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The burkholderia group is composed of multiple bacterial genera (including Burkholderia and Paraburkholderia). Some species indulge in diverse interactions with eukaryotic hosts that range from pathogenicity to symbiosis. Many burkholderia species dwell in association with rice, making this host and ideal model for burkholderia/plant interactions. The taxonomy of burkholderia delineates a frontier between the Burkholderia genus, grouping the majority of pathogenic species, and the Paraburkholderia genus, mainly phytobeneficial and environmental species. This thesis project strived to characterize the genetic frontiers between species of both genera that share the capacity to interact with rice. First, we explored the taxonomic diversity for 124 rice-isolates using dedicated markers (16S and recA), and went into a more detailed analysis for a subset of 12 supposedly different species suing whole genome sequencing. We developed the intraspecific diversity of B. cenocepacia strains which we had found to be rice associated This was unexpected for this human pathogen and led us to describe a new species, with improved plant interaction abilities (which we propose to name B. servocepacia). We then explored the genetic bases regulating plant-adaptation of Burkholderia and Paraburkholderia species using two complementary approaches. We first undertook a transcriptomic profiling of the reaction to root exudates for six rice-isolates belonging to either genus. We thus demonstrated a strain specific response of the early plant-sensing, independent of the strain’s taxonomic attribution. We also listed the principal functions involved in exudate sensing. Our second approach focused on the rice endophyte models B. vietnamiensis LMG10929 (Bv) and P. kururiensis M130 (Pk) for which we undertook a high-throughput genetic screening of insertion mutant libraries (Tn-seq), during the root surface colonization step of two rice cultivars belonging to Oryza sativa ssp. japonica and Oryza sativa ssp. indica. We noticed a strong disparity in the adaptation for rice colonization between Bv and Pk as the display genetic requisites that differ in nature and number. Furthermore, we demonstrated a host-dependent adaptation for root colonization from both strains. Finally, we investigated on the distribution of type III secretion systems (T3SS) within burkholderia. We describe two novel T3SS types and in one instance, demonstrate its role in plant colonization for Bv. The thesis is concluded by a general discussion, summarizing the results of this project and situating them in the context of adaptative frontiers for plant interactions between Burkholderia and Paraburkholderia.; Les burkholderias appartiennent à plusieurs genres bactériens (dont Burkholderia et Paraburkholderia). Certaines espèces interagissent avec de multiple hôtes eucaryotes avec lesquels elles développent une gamme d’interaction allant de la symbiose à la pathogénie. Une grande diversité d’espèces de burkholderias interagisse avec le riz, faisant de cette plante un modèle idéal pour l’étude des interactions burkholderias/plantes. Une frontière taxonomique semble se dessiner entre le genre Burkholderia, qui regroupe la majorité des espèces pathogènes, et le genre Paraburkholderia qui concentre des espèces phytobénéfiques et environnementales. Ce travail de thèse a porté sur l’étude des frontières génétiques chez des espèces de ces deux genres interagissant avec le riz. Nous avons d’abord exploré la diversité taxonomique de 124 souches isolées du riz par l’étude de marqueurs taxonomiques (16S et recA) et, pour un sous ensemble de 12 espèces potentiellement différentes, d’analyse de leurs génomes (ANI). Nous avons progressé dans la description de la diversité intraspécifique chez l’espèce Burkholderia cenocepacia dont nous possédions des isolats de racines de riz, fait étonnant pour ce pathogène humain, et qui nous a conduit à décrire une nouvelle espèce mieux adaptée à l’environnement végétale (que nous proposons de nommer B. servocepacia). Nous avons ensuite exploré les bases génétiques de l’adaptation à l’environnement plantes chez Burkholderia et Paraburkholderia par deux approches. La première portait sur les étapes précoces d’interaction avec la plante, en étudiant la réponse transcriptomique de six espèces, tirées des deux genres, stimulées aux exsudats racinaires de riz, qui nous a permis de montrer une réponse souche-spécifique indépendante de leur appartenance taxonomique, et de lister des catalogues de fonctions impliqués dans la perception des exsudats. La seconde approche a porté sur deux souches modèles endophytes du riz, Paraburkholderia kururiensis M130 (Pk) et Burkholderia vietnamiensis LMG10929 (Bv), pour lesquelles nous avons réalisé un crible génétique haut-débit de banques de mutants par Tn-Seq, visant à trouver les déterminants génétiques leur permettant de coloniser les racines des deux sous-espèces de riz, Oryza sativa ssp. japonica et Oryza sativa ssp. indica. Nous observons une forte disparité dans l’adaptation des deux souches à la colonisation racinaire puisque Bv et Pk requiert des gènes différents par leur nombre et leur nature. Par ailleurs, l’effet génotype de l’hôte induit une adaptation de la part des deux colonisateurs. En dernière partie, nous avons étudié la distribution des systèmes de sécrétion de type 3 (T3SS) chez les burkholderias. Nous décrivons deux nouveaux types de T3SS et démontrons que l’un d’eux est impliqué chez Bv dans la colonisation racinaire. Nous discutons finalement de l’ensemble des résultats de cette thèse dans le contexte de l’étude des frontières adaptatives à l’environnement plante chez les Burkholderia et Paraburkholderia.

