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Orientadora : Marta Margarete Cestari Co-orientador : Roberto Ferreira Artoni Dissertaçăo (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Cięncias Biológicas, Programa de Pós-Graduaçăo em Genética. Defesa: Curitiba, 2008 Inclui bibliografia

Submitted by arlindo kohlrausch (ajfk@uepg.br) on 2022-07-28T18:39:30Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Raylen Pereira de Ramos.pdf: 3059024 bytes, checksum: 4b1e7c1b2971abce28e2fddb6ccb1564 (MD5) Made available in DSpace on 2022-07-28T18:39:30Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Raylen Pereira de Ramos.pdf: 3059024 bytes, checksum: 4b1e7c1b2971abce28e2fddb6ccb1564 (MD5) Previous issue date: 2022-05-30 A ordem Coleoptera representa 40% dos insetos descritos e inclui a subfamília Alticinae que possui hierarquia taxonômica complexa e muitos casos de mimetismo o que dificulta mais essa categorização. A subtribo Oedionychina tem sido muito estudada com enfoque citogenético, por apresentar características peculiares em relação aos cromossomos sexuais gigantes e assinápticos. O genoma eucarioto é constituído de heterocromatina que contém vários tipos de DNA repetitivos e são importantes na sua estrutura e atividade, assim como na evolução cromossômica. A Pintura Cromossômica é uma técnica que utiliza sondas produzidas por DOP-PCR, e é usada para evidenciar rearranjos e homeologias de uma espécie, mas ela também pode mapear DNA repetitivo. O objetivo deste trabalho foi descrever a nova espécie Alagoasa neoequestris, utilizando estudos citogenéticos, morfológicos e moleculares, incluindo analise filogenética com as espécies semelhantes, conferindo um nome científico próprio, e mapear DNAs repetitivos obtidos pela DOP-PCR e mapeados pela técnica de Pintura Cromossômica em Omophoita communis. A espécie Alagoasa neoequestris possui características morfológicas que validam a posição taxonômica dentro do gênero. O padrão elitral não foi encontrado em outras espécies do gênero. A comparação da genitália masculina com outras espécies do gênero mostrou diferenças que sugerem isolamento reprodutivo. O número cromossômico 2n=22 e sistema sexual Xy com cromossomos gigantes e assinápticos é representativo da subtribo. A variação da morfologia cromossômica encontrada e a localização de heterocromatina constitutiva em três bivalentes estão associadas com diferenciações cariotípicas do gênero. Os cístrons rDNA 45S e 5S sintênicos e colocalizados em um par autossômico é considerada característica ancestral para Coleoptera. A análise filogenética agrupou A. neoequestris dentro do gênero Alagoasa, num ramo com Alagoasa plaumanni, e separada de O. communis e O. equestris, que são morfologicamente semelhantes. Na literatura há uma espécie denominada “Alagoasa equestris” descrita citogeneticamente com número cromossômico 2n=12. Além disso, essa espécie é morfologicamente muito semelhante a Omophoita communis e Omophoita equestris. Os resultados obtidos no nosso trabalho discordam dàqueles descritos na literatura para “A. equestris”. Esse número cromossômico de 2n=12 é igual ao número descrito para O. communis, e sugere que “A. equestris” possa ter sido confundida com O. communis durante tal estudo. Com base nisso e nas análises de relação filogenética, a espécie estudada no nosso trabalho é uma nova espécie de Alagoasa do sul do Brasil, suportado por taxonomia integrativa. A hibridação da sonda em O. communis evidenciou marcações centroméricas em todos os autossomos e na região pericentromérica do cromossomo sexual X e intersticial no sexual y sem o uso de competidor. Essas marcações são correspondentes a localização de heterocromatina com Bandas-C em Coleoptera e também em Oedionychina. O uso de 30 µg de competidor, padrão para pintura cromossômica, inibiu todas as hibridações confirmando que a sonda contém sequências repetitivas. Possivelmente estas sequências do genoma foram amplificadas em maioria pela DOP-PCR, como também já foi observado em outros trabalhos com Pintura Cromossômica. Apesar disso, ainda são necessários mais estudos com outras técnicas para complementar os resultados de caracterização de DNA repetitivo em O. communis. The Coleoptera order represents 40% of the described insects and includes the subfamily Alticinae, which has a complex taxonomic hierarchy and many cases of mimicry which makes this categorization more difficult. The subtribe Oedionychina has been studied with a cytogenetic approach due its peculiar characteristics about the giant and asynaptic sex chromosomes. The eukaryotic genome consists of heterochromatin that contains various types of repetitive DNA and have an important in its structure and activity, and chromosomal evolution. Chromosome Painting is a technique that uses probes produced by DOP-PCR, and is used to highlight rearrangements and homeologies of species, but it can also map repetitive DNA. The aim of this work was to describe the new specie A. neoequestris, using cytogenetic, morphological and molecular studies, including phylogenetic analysis with similar species, given it a scientific name, and map repetitive DNAs obtained by DOP-PCR and mapped by the technique of Chromosome Painting in Omophoita communis. The specie Alagoasa neoequestris has morphological features that validate its taxonomic position within the genus. Other species of the genus did not have the elytral pattern found. Comparison of the male genitalia with other species of the genus showed differences that suggest reproductive isolation. The chromosomal number 2n=22 and Xy sex determination system with giant and asynaptic sex chromosomes is representative of the subtribe. The variation in chromosomal morphology found and the location of constitutive heterochromatin in three bivalents are associated with karyotype differentiation of the genus. The 45S and 5S rDNA cístrons, colocalized in one autosomal pair is considered ancestral for Coleoptera. Phylogenetic analysis grouped A. neoequestris within the genus Alagoasa, in a branch with Alagoasa plaumanni, and separated from O. communis and O. equestris. In the literature, are individuals identified as "Alagoasa equestris" with chromosome number 2n=12 morphologically similar to Omophoita communis and Omophoita equestris. The results obtained in this study disagree with those described in the literature for "A. equestris" described as 2n=12. This chromosomal number of "A. equestris" is equal to the number described for O. communis and suggests that "A. equestris" may have been confused with O. communis during that study. Based on this and in the analysis of the phylogenetic relationship, the species studied in this paper is a new specie of the genus in southern Brazil, supported by integrated taxonomy. The hybridization of the probe in O. communis showed centromeric markings in all autosomes and in the pericentromeric region of the X sex chromosome and intersticial of y chromosome. These markings correspond to the location of C-banded heterochromatin in Coleoptera and also in Oedionychina. The use of 30 µg competitor, standard for chromosome painting, inhibited all hybridizations confirming that the probe contains repetitive sequences. Possibly these sequences in the genome were mostly amplified by DOPPCR, as has also been observed in other work with Chromosome Painting. Nevertheless, further studies are still needed with techniques that complement the results of characterization repetitive DNA in O. communis.

Não recebi financiamento Astyanax is a fish genus of Characiformes and currently is classified as incertae sedis. Astyanax scabripinnis, one of these species, is recognized as a species complex, which is composed of 33 species. This study propose to investigate karyotypic constitution of species of this complex, throughout classical and molecular analyzes: conventional Giemsa staining, C-banding, impregnation with silver nitrate and fluorescence in situ hybridization (FISH) with different repetitive DNA probes (rDNA 5S, rDNA 18S, As51, snRNA U2, H3, H4, Rex1, Rex3, telomeric sequence and microsatellites in three species from different rivers basins: 1) Astyanax aff. scabripinnis (Alto rio Paraná); 2) Astyanax cf. intermedius (Paraíba do Sul); 3) Astyanax cf. goyanensis (Tocantins). For the latter, two units were observed occurring in sympatry, and then the presence of two karyomorphs (A and B) was considered. The analyzes showed that the species have some conserved chromosomal characteristics, such as 2n=50 chromosomes, telomeric sites and chromosomal distribution pattern of repetitive elements Rex1 and Rex3. However, the presence of variable chromosomal characters stands out among the species, showing diversity regarding chromosomal morphology, C-banding pattern, number of sites and location of AgNORs, chromosomal distribution of repetitive DNAs (rDNA 18S and 5S, As51, snRNA U2, H3, H4 and microsatellites). These results demonstrate great diversification of the karyotypic microstructure of species of Astyanax scabripinnis complex and reinforce the biodiversity of the group. In addition, the data obtained has an important role in assisting the taxonomy and evolutionary biology of the group, since they reveal the presence of different units within the complex, which can be delimited with cytogenetic assistance, showing the occurrence of exclusive chromosomal characteristics of each species Astyanax é um gênero de peixes pertencente à Characiformes, sendo atualmente classificado como incertae sedis. Dentre suas espécies encontra-se Astyanax scabripinnis, que é reconhecida como um complexo de espécies, o qual é composto por 33 espécies. Este estudo propôs-se a investigar a constituição cariotípica clássica e molecular de espécies desse complexo, através de análises de citogenética clássica e molecular: coloração convencional por Giemsa, bandamento C, impregnação por Nitrato de Prata e hibridizações in situ fluorescente (FISH) com diferentes sondas de DNA repetitivos (DNAr 5S, DNAr 18S, As51, snRNA U2, H3, H4, Rex1, Rex3, sequência telomérica e microssatélites) em três espécies de diferentes bacias hidrográficas: 1) Astyanax aff. scabripinnis (Alto rio Paraná); 2) Astyanax cf. intermedius (Paraíba do Sul); 3) Astyanax cf. goyanensis (Tocantins). Para esta última observou-se duas unidades ocorrendo em simpatria, sendo então considerada a presença de dois cariomorfos (A e B). As análises mostraram que as espécies possuem algumas características cromossômicas conservadas, como 2n=50 cromossomos, sítios teloméricos e padrão de distribuição cromossômica dos elementos repetitivos Rex1 e Rex3. Entretanto, a presença de caracteres cromossômicos variáveis se sobressai entre as espécies, mostrando diversidade no que se refere à morfologia cromossômica, padrão de bandamento C, número de sítios e localização de AgRONs, distribuição cromossômica de DNAs respetitivos (DNAr 18S e 5S, As51, snRNA U2, H3, H4 e microssatélites). Estes resultados demonstram grande diversificação da microestrutura cariotípica de espécies do complexo Astyanax scabripinnis e reforçam a biodiversidade existente no grupo. Além disso, os dados obtidos tem um importante papel no auxilio à taxonomia e biologia evolutiva do grupo, uma vez que revelam a presença de diferentes unidades dentro do complexo, as quais podem ser delimitadas com o auxílio citogenético, mostrando a ocorrência de características cromossômicas exclusivas de cada espécie

Submitted by Gabriel Marra Schade (gabrielmarras@gmail.com) on 2020-09-13T23:21:18Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_de_Mestrado_Gabriel_Marra.pdf: 1091990 bytes, checksum: edbb7361832bdc2015659846f946dfbc (MD5) Rejected by ROSANGELA APARECIDA LOBO null (rosangelalobo@btu.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: problema 1: folha de rosto (natureza do trabalho) Na folha de rosto, natureza do trabalho você coloca: “Defesa de Mestrado”. O correto é: Dissertação (Dissertação apresentada ao curso... ). Na capa não é necessário colocar essa informação: “Defesa de Mestrado” Problema 2: financiamento Capes No formulário de submissão consta a Capes como agência financiadora do seu projeto. No arquivo submetido não localizei uma agradecimento a esta. Isso é uma exigência das agências de fomento. E a Capes sugere que o agradecimento seja feito da seguinte maneira: "O presente trabalho foi realizado com apoio da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES) - Código de Financiamento 001 Assim que tiver efetuado as correções submeta o arquivo, em formato PDF, novamente. Agradecemos a compreensão. on 2020-09-14T13:13:49Z (GMT) Submitted by Gabriel Marra Schade (gabrielmarras@gmail.com) on 2020-09-30T10:33:12Z No. of bitstreams: 1 FINAL_Dissertação_Gabriel_Marra.pdf: 1672112 bytes, checksum: 31b22cd342193a774b5374d28d29f188 (MD5) Approved for entry into archive by ROSANGELA APARECIDA LOBO null (rosangelalobo@btu.unesp.br) on 2020-09-30T14:29:11Z (GMT) No. of bitstreams: 1 schade_gm_me_bot_par.pdf: 487366 bytes, checksum: 9abe49ca71e4ef62c6f1d41e06b383c3 (MD5) Made available in DSpace on 2020-09-30T14:29:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 schade_gm_me_bot_par.pdf: 487366 bytes, checksum: 9abe49ca71e4ef62c6f1d41e06b383c3 (MD5) Previous issue date: 2020-08-13 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Poliploidia é um fenômeno onde um organismo apresenta um conjunto extra de cromossomos, com histórico evolutivo de ocorrência natural em muitos grupos de peixes. Dentre as teorias relacionadas à sua ocorrência, a hibridização interespecífica é plausível por suas possibilidades de recombinações únicas de cromossomos. A hibridização pode causar anormalidades na gametogênese principalmente no tocante à etapa reducional da meiose, levando a ocorrência de gametas não reduzidos como espermatozoides e oócitos 2n ou 4n. Desta maneira, a fertilização com tais gametas poderia produzir progênie naturalmente poliploide. Objetivou-se nesse estudo verificar se a hibridização interespecífica entre Astyanax altiparanae e A. schubarti, e interpopulacional entre A. altiparanae favorece a ocorrência de gametas não reduzidos. Os espécimes apresentaram número diploide de 2n = 50 (A. altiparanae), 2n = 36 (A. schubarti) e 2n = 43 (hibrido interespecífico), com desenvolvimento embrionário similar ao controle (A. altiparanae). Os híbridos interpopulacionais não evidenciaram espermatozoides não reduzidos, com parâmetros espermáticos similares ao controle. Os híbridos interespecíficos indicaram maior quantidade de DNA (P = 0,0024) e espermatozoides não reduzidos (1n, 2n e 4n) viáveis, porém não sem nenhuma motilidade. Embora os híbridos interespecíficos sejam inférteis, a evidência de espermatozoides não reduzidos entre híbridos do gênero Astyanax suporta a hipótese da ocorrência de peixes naturalmente poliploides na região Neotropical. Polyploidy is a phenomenon in which an organism has an extra set of chromosomes, with the evolutionary history of occurring naturally in many fish groups. Among many theories related to its occurrence, interspecific hybridization is plausible due to its unique chromosome recombination possibilities. Hybridization can cause abnormalities in gametogenesis, especially concerning the reductive stage of meiosis, leading to the occurrence of unreduced gametes like 2n or 4n spermatozoa. Thus, fertilization with such gametes could produce naturally polyploid progeny. The objective of this study was to verify if the interspecific hybridization between Astyanax altiparanae and A. schubarti, and interpopulation hybridization between A. altiparanae favors the occurrence of unreduced gametes. The specimens had a diploid number of 2n = 50 (A. altiparanae), 2n = 36 (A. schubarti) and 2n = 43 (interspecific hybrid), and showed embryonic development similar to the control group (A. altiparanae). The interpopulation hybrids did not present unreduced sperm and showed sperm parameters similar to the control group. The interspecific hybrids showed a higher amount of DNA (P = 0.0024) and unreduced sperm (1n, 2n and 4n), but it did not show any motility. Although interspecific hybrids are infertile, the evidence of unreduced sperm among hybrids of the Astyanax genus supports the hypothesis that hybridization events are associated with the occurrence of naturally polyploid fish in the Neotropical region. 88887.341931/2019-00

Submitted by Angela Maria de Oliveira (amolivei@uepg.br) on 2019-09-24T11:43:29Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Diego José Schebelski.pdf: 1645628 bytes, checksum: 0e26d1629ae95908e7d54ed09ff79401 (MD5) Made available in DSpace on 2019-09-24T11:43:29Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Diego José Schebelski.pdf: 1645628 bytes, checksum: 0e26d1629ae95908e7d54ed09ff79401 (MD5) Previous issue date: 2019-05-24 A retinopatia diabética é uma das principais complicações da diabetes mellitus. Não existe tratamento para retinopatia diabética inicial, apenas controle da glicemia e controle de comorbidades. O cilostazol é uma possível alternativa terapêutica. Essa pesquisa teve o objetivo de avaliar o efeito protetor do cilostazol administrado por gavagem no desenvolvimento e evolução de retinopatia diabética em ratos com indução de diabetes mellitus por estreptozotocina intraperitoneal. Foram comparados 4 grupos de 15 animais por 8 semanas. Em dois grupos foi administrado estreptozotocina intraperitoneal para indução de diabetes mellitus e dois grupos foram mantidos normoglicêmicos para controle. Após confirmação da hiperglicemia nesses grupos, um grupo de rato diabético e um grupo sem diabetes passou a recebeu cilostazol oral (30mg/dia) por 8 semanas. Após o período de tratamento os olhos foram removidos e um deles foi destinado para análise histológica. Foram comparadas as espessuras e a contagem de núcleos das camadas da retina. O grupo de ratos diabéticos tratados com cilostazol oral (média de 3 ±1 núcleos em 50 µm de retina) teve perda estatisticamente menor (p

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Fish are animals present in a wide variety of habitats and are distributed all over the world. The diversity of forms, behaviors and niches associated with the evolutionary characteristics of these animals make them important to the studies associated sex determination and sexual differentiation. Among the freshwater fish of the Neotropical region, the tetras of the genus Astyanax are one of most representatives. The A. scabripinnis species complex has been well studied about the origin, distribution and frequency of B chromosomes, being considered a model organism for evolutionary studies. Several studies with population inferences about the occurrence and frequency of B chromosomes show a seasonal variation between the sexes associated with the presence of supernumerary elements in A. scabripinnis. The hypothesis is that B chromosomes could have a possible influence on the reproductive processes of this species. Thus, the present study aimed to infer if there are differences in the levels of gene expression between specimens carrying and not carrying B chromosomes concerning some candidate genes for sex determination. The results obtained showed an over expression of the dmrt1 gene in maturing male gonads of animals with B chromosomes. For amh and foxl2 genes occurred an atypical expression in females carrying B chromosomes, where their expression patterns were more similar to those of males and the reverse to those of females that do not carry Bs. The male gonads were more conservative in relation to the expression of the amh and foxl2 genes, regardless of the maturation stage and the occurrence of the B chromosomes. These results indicate that B chromosomes are changing the profiles of the sex related genes, suggesting a possible adaptive role in extending the reproductive cycle. Os peixes são animais presentes em uma grande variedade de hábitats e estão distribuídos pelo mundo todo. A diversidade de formas, comportamentos e nichos, associados às características evolutivas destes animais os tornam importantes ao estudo associados à evolução da determinação e diferenciação sexual. Entre os peixes de água doce mais representativos da região Neotropical, os lambaris do gênero Astyanax ocupam destaque. O complexo de espécies A. scabripinnis é um dos mais estudados quanto à origem, distribuição e frequência de cromossomos B, sendo considerado um organismo modelo para estudos evolutivos. Vários estudos com inferências populacionais acerca da ocorrência e frequência de cromossomos B mostram haver variação sazonal entre os sexos, associada com a presença destes elementos supranumerários em A. scabripinnis. A hipótese aqui postulada é de que os cromossomos B possam ter alguma influência em relação aos processos reprodutivos dessa espécie. Assim sendo, o presente trabalho objetivou inferir se há diferenças entre os níveis de expressão gênica dos principais genes candidatos à determinação sexual, conhecidos para outros vertebrados, frente a ocorrência de cromossomos B em A. scabripinnis. Os resultados obtidos mostram superexpressão do gene dmrt1 em gônadas masculinas em maturação de animais com cromossomos B. Já para os genes amh e foxl2 os resultados mostram expressão atípica para as fêmeas que são portadoras de cromossomos B. Estas fêmeas apresentam padrões de expressão destes genes mais semelhantes ao dos machos e inverso ao das fêmeas que não carregam os cromossomos adicionais. As gônadas masculinas foram mais conservadoras em relação a expressão dos genes amh e foxl2, independente do estádio de maturação e da ocorrência de cromossomo B. A partir destes resultados conclui-se que a presença de cromossomos B, de alguma maneira, está alterando os perfis de expressão dos principais genes relacionados ao sexo, sugerindo-se um possível papel adaptativo nos animais portadores dos cromossomos B na extensão do ciclo reprodutivo. CAPES: Código de financiamento 001

