and showed hemolytic activity in blood of sheep trading in ascending order with respect to extract concentrations (0, 2 to 1.0 mL), LC50 = 363,88μg and LC50 = 241,51μg after 1h and 24h of incubation, respectively. The in vivo test indicated that the extract when administered at a dose of 1000 mg.Kg-1 in rats, no deaths or clinical signs of toxicity in any of the treated animals did not cause significant changes in haematological and biochemical parameters when compared to the group control, and histological analyzes revealed no acute toxicity under the experimental conditions. Therefore, the extract of P. florida DPUA 1534 showed potential for use as coagulating milk. Espécies de fungos já estão disponíveis no mercado e os cogumelos têm sido reportados como produtores de enzimas coagulantes do leite para produção de queijos. O objetivo do presente trabalho foi investigar o crescimento de Pleurotus florida DPUA 1534 e Pleurotus ostreatus DPUA 1533 em substrato vegetal para selecionar uma espécie com potencial proteolítico coagulante para fins de aplicação na indústria de alimentos. Nos resultados do crescimento micelial vertical, embora P. florida DPUA 1534 e Pleurotus ostreatus DPUA 1533 tenham colonizado os resíduos naturais testados, P. florida DPUA 1534 foi a espécie que apresentou crescimento significativo (p>0,05) ao final de 15 dias, dado que determinou a escolha dessa espécie para produção dos basidiomas. Na produção o substrato formulado a base de casca de cupuaçu suplementado com farelo de arroz 20%, inóculo de 20 discos miceliais (Ø= 10 mm) resultou na melhor eficiência biológica (14,2%) e as demais análises foram realizadas do cogumelo de P. florida DPUA 1534 produzido nessas condições. A análise dos basidiomas mostrou em destaque a seguinte característica nutricional de P. florida DPUA 1534, proteínas (25,94%), carboidratos (49,72%), ferro (89,82%) e zinco (85,08%), além da presença de todos os aminoácidos essenciais. No extrato bruto dos basidiomas de P. florida DPUA 1534 a atividade coagulante e a razão foi de 67,68 UAC e 2,15, respectivamente. A atividade ótima foi demonstrada em pH 7,0 a 40 °C. O extrato enzimático mostrou-se estável entre 25 °C e 40 °C, e na faixa de pH entre 4 a 10 apresentou cerca de 80 a 90% de atividade nos primeiros 90 minutos de incubação. O extrato enzimático mostrou susceptibilidade aos inibidores das classes de serino-protease (90%), metaloprotease (93%), cisteíno-protease (92%) e protease aspártica (94%). O composto mais eficaz foi Pepstatin A, sugerindo a presença de protease aspártica, enzimas que apresentam resíduos aspárticos no sítio ativo, indicando a possibilidade de sua aplicação na indústria de laticínios. Em relação à toxicidade os resultados demonstraram que P. florida DPUA 1534 produz proteases com atividade biológica frente à Artemia salina (CL50= 25,5μg) e apresentou atividade hemolítica em sangue de carneiro comercial em ordem crescente em relação à concentração do extrato (0,2 a 1,0 mL), com CL50= 363,88μg e CL50= 241,51μg após 1h e 24h de incubação, respectivamente. O teste in vivo indicou que o extrato quando administrado na dose de 1000 mg.Kg-1 em ratos Wistar, não ocorreu óbito ou sinais clínicos de toxicidade em nenhum dos animais tratados, não promoveu alterações significativas dos parâmetros hematológicos e bioquímicos quando comparados ao grupo controle, e as análises histológicas revelaram que não houve toxicidade aguda nas condições do experimento. Portanto, o extrato de P. florida DPUA 1534 apresentou potencial para utilização como coagulante do leite.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-05-18T12:44:39Z No. of bitstreams: 1 Soraya Farias de Andrade Freitas.pdf: 720574 bytes, checksum: 5bdec2199a6c7a1051ac90567718753f (MD5) Made available in DSpace on 2017-05-18T12:44:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Soraya Farias de Andrade Freitas.pdf: 720574 bytes, checksum: 5bdec2199a6c7a1051ac90567718753f (MD5) Previous issue date: 2013-07-17 Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES Milk is a food of nutritional and functional importance for all phases of life; however, of all constituents, the fat and protein components are considered to be the most economical value within milk quality payment programs. This fact suggests a greater importance given to these constituents by the main actors of the milk production chain within the economic scenario (MADALENA, 2000). Dürr (2004) reports that milk fat and protein concentrations vary mainly depending on the nutritional management and genetic potential of the animals. As a consequence of the genetic differences responsible for the variation of 25% of the total milk production and 50% in the variations of fat, protein and non-greasy solids (GONYON et al., 1987) ). According to Bonfatti et al. (2010), it is estimated that the additive genetic variance for milk composition