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The study focuses firstly on the morphological analysis of ciliates and secondly the variation in abundance of acaryotes and prokaryotes of the digestive tract of annelids Oligochaetes collected in the Center Region of Cameroon. In addition, the physicochemical parameters that influence the seriation of these microorganisms along the digestive tract of their hosts were analysed.The morphological study is based on the techniques of impregnation of specimens with the ammoniacal silver carbonate, the DAPI and the Feulgen nuclear staining. The surveys carried out on the annelid oligochaetes of the family of Glossoscolecidae have anabled the description of twenty species of ciliates belonging to Heterotrichs, Hysterocinetidae and Astomes. Amoung Heterotrichs, have been described three species of the genus Nyctotherus characterized by the presence of an apical secant system on their right side and a species of the genus Nyctotheroïdes characterized by the existence of three secant systems on their two sides: one on the right side and two on the left. Up to now, the presence of Heterotrichs was unsuspected in Glossoscolecidae. In Hysterocinetidae, the description of nine new species demonstrates the existence of four different types of skeletal pattern. The first type, present four superimposed and antagonistic skeletal fibre layers, corresponds to that of the genus Ptychostomum. The second type is characterized by the existence of an unorganized field of fibrillary structures forming a dense and undivided mass in the central part of the suction cup, for which a new genus is created: Ptychostomoïdes. The third type, present in the genus Proptychotomoïdes, is characterized by the existence of a glabrous surface in the central area of the adhesive apparatus. In the genus Thurstonia, an uncialiated kidney shape surface bordered subsequently by two mobile lips deprived of skeletal fibers was observed. This morphological diversity within Hysterocinetidae requires a new approach of the systematic in this group. In some Astomes (Almophrya bivacuolata and A. mediovacuolata), the analysis of the morphological variations of the nuclear apparatus allowed us to highlight important digitations and the presence of dark bands in the H macro-nucleus structure of the small cellular types, as well as the presence of intermediate forms between H and X macronucleus in these two species. In Almophrya laterovacuolata, the disposition of the vacuolar apparatus is variable: either two longitudinal lines are arranged among branches of the H macronucleus, or two longitudinal lines are out of the H macronucleus branches. These longitudinal lines may also be arranged without obvious order among the H macronucleus branches. Given that the identification within the genus Almophrya is specifically based on the number and the arrangement of vacuoles, a revision of these criteria is required. Four new species belonging to genera Anoplophrya, Hoplitophrya and Dicontophrya were also described in Astomes.In addition to the description of two new genera in Hysterocinetidae, four species in Heterotrichs, and seven species in Astomes, the technique of the cytometry in flow enabled us to highlight an unsuspected population of viruses in the digestive tract of the Glossoscolecidae as well as a population of bacteria not less important.The technique of aspiration under a vacuum pump allowed us to isolate and collect the intestinal liquid in three portions of the digestive tract of Alma emini. The correlations carried out between physico-chemical parameters and ciliates biomass held our attention. These results suggest that each portion of the digestive tract of Alma emini is a set of biotope niches, and microhabitats in which a large number of physical and chemical factors create ecological niches more suitable to a species or a group of species. This might explain the striation and the variation of abundance of the microfauna along the digestive tract of oligochaetes annelids.; L’étude porte sur les analyses morphologiques des Protozoaires Ciliés et sur la variation d’abondance de virus et de bactéries du tube digestif d’annélides oligochètes de la famille des Glossoscolecidae récoltés dans la région du Centre Cameroun. De plus, les paramètres physico-chimiques susceptibles d’influencer la sériation de ces microorganismes le long du tube digestif de leurs hôtes ont été analysés. L’étude morphologique est basée sur les techniques d’imprégnation des spécimens au carbonate d’argent ammoniacal pyridiné et à la coloration au Di Aminido Phenyl Indol. Les prospections effectuées ont permis la description de vingt espèces de Ciliés appartenant aux Hétérotriches, Hysterocinetidés et Astomes. Chez les Hétérotriches dont la présence jusqu'ici était insoupçonnée chez les Glossoscolecidae, trois espèces du genre Nyctotherus ont été décrites ; caractérisées par la présence d’un système sécant apical sur leur face droite. Une espèce du genre Nyctotheroïdes a été décrite. Elle est caractérisée par l’existence de trois systèmes sécants dont un apical sur la face droite et deux (apical et caudal) sur la face gauche. Chez les Hysterocinetidés, la description de neuf espèces nouvelles démontre l’existence, au niveau de