Quelles connaissances la littérature scientifique apporte-t-elle sur la question de l’acceptance des parcs ? Quelles recommandations pour la pratique donne-t-elle et comment la recherche peut-elle contribuer à une meilleure compréhension de l’acceptance des parcs ? Ces questions ont été abordées dans le cadre d’une étude de synthèse dont il ressort qu’il est crucial pour l’acceptance des parcs de communiquer de manière spécifique avec les différents groupes cibles en faisant appel à des personnes implantées au niveau local. Objectifs, planification et possibilités participatives doivent être expliqués de manière transparente. Il faut développer une vision commune à laquelle la population locale puisse s’identifier. Cette vision doit être intégrée dans les objectifs du parc et mise en œuvre par le biais de projets., Michel AH, Wallner A (2020) Comment gagner l'adhésion des populations locales à un parc ? Swiss Academies Factsheet 15 (5).

International audience; Un tunnel est une portion d'un chemin où un protocole de communication est encapsulé dans un autre. Les tunnels sont de plus en plus présents dans les réseaux. Ils sont utilisés pour la sécurité, l'interopérabilité, les réseaux virtuels, etc. Un chemin contenant un tunnel doit être faisable, c'est-à-dire qu'il doit respecter l'ordre des encapsulations et des désencapsulations, parfois imbriquées. Les algorithmes de calcul de chemins avec prise en compte de tunnels ne sont pas les mêmes que dans un réseau classique. Afin de tester ces algorithmes, il serait utile de disposer d'un générateur de topologies aléatoires avec tunnels. Ce générateur devra produire des topologies ayant certaines caractéristiques (par exemple, que la probabilité qu'un chemin soit faisable soit un paramètre p quelconque).Il se trouve que ce problème est lié aux chemins de Dyck et de Motzkin en combinatoire. En effet, une encapsulation peut être vue comme un pas montant et une désencapsulation peut être vue comme un pas descendant. La question qui se pose est donc de savoir quelle est la probabilité qu'un chemin de Dyck ou de Motzkin ait certaines propriétés. Dans ce travail, en utilisant des outils de combinatoire analytique, nous donnons la probabilité qu'un chemin soit faisable en fonction de la distribution des encapsulations et des désencapsulations sur les sommets.

Die vorliegende Masterarbeit befasst sich mit der vergleichenden linguistischen Analyse des Romans und des Films „Ensemble, c’est tout“. Es geht dabei um die Art der Präsentation des Inhalts, sowie um die Realisierung der verwendeten Sprache. Der Roman der Autorin Anna Gavalda erschien 2005, zwei Jahre später, 2007, wurde er von Claude Berri verfilmt.

In this paper, we compare peer interactions in two collaborative contexts (synchronous textual communication and face-to-face communication) involving either 14-year-old students or students, who had to build a concept map with an educational software (ModellingSpace). The first study involved 22 pairs of students ; half of them communicated face-to-face and the other group used computer-supported communication. The distant communication condition has been experimented in the second study, with 16 pairs of secondary school students. The structure and content of verbal interactions were the focus of analysis. Results show that the mode of communication has an impact on the structure of the interactions, but not on the content and on the quality of the concept maps. The adults and teenagers’ exchanges present the same structure but differ in their content. These results are discussed in relation with the issue of the assessment of educational software., Cette recherche compare les échanges entre pairs dans différentes situations de collaboration (en face à face ou à distance) impliquant des collégiens, ou des étudiants confrontés à une tâche de construction d’une carte conceptuelle à l’aide du logiciel ModellingSpace. La première étude a impliqué 11 dyades d’étudiants ; la moitié des dyades communique en face à face, et l’autre moitié à distance. Dans la seconde étude, la modalité de communication à distance a été répliquée auprès d’élèves d’une classe de 4 e (âgés de 14 ans en moyenne), 8 dyades au total. Les analyses concernent la structure et le contenu des échanges. Il s’avère que, chez les étudiants, le mode de communication a un impact sur les échanges enregistrés du point de vue de la structure des échanges, mais pas de leur contenu, sans incidence sur la qualité des productions. Les échanges des adultes et des adolescents communiquant à distance présentent le même type de structure mais les contenus des échanges sont différents. Ces résultats font l’objet d’une discussion en relation avec des préoccupations liées à l’évaluation des logiciels éducatifs., Lainé Aurélie, Ortiz Wallner Alexandra, Weil-Barais Annick. Évaluation d’un logiciel éducatif dans deux contextes de communication : face à face et synchrone à distance. In: Sciences et Technologies de l'Information et de la Communication pour l'Éducation et la Formation, volume 13, 2006. Forum de Discussion en Education. pp. 97-128.

https://www.ester.ee/record=b4264958*est

Wallner Anton. Sur le poème latin des Misères de la vie humaine. In: Romania, tome 31 n°124, 1902. p. 595.

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