characteristics is between 14 and 39% of the total variance. In relation to the polymorphisms of the genes coding for the main milk proteins, such as caseins, β-Lg and α-La, these became markers of interest in milk production, composition and processing. They are excellent models for understanding the behavior of the dairy raw material during the industrial process, since they are closely related to the milk casein fraction, the main protein portion involved with the high yield in the production of cheeses and other derivatives. In addition, genetic polymorphisms of milk proteins are frequently used for the characterization of several breeds of animal production (CAROLI et al., 2010). In order to promote improvements in the genetics of milk production, composition and processing characteristics, research in the field of molecular biology has made it possible to map and identify genomic, transcriptomic and proteomic levels of polymorphisms that contribute to variations in milk composition , In this way, the process of selection of animals in breeding programs. In view of the above, the objective of this research was to study the genetic polymorphisms of kappa-casein and alpha-lactalbumin in cattle of the Girolando and Siboney races O leite é um alimento de importância nutricional e funcional para todas as fases da vida, entretanto, de todos os constituintes, os componentes gordura e proteína são considerados os de maior valor econômico dentro dos programas de pagamento de leite por qualidade. Esse fato sugere uma maior importância dada a esses constituintes pelos principais atores da cadeia produtiva leiteira dentro do cenário econômico (MADALENA, 2000). Dürr (2004) relata que as concentrações de gordura e proteína do leite variam principalmente em função do manejo nutricional e potencial genético dos animais. Desta forma, como principal fator de variação têm-se os efeitos das diferenças genéticas responsáveis pela variação de 25% do total da produção de leite e 50% nas variações dos teores de gordura, proteína e sólidos não gordurosos (GONYON et al., 1987). Segundo Bonfatti et al. (2010), estima-se que a variância genética aditiva para as características de composição do leite encontra-se entre 14 e 39% da variância total. Com relação aos polimorfismos dos genes que codificam as principais proteínas do leite, como as caseínas, β-Lg e α-La, estes se tornaram marcadores de interesse na produção, composição e beneficiamento do leite. São excelentes modelos de compreensão do comportamento da matéria prima láctea durante o processo industrial, já que estão intimamente relacionados à fração caseínica do leite, principal porção proteica envolvida com o alto rendimento na produção de queijos e demais derivados. Além disso, os polimorfismos genéticos das proteínas lácteas são frequentemente utilizados para a caracterização de diversas raças de produção animal (CAROLI et al., 2010). Deste modo, para promover melhorias na genética das características de produção, composição e beneficiamento do leite, pesquisas no ramo da biologia molecular têm possibilitado realizar o mapeamento e identificação em nível genômico, transcriptômico e proteômico dos polimorfismos que contribuem para variações na composição do leite facilitando, desta forma, o processo de seleção dos animais em programas de melhoramento genético. Diante do exposto, o objetivo desta pesquisa foi estudar os polimorfismos genéticos da kappa-caseína e alfa-lactoalbumina em bovinos das racas Girolando e Siboney.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2016-08-24T12:11:26Z No. of bitstreams: 1 Elaine Cristina Alves da Silva.pdf: 1186963 bytes, checksum: 0669a44f8869ee386007139a1776b318 (MD5) Made available in DSpace on 2016-08-24T12:11:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Elaine Cristina Alves da Silva.pdf: 1186963 bytes, checksum: 0669a44f8869ee386007139a1776b318 (MD5) Previous issue date: 2013-02-28 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES The problems related to the distribution of rainfall tend to intensify as global warming, resulting in economic losses, mainly for the semi-arid region. The Moringa oleifera Lam. is a species that has a variety of uses and can be an alternative crop for semiarid. Given the above, this work aimed to evaluate the initial responses in seedlings of moringa in greenhouse under adverse environmental conditions in two trials (water and salt). Parameters such as water relations, gas exchange, quantum efficiency of photosystem II, concentration of photosynthetic pigments, organic solutes and enzyme activity. For the first test we used four water treatments: control (C), 5 day watering suppression (5d SR), 10 days suppression watering (10d SR) and reirrigado (RI) and the 2 test were used three treatments saline: 0 mM NaCl (C), 75 mM NaCl (EM) and 150 mM NaCl (ES) into three periods of exposure to stress 2, 