1. Analisi molecolari dei geni interni PA, PB1, PB2 dopo passaggi in specie domestiche di un virus A/H7N3 isolato da anatra selvatica
- Author
-
Falcone E, Giannecchini S, Nenci M, Azzi A, Capua I, Di Trani L., DELOGU, MAURO, EMILIANA FALCONE , SUSAN BABSA, FRANCO MARIA RUGGERI , CANIO BUONAVOGLIA, Falcone E, Giannecchini S, Nenci M, Delogu M, Azzi A, Capua I, and Di Trani L.
- Subjects
A/H7N3 ,ANALISI MOLECOLARI DEI GENI INTERNI ,PB1 ,PB2 ,PA - Abstract
Il passaggio del Virus dell'Influenza Aviaria (AIV) dal serbatoio naturale rappresentato dalle specie aviarie selvatiche alle specie aviarie domestiche, può indurre cambiamenti aminoacidici a livello delle glicoproteine di superficie e delle proteine interne strutturali. Lo studio, di cui si presentano alcuni dati preliminari, ha l'obiettivo di identificare le modificazioni nucleotidiche a livello dei geni virali interni PA, PB1 e PB2 a seguito di trasmissione sperimentale di un virus isolato da anatra selvatica in due diverse specie aviarie domestiche, tacchino e quaglia. A tale scopo è stato utilizzato il virus A/Mall/It/33/01 (A/H7N3), identificato quale precursore diretto dei virus A/H7N3 a bassa patogenicità circolati negli allevamenti italiani dal 2002 al 2004. Le principali modificazioni amminoacidiche tra virus A/H7N3 isolati nel corso dell'epizoozia nel pollame ed il virus isolato dall'anatra, sono state identificate come sostituzioni di due amminoacidi nell'emoagglutinina, delezione di 23 amminoacidi nello stalk della neuraminidasi ed un numero limitato di cambiamenti a carico delle proteine strutturali interne. Metodi. Per lo studio molecolare sono stati selezionati 4 isolati virali da 10 passaggi (ps.) seriali del virus A/H7N3 effettuati rispettivamente in tacchino e quaglia ed indicati Tk-p.4 (4° ps. in tacchino), Tk-p.10 (10° ps. in tacchino), Qu-p.6 (6° ps. in quaglia), Qup. 10 (10° ps. in quaglia). Per ciascuno dei passaggi indicati sono state ottenute le sequenze dei geni interni PA (bp.1-2233), PB1 (bp.1-2341) e PB2 (bp.1-2341). L'assemblaggio e l'allineamento con sequenze di virus aviari, sono stati effettuati col software DNASTAR-Lasergene. Risultati e conclusioni. L'analisi molecolare dei geni interni PA, PB1 e PB2, relativi ad alcuni passaggi in vivo del virus A/Mall/It/33/01 ed il confronto di analoghe sequenze ottenute dal precursore selvatico, hanno evidenziato mutazioni sinonime e non sinonime nei geni in studio rispetto al ceppo originale; inoltre alcune sostituzioni amminoacidiche distinguono gli isolati ottenuti in quaglia rispetto a quelli replicati in tacchino. I risultati 55 dello studio contribuiscono alla identificazione dei cambiamenti molecolari che possono avere un ruolo importante nella trasmissione interspecie degli AIV dalle specie aviarie selvatiche a quelle domestiche.
- Published
- 2009