Submitted by Angela Maria de Oliveira (amolivei@uepg.br) on 2019-05-17T19:19:10Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Weverton Carlos Ferreira Trindade.pdf: 7837459 bytes, checksum: 51b0c97fd9dc354a9cd1564777eaf5fc (MD5) Made available in DSpace on 2019-05-17T19:19:10Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Weverton Carlos Ferreira Trindade.pdf: 7837459 bytes, checksum: 51b0c97fd9dc354a9cd1564777eaf5fc (MD5) Previous issue date: 2019-02-11 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior Embora o desmatamento seja atualmente a maior ameaça aos ecossistemas terrestres, as alterações climáticas podem ter um efeito igual ou até maior na extinção de espécies. O mosaico vegetação encontrado no Estado do Paraná (Sul do Brasil) formado por florestas, campos e savanas foi resultado de flutuações climáticas ocorridas durante o Quaternário, o que torna o Paraná um interessante campo de estudos sobre a dinâmica de distribuição da vegetação em relação ao clima, podendo fornecer valiosas informações sobre a resposta de ecossistemas terrestres às alterações climáticas futuras. Modelos de Distribuição de Espécies têm sido amplamente utilizados para gerar este tipo de informação. Neste trabalho, utilizamos o Maxent para construir modelos de distribuição das formações vegetais do Paraná em cinco cenários temporais: Último Máximo Glacial (LGM), Holoceno Médio (MID), presente e projeções otimista e pessimista para 2070. Os resultados foram divididos em três seções. Na primeira seção de resultados, apresentamos tutoriais criados para agilizar o pré-processamento de variáveis ambientais utilizando ferramentas open source, como o R e o QGIS. Na segunda seção avaliamos as alterações na vegetação entre um cenário temporal e outro. Os modelos do passado mostram um domínio de vegetação campestre durante o LGM, com expansão de florestas durante o MID, o que é consistente com dados paleopalinológicos. A projeção otimista para 2070 mostra uma expansão de florestas, sobretudo sobre Estepe e Savana. Na projeção pessimista para 2070 quase todo o Estado é formado por áreas mais adequadas apenas para um tipo de vegetação: Floresta Estacional Semidecidual. Na terceira seção, avaliamos a eficiência áreas de proteção (PAs) na preservação de áreas climaticamente estáveis (CSAs), além de propor áreas prioritárias para conservação considerando áreas climaticamente estáveis, áreas de proteção e remanescentes de vegetação nativa. A perda de CSAs pode chegar a 25% considerando um cenário otimista, diminuindo em 5.2% a eficiência das PAs. Em um cenário pessimista, a perda de CSAs pode chegar a 99%, levando a uma redução de 80% na eficiência PAs. Algumas áreas identificadas neste trabalho como prioritárias para conservação coincidem com áreas prioritárias definidas por outros trabalhos e com áreas que necessitam de restauração de acordo com o Novo Código Florestal Brasileiro. O planejamento de novas PAs deve considerar uma variedade de critérios biológicos, incluindo a identificação de CSAs que garantem a funcionalidade destas áreas de conservação a longo prazo. Aas modificações na paisagem causadas pelas alterações climáticas podem causar impactos ecológicos e econômicos irreversíveis tanto a curto prazo, pela perda de espécies, quanto a longo prazo, pela perda de áreas que tem potencial de servirem de refúgios em um cenário de alterações climáticas, o que reforça a necessidade de políticas de redução de gases que contribuem para o aquecimento global. Deforestation is currently the greatest threat to terrestrial ecosystems, but climate changes can have equal or even greater effect on species extinction. The mosaic vegetation that cover Paraná State (Southern Brazil) comprising forests, grasslands, and savannas was result of past climate fluctuations during the Quaternary. It makes Paraná an interesting field of study about the dynamic of vegetation distribution in response to climate, being able to provide valuable data about the response of terrestrial ecosystems to future climate changes. Species Distribution Modeling have been widely used to generate this kind of information. Here, we used Maxent to generate distribution models of the vegetation types of Paraná in five temporal scenarios: Last Glacial Maximum (LGM), Mid Holocene (MID), current time, and optimistic and pessimistic projections for 2070. We divided the results into three sections. In the first section of the results, we present tutorials designed to pre-process environmental variables in a fast way using open source tools, as R and QGIS. In the second section, we evaluated changes in vegetation between temporal scenarios. Models of past show a domain of subtropical grasslands during LGM, with forest expansion during the MID, which is consistent with paleopalinological data. Optimistic future projection shows a forest expansion, mainly over Steppe and Savanna. In the pessimistic future projection, almost the entire Paraná is covered with suitable areas for only a vegetation type: Semideciduous Seasonal Forest. In the third section, we evaluated the efficiency of protected areas in the protection of climatically stable areas, and we proposed priority areas considering climatically stable areas, protected areas and native vegetation remnants. CSAs loss can reach 25% in an optimistic climate changes scenario and thus would decrease by 5.2% the PA efficiency. In a pessimistic scenario, CSA loss can reach 99% and thus would decrease by 80% the PA efficiency. Some conservation priority areas identified here overlap with priority areas identified in other researches and with areas in need of restoration according to the new Brazil’s Forest Code. Planning for new PAs should consider a variety of biological criteria, including the identification of CSAs that could ensure the long-term functionality of these areas. Landscape modifications caused by climate changes can induce irreversible ecological and economic impacts both in the short-term, due to species loss, and in the long-term, due to loss of areas that have the potential to act as refuges in a climate change scenario, reinforcing the need for policies to reduce gases that contribute to global warming.

Orientador: Prof. Dr. Vladimir Pavan Margarido Dissertação (mestrado em Biologia Comparada) - Universidade Estadual de Maringá, 2019 Bryconamericus é um gênero especioso de Characidae, embora poucos estudos citogenéticos tenham sido feitos neste grupo. Neste trabalho, quatro espécies de Bryconamericus foram caracterizadas citogeneticamente, sendo: duas populações de B. aff. iheringii (rio Ijuí, bacia do Alto rio Uruguai/rio Iguaçu, bacia do Baixo rio Paraná), B. coeruleus (rio Piquiri, bacia do Alto rio Paraná), B. cf. ecai e B. cf. eigenmanni (riacho Bigua, Bacia do Alto rio Uruguai). Todas as espécies apresentaram 2n=52 cromossomos, com variação interpopulacional/interespecífica de fórmulas cariotípicas e número fundamental, corroborando o número diploide considerado basal para o gênero, e a ocorrência de rearranjos cromossômicos que atuam na dinâmica evolutiva deste grupo. Heterocromatinas foram evidenciadas nas regiões pericentromérica, telomérica e intersticial (em alguns cromossomos), e as AgRONs mostraram-se múltiplas, com variação intraespecífica, em B. aff. iheringii (Ijuí) e B. coeruleus; e simples para as demais espécies. A 18S rDNA-FISH confirmou a localização das RONs em B. aff. iheringii (Iguaçu), e nas demais espécies evidenciou sítios extras. Os sítios de 5S rDNA foram evidenciados majoritariamente na região terminal do braço curto, muitas vezes co-localizados aos genes de 18S rDNA, com variação intraespecífica (em B. aff. iheringii (Ijuí) e B. coeruleus) e interespecífica quanto ao número de sítios. A caracterização molecular destes genes revelou a presença de duas variantes de 5S rDNA, uma correspondente às cópias funcionais (V1), compostas por 120 pb que abrigam regiões promotoras para a transcrição e que resultam num RNA com estrutura secundária em Y, e a outra (V2) compreendendo cópias truncadas (pseudogenes), com perdas nucleotídicas nos promotores internos, resultando num RNA com estrutura secundária sem funcionalidade aparente. Dois NTSs também foram observados: um com 82 pb altamente conservadas mesmo entre as espécies, e que contém sequências de reconhecimento importantes no processo de transcrição; e outro com composição nucleotídica variável e a ausência destas sequências. A presença de pseudogenes associada a ocorrência de dois tipos de NTSs, sugerem que em Bryconamericus a evolução dos genes de 5S rDNA envolve mecanismos mistos de Nascimento e Morte e Evolução Concertada. Este trabalho traz os primeiros dados citogenéticos para estas populações de Bryconamericus, sendo o primeiro estudo em B. cf. eigenmanni, além de contemplar a primeira caracterização dos genes de 5S rDNA e a proposição de mecanismos evolutivos para estes genes, auxiliando na compreensão deste grupo Bryconamericus is a specious genus in Characidae, although few cytogenetic studies have been done in this group. In this work, four species of Bryconamericus were characterized cytogenetically, being: two populations of B. aff. iheringii (Ijuí River, Upper Uruguay River basin /Iguaçu river, Lower Paraná river basin), B. coeruleus (Piquiri river, Upper Parana River Basin), B. cf. ecai and B. cf. eigenmanni (Bigua stream, Upper Uruguay river basin). All species presented 2n=52 chromosomes, with interpopulational/interspecific variation of karyotype formulas and fundamental number, corroborating the diploid number considered basal for the genus, and the occurrence of chromosomal rearrangements that act on the evolutionary dynamics of this group. Heterochromatins were evidenced in the pericentromeric, telomeric and interstitial regions (in some chromosomes), and the AgNORs showed multiple, with intraspecific variation, in B. aff. iheringii (Ijuí) and B. coeruleus; and simple for the other species. 18S rDNA-FISH confirmed the location of the NORs in B. aff. iheringii (Iguaçu), and in the other species showed extra sites. 5S rDNA sites were mostly found in the terminal short arm region, often co-localized to the 18S rDNA genes, with intraspecific variation (in B. aff. iheringii (Ijuí) and B. coeruleus) and interspecific in number sites. The molecular characterization of these genes revealed the presence of two variants of 5S rDNA, one corresponding to functional copies (V1), composed of 120 bp that harbor transcriptional promoter regions and which result in an RNA with secondary structure in Y, and the other (V2) comprising truncated copies (pseudogenes), with nucleotide losses in the internal promoters, resulting in an RNA with secondary structure without apparent functionality. Two NTSs were also observed: one with 82 bp highly conserved even among species, and containing important recognition sequences in the transcription process; and another with variable nucleotide composition and the absence of these sequences. The presence of pseudogenes associated with the occurrence of two types of NTSs suggests that in Bryconamericus the evolution of 5S rDNA genes involves mixed Birth-and-Death mechanisms and Concerted Evolution. This work presents the first cytogenetic data for these Bryconamericus populations, being the first study in B. cf. eigenmanni, besides contemplating the first characterization of the genes of 5S rDNA and the proposition of evolutionary mechanisms for these genes, helping in the understanding of this group

Orientador: Prof. Dr. Vladimir Pavan Margarido Coorientadora: Prof.ª Dr.ª Carla Simone Pavanelli Tese (doutorado em Biologia Comparada) - Universidade Estadual de Maringá, 2019 Pimelodidae é uma família de peixes endêmica e amplamente distribuída na região Neotropical. Com 114 espécies as relações filogenéticas entre seus gêneros ainda não são totalmente compreendidas. Com o objetivo de gerar dados que possam auxiliar no entendimento das relações dentro desta família, foram realizados estudos citogenéticos e análises moleculares em dez espécies de três gêneros de Pimelodidae que ocorrem ao longo das bacias hidrográficas brasileiras. Os exemplares foram coletados no rio Piquiri, bacia do Alto rio Paraná; no rio Iguaçu, jusante às Cataratas do Iguaçu na bacia do Médio rio Paraná; no rio Iguaçu, bacia do Baixo rio Iguaçu; no rio Ijuí, bacia do Alto rio Uruguai; no rio Uruguai, bacia do baixo rio Uruguai; no rio Miranda, bacia do Alto rio Paraguai e no Lago Catalão, na bacia Amazonica. Buscando compreender as relações filogenéticas envolvendo Iheringichthys e Bergiaria, foram realizados estudos citogenéticos e do DNA mitocondrial em três populações de Iheringichthys labrosus, uma população determinada como Iheringichthys cf. syi e uma população de Bergiaria westermanni. Estudos citogenéticos básicos e moleculares foram realizados em Pimelodus pantaneiro do rio Miranda, bacia do Alto rio Paraguai e em Pimelodus cf. blochii da bacia Amazônica, além do mapeamento de sequências repetitivas U2 snDNA em seis espécies de Pimelodus. As análises mostraram a presença de 2n=56 cromossomos em todas as espécies, exceto em 4 exemplares de Pimelodus cf. blochii, reforçando a hipótese de número diplóide basal para a família. As AgRONs, confirmadas pela FISH-DNAr 18S, foram localizadas na região terminal de um par de cromossomos nas espécies de Iheringichthys e Pimelodus, exceto nos cariomorfos B e C de Pimelodus cf. blochii em que múltiplos cístrons de DNAr 18S foram observados, sendo essa uma condição nova para as espécies de Pimelodidae estudadas até o momento, pois todas as outras espécies possem esses sítios em apenas um par de cromossomo. O padrão de distribuição de heterocromatina encontrado é semelhante ao observado em outros Pimelodidae, com maiores divergências em Pimelodus cf. blochii, apresentando divergencias específicas entre as espécies permitindo sua caracterização, consistindo em um importante marcador. A localização das sequências de DNAr 5S em Iheringichthys permitiu diferenciar I. labrosus de I. cf. syi, podendo ser utilizado como marcador taxonômico. As análises de máxima verossimilhança e Bayesiana agruparam B. westermanni e I. cf. syi em um clado distinto das populações de I. labrosus. As diferenças citogenética e moleculares entre essas espécies sugerem que I. cf. syi deve ser realocado em Bergiaria ou que todas estas espécies devem fazer parte do mesmo gênero, reforçando a necessidade de uma revisão taxonômica das espécies destes gêneros. A localização do U2 snDNA foi observada em um par de cromossomos na região pericentromérica em todas as espécies de Pimelodus, aqui estudadas, demostrando uma provável manutenção do padrão de dispersão desses gene no genoma dessas espécies. Em P. pantaneiro o DNAr 5S foi encontrado em dois pares de cromossomos. As análises citogenéticas em Pimelodus cf. blochii mostram a ocorrência de três cariomorfos (A, B e C) com variações na localização e no número de sítios de DNAr 5S e 18S. Os dados citogenéticos e moleculares de Iheringichthys e Bergiaria possibilitam a melhor compreensão da história evolutiva ocorrida entra suas espécies e sugerem um novo arranjo para esses grupos. A descrição da organização cariotípica de Pimelodus pantaneiro e o mapeamento da sequências repetitivas U2 snDNA, pela primeira vez em espécies de Pimelodus, fornecem importantes informações sobre a organização genômica desse grupo. Os resultados do presente estudo revelam dados que contribuem para o conhecimento da história evolutiva das espécies de Pimelodidae, permitem estabelecer e compreender as relações filogenéticas dentro dos grupos e auxiliam na identificação das espécies, fornecendo bases para planos de manejo e conservação adequados Pimelodidae is an endemic and widely distributed fish family in the Neotropical region. With 114 species, phylogenetic relationships among their genera are not yet fully understood. In order to generate data that could help in understanding the relationships within this family, cytogenetic studies and molecular analyzes were performed on ten species of three genera of Pimelodidae that occur along the Brazilian watersheds. The specimens were collected in the Piquiri River, Upper Parana River Basin; on the Iguaçu River, downstream of the Iguaçu Falls in the Middle Paraná River Basin; on the Iguaçu River, Lower Iguaçu River Basin; on the Ijuí River, Upper Uruguay River Basin; on the Uruguay River, the Uruguay River basin; on the Miranda River, the Upper Paraguay River Basin and on the Catalão Lake, in the Amazon basin. In order to understand the phylogenetic relationships involving Iheringichthys and Bergiaria, cytogenetic and mitochondrial DNA studies were performed in three populations of Iheringichthys labrosus, one population determined as Iheringichthys cf. syi and one population of Bergiaria westermanni. Basic and molecular cytogenetic studies were performed in Pimelodus pantaneiro of the Miranda River, Upper Paraguay River basin and in Pimelodus cf. blochii of the Amazon basin, besides the mapping of repetitive sequences U2 snDNA in six species of Pimelodus. The analyzes showed the presence of 2n = 56 chromosomes in all species, except in four specimens of Pimelodus cf. blochii, reinforcing the hypothesis of basal diploid number for the family. The AgNORs, confirmed by FISH-rDNA 18S, were located in the terminal region of a pair of chromosomes in the Iheringichthys and Pimelodus species, except in the B and C caryomorphs of Pimelodus cf. blochii in which multiple cistrons of 18S rDNA were observed, a new condition for the Pimelodidae species studied so far, since all other species have these sites in only one pair of chromosomes. The pattern of heterochromatin distribution found is similar to that observed in other Pimelodidae, with greater divergences in Pimelodus cf. blochii, presenting specific divergences among the species allowing its characterization, consisting of an important marker. The location of the 5S rDNA sequences in Iheringichthys allowed differentiating I. labrosus from I. cf. syi, and can be used as a taxonomic marker. The maximum likelihood and Bayesian analyzes grouped B. westermanni and I. cf. syi in a distinct clade of the populations of I. labrosus. The cytogenetic and molecular differences between these species suggest that I. cf. syi must be reallocated in Bergiaria or that all these species should be part of the same genus, reinforcing the need for a taxonomic revision of the species of these genera. The location of U2 snDNA was observed in a pair of chromosomes in the pericentromeric region of all Pimelodus species studied, demonstrating a possible maintenance of the dispersion pattern of these genes in the genome of these species. In P. pantaneiro, 5S rDNA was found on two pairs of chromosomes. Cytogenetic analyzes in Pimelodus cf. blochii show the occurrence of three caryomorphs (A, B and C) with variations in the location and number of 5S and 18S rDNA sites. The cytogenetic and molecular data of Iheringichthys and Bergiaria provide a better understanding of the evolutionary history of their species and suggest a new arrangement for these groups. The description of the karyotypic organization of Pimelodus pantaneiro and the mapping of the repetitive sequences U2 snDNA, for the first time in species of Pimelodus, provide important information about the genomic organization of this group. The results of the present study reveal data that contribute to the knowledge of the evolutionary history of the Pimelodidae species, allow to establish and understand the phylogenetic relationships within the groups and to assist in the identification of the species, providing the basis for adequate management and conservation plans

Recentemente a citogenética de aves tem apresentado grandes avanços com o advento de técnicas moleculares como a hibridização in situ fluorescente (FISH). As aves possuem características evolutivas interessantes, principalmente pelo seu tamanho de genoma reduzido e cariótipo em formato bimodal. A ordem Caprimulgiformes é uma das menos conhecidas do ponto de vista citogenético. Nesse trabalho duas espécies de famílias distintas foram analisadas Nyctibius griseus (Nyctibiidae) e Hydropsalis torquata (Caprimulgidae), com 2n= 86 e 74 cromossomos respectivamente. A citogenética clássica contribuiu para a identificação das regiões ricas em heterocromatina constitutiva, com o uso de bandeamento CBG nas duas espécies, apresentando grande acúmulo no cromossomo W em ambas e em alguns pares de microcromossomos de N. griseus. O bandeamento GTG estabeleceu o padrão de bandas positivas e negativas de N. griseus, reiterando as diferenças dos cromossomos Z e W desta espécie, um peculiar elemento deste cariótipo, que apresenta características diferentes de outras aves e até mesmo de H. torquata sendo homomórfico ao cromossomo Z. Utilizando técnicas moleculares de hibridização com sondas de sequências rDNA 18S foram encontrados sinais positivos em apenas um par de microcromossomos na mesma região onde também foi hibridizada a sonda (CGG)10 em ambas espécies. Dentre as seguintes sequências repetitivas (CA)15, (CAA)10, (CAC)10, (CAG)10, (CAT)10, (CGG)10, (GA)15, (GAA)10, (GAG)10, (GC)15 e (TA)15, somente (CA)15 e (TA)15 não hibridizaram no cromossomo W de N. griseus, em contraste, o W de H. torquata não apresentou nenhum sinal de hibridização. Em relação aos cromossomos autossômicos, H. torquata exibiu sinais de hibridização de quatro sequências repetitivas (CA)15, (CAC)10, (CGG)10, e (TA)15, todas em cromossomos autossômicos, ao passo que, em N. griseus somente as sequências (CA)15, (CAC)10 e (CGG)10, hibridizaram, sendo todas elas em microcromossomos. Esses dados indicam que, no decorrer da história evolutiva desse grupo o genoma de H. torquata acumulou menos sequências microssatélites que o genoma de N. griseus diferenciando essas duas linhagens na ordem Caprimulgiformes. Por fim é possível inferir que o cromossomo W de N. griseus reagiu a pressões evolutivas utilizando mecanismos singulares que permitiram a obtenção de características que o difere do W de outras aves neognatas. Estes resultados revelam a importância deste tipo de sequência na evolução e diferenciação do cromossomo sexual W. Recently, the avian cytogenetics has presented great advances with the advent of molecular techniques such as fluorescence in situ hybridization (FISH). Birds have interesting evolutionary characteristics, mainly due to their reduced genome size and bimodal karyotype. The order Caprimulgiformes is one of less known from the cytogenetic point of view. In this work two species of distinct families were analyzed Nyctibius griseus (Nyctibiidae) and Hydropsalis torquata (Caprimulgidae), with 2n = 86 and 74 chromosomes respectively. Classical cytogenetics contributed to the identification of the regions rich in constitutive heterochromatin with CBG banding in this two species, presenting large accumulation in the W chromosome in both and in some pairs of N. griseus microchromosomes. The GTG banding established the pattern of positive and negative bands in N. griseus, reiterating the differences of the Z and W chromosomes from this species, a peculiar element in its karyotype, which presents different characteristics from other birds and even from H. torquata being homomorphic to Z chromosome. Using is situ hybridization with 18S rDNA sequences probes, positive signals were found in only one pair of microchromosomes in the same region where the (CGG)10 probe was also hybridized, thus both species present the same condition. Among the repetitive sequences (CA)15, (CAA)10, (CAC)10, (CAG)10, (CAT)10, (CGG)10, (GA)15, (GAA)10, (GAG)10, (GC)15 and (TA)15, only (CA)15 and (TA)15 did not hibridize in the W chromosome of N. griseus, in contrast, the W of H. torquata has not present any signal of hibridization. Regarding to autosomal chromosomes, H. torquata showed signals of hybridization of four repetitive sequences (CA)15, (CAC)10, (CGG)10, and (TA)15, all on autosomal macrochromosomes, whereas in N. griseus only sequences (CA)15, (CAC)10 and (CGG)10 hybridized, all of them in microchromosomes. These data indicate that during the evolutionary history of this group H. torquata genome accumulated less microsatellites sequences than the N. griseus genome, differentiating these two lineages in the order Caprimulgiformes. In conclusion, it is possible to infer that W chromosome of N. griseus reacted to evolutionary pressures using unique mechanisms wich allowed to obtain distinguishing features from the W of other neognathae birds. These results reveal the importance of this kind of sequence in the evolution and differentiation of the W sex chromosome.