24 and 48 hours. As the results of Test 1, it was observed that the treatment was more affected 10d SR, where plants of this treatment had reduced water potential however their relative water content was maintained. The variables of gas exchange for such plants were all reduced compared to the control. The quantum efficiency of photosystem II was not affected which allowed the recovery of most of the variables after reirrigação. Regarding organic solutes observed a reduction in the leaves of these plants subjected to treatment 10d SR, however for roots and tubers observed the reverse, where these plants showed the highest values.The activity of the enzyme ascorbate peroxidase was enhanced in roots treatment 10d SR and IR, and catalase activity was enhanced in the leaves of plants subjected to treatment and reduced RI roots. he results of test 2 showed that plants subjected to ES showed the lowest values for the water relations and gas exchange, which were intensified with prolonged stress. In general, it can be observed that increased concentrations of solutes in the roots and tubers. The activity of the enzyme ascorbate peroxidase was enhanced in roots treatment 10d SR and IR, and catalase activity was enhanced in the leaves of plants subjected to treatment and reduced RI roots. The results of test 2 showed that plants subjected to ES showed the lowest values for the water relations and gas exchange, which were intensified with prolonged stress. In general, it can be observed that increased concentrations of solutes in the roots and tubers. The activity of the enzyme ascorbate peroxidase was intensified in the leaves and roots and tubers decreased, while catalase activity was higher only in the leaves. These results were different from plants subjected to ES, because they were very similar to plants of treatment C for most variables. The suppression water 10 days was not enough to cause damage to the photosynthetic apparatus, allowing the same recover in just 24 hours reirrigação. Plants subjected to EM were not affected, because for the majority of variables, these plants showed similar treatment plants C. Unlike plants subjected to ES all parameters were drastically affected and although it increased the enzyme activity, this was not enough to prevent the damage caused by salt stress. Os problemas relacionados com a distribuição de chuvas tendem a se intensificarem com o aquecimento global, o que resulta em prejuízos econômicos, principalmente para a região do semiárido. A Moringa oleifera Lam. é uma espécie que apresenta uma diversidade de usos e pode ser uma alternativa de cultivo para o semiárido. Diante do exposto, este trabalho teve como objetivo avaliar as respostas iniciais em mudas de moringa em casa de vegetação sob condições ambientais adversas em dois ensaios (hídrico e salino). Foram avaliados parâmetros como, relações hídricas, trocas gasosas, eficiência quântica do fotossistema II, concentração de pigmentos fotossintetizantes, solutos orgânicos e a atividade enzimática. Para o ensaio 1 foram utilizados quatro tratamentos hídricos: controle (C), 5 dias de supressão de rega (5d SR), 10 dias de supressão de rega (10d SR) e reirrigado (RI) e para o ensaio 2 foram utilizados três tratamentos salinos: 0 mM de NaCl (C), 75 mM de NaCl (EM) e 150 mM de NaCl (ES) em três períodos de exposição ao estresse 2, 24 e 48 horas. Como resultados do ensaio 1, observou-se que o tratamento mais afetado foi 10d SR, onde as plantas deste tratamento tiveram seu potencial hídrico reduzido no entanto seu teor relativo de água foi mantido. As variáveis das trocas gasosas para estas mesmas plantas foram todas reduzidas em relação ao controle. A eficiência quântica do fotossistema II não foi afetada o que possibilitou a recuperação da maioria das variáveis após a reirrigação. Em relação aos solutos orgânicos observou-se uma redução destes nas folhas das plantas submetidas ao tratamento 10d SR, no entanto para as raízes e túberas observou-se o inverso, onde estas plantas apresentaram os maiores valores. A atividade da enzima ascorbato peroxidade foi intensificada nas raízes das plantas do tratamento 10d SR e RI, e a atividade da catalase foi intensificada nas folhas das plantas submetidas ao tratamento RI e reduzida nas raízes. Como resultados do ensaio 2 observou-se que as plantas submetidas ao ES, apresentaram os menores valores para as relações hídricas e trocas gasosas, que foram se intensificando com o prolongamento do estresse. De modo geral, pode-se observar que os teores de solutos aumentaram nas raízes e túberas. A atividade da enzima ascorbato peroxidase foi intensificada nas folhas e reduzida nas raízes e túberas, enquanto a atividade da catalase foi maior apenas nas folhas. Estes resultados foram diferentes das plantas submetidas ao EM, pois estas apresentaram valores semelhantes às plantas do tratamento C para a maioria das variáveis avaliadas. A supressão hídrica de 10 dias não foi suficiente para provocar danos ao aparato fotossintético, possibilitando a mesma recuperar-se em apenas 24 horas de reirrigação. As plantas submetidas ao EM não foram afetadas, pois para a maioria das variáveis avaliadas, estas plantas apresentaram valores semelhantes as plantas do tratamento C. Diferentemente das plantas submetidas ao ES todos os parâmetros avaliados foram afetados drasticamente e embora tenham aumentado a atividade enzimática, esta não foi suficiente para impedir os danos provocados pelo estresse salino.