7 results on '"A. Farrant"'
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2. Nuclei of cervical cells detection using deep learning
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Eliezer Farrant Braz, Lotufo, Roberto de Alencar, 1955, Flores, Franklin Cesar, Rittner, Leticia, Universidade Estadual de Campinas. Faculdade de Engenharia Elétrica e de Computação, Programa de Pós-Graduação em Engenharia Elétrica, and UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS
- Subjects
Morfologia matemática ,Artificial intelligence ,Image processing ,Redes neurais (Computação) ,Mathematical morphology ,Neural networks (Computing) ,Processamento de imagens ,Cells - Nucleus ,Inteligência artificial ,Células - Núcleo - Abstract
Orientador: Roberto de Alencar Lotufo Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Elétrica e de Computação Resumo: Câncer de colo de útero é uma das principais causas de mortes por câncer entre as mulheres no mundo. Contudo, se o diagnóstico da doença for feito em estágios iniciais, as chances de cura aumentam significativamente. Estudos apontam que os núcleos de células cervicais podem sofrer alterações em caso de doença, além disso, dada sua estrutura e localização, sua detecção pode ser bastante útil para realizar outros tipos de análise nas células. Desta forma, ao longo dos anos, vários métodos que automaticamente detectam núcleos de células cervicais foram propostos para aprimorar a análise das imagens de teste de microscópio. Neste texto, iremos propor um método baseado em Redes Neurais Convolucionais para detectar automaticamente os núcleos de células cervicais. Após a Rede Neural Convolucional ser treinada com um conjunto de dados disponibilizados pelo Overlapping Cervical Cytology Image Segmentation Challenge - ISBI 2014, suas camadas completamente conectadas são convertidas em camadas convolucionais para permitir o processamento de imagens de qualquer tamanho. Os resultados obtidos foram comparados com os obtidos pelos participantes que submeteram trabalhos com sucesso no ISBI 2014 e outros trabalhos que utilizaram o mesmo conjunto de dados. Nossos resultados experimentais indicaram que a metodologia proposta provê uma detecção de núcleos com métricas de precisão e recall comparáveis com os métodos do estado da arte em detecção de núcleos de células cervicais. Nos casos em que o tempo de processamento não seja um limitador, utilizando-se técnicas de morfologia matemática é possível melhorar ainda mais os resultados, obtendo-se valores para o recall que superam os melhores resultados descritos na literatura Abstract: Cervical cancer is one of the most common causes of cancer death for women worldwide. However, if diagnosis occurs in an early stage of the disease, the chances of cure significantly increases. Studies have shown that changes on cervical cell¿s nucleus may occur in case of disease. Also, due to its structure and displacement, the detection of the nucleus can be very useful while performing other types of analysis in cervical cells. Through the years, various methods that automatically detect the nuclei of cervical cells have been proposed to improve the analysis of screening test images. In this work, we propose a Convolutional Neural Networks-based method that automatically detects the nuclei of cervical cells. Following training using a public dataset provided by the Overlapping Cervical Cytology Image Segmentation Challenge - ISBI 2014, the network¿s fully connected layers are converted to convolutional layers to enable processing of images of any size. Our results were then compared with those achieved by other participants who successfully submitted their work to ISBI 2014 and other studies that used the same dataset. Our experimental results indicate that the methodology provides fast nuclei detection with precision and recall that are comparable with the state-of-the-art methods used to detect the nuclei of cervical cells. If the processing time is not an issue, it is possible to obtain even better results by applying morphological operations to previous results. In these case, it is possible to obtain recall results that surpass the best result described in the literature Mestrado Engenharia de Computação Mestre em Engenharia Elétrica
