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RESUMO Apesar da incontestável importância da obra de Jane Jacobs, são relativamente poucos os estudos que testaram empiricamente suas proposições. Neste trabalho, investigamos a relação entre as ocorrências criminais, utilizadas como forma de medir o quanto locais da cidade podem ser considerados bem ou mal sucedidos, e as principais condições de vitalidade urbana defendidas por Jacobs em Morte e Vida de Grandes Cidades: diversidade de usos do solo, tamanho médio das quadras e densidade populacional. Utilizando como base setores censitários, realizamos uma investigação através de análises visuais e estatísticas para os conjuntos urbanos das três cidades mais populosas de Santa Catarina, Brasil: Joinville, Florianópolis (capital do estado) e Blumenau. Os resultados mostram que as áreas mais centrais e as mais periféricas possuem as maiores taxas de ocorrências criminais, assim como aquelas com maiores porcentagens de usos não residenciais. A alta densidade populacional, por outro lado, apresentou-se associada a maior segurança, e o tamanho médio de quadras não apareceu como fator relevante nos três conjuntos urbanos.

Receptores nucleares controlam a transcrição em células eucarióticas quando ativados por ligantes e, além do sítio de interação com ligantes, há outros sítios alternativos em sua superfície que podem ser alvo de compostos capazes de interferir com as interações proteína-proteína desativando o RN. A ativação do Receptor X de Pregnano (RXP) e do Receptor Constitutivo de Androstano (RCA) resulta na indução do metabolismo e efluxo de fármacos. Portanto, RXP/RCA sao responsáveis por causar reações adversas ou falhar terapias. Uma abordagem combinando a triagem experimental à nível cellular, em uma biblioteca de fármacos, e validação com ensaios in vitro e in silico, conseguimos identificar três novos antagonistas de RXP e cinco novos contra RCA, cada um com um perfil único de interação. Nuclear receptors can control transcription in eukaryotic cells in a ligand-dependent manner and, besides the ligand-binding pocket there is evidence of the existence of alternative ligand-binding sites on the surface, which can be addressed by small organic molecules that disrupt specific protein-protein interactions and thereby may antagonise NR function. Activation of pregnane X receptor (PXR) and constitutive androstane receptor (CAR) results in the induction of first-pass metabolism and drug efflux. Hereby PXR/CAR may cause adverse drug reactions or therapeutic failure of drugs. Therefore, PXR and/or CAR antagonists can minimise adverse effects or improve therapeutic efficiencies. Combination of cellular high-throughput screen identified CAR and PXR potent antagonists in a library of approved and investigational drugs. Further validated by cellular and in vitro assays, as well as molecular docking, suggesting additional or exclusive binding outside the classical ligand binding pocket. In conclusion, we here have identified three approved drugs as novel potent PXR antagonists and five potential CAR inverse agonists with differential receptor interaction profiles.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico, Programa de Pós-Graduação em Arquitetura e Urbanismo, Florianópolis, 2016. O desenvolvimento do Brasil urbano foi acompanhado de perto pelas contradições da cidade: a riqueza e a pobreza, a classe dominante e as classes populares, os sobrados e os mucambos. Compreender a sociedade brasileira, portanto, implica, necessariamente, compreender a o fenômeno da desigualdade socioeconômica. Da mesma forma que compreender o espaço urbano nacional - palco dessas contradições e das disputas de classes - implica compreender a segregação socioespacial. Nesse sentido, esta pesquisa busca investigar a relação entre a desigualdade socioeconômica e a localização das diversas camadas socioeconômicas da população na Área Conurbada de Florianópolis (ACF). Buscamos compreender os abismos sociais, econômicos e políticos que separam as servidões e a beira-mar desse espaço urbano. Para tanto, buscamos caracterizar a realidade socioeconômica da ACF a partir da construção de um Índice Socioeconômico (com dados provenientes do Censo Demográfico 2010 do IBGE) e, a configuração desse espaço urbano utilizando a Teoria da Sintaxe Espacial e suas principais medidas (Integração e Escolha) ? o que nos permitiu examinar a localização dos setores censitários em condições socioeconômicas extremas e, suas relações de vizinhança e adjacência, isto é, relações configuracionais com potencial de promoverem fluxos de pessoas e de veículos, facilitando, ou dificultando, o encontro entre distintas classes socioeconômicas. Abstract : The development of urban Brazil was closely followed by the contradictions of the city: wealth and poverty, the ruling class and the popular classes, the houses and the mucambos. Thus, understanding the Brazilian society implies necessarily to understand the phenomenon of socioeconomic inequality. Similarly, understanding the national urban space ? stage of these contradictions and class dispute ? implies to understand the socio-spatial segregations. In this sense, this research aims to investigate the relationship between socioeconomic inequality and the location of different socioeconomic strata of the population in Florianópolis and its neighboting municipalities (ACF). Therefore, we sought to characterize the socioeconomic reality of the ACF by constructing a Socioeconomic Index (with data from the 2010 Population Census of IBGE) and the configuration of this urban space using the Theory of Space Syntax and its main measures (Integration and Choice). Allowing us to examine the location of census sectors in extreme socioeconomic conditions and their neighborly relations, this is configurational relationships with potential to pomote pedestrian and vehicles flows, facilitating or hindering the encounter between different socioeconomic classes.

Kronenberger T. Structural implication of mutants of the pyridoxal kinase from Plasmodium falciparum. [Masters thesis (Host-Pathogen Relationship Biology)]. Sao Paulo: Instituto de Ciencias Biomedicas, Universidade de Sao Paulo; 2013. Malaria is a deadly infectious disease of which annually more than half a million people especially in the tropics die. Currently there are no potent vaccines available and parasite is developing drug-resistance to the most antimalarials. The vitamin metabolism has already been exploited as drug-target as demonstrated by the folate (vitamin B9) metabolism. Recently the vitamin B6 (pyridoxal and other 2itâmeros) has also been validated to be druggable in the malaria parasite. We already analysed biochemically and structurally the plasmodial dimeric pyridoxal kinase , which is involved in the vitamin B6 interconversion pathway catalysing the phosphorylation of B6 vitamers. Our approach combines in silico molecular dynamics and modelling with mutagenic analysis of the respective enzyme in order to verify the oligomeric state as well as the catalytic activity of the PdxK in comparison to the respective wild-type protein. The crystal structure and models of PfPdxK allowed us to determine the localisation of the active site as well the interface between the two monomers and to identify the involved amino acid residues. By apply molecular dynamics it became clear that the dimerization of the PdxK is importance for the stability of the active site, which was confirmed by the decrease of activity of mutants related to this region. Interestingly, two interface mutations increased the activity: i) F25Y and ii) F14W. Gel filtration assays revealed an equilibrium of the monomer-dimer conformation and therefore the decrease in activity of the interface mutations might not be directly related to the dimerization processes, but rather to the stabilization of the active site organisation. Within the active site region the serine (S11) is involved in the maintenance of the conformation of pyridoxal during catalyses and the identified lid region covering the ATP binding site is responsible for preventing auto-hydrolysis. Substitution of the respective amino acid residues to alanine resulted in enzyme inactivation. In silico analysis of the PfPdxK spacer region identified nucleic acid binding sides, however RNA binding experiments failed so far and the interesting possibility of protein-RNAbinding remains for elucidation.