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-04-20T16:36:59Z No. of bitstreams: 1 Itala Iara Medeiros de Araujo.pdf: 682787 bytes, checksum: fc0270c78b2defb1d6aa93cc96d0ae10 (MD5) Made available in DSpace on 2017-04-20T16:36:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Itala Iara Medeiros de Araujo.pdf: 682787 bytes, checksum: fc0270c78b2defb1d6aa93cc96d0ae10 (MD5) Previous issue date: 2013-02-06 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES Candidate genes of the kappa-casein (CSN3) and beta-lactoglobulin (LGB) are involved in the composition, processing and quality of milk and are linked to production characteristics. This study aimed to evaluate the allele and genotype frequencies of kappa-casein gene (CSN3) and beta-lactoglobulin (LGB) and associate them with milk production of cattle participants Progeny Test Breed Girolando through analysis of variables milk yield in 305 days (P305) and predicted transmitting ability (PTA) for milk. For the study of polymorphisms were genotyped sires 138 and 729 cows (n = 867) for CSN3 and 737 and 131 bulls and cows (n = 868) to LGB. For the association analysis were evaluated 127 bulls and 536 cows (n = 663) and 127 for CSN3 bulls and 536 cows (n = 663) for LGB. The differentiation of allele A / B genes studied was obtained by PCR-RFLP. Allele frequencies, genotype and calculating the probability of Hardy-Weinberg equilibrium (HWE) were established through the program Popgen versão1.32 and tested by χ ² test at a significance level of 1%. The association study was performed by regression analysis using the GLM procedure of SAS 9.1. The allele and genotype frequencies for the gene CSN3 were, respectively, 0.7324 (AA), 0.2468 (AB) 0.0208 (BB) and 0.8558 (A) 0.1442 (B) and the LGB were, respectively, 0.2604 (AA), 0.4827 (AB) 0.2569 (BB) and 0.5017 (A) 0.4983 (B). The population is in HWE for both genes. No association was found between genes evaluated and analyzed variables. Os genes candidatos da kappa-caseína (CSN3) e da beta-lactoglobulina (LGB) estão envolvidos na composição, processamento e qualidade do leite e estão ligados às características de produção. Objetivou-se avaliar as frequências alélicas e genotípicas do gene da kappa-caseína (CSN3) e da beta-lactoglobulina (LGB) e associá-las à produção de leite de bovinos participantes do Teste de Progênie da Raça Girolando, por meio de análise das variáveis de produção de leite em até 305 dias (P305) e de capacidade prevista de transmissão (PTA) de leite. Para o estudo do polimorfismo, foram genotipados 138 touros e 729 vacas (n = 867) para o CSN3 e 131 touros e 737 vacas (n = 868) para LGB. Para a análise de associação foram avaliados 127 touros e 536 vacas (n = 663) para CSN3 e 127 touros e 536 vacas (n = 663), para LGB. A diferenciação dos alelos A/B dos genes estudados foi obtida por meio da técnica de PCR-RFLP. As frequências alélicas, genotípicas e o cálculo da probabilidade de equilíbrio de Hardy-Weinberg (EHW) foram estabelecidos por meio do programa Popgen versão1.32 e testado pelo teste χ² ao nível de significância de 1%. O estudo de associação foi realizado por meio de análise de regressão utilizando o procedimento GLM do SAS 9.1. As frequências genotípicas e alélicas para o gene CSN3 foram, respectivamente, 0,7324 (AA); 0,2468 (AB); 0,0208 (BB) e 0,8558 (A); 0,1442 (B) e para o LGB foram, respectivamente, 0,2604 (AA); 0,4827 (AB); 0,2569 (BB) e 0,5017 (A); 0,4983 (B). A população encontra-se em EHW para ambos os genes. Não foi detectada associação entre os genes avaliados e as variáveis analisadas.