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Des modifications dans le gène codant pour la sous-unité II du cytochrome c oxydase du génome mâle (Mcox2) ont été recensées chez des espèces de bivalves présentant un mode unique de transmission mitochondriale nommé double transmission uniparentale (DUI). Dans la DUI, les mitochondries paternelles (et leur ADNmt mâle) ainsi que les mitochondries maternelles (et leur ADNmt femelle) sont transmises aux descendants mâles. Scrobicularia plana, une espèce de bivalves présentant ce modèle d'hérédité, possède une insertion importante d'environ 4,8 kb dans son gène Mcox2 qui ne change pas le cadre de lecture et qui est traduite en un polypeptide de 1 892 acides aminés, ce qui en fait la plus grande protéine COX2 connue à ce jour chez les métazoaires. L’objectif de cette étude était de caractériser l'évolution et la fonction potentielle de l'insertion dans Mcox2 chez S. plana par RT-PCR, tests immunologiques et analyses bio-informatiques. L'insertion est présente parmi les individus de différentes populations, contient des variations dans la longueur de sa séquence, est riche en zones de désordre intrinsèque et évolue sous sélection purificatrice. La longue insertion pourrait modifier la structure 3D du complexe IV de la chaîne de transport d'électrons (CTE), affectant sa fonction dans la phosphorylation oxydative (OXPHOS) ce qui pourrait expliquer les faibles taux d'OXPHOS observés dans les mitochondries mâles des bivalves à DUI. L'insertion pourrait également modifier le métabolisme mitochondrial mâle en interagissant avec d'autres complexes de la CTE et avec l'ATP synthase. Comme pour les autres modifications de Mcox2 chez les bivalves à DUI, un rôle potentiel dans la détermination du sexe peut être prédit pour MCOX2 chez S. plana., Modifications in the cytochrome c oxidase subunit II gene of male-transmitted genome (Mcox2) have been found in some bivalve species that exhibit a unique mode of mitochondrial transmission named doubly uniparental inheritance (DUI). In DUI, paternal mitochondria (and their male mtDNA) as well as maternal mitochondria (and their female mtDNA) are transmitted to male offspring. Scrobicularia plana, a bivalve specie exhibiting this inheritance model possesses an important in-frame insertion of approximately 4,8 kb in its Mcox2 gene that is translated into a polypeptide of 1 892 amino acids making it the largest metazoan COX2 protein known to date. The aim of this study was to characterize the evolution and possible function of the Mcox2 insertion in S. plana through RT-PCRs, immunoassays, and bioinformatic analysis. The insertion is present amongst individuals from different populations, contains some variations in its sequence length, is rich in intrinsically disordered regions and evolves under purifying selection. The long insertion could modify the 3D structure of complex IV in the electron transport chain (ETC), impacting its function in oxidative phosphorylation (OXPHOS) which could explain low OXPHOS rates that were found in male mitochondria of DUI bivalves. The insertion could also alter male mitochondrial metabolism by interacting with other complexes of the ETC and with ATP synthase. As for other modifications of Mcox2 in DUI bivalves, a role in sex determination can also be predicted for MCOX2 in S.plana.