l’appareil adhésif de quatre types différents de topographies d’armature squelettique. Le premier, qui présente quatre strates de fibres squelettiques superposées et antagonistes, correspond à celui du genre Ptychostomum. Le second est caractérisé par l’existence d’un champ inorganisé de structures fibrillaires formant une masse dense et indivise dans la partie centrale de la ventouse, pour lequel un nouveau genre est créé : le genre Ptychostomoïdes. Le troisième type se distingue du précèdent par l’existence d’une aire glabre dans la région centrale de l’appareil adhésif. En fin le quatrième type, caractéristique du genre Thurstonia présente une aire non ciliée réniforme bordée postérieurement par deux lèvres mobiles et dépourvue de fibres squelettiques. Cette diversification morphologique au sein des Hysterocinetidés semble devoir imposer une nouvelle approche de la systématique de ce groupe. Les Ciliés Astomes Almophrya bivacuolata et A. mediovacuolata sont caractérisés par un macronoyau soit en X, en H, soit intermédiaire entre X et H. L’étude des variations morphologiques de l’appareil nucléaire chez ces espèces d’Almophrya révèle d’importantes digitations, des bandes sombres et d’interbandes dans la structure du macronoyau en H des petits types cellulaires. Chez A. laterovacuolata, la disposition de l’appareil vacuolaire est très variable : deux rangées longitudinales entre les branches du macronoyau en H; deux rangées longitudinales hors des branches de celui-ci ; sans ordre évident entre ses branches. Une révision des critères d’identification des Ciliés Almophrya semble devoir s’imposer. Quatre espèces nouvelles appartenant aux genres Anoplophrya, Hoplitophrya et Dicontophrya ont également été décrites chez les Astomes. Par ailleurs, la technique de la cytométrie en flux nous a permis de mettre en évidence une population jusqu’alors insoupçonnée de virus dans le tractus digestif des vers Glossoscolecidae ainsi qu’une population non moins importante de bactéries. La technique d’aspiration sous une pompe à vide a permis d’isoler et de recueillir le liquide intestinal du tube digestif de Alma emini. Les corrélations effectuées entre les paramètres physico-chimiques et les variations d’abondances des Ciliés ont été significatives. Ces résultats laissent supposer que chaque portion du tractus digestif de Alma emini est un ensemble de biotopes, de microhabitats dans lesquels un grand nombre de facteurs physiques et chimiques créent des niches écologiques plus favorables à une espèce ou à un groupe d’espèces. Ceci expliquerait la sériation et la variation d’abondance de la microfaune le long du tube digestif des annélides oligochètes.

The study focuses firstly on the morphological analysis of ciliates and secondly the variation in abundance of acaryotes and prokaryotes of the digestive tract of annelids Oligochaetes collected in the Center Region of Cameroon. In addition, the physicochemical parameters that influence the seriation of these microorganisms along the digestive tract of their hosts were analysed.The morphological study is based on the techniques of impregnation of specimens with the ammoniacal silver carbonate, the DAPI and the Feulgen nuclear staining. The surveys carried out on the annelid oligochaetes of the family of Glossoscolecidae have anabled the description of twenty species of ciliates belonging to Heterotrichs, Hysterocinetidae and Astomes. Amoung Heterotrichs, have been described three species of the genus Nyctotherus characterized by the presence of an apical secant system on their right side and a species of the genus Nyctotheroïdes characterized by the existence of three secant systems on their two sides: one on the right side and two on the left. Up to now, the presence of Heterotrichs was unsuspected in Glossoscolecidae. In Hysterocinetidae, the description of nine new species demonstrates the existence of four different types of skeletal pattern. The first type, present four superimposed and antagonistic skeletal fibre layers, corresponds to that of the genus Ptychostomum. The second type is characterized by the existence of an unorganized field of fibrillary structures forming a dense and undivided mass in the central part of the suction cup, for which a new genus is created: Ptychostomoïdes. The third type, present in the genus Proptychotomoïdes, is characterized by the existence of a glabrous surface in the central area of the adhesive apparatus. In the genus Thurstonia, an uncialiated kidney shape surface bordered subsequently by two mobile lips deprived of skeletal fibers was observed. This morphological diversity within Hysterocinetidae requires a new approach of the systematic in this group. In some Astomes (Almophrya bivacuolata and A. mediovacuolata), the analysis of the morphological variations of the nuclear apparatus allowed us to highlight important digitations and the presence of dark bands in the H macro-nucleus structure of the small cellular types, as well as the presence of intermediate forms between H and X macronucleus in these two species. In Almophrya laterovacuolata, the disposition of the vacuolar apparatus is variable: either two longitudinal lines are arranged among branches of the H macronucleus, or two longitudinal lines are out of the H macronucleus