6 results on '"Taryn A"'
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2. Abstract: the MIDOG Challenge 2021 : Mitosis Domain Generalization in Histopathology Images
- Author
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Aubreville, Marc, Stathonikos, Nikolas, Bertram, Christof A., Klopfleisch, Robert, Hoeve, Natalie ter, Ciompi, Francesco, Wilm, Frauke, Marzahl, Christian, Donovan, Taryn A., Maier, Andreas, Veta, Mitko, Breininger, Katharina, Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), Deserno, Thomas M., editor, Handels, Heinz, editor, Maier, Andreas, editor, Maier-Hein, Klaus, editor, Palm, Christoph, editor, and Tolxdorff, Thomas, editor
- Published
- 2023
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3. Study protocol: NITric oxide during cardiopulmonary bypass to improve Recovery in Infants with Congenital heart defects (NITRIC trial): a randomised controlled trial
- Author
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Yves d’Udekem, Simon Erickson, Marino Festa, Stephen Brian Horton, Debbie Amanda Long, John Beca, Nelson Alphonso, Kerry Johnson, Carmel Delzoppo, Kim van Loon, B Gannon, Jonas Fooken, Antje Blumenthal, Warwick Butt, Steve Horton, Johnny Millar, David Buckley, Taryn Evans, Claire Sherring, John Artrip, Killian O’Shaughnessy, Rebecca Fletcher, Simon Byrne, Sam Barr, Rae Kelly, Deborah Long, Kerry Johnston, Carla Zuzak, Benjamin Anderson, Nicole J C W van Belle-van Haaren, Bram van Wijk, Erik Koomen, University of Zurich, and Schibler, Andreas
- Subjects
Heart Defects, Congenital ,Male ,medicine.medical_specialty ,Cardiotonic Agents ,Heart disease ,medicine.medical_treatment ,lcsh:Medicine ,610 Medicine & health ,2700 General Medicine ,Nitric Oxide ,law.invention ,03 medical and health sciences ,0302 clinical medicine ,Superiority Trial ,Double-Blind Method ,Randomized controlled trial ,law ,Protocol ,Cardiopulmonary bypass ,Humans ,Medicine ,030212 general & internal medicine ,Cardiac Surgical Procedures ,Randomized Controlled Trials as Topic ,Mechanical ventilation ,child ,Cardiopulmonary Bypass ,business.industry ,ventilation ,lcsh:R ,Intensive Care ,Infant ,General Medicine ,medicine.disease ,congenital heart disease ,mortality ,3. Good health ,Cardiac surgery ,Clinical trial ,inflammation ,10036 Medical Clinic ,Anesthesia ,Female ,Risk Adjustment ,business ,030217 neurology & neurosurgery - Abstract
IntroductionCongenital heart disease (CHD) is a major cause of infant mortality. Many infants with CHD require corrective surgery with most operations requiring cardiopulmonary bypass (CPB). CPB triggers a systemic inflammatory response which is associated with low cardiac output syndrome (LCOS), postoperative morbidity and mortality. Delivery of nitric oxide (NO) into CPB circuits can provide myocardial protection and reduce bypass-induced inflammation, leading to less LCOS and improved recovery. We hypothesised that using NO during CPB increases ventilator-free days (VFD) (the number of days patients spend alive and free from invasive mechanical ventilation up until day 28) compared with standard care. Here, we describe the NITRIC trial protocol.Methods and analysisThe NITRIC trial is a randomised, double-blind, controlled, parallel-group, two-sided superiority trial to be conducted in six paediatric cardiac surgical centres. One thousand three-hundred and twenty infants Ethics and disseminationThe study has ethical approval (HREC/17/QRCH/43, dated 26 April 2017), is registered in the Australian New Zealand Clinical Trials Registry (ACTRN12617000821392) and commenced recruitment in July 2017. The primary manuscript will be submitted for publication in a peer-reviewed journal.Trial registration numberACTRN12617000821392