National audience

Sex determination in the Nile tilapia depends on genetic factors following an XX/XY pattern and can be influenced by temperature as well as minor parental factors. Associations with sex have been identified previously on several linkage groups (LG) and especially LG1 and LG23 depending on the strain studied. These studies have been performed only on domesticated (laboratory or commercial) strains which have undergone considerable stock transfers, inbreeding and genetic bottlenecks. It is unclear to what extent the complexity of the genetic sex determination is due to the processes of domestication or if it reflects a diversity of sex determination systems encountered in natural populations. To study whether wild populations followed a male heterogametic XY system as detected in domesticated strains, and find what LGs were segregating for the phenotypic sex we studied three different wild populations: two from East Africa (Ethiopia) and one from West Africa (Ghana). A broad range of genomic studies have been conducted through ddRAD sequencing, Whole Genome sequencing and RNA sequencing using both short and long reads technologies. Our results confirmed a male heterogametic sex determination system on LG23-Y with a sex region composed of a tandem duplication which involved two copies of the Anti-Müllerian Hormone gene (amh) for two of the wild populations. We were able to define precisely the sex-region and describe the gene content and order, along with the boundaries of the duplication. Our studies also suggested that this system is ancestral to the divergence of Eastern and Western populations. However, we produced evidence for the loss of this ancestral sex-system in one of the Ethiopian population, suggesting polymorphism of sex determination system in wild populations, similarly to what occurs in domesticated strains. Transcriptome analysis of this Ethiopian population gave clues for the early involvement of the gsdf gene in sex-differentiation. No evidence for a new pair of sex chromosomes were found for this population lacking the LG23-Y amh duplication, leaving open the question of the identity or even the existence of a new genetic sex determinant that would assume this role. This thesis work highlights the potential for different sex-determination system segregating in wild populations of Nile tilapia and more generally emphasizes the need to look for the diversity of sex-system at intra-specific level as it might be as important as at the interspecific scale.; Le déterminisme du sexe chez le tilapia du Nil dépend de facteurs génétiques de type XX/XY et peut être influencé par la température ainsi que par des facteurs parentaux mineurs. Des associations avec le sexe ont été identifiées précédemment sur plusieurs groupes de liaison (LG) et notamment LG1 et LG23 selon la souche étudiée. Les travaux précédents n'ont été réalisés que sur des souches domestiquées (de laboratoire ou commerciales) potentiellement fortement consanguines qui ont fait l'objet de nombreux transferts et de goulots d'étranglement génétiques. Ainsi, il est difficile de savoir si la complexité du déterminisme du sexe génétique est due aux processus de domestication ou si elle reflète la diversité rencontrée dans les populations naturelles. Afin d'étudier si les populations sauvages suivent un système XY hétérogamétique mâle tel que détecté dans les souches domestiquées, et de trouver quels LGs sont impliqués dans le sexe phénotypique, nous avons étudié trois populations sauvages : deux d'Afrique de l'Est (Ethiopie) et une d'Afrique de l'Ouest (Ghana). Différentes analyses génomiques ont été menées au moyen de séquençages de type ddRAD, de séquençages de génomes complets et de séquençage d'ARN en utilisant des technologies de lectures courtes et/ou longues. Nos résultats ont confirmé l’existence du système hétérogamétique mâle sur LG23-Y avec une région spécifique du sexe correspondant à une duplication en tandem qui comporte deux copies du gène de l'Hormone Anti-Müllerienne (amh) pour deux des populations sauvages. Nous avons pu définir précisément cette région spécifique du sexe et décrire le contenu et l'ordre des gènes ainsi que les limites de cette duplication. Nos études ont également suggéré que ce système est ancestral à la divergence des populations de l'Est et de l'Ouest. Cependant, nous présentons des preuves de la perte de ce système sexuel ancestral dans l’une des populations éthiopiennes, suggérant un polymorphisme du déterminisme du sexe non seulement dans les souches domestiquées mais aussi dans les populations sauvages de Tilapia du Nil. L'analyse du transcriptome de cette population éthiopienne a donné des indices quant à l’importance de l’expression de gsdf dans les stades précoces de la différenciation sexuelle. Aucune nouvelle paire de chromosomes sexuels n'a été mise en évidence pour cette population dépourvue de la duplication de l'amh sur LG23-Y, laissant en suspens la question de l'identité ou même de l'existence d'un nouveau déterminant génétique du sexe. Ce travail de thèse met en évidence la possibilité que différents systèmes de déterminisme du sexe ségrègent dans les populations sauvages de tilapia du Nil et, plus généralement, renforce l’idée qu’il est nécessaire de considérer la diversité des déterminismes sexuels au niveau intraspécifique, car celle-ci pourrait être aussi importante qu'à l'échelle interspécifique.