Submitted by Eunice Novais (enovais@uepg.br) on 2018-09-06T18:06:00Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Fernanda Silva.pdf: 8612783 bytes, checksum: 75134e09c730581d4c96c8bf2b470456 (MD5) Made available in DSpace on 2018-09-06T18:06:00Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Fernanda Silva.pdf: 8612783 bytes, checksum: 75134e09c730581d4c96c8bf2b470456 (MD5) Previous issue date: 2018-02-26 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior O turismo em ambientes marinhos é uma atividade crescente a cada ano, principalmente em regiões de litoral atrativo. Uma das principais práticas dos turistas refere-se à oferta de alimentação suplementar para peixes, tais como pão, biscoitos e outros alimentos artificiais na dieta desses indivíduos. Por um lado, essa atividade pode ajudar na sensibilização ambiental, mas também resulta em impactos negativos pouco compreendidos. Sendo assim, o objetivo deste estudo foi analisar os efeitos da alimentação por turistas na dieta do peixe Haemulon aurolineatum em recifes coralíneos do Rio Grande do Norte. Duas áreas foram escolhidas para a coleta dos espécimes: uma com alimentação suplementar ofertada por turistas – Parrachos de Maracajaú, e outra com alimentação natural – Parrachos de Rio do Fogo. Foram tomadas as medidas de comprimento, peso, índice hepatossomático (IHS) e fator de condição (K) das duas áreas amostrais. Para confirmação da classe etária dos indivíduos, foram contados os anéis de crescimento presentes no otólito Sagitta. Os itens consumidos foram identificados na menor categoria taxonômica possível e os resultados foram comparados através de NMDS e ANOSIM. Também foi analisado o teor de amido do conteúdo estomacal. O teste estatístico t apontou diferença para o comprimento dos indivíduos, possivelmente pela alta ingestão de alimentos. Entretanto os testes apontaram equivalência para o peso, IHS e K. A análise de NMDS diferenciou os itens consumidos para as duas regiões amostradas e a análise de similaridade confirmou que o turismo reflete em modificações na composição da dieta. O conteúdo estomacal dos indivíduos coletados na região com alimentação suplementar apresentou 48,73% de amido em sua composição. Considerando a dieta natural dessa espécie, a ingestão de carboidratos pode interferir no acúmulo energético individual. Adicionalmente, as presas habituais de H. aurolineatum não estão sendo capturadas, o que pode acarretar desequilíbrio entre as populações. Nossos resultados procuram contribuir para o manejo de áreas recifais, com redução do volume e controle do tipo de alimento ofertado, para que o turismo seja de fato, uma atividade sustentável. Tourism in marine environments is growing every year, especially in attractive coastal regions. One of the regular practices of tourists refers to supplementary food provisioning for fish, such as bread, biscuits and other artificial foods in the diet of these individuals. On the one hand, this activity can assist in fish conservation and environmental awareness, but on the other hand it results in negative impacts little understood so far. Thus, the objective of this study was to analyze the effects of food offer by tourists in the diet of the fish Haemulon aurolineatum in coral reefs of Rio Grande do Norte. Two areas were chosen for collection: one with supplementary feeding offered by tourists - Parrachos de Maracajau, and another with natural food - Parrachos do Rio do Fogo. Measures of length, weight, hepatosomatic index (HSI) and condition factor (K) of the two sampling areas were taken. To confirm the age class of individuals, the growth rings present in the otolith Sagitta were counted. The consumed items were identified to the smallest taxonomic category possible and the results were compared through NMDS and ANOSIM. The starch content of the stomach contents has also been analyzed. The t test pointed out differences in individuals’ length, possibly due to high food intake. However, the t tests pointed equivalent weight, HSI and K for both areas. The NMDS differentiated the items consumed for the two sampled regions and the analysis of similarity confirmed that tourism reflects on modifications in diet composition. The stomach contents of supplementary fed individuals presented 48.73% starch in its composition. Considering the natural diet of this species, carbohydrate intake can interfere with individual energy accumulation. Additionally, H. aurolineatum habitual preys are not being captured, which may lead to imbalance among the populations. Our results try to contribute to the management of reef areas, with a reduction in the volume and control of the food type being offered, so that tourism can become in fact a sustainable activity.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) The order Osteoglossiformes represent one of the most basal groups among the Teleosteos. These fishes live exclusively on freshwater environments and are characterized by the presence of a bonytongue. The group is a good model for evolutive studies due the presence of alive representatives in all continental lands localized on south hemisphere (except the Antarctic continent) even with a gondwanica origin (allowing to perform inferences about vicariant/dispersal events). The members of the Notopteridae family are distributed throughout the African and Asian (in tropical region) continents. In order to explain the distribution of the Asian biota that has close relations with the species present in Africa, the hypothesis "Out-of-India" was proposed. The idea in this hypothesis is that the lineages previously present in Gondwana reached Asia through the continental drift of the Indian subcontinent. This idea was considered the better explanation for the distribution of notopterids during a long time, but recent molecular data disclose disagreements between the geological times of tectonic drift and molecular divergence. In this context, we perform chromosomal and molecular approaches to infer about the group's diversity in relation to its biogeography. Chromosomal approaches involved classical banding techniques as well as FISH assays using repetitive DNA probes, chromosome painting and CGH; while the molecular approach was performed through the analysis of allelic sequences containing SNP polymorphisms obtained by the DArTseq genotyping technique, which involves next generation sequencing technology. The results of cytogenetic data pointed a diploid number variation in two of the seven species here studied, and also was verified variations for the distribution of the rDNA 18S and rDNA 5S markers for three species. This variation for the karyotype structure in the family was better evidenced by the CGH results, in which few chromosomal segments were shared between the intergeneric crossings assays. Indeed, these chromosomal variations was expected due the ancient divergent time in scale of tens of millions years ago between the lineages. The chromosome painting results showed a shared segment in all the seven species, pointing a possible linkage site that was also in the ancestor of the group. The PCA analysis of the polymorphisms obtained by DArTseq grouped the species according to their geographic distribution, result that was also verified by a Bayesian analysis when both chromosomal and molecular markers was combined. Thus, based on our data here obtained together with the molecular data obtained in the literature, we infer about the possibility of a gene flow occurring even after the separation of the African and Indian continental masses, discussing possibilities of the existence of temporary bridges linking Africa to the subcontinent Indian Ocean through the island of Madagascar and the Seychelles archipelago. Indeed, the existence of gene flow through temporary bridges in some moment linking the Africa to islands present in the sea localized on the African east coast is discussed in several groups of limited dispersion, which gave rise to an alternative hypothesis to "Out-of-India", called "Lemurian-step-stones". This approach from the point of view of "Lemurian-step-stones" is the first one carried out on freshwater fish. A ordem Osteoglossiformes representam um dos grupos mais basal dentre os Teleósteos. São peixes exclusivamente de água-doce caracterizados pela presença de uma língua óssea. O grupo é um bom modelo para estudos evolutivos devido a presença de seus representantes vivos em todos as massas continentais do hemisfério sul (exceto Antártica) mesmo possuindo uma origem gondwanica (permitindo assim realizar inferências sobre eventos vicariantes/dispersão). Os membros da família Notopteridae encontram-se distribuídos pelos continentes africano e asiático (na região tropical). Para explicar a distribuição da biota asiática que possui relações próximas às espécies presentes na África, foi proposta a hipótese “Out-of-India”, que diz que as linhagens presentes antes no Gondwana chegaram até a Ásia por meio da deriva continental do subcontinente indiano. Esta ideia foi considerada a mais adequada para explicar a distribuição dos notopterídeos por um bom tempo, porém dados moleculares recentes demonstram discordâncias entre os tempos geológicos de deriva tectônica e a divergência molecular. No contexto desta problemática, realizamos abordagens cromossômicas e moleculares para inferir sobre a diversidade do grupo em relação a sua biogeografia. As abordagens cromossômicas envolveram as técnicas de bandeamento clássicas assim como ensaios de FISH utilizando sondas de DNA repetitivos, pintura cromossômica e CGH; enquanto que a abordagem molecular foi realizada através da análise de sequencias alélicas contendo polimorfismos SNP obtidas pela técnica de genotipagem DArTseq, que envolve técnicas de sequenciamento de nova geração. Os resultados dos dados citogenéticos apontaram uma variação do número diploide em duas das sete espécies estudadas, assim como foram verificadas variações para a distribuição dos marcadores rDNA 18S e 5S em três espécies. Esta variação na estrutura cariotípica na família fica melhor evidenciada com os resultados de CGH, no qual poucos segmentos cromossômicos são compartilhados para os cruzamentos intergêneros. Estas variações são esperadas dado aos tempos de divergências na escala de dezenas de milhões de anos apresentados entre estas linhagens. O resultado de pintura cromossômica aponta o compartilhamento de um segmento entre todas as espécies, indicando um possível sítio de ligação presente no ancestral comum. A análise dos polimorfismos obtidos através de DArTseq por PCA agrupou as espécies de acordo com a distribuição geográfica, resultado também verificado por uma análise Bayesiana casando os marcadores cromossômicos e moleculares. Assim, baseados nos nossos dados aqui obtidos juntamente com os dados moleculares obtidos na literatura, inferimos sobre a possibilidade da ocorrência de um fluxo gênico mesmo após a separação das massas continentais Africanas e Indiana através da existência de pontes temporárias ligando a África ao subcontinente indiano compostas pelas ilhas de Madagascar e do arquipélago de Seychelles. De fato, a existência de fluxo gênico através de pontes temporárias ligando a África às ilhas presentes no oceano ao leste da costa africana é discutido em diversos grupos de dispersão limitada, o que deu origem a uma hipótese alternativa a “Out-of-India”, chamada de “Lemurian-step-stones”. Esta abordagem sob o ponto de vista da “Lemurian-step-stones” é a primeira realizada em peixes de agua-doce.

O Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) A Série Percomorpha é maior divisão entre os vertebrados, constituindo o maior e mais derivado clado de peixes teleósteos. Dentre suas Ordens, Perciformes e Labriformes constituem modelos adequados à investigação do conservadorismo e diversificação cromossômica. Em Perciformes o conservadorismo cromossômico é representado por cariótipos basais com 2n=48 acrocêntricos, extensivamente compartilhados por uma parcela considerável de espécies. As causas e extensão do conservadorismo cariotípico em várias famílias desta Ordem não são inteiramente claras. Diante da diversidade de espécies em Labriformes, aspectos mais detalhados de sua evolução cariotípica ou mesmo status taxonômico de algumas espécies merecem particular atenção. Com vistas a contribuir com novas informações sobre essas questões foram implementadas análises cromossômicas convencionais (coloração convencional com Giemsa, bandamento C e Ag-RONs, fluocrocromos base-específicos) e citomoleculares (hibridização in situ com sondas DNAr 18S, DNAr 5S). Oito espécies dos gêneros Anisotremus e Haemulon da família Haemulidae (Perciformes) foram analisadas, incluindo amostras de diferentes áreas do Atlântico, como modelo de evolução conservativa. Em 2 espécies do gênero Bodianus da família Labridae (Labriformes), foram analisados também aspectos da evolução de sequências repetitivas particulares (DNAr 18S, DNAr 5S, Alu e Tol2) nos cromossomos por hibridização com 5 metilcitosina (5mC). Adicionalmente, foram realizadas comparações filogenéticas, utilizando sequências de DNA mitocondrial (COI e 16S) e nuclear (Rodopsina) para verificar o status taxonômico da espécie Bodianus insularis, endêmica das ilhas Meso-Atlânticas. Todas as espécies de Haemulidae apresentaram 2n=48a, sítios Ag-RONs simples e heterocromatina centromérica reduzida, além de considerável compartilhamento de sítios de DNAr 5S e 18S, confirmando a ocorrência de estase cariotípica na família. Os padrões cariotípicos das populações de A. virginicus e H. chrysargyreum entre o Caribe e Atlântico Sul não revelaram variações cromossômicas decorrentes da barreira dos deságues dos rios Amazonas/Orinoco. Em Bodianus, as análises identificaram uma notável região descondensada em um par cromossômico subtelocêntrico, denominada região BOD. Entre suas características constitutivas e funcionais particulares, se mostram DAPI-, argentofílica (Ag+), marcantemente hipometilada e saturada de elementos transponíveis, sugerindo que a participação destes elementos móveis pode ter contribuído para sua gênese e dinâmica epigenética complexa. Quanto a espécie endêmica B. insularis, sua divergência genética é muito inferior à apresentada por espécies diferenciadas sugerindo que embora represente um grupo geograficamente isolado, constitua uma sinonímia de B. pulchellus. A divergência nos ritmos de diversificação cariotípica entre Haemulidae e Labridae é aqui discutida à luz de características cariotípicas intrínsecas que podem favorecer o tamponamento e a fixação de mudanças cromossômicas e aspectos biológicos das espécies que contribuem para as condições particulares de evolução cariotípica desses dois grupos de peixes marinhos. Percomorpha series is the largest division among vertebrates, constituting the largest and most derived clade of teleostean fishes. Among its Orders, Perciformes and Labriformes constitue adequated models for the investigation of conservatism and chromosomal diversification. In Perciformes the chromosomal conservatism is represented by basal karyotypes with 2n = 48 acrocentric, extensively shared by a considerable portion of species. The causes and extent of the karyotypic conservatism in various families of this Order are not entirely clear. In front of the diversity of species in Labriformes, more detailed aspects of its karyotype evolution or even the taxonomic status of some species deserve particular attention. In order to contribute with new information on these issues, it was implemented conventional chromosome analysis (conventional staining with Giemsa, C-banding and Ag- NORs, base-specific fluochromes) and cytomolecular (in situ hybridization with 18S rDNA, 5S rDNA) probes were implemented. Eight species of the genera Anisotremus and Haemulon of the family Haemulidae (Perciformes) were analyzed, including samples from different areas of the Atlantic, as a model of conservative evolution. In 2 species of the Bodianus genus Labridae (Labriformes), it was also analyzed aspects of the evolution of particular repetitive sequences (DNAr 18S, DNAr 5S, Alu and Tol2) in the chromosomes by hybridization with 5 methylcytosine (5mC). Additionally, phylogenetic comparisons were performed using mitochondrial (COI and 16S) and nuclear (Rhodopsin) DNA sequences to verify the taxonomic status of the Bodianus insularis species, endemic to the Meso-Atlantic islands. All Haemulidae species presented 2n = 48a, single Ag-NORs sites and reduced centromeric heterochromatin, besides considerable sharing of rDNA 5S and 18S sites, confirming the occurrence of karyotype stasis in the family. The karyotypic patterns of the populations of A. virginicus and H. chrysargyreum between the Caribbean and the South Atlantic did not reveal chromosomal variations due to the barrier of the discharges of the Amazonas / Orinoco rivers. In Bodianus, the analyzes identified a remarkable decondensed region in a subtelocentric chromosomal pair, denominated BOD region. Among its particular constitutive and functional characteristics, it is DAPI-, Argentofílica (Ag +), markedly hypomethylated and saturated with transposable elements, suggesting that the participation of these mobile elements may have contributed to its genesis and complex epigenetic dynamics. In relation to the endemic species B. insularis its genetic divergence is much inferior to that presented by differentiated species suggesting that although it represents a geographically isolated group, it constitutes a synonym of B. pulchellus. The divergence in the rates of karyotype diversification between Haemulidae and Labridae is discussed here in the light of intrinsic karyotype characteristics that may favor the buffering and the fixation of chromosomal changes and biological aspects of the species that contributes to particular conditions of karyotype evolution of these two groups of marine fish.

Made available in DSpace on 2017-07-21T19:59:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Miguel Soto.pdf: 3392628 bytes, checksum: 62e83dd8713fab1173dd8f45d005072c (MD5) Previous issue date: 2017-02-22 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior Within the great biodiversity of freshwater fish of South America, the Characidae family has been one of the most controversial groups taxonomically. In the trans-Andean country of Chile, the family is represented only by the Cheirodontinae of the genus Cheirodon and its five species, of which C. pisciculus, C. galusdae, C. kiliani and C. australe are endemic, and C. interruptus is native to the Atlantic basins of Argentina, Uruguay and Brazil. In order to contribute to the description of the evolutionary relationships and taxonomic delimitation of the species of genus Cheirodon present in Chile, the karyotypes of these five species are described for the first time and compared by their diploid number, chromosomic morphology, C bands, Nucleolar Organizer Regions (Ag-NOR) and the rDNA 5S and 18S marking by fluorescence in situ hybridization (FISH). For all the analyzed species the diploid number was 50 chromosomes, varying in the karyotype formula among the metacentric, submetacentric, subtelocentric and acrocentric types. The number of chromosome arms was 68 in C. australe and C. kiliani and 66 in C. galusdae, C. pisciculus and C. interruptus. The presence and distribution of constitutive heterochromatin was similar in the five species, being observed mainly in the centromeres and telomeres. Variation in the number and distribution of the 5S and 18S rDNA regions was observed, being those two clusters on different chromosomes or in syntenia. It was also observed a variation in the activity of RONs, being found in C. kiliani and C. galusdae, the highest level of relative activity. There is a greater karyotype similarity between the two species that living more to the south in relation to those with the most central and north distribution, evidencing a reflection of hydrograph formation and species isolation. Dentro da grande biodiversidade de peixes de água doce de América do Sul,a família Characidae tem sido um dos grupos mais controversos taxonomicamente. No país transandino Chile, a família é representada apenas pelos Cheirodontinae do gênero Cheirodon e suas cinco espécies, das quais C. pisciculus, C. galusdae, C. kiliani e C. australe são endêmicas. No entanto C. interruptus é originaria das bacias atlânticas da Argentina, Uruguai e Brasil. Para contribuir na descrição das relações evolutivas e delimitação taxonômica das espécies do gênero Cheirodon presentes no Chile, são descritos pela primeira vez os cariótipos destas cinco espécies e comparados segundo seu número diplóide, morfologia cromossômica, bandas C, Regiões Organizadoras do Nucléolo (Ag-RON) e a marcação de DNAr 5S e 18S por hibridação in situ fluorescente (FISH). Para todas as espécies analisadas o número diplóide foi de 50 cromossomos, variando na fórmula cariotípica entre os tipos metacêntricos, submetacêntricos, subtelocêntricos e acrocêntricos. O número de braços cromossômicos foi de 68 em C. australe e C. kiliani e de 66 em C. galusdae, C. pisciculus e C. interruptus. A presença e distribuição da heterocromatina constitutiva foi similar nas cinco espécies, sendo observada principalmente nos centrômeros e telômeros. Foi observada variação no número e distribuição das regiões de DNAr 5S e 18S, podendo esses dois clusters estar em cromossomos diferentes ou em sintenia. Também foi observada variação na atividade das RONs, sendo encontrado em C. kiliani e em C. galusdae, o maior nível de atividade relativa. Existe maior similaridade cariotípica entre as duas espécies ocorrentes mais ao sul do que destas em relação àquelas mais centrais e ao norte, mostrando um reflexo da formação da hidrografia e isolamento das espécies.