- Published
- 2019
4. Mögliche Rolle des terminalen Komplementkomplexes TCC bei der Bandscheibendegeneration
- Author
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Neidlinger-Wilke, Cornelia, Joos, Helga, Saggese, Taryn, Brisby, Helena, Ruf, Michael, Barth, Thomas, Mauer, Uwe Max, and Brenner, Rolf
- Subjects
terminaler Komplementkomplex TCC ,ddc: 610 ,Bandscheibendegeneration ,610 Medical sciences ,Medicine ,Immunhistologie - Abstract
Fragestellung: Bisher ist wenig über eine mögliche Rolle des Komplementsystems bei degenerativen Bandscheibenerkrankungen bekannt [ref:1]. Die Aktivierung des terminalen Komplementkomplexes TCC (C5b-9) an der Zellmembran gilt als möglicher Auslöser für Entzündungsreaktionen[zum vollständigen Text gelangen Sie über die oben angegebene URL], Deutscher Kongress für Orthopädie und Unfallchirurgie (DKOU 2017)
- Published
- 2017
5. Funktionelle Expression von Channelrhodopsin-2 (ChR2) in der methylotrophen Hefe Pichia pastoris und biophysikalische Charakterisierung
- Author
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Kirsch, Taryn
- Subjects
Rhodopsin ,Sensorrhodopsin ,Pichia pastoris ,ddc:570 ,Blitzlicht-Photolyse ,IMAC ,Blitzlicht ,Aufreinigung - Abstract
Chlamydomonas reinhardtii ist eines der bekanntesten Modellsysteme der Forschung, um photo-, zell- und molekularbiologische Fragestellungen zu untersuchen. Die phototaktischen Reaktionen dieser einzelligen Grünalge werden durch mikrobielle Rhodopsine, sogenannte Photorezeptoren initiiert, deren Chromophor all-trans-Retinal ist. Eines dieser Rhodopsine ist Channelrhodopsin 2 (ChR2). Ein Sequenzvergleich mit anderen mikrobiellen Rhodopsinen aus Archaebakterien, wie z.B. der lichtgetriebenen Protonenpumpe Bakteriorhodopsin, zeigt eine Homologie von bis zu 20 %. Aus diesem Grund kann angenommen werden, dass die hydrophobe N-terminale Hälfte mit circa 300 von 737 Aminosäuren ebenso aus einem Siebentransmembranhelixmotiv besteht, wie dies für Rhodopsinmoleküle typisch ist. Seit der Entdeckung 2003 durch Nagel et al. ist bekannt, dass es sich bei ChR2 um einen lichtgetriebenen, kationenselektiven Ionenkanal handelt, der in dieser Form bisher nicht bekannt war. Diese biophysikalische Charakteristik konnte durch detaillierte elektrophysiologische Daten erhoben werden. Sie lieferten zudem die Erkenntnis, dass ChR2 als „Werkzeug“ in der Neurobiologie verwendet werden kann, da die lichtinduzierte Depolarisation zum Feuern von Aktionspotentialen in ChR2-exprimierenden Neuronen führt. Die vorliegende Arbeit sollte dazu beitragen, die molekularen Mechanismen von ChR2 aufzuklären, indem elektrophysiologische, spektroskopische und biochemische Daten miteinander korreliert wurden. Dazu wurde ChR2 funktionell in der methylotrophen Hefe Pichia pastoris exprimiert. Ein Glykosylierungstest konnte belegen, dass Pichia pastoris in der Lage ist, die für ChR2 erforderliche N-Glykosylierung durchzuführen. Mit einer 90%igen Expression war es somit möglich, ausreichend Protein für eine Metallchelat-Affinitätschromatographie zu gewinnen. Weiterhin konnte die bestehende Funktionalität nach der Isolierung von ChR2 nachgewiesen werden. Dies erfolgte zum einen über Messungen des charakteristischen Photostroms mittels der BLM-Technik. Zum anderen konnte dies durch spektroskopische Messungen der spezifischen Absorption von ChR2 bei 480 nm bestätigt werden. Die zeitaufgelöste Laserblitzabsorptionsspektroskopie lieferte zudem Differenzspektren des isolierten ChR2, die erstmalig das Vorhandensein eines spektral verschiedenen Intermediats bei 540 nm zeigten. Zusammen mit dem Zeitverlauf