Sex determining (SD) mechanisms in teleost fishes have been investigated mainly at a macro-evolutionary scale highlighting a high turnover of master SD genes and their associated sex chromosomes. Interestingly, in addition to the A chromosomes, supernumerary B chromosomes (Bs) have been detected in a number of species and even associated as sex chromosomes in some of them. As such, my thesis project aimed to investigate SD mechanisms evolution with respect to these Bs in the Mexican tetra, Astyanax mexicanus, in which many blind cave populations (CF) are known to have evolved from a surface ancestral population (SF) less than 20,000 years. Our results provide functional evidences for the existence of an "unusual" SD system relying solely on male-dominant "B-sex" chromosomes with the gdf6b-B gene as a potential MSD gene in the Pachón CF. Furthermore, we also provide results suggesting a rapid evolutionary transition from a fixed male-dominant B-sex chromosome-type system in some populations toward a complex (probably polygenic) SD system relying only partly on the B-sex chromosome and their gdf6b-B loci in other populations.; L’évolution des mécanismes de détermination du sexe (SD), qui a souvent été abordée principalement dans un contexte macro-évolutif chez les poissons, montre une variabilité saisissante des gènes SD et de leurs chromosomes sexuels associés. En plus des chromosomes de type A, certaines espèces de poissons téléostéens contiennent des chromosomes B (Bs), qui sont parfois considérés comme des chromosomes sexuels. À ce titre, mon projet de thèse avait pour objectif d’explorer l’évolution des systèmes SD en lien avec les Bs chez le tétra Mexicain, Astyanax mexicanus, qui comporte de nombreuses populations cavernicoles (CF) ayant évoluées à partir d'une population ancestrale de surface (SF) il y a moins de 20 000 ans. Nos travaux apportent des preuves fonctionnelles de l’existence d’un système de SD “original” reposant uniquement sur des chromosomes “B-sexuels” à dominance mâle avec gdf6b-B comme potentiel gène déterminant majeur du sexe chez les CF de la grotte Pachón. En parallèle, nous apportons des résultats qui suggèrent qu’il pourrait exister une transition évolutive rapide entre un système de type B-sex chromosome à dominance mâle fixe chez certaines populations vers un système plus complexe (probablement polygénique) ne reposant que partiellement sur le chromosome “B-sexuel” et ses loci gdf6b-B chez d’autres populations.

Les systèmes sexuels et les mécanismes responsables de la détermination du sexe chez les animaux sont issus de stratégies diverses. Cette incroyable diversité se reflète notamment chez les bivalves, où autant les facteurs génétiques qu’environnementaux y jouent un rôle, avec des espèces utilisant divers modes de reproduction, tels que le gonochorisme ou l’hermaphroditisme simultané ou séquentiel. La découverte la plus notable est celle d’un système de déterminisme sexuel unique qui impliquerait les mitochondries. Spécifiquement, un système de transmission sexe-spécifique de l’ADN mitochondrial, connu sous le nom de DUI (« Double Uniparental Inheritance » ou double transmission uniparentale), serait lié au maintien du gonochorisme chez certaines espèces de bivalves. La DUI implique un ADN mitochondrial qui est transmis de façon maternelle (ADNmt F) aux femelles et aux mâles, et l’autre transmis de façon paternelle (ADNmt M) aux mâles seulement. Les ADNmt F et M chez les espèces à DUI sont caractérisés par des traits uniques, comme une modification du gène cox2, ou encore la présence de nouveaux gènes associés à chacun des génomes mitochondriaux (des gènes sexe-spécifiques) qui ont une fonction autre que la production d’énergie contrairement aux autres gènes mitochondriaux typiques. Le lien entre la DUI et la détermination du sexe étant encore flou, trois approches ont été proposées pour aider à le démystifier, chacune des approches constituant un chapitre de cette thèse. Les deux premiers chapitres se sont concentrés sur des espèces de moules d’eau douce de l’ordre des Unionida, où une corrélation entre gonochorisme et DUI et hermaphroditisme et SMI (« Strictly Maternally Inheritance » ou transmission strictement maternelle) a été décrite. La première approche consistait à produire une analyse transcriptomique comparative entre les gonades mâles et femelles de deux espèces à DUI gonochoriques, Venustaconcha ellipsiformis et Utterbackia peninsularis (famille Unionidae), pour mieux comprendre les mécanismes sous-jacents à la détermination du sexe et à la DUI chez ces bivalves. Cette étude a révélé 12 000 gènes