Orientadora : Profª Drª Iris Hass Coorientadora : Profª Drª Roberto Ferreira Artoni Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética. Defesa: Curitiba,20/03/2017 Inclui referências : f. 44-48 Resumo: Cromossomos B, ou cromossomos extranumerários, são elementos extras ao complemento padrão de uma espécie. Eles apresentam comportamento distinto ao complemento A e não obedecem às frequências Mendelianas, resultado de uma gametogênese desbalanceada. Em mamíferos, aproximadamente 70% dos cromossomos B descritos ocorrem na ordem Rodentia. Akodon montensis é a única espécie do gênero a apresentar cromossomos B, cuja origem ainda é desconhecida. Este trabalho teve como objetivo analisar variações morfológicas, numéricas e possíveis homologias entre os cromossomos extranumerários e o complemento A, encontrados em uma população de Akodon montensis na ilha de São Francisco do Sul, Santa Catarina. Sondas de cromossomos B inteiros para pintura cromossômica foram desenvolvidas utilizando microdissecção cromossômica, sondas de DNA repetitivo 18S, 5S e sequencia telomérica também foram utilizadas. Análises morfológicas dos cromossomos permitiram a identificação de quatro tipos de cromossomos B na população: na população. As hibridações com as sondas de cromossomos inteiros revelaram homologia entre todos os cromossomos B, mas não mostraram sinal cromossomos A. Os resultados indicam que os cromossomos B dessa população podem ter uma origem comum antiga, que resultou na variação de tamanho e morfologia observados. Palavras-chave: Rodentia, Akodon montensis, cromossomo B, DOP-PCR, FISH, pintura cromossômica. Abstract: B chromosomes are extra chromosomes to the standard complement that occur in about 15% of eukaryotes. They present parasite behavior and do not follow Mendelain heritage patterns, resulting in an unbalanced gametogenesis. In mammals, about 70% of reported B chromosomes occur in Rodentia. Akodon montensis is a South American rodent known to host B chromosomes. The purpose of this work was to analyze morphology, frequency, and possible homologies amongst various B chromosomes found in an isolated population in São Francisco do Sul Island, Brazil. Morphological analysis identified four different B euchromatic chromosomes types. Whole chromosome probes were manufactured through microdissection of all B types singly. The rDNA 18S, 5S and telomeric probes were also employed in addition of the nucleolar organizing regions by Ag-NORs. The larger rDNA had polymorphic labeling, except for B chromosomes, whereas the 5S rDNA was located exclusively in the interstitial position of the long arm of the chromosomes 5. Whole chromosome painting with B probes by fluorescent in situ hybridization revealed homologous composition for all four types of B chromosomes in this population, but no occurrence of homologous regions in autosomal chromosomes or the sex chromosomes. These results indicate that B chromosomes in this population may have a common origin, with posterior size and morphology diversification. Key words: Rodentia, Akodon montensis, B chromosome, DOP-PCR, FISH, chromosome painting

CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior FAPEMIG - Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais No Brasil, foram construídas diversas usinas hidrelétricas ao longos dos anos e na mesorregião do Triângulo Mineiro e Alto Paranaíba, isolando partes dos rios. Os peixes têm sofrido grandes impactos, com a construção de reservatórios, alterando o ciclo biológico dessas espécies que estão relacionados aos ciclos hidrológicos, alterando a conectividade entre o rio e áreas de reprodução. A espécie Cichlasoma paranaense (família Cichlidae), foi escolhida pois ocorre em diferentes regiões do Triângulo Mineiro, e os marcadores citogenéticos utilizados foram Ag-RONs, DAPI, Cromomicina e bandeamento C e um molecular foi o sequenciamento parcial da COI mitocondrial. Assim, o objetivo foi avaliar se o tempo de implementação das barragens nos Rios Araguari, Tijuco, Paranaíba e Grande foi suficiente para afetar a variabilidade genética das populações desta espécie. A bacia do Rio Paranaíba apresenta um total de dezesseis usinas hidrelétricas instaladas ao longo dos seus principais cursos d’água. Os dados citogenéticos referentes ao número e morfologia cromossômica (2n) das populações corroboram o conservadorismo cariotípico dos ciclídeos neotropicais, apresentando em sua maioria cromossomos com 2n=48 subtelo-acrocêntricos com Ag-RONs simples. Variações na fórmula cariotípica (FC) e nas marcações de bandeamento C, e variações na rede de haplótipos foram observadas e podem ser consequência do isolamento populacional imposto pela construção de barragens ao longo dos anos nestes rios. A proximidade genética entre as populações do Rio Grande e Paranaíba, geograficamente distantes, nos levam a sugerir que outras regiões do DNAmt e do DNA nuclear devem ser sequenciadas e novos marcadores devem ser empregados, como os microssatélites. Que irá possibilitar identificar mais precisamente as relações genéticas entre as populações aqui estudadas, e possivelmente com populações de rios onde não há barragens, podendo auxiliar futuras ações de conservação nos rios do Triângulo Mineiro. In Brazil, several hydropower plants were bilt over time in Triângulo Mineiro and Alto Paranaiba mesoregion, isolating parts of the rivers. With the construction of reservoirs fish have suffered major impacts, changing the life cycle of those species that are related to hydrological cycles, changing the connectivity between the river and breeding areas. The species Cichlasoma paranaense (family Cichlidae), was chosen because it occurs in different regions of Triângulo Mineiro, and cytogenetic markers used were Ag-NORs, DAPI, Chromomycin and C banding and a molecular was the partial sequencing of the mitochondrial COI. Therefore, the objective was to assess whether the implementation time of the dams on the Rivers Araguari, Tijuco, Paranaiba and Grande was enough to affect the genetic variability of the populations of this species. The basin of the Paranaiba River has a total of sixteen hydroelectric plants installed along its main watercourses. Cytogenetic data on the number and chromosome morphology (2n) of the population confirm the karyotype conservatism of Neotropical cichlids, featuring mostly chromosomes with 2n = 48 subtelo-acrocentrics simple Ag-NORs. Variations in karyotype formula (KF) and markings C banding, and variations in the haplotype network were observed and may be a consequence of population isolation imposed by dam construction over the years in these rivers. The genetic similarity between populations of Rio Grande and Paranaiba, geographically distant, lead us to suggest that other regions of the mtDNA and nuclear DNA must be sequenced and new markers should be employed, such as microsatellites, which will enable to identify more precisely the genetic relationships among populations studied here, and possibly with populations of rivers where there are no dams, and may help future conservation actions in the rivers of Triângulo Mineiro. Dissertação (Mestrado)

Made available in DSpace on 2017-07-21T19:59:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ieda Schleger.pdf: 2652464 bytes, checksum: d6b5e5be7baa4e50ef5c5874a9a4189d (MD5) Previous issue date: 2016-02-19 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior The family Characidae (Characiformes) is the most diverse in number of species among Neotropical fish. Many genera of this family, for no to present evidence of monophyly, are considered Incertae Sedis, such as Astyanax. This genus of fish groups popularly known as lambari, comprises 155 valid species. Astyanax serratus is considered endemic of the Iguaçu River, where is largely distributed. Astyanax laticeps occurs in coastal basins of the coastal region of Uruguay, south and southeast Brazil. These species are morphologically similar and are included in the complex A. scabripinnis. The purpose of this study was to determine A. serratus and A. laticeps are the same species in synonymy, or form distinct evolutionary units, but cryptic. Therefore, was used morphometric analysis, including measurements of body proportions relative to length of the body and of the head, counting number of teeth, cusps and fins. Cytogenetic analysis consisted in chromosome preparations conventional Giemsa staining, localization of constitutive heterochromatin by C-banding method, detection of nucleolar organizer regions (NORs) by impregnation with silver nitrate (Ag-NORs) and fluorescent in situ hybridization using DNA probes ribosomal (rDNA) 5S and 18S. The sequences used as DNA barcode, were obtained by partial amplification of cytochrome c oxidase I (COI) gene and the genetic distance calculated by the method of Kimura 2-parameters (K2P). The results of morphometric analysis revealed pre-jaw with two series of teeth, presence of hooks on anal and pelvic fins of males, elongated body with a humeral spot with narrow anteroventral extension in both species. Cytogenetic showed the same diploid number of 50 chromosomes, including the first pair of large metacentric chromosomes in relation to the others complements, the same karyotype formula (4m + 24sm + 6st + 16a) and even fundamental number (84). The markings of 5S rDNA coincide in the centromeric region of chromosome 19 pair and were evidenced multiple sites of 18S rDNA, located in the telomeric regions of the chromosomes in both species analyzed. The Ag-NORs showed to be coincident with 18S sites in most cases. The distribution of constitutive heterochromatin blocks occurred preferentially in the centromeric and terminals regions of chromosomes, coincident with the location of ribosomal sites and Ag-NORs in telomeric regions. The analysis of DNA barcode through the COI gene revealed an interspecific genetic divergence to 0.2%, a rate below the threshold considered for the separation of fish species (2%). These different levels of analysis suggest that A. serratus and A. laticeps are synonymous species, increasing the occurrence of A. laticeps for the Iguaçu River basin and enhancing the hypothesis of fauna sharing, caused by tectonic activities of crystalline shield. The interspecifc variations found in the mapping of constitutive heterochromatin, Ag-NORs and 18S rDNA are common in Astyanax and derived of events no robertsonian, while the differences may reflect the vicariant process, with geographic isolation of watersheds and gene flow restriction among the population of the Iguaçu River and coastal populations. A Família Characidae (Characiformes) é a mais diversa em número de espécies entre os peixes neotropicais. Muitos gêneros dessa Família, por não apresentarem evidências de monofiletismo, são considerados como Incertae Sedis, como é o caso de Astyanax. Este gênero agrupa peixes popularmente conhecidos como lambaris, sendo composto por 155 espécies válidas. Astyanax serratus é considerada endêmica do Rio Iguaçu, onde está amplamente distribuída. Astyanax laticeps ocorre nas bacias costeiras da região litorânea do Uruguai, sul e sudeste brasileiro. Estas espécies são morfologicamente semelhantes e estão incluídas no complexo Astyanax scabripinnis. O objetivo do presente estudo foi verificar se A. serratus e A. laticeps constituem uma mesma espécie, em sinonímia, ou formam unidades evolutivas distintas, mas crípticas. Assim, foi empregada análise morfométrica, incluindo medições das proporções corporais em relação ao comprimento do corpo e da cabeça, contagem do número de dentes, cúspides e de raios nas nadadeiras. A análise citogenética consistiu em preparações cromossômicas com coloração convencional por Giemsa, localização de heterocromatina constitutiva pelo método de bandamento C, detecção das regiões organizadoras de nucléolos por impregnação com nitrato de prata (Ag-RONs) e hibridação in situ fluorescente com sondas de DNA ribossomal (rDNA) 5S e 18S. As sequências utilizadas como DNA barcode foram obtidas através da amplificação parcial do gene citocromo c oxidase I e a distância genética calculada pelo método Kimura 2 Parâmetros (K2P). Os resultados da análise morfométrica revelaram pré-maxilar com duas séries de dentes, presença de ganchos nas nadadeiras anal e pélvicas de machos, corpo alongado, com uma mancha umeral com prolongamento anteroventral estreito em ambas as espécies. A citogenética evidenciou mesmo número diplóide, de 50 cromossomos, incluindo o primeiro par de cromossomos metacêntricos de grande porte em relação aos demais do complemento, mesma fórmula cariotípica (4m + 24sm + 6st + 16a) e mesmo número fundamental (84). As marcações de rDNA 5S coincidiram na região centromérica do par cromossômico 19 e foram evidenciados sítios múltiplos de rDNA 18S, localizados nas regiões teloméricas dos cromossomos em ambas as espécies analisadas. As Ag-RONs mostraram-se coincidentes com os sítios de 18S na maioria dos casos. A distribuição dos blocos de heterocromatina constitutiva ocorreu preferencialmente nas regiões centroméricas e terminais dos cromossomos, coincidentes com a maioria dos sítios ribossomais e das Ag-RONs nas regiões teloméricas. A análise do DNA barcode através do gene COI revelou uma divergência genética interespecífica de 0,2%, índice abaixo do considerado limiar para a separação de espécies de peixes (2%). Estes diferentes níveis de análise sugerem que A. serratus e A. laticeps são espécies sinônimas, ampliando a ocorrência de A. laticeps para a bacia do Rio Iguaçu e reforçando a hipótese de compartilhamento de fauna, provocado pelas atividades tectônicas do escudo cristalino. As variações interespecíficas encontradas no mapeamento de heterocromatina constitutiva, Ag-RONs e rDNA 18S são comuns em Astyanax e derivam de eventos não robertsonianos, mas também podem refletir um processo de vicariância, com o isolamento geográfico das bacias hidrográficas e restrição de fluxo gênico entre a população do rio Iguaçu e populações litorâneas.

Submitted by Angela Maria de Oliveira (amolivei@uepg.br) on 2019-11-08T19:21:47Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Zelinda Schemczssen.pdf: 3499040 bytes, checksum: ddbf5c376e6c760b3b2ae8539638031f (MD5) Made available in DSpace on 2019-11-08T19:21:47Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Zelinda Schemczssen.pdf: 3499040 bytes, checksum: ddbf5c376e6c760b3b2ae8539638031f (MD5) Previous issue date: 2016-02-19 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior Cromossomos B são componentes genômicos encontrados em vários grupos taxonômicos de plantas e animais. Até agora nenhuma evidência de efeitos fenotípicos detectáveis foi encontrado em indivíduos portadores de cromossomo B em Astyanax scabripinnis. Para conhecer a localização, variabilidade e natureza da cromatina do cromossomo B e elucidar possíveis regiões transcricionais, é necessário, a priori, obter padrões de bandas cromossômicas resolutivas. Através desta obtenção de bandas de replicação (bandas RBG) é possível saber em quais regiões o cromossomo B replica no início da fase S, onde nestes locais a cromatina pode ser matéria prima do genoma usado para transcrição. Neste estudo foram utilizados 35 exemplares de Astyanax aff. scabripinnis provenientes de rios da região de Campos do Jordão, São Paulo, em população previamente identificadas pela presença de cromossomos B. As amostragens foram realizadas em um ponto do Córrego da Fazenda Lavrinha, bacia do rio Paraíba do Sul. A população do de A. scabripinnis apresentou indivíduos com 2n=50 e 2n=51, estes portadores de um cromossomo B metacêntrico. Foi possível identificar regiões claras e escuras no cromossomo B, no início da replicação cromossômica, confirmando que a replicação não acontece de forma homogênea, elucidando que o cromossomo B de A. scabripinnis possui uma compartimentalização cromossômica, alusiva aos isocores observados em outros metazoários, que estão envolvidos na compartimentalização do genoma e estão relacionados ao suporte da regulação transcricional. Através da incorporação do análogo de base BrdU, in vivo, foi possível encontrar regiões do cromossomo B que replicam no início da fase S, diferencialmente caracterizadas em relação as regiões de replicação tardia. Nesta perspectiva é possível mostrar que o cromossomo B desta espécie possui território e cromatina disponíveis para transcrever, especialmente nas bandas claras de replicação inicial, sendo estas: p1.1; p1.3; p2.2 e q1.1; q1.3; q2.1; q2.3. As regiões de replicação tardia são correspondentes a blocos de heterocromatina constitutiva e localização preferencial de sequências repetitivas As51. Com o emprego do fluorocromo cromomicina CMA3 foi possível evidenciar regiões ricas em CG em diferente contraste das regiões ricas em AT, evidenciando que as regiões CG coincidem com regiões de replicação inicial, confirmando os dados obtidos para bandas de replicação e banca C. Comprovando e delimitando que o cromossomo B possui cromatina para transcrição é necessário que este estudo de continuidade para que, se possam identificar quais informações são transcritas, e o efeito fenotípico que estes possíveis genes localizados nestas regiões de replicação inicial, trazem ao indivíduo portador do cromossomo B. The B chromosomes are genomic components found in several taxonomic groups of plants and animals. So far no evidence of detectable phenotypic effects was found in specimens carrier chromosome B. In order to know the location, variability and nature of the chromatin of the B chromosome, and try to elucidate transcript regions, it is necessary, a priori, to obtain chromosomal bands patterns. After the determination of these replication bands (RBG bands), it is possible to know where the B chromosome begins to replicate, in the early S phase. These replication bands may have a local chromatin used as genome raw material for transcription. In this study 35 specimens of Astyanax aff. scabripinnis were analyzed and captured from rivers of Campos do Jordão regions, São Paulo, in populations previously identified by the presence of B chromosomes. The sample were made at one point of the Fazenda Lavrinha stream, Paraíba do Sul river basin. The specimens of the A. scabripinnis population presented a diploid number of 2n=50 and 2n=51, with a supernumerary metacentric B chromosome. It was possible to identify light and dark regions on B chromosome, at the chromosomal replication beginning, which confirm that replication does not happen in a homogeneous way. Thus, the B chromosome of A. scabripinnis has a chromosomal compartmentalization, similar to the isocores observed in other metazoan, which are involved in the genome compartmentalization and in the transcription regulation. By incorporating the analogue base BrdU in vivo, it was possible to find regions of B chromosome that replicate in the early S phase, different to the regions of late replication. In this perspective, the B chromosome of this species has available territory and chromatin to transcribe, especially in the initial replication of light bands, which are: p1.1; p1.3; p2.2 e q1.1; q1.3; q2.1; q2.3. The late replication regions match to constitutive heterochromatin blocks and to the As51 repetitive sequences location. GC-rich regions in a different contrast were evidenced with fluorochrome chromomycin CMA3, overlapping early replication regions, and confirming the replication bands and C-banding results. Proving and defining that the B chromosome has chromatin for transcription, thus it is necessary to continue this study to identify which informations are transcribed, and what possible phenotypic effects these potential genes located in the early replication regions may bring to the B chromosome keeper.