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-07-03T13:04:37Z No. of bitstreams: 1 Rejane Rodrigues de Oliveira.pdf: 1165760 bytes, checksum: 80f04a5414f3c6a357ac1aa597c0719c (MD5) Made available in DSpace on 2017-07-03T13:04:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rejane Rodrigues de Oliveira.pdf: 1165760 bytes, checksum: 80f04a5414f3c6a357ac1aa597c0719c (MD5) Previous issue date: 2012-12-27 Aiming at studying the structure of population and demography of Murciano-Granadina goat breed, 24,444 data on pedigree, from Asociación Nacional de Criadores de Caprino de Raza Murciano-Granadina – CAPRIGRAN, were analyzed. In order to set population structure the following population data were analyzed: complete generations; complete generation equivalent; effective number of founders (fe); effective number of ancestors (fa); inbreed coefficient (F-statistics) and average relatedness coefficient (AR). The conclusion was that the levels of genetic variability in the studied population of Murciano-Granadina goat breed were in satisfactory level, allowing its utilization in programs of genetic improvement and conservation of genetic resources. As for demographic census, quantitative data were studied regarding: number of males and females; medium generation intervals (GI); effective number (Ne). The conclusion was that low depth of pedigrees limits getting more precise parameters. Smaller herds presented sex rate under recommended and the medium GI observed (2.77 years) demonstrates that population is under intense improvement work that can compromise genetic variability in the future. Com o objetivo de estudar a estrutura de populações e a demografia da raça caprina Murciano-Granadina, foram avaliadas 24.444 informações de pedigree, pertencentes ao banco de dados da Asociación Nacional de Criadores de Caprino de Raza Murciano-Granadina - CAPRIGRAN. Para compor a estrutura da população, foram avaliados os seguintes parâmetros populacionais: número de gerações completas; número de gerações equivalentes; número efetivo de animais fundadores (fe); número efetivo de ancestrais (fa); coeficiente de consanguinidade (estatísticas F de Wright) e coeficiente médio de parentesco (AR), concluindo-se que a existência de variabilidade genética nas populações estudadas da raça caprina Murciano-Granadina da Espanha encontra-se em níveis satisfatórios, permitindo sua utilização em programas de melhoramento e de conservação de recursos genéticos. Para o censo demográfico, foram analisadas informações quantitativas sobre número de macho e fêmeas; intervalo médio de gerações (IG); tamanho efetivo da população (Ne), resultando na baixa profundidade dos pedigrees limitante na obtenção de parâmetros mais acurados e mais precisos. Os rebanhos menores apresentaram taxa sexual inferior ao recomendado, ao passo que o IG médio observado (2,77 anos) demonstra que a população está sob intenso trabalho de melhoramento genético, o que pode comprometer a variabilidade genética no futuro.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2016-06-02T14:36:17Z No. of bitstreams: 1 Gustavo Alves do Nascimento.pdf: 1681544 bytes, checksum: acfb4a02e8653a17d32122ce9e6a41e5 (MD5) Made available in DSpace on 2016-06-02T14:36:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Gustavo Alves do Nascimento.pdf: 1681544 bytes, checksum: acfb4a02e8653a17d32122ce9e6a41e5 (MD5) Previous issue date: 2011-11-28 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES The bovine papillamatosis is a disease caused by papillomavirus that can generate damage for producers and farmers. In extreme cases it can affect all the herd. Diagnostic methods for bovine papillomavirus are essential to the sector because traditional methods of morphological observations are not very effective. The use of devices technological to recognize specific biological molecules may help treatment and prevention of bovine viral diseases. The biosensor incorporates a biological recognition element through electrochemical reactions that generate electrical signals that can be quantified and interpreted. Thus, this work aimed to develop molecular diagnostic methods for detection of bovine viral diseases through the construction of biosensors. One of the biosensor was constructed from pencil graphite type 4B and the other model biosensor was composed to three screen-printed electrodes. In both biosensors proposed, a DNA probe specific for the BPV was immobilized on the working electrode by electrodeposition or by adsorption and then a target sequence was hybridized with the probe immobilized. The hybridization redox signals were analyzed using differential pulse voltammetry. The results showed that biosensors could differentiate hybridization of non-hybridization. The hybridization occurrence showed decrease on the redox signal and represented the positive diagnostic for BPV infection. The two biosensors (pencil graphite and screen-printed electrodes) showed high sensitivity which detection limits were 3.84 nM and 4.35 nM, respectively. The biosensor also detected viral DNA extracted from bovine blood using screen-printed electrodes. The data obtained with the biosensors showed viability for the diagnosis of various bovine papillomavirus types, thereby allowing the development of a new portable detection system for viruses. Enfermidades virais bovina, com destaque para o papilomatose bovina, trazem prejuízos para os produtores, podendo acometer todo o rebanho. Métodos de diagnósticos para o papilomavírus bovino (BPV) vêm sendo indispensáveis para o setor, pois os métodos tradicionais de observação morfológica