orthologues, avec 2 583 gènes différentiellement exprimés chez les deux espèces, dont les gènes Sry, Dmrt1 et Foxl2 connus pour être des éléments clés dans la détermination du sexe chez les vertébrés et d’autres bivalves. Nos résultats ont aussi été comparés avec d’autres espèces à DUI, notamment avec la palourde marine Ruditapes philippinarum, pour identifier des éléments partagés entre des espèces éloignées qui pourraient être responsables de la régulation de la DUI. Globalement, ces résultats corroborent l'hypothèse selon laquelle un mécanisme d'ubiquitination modifié pourrait être responsable de la rétention de l'ADNmt paternel chez les bivalves mâles. Les analyses ont aussi révélé que la méthylation de l'ADN pourrait être impliquée dans la régulation de la DUI. Une deuxième analyse transcriptomique comparative a été réalisée afin de discerner les mécanismes sous-jacents à la détermination du sexe et à la DUI, mais cette fois-ci entre l’espèce à DUI gonochorique U. peninsularis et l’espèce proche parente à SMI hermaphrodite U. imbecillis. Cette étude a permis de supporter l’hypothèse d’une implication des mécanismes d’ubiquitination et de méthylation dans la régulation de la DUI, ainsi que de confirmer un rôle des gènes conservés liés à la détermination du sexe également chez les bivalves hermaphrodites. Nos résultats ont également révélé de nouveaux gènes candidats ayant des rôles potentiels dans la DUI, y compris des nucléases et des facteurs impliqués dans l’autophagie / mitophagie. Finalement, afin d’identifier des éléments génétiques mitochondriaux qui pourraient faire partie des mécanismes sous-jacents à la DUI et la détermination du sexe chez les bivalves, nous avons séquencé les ADNmt F et M complets de deux nouvelles espèces à DUI de deux familles de l’ordre des Venerida, Scrobicularia plana (famille Semelidae) et Limecola balthica (famille Tellinidae). En effet, la description complète des ADNmt chez les espèces à DUI a été effectuée chez plusieurs espèces de moules d’eau douce (ordre Unionoida), mais peu d’espèces l’ont été pour les ordres Mytilida et Venerida. Ces études sont essentielles pour retracer des signatures génétiques mitochondriales partagées par différentes espèces à DUI. Nos résultats ont révélé les plus grosses différences de taille (>10kb) et de divergence nucléotidique (jusqu’à 50% de divergence) entre les ADNmt M et F, parmi toutes les espèces à DUI. Ces différences de taille sont principalement dues à une immense insertion (>3.5kb) dans la séquence du gène cox2 du génome mitochondrial M, chez nos deux espèces, un trait précédemment décrit chez les moules d’eau douce. Le gène cox2 des mâles de S. plana est la plus longue séquence à travers le règne animal. Une autre fonctionnalité importante portés par les ADNmt F et M est la présence de nouveaux gènes spécifiques au sexe, comme reportée chez toutes les autres espèces à DUI jsuqu’à maintenant. Les résultats combinés de cette thèse soutiennent le partage de plusieurs éléments génétiques clés entre les espèces à DUI. De plus, un parallèle avec le système CMS (« Cytoplasmic Male Sterility » ou stérilité cytoplasmique mâle) chez les plantes, les seuls autres organismes possédant un déterminisme sexuel qui implique les mitochondries, est proposé pour expliquer le rôle de l’ADNmt dans la détermination du sexe chez les espèces de bivalves à DUI., Sexual systems and sex determining mechanisms described among animals are extraordinarily diverses. This amazing diversity is present in bivalves where both environment and genetic factors occur, leading to, among others, gonochoric and simultaneous or sequential hermaphroditic species. The most impressive discovery is a sex-determining system that would involve mitochondria. Specifically, a unique mitochondrial DNA inheritance system, known as Doubly Uniparental Inheritance (DUI), would be related to the maintenance of gonochorism in some bivalve species. DUI involves two mitochondrial DNA lineages, one that is maternally transmitted (F mtDNA) to females and males, and the other that is transmitted paternally (M mtDNA) to males only. The F and M mtDNAs, in DUI species, are characterized by unique traits, such as a modification of the cox2 gene, or the presence of new genes associated with each of the mitochondrial genomes (sex-specific genes) that have a function other than energy production, unlike other typical mitochondrial genes. Since the link between DUI and sex determination is still unclear, three approaches have been proposed to help demystify it, with each of the approaches constituting a chapter of this thesis. The