Capes A respectiva pesquisa encontra-se no contexto de um ciclo produtivo de um laboratório de análises clínicas da área genômica. Esse trabalho propôs um método de redução de dimensionalidade que auxilia o diagnóstico para a medicina laboratorial genômica. O novo método de redução de dimensão de dados é chamado de DRM-F e é capaz de identificar em bases deste domínio os atributos (gene) mais relevantes, por meio de conceitos de equivalência e generalização. Foi efetuada a comparação do Método DRM-F com o Método de Seleção de Atributos. Essa comparação objetivou a avaliação do método proposto com o método já existente na mineração de dados, Seleção de Atributos. O Método DRM-F fundamentado em Framework usou conceitos de equivalência e generalização. Esses dois métodos foram aplicados no domínio de expressão de genes usando três bases, denominadas DLBCL, DLBCL Tumor sobre leucemia e ALL/AML contendo dados do linfoma. Analisando os resultados obtidos, utilizando como critérios de avaliação a Validação Cruzada, verificou-se que o uso dos métodos resultou em uma melhora nos valores de taxa de acerto quando comparados com as bases, possuindo todos os atributos no domínio de expressão gênica. Nesse domínio, o melhor método de redução foi com o uso da Abordagem Wrapper nas três bases. Não obstante, ressalta-se que o método proposto apresentou um resultado superior a 80% de taxa de acerto, não podendo ser considerado um método de redução com desempenho ruim. O Método DRM-F, embora tenha apresentado resultados inferiores ao método de Seleção de Atributos, na média geral não apresentou taxa de acerto inferior a 80% na geração de modelos preditivos. O Método DRM-F busca extrair os atributos (gene) comuns e específicos do domínio de estudo, expressão gênica, porém não somente de uma única base, mas, entre todas as bases que pertencem ao domínio. Assim, podem-se obter os atributos (gene) comuns entre as várias doenças analisadas entre as bases. No presente experimento, foi possível extrair os atributos (gene) comuns e específicos entre as doenças analisadas. Com os atributos (gene) comuns e específicos de cada doença, podem-se submeter esses subconjuntos a uma análise biológica, a fim de verificar o significado biológico dos atributos objetivando uma contribuição na área biomédica e direcionamento de diagnósticos. The following research is in the context of a production cycle of a clinical laboratory in the genomic area. This work proposed a dimensionality reduction method that helps the diagnosis for the genomic laboratory medicine. The new method of data size reduction is called DRM-F and it is able to identify on bases of this domain the most relevant (gene) attributes, by means of equivalence and generalization concepts. The DRM-F Method was compared to the Attributes Selection Method. This comparison aimed to assess the proposed method with the existing method for data mining, Attributes Selection. In the DRM-F Method based on Framework used equivalence and generalization concepts. These two methods have been applied in the domain of gene expression using three bases, named DLBCL, DLBCL tumor regarding leukemia and ALL/AML containing lymphoma data. Analyzing the results, using as assessment criteria the Cross Validation, it was found that the use of the methods resulted in an improvement in the hit ratio values as compared with bases having all the attributes in the domain of gene expression. In this area the best reduction method was achieved by using the wrapper approach in the three bases. Nevertheless, it is noteworthy that the proposed method showed a result of over 80% in accuracy rate, which cannot be considered a reduction method with poor performance. Although the DRM-F Method presented results below the attributes selection method, in general it showed no average hit rate lower than 80% in the generation of predictive models. The DRM-F Method, aims to extract common and specific (gene) attributes from the field of study, gene expression, but not only from a single base, but among all the bases belonging to the domain. Thus, one can obtain the (gene) attributes common among the various diseases analyzed between the bases. In the present experiment, it was possible to extract the common and specific (gene) attributes among the analyzed diseases. With the (gene) attributes common and specific to each disease it is possible to submit these subsets to biological analysis in order to verify the biological significance of the attributes with the objective of contributing to the area of biomedical diagnostics and routing.

A família Centropomidae é composta por três gêneros, Centropomus, Lates e Psammoperca. Centropomus é o grupo mais diversificado, apresentando seis espécies com ocorrência no Oceano Atlântico Ocidental, C. undecimalis (Bloch, 1792), C. poeyi Chávez, 1961, C. parallelus Poey, 1860, C. mexicanus Bocourt, 1868, C. pectinatus Poey, 1860 e C. ensiferus Poey, 1860. Algumas destas espécies são consideradas crípticas, por apresentarem características morfológicas pouco resolutivas para fins de identificação. Apesar do grande interesse como recurso natural e para cultivo, aspectos sobre sua diversidade e padrões cariotípicos são pouco conhecidos. Neste trabalho classificações morfológicas e comparações de sequências mitocondriais 16S foram utilizadas para identificação das espécies do gênero Centropomus com ocorrência no Rio Grande do Norte, nordeste do Brasil. Duas espécies foram identificadas, C. undecimalis e C. mexicanus, que tiveram seus aspectos cromossômicos analisados através de métodos citogenéticos clássicos (coloração convencional, bandamento C, Ag-RONs), coloração com fluorocromos AT- e GC-específicos, bandas de replicação pela incorporação do análogo de base 5´BrdU ( 5-bromo-2´-deoxiuridina) e mapeamento cromossômico in situ de sequências (TTAGGG)n e dos genes RNAr 18S e 5S. Ambas as espécies apresentaram 2n=48 cromossomos acrocêntricos, com sítios ribossomais (Ag-RON/DNAr 18S/Mitramicina+) no segundo par cromossômico, em posição telomérica no braço longo de C. mexicanus) e intersticial em C. undecimalis. O par organizador nucleolar (par 2) se mostra um marcador citotaxonômico resolutivo para estas duas espécies. Os dados gerados revelam uma menor diversidade de espécies de Centropomus do que se acreditava, sugerindo uma maior atenção na identificação taxonômica das espécies, tendo em vista otimizar ações de exploração comercial, conservação biológica e cultivo. The Centropomidae family consists of three genera, Centropomus, Lates and Psammoperca. Centropomus is the most diverse group, with six Centropomus species occur in the Western Atlantic Ocean C. poeyi Chávez, 1961, C. parallelus Poey, 1860, C. mexicanus Bocourt, 1868, C. pectinatus Poey, 1860 and C. ensiferus Poey, 1860. Some of these species are considered cryptic, because of its morphological traits showed low resolution for identification purposes. Despite showing great interest as a natural resource and fish culture, aspects of their diversity and karyotypic patterns are poorly understood. In this work morphological identification and comparison of mitochondrial 16S gene sequence were used to identify the species of the genus Centropomus occurring in Rio Grande do Norte, northeastern Brazil. Two sepecies were identified, C. undecimalis and C. mexicanus, which had the chromosomal aspects analyzed, through Classical cytogenetic method analyzes (conventional staining, C-banding, Ag-NORs), fluorochrome staining AT- and GC-specific, replication bands by incorporating of the base analog 5-Bromo-2’-deoxyuridine (5-BrdU), in situ chromosomal mapping of (TTAGGG)n sequences and in situ chromosome mapping 18S and 5S rRNA genes. Both species show 2n=48 acrocentric chromosomes, with ribosomal sites (Ag-NOR/18S rDNA/ Mitramycin+) in second chromosomal pair, in telomeric position on the long arm in C. mexicanus and interstitial in C. undecimalis. The nuclear organization pair (pair 2) shown a resolutive cytotaxonomic marker for these two species. The generated data reveal a lower species diversity than previously believed, suggesting that greater attention should be paid in taxonomic identification of the species, in view of optimize commercial actions exploitation, biological conservation and cultivation.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq A família Acanthuridae é um grupo bastante representativo dentre os peixes marinhos e que desempenha um papel fundamental na dinâmica ecológica dos recifes de corais. Três espécies pertencentes ao gênero Acanthurus são comuns ao longo dos recifes costeiros do Atlântico Ocidental: A. coeruleus, A. bahianus e A. chirurgus. No presente estudo, são apresentados dados citogenéticos para estas três espécies de Acanthurus com base em métodos citogenéticos clássicos e no mapeamento de sequências ribossomais repetitivas, como DNAr 18S e 5S, além de sondas teloméricas com a finalidade de auxiliar na compreensão da carioevolução deste grupo. O padrão citogenético dessas espécies indica que as etapas sequenciais de rearranjos cromossômicos, que datam 19-5 milhões de anos atrás (Ma), são responsáveis por suas diferenças interespecíficas. Acanthurus coeruleus (2n=48; 2sm + 4st + 42a), A. bahianus (2n=36; 12m + 2sm + 4st + 18a) e A. chirurgus (2n=34; 12m + 2sm + 4st + 16a) compartilham um antigo conjunto de três pares cromossômicos originados através de inversões pericêntricas. Um conjunto de seis grandes pares metacêntricos formados por translocações Robertsonianas (Rb) encontrado em A. bahianus e A. chirurgus e uma suposta fusão em tandem presente em A. chirurgus são eventos mais recentes. A falta de sequências teloméricas intersticiais (ITS), apesar de várias fusões cêntricas em A. bahianus e A. chirurgus pode estar relacionada com o longo período de tempo após a sua ocorrência (estimado em 5 Ma). Além disso, as homeologias entre os pares de cromossomos que carregam os genes ribossomais, além de outras características estruturais, destacam grandes regiões cromossômicas conservadas nas três espécies. Nossos resultados indicam que as mudanças macroestruturais ocorreram durante a cladogênese dessas espécies não foram seguidas por rearranjos microestruturais visíveis nos cariótipos. The Acanthuridae family is a representative group from the marine fish that plays a key role in ecological dynamics of coral reefs. Three species are common along coastal reefs of Western Atlantic: Acanthurus coeruleus, Acanthurus bahianus and Acanthurus chirurgus. In the present study, cytogenetic data are presented for these three species Acanthurus based on classical cytogenetic methods and mapping of repetitive sequences such as ribosomal 18S and 5S rDNA and telomeric repeats to improve their karyotype evolutionary analyses. The cytogenetic pattern of these species indicated sequential steps of chromosomal rearrangements dating back 19 to 5 millions of years ago (M.a.) that accounted for their interspecific differences. A. coeruleus (2n=48; 2sm+4st+42a), A. bahianus (2n=36; 12m+2sm+4st+18a) and A. chirurgus (2n=34; 12m+2sm+4st+16a) share an older set of three chromosomal pairs that were originated through pericentric inversions. A set of six large metacentric pairs formed by Robertsonian (Rb) translocations found in A. bahianus and A. chirurgus and a putative in tandem fusion found in A. chirurgus are more recent events. The lack of interstitial telomeric sequences (ITS) in spite of several centric fusions in A. bahianus and A. chirurgus might be related to the long period of time after their occurrence (estimated in 5 M.a.). Furthermore, the homeologies among the chromosome pairs bearing ribosomal genes, in addition to other structural features, highlight large conserved chromosomal regions in the three species. Our findings indicate that macrostructural changes occurred during the cladogenesis of these species were not followed by conspicuous microstructural rearrangements in the karyotypes.

Submitted by Angela Maria de Oliveira (amolivei@uepg.br) on 2017-10-19T19:03:18Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Lucas Rosolen de Almeida Mello.pdf: 2555328 bytes, checksum: 3d7ce3cf485cd835d38b843b7b692900 (MD5) Made available in DSpace on 2017-10-19T19:03:18Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Lucas Rosolen de Almeida Mello.pdf: 2555328 bytes, checksum: 3d7ce3cf485cd835d38b843b7b692900 (MD5) Previous issue date: 2015-02-27 A ordem Coleoptera é a mais diversificada entre todos os seres vivos, existindo ampla possibilidades de estudos no que diz respeito à diversidade cariotípica e aos mecanismos de diferenciação. As espécies da subtribo Oedionychina (Alticinae; Chrysomelidae) são interessantes para estudos evolutivos, pois possuem cromossomos sexuais gigantes e assinápticos durante a meiose, podendo ser considerados altamente derivados. Assim, o objetivo do presente estudo foi propor os mecanismos moleculares envolvidos no processo de diferenciação e evolução dos cromossomos sexuais em espécies do gênero Omophoita. A análise de mapeamento, utilizando sondas de DNA C0t-1 total (cinética de reassociação de DNA altamente e moderadamente repetitivo) mostrou marcações distribuídas em todos os cromossomos, especialmente nos cromossomos sexuais. A hibridação cruzada entre as espécies produziu um padrão de localização muito semelhante, evidenciando que a maior parte do genoma é compartilhada entre as espécies de Omophoita. Análise em conjunto dos resultados obtidos com bandas C, fluorocromos e C0t-1 mostram que a heterocromatina das espécies em grande parte é composta de DNA repetitivo distribuída ao longo dos cromossomos sexuais e autossomos. O mapeamento cromossômico com sondas de microssatélites (SSRs) mostrou marcações conservadas para os autossomos e diversificadas para os cromossomos sexuais, evidenciando uma diferença de composição de SSRs dos cromossomos sexuais entre as espécies. Os resultados de hibridação com clones de elementos de transposição mostraram alguns padrões semelhantes aos obtidos com SSRs, podendo indicar que ao longo do processo evolutivo das espécies esses elementos estiveram presentes no processo de diferenciação. Considerando todos os resultados, pode se propor uma diferença de constituição nos cromossomos sexuais das espécies e, desta forma, inferir que os DNAs repetitivos tiveram um papel evolutivo na diferenciação desses cromossomos na subtribo. The order Coleoptera is the most diverse of all living beings, with a wide possibilities of studies with regards to the karyotype diversity and the mechanisms of differentiation. The species of the subtribe Oedionychina (Alticinae; Chrysomelidae) are interesting for evolutionary studies due to the giant sex chromosomes and asynaptic during meiosis, can be considered highly derivate. The objective of this study was to propose the molecular mechanisms involved in the differentiation process and evolution of sex chromosomes in the Omophoita genus. The Mapping analysis using DNA C0t-1 total (reassociation kinetics highly and moderately repetitive DNA) showed marks distributed in all chromosomes, especially in the sex chromosomes. The cross-hybridization among species produced a very similar location pattern, indicating that most of the genome is shared among species Omophoita. Analysis of the results obtained in conjunct with C-bands, fluorochromes and C0t-1 together show that the heterochromatin of the species is largely composed of repetitive DNA distributed throughout the autosomes and sex chromosomes. Chromosome mapping with microsatellite (SSRs) probes showed conserved patterns for autosomes, but diversified to sex chromosomes, showing difference in SSRs composition in the sex chromosomes, of the species. The results of hybridization with transposition element clones showed some similarities patterns to the SSRs markers, which may indicate that throughout the evolutive process of species these elements were present. Considering all results we can propose differences in the constitution of sex chromosomes of the species studied, thus, we can infer an evolutionary role of repetitive DNA in the differentiation of chromosomes in the subtribe.

Made available in DSpace on 2017-07-21T19:59:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Thais Dulz.pdf: 2466351 bytes, checksum: 208f40d4e86e959ef9f685c1e5a3cac5 (MD5) Previous issue date: 2015-02-27 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior The Characidae is considered the largest family and most complex among the Characiforms. The Astyanax genus is one of the most specious between the characids, comprising 142 valid species distributed in the Neotropical Region. Many of these species are restricted to certain river basins. The fish fauna of the Iguaçu River basin is characterized by having a high endemism, possibly because its isolation of the Paraná River basin, occurred about 22 million years, caused by the emergence of the Iguaçu Falls. Were recently described new species of this genus in the Rio Iguaçu, however its systematic position opposite the other Astyanax is still unknown, reinforcing necessary studies aimed at understanding their diversity and their evolutionary relationships. Therefore, this research aimed was to perform the karyotype characterization of the Astyanax species from the middle Rio Iguaçu: Astyanax altiparanae, A. bifasciatus, A. dissimilis, A. minor, A. ribeirae and A. serratus, using cytogenetics as a tool, in order to contribute to a more consistent scenario about the evolution of this group. The analysis were based on conventional Giemsa staining techniques, detection of nucleolar organizing regions by silver nitrate (Ag-NORs), C-banding and fluorescence in situ hybridization (FISH) to ribosomal genes 18S e 5S probes. All species presented 2n = 50 chromosomes, confirming the conservatism to the genus. The karyotypes comprise all chromosomal types and prevalence of chromosomes with two arms, mainly on the metacentric type except for A. ribeirae with the karyotype formula containing high number of acrocentrics. Despite the diploid number remain constant in these species; there were variations in karyotype formula and consequently the fundamental number, ranging from 66 to 92. The C-banding showed differences in the distribution of heterochromatic blocks between species, occurring polymorphism in A. serratus, which was also observed in other studies involving Astyanax sp. D (A. serratus). The six species showed the presence of NORs located in the telomeric region of the short arm of a chromosome pair of the type subtelocentric, characteristic conserved for the genus. Was identified single NORs in A. altiparanae and A. dissimilis, although the most common being multiple NORs, in almost all cases confirmed by 18S rDNA. All species showed 5S rDNA located in the interstitial segments of the chromosomes. Have been observed simple rDNA 5S in A. altiparanae, A. minor and A. serratus, and multiple in A. bifasciatus, A. dissimilis and A. ribeirae. Highlighted A. ribeirae by presenting a high number of rDNA 18S and 5S sites, which proved to be sintenics and co-located. In addition, this species is considered endemic for Ribeira de Iguape basin; however, was first found in the Iguaçu basin, strengthening fauna sharing hypothesis between rivers of the plateau and coastal regions in southern Brazil. The karyotype diversity evident for all species is mainly due to non-Robertsonian rearrangements. This study presented the first cytogenetic data for the genus Astyanax occurring in the Middle Rio Iguaçu region. A família Characidae é considerada a maior e mais complexa entre os Characiformes. O gênero Astyanax é um dos mais especiosos entre os caracídeos, compreendendo 142 espécies válidas distribuídas na região Neotropical. Muitas destas espécies encontram-se restritas a determinadas bacias hidrográficas. A ictiofauna da bacia do Rio Iguaçu caracteriza-se por apresentar um elevado grau de endemismo, possivelmente devido o seu isolamento da bacia do Rio Paraná, ocorrido há cerca de 22 milhões de anos, causado pelo surgimento das Cataratas do Iguaçu. Recentemente, foram descritas novas espécies deste gênero no Rio Iguaçu, entretanto seu posicionamento sistemático frente aos demais Astyanax ainda é desconhecido, fazendo-se necessários estudos que visem à compreensão de sua diversidade e de suas relações evolutivas. Sendo assim, objetivou-se realizar a caracterização cariotípica de espécies do gênero Astyanax provenientes do médio Rio Iguaçu: Astyanax altiparanae, A. bifasciatus, A. dissimilis, A. minor, A. ribeirae e A. serratus, utilizando como ferramenta a citogenética, a fim de contribuir com um cenário mais consistente acerca da evolução deste grupo. Utilizou-se técnicas baseadas na coloração convencional por Giemsa, detecção de regiões organizadoras de nucléolo por nitrato de prata (Ag-RONs), bandamento C e hibridação in situ fluorescência (FISH) com sondas de genes ribossomais 18S e 5S. Todas as espécies estudadas apresentaram 2n = 50 cromossomos, confirmando o conservadorismo para o gênero. Observaram-se cariótipos compostos por todos os tipos cromossômicos e predominância de cromossomos com dois braços, principalmente do tipo metacêntrico, exceto para A. ribeirae com fórmula cariotípica composta por elevado número de acrocêntricos. Apesar do número diploide se manter constante nestas espécies, houve variações na fórmula cariotípica e, consequentemente no número fundamental, variando de 66 até 92. O bandamento C evidenciou variações na distribuição dos blocos heterocromáticos entre as espécies, com ocorrência de polimorfismo em A. serratus, o que também foi observado em outros estudos envolvendo Astyanax sp. D (A. serratus). As seis espécies estudadas mostraram a presença de RONs localizadas na região telomérica do braço curto de um par cromossômico do tipo subtelocêntrico, característica conservada para o gênero. Ocorreram RONs simples em A. altiparanae e A. dissimilis, as demais espécies possuem RONs múltiplas, em quase todos os casos confirmadas pela FISH com rDNA 18S. Todas as espécies evidenciaram rDNA 5S localizados nos segmentos intersticiais dos cromossomos. Foram observados rDNA 5S em um único par em A. altiparanae, A. minor e A. serratus, e múltiplos em A. bifasciatus, A. dissimilis e A. ribeirae. Destaca-se A. ribeirae por apresentar um elevado número de sítios rDNA 18S e 5S, os quais mostraram-se sintênicos e co-localizados. Além disso, esta espécie é considerada endêmica para bacia do Ribeira de Iguape; no entanto, foi encontrada pela primeira vez na bacia do Iguaçu, reforçando a hipótese de compartilhamento de fauna entre rios do planalto cristalino e regiões costeiras no sul do Brasil. A diversidade cariotípica evidenciada para todas as espécies devem-se principalmente a rearranjos não Robertsoniano. Neste estudo foram apresentados os primeiros dados citogenéticos para o gênero Astyanax ocorrentes na região do médio Rio Iguaçu.