branches. These longitudinal lines may also be arranged without obvious order among the H macronucleus branches. Given that the identification within the genus Almophrya is specifically based on the number and the arrangement of vacuoles, a revision of these criteria is required. Four new species belonging to genera Anoplophrya, Hoplitophrya and Dicontophrya were also described in Astomes.In addition to the description of two new genera in Hysterocinetidae, four species in Heterotrichs, and seven species in Astomes, the technique of the cytometry in flow enabled us to highlight an unsuspected population of viruses in the digestive tract of the Glossoscolecidae as well as a population of bacteria not less important.The technique of aspiration under a vacuum pump allowed us to isolate and collect the intestinal liquid in three portions of the digestive tract of Alma emini. The correlations carried out between physico-chemical parameters and ciliates biomass held our attention. These results suggest that each portion of the digestive tract of Alma emini is a set of biotope niches, and microhabitats in which a large number of physical and chemical factors create ecological niches more suitable to a species or a group of species. This might explain the striation and the variation of abundance of the microfauna along the digestive tract of oligochaetes annelids., L’étude porte sur les analyses morphologiques des Protozoaires Ciliés et sur la variation d’abondance de virus et de bactéries du tube digestif d’annélides oligochètes de la famille des Glossoscolecidae récoltés dans la région du Centre Cameroun. De plus, les paramètres physico-chimiques susceptibles d’influencer la sériation de ces microorganismes le long du tube digestif de leurs hôtes ont été analysés. L’étude morphologique est basée sur les techniques d’imprégnation des spécimens au carbonate d’argent ammoniacal pyridiné et à la coloration au Di Aminido Phenyl Indol. Les prospections effectuées ont permis la description de vingt espèces de Ciliés appartenant aux Hétérotriches, Hysterocinetidés et Astomes. Chez les Hétérotriches dont la présence jusqu'ici était insoupçonnée chez les Glossoscolecidae, trois espèces du genre Nyctotherus ont été décrites ; caractérisées par la présence d’un système sécant apical sur leur face droite. Une espèce du genre Nyctotheroïdes a été décrite. Elle est caractérisée par l’existence de trois systèmes sécants dont un apical sur la face droite et deux (apical et caudal) sur la face gauche. Chez les Hysterocinetidés, la description de neuf espèces nouvelles démontre l’existence, au niveau de l’appareil adhésif de quatre types différents de topographies d’armature squelettique. Le premier, qui présente quatre strates de fibres squelettiques superposées et antagonistes, correspond à celui du genre Ptychostomum. Le second est caractérisé par l’existence d’un champ inorganisé de structures fibrillaires formant une masse dense et indivise dans la partie centrale de la ventouse, pour lequel un nouveau genre est créé : le genre Ptychostomoïdes. Le troisième type se distingue du précèdent par l’existence d’une aire glabre dans la région centrale de l’appareil adhésif. En fin le quatrième type, caractéristique du genre Thurstonia présente une aire non ciliée réniforme bordée postérieurement par deux lèvres mobiles et dépourvue de fibres squelettiques. Cette diversification morphologique au sein des Hysterocinetidés semble devoir imposer une nouvelle approche de la systématique de ce groupe. Les Ciliés Astomes Almophrya bivacuolata et A. mediovacuolata sont caractérisés par un macronoyau soit en X, en H, soit intermédiaire entre X et H. L’étude des variations morphologiques de l’appareil nucléaire chez ces espèces d’Almophrya révèle d’importantes digitations, des bandes sombres et d’interbandes dans la structure du macronoyau en H des petits types cellulaires. Chez A. laterovacuolata, la disposition de l’appareil vacuolaire est très variable : deux rangées longitudinales entre les branches du macronoyau en H; deux rangées longitudinales hors des branches de celui-ci ; sans ordre évident entre ses branches. Une révision des critères d’identification des Ciliés Almophrya semble devoir s’imposer. Quatre espèces nouvelles appartenant aux genres Anoplophrya, Hoplitophrya et Dicontophrya ont également été décrites chez les Astomes. Par ailleurs, la technique de la cytométrie en flux nous a permis de mettre en évidence une population jusqu’alors insoupçonnée de virus dans le tractus digestif des vers Glossoscolecidae ainsi qu’une population non moins importante de bactéries. La technique d’aspiration sous une pompe à vide a permis d’isoler et de recueillir le liquide intestinal du tube digestif de Alma emini. Les corrélations effectuées entre les paramètres physico-chimiques et les variations d’abondances des Ciliés ont été significatives. Ces résultats laissent supposer que chaque portion du tractus digestif de Alma emini est un ensemble de biotopes, de microhabitats dans lesquels un grand nombre de facteurs physiques et chimiques créent des niches écologiques plus favorables à une espèce ou à un groupe d’espèces. Ceci expliquerait la sériation et la variation d’abondance de la microfaune le long du tube digestif des annélides oligochètes.