- Published
- 2018
3. Perfil clínico e assistencial de crianças e adolescentes com doença falciforme no Nordeste Brasileiro.
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Marques, Taciana, Arruda Vidal, Suely, Farrant Braz, Adriana, and Holanda Teixeira, Maria de Lourdes
- Abstract
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- Published
- 2019
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4. Growth hormone pharmacogenetics in patients with Turner syndrome
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Adriana Farrant Braz, Alexander Augusto de Lima Jorge, Sonir Roberto Rauber Antonini, Maria Lucia Cardillo Correa Giannella, and Alexandre da Costa Pereira
- Abstract
A resposta individual ao tratamento com hormônio de crescimento recombinante humano (rhGH) na síndrome de Turner (ST) é muito variável. A falta de individualização da dose pode justificar a variabilidade de respostas e os resultados insatisfatórios de algumas pacientes mesmo quando diagnosticadas e tratadas em condições ideais. Como a resposta ao tratamento com rhGH reflete fatores genéticos e não genéticos, o objetivo do presente estudo é avaliar a influência de fatores genéticos no tratamento com rhGH das portadoras de ST. Foram estudadas 112 pacientes com ST, em tratamento ou que interromperam a terapia, após atingir a altura final. O DNA genômico de todas as pacientes foi obtido para estudo de três polimorfismos em genes envolvidos na ação do GH: a presença ou ausência do éxon 3 do receptor do GH (GHR), VNTR presente na região promotora do gene do fator de crescimento insulina-símile-1(IGF1) e polimorfismo de único nucleotídeo (SNP) presente na região promotora do gene da Proteína 3 de Ligação a Fator de Crescimento Insulina-símile (IGFBP3). Os achados moleculares foram correlacionados com a velocidade de crescimento no primeiro ano de tratamento (n=112) e com altura adulta (n=65)) após uso de rhGH por meio de análises de regressão linear simples e múltipla, ajustadas para as demais variáveis clínicas relacionadas à resposta ao tratamento com rhGH em ST. Dois desses polimorfismos - a presença (GHR-fl) ou ausência (GHR-d3) do éxon 3 do GHR e o polimorfismo - 202 A/C IGFBP-3- influenciaram de forma independente e interativa a capacidade de resposta ao tratamento com rhGH em pacientes com ST; e o VNTR de repetições (CA)n da região promotora do IGF1 não demonstrou influência sobre nenhum dos parâmetros analisados. Pacientes carreadoras de, pelo menos, um alelo GHR-d3 apresentaram melhor velocidade de crescimento e maior altura final após tratamento com rhGH do que as homozigotas para o alelo GHR-fl. Similarmente, as carreadoras de, pelo menos, um alelo -202 A-IGFBP3 apresentaram melhor velocidade de crescimento e maior altura final após tratamento com rhGH, além de maiores concentrações séricas de IGFBP-3, do que as homozigotas para o alelo -202 CIGFBP3. Finalmente, a análise conjunta dos genótipos GHR-éxon 3 e -202 A/C IGFBP3 mostrou uma clara influência epistática, parcialmente aditiva, desses dois polimorfismos comuns na altura adulta de pacientes com ST tratadas com rhGH (efeito isolado do GHR-éxon 3, R2 = 0,27; efeito isolado do -202 A/C IGFBP3, R2 = 0,24; influência combinada desses polimorfismos, R2 = 0,37). Em conjunto com as variáveis clinicas, altura ao início do tratamento (p
- Published
- 2013
5. Review of some methods of evaluating transport projects
- Author
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AMARAL, Roseany Farrant do., RABBANI, Soheil Rahnemay., RABBANI, Simin Jalali Rahnemay., SILVA, Antônio José., and BARKOKEBAS JÚNIOR, Beda.
- Subjects
Utilidade multiatributo ,Engenharia civil ,Transports ,Multi-attribute Utility ,Transportes - Abstract
Submitted by Deyse Queiroz (deysequeirozz@hotmail.com) on 2019-02-28T12:18:34Z No. of bitstreams: 1 ROSEANY FARRANT DO AMARAL - DISSERTAÇÃO PPGECA 1999..pdf: 2975265 bytes, checksum: 56cd8b13e6f3bbd5ddd7a31384724479 (MD5) Made available in DSpace on 2019-02-28T12:18:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ROSEANY FARRANT DO AMARAL - DISSERTAÇÃO PPGECA 1999..pdf: 2975265 bytes, checksum: 56cd8b13e6f3bbd5ddd7a31384724479 (MD5) Previous issue date: 1999-06 Tradicionalmente, até a década de 60, os projetos de transportes eram avaliados apenas sob o ponto de vista econômico, através de métodos monocriteriais de avaliação. Os métodos tradicionais são de fácil entendimento e são classificados em dois grupos; o primeiro, baseia-se nas relações entre benefícios e custos e o segundo, nas relações entre custo e efetividade. No entanto, as consequências de um projeto não se restringem ao critério econômico. Desta forma, devido a crescente necessidade de inserir na avaliação, diversos fatores tangíveis e intangíveis relevantes ao processo decisório, surgiram no finai da década de 70, os métodos muítícriteriais mais eficientes e bastante utilizados em ambientes científicos na tomada de decisão. Com o surgimento dos métodos multicriteriais, tornou-se possível a construção