aller vier korrespondierenden Intermediate und der Hinzunahme elektrophysiologischer Daten konnte somit ein linearer Photozyklus bestehend aus vier Zuständen erstellt werden (erstellt durch Dr. Christian Bamann). Die ersten drei Intermediate des Photozyklus P1-P3 werden demnach durch die rotverschobene Spezies beschrieben, mit einer Relaxationszeit von unter einer Millisekunde. Dieses rote Intermediat spiegelt die Konformationsänderung des Retinals wider und geht mit dem Öffnen des Kanals einher. Die Zustände P2 und P3 konnten beide als kationenleitende Zustände identifiziert werden. Das Schließen des Kanals wird durch den Übergang von P3 zu P4 (spektral mit dem Grundzustand gleich) vermittelt. Das Zurückkehren in den Grundzustand folgt einem langsamen Prozess im Bereich von mehreren Sekunden. Biochemische, spektroskopische und elektrophysiologische Daten haben damit erfolgreich zur weiteren Aufklärung der molekularen Funktionsweise von ChR2 beigetragen. Mit diesen Ergebnissen ist nun die Erschließung neuer Informationen über die verschiedenen Signaltransduktionswege von Membranproteinen möglich. In 2003, channelrhodopsin-2 (ChR2) from Chlamydomonas reinhardtii was discovered to be a light-gated cation channel, and since that time the channel became an excellent tool to control by light neuronal cells in culture as well as in living animals with high temporal and spatial resolution in a noninvasive manner. However, little is known about the spectral properties and their relation to the channel function. We have expressed ChR2 in the yeast Pichia pastoris and purified the protein. Flash-photolysis data were combined with patch-clamp studies to elucidate the photocycle. The protein absorbs maximally at approximately 480 nm before light excitation and shows flash-induced absorbance changes with at least two different photointermediates. Four relaxation processes can be extracted from the time course that we have analysed in a linear model for the photocycle leading to the kinetic intermediates P(1) to P(4). A short-lived photointermediate at 400 nm, suggesting a deprotonation of the retinal Schiff base, is followed by a red-shifted (520 nm) species with a millisecond lifetime. The first three kinetic intermediates in the photocycle, P(1) to P(3), are described mainly by the red-shifted 520-nm species. The 400-nm species contributes to a smaller extent to P(1) and P(2). The fourth one, P(4), is spectroscopically almost identical with the ground state and lasts into the seconds time region. We compared the spectroscopic data to current measurements under whole-cell patch-clamp conditions on HEK 293 cells. The lifetimes of the spectroscopically and electrophysiologically determined intermediates are in excellent agreement. The intermediates P(2) and P(3) (absorbing at 520 nm) are identified as the cation permeating states of the channel. Under stationary light, a modulation of the photocurrent by green light (540 nm) was observed. We conclude that the red-shifted spectral species represents the open channel state, and the thermal relaxation of this intermediate, the transition from P(3) to P(4), is coupled to channel closing.
- Published
- 2008
6. PATRICK GUNNING SEIZES THE MOMENT.
- Author
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SWADBA, TARYN
- Subjects
PHOTOGRAPHERS ,ROCK concerts - Abstract
The article discusses the strategies of British photographer Patrick Gunning to capture live music events; reports his participation in the periodical's Ultimate Music Moment competition; and mentions how he enjoys photographing live music events.
- Published
- 2017
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