são pouco eficazes. O uso de dispositivos capazes de reconhecerem moléculas biológicas específicas, como os biossensores, pode auxiliar no tratamento e prevenção de doenças virais bovina. O presente trabalho visou o desenvolvimento de métodos diagnósticos para detecção molecular de enfermidades bovinas de origem viral através da construção de biossensores. Um dos biossensores foi construído a partir de lápis grafite tipo 4B e outro modelo de biossensor foi constituído por eletrodos impressos. Nos dois biossensores propostos, um sonda de DNA específica para o BPV foi imobilizada no eletrodo de trabalho por eletrodeposição ou por adsorção e em seguida uma sequência alvo foi hibridizada com a sonda imobilizada. Os sinais redox da hibridização foram analisados pela técnica de voltametria de pulso diferencial. Os resultados mostraram que os biossensores puderam diferenciar a hibridização da não-hibridização. A ocorrência da hibridização apresentou diminuição no sinal redox e representou a positividade para a infecção do BPV. Os dois biossensores propostos (lápis grafite e eletrodos impressos) apresentaram elevada sensibilidade cujos limites de detecção foram 3,84 nM e 4,35 nM, respectivamente. O biossensor detectou também DNA viral extraído a partir de sangue bovino utilizando os eletrodos impressos. Os dados obtidos com os biossensores mostraram viabilidade para o diagnóstico de vários tipos de papilomavírus bovino, permitindo com isso o desenvolvimento de um novo sistema de detecção portátil para os vírus.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-04-10T13:19:21Z No. of bitstreams: 1 Elizabete Cristina da Silva.pdf: 4327297 bytes, checksum: 969fe0e6e726dc739f29566fd5377097 (MD5) Made available in DSpace on 2017-04-10T13:19:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Elizabete Cristina da Silva.pdf: 4327297 bytes, checksum: 969fe0e6e726dc739f29566fd5377097 (MD5) Previous issue date: 2010-08-12 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES In Brazil, naturalized pigs or animals called locally adapted are endangered species due to the overvaluation of exotic pig breeds that have caused loss of genetic diversity in these populations. Thus, this study aimed to characterize diversity and genetic structure of nine pig genetics groups locally adapted: Baé (n=11), Caruncho (n=07), Canastra (n=29), Canastrão (n=09), Mamelado (n=07), Moura (n=18), Nilo (n=16), Piau (n=17) and mongrel (SRD; n=47) and three exotic breeds (Duroc=04, Landrace=21 and Large White=04) with 18 microsatellite markers as well as testing these markers to allocate individuals from a mongrel population and their actual population. It was detected 198 alleles with 18 loci examined in 190 pigs from 12 genetic groups, all of them were polymorphic with PIC (polymorphic information content) ranged from 0.541 (SW72) to 0.933 (S0005). The results of AMOVA showed that 3.2% of total variation came from the difference between genetic groups (P

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-05-08T16:37:29Z No. of bitstreams: 1 Laura Leandro da Rocha.pdf: 1419772 bytes, checksum: 81999c16deb201b3630158eccfcb1ddf (MD5) Made available in DSpace on 2017-05-08T16:37:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Laura Leandro da Rocha.pdf: 1419772 bytes, checksum: 81999c16deb201b3630158eccfcb1ddf (MD5) Previous issue date: 2009-11-25 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES The aim of the present study was develop a panel of microsatellites for testing paternity in goats as an aid for conservation and improvement programs for local breeds. A total of 381 animals from 10 goat populations [six local Brazilian ecotypes/breeds (Azul, Canindé, Graúna, Marota, Moxotó and Repartida) and four exotic breeds currently used in Brazil (Alpine, Anglo-Nubian, Boer and Saanen) were genotyped. Nine multiplex systems were performed, totaling 27 microsatellites.Polymorphism information content (PIC), probability of exclusion (PE) of the markers and Hardy- Weinberg (HW) equilibrium were estimated for the populations and the probability of identity was determined. For the system with 27 microsatellites, the combined PE was 0.999991 and 0.999999 (PE1 and PE2) and the 21 microsatellites exhibited PIC > 0.60; four microsatellites were monomorphic in some populations. Significant deviations from HW equilibrium (P< 0.05) were found for the markers; CSSM66 was deviated from HW equilibrium in the greatest number of populations (8). Nine markers were selected to make up the panel, eight of which were common to both groups (local and exotic goats); the BM1818 marker was the most informative in the local populations and the BM6506 marker was the most informative in the exotic populations. Combined PE with the group of eight microsatellites was 0.9943 and 0.9997 (PE1 and PE2). Based on the calculation of the probabilities of exclusion within the