de modelos mais realistas. O método de avaliação muíticriteríal, em realce, o Processo de Análise Hierárquica - AHP, se enquadra perfeitamente nos moldes do moderno processo decisório, haja vista, que as inúmeras vantagens destes métodos, consistem na possibilidade de proceder-se o estudo, trabalhando-se ao mesmo tempo tanto com fatores quantitativos, como os de natureza qualitativa, além de possuir a capacidade de considerar simultaneamente uma diversificada gama de critérios. Os métodos de avaliação multicriteriais superam as deficiências existentes nos métodos tradicionais, bem como, induzem a um maior entrosamento entre os avaliadores e os dirigentes responsáveis pelas decisões, já que existem etapas de trabalho que forçosamente, conta com a participação simultânea de ambos. Assim, o processo decisório torna-se bem estimulante e com maiores chances de se tornar mais eficiente. O presente trabalho mostra uma revisão de alguns métodos de avaliação de projetos de transportes, destacando os métodos tradicionais de avaliação econômica benefício-custo, bem como, os métodos de análise multicríterial, dentre eles, o método AHP -Analytic Hierarchy Process e alguns métodos estatísticos muitivariados como Análise de Regressão Linear, Análise Fatorial e Análise Discriminante. Traditionally, until the 1960 decade, transportation projects were evaluated only under the economic point of view, through monocriteriai evaluation methods. Traditional methods are easily understandable and are classified in two groups: the first group is based on benefit and cost relations; the second, on cost and effectivity relations. However, due to the increasing need to include in the evaluation several tangible and intangible factors relevant to the decision process that were not taken into account by the traditional methods are more efficient and are largely used in decision making by the scientific community. The use of multicriterial methods made possible the construction of more realistic models. The multicriterial evaluation method under consideration, The Analytic Hierarchy Process - AHP, fits well in the modern decision process requirements. Among the several advantages of multicriterial methods, there is the possibility of taking under consideration, at the same time, quantitative as well as qualitative factors, besides the capacity of simultaneously considering a wide set of criteria and of representing their multicriterial analysis in matrix form. Multicriterial evaluation methods surpass the shortcomings of traditional methods and give rise to more conperation between evafuators and decision makers since there are steps in the evaluation process in which both have to work together. Thus, the decision process becomes more stimulant and has more chance of becoming more efficient. In this work, an analysis of traditional methods, multicriterial methods, and multivariate methods of economic evaluation is made. Though the latter are not directly involved in the evaluation, they are a tool that helps in the analysis of the variables.
- Published
- 1999
6. Clinical and care profiles of children and adolescents with Sickle Cell Disease in the Brazilian Northeast region
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Taciana Marques, Suely Arruda Vidal, Adriana Farrant Braz, and Maria de Lourdes Holanda Teixeira
- Subjects
Sickle cell disease ,Complications ,Epidemiology ,Child health ,Adolescent health ,Neonatal screening ,Gynecology and obstetrics ,RG1-991 - Abstract
Abstract Objectives: to describe the clinical epidemiological and care profiles of pediatric patients with sickle cell disease. Methods: a descriptive study of all (48) children and adolescents with sickle cell disease, assisted at a public referral hospital in Paraíba State. The information were obtained from the patients’ medical records and interviews were analyzed by using the Epi-Info program 7.2 version, frequency tables were built for the categorical variables and the central measurements and dispersion tendencies were calculated for the variables related to age and hospitalizations. Results: the patients’ age ranged from 15 months to 19 years old (median 8.6 years old); 91.7% considered their skin color mixed/black; 81.3% belong to D and E social class; 48% of the responsible guardians reported to have less than nine years of schooling; 70.9% lived in other cities; 93.8% received late diagnosis and 87.5% had irregular outpatient follow-up, 62,5% had an incomplete or outdated vaccination record. There were 226 hospitalizations; painful crises were the most common causes (55.7%). Each patient was hospitalized, about 5.2 times in the period; the median of total days for being hospitalized was 28. There were no deaths. Cardiac (56.2%) and hepatobiliary (54.3%) were the most common chronic compli-cations. Conclusions: sickle cell disease is a neglected clinical condition in the Brazilian Northeast region, where the appropriate political support for the patients is not fulfilled.
