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O propósito desta revisão é focalizar o exercício como modulador da reprodução humana, resumir e integrar os dados atuais referentes ao eixo hipotálamo-hipófise-gonadal na mulher atleta. A prevalência de disfunção menstrual, tal como fase lútea deficiente, oligomenorréia, amenorréia e retardo puberal, é maior entre o grupo de mulheres atletas quando comparado à população geral. Vários fatores podem predispor e contribuir para o desenvolvimento das irregularidades menstruais durante o programa de atividade física, sendo considerados fatores de risco, entre eles, baixo peso, teor de gordura corporal e estados hipoestrogênicos. O hipoestrogenismo pode afetar o pico de massa óssea na puberdade e acarretar perda óssea prematura irreversível. O artigo revisa os efeitos fisiológicos do treinamento físico nos vários sistemas endócrinos e aborda informações clínicas a respeito dos distúrbios hormonais específicos da mulher atleta. The purpose of this review is to focus the exercise as a modulator of human reproduction and to summarize and integrate current data concerning the hypothalamus-pituitary-gonadal axis in exercising women. The prevalence of menstrual dysfunctions, as the luteal phase deficiency, oligomenorrhea, amenorrhea and menarcheal delay are greater among athletes than in the general population. Many factors undergo changes during the course of an athletic training program and any or all of these may contribute to disturbances in menstrual cyclicity. A number of risk factors have been identified as predisposing women to the development of menstrual irregularities, such as low body weight, body fat and hypoestrogenic status. Hypoestrogenism may affect peak bone mass in the puberty and lead to irreversible premature bone loss. This paper reviews the physiologic effects of fitness training on various endocrine systems and provides clinical information about specific endocrine disturbances in athlete women.