populations, it was possible to discriminate one individual from among a million (106). The results indicate the possibility of employing few microsatellites in the investigation of paternity in goats with a satisfactory degree of reliability and minimal cost. O presente trabalho teve como objetivo desenvolver um painel de microssatélites para teste de paternidade em caprinos como auxílio a programas de conservação e melhoramento das raças locais.Foram genotipados 381 animais de 10 populações caprinas sendo seis raças ou ecotipos locais brasileiros (Azul, Canindé, Graúna, Marota, Moxotó e Repartida) e quatro raças exóticas utilizadas atualmente no Brasil (Alpina, Anglo-Nubiana, Boer e Saanen). Realizou-se nove sistemas multiplex,totalizando 27 microssatélites. Foram estimados o PIC, as probabilidades de exclusão dos marcadores e o equilíbrio de Hardy-Weinberg nas populações e, em seguida, determinada a probabilidade de identidade. Para o sistema de 27 microssatélites a probabilidade de exclusão combinada foi de 0,999991 e 0,999999 (PE1 e PE2) e, 21 microssatélites apresentaram PIC > 0,60, onde quatro apresentaram-se monomórficos em algumas populações. Verificaram-se desvios do equilíbrio de Hardy-Weinberg significativos (P< 0,05) para os marcadores, sendo o CSSM66, o que apresentou maior número de populações (8) com desvio. Para compor o painel foram escolhidos 9 marcadores dos quais oito foram comuns aos dois grupos estudados (caprinos locais e exóticos), sendo o BM1818 mais informativo nas populações locais e, o marcador BM6506 nas populações exóticas. A probabilidade de exclusão combinada com o grupo dos oito microssatélites foi de 0,9943 e 0,9997 (PE1 e PE2). Baseado no cálculo das probabilidades de identidade dentro das populações foi possível discriminar um indivíduo entre um milhão (106). Os resultados indicaram a possibilidade de empregar poucos microssatélites na investigação de paternidade em caprinos, com grau de confiabilidade considerado bom, minimizando custos.

Due to the current and future problematic of the maintenance of the hydric resources, the reuse of waters after previous treatment has been a strategy in the management of aquifers. The bioaugmentation is one of the techniques of purification of effluents and, because of this, studies were carried out in lagoons from the station of treatment of effluents (STE) of one sugar-alcohol industry, in Coruripe, State of Alagoas, aiming its reuse in ferti-irrigation. Therefore, in the sugarcane harvests of 2004/05 and 2005/06, samples were collected respectively from residuary waters and turf of this STE, initially for isolation of microorganisms (agar-broth of sugar-cane 25%). The isolates were identified in agreement to its growth in differential media and microscopic morphology. The activities of extracellular enzymes were also evaluated. The isolates with characteristics of the genus Pseudomonas were cultivated in the media King A and B , agar-milk (production of caseinase) and in the system API 20E (Biomerieux), for identification at the level of species. The eight fungi isolated from the samples, as well as two fungi furnished by André Toselo Foundation (Phanerochaete chrysosporium and Geotrichum candidum), were evaluated in solid media according to their secretion of phenoloxidases, in special Lignin-Peroxidase and Tanase. All the ten fungi grew in these media, even so only some have generated halos of discoloration larger than the size of the colonies, as it happened with the isolate XXI identified as Cladosporium sp. This was able to degrade different azodyes, tannic acid and different natural phenolic substrates (sugar-cane bagasse and wood-dust) in solid and liquid media. When this fungus was cultivated in liquid medium with methylene blue, its growth curve and azodye discoloration, as well as its action on the variation of pH and electric conductivity, were evaluated. It was also compared its ability to remove total reducing glicids, proteins and phenols, as well as its production of Lignin-Peroxidase in liquid medium with methylene blue or natural phenolic substrates. Laccase was the probable phenoloxidase produced by the isolate of Cladosporium sp in these circumstances, mainly in natural substrates. It is possible that this fungus consumed the glicids released from the degradation of lignocellulosic polymers so that they didn t need to use the phenols during the time interval of the experiments (144 h). The best isolates to remove the azodye in the liquid medium containing 2 % of tannic acid, that is, Cladosporium sp and Aspergillus sp, were monitored according to the variation on the concentrations of total reducingglicids, proteins, phenols, and chemical oxygen demand (COD) in the media. The isolate of Cladosporium sp removed 12 % of the total COD of the media, against 9.3 % of removal by the isolate of Aspergillus sp, and both had reached the same