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7. Síndrome da apneia obstrutiva do sono, doenças hepáticas crônicas (hepatites virais, doença hepática gordurosa não alcoólica) e Síndrome Metabólica: estudo descritivo
- Author
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MARQUIS, Valéria Wanderley Pinto Brandão, LOPES NETO, Edmundo Pessoa de Almeida, and BRAZ, Adriana Farrant
- Subjects
Síndrome da apneia obstrutiva do sono ,Doença hepática gordurosa não alcoólica ,Síndrome X metabólica ,Hepatite B ,Hepatita C - Abstract
O objetivo deste estudo foi descrever a ocorrência de doenças hepáticas crônicas (hepatite B e C e doença hepática gordurosa não alcoólica - DHGNA) e síndrome metabólica (SM) em pacientes com Síndrome da apneia obstrutiva do sono (SAOS). Os objetivos secundários, foram descrever: (1) a frequência de doenças hepáticas crônicas (hepatite B e C, DHGNA) e SM em pacientes com SAOS de acordo com as variáveis biológicas, antropométricas e as alterações bioquímicas; (2) a ocorrência de DHGNA e SM de acordo com a gravidade da SAOS; (3) a presença dos critérios diagnósticos de SM, segundo a NCEP-ATP III, e sua prevalência de acordo com a gravidade da SAOS. Selecionamos pacientes a partir da aplicação do questionário clinico de Berlim, incluindo pacientes entre 20-74 anos de idade, não alcoolistas crônicos, que apresentaram diagnóstico de SAOS através de poligrafia de noite inteira. Foram incluídos 167 pacientes, com média de idade de 52,3 ± 12,1 anos, sendo 59,2% do sexo feminino, média do peso de 76,1 ± 15,1 kg, com média de IMC de 29,5 ± 4,07 kg/m2. No sexo masculino, a circunferência cervical e abdominal média foi de 41,2 ± 2,7 e 101,4 ± 12,4 cm, respectivamente, e no feminino 37,9 ± 2,6 cm e 99,2 ± 9,6 cm. Os resultados demonstraram que (1) prevalência de DHGNA em 58,7%, SM em 44,3%; prevalência de Hepatite B em 1,2% e não houve casos de hepatite C; (2) os pacientes com SM apresentaram maior média de idade e o sexo feminino foi mais acometido, mas não foi encontrada esta diferença nos pacientes com DHGNA; (3) o IMC e a circunferência abdominal foram aumentados foram mais observados naqueles com DHGNA e com SM; (4) a maioria dos pacientes obtiveram resultados laboratoriais normais, sendo que a dosagem de triglicerídeos apresentou maior percentual de resultados alterados. ALT foi o marcador de lesão hepática aumentado nos portadores de DHGNA e triglicerídeos e glicemia de jejum foram maiores nos grupos tanto com DHGNA como com SM; (5) a presença de DHGNA e de SM não teve relação a gravidade da SAOS, porém a intensidade da DHGNA, segundo ultrassonografia abdominal, tem uma associação com a gravidade da SAOS; (6) entre os parâmetros diagnósticos da SM, a circunferência abdominal aumentada para ambos os sexos foi o mais prevalente, e não houve relação dos parâmetros com a gravidade da SAOS. Conclui-se que cerca da metade dos pacientes com SAOS apresentaram DHGNA e SM, neste estudo. A ocorrência de doença hepática crônica pelo vírus B e C foi semelhante a população geral. The objective of this study was to describe the occurrence of chronic hepatic diseases (hepatitis B and C and non-alcoholic fatty liver disease - NAFLD) and metabolic syndrome (MS) in patients with obstructive sleep apnea syndrome (OSAS). As secondary objectives, we sought to (1) describe the frequency of chronic liver diseases (hepatitis B and C, NAFLD) and MS in OSAS patients according to biological, anthropometric and biochemical changes; (2) describe the occurrence of NAFLD and SM according to the severity of OSAS; (3) describe the presence of the diagnostic criteria of MS according to NCEP-ATP III and its prevalence according to the severity of OSAS. We selected patients using the Berlin Clinical Questionnaire, including patients aged 20-74 years old, who were non-alcoholic, and presented a diagnosis of OSAS through polygraphy. One hundred and sixty seven patients were included, with a mean age of 52.3 ± 12.1 years, 59.2% female, mean weight 76.1 ± 15.1 kg, and a mean BMI of 29.5 ± 4.07 kg/ m². In males, the mean cervical and abdominal circumference was 41.2 ± 2.7 and 101.4 ± 12.4 cm, respectively, and in the female, 37.9 ± 2.6 cm and 99.2 ± 9.6 cm. The results demonstrated that (1) the prevalence of NAFLD in 58.7% and MS in 44.3%; Hepatitis B prevalence was low (1.2%) and there were no cases of hepatitis C; (2) patients with MS were older and females were more affected, but this difference was not found in patients with NAFLD; (3) increased BMI and abdominal circumference were mostly observed in patients with NAFLD and SM; (4) the majority of the patients had normal laboratory results, and the triglyceride dosage was the only one that obtained more altered results. ALT was the marker of increased liver injury in patients with NAFLD and triglycerides and fasting glycaemia were higher in both DHGNA and SM groups; (5) the presence of DHGNA and MS was not related to OSAS severity, however NAFLD intensity, according to abdominal ultrasonography has a association with the severity of OSAS; (6) in the diagnostic parameters of MS, increased abdominal circumference for both sexes was the most prevalent, and there were no relation between the parameters and the severity of OSAS. We conclude that about half of OSAS patients had NAFLD and MS diagnose, in this study. The occurrence of chronic hepatic disease due to B and C virus was the same as the general population.
- Published
- 2017
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