Même si des travaux récents ont permis de caractériser certains aquifères du sud du Québec, plusieurs demeurent encore très peu connus. Cette recherche a pour objectifs de comprendre la dynamique de l’écoulement souterrain et la vulnérabilité de l’aquifère du bassin de la rivière Noire (Montérégie, Québec), un bassin représentatif des aquifères de milieux fracturés situés en bordure des Basses-Terres du Saint-Laurent. Dans ce travail, un modèle de bilan hydrique en zone non saturée a permis de quantifier la distribution spatio-temporelle de l’infiltration sur le bassin. L’infiltration simulée moyenne est importante (215 mm•an‑1) et a lieu surtout au moment de la fonte printanière (74 %). L’infiltration la plus élevée se produit dans la partie amont du bassin, mais les résultats du modèle ne permettent pas d’évaluer quelle proportion de la recharge atteint effectivement l’aquifère régional profond. Sur l’ensemble du bassin, les concentrations en nitrate dans l’eau souterraine sont majoritairement en deçà de la norme pour l’eau potable (10 mg N-NO3•L‑1). Néanmoins, 18 % des puits analysés ont des concentrations supérieures à 1,5 mg N-NO3•L‑1, seuil considéré comme la teneur de fond en nitrate. Les indicateurs géochimiques (pH, conductivité électrique, ions majeurs et rapports des isotopes stables de l’eau) montrent que la topographie et la géologie jouent un rôle important dans la dynamique de l’écoulement souterrain. Soixante-quinze pourcents du territoire étudié ont une vulnérabilité intrinsèque élevée, mais la sensibilité des forages à la contamination varie selon leur position le long de l’écoulement souterrain. La recharge réelle de l’aquifère régional se fait principalement dans la partie inférieure du bassin versant et est probablement plus faible que l’infiltration simulée. La vulnérabilité de l’aquifère à la contamination dans cette zone est limitée en raison de la dilution des contaminants dans un volume important d’eau souterraine non contaminée, alimenté par des écoulements souterrains intermédiaires et profonds. La contamination de l’aquifère à l’aval du bassin pourrait cependant augmenter au cours des prochaines décennies à mesure que l’aquifère tendra vers un régime permanent d’apports en contaminants d’origine agricole., Although recent studies have characterized a number of aquifers in southern Quebec, hydrogeological data are still almost nonexistent for many aquifers. The objectives of this study are to understand the groundwater flow dynamics and vulnerability of the Noire River basin aquifer (Montérégie, Québec) which is representative of the fractured bedrock aquifers located at the fringe of the St. Lawrence Lowlands. In this study, an unsaturated zone water budget model was used to quantify the spatio-temporal variability of infiltration over the study area. The average simulated infiltration is high (215 mm•yr‑1) and occurs mostly during spring snowmelt (74%). Although the largest infiltration occurs in the upper part of the basin, the model does not provide the proportion of recharge that effectively reaches the deep regional aquifer. Throughout the basin, nitrate concentrations are generally below the guideline for drinking water (10 mg N-NO3•L‑1). Nevertheless, 18% of the sampled wells have concentrations higher than 1.5 mg N‑NO3•L‑1, a level considered to be the threshold of background concentrations. Geochemical indicators (water pH, electric conductivity, major ion concentration and stable isotope composition) indicate that topography and geology play a significant role in groundwater dynamics. Seventy-five percent of the study area has a high intrinsic vulnerability, but well sensibility to contamination varies according to the position along the groundwater flow path. In the up-gradient part of the watershed, surface wells are more vulnerable because they intercept superficial groundwater flow. Aquifer recharge occurs mostly in the lower part of the watershed and is probably less than the simulated infiltration. Vulnerability in this area is low because contaminants are diluted into a large reservoir of uncontaminated groundwater fed by intermediate and deep groundwater flows. Groundwater pollution could increase in this zone over the coming decades as the aquifer reaches a steady state of agricultural contaminant input.