rate of phenol reduction at the end of the evaluated period. Regarding to the samples of the agri-industrial effluent supplemented with only 1% of Carbon and Nitrogen composition of the Sabouraud-agar medium, it was observed that Mucor sp showed the best rates of reduction of COD and phenols, followed by the isolates of Cladosporium sp, P. chrysosporium and G. candidum. Finally, after the daily bioagumentation of the facultative lagoons from the studied STE (with an outflow of about 5.000 m3.h-1 and approximately 2 days of hydraulic retention), during the harvests of 2005/06 and 2006/07, by a consortium of 6 of the isolates tested in vitro, the monitoring of the physico-chemiscal parameters of biweekly collected water samples during both seasons showed that this strategy was promising, for having improved most of the quality parameters and turning the water appropriated for fertiirrigation. Even so, some of the characteristics did not obey yet the legislation got for launching in rivers (DO, COD and phosphates). Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico Face à atual e futura problemática da manutenção dos recursos hídricos, o reuso de águas tem sido utilizado como estratégia no gerenciamento de mananciais. A biosuplementação é uma das técnicas de purificação de efluentes e, com base nisso, estudos foram conduzidos visando sua utilização em lagoas de tratamento de efluente (ETE) de uma indústria sucroalcooleira, situada em Coruripe, estado de Alagoas, para o reuso em fertirrigação. Nas safras 2004/05 e 2005/06, foram coletadas respectivamente amostras de águas residuárias e turfa da ETE estudada, inicialmente para isolamento de microrganismos (agar-caldo de cana 25%). Os isolados foram posteriormente identificados conforme seu crescimento em meios diferenciais e sua morfologia microscópica. Foram também avaliadas as atividades de enzimas secretadas. Os isolados com características do gênero Pseudomonas foram cultivados nos meios King A e B , ágar-leite (produção de caseínase) e no sistema API 20E (Biomerieux), para identificação a nível de espécie. Os oito fungos isolados das amostras, bem como dois cedidos pela Fundação André Toselo (Phanerochaete chrysosporium e Geotrichum candidum), foram avaliados quanto à secreção de fenoloxidases em meios sólidos, em especial de Lignina-Peroxidase e Tanase. Todos os dez fungos cresceram nesses meios, embora apenas alguns tenham gerado halos de descoloração maiores do que o tamanho de suas colônias, como o isolado XXI identificado como Cladosporium sp. Este também foi capaz de degradar diferentes azocorantes, ácido tânico e diferentes substratos fenólicos naturais (bagaço-de-cana e serragem de madeira) em meios sólido e líquido. Quando cultivado em meio líquido contendo o azocorante azul de metileno, a curva de crescimento desse fungo, bem como sua atividade descolorante e de alteração do pH e da condutividade elétrica, também foram avaliadas. Também comparou-se a remoção de glicídios redutores, proteínas e fenóis totais, bem como a produção de fenoloxidase por tal fungo em meio líquido contendo ou azul de metileno ou substratos fenólicos naturais. Constatou-se que a fenoloxidase secretada pelo fungo nessas condições é provavelmente a lacase, e que a remoção de fenóis foi mais lenta nos substratos naturais, aparentemente devido à grande disponibilidade de glicídios liberados na degradação dos polímeros lignocelulósicos, não sendo necessário degradar fenóis durante o intervalo de tempo dos experimentos (144 h). Em meio líquido contendo 2 % de ácido tânico, os isolados que promoveram maior descoloração (Cladosporium sp e Aspergillus sp), tiveram suas culturas monitoradas quanto à redução das concentrações de glicídeos redutores, proteínas, fenóis totais e demanda química de oxigênio (DQO). Verificou-se que o isolado de Cladosporium sp removeu 12 % da DQO desse meio, contra 9,3 % de remoção pelo isolado de Aspergillus sp, e ambos reduziram na mesma proporção os teores de fenóis totais ao final do período avaliado. Já nas amostras de efluente agroindustrial suplementado com 1 % da composição em Carbono e Nitrogênio do meio ágar Sabouraud, constatou-se que o fungo Mucor sp apresentou as melhores taxas de redução de DQO e fenóis, seguido pelos isolados de Cladosporium sp, P. chrysosporium e G. candidum. Finalmente, após a bioaumentação diária das lagoas facultativas da ETE estudada (vazão de cerca de 5.000 m3.h-1 e aproximadamente 2 dias de retenção hidráulica), durante as safras 2005/06 e 2006/07, por um consórcio de 6 dos microrganismos isolados e testados in vitro, as análises físico-químicas quinzenais permitiram evidenciar que a estratégia mostrou-se promissora por ter melhorado a maioria dos parâmetros de qualidade, tornando a água adequada para fertirrigação, embora algumas das características (OD, DQO e fosfatos) ainda não obedeçam a legislação para lançamento em rios.