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Le virus herpès simplex de type 1 affecte la population mondiale en entraînant des lésions bénignes comme les feux sauvages, mais aussi des complications sévères telles que la cécité. Les traitements actuels ne permettent toutefois pas d’éradiquer ce virus, car ce dernier a notamment un rapide et complexe cycle de vie. Les acteurs moléculaires impliqués dans les différentes étapes du cycle viral sont encore peu connus, mais le laboratoire a précédemment démontré l’implication de la protéine kinase D de l’hôte et du diacylglycérol, sa principale molécule d’ancrage, dans la sortie du virus du réseau trans-Golgien vers la membrane plasmique. Ce projet de maîtrise va plus loin en étudiant le rôle des différents modulateurs de la protéine kinase D dans la propagation virale. Suite à des expériences d’ARN d’interférence, de surexpression et l’utilisation de drogue, les résultats démontrent que, contrairement à la protéine kinase D, plusieurs de ses modulateurs comme CERT, GGA1 et Nir2 régulent négativement la relâche extracellulaire du virus. Ces effets seraient d’ailleurs indépendants des niveaux intracellulaires totaux de diacylglycérol. La microscopie électronique suggère enfin que la protéine kinase D et Nir2 ne jouent pas seulement un rôle au niveau du réseau trans-Golgien, mais affectent également d’autres étapes de la propagation virale comme la sortie nucléaire. Au final, ces résultats contribuent à une meilleure compréhension du transport du virus herpès simplex de type 1 et de ses interactions avec la cellule hôte. Ces nouvelles données pourraient éventuellement mener au développement de nouveaux traitements, puisqu’elles peuvent s’appliquer à d’autres virus ou aux larges cargos cellulaires., Herpes simplex virus type 1 affects the world's population by causing benign lesions such as cold sores, but also severe complications such as blindness. However, current treatments do not eradicate this virus, because the latter has a fast and complex life cycle. The molecular actors involved in the various stages of the viral cycle are still little known, but the laboratory has previously demonstrated the involvement of the host protein kinase D and diacylglycerol, its main anchoring molecule, in the release of the virus from the trans-Golgi network to the plasma membrane. This project goes further by studying the role of different modulators of protein kinase D in viral propagation. Following RNA interference, overexpression and drug experiments, the results demonstrate that, unlike protein kinase D, several of its modulators such as CERT, GGA1 and Nir2 negatively regulate the extracellular release of the virus. These effects are, moreover, independent of the total intracellular levels of diacylglycerol. Finally, electron microscopy suggests that protein kinase D and Nir2 do not only play a role in the trans-Golgi network, but also affect other steps of viral propagation such as nuclear release. These results contribute to a better understanding of the transport of herpes simplex virus type 1 and its interactions with the host cell. These new data could eventually lead to the development of new treatments, since they can be applied to other viruses or large cellular cargos.

Une méthode de calcul Ab-Initio a été utilisée pour étudier les propriétés structurales et électroniques de chalcogénures de béryllium BeS, BeSe et BeTe, en utilisant la méthode des ondes planes augmentées linéarisées potentiel (FP-LAPW). L'énergie de d'échange-corrélation est décrite dans l'approximation du gradient généralisé (GGA) en utilisant le paramétrage de Perdew, Burke et Ernzerhof (PBE). D'après les résultats des propriétés électroniques, nous constatons que ces matériaux ont des bandes interdites indirectes. Les paramètres structuraux dans la phase blende de zinc (B3) sont déterminés. Une cohérence a été montrée entre nos résultats et ceux d'autres calculs théoriques et d’autres données expérimentales.

Ab-initio molecular dynamics simulations are used to study GeS2 and (M2S)0.33(GeS2)0.66 M=Na,Ag chalcogenide glasses. A new theoretical method which uses ring statistics is proposed in order to analyse the connectivity of amorphous materials. The cooling rate effect on the physical properties of the GeS2 glasses is analysed. The medium and short range order analysis reveals the existence of a maximum cooling rate above which the structure of the material is too similar to the one of the liquid. This is confirmed by the ring statistics analysis which also highlights major differences between the connectivity of the liquid and the glassy GeS2 structures. Finally the existence of extended charged regions in the glassy GeS2 matrix is confirmed even for the lowest cooling rates. The conditions needed to observe the diffusion of the sodium atoms in the glassy (Na2S)0.33(GeS2)0.66 matrix are studied. When the diffusion process occurs the displacement of the sodium atoms seems to become cooperative. Parametrisation attempts are done in order to model (Ag2S)0.33(GeS2)0.66 and GeS2 chalcogenide glasses using the SIESTA code.; La dynamique moléculaire ab-initio est utilisée pour étudier les verres de chalcogénures GeS2 et GeS2 dopés de formule (M2S)0.33(GeS2)0.66 M=Na,Ag. Une nouvelle méthode théorique d'analyse de la connectivité des matériaux amorphes est proposée en utilisant les recherches d'anneaux. L'effet de la vitesse de trempe sur les propriétés physiques des verres GeS2 est analysé. L'analyse de l'ordre à moyenne et courte portée révèle l'existence d'une vitesse de trempe maximale au dessus de laquelle la structure du matériau est trop proche de celle du liquide. Ceci est confirmé par les résultats des recherches d'anneaux qui permettent également de mettre en avant des différences fondamentales entre les connectivités des phases liquides et vitreuses du GeS2. Enfin la présence de zones chargées est confirmée dans les matrices vitreuses de GeS2, même aux plus basses vitesses de trempe. Les conditions nécessaires à la diffusion des atomes de sodium dans les matrices vitreuses (Na2S)0.33(GeS2)0.66 sont étudiées. Lorsque la diffusion apparaît le déplacement des atomes de sodium semble devenir coopératif. Des essais de paramétrisation sont réalisés pour tenter de modéliser les verres de chalcogénures (Ag2S)0.33(GeS2)0.66 et GeS2 à l'aide du code SIESTA.