Ce travail concerne l'étude de la qualité physico-chimique de la masse d'eau du réservoir Daourat au Maroc ; situé sur le cours inférieur du bassin Oum Rbia. Une vidange du réservoir a lieu le 23 décembre 2001, l'impact de cette vidange sur la qualité physico-chimique de l'eau a été déduit à travers l'augmentation du débit à l'entrée et à la sortie du réservoir en décembre ; l'élévation du taux de la matière en suspension ; des concentrations en éléments nutritifs et de la chlorophylle " a ". Cette étude inclue également une analyse de régression qui a permis de déterminer une relation entre le phosphore et la chlorophylle " a " ; ainsi qu'une évaluation du niveau d'eutrophisation du réservoir Daourat.Les résultats fournis par les paramètres physico-chimiques ont révélé que la masse d'eau ne présente aucune stratification thermique ni anoxie et que le pH est alcalin. L'évolution des concentrations en éléments nutritifs dans la masse d'eau du réservoir dépend des apports exogènes et endogènes. Les apports exogènes sont dominés par les apports latéraux venant du bassin versant local peu boisé et caractérisé par un sol à vocation agricole responsable de l'enrichissement du milieu récepteur en éléments azotés. Les apports endogènes sont gouvernés par les interactions eau - sédiment suite à la minéralisation de la matière organique en période estivale et par le relargage d'éléments à partir du sédiment suite à la vidange et à la crue en période hivernale. L'impact de la vidange sur l'écosystème étudié a été déduit à partir des modifications des paramètres abiotiques et biotique enregistrés en décembre (période de vidange) dans le milieu du réservoir (S2) et son aval (S3). L'étude de la relation entre les orthophosphates et la chlorophylle " a " dégage une forte corrélation significative. Les données du phosphore et de la chlorophylle " a " classe le réservoir Daourat dans l'état hypereutrophe, The Oum Rbia River is the longest river in Morocco with a total length of about 550 km. Studies conducted on this river have shown that agricultural activity is the main factor affecting the water quality. The current study focused on Daourat Reservoir, a part of the Oum Rbia River.The aim of this study was to investigate the water quality of the Daourat reservoir (physico-chemical parameters, nutrients and chlorophyll a) in order to estimate its eutrophication status. The influence of draining reservoir on water quality was also analysed. This survey also included a regression analysis that permitted the determination of the relationship between phosphorus and chlorophyll a, as well as an assessment of the level of eutrophication of the Daourat reservoir.A monthly survey was conducted to monitor changes in the hydrological cycle as well as possible seasonal variations during the period from 2001-2002. Water parameters (T°, pH, dissolved oxygen, suspended solids), nutrients (NH4+, NO3-, P-PO4, Tot-P) and chlorophyll a were determined according to standard French protocols (AFNOR, 1994). Annual nutrient inputs and outputs were calculated from the monthly discharge from the river and the monthly mean nutrient concentrations. The annual nutrient output was calculated similarly.The physico-chemical parameters and nutrient concentrations varied temporally in the Daourat Reservoir. The highest concentrations of nutrients were observed during summer and winter, with the lowest concentrations occurring in the spring. This evolution seemed to be influenced by the nature of the loads. Nutrient loading from the upstream regions of the reservoir was minimal compared to the contributions from the local catchment area and from internal loading from the sediments. Significant nutrient loading to the reservoir came from sediment resuspension on December 23, 2001 and by internal loading from sediments during the summer. The upstream reservoirs (Al Massira and Imfout) had minimal influence and were in fact responsible for the reduced fluvial contributions to the Daourat Reservoir. The increase in nutrient loads in the reservoir was responsible for high phytoplankton biomass, indicated by the high chlorophyll a values (mean 35 µg/L). The trophic state of the Daourat Reservoir was classified as hypereutrophic. Due to the large intra-annual variability of water quality, a properly designed monitoring program of reservoir water is recommended.