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Le Centre de Recherche Philologique de l’Université de Lille III publie ici, dans un premier cahier, quelques etudes consacrées a l’histoire de l’epicurisme, qui est l’objet d’une de ses activités principales. Les travaux de ses membres ont en commun d’insister sur l’examen approfondi de la lettre du texte, où nous voyons la condition d’un renouvellement de la compréhension. La critique de la tradition interprétative fait partie de ce reexamen, dont le lieu privilégié se trouve dans des textes, qui, se situant eux-mêmes dans une continuité remarquable, comme le poeme de Lucrèce et le mur d ’Oenoanda, imposent une réflexion sur les modes de l’actualisation dans le cadre d’une orthodoxie essentielle. Nous sommes heureux de publier en meme temps les travaux d’hotes du Centre, et en particulier les demieres découvertes de Martin F. Smith a Oenoanda, qui manquent une nouvelle etape de la connaissance de l’inscription de Diogene. David Sedley, qui a présenté a Lille, dans une sérié de séminaires, les problèmes poses par l ’interpretation des papyrus du Péri Phuseôs d’Épicure, reprend ici l’analyse de quelques parties de la Vie de Diogene Laerce, complétant heureusement le commentaire de ce texte par André Laks. P.H. Schrijvers explique, a propos d’un chapitre de la physiologie, de quelle manière doit être reprise, selon lui. la question des « sources » de Lucrèce, considérées comme le materiel d’une culture scientifique globale. Diskin Oay, qui entretient avec le Centre des relations suivies et déjà anciennes, communique, sur ce sujet, les éléments d’une réflexion de portée générale.

Le rythme impressionnant auquel les technologies de séquençage progressent est alimenté par leur promesse de révolutionner les soins de santé et la recherche biomédicale. Le séquençage par nanopores est devenu une technologie attrayante pour résoudre des lacunes des technologies précédentes, mais aussi pour élargir nos connaissances sur le transcriptome en générant des lectures longues qui simplifient l’assemblage et la détection de grandes variations structurelles. Au cours du processus de séquençage, les nanopores mesurent les signaux de courant électrique représentant les bases (A, C, G, T) qui se déplacent à travers chaque nanopore. Tous les nanopores produisent simultanément des signaux qui peuvent être analysés en temps réel et traduits en bases par le processus d’appel de bases. Malgré la réduction du coût de séquençage et la portabilité des séquenceurs, le taux d’erreur de l’appel de base entrave leur mise en oeuvre dans la recherche biomédicale. Le but de ce mémoire est de classifier des séquences d’ARNm individuelles en différents groupes d’isoformes via l’élucidation de motifs communs dans leur signal brut. Nous proposons d’utiliser l’algorithme de déformation temporelle dynamique (DTW) pour l’alignement de séquences combiné à la technologie nanopore afin de contourner directement le processus d’appel de base. Nous avons exploré de nouvelles stratégies pour démontrer l’impact de différents segments du signal sur la classification des signaux. Nous avons effectué des analyses comparatives pour suggérer des paramètres qui augmentent la performance de classification et orientent les analyses futures sur les données brutes du séquençage par nanopores., The impressive rate at which sequencing technologies are progressing is fueled by their promise to revolutionize healthcare and biomedical research. Nanopore sequencing has become an attractive technology to address shortcomings of previous technologies, but also to expand our knowledge of the transcriptome by generating long reads that simplify assembly and detection of large structural variations. During the sequencing process, the nanopores measure electrical current signals representing the bases (A, C, G, T) moving through each nanopore. All nanopores simultaneously produce signals that can be analyzed in real time and translated into bases by the base calling process. Despite the reduction in sequencing cost and the portability of sequencers, the base call error rate hampers their implementation in biomedical research. The aim of this project is to classify individual mRNA sequences into different groups of isoforms through the elucidation of common motifs in their raw signal. We propose to use the dynamic time warping (DTW) algorithm for sequence alignment combined with nanopore technology to directly bypass the basic calling process. We explored new strategies to demonstrate the impact of different signal segments on signal classification. We performed comparative analyzes to suggest parameters that increase classification performance and guide future analyzes on raw nanopore sequencing data.