Made available in DSpace on 2017-07-21T19:59:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Anelice Calixto Ruh.pdf: 1623886 bytes, checksum: 5599040fa0079070320589375717c125 (MD5) Previous issue date: 2013-12-03 Pressure sores (PS) are wounds found mainly on bone surfaces where the tissue under pressure suffers ischemia which leads to cellular lesion. The causes of such lesion are several and its healing process depends on several factors, intrinsic and extrinsic to the individual. The objective of this study was to analyze the tissue expression of growth factors, IL6, TNF, VEGF, TGF, which take part in the tissue healing process under the effect of low-level laser InGaAIP. The study was approved by the Ethics Committee at UEPG and the individuals informed and made aware of the aims of the study. The group under study comprised 8 volunteers aged 30 to 75 years old, admitted at the Santa Casa de Misericórdia de Ponta Grossa (SCMPG) hospital, who presented sacroiliac PS, ranked as degree II, III or IV according to NPUAP (2009), both sexes. The PSs were photographed for classification and gross analysis of the lesion area through the program Image Pro Plus 6.0®. Samples of periulcerated tissue were obtained through biopsy before and after laser therapy. The biopsies were destined to the qRT-PCR (Quantitative Real Time PCR). Results revealed that in the gross evaluation of the wound there was improvement of the appearance and size of the lesion area, with increase in the granulation tissue. For the qRT-PCR tests, results point out a non-significant expression of differential growth factors between pre and post laser therapy condition. Based on these results it was possible to conclude that the laser therapy helps the healing process, but the expression of growth factors suffers influence of aspects that interfere in the healing process such as age, underlying pathology, medication, patient’s general condition, nutrition, and skin condition. Úlceras por pressão (UPP) são feridas encontradas principalmente em superfícies ósseas aonde o tecido sob pressão sofre isquemia levando a lesão celular. As causas desta lesão são muitas e seu processo de cicatrização sofre influência de vários fatores, intrínsecos e extrínsecos do indivíduo. O objetivo desta pesquisa foi analisar a expressão tecidual dos fatores de crescimento, IL6, TNF, VEGF, TGF, que participam do processo de cicatrização tecidual sob os efeitos do laser de baixa potência InGaAIP. O trabalho foi aprovado pelo Comitê de Ética da UEPG e os indivíduos foram informados e esclarecidos sobre os objetivos da pesquisa. O grupo estudado foi composto de 8 voluntários com idade entre 30 a 75 anos, internados na Santa Casa de Misericórdia de Ponta Grossa (SCMPG), que apresentassem UPP sacroíliaca, classificadas em grau II, III ou IV segundo a NPUAP (2009), ambos os sexos. As UPP foram fotografadas para classificação e análise macroscópica da área da lesão através do programa Image Pro Plus 6.0®. Foram obtidas amostras do tecido peri-ulcerado através de biópsia antes e após aplicações de laserterapia. Estas biópsias foram destinadas aos ensaios de qRT-PCR (Quantitative Real Time PCR). Os resultados demonstram que na avaliação macroscópica da ferida houve melhora no aspecto e tamanho da área da lesão, com aumento do tecido de granulação. Para ensaios de qRT-PCR os resultados apontam uma expressão dos fatores de crescimento diferencial não significativa entre o estado pré e pós laserterapia. Com estes resultados foi possível concluir que a laserterapia ajuda no processo de cicatrização, mas que a expressão dos fatores de crescimento sofrem influência de aspectos que interferem no processo de cicatrização como, idade, patologias de base, medicamentos, estado geral paciente, nutrição, estado da pele.

Submitted by Angela Maria de Oliveira (amolivei@uepg.br) on 2017-10-19T19:19:13Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Rafael Bonfim de Almeida.pdf: 1398729 bytes, checksum: b49f522af530568d079f7e0bdc9a7372 (MD5) Made available in DSpace on 2017-10-19T19:19:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Rafael Bonfim de Almeida.pdf: 1398729 bytes, checksum: b49f522af530568d079f7e0bdc9a7372 (MD5) Previous issue date: 2013-02-28 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior A grande quantidade de dados filogenéticos que vêm sendo disponibilizados, principalmente de caráter molecular, com os avanços de técnicas de obtenção, amplificação e sequenciamento de moléculas de DNA, RNA e proteínas, oferece uma nova perspectiva para a resolução de relações filogenéticas de grupos problemáticos. Porém, esta crescente quantidade de dados necessita de estratégia de integração e análise conjunta tanto entre os dados moleculares a per se quanto com outros dados anteriores, como dados morfológicos, citogenéticos, etológicos, entre outros. Uma alternativa recente para essa integração e metanálise filogenética é a abordagem de construção de super árvores, que consiste no princípio de agrupamento de filogenias independentes menores que possuem táxons terminais em comum em uma filogenia maior, construída com maior número de caracteres, com maior número de táxons terminais, sendo, portanto uma importante ferramenta para inferências mais acuradas quanto à sistemática, evolução, biologia, etologia, biogeografia e citogenética já que oferece uma perspectiva mais ampla do grupo em estudo. Neste estudo, dois grupos problemáticos quanto à sistemática filogenética foram escolhidos e analisados sob a perspectiva da abordagem de construção de super árvore. Para a subfamília Galerucinae sensu lato foi realizada uma filogenia molecular para espécies de Alticinae com ênfase na tribo Oedionychini a partir do alinhamento das sequências do segmento de expansão 2 (D2) do gene nuclear para 28S rDNA (28S-D2) e o gene mitocondrial para a subunidade I do Citocromo Oxidase C (COI), sendo essa filogenia juncionada com sequências associadas a bancos de dados e utilizadas em estudos filogenéticos anteriores. Posteriormente essa filogenia molecular foi integrada a uma super árvore construída para Galerucinae sensu lato. A super árvore recuperou a monofilia de Galerucinae com um grupo Alticinae parafilético. Para a ordem Siluriformes (Teleostei: Ostariophysi) foi construída uma super árvore baseada tanto em dados morfológicos quanto dados moleculares, contendo todas as famílias do grupo na topologia final. A topologia final recuperou a monofilia de Siluriformes, com Diplomystidae sendo o silurídeo mais basal e grupo-irmão do restante dos Eusiluroidei. The large amount of phylogenetic data that are being available, with predominance of molecular, with the recent advances in techniques to obtainment, amplification and sequencing of DNA molecules, RNA and proteins, offer a new perspective for solving phylogenetic relationships of problem groups. However, this increased amount of data requires integration strategies and combined analysis of data, gathering the molecular per se with other previous data, such as morphological, cytological, ethological, and others. A recent alternative for this integration and phylogenetic meta-analysis is the Supertree Construction approach, that in principle consists in a gathering of independent smaller phylogenies that have some terminal taxa in common into a larger phylogeny, built with more characters, major number of terminal taxa, being an important tool for more accurate inferences about the systematics, evolution, biology, ethology, biogeography, cytogenetics, and others, once it offers a broader perspective of the study group. In this study, two problematic groups about their phylogenetic systematics were selected and analyzed under the perspective of the Supertree Construction approach. For subfamily Galerucinae sensu lato was performed a molecular phylogeny for Alticinae species with emphasis on the segment Oedionychini, based on alignment of the sequences of expansion segment 2 (D2) of nuclear 28S rDNA gene (28SD2), and the mitochondrial gene for the subunit I of cytochrome oxidase c (COI), being this phylogenies gather with other data used in previous phylogenetic studies. Later, this molecular phylogeny was incorporated into a supertree, constructed for Galerucinae sensu lato. The supertree recovered the monophyly of a Galerucinae group, and paraphyletic Alticinae. To order Siluriformes (Teleostei: Ostariophysi) was built a supertree based on both, morphological and molecular data, containing all families recognized for the group. The final topology recovered the monophyly of Siluriformes with Diplomystidae being the most basal catfish and sister group of the rest of Eusiluroidei.

Made available in DSpace on 2017-07-21T19:59:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rubia Caldas.pdf: 1293952 bytes, checksum: 52cae77ba14b2beb72e4443c324cd16c (MD5) Previous issue date: 2013-02-28 High blood pressure (HBP) is a multifactorial clinical condition characterized by high and sustained levels of blood pressure (BP). The renin-angiotensin system is involved in the control of the BP, and has as a component the angiotensin converting enzyme (ACE). Recent studies that relate gene variants of Angiotensin Converting Enzyme (ACE) gene, increase the risk of hypertension, compared with the presence of the allele D. Thus, it becomes necessary studies aimed at investigating the relationship of the polymorphism in intron 16 of the ACE gene with hypertension. The aim of the study was to verify the relationship between I / D polymorphism of the ACE gene and genotypic variants with the installation of HBP in four distinct groups. Participants were 112 individuals arranged in the following groups: normotensive (control), hypertensive and non-obese, hypertensive and obese and hypertensive and with type II diabetes mellitus. We evaluated the possible relationship between I/D polymorphism of the ACE gene in different groups of hypertensive patients, but there was no significant difference between the genotypes in different groups in the sample. Regarding the epidemiology higher the body mass index (BMI), waist circumference, triglycerides and cholesterol levels and physical inactivity, was greater incidence of hypertension in the population. The data obtained in this study reinforce environmental interference that are prevalent in the evolution of the framework of HBP and not related to the frequency of the D allele in the population studied. A hipertensão arterial sistêmica (HAS) é uma condição clínica multifatorial caracterizada por níveis elevados e sustentados de pressão arterial (PA). O sistema renina-angiotensina está envolvido no controle da PA, e tem como um dos componentes a enzima conversora de angiotensina (ECA). Estudos recentes relacionam que variantes do gene da Enzima Conversora de Angiotensina (ECA) aumentam o risco de HAS, com relação à presença do alelo D. Com isso, se fazem necessários estudos voltados à investigação da relação do polimorfismo no íntron 16 do gene da ECA com a HAS. O objetivo do estudo foi verificar a existência de relação do polimorfismo I/D do gene da ECA e suas variantes genotípicas com a instalação da HAS, em quatro grupos distintos. Participaram da pesquisa 112 indivíduos arranjados nos seguintes grupos: normotenso (controle), hipertenso e não obeso, hipertenso e obeso, e hipertenso e com diabetes mellitus tipo II. Foi avaliada a possível relação do polimorfismo I/D do gene da ECA, em diferentes grupos de hipertensos, porém não foi encontrada diferença significativa quanto aos genótipos nos diferentes grupos na amostra analisada. Em relação à epidemiologia, quanto maior o índice de massa corporal (IMC), cintura abdominal, valores de colesterol e triglicerídeos e sedentarismo, maior foi a incidência de HAS na população. Os dados obtidos no presente estudo reforçam que interferências ambientais são prevalentes na evolução do quadro de HAS, e não relacionado à frequência do alelo D na população analisada.

Made available in DSpace on 2017-07-21T19:59:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Diana Cornelio.pdf: 3420425 bytes, checksum: ff1f9eef75ccbe98d2e754cd2215c5c5 (MD5) Previous issue date: 2013-02-08 Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de São Paulo Astyanax scabripinnis is a species found in the neotropics, this species forms demes isolated populations in headwater streams. It is taxonomically unresolved, but is presented as an interesting model to study the presence of chromosomal B. The occurrence of these chromosomes in A. scabripinnis may be associated with various environmental factors and population, although little savvy about maintaining parasitic or possible heterotic effects of these chromosomes. The reproductive biology related to the presence of B chromosomes in A. scabripinnis never been addressed. Thus, the object of this study was to investigate whether aspects of the reproductive process, fundamental to the adaptive value may be related to the presence of B chromosomes in A. scabripinnis. Samples were collected quarterly between the years 2012 and 2013 in Campos do Jordao, Sao Paulo, Brazil (22 ° 40 '49.5 "S, 45 ° 23` 31.9 "W) at Stream Farm Lavrinha basin of the Paraíba do Sul. The gonads were classified macroscopically and microscopically second stages of development. Settled seasonally sex ratio of the population in the different samples. We calculated the gonadosomatic ratio (GSR) and the relationship hepatossomática (RHS) separately for females with and without chromosome B. The presence of B chromosomes was confirmed by classical cytogenetic and molecular with the use of chromosome specific probe B constructed by chromosome microdissection and amplification Degenerated Oligonucleotids Primers (DOP-PCR) and subsequent in situ hybridization (FISH). Geometric morphometric analysis were performed separately for males and females with and without the presence of chromosomes B. The results indicate that the sex ratio varied seasonally having an increased number of males compared to females. Hermaphrodite individuals were found at a frequency of 7.7%. The reproductive period is characterized by an atypical reproductive peak during the winter period, beyond the period observed pattern from the spring in September. The presence of B chromosomes has been linked to possible reproductive strategies in different populations studied, especially in relation to energy intake and stages of gonadal development. There morphometric differences both between individuals female and male subjects with and without chromosome B. Astyanax scabripinnis é uma espécie encontrada na Região Neotropical, essa espécie forma demes populacionais isolados em cabeceiras de riachos. Ela é taxonomicamente mal resolvida, mas se apresenta como interessante modelo para o estudo da presença de cromossomos B. A ocorrência desses cromossomos em A. scabripinnis pode estar associada a diversos fatores ambientais e populacionais, embora seja pouco esclarecido sobre a manutenção parasítica ou possíveis efeitos heteróticos desses cromossomos. A biologia reprodutiva relacionada à presença de cromossomo B em A. scabripinnis nunca foi abordada. Assim, foi objeto deste trabalho investigar se aspectos do processo reprodutivo, fundamental para o valor adaptativo, podem estar relacionados à presença de cromossomos B em A. scabripinnis. As coletas foram realizadas trimestralmente entre os anos de 2012 e 2013 na região de Campos do Jordão, São Paulo, Brasil (22°40`49,5”S, 45°23`31,9” W), no Córrego da Fazenda Lavrinha, bacia do rio Paraíba do Sul. As gônadas foram classificadas macro e microscopicamente segundo estádios de desenvolvimento. Estabeleceu-se sazonalmente a proporção sexual da população nas diferentes amostragens. Foi calculada a relação gonadossomática (RGS) e a relação hepatossomática (RHS) separadamente para fêmeas com e sem cromossomo B. A presença de cromossomos B foi confirmada por meio da citogenética clássica e molecular com o emprego de sonda específica do cromossomo B construída por microdissecção cromossômica e amplificação por Degenerated Oligonucleotids Primers (DOP-PCR) e posterior hibridação fluorescente in situ (FISH). Análises de morfometria geométrica foram realizadas separadamente para fêmeas e machos com e sem a presença de cromossomos B. Os resultados indicam que a proporção sexual variou sazonalmente havendo um aumento do número dos machos em relação às fêmeas. Foram encontrados indivíduos hermafroditas na frequência de 7,7%. O período reprodutivo é caracterizado por um pico de reprodução atípico no período do inverno, além do período padrão observado a partir da primavera no mês de setembro. A presença de cromossomos B foi relacionada a possíveis estratégias reprodutivas distintas na população estudada, especialmente em relação ao aporte energético e estádios de desenvolvimento gonadal. Há diferenças morfométrica tanto entre indivíduos fêmeas e machos como entre indivíduos com e sem cromossomo B.

Made available in DSpace on 2017-07-21T20:00:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Patricia Barbosa.pdf: 1571215 bytes, checksum: daac7b661ca93cbfd05ca0e7cda85213 (MD5) Previous issue date: 2013-02-08 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior The most part of the eukaryote genomes is constituted for repetitive DNA or multiple copies DNA, which has already been considered as “junk”, may be associated to the heterochromatin. In this study three Astyanax scabripinnis populations from Pindamonhangaba and Guaratinguetá (SP, Brazil) rivers and stream and one population from Maringá (PR, Brazil) were analyzed about the nucleolar organizing region (NORs), As51 satellite DNA, 18S and 5S rDNA location. Moreover, repetitive sequences were isolated and mapped through Cot-1 technique, which showed homology with UnaL2, a LINE type retrotransposon. The fluorescent in situ hybridization (FISH), with the isolated built retrotransposon probe, evidenced disperse labeled and stronger in centromeric and telomeric chromosomes regions, co-located and interspersed with the 18S DNAr and As51, proven by the fiber-FISH technique. The B chromosome of those populations showed very conspicuous labeled with the LINE probe, also co-located with the As51 sequences. The NORs were actives in a single site of a homologue pair in all three populations, with no evidence that the transposable elements and repetitive DNA have influence in its regulation at the performed analyzes level. A maior parte do genoma dos eucariotos é constituída por DNA repetitivo ou DNA de múltiplas cópias, o qual já foi considerado “lixo”, podendo estar associado à heterocromatina. Neste estudo foram analisadas três populações de Astyanax scabripinnis provenientes de rios e córregos de Pindamonhangaba e Guaratinguetá (SP, Brasil) e uma população da cidade de Maringá (PR, Brasil) quanto a localização das regiões organizadoras de nucléolo (RONs), DNA satélite As51, DNA ribossomal (DNAr) 18S e DNAr 5S. Ainda, foram isoladas e mapeadas sequências repetitivas por meio da técnica de Cot-1, que mostrou homologia com UnaL2, retrotransposon do tipo LINE. A hibridação in situ fluorescente (FISH), com sonda construída para o retrotransposon isolado, evidenciou marcações dispersas e mais concentradas em regiões centroméricas e teloméricas dos cromossomos, co-localizadas e interespaçadas com DNAr 18S e As51, comprovada pela técnica de fiber-FISH. O cromossomo B das populações mostrou marcações bastante conspícuas com a sonda LINE, também co-localizada com sequências As51. As RONs apresentaram-se ativas em sítios únicos de um par homólogo nas três populações, não havendo indícios de que elementos transponíveis e DNA repetitivo tenham influência na sua regulação ao nível das análises realizadas.

Made available in DSpace on 2017-07-21T19:59:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lucia Hoffmann.pdf: 1860358 bytes, checksum: d1a047a5d9cc402bd848a17fc42409b4 (MD5) Previous issue date: 2012-12-14 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior Apolipoprotein B (apoB) is the principal protein from low density lipoprotein (LDL) involved in cholesterol metabolism and transport. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the human apoB gene have been associated with cardiovascular disease risk, such as Coronary Artery Disease (CAD), dyslipidemia and atherosclerosis. These multifactorial diseases are generated by interaction between environmental and genetic factors. Previous works investigated the genetic causative components of these diseases and focused mainly on polymorphisms that occur in genes encoding structural proteins and enzymes related to lipid profile. The present study aimed to investigate the MspI polymorphism in the apoB gene association with cardiovascular risk factors in a case-control patients group from the Campos Gerais region (Paraná, Brazil) population, moreover to determine this polymorphism allele and genotype frequencies, and also to associate the obtained genetic data with cardiac risk related variables by using correlation analysis. We evaluated 66 patients, from which 55 patients formed the cardiovascular risk group, and 11 others composed the group without risk – control. The patients mean age was 60 ± 10.0 years in the group with risk and 53 ± 14.0 years in the control group. The MspI polymorphism (exon 26) on apoB gene was characterized by PCR-RFLP and, after restriction, DNA fragments were identified by electrophoresis using agarose gel. The normal allele was named M1 and the mutated allele was called M2. The obtained values for MspI polymorphism genotypic frequencies were 0.82, 0.09, 0.09 for the control group, and 0.76, 0.24, 0.00 for the CAD risk group, respectively for genotypes M1M1, M1M2, M2M2. It was showed that the M1M1 homozygous was dominant in the genotype distribution for both groups. There was no significant difference between the allele and genotype frequencies for MspI polymorphism in the apoB gene (2 = 5.90, P > 0.05; Contingency Test) when comparing the two groups. Therefore, the distribution of the studied polymorphism in the Campos Gerais region population presented to be in Hardy-Weinberg equilibrium both for the control group and for the CAD risk patients group, keeping stable the polymorphism, what was already previously reported for Chinese and Korean populations. The Pearson correlation analysis performed between the risk variables (age, diabetes mellitus, high LDL, high triglycerides, low HDL, hypothyroidism, weight, body mass index) showed correlation between the most of the variables for M1M1 and M1M2 genotypes. But for the total population (n = 66), the association of the apoB gene polymorphism was not correlated with cardiac risk variables. In the end, this research presented data for understanding the association of apoB gene polymorphism with lipid metabolism disorder in the development of risk factors for cardiovascular disease in the population of Campos Gerais (PR). A apolipoproteína B (apoB) é a principal proteína da lipoproteína de baixa densidade (LDL) que está envolvida no transporte e metabolismo do colesterol. Polimorfismos de único nucleotídeo (SNPs) no gene da apoB humana têm sido associados ao risco para doenças cardiovasculares, como a Doença Arterial Coronariana (DAC), as dislipidemias e a aterosclerose. Estas doenças são caracterizadas como multifatoriais, causadas pela interação entre fatores ambientais e genéticos. Estudos de investigação dos componentes genéticos causadores destas doenças têm focado principalmente em polimorfismos nos genes que codificam proteínas estruturais e enzimas relacionadas ao perfil lipídico. Este trabalho teve como objetivo investigar a associação do polimorfismo MspI no gene da apoB com os fatores de risco cardiovascular em um grupo de pacientes caso-controle na população da Região dos Campos Gerais (Paraná, Brasil), além de determinar as frequências alélicas e genotípicas deste polimorfismo, e associar os dados genéticos obtidos com as variáveis relacionadas aos riscos cardíacos através da análise de correlação. Foram avaliados 66 pacientes, dos quais 55 compuseram o grupo com risco cardiovascular, e os 11 demais formaram o grupo sem risco – controle. A idade média dos pacientes foi de 60 ± 10,0 anos no grupo com risco e 53 ± 14,0 anos no grupo controle. O polimorfismo MspI (exon 26) no gene da apoB foi caracterizado por PCR-RFLP, sendo os fragmentos de DNA, após a restrição, identificados por eletroforese em gel de agarose. O alelo normal foi denominado M1 e o alelo mutado M2. As frequências genotípicas encontradas para o polimorfismo MspI foram 0,82, 0,09 e 0,09 para o grupo controle; e 0,76, 0,24 e 0,00 para o grupo de pacientes com risco, respectivamente para os genótipos M1M1, M1M2 e M2M2. O homozigoto M1M1 foi predominante na distribuição genotípica para ambos os grupos. Não houve diferença significativa entre as frequências genotípicas e alélicas do polimorfismo MspI no gene da apoB (2 = 5,90; P > 0,05; Teste de Contingência), quando comparados os 2 grupos em estudo. Assim, a distribuição do polimorfismo estudado na população da região dos Campos Gerais (PR) se mostrou no equilíbrio de Hardy-Weinberg, tanto no grupo controle quanto no grupo de pacientes com risco cardíaco, mantendo o polimorfismo estável, sendo estes resultados também relatados para as populações chinesa e coreana. Na análise de correlação de Pearson entre as variáveis de risco (idade, diabetes mellitus, LDL alto, triglicerídios alto, HDL baixo, hipotireoidismo, peso, índice de massa corporal), observou-se que a maioria das variáveis analisadas se correlacionaram para os genótipos M1M1 e M1M2. Já para a população total estudada (n = 66), a associação do polimorfismo gênico da apoB não apresentou correlação com as variáveis de risco cardíaco. Enfim, esta pesquisa apresentou dados para o entendimento da associação do polimorfismo do gene da apoB com o distúrbio de metabolismo lipídico no desenvolvimento de fatores de risco para doenças cardiovasculares na população dos Campos Gerais (PR).

