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疾患の遺伝学的理解には,遺伝子の構造だけでなく,その発現状態についての理解も必要である。DNA へのメチル化修飾に代表されるエピジェネティクスは,このような遺伝子調節を司るメカニズムである。しかしながら,そのゲノムワイドでのエピジェネティクスパターン解析すなわちエピゲノムの理解はまだほとんど進んでいない。そこでわれわれは,臨床的に最も利用されるヒト末梢血中のリンパ球におけるさまざまな遺伝子のDNA メチル化パターンを,亜硫酸ナトリウム処理塩基配列決定法を用いて調べた。その結果,解析対象とした24 遺伝子において,(1)リンパ球のメチル化パターンは個体間でほとんど違いがないこと,(2)リンパ球のメチル化パターンは線維芽細胞のものとかなり異なること,(3)CpG 配列の密度が低い方が高いメチル化が見られる傾向にあること,が判明した。以上の定量的なメチル化情報は,全遺伝子プロモーターにおけるメチル化状態の把握を可能にするゲノムマイクロアレイ法の定量性判定に有用であり,これにより正常リンパ球におけるエピゲノム情報の整備がなされれば,エピゲノム変化が想定される後天性疾患の診断や病態把握に役立つものと思われた。

The APEX nuclease is a mammalian multifunctional repair enzyme having 5' apurinic/apyrimidinic (AP) endonuclease, DNA 3' repair diesterase, 3'-5' exonuclease and DNA 3' phosphatase activities. The mouse Apex gene for the enzyme, was isolated from a mouse leukocyte genomic library by plaque hybridization with the mouse Apex cDNA as a probe. The nucleotide sequence of the Apex gene and its 5'-and 3'-flanking regions were determined. With reference to the published Apex cDNA sequence, the mouse Apex gene can be divided into five exons and four introns with a total length of about 2.6 kb. The boundaries between exon and intron follow the GT/AG rule. The translation initiation and termination sites are located in exons Ⅱ and Ⅴ, respectively. A part of the 5' flanking region belongs to a CpG island, which extends to intron Ⅱ. The CpG island is thought to be a putative transcription regulatory region of the Apex gene, a housekeeping gene.