first two chapters focused on freshwater mussel species of the order Unionida, where a correlation between gonochorism and DUI and hermaphroditism and SMI (Strictly Maternally Inheritance) was described. The first approach was to produce a comparative transcriptomic analysis between the male and female gonads of two gonochoric DUI species; Venustaconcha ellipsiformis and Utterbackia peninsularis (Unionidae family), to better understand the mechanisms underlying sex determination and DUI in these bivalves. This study revealed 12,000 orthologous genes, with 2 583 genes differentially expressed in both species, including Sry, Dmrt1, and Foxl2 known to be key sex-determining genes in vertebrates and other bivalve species. Our results were also compared with other DUI species, including the marine clam Ruditapes philippinarum, to identify shared elements between distant species that may be responsible for DUI regulation. Overall, these results support the hypothesis that a modified ubiquitination mechanism may be responsible for the retention of paternal mtDNA in male bivalves. The analyzes also revealed that DNA methylation could be involved in DUI regulation. 7 A second comparative transcriptomic analysis was performed to discern the mechanisms underlying sex determination and DUI between the gonochoric DUI species, U. peninsularis, and the closely related SMI hermaphroditic species, U. imbecillis. This study supported the hypothesis of an involvement of ubiquitination and methylation mechanisms in DUI regulation, as well as confirmed a role of conserved genes related to sex determination in hermaphroditic bivalves. Our results also revealed novel candidate genes with potential roles in DUI, including nucleases and factors involved in autophagy / mitophagy mechanisms. Finally, to identify mitochondrial genetic elements that could be part of the mechanisms underlying DUI and sex determination in bivalves, we sequenced the complete F and M mtDNAs of two new DUI species, from two families of the order Venerida; Scrobicularia plana (Semelidae family) and Limecola balthica (Tellinidae family). The complete description of mtDNAs in DUI species has been carried out for several species of freshwater mussels (Unionoida order), but very few species have been described for the orders Mytilida and Venerida. Such studies are essential for tracing mitochondrial genetic signatures shared by different DUI species. Our results revealed the largest differences in size (>10kb) and nucleotide divergence (up to 50% divergence) between M and F mtDNAs, among all DUI species. These differences in size are mainly due to a huge insertion (> 3.5kb) in the cox2 gene of the M mtDNA from both species, a trait previously described in freshwater mussels. The cox2 gene in S. plana males represents the longest cox2 sequence across the animal kingdom. Another important feature of F and M mtDNAs is the presence of new sex-specific genes, as reported in all other DUI species so far. The combined results of this thesis support the sharing of several key genetic elements among DUI species. In addition, a parallel with the Cytoplasmic Male Sterility (CMS) system in plants, the only other organisms with a sex determination system that involves mitochondria, is proposed to explain the role of mtDNA in sex determination in DUI bivalve species.

Knowledge about the mode of reproduction and the sex determination of the cupped oyster Crassostrea gigas remains limited. As a sequential hermaphroditic species, sex determination takes place several times during its lifetime. As part of this thesis, the sexual phenotypes of the first 6 years of life of oysters were identified in two cohorts. Thus, the sex ratio was biased towards females from the first sexual maturity, as well as for all subsequent years. After six years of sexing, 42%, 32%, 19%, 5%, 1% and 0.1% of oysters showed 0, 1, 2, 2, 3, 4 and 5 sex changes. The frequency of sex changes also decreased with age (34% between years 1-2 to 9% between years 5-6). This thesis work has also sought to determine the influence of sex and sex change on the morphological parameters of individuals. Thus, a sexual dimorphism was identified for the total weight as well as the length, width and thickness of the shell, in favour of female oysters, including those that have changed sex in the male to female direction. Finally, a transcriptomic analysis of the gonad of individuals with contrasted phenotypes ("true" females and "true" males) was to provide further knowledge on the molecular factors of sex determination. Thus, this approach made it possible (i) to identify the expression patterns of homologs of sex-determining genes, over the entire period of this mechanism and (ii) to identify new molecular actors of interest, overexpressed specifically in one sex during sex determination. Each expression pattern obtained in "true" males or "true" females could thus be interpreted in the light of the most probable future phenotype of the sex, despite sequential hermaphroditism. This approach allowed to refine hypotheses about the role of various factors in determining the sex of this cupped oyster.; Le savoir relatif au mode de reproduction et au déterminisme sexuel de l’huître creuse Crassostrea gigas demeure limité. Etant une espèce hermaphrodite séquentielle, la détermination de son sexe a lieu plusieurs fois au cours de sa vie. Dans le cadre de cette thèse, les phénotypes sexuels des 6 premières années de vie de l’huître ont été identifiés au sein de deux cohortes. Ainsi, le sexe-ratio était biaisé vers les femelles dès la première maturité sexuelle, ainsi que pour toutes les années suivantes. Après six années de sexage, 42%, 32%, 19%, 5%, 1% et 0,1% des huîtres ont montré 0, 1, 2, 3, 4 et 5 changements de sexe. La fréquence des changements de sexe décroissait aussi avec l’âge des individus (34% entre les années 1-2 à 9% entre les années 5-6). Ces travaux de thèse ont également cherché à déterminer l’influence du sexe et du changement de sexe sur les paramètres morphologiques des individus. Ainsi, un dimorphisme sexuel a été identifié pour le poids total ainsi que la longueur, largeur et épaisseur de la coquille, en faveur des huîtres femelles, dont celles ayant changé de sexe dans le sens male vers femelle. Enfin, une analyse transcriptomique de la gonade d’individus à phénotypes contrastés (« vraies » femelles et « vrais » mâles) devait permettre d’approfondir les connaissances sur les facteurs moléculaires du déterminisme sexuel. Ainsi, cette approche a permis (i) d’identifier les profils d’expression d’homologues du déterminisme sexuel sur toute la période de ce mécanisme et (ii) d’identifier de nouveaux acteurs moléculaires d’intérêt surexprimés spécifiquement dans un sexe lors du déterminisme sexuel. Chaque pattern d’expression obtenu chez de « vrais » mâles ou de « vraies » femelles a ainsi pu être interprété à la lumière du plus probable futur phénotype du sexe, malgré l’hermaphrodisme séquentiel. Cette approche a permis d’affiner les hypothèses concernant le rôle des divers facteurs dans le déterminisme du sexe de l’huître creuse.

Knowledge about the mode of reproduction and the sex determination of the cupped oyster Crassostrea gigas remains limited. As a sequential hermaphroditic species, sex determination takes place several times during its lifetime. As part of this thesis, the sexual phenotypes of the first 6 years of life of oysters were identified in two cohorts. Thus, the sex ratio was biased towards females from the first sexual maturity, as well as for all subsequent years. After six years of sexing, 42%, 32%, 19%, 5%, 1% and 0.1% of oysters showed 0, 1, 2, 2, 3, 4 and 5 sex changes. The frequency of sex changes also decreased with age (34% between years 1-2 to 9% between years 5-6). This thesis work has also sought to determine the influence of sex and sex change on the morphological parameters of individuals. Thus, a sexual dimorphism was identified for the total weight as well as the length, width and thickness of the shell, in favour of female oysters, including those that have changed sex in the male to female direction. Finally, a transcriptomic analysis of the gonad of individuals with contrasted phenotypes ("true" females and "true" males) was to provide further knowledge on the molecular factors of sex determination. Thus, this approach made it possible (i) to identify the expression patterns of homologs of sex-determining genes, over the entire period of this mechanism and (ii) to identify new molecular actors of interest, overexpressed specifically in one sex during sex determination. Each expression pattern obtained in "true" males or "true" females could thus be interpreted in the light of the most probable future phenotype of the sex, despite sequential hermaphroditism. This approach allowed to refine hypotheses about the role of various factors in determining the sex of this cupped oyster., Le savoir relatif au mode de reproduction et au déterminisme sexuel de l’huître creuse Crassostrea gigas demeure limité. Etant une espèce hermaphrodite séquentielle, la détermination de son sexe a lieu plusieurs fois au cours de sa vie. Dans le cadre de cette thèse, les