The upper rio Tibagi basin is located in the center-east of Paraná State and possess 65 main tributaries and headwater occur at East of Ponta Grossa region. It shows a great fish diversity with Characiformes and Siluriformes prevalence. The Astyanax altiparanae species is found in smaller tributaries of this basin. The upper rio Iguaçu basin is located in the left margin of the medium course of the rio Paraná, it possess 103 tributaries and headwater occur at East of the Serra do Mar mountain. It shows a poor ichthyofauna with high endemism degree, also with Characiformes and Siluriformes prevalence. Recently, Astyanax altiparanae has been found in the rio Iguaçu basin, being not registered up to 1983, for that it is discussed there origin. The Astyanax altiparanae species show diploid number with 2n=50 chromosomes and difference in their karyotypic formula and the chromosomes bearing the nucleolar organizing regions. In this work the Astyanax altiparanae karyotype of upper rio Tibagi and upper rio Iguaçu basins populations was characterized, using conventional stain with Giemsa, and differential with C-banding, Ag-NORs, base-specific fluorochrome (chromomycin A3) and in situ hybridization with rDNA 18S and 5S probes. Diagnostics morphometric characteristics in these two populations were analyzed to compose the axes of the free size canonical variables. The cytogenetics and morphological approaches were coincident and show comparable overlap of several markers among these populations and exclusiveness that reflect the level of isolated populations. Like This, and in opposition to studies that indicate gene flowamong A. altiparanae populations in the low rio Iguaçu with tributaries of the rio Paraná, it is waited that different populational stocks (regional variations) of this species occur along the basins of the Tibagi and Iguaçu rivers, individually, reflecting a complex evolutionary history.

Submitted by Boris Flegr (boris@uerj.br) on 2021-01-06T20:53:42Z No. of bitstreams: 1 Marcos Ricardo da Silva Rodrigues Tese completa.pdf: 2464617 bytes, checksum: 21ca81cf380d61ca7d40eb82b69f9337 (MD5) Made available in DSpace on 2021-01-06T20:53:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marcos Ricardo da Silva Rodrigues Tese completa.pdf: 2464617 bytes, checksum: 21ca81cf380d61ca7d40eb82b69f9337 (MD5) Previous issue date: 2012-05-17 Diabetes mellitus type 2 (DM2) is a worldwide increasing prevalence disease, being related to a variety of comorbidities. The relationship between the digestive tract and DM2 has been strengthened by the results of different metabolic surgery procedures on resolution of the endocrine disorder, before weigh loss achievement. Hypertrophic morphological changes in the intestinal epithelium are observed in the early stages of disease development and seems to have a pivotal role in the establishment of chronic hyperglicemia. The p53 gene directly participates on regulation of growth processes of the intestinal epithelium, and its expression has been shown to be altered in diabetic states.The objectives were to evaluate clinical and laboratory results in DM2 patients, presenting Body Mass Index(BMI)>25 and 25 e

Made available in DSpace on 2017-07-21T19:59:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 LeonardoGoll.pdf: 2578520 bytes, checksum: e4dc5f18aad72bd8d62d5803fed3c4ef (MD5) Previous issue date: 2012-02-29 Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico TheColeopterahave a large variationof the sex determinationsystem, being the Xypmechanism considered ancestorfor thisorder. The presenceof a argyrophilous material associated with thesexbivalent is described asresponsible formaintenance andassociation of thesechromosomes.However,there is no consensus in the literature about the nature ofthisargyrophilous material. In addition,few species have been studied using fluorescence in situhybridization (FISH) tothe location of the multigene families, which areuseful and can elucidate the variation in the karyotype and genomic organization of several species.To date,there is no cytogenetic analysis in the genus Lagria.Thus, theaim of this study was tocharacterizecytogeneticallyLagriavillosa, throughconventional andmolecularcytogenetics, forinvestigating the mechanism ofassociationofsex chromosomesXyp,through analysis of nature of argyrophilous material in the lumen of sex bivalent. Additionally, thechromosomalmapping of 5S rDNA multigene families, 18S rDNA and histone H3 genes in L. villosa, was carried out, and showing for the first timein Coleoptera, that genes 18S and 5S DNAs are interspersed. In addition, the analysis oftesticular cellsshowed 2n=18=16+Xypand formulameiotic 2n=8II+Xyp.In this workwe discuss thepossible mechanismsevolvingin the association ofXypsex chromosomes,where it is consideredthat the combination ofsynaptonemalcomplex proteinsmayparticipate in thecorrect segregationofchromosomes.In addition, the fiber-FISH technique with dual probes (18S and 5S) was used for better resolution mapping of these regions in L. villosa, showing that the two DNAs are closely interspersed with varying amounts of both classes of DNA. Association between the two rDNA families have been reported for other species and different hypotheses are raised about the functional organization in these families. Os Coleoptera apresentam grande variação quanto aos sistemas de determinação sexual, sendo o mecanismo cromossômico do tipo Xyp considerado ancestral para esta ordem. A presença de uma substância argirofílica associada ao bivalente sexual é descrita como sendo a responsável pela manutenção e associação desses cromossomos, porém não existe um consenso na literatura sobre a natureza desse material. Além disso, poucas espécies têm sido analisadas utilizando a Hibridação in situ Fluorescente (FISH) para a localização das famílias multigênicas, as quaissão úteis marcadores e podem elucidar a variação do cariótipo e a organização genômica de diversas espécies.Até o presente momento, não existe análise citogenética em espécies do gênero Lagria. Desta forma, o objetivo desse trabalho foi caracterizar citogeneticamente Lagria villosa, através da citogenética convencional e molecular, investigando o mecanismo de associação dos cromossomos sexuais Xyp, através da análise da natureza do material argirofílico presente no lúmen do bivalente sexual. Adicionalmente, realizou-se o mapeamento cromossômico das famílias multigênicasDNAr 5S, DNAr18S e genes de histona H3 em L. villosa, mostrando pela primeira vez uma associação intercalar dosgenes DNAs 5S e 18S em Coleoptera. Além disso, aanálise de células testiculares evidenciou 2n=18=16+Xype fórmula meiótica 2n=8II+Xyp.No presente trabalho são discutidos os possíveis mecanismos evolvidos na associação dos cromossomos sexuais Xyp, onde é considerado que a associação de proteínas do complexo sinaptonêmico pode participar da correta segregação desses cromossomos. Além disso, atécnica de fiber-FISH com dupla sonda (18S e 5S) foi utilizada para uma melhor resolução do mapeamento dessas regiões genômicas em L. villosa, mostrando que os dois DNAs estão intimamente intercalados com quantidades variáveis de ambas as classes de DNA. Associação entre as duas famílias DNArtem sido relatadopara outras espécies e diferentes hipóteses são levantadas sobre a organização funcional dessas famílias.

Made available in DSpace on 2017-07-21T19:59:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Priscila Costa Estabile.pdf: 1735178 bytes, checksum: b258b31793d5d5954531a50cbe4206cc (MD5) Previous issue date: 2012-02-13 Fundação Araucária de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico do Paraná The Type 2 Diabetes Mellitus, as well as the metabolic syndrome (MS), is a multifactorial and metabolic disorder that now presents itself as a worldwide pandemic with effects on morbidity and mortality, possibly as a result of the mismatch between biological and cultural evolution of man. Was the object of research of this study to analyze the tissue expression of incretin hormones glucagon Pepitide Like-1 (GLP1) and Pepitide YY (PYY3-36), to identify and quantify L cells along the gastrointestinal tract in patients with DM2 subjected to adaptative gastroenteromentectomia with intestinal bipartition (Partial Duodenal Switch - DSP). The study was approved by the Ethics Committee of UEPG and patients informed and educated about the research objectives. The volunteer group consisted of 7 patients aged between 35 and 65 years, body mass index> 25 kg/m2 with T2DM on dietary treatment and medication for a minimum of 2 years and with difficulty on glycemic control and hypertriglyceridemia associated. Samples were obtained from the intestinal mucosa (jejunum and ileum) of DSP in patients undergoing preoperative and postoperative condition of fasting for 12 hours (three and twelve months respectively), through incisional biopsy. These biopsies were designed to test immunohistochemistry, qRT-PCR (Quantitative Real Time PCR) and Western Blott. The results were consistent and indicate a very significant differential expression between the state of pre-and postoperative tests for qRT-PCR (p = 0.1669) and Western Blot (p = 0.1569). Immunohistochemistry also showed low significance (p = 0.0043) of immune marked L cells for the same patients under the same conditions. These data can be interpreted in light of the fast imposed on patients. In addition the results are unprecedented for the immunostaining of L-cells of the human gastrointestinal tract, the data indicate that these cells have basal secretion for GLP-1, even after 12 hours without feed stimulation. In addition, the patients showed normalization of blood glucose levels in the post-surgery, suggesting metabolic improvement. It was also found that the number of L cells marked increases in density along the gastrointestinal tract toward the distal portion of the ileum (p = 0.0409). With these results it was possible to identify, locate and investigate different levels of expression and secretion from intestinal L cells in patients with DM2 and subjected to surgical control. Diabetes mellitus do tipo 2 (DM2), assim como a Síndrome Metabólica (SM), é uma desordem metabólica e multifatorial que atualmente se apresenta como pandemia mundial com reflexos na morbimortalidade, possivelmente em decorrência do descompasso entre a evolução biológica e cultural do homem. Foi objeto de investigação do presente estudo analisar a expressão tecidual dos hormônios incretínicos Glucagon Like Pepitide-1 (GLP1) e Pepitide YY (PYY3-36), visando identificar e quantificar células L ao longo do trato gastrointestinal, de pacientes portadores de DM2 submetidos a gastroenteromentectomia adaptativa com bipartição intestinal (Duodenal Switch Parcial - DSP). O trabalho foi aprovado pelo Comitê de Ética da UEPG e os pacientes informados e esclarecidos sobre os objetivos da pesquisa. O grupo de voluntários foi composto de 7 pacientes com idade entre 35 e 65 anos, Índice de Massa Corporal > 25 Kg/m2, com DM2 em tratamento dietético e medicamentoso por um período mínimo de 2 anos e com dificuldade de controle glicêmico e hipertrigliceridemia associada. Foram obtidas amostras da mucosa intestinal (jejuno e íleo) dos pacientes submetidos à DSP no pré-operatório e no pós-operatório em condição de jejum de 12 horas (três e doze meses, respectivamente), através de biópsia incisional. Estas biópsias foram destinadas aos ensaios de Imunohistoquímica, qRT-PCR (Quantitative Real Time PCR) e Western Blott. Os resultados obtidos foram congruentes e apontam uma expressão diferencial pouco significativa entre o estado de pré- e pós-operatório para os ensaios de qRT-PCR (p=0,1669) e Western Blott (p=0,1569). A imunohistoquímica mostrou também baixa significância (p=0,0043) de células L imuno marcadas para os mesmos pacientes, nas mesmas condições. Estes dados podem ser interpretados a luz do jejum imposto aos pacientes. Além dos resultados serem inéditos para a imunomarcação de células L do trato gastrointestinal humano, os dados obtidos indicam que estas células apresentam secreção basal para GLP-1, mesmo após 12 horas sem estímulo alimentar. Em adição, os pacientes apresentaram normalização dos níveis de glicemia no estado pós-operado, sugerindo melhora metabólica. Foi ainda constatado que o número de células L marcadas aumenta em densidade ao longo do trato gastrointestinal em direção à porção mais distal do íleo (p=0,0409). Com estes resultados foi possível identificar, localizar e investigar diferentes níveis de expressão e secreção das células L intestinais em pacientes portadores de DM2 e submetidos a controle cirúrgico.

Made available in DSpace on 2017-07-21T19:59:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jonathan Pena Castro.pdf: 3378425 bytes, checksum: 726a329ba31e1d12d715441e9de01e5a (MD5) Previous issue date: 2012-02-08 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior The species complex Astyanax scabripinnis are composed by fish with wide geographic distribution. Their populations are often isolated in small streams, separated by thousands of years, making it a very interesting system to study evolution. The use of different markers is crucial, since they allow inferences on the identification of individuals and therefore the study of populations. Thus, three populations isolated from each other of Campos do Jordão - SP, and two of Maringá - PR were analyzed by geometric morphometrics, correlating with data from presence / absence of B chromosomes, karyotypic and cytogenetic data, and reproductive data. Canonical variate analysis (CVA) showed that there are significant differences between populations (p

Resumo: A ocorrencia de diabetes mellitus tipos 1 e 2 e bem documentada na literatura cientifica. Contudo, existem pelo menos 6 subtipos variantes de diabetes, de carater monogenico, denominados diabetes tipo MODY (Maturity Onset Diabetes of the Young), responsaveis por aproximadamente 10% de todos os casos de diabetes mellitus. Estes exibem um padrao de heranca autossomica dominante, sao de manifestacao precoce e nem sempre requerem qualquer tipo de medicacao ou insulinoterapia para tratamento. O diagnostico precoce desta doenca e de extrema importancia, visto que tratamentos eficazes rendem melhores prognosticos ao paciente. Estudos epidemiologicos demonstram que dentre as formas ja conhecidas de diabetes tipo MODY, as mais recorrentes sao as do tipo 2, causadas por mutacoes na enzima Glicoquinase (GCK) e 3, provocadas por mutacoes no fator de transcricao Hepatocitico Nuclear 1ƒ¿ (HFN1ƒ¿). Estudos envolvendo a identificacao e prevalencia de subtipos de MODY na populacao brasileira sao escassos e pouco informativos, apontando para a necessidade de uma investigacao minuciosa sobre a ocorrencia deste tipo de diabetes. No presente estudo, amplificacoes das regioes exonicas e posterior sequenciamento nucleotidico das mesmas foram utilizados para realizar prospeccao de mutacoes no gene HFN1ƒ¿ em pacientes da regiao dos Campos Gerais-PR, suspeitos de portarem diabetes MODY3. Foi encontrada uma nova mutacao truncante (W113X) no exon 2 de tres pacientes aparentados, portadores de diabetes mellitus e, paralelamente, foram identificadas cinco mutacoes silenciosas e tres mutacoes missense em pacientes diabeticos nao aparentados. Estas mutacoes missense correspondem a polimorfismos ja descritos na literatura e estao implicados na patogenese do diabetes, especialmente diabetes mellitus tipo 2.

Resumo: O gênero Hypostomus é amplamente distribuído pela América do Sul e um dos mais estudados dentre os Loricariidae, com cerca de 130 espécies descritas. Entretanto, sua correta identificação taxonômica é bastante difícil devido às discretas diferenças morfológicas entre as espécies. Uma mesma entidade taxonômica, em diferentes localidades, apresenta características cariotípicas distintas. Deste modo, dados citogenéticos acerca deste gênero são fundamentais para elucidar a história evolutiva do grupo. Análises citogenéticas foram realizadas em cinco espécies de Hypostomus: duas da região de Sapopema - PR (Hypostomus regani e Hypostomus albopunctatus), uma da região de Ponta Grossa - PR (Hypostomus aff. ancistroides), uma da região de Curitiba – PR (Hypostomus derbyi) e outra da região de Mangueirinha – PR (Hypostomus commersonii). Os padrões citogenéticos encontrados apresentam diferenças em relação à evolução cariotípica proposta para o grupo. Foi evidenciado um sistema de determinação sexual do tipo ZZ/ZW para H. albopunctatus. Não houve correlação entre o número diplóide e a quantidade de heterocromatina. Foi também observada uma dinâmica dos sítios organizadores do nucléolo em relação aos cromossomos do complemento cariotípico, evidenciada tanto pela atividade detectada pela prata coloidal (Ag-RONs), assim como pela localização gênica com sondas DNAr 18S por hibridação in situ fluorescente (FISH). Os dados obtidos reforçam o aproveitamento de marcadores citotaxonômicos para identificar e classificar espécies do gênero Hypostomus e corroboram os dados de diversidade cariotípica anteriormente relatados para este gênero de peixes neotropicais.

Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais CHAPTER II: The Hypostominae subfamily comprises 45 genera, and in only five (Hypostomus, Liposarcus, Rhinielepis, Pogonopoma and Pterygoplichthys) some sort of cytogenetic work has been developed, being Hypostomus genus the largest in number of karyotyped species. Four species of the genus Hypostomus from Araguari and Tijuco rivers, Uberlândia-MG, were analyzed: H. regani, H. paulinus, H. margaritifer e H. strigaticeps, through cytogenetic techniques such as conventional staining, silver nitrate impregnation, C-banding and fluorochromes CMA3 and Hoechst 33258. In the conventional analysis H. regani presented 2n = 72, 10m+18sm+44st/a; H.strigaticeps 2n = 74, 6m+14sm+54st/a; H. margaritifer 2n = 74, 10m+24sm+40st/a, with an individual presenting an unusual heteromorphic metacentric pair on the size, and H. paulinus 2n=76, 6m+12sm+58st/a. The impregnation with silver nitrate showed multiple NORs, for the most species examined, except H. paulinus. The heterochromatin is distributed in the interstitial and telomeric regions. Staining with CMA3 showed positive markings for H. paulinus, H. margaritifer and H. strigaticeps, and negative bands in H. regani, H. margaritifer. Hoechst staining showed positive fluorescent bands in H. regani, H. strigaticeps. The results obtained in this study contribute to a better characterization of Hypostomus cytogenetics and understanding of evolution within the group and the Loricariidae family. H. regani and H. margaritifer. Hoechst staining showed fluorescent bands in H. regani and H. strigaticeps. The results obtained in this study contribute to a better cytogenetics characterization of Hypostomus and understanding of evolution within the group and the Loricariidae family. CHAPTER III: It is estimated that approximately 70 species of the Loricariidae family have been studied cytogenetically. This study aimed to characterize the karyotype of Squaliforma emarginata, which is cited by Artoni et al. (2001) as Hypostomus emarginatus and Pterygoplichthys joselimaianus. Specimens were collected in Porto Nacional -TO, the reservoir formed by damming the waters of the Tocantins River, for the implementation of the Power Plant Luis Eduardo Magalhaes. We performed cytogenetic studies by conventional staining, silver nitrate impregnation, C-banding, fluorochromes, CMA3 and Hoechst. The conventional analysis of S. emarginata showed 2n=52, 14m+2sm+36st and P. joselimaianus 2n=52, 20m+22sm+10st. Impregnation with silver nitrate in S. emarginata showed variation in the pattern of NORs between individuals, while P.joselimaianus showed single NORs. The heterochromatin is distributed in the interstitial and telomeric regions. Staining with CMA3 showed positive markings in S. emarginata corresponding to heterochromatin associate the AgRONs, while the dye Hoechst showed negative bands in both species. In P. joselimaianus staining CMA3 + showed heterochromatin rich in GC, confirmed whit Hoechst negative staining. The results obtained in this study are intended to understand the mechanism of evolution, to explain the taxonomic determinations and contribute to future conservation studies for these species. CAPÍTULO II: A subfamília Hypostominae é composta por 45 gêneros, porém, em apenas cinco (Hypostomus, Liposarcus, Rhinelepis, Pogonopoma e Pterygoplichthys) foram desenvolvidos estudos citogenéticos. Hypostomus é o gênero que apresenta o maior número de espécies cariotipadas No presente trabalho são apresentados os resultados obtidos em quatro espécies do gênero Hypostomus: H. regani, H. paulinus, H. margaritifer e H. strigaticeps, coletados no rio Araguari e Tijuco, Uberlândia-MG; submetidos aos estudos citogenéticos por meio da coloração convencional, impregnação por nitrato de prata, bandamento-C e pelos fluorocromos CMA3 e Hoechst 33258. Na análise convencional H. regani apresentou 2n = 72, 10m+18sm+44st/a; H.strigaticeps 2n = 74, 6m+14sm+54st/a; H. margaritifer 2n = 74, 10m+24sm+40st/a; com um individuo atípico apresentando o 1º par metacentric pair on the size, and H. paulinus 2n = 76, 6m+12sm+58st/a. A impregnação com nitrato de prata evidenciou RONs múltiplas para a maioria das espécies analisadas, com exceção de H. paulinus. A heterocromatina esta distribuída nas regiões teloméricas e intersticiais. A coloração com CMA3 revelou marcações positivas em H. paulinus, H. margaritifer e H. strigaticeps, e bandas negativas em H. regani e H. margaritifer. A coloração com Hoechst revelou bandas fluorescentes positivas em H. regani e H. strigaticeps. Os resultados obtidos no presente trabalho visam contribuir para uma melhor caracterização citogenética dos Hypostomus e compreensão da evolução tanto do grupo, quanto da família Loricariidae. CAPÍTULO III: Estima-se que aproximadamente 70 espécies dessa família Loricariidae já tenham sido estudadas citogeneticamente. Dentro desta família, a subfamília Hypostominae apresenta a maior quantidade de estudos citogenéticos, e para acrescentar estes dados, este trabalho teve como objetivo caracterizar o cariótipo de Squaliforma emarginata, que é citada por Artoni et al. (2001) como Hypostomus emarginatus e Pterygoplichthys joselimaianus. Os exemplares foram coletados em Porto Nacional-TO, no reservatório formado com o represamento das águas do rio Tocantins, com a implantação da Usina Hidrelétrica Luis Eduardo Magalhães. Realizou-se estudos citogenéticos por meio da coloração convencional, impregnação por nitrato de prata, bandamento-C e pelos fluorocromos cromomicina A3 e Hoechst 33258. A análise convencional confirmou o 2n = 52, 14m+36sm+2st para S. emarginata e 2n = 52, 20m+22sm+10st para P. joselimaianus. A impregnação com nitrato de prata em S. emarginata evidenciou variação no padrão de RONs múltiplas entre os indivíduos enquanto P. joselimaianus apresentou RONs simples. A heterocromatina está distribuída nas regiões teloméricas e intersticial of most chromosomes. A coloração com CMA3 apresentou marcações positivas em S. emarginata correspondentes a heterocromatina associada à AgRONs, enquanto o corante Hoechst evidencou bandas negativas em ambas as espécies. Os resultados obtidos no presente trabalho têm como finalidade compreender alguns dos possíveis mecanismos de evolução cromossômica, fornecer alguns subsídeos para a taxonomia do grupo e contribuir com estudos futuros relacionados à conservação destas espécies. Mestre em Genética e Bioquímica

Made available in DSpace on 2017-07-21T19:59:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Maelin da Silva.pdf: 4148919 bytes, checksum: c40d33739dbca2809bfaa5126daa2f6d (MD5) Previous issue date: 2010-03-12 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior The order Gymnotiformes ranges the electrical fish. It’s distributed by South and Central America. Family Gymnotidae show two genus; Gymnotus and Eletrophurus, the last one was recently included in this family. Genus Gymnotus is the most widespread and show 33 species and present great number of cytogenetics studies. Our objectives in the present study were analyse the meiotic behaviour of multiple sexual chromosomes system X1X1X2X2/X1X2Y of G. pantanal, isolate sequences of repetitive DNA from three species of Gymnotus; G. sylvius, G. paraguensis and G. pantanal, inhabiting in simpatry at Piquiri River - PR – BR, verify the association of these sequences with sexual chromosomes and mapping the rDNA 5S gene at G. paraguensis and G. pantanal. Meiotic analysis of G. pantanal presented one trivalent in pachytene of profase I formed by X1, X2 and Y chromosomes, totally paired characterizing a recent sexual chromosomes system. In the metaphase II was visualized cells 18+Y and 18+X1X2 chromosomes with normal disjunction of sexual chromosomes and balanced gametes. The mapping of repetitive DNA sequences, isolated by Cot1, presented location in centromeric and Nucleor Organization Regions (NORs) of all analyzed species, included the sexual chromosomes of G. pantanal, standard similar of heterocromatin obtained by C banding. Hybridization with rDNA 5S probes presented a standard unique for all species analyzed. Our data suggest a recent origin for sex chromosomes of G. pantanal and a differentiate evolutionary dynamic for the distribution of rDNA 5S in the karyotype of species analyzed, suggesting that character can be broadly utilized among the Gyminotidae as cytotaxonomic marker. A ordem Gymnotiformes compreende os peixes elétricos, que estão amplamente distribuídos pelas Américas Central e do Sul. A família Gymnotidae possui apenas dois gêneros Gymnotus e Eletrophurus, sendo que este último foi recentemente incluído à família. O gênero Gymnotus é o mais especioso da ordem com 33 espécies, e é também o que comporta maior número de estudos citogenéticos. O presente trabalho teve por objetivos analisar o comportamento meiótico do sistema de cromossomos sexuais múltiplo X1X1X2X2/X1X2Y em G. pantanal. Isolar sequências de DNA repetitivo das três espécies que habitam em simpatria o rio Piquiri – Paraná – Brasil: G. sylvius, G. paraguensis e G. pantanal, e neste último a possível associação dessas sequências aos cromossomos sexuais. E mapear o DNAr 5S em G. paraguensis e G. pantanal. A Análise meiótica revelou a formação de um trivalente no estágio de paquíteno da Prófase I em G. pantanal formado pelos cromossomos X1, X2 e Y, pareados complementarmente caracterizando um sistema de determinação sexual recente. A metáfase II apresentou células com 18+Y e 18+X1X2 cromossomos, caracterizando uma disjunção típica dos cromossomos sexuais, dando origem a gametas balanceados. O mapeamento de sequências de DNA repetitivos isolados por C0t – 1 apresentou localização em região centromérica e na região das regiões organizadoras de nucléolos de todas as espécies analisadas, inclusive nos cromossomos sexuais de G. pantanal, padrão coincidente com blocos heterocromáticos. A hibridização com sondas de DNAr 5S revelou padrão de marcação próprio em todas as espécies analisadas. Nossos dados sugerem uma origem recente para os cromossomos sexuais de G. pantanal e uma dinâmica evolutiva diferenciada para distribuição do DNAr 5S no cariótipo das espécies analisadas. Sugerindo que este caráter possa ser mais amplamente utilizado entre os Gymnotidae como marcador citotaxonômico.

Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais The family Characidae is the largest and most complex among the Characiformes, including the majority of freshwater fish in Brazil, with species varying considerably in size, weight, shape, diet and behavior. Recently, this group was listed as Incertae Sedis due to lack of consistent evidence of monophyly going to have only 12 subfamilies beyond those cited groups above. With the objective of raising information that can be useful to assist in the understanding of this complex ictiofauna, cytogenetic analysis were performed on species of Astyanax aff. fasciatus from the region of Uberlândia-MG, Astyanax sp, Astyanax aff. bimaculatus and Bryconops sp the region of Monte do Carmo-TO. A. fasciatus showed diploide number of 46 chromosomes and a system of multiple Ag-NORs, which proved to positively stained Chromomycin A3 (CMA3). Astyanax sp and Astyanax bimaculatus showed 50 chromosomes, being that in the first one if it verified the presence from 0 to 6 chromosomes B and a system Ag-NORs simple. These small farms if had also shown heterochromatic. Moreover, conspicuous centromeric and pericentromeric heterochromatics markings had been also observed, Astyanax bimaculatus presented system Ag-NORs multiple with up to three pairs marked, some of which also CMA3 +. C-banding revealed centromeric marks in almost all chromosomes. Bryconops sp presented 2n = 48 chromosomes, Ag-NORs simple coinciding with the markings CMA3 and centromeric heterochromatic blocks. These results go of meeting to the idea that the group previously treated as Tetragonopterinae encompasses a diversity to groups sufficiently accented what it is a consequence of its polifiletic nature. A família Characidae é a maior e mais complexa dentre os Characiformes, compreendendo a maioria dos peixes de água doce do Brasil, com espécies variando consideravelmente em tamanho, peso, forma, alimentação e comportamento. Recentemente, várias espécies deste grupo foram listadas como Incertae Sedis devido a falta de evidências consistentes de monofiletismo. Atualmente essa família é composta por 12 subfamílias, além daqueles grupos citados acima. Com o objetivo de levantar informações que possam ser úteis para auxiliar na compreensão dessa complexa ictiofauna, foram realizadas análises citogenéticas em espécies de Astyanax aff. fasciatus, provenientes da região de Uberlândia-MG, Astyanax sp, Astyanax aff. bimaculatus e Bryconops sp da região de Monte do Carmo-TO. A. fasciatus apresentou número diplóide igual a 46 cromossomos e um sistema de Ag- RONs múltiplas, as quais se mostraram positivamente coradas pela Cromomicina A3 (CMA3). Astyanax sp e Astyanax bimaculatus apresentaram 50 cromossomos, sendo que no primeiro se verificou a presença de 0 a 6 cromossomos B e um sistema de Ag-RONs simples. Estes sítios se mostraram também heterocromáticos. Além disso, conspícuas marcações heterocromáticas centroméricas e pericentroméricas também foram observadas, Astyanax bimaculatus apresentou sistema de Ag-RONs múltiplas com até três pares marcados, alguns dos quais também CMA3 +. O bandamento C revelou marcas pericentroméricas em quase todos os cromossomos. Bryconops sp apresentou 2n = 48 cromossomos, Ag-RONs simples coincidindo com as marcações de CMA3 e blocos heterocromáticos centroméricos. Esses resultados vão de encontro à idéia de que o grupo anteriormente tratado como Tetragonopterinae engloba uma diversidade de grupos bastante acentuada o que é um reflexo de sua natureza polifilética. Mestre em Genética e Bioquímica

Made available in DSpace on 2017-07-21T19:59:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Joao Felipe Moutinho.pdf: 1502053 bytes, checksum: 7b2e87ce68365a056bed078acc98f710 (MD5) Previous issue date: 2009-10-02 Species of large size and commercial value are found in the basin of the Iguaçu, with the highlights, representatives of the order Siluriformes. The genus Steindachneridion belongs to the order Siluriformes and has restricted distribution of some rivers basins of South America. The endemic Iguaçu’s surubim (Steindachneridion melanodermatum) as well as other catfish, has characteristics that have attracted great interest for cultivation. Another representative of Siluriformes, with broad representation in the Iguaçu river, the jundiá (Rhamdia quelen), this species has already successfully introduced in commercial farming. The purpose of this study was to investigate the reproductive processes in the laboratory in order to define better strategies for induced spawning, fertilization rate and embryo-larval development of Siluriformes. The experiment was conducted in fishponds Station studied ichthyology Plant Ney Braga, located in the reservoir of Salto Segredo, PR. In order to evaluate qualitative and quantitative characteristics of semen surubim, S. melanodermatum, used the eleven males weighing between 1.1 and 2.4 kg were subjected to treatment hypophysation. The volume of semen collected from 0.4 to 2.5 mL. Sperm motility after collection has remained between 85 to 292 seconds when activated with water tank, and 66 and 268 seconds when activated with distilled water. For sperm concentration, we found values that ranged between 28 and 88 x106 sperm / mm ³. From 0 to 74 hours after fertilization, were performed on 37 samples every two hours for each species. Was observed organogenesis, hatching with closed mouth and anus, formation of the heart, eyes, fins and digestive tract. The larvae of S. melanodermatum and R. quelen have similar characteristics during development. Espécies de grande porte e valor comercial são encontradas na bacia do Iguaçu, tendo como destaques, representantes da ordem Siluriforme. O gênero Steindachneridion pertence à ordem dos Siluriformes e possui distribuição restrita aos rios de algumas bacias da América do Sul. O endêmico surubim do Iguaçu (Steindachneridion melanodermatum), assim como outros siluriformes, apresenta características que vêm despertando grande interesse para o cultivo. Outro representante dos Siluriformes, com ampla representação no rio Iguaçu, é o jundiá (Rhamdia quelen), espécie esta já introduzida com sucesso na piscicultura comercial. O intuito deste trabalho foi de investigar os processos reprodutivos em laboratório a fim de definir melhores estratégias para reprodução induzida, taxa de fecundação, e desenvolvimento embrio-larval destes Siluriformes. O experimento foi realizado em viveiros de piscicultura da Estação de Estudos Ictiológicos da Usina Ney Braga, localizada na represa de Salto Segredo, PR. Com o objetivo de avaliar características qualitativas e quantitativas do sêmen de surubim, S. melanodermatum, utilizaram-se onze machos com peso entre 1,1 e 2,4 kg, submetidos ao tratamento de hipofisação. O volume de sêmen coletado variou de 0,4 a 2,5 mL. A motilidade dos espermatozóides após a coleta manteve-se entre 85 a 292 segundos, quando ativados com água do tanque, e de 66 e 268 segundos, quando ativados com água destilada. Para a concentração espermática, foram encontrados valores que oscilaram entre 28 e 88 x106 espermatozóides/mm³. Entre 0 à 74 horas pós fertilização, foram realizadas 37 coletas à cada duas horas, para cada espécie. Foi observada a organogênese, eclosão com boca e ânus fechados, formação do coração, olhos, nadadeiras e trato digestório. As larvas de S. melanodermatum e R. quelen possuem características similares durante o desenvolvimento.

Made available in DSpace on 2017-07-21T19:59:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Americo Moraes.pdf: 5820633 bytes, checksum: 965e01013ad416e0fcd25ab3ad7ec73d (MD5) Previous issue date: 2009-09-25 Fundação Araucária de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico do Paraná Currently, studies of aspects of evolutionary biology in neotropical fishes diversity are still lacking, despite the strong environmental impact caused by human action that has had a negative effect in native species, many of which probably still unknown to science. The knowledge of genetic variability within and between populations is of utmost importance for planning of both fish breeding and conservation of natural populations. In the present study we have analyzed, especially through molecular cytogenetics techniques, 29 specimens of Pseudoplatystoma reticulatum (Paraguay river, state of Mato Grosso do Sul), 14 specimens of Pimelodus britskii (Igua?u river, state of Paran?), 6 specimens of Sorubim lima (Paraguay river, state of Mato Grosso do Sul) and 10 specimens of Steindachneridion parahybae (Para?ba do Sul river, state of S?o Paulo). Results indicate 2n = 56 chromosomes for all species, a distinct karyotype formula composed mainly of biarmed chromosomes. Other particular features were found, regarding the location for Ag+NORs and fluorescent in situ hybridization with 5S and 18S probes. Except P. britskii, which showed NORs in the terminal region of the long arm, all species showed Ag+NORs in the terminal position of the short arm. Another peculiar feature of this fish was the co-localization of one of the 5S and 18S rDNA sites, which could be considered an apomorphy to the others Pimelodidae studied. The present work aims to contribute to the collection of data on the cytogenetics studies of Siluriformes, considering that much of the here presented information are the first characterization of the karyotype macro-struture of analysed fishes. Considerando-se a diversidade ictiofaun?stica neotropical, estudos sobre aspectos de biologia evolutiva s?o ainda pouco expressivos. Em contraste, o forte impacto ambiental causado pela a??o humana tem refletido negativamente sobre as esp?cies nativas, muitas ainda desconhecidas da ci?ncia. O conhecimento da variabilidade gen?tica intra e inter populacional ? de extrema import?ncia para o planejamento tanto da piscicultura quanto para a conserva??o das popula??es naturais. No presente trabalho foram analisados citogeneticamente, sobretudo aplicando t?cnicas de citogen?tica molecular, 29 exemplares de Pseudoplatystoma reticulatum (rio Paraguai, MS), 14 esp?cimes de Pimelodus britskii (rio Igua?u, PR), 6 indiv?duos de Sorubim lima (rio Paraguai, MS), e 10 exemplares de Steindachneridion parahybae (rio Para?ba do Sul, SP). Os dados obtidos revelaram 2n = 56 cromossomos para todas as esp?cies analisadas, f?rmulas cariot?picas distintas, compostas basicamente de cromossomos de dois bra?os e caracter?sticas pr?prias em rela??o ? localiza??o das RONs atrav?s da impregna??o pelo ?on Ag+ e pela hibrida??o fluorescente in situ com sondas de DNAr 5S e 18S. Com exce??o de P. britskii, que apresentou RONs na regi?o terminal do bra?o longo, todas as outras esp?cies apresentaram marca??es das Ag+RONs em posi??o terminal no bra?o curto. Outra caracter?stica peculiar de P. britskii foi a localiza??o sint?nica de um dos s?tios de DNAr 5S e o 18S em cromossomos subteloc?ntricos, atributo que pode ser considerado uma apomorfia em rela??o a outros pimelod?deos estudados. O presente estudo visa contribuir com o acervo de dados citogen?ticos a respeito dos Siluriformes em estudo, considerandose que muitas das informa??es correntes tratam-se das primeiras caracteriza??es da macroestrutura cariot?pica das esp?cies de peixes analisadas.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior Cytogenetic studies were performed in three populations of Rhamdia quelen in Uberlândia-MG and one in Prata-MG. The results obtained evidenced a diploid number 2n=58 with 0-2 supranumerary chromosomes. The Nucleolus Organizer Regions were identified by silver nitrate and the NOR evidenced a simple heteromorphic NOR system. The three populations showed Ag-NOR in the short arm of the subtelo/acrocentric chromosome pair, in the Tijuco s population the NOR is located on the intersticial region of the submetacentric pair. The preparations were stained with the specific G-C fluorochrome CMA3, some of the chromosomes exhibited a pale fluorescence, indicating other regions richness in G-C base pairs beyond the NORs. The C band pattern showed small heterochromatic blocks in the centromeric and telomeric regions. In the attempt of a complete characterization, Restriction Endonuclease Banding, Hoechst 33258 and Cd-banding were applied. This study confirms some results of literature and show new important results for the better understanding this specie. Foram realizados estudos citogenéticos em quatro populações de Rhamdia quelen da região de Uberlândia-MG. Todas as populações apresentaram 2n= 58 cromossomos, com a ocorrência de 0-2 cromossomos supranumerários. Nos animais analisados, observou-se NOR simples e heteromórfica. As Ag-NORs de três populações marcaram a região do braço curto de um par de cromossomos subtelocêntrico/acrocêntrico, enquanto que a população do rio Tijuco apresentou NOR intersticial em um par submetacêntrico. O tratamento com cromomicina A3 evidenciou a presença de algumas regiões com afinidade ao fluorocromo CG específico, indicando a presença de outras regiões de blocos heterocromáticos ricos em GC além dos associados às NOR. Pequenos blocos heterocromáticos nos centrômeros e telômeros foram visualizados através da técnica de banda C. Na tentativa de uma caracterização mais completa das populações foram utilizadas as técnicas de Enzima de Restrição, Hoechst 33258 e bandeamento Cd. Este trabalho confirma alguns dados da literatura e trás novas informações enriquecedoras para o conhecimento de diferentes populações desta espécie. Mestre em Genética e Bioquímica