Search

It is widely accepted that, that in recent years, there is an intense activity of the Cyprus wine industry, where the local winemakers focus mainly on the exploitation of indigenous varieties. Grapevine trunk diseases (GTDs) form the most destructive biotic complex, limiting vineyard productivity and longevity globally. Based on recent data, the Cyprus vineyard is seriously affected by GTDs. At the same time, there is a trend from Cypriot producers to organic farming, as a result the chemical methods of combating these diseases are not feasible. The aim of the present thesis was to evaluate the local microflora of Cyprus, of two indigenous varieties of the Cypriot vineyard, Giannoudi and Promara, in terms of their use to treat pathogenic fungi that attack the vineyard, which could be applied GTDs management antagonistic activity of 164 bacterial isolates was screened in vitro against with 6 important GTD pathogens (Phaeomoniella chlamydospora, Diplodia seriata, Neofusicoccum parvum, Eutypa lata, Ilyonectria liriodendri, Dactylonectria alcacerensis and Dactylonectria torresensis). Είναι γενικά παραδεκτό ότι τα τελευταία χρόνια υπάρχει έντονη δραστηριότητα της κυπριακής αμπελοοινικής βιομηχανίας, όπου οι ντόπιοι οινοποιοί εστιάζουν κυρίως στην εκμετάλλευση των ιθαγενών ποικιλιών της αμπέλου. Οι ασθένειες του ξύλου της αμπέλου (Grapevine Trunk Diseases, GTDs) αποτελούν το πιο καταστρεπτικό βιοτικό σύμπλεγμα, περιορίζοντας την παραγωγικότητα του αμπελώνα και τη μακροζωία του. Σύμφωνα με πρόσφατα στοιχεία, ο κυπριακός αμπελώνας επηρεάζεται σοβαρά από τις GTD ασθένειες. Ωστόσο, οι κύπριοι παραγωγοί τείνουν κυρίως προς την βιολογική καλλιέργεια, με αποτέλεσμα οι χημικοί τρόποι καταπολέμησης των ασθενειών αυτών να μην είναι εφικτοί. Στόχος της παρούσας μεταπτυχιακής διατριβής είναι η αξιολόγηση της τοπικής μικροχλωρίδας της Κύπρου μέσα από δύο γηγενείς ποικιλίες του Κυπριακού αμπελώνα, το Γιαννούδι και τη Πρωμάρα, για τη χρησιμοποιήσει τους στην αντιμετώπιση παθογόνων μυκήτων που προσβάλουν το αμπέλι και όπου θα μπορούσαν να εφαρμοστούν στο κυπριακό terroir για τη διαχείριση των GTDs. Ακόμη η ανταγωνιστική δραστικότητα 164 βακτηριακών απομονώσεων υποβλήθηκε σε δοκιμασία in vitro έναντι 7 σημαντικών παθογόνων GTD (Phaeomoniella chlamydospora, Diplodia seriata, Neofusicoccum parvum, Eutypa lata, Ilyonectria liriodendri, Dactylonectria alcacerensis και Dactylonectria torresensis). Completed

Grapevine trunk diseases (GTDs) are a huge threat to vineyards around the world. Thus, in Cyprus which viticulture is an important sector for the island's economy, the recent years the Ministry of Agriculture and Cypriot viticulturists worry about the several damages in vineyards cause from these destructive diseases every year. In the present study, a molecular characterization of 335 fungi sequences was conducted, which isolated from vines that have GTDs symptoms, from a total of 96 vineyards from 33 villages in the area Paphos. Specifically, the 55.6% of the total isolations include fungus that are scientifically related to the 4 main grapevine trunk diseases, Esca (26.6%), Botryosphaeria dieback (17.9%), Eutypa dieback (7.2%) and Phomopsis dieback (3.9%). The species of Phaeomoniella chlamydospora was isolated more times than other fungi, in 55 of the 335 isolates. Also the fungus of Diplodia genus identified in 38 isolates and the fungus of Phaeoacremonium genus in 34 isolates. Furthermore, 2-3 fungus were isolated to colonize the same vascular tissue of infected wood at the same time, where one of them at least causes GTDs, such as the Phaeomoniella chlamydospora together with the Eutypa leptoplaca. We identified 22 isolations of genus Fusarium, mainly the species F. proliferatum and F. oxysporum. Notably, we have identified the fungi Cladosporium (4 isolates), Aureobasidium pullulans (1 isolation), Neofabraea kienholzii (4 isolation), Paraconiothyrium variabile (12 isolation), Seimatosporium (5 isolation), Alternaria spp. (39 isolation) and Kalmusia (8 isolation). From the 335 isolations that carried out, the 64.4% concern vineyards of the two main indigenous cultivars (cvs. Mavro and Xinisteri), therefore it is very important to take measures, mainly preventive, towards a sustainable and economically viable viticulture. Οι ασθένειες του ξύλου της αμπέλου (Grapevine Trunk Diseases; GTDs) αποτελούν στις μέρες μας μια σημαντική απειλή για τους αμπελώνες σε όλο τον κόσμο. Έτσι λοιπόν και στην μεγαλόνησο Κύπρο, στην οποία η αμπελουργία κατέχει σημαντική θέση στο οικονομικό υπόβαθρο των κατοίκων του νησιού τα τελευταία χρόνια τα αρμόδια άτομα και οι αμπελοκαλλιεργητές άρχισαν να αφυπνίζονται βλέποντας όλο και πιο συχνά πρέμνα να αποδυναμώνονται, να μειώνουν την ποιοτική και ποσοτική παραγωγή τους και να ξεραίνονται τμηματικά. Στη παρούσα μελέτη πραγματοποιήθηκε o μοριακός χαρακτηρισμός 335 αλληλουχιών μυκήτων που απομονώθηκαν από συμπτωματικά πρέμνα από συνολικά 96 αμπελώνες από 33 χωριά της επαρχίας Πάφου. Το 55,6% των απομονώσεων, περιλαμβάνει μύκητες που σχετίζονται με τις 4 κύριες ασθένειες του ξύλου της αμπέλου: Ίσκα (26.6%), Μελανή Νέκρωση Βραχιόνων (17.9%), Ευτυπίωση (7.2%) και Φώμοψη (3.9%). Το κυρίαρχο είδος μύκητα που απομονώθηκε από τα δείγματα μολυσμένου ξύλου και συνδέεται με ασθένειες του ξύλου της αμπέλου, είναι το Phaeomoniella chlamydospora, με το μύκητα αυτό να ανιχνεύεται στις 55 από τις 335 απομονώσεις, δεύτεροι σε συχνότητα εμφάνισης ακολουθούν μύκητες του γένους Diplodia (38 απομονώσεις) και τρίτοι σε εμφάνιση καταγράφονται οι μύκητες του γένους Phaeoacremonium (34 απομονώσεις). Επίσης, καταγράφηκαν και απομονώθηκαν περιπτώσεις πολλαπλών μυκήτων στον ίδιο αγγειακό ιστό μολυσμένου ξύλου, εκ των οποίων τουλάχιστον ο ένας προκαλεί GTDs, όπως ο μύκητας Phaeomoniella chlamydospora μαζί με τον μύκητα Eutypa leptoplaca. Αξιοσημείωτες απομονώσεις από τα δείγματα μολυσμένου ξύλου αμπέλου αποτελούν οι 22 απομονώσεις του γένους Fusarium, με πιο κύριες αυτές του είδους F. proliferatum και F. oxysporum. Πολύ σημαντικά ευρήματα είναι και η ταυτοποίηση των μυκήτων Cladosporium (4 απομονώσεις), Aureobasidium pullulans (1 απομόνωση), Neofabraea kienholzii (4 απομονώσεις), Paraconiothyrium variabile (12 απομονώσεις), Seimatosporium (5 απομονώσεις), Alternaria spp. (39 απομονώσεις) και Kalmusia (8 απομονώσεις). Από τις 335 απομονώσεις που πραγματοποιήθηκαν, το 64,4% προέρχεται από αμπελώνες των δύο κυριότερων γηγενών ποικιλιών (Μαύρο και Ξυνιστέρι). Ως εκ τούτου, η ανάγκη άμεσης λήψης προληπτικών (πιστοποίηση πολλαπλασιαστικού υλικού και για τις ασθένειες του ξύλου) και θεραπευτικών μέτρων κρίνεται επιβεβλημένη. Completed