phénotypes sexuels des 6 premières années de vie de l’huître ont été identifiés au sein de deux cohortes. Ainsi, le sexe-ratio était biaisé vers les femelles dès la première maturité sexuelle, ainsi que pour toutes les années suivantes. Après six années de sexage, 42%, 32%, 19%, 5%, 1% et 0,1% des huîtres ont montré 0, 1, 2, 3, 4 et 5 changements de sexe. La fréquence des changements de sexe décroissait aussi avec l’âge des individus (34% entre les années 1-2 à 9% entre les années 5-6). Ces travaux de thèse ont également cherché à déterminer l’influence du sexe et du changement de sexe sur les paramètres morphologiques des individus. Ainsi, un dimorphisme sexuel a été identifié pour le poids total ainsi que la longueur, largeur et épaisseur de la coquille, en faveur des huîtres femelles, dont celles ayant changé de sexe dans le sens male vers femelle. Enfin, une analyse transcriptomique de la gonade d’individus à phénotypes contrastés (« vraies » femelles et « vrais » mâles) devait permettre d’approfondir les connaissances sur les facteurs moléculaires du déterminisme sexuel. Ainsi, cette approche a permis (i) d’identifier les profils d’expression d’homologues du déterminisme sexuel sur toute la période de ce mécanisme et (ii) d’identifier de nouveaux acteurs moléculaires d’intérêt surexprimés spécifiquement dans un sexe lors du déterminisme sexuel. Chaque pattern d’expression obtenu chez de « vrais » mâles ou de « vraies » femelles a ainsi pu être interprété à la lumière du plus probable futur phénotype du sexe, malgré l’hermaphrodisme séquentiel. Cette approche a permis d’affiner les hypothèses concernant le rôle des divers facteurs dans le déterminisme du sexe de l’huître creuse.

Teleost fishes, the most species-rich clade among vertebrates, employs an astonishing diversity of sex-determining (SD) mechanisms, including environmental and genetic systems. Recent studies identified many new genetic regulators in fish sexual development that lead to the notion of an 'evolutionary playground'.This thesis project aims to provide a complete picture of the evolutionary dynamic of SD systems within a small order of teleost, Esociformes. In our focal species Esox lucius, we idenWhile the gene is lost in another population of the same species rapidly possibly during post-glacial recolonization process, it is well conserved among different species. Meanwhile, additional transition of SD system have also been identified in a sister Esox species. Moreover, in the most distant genera Dallia and Umbra, the Esox master SD gene is not present and we found different SD mechanisms with novel SD genes that adds additional layers of complexity to this group, which mirrors the observed high genetic plasticity in teleost SD; Les téléostes, le clade possédant le plus d’espèces parmi les vertébrés, emploient une saisissante diversité de mécanismes de détermination du sexe, incluant des mécanismes génétiques et environnementaux. Des études récentes ont identifié de nombreux nouveaux régulateurs génétiquesdu développement sexual des poissons et ont introduit la notion de “terrain de jeux évolutif”. Le but de ce projet de thèse est de donner une vue complète des dynamiques évolutives des déterminants du sexe dans un ordre de téléostes, les Esociformes. Dans notre espèce focale, Esox lucius, nous avons identifié une duplication d’un membre de la famille des TgfB – une famille qui a émergé en tant que fondamentale dans la régulation du sexe chez les téléostes – comme MSD (gène controlant la détermination du sexe). Nous avons obtenu des preuves fonctionnelles du rôle de ce gène en tant que MSD, de son interaction avec des facteurs environnementaux, ainsi que des nouvelles informations sur les processus évolutifsCe gène est perdu dans une population de la même espèce en Amérique du Nord, mais il est conservé parmi les autres Esociformes. En parallèle, d’autres systèmes de détermination du sexe ont été identifiés dans des espèces proches. De plus, dans des clades plus distants comme Umbra et Dallia, le MSD d’Esox n’est pas présent, et d’autres mécanismes implicants de nouveaux MSD ont été identifiés, complefixiant l’histoire évolutive des MSD dans ce groupe, qui reflète la plasticité génétique observée dans les téléostes en général.

Oniscidea show a remarkable diversity of chromosomal sex determination systems (male heterogamety XX/XY or female heterogamety ZW / ZZ). However, the origin of such diversity is still largely unknown to date. It has been proposed that these different systems may be the product of the coevolution between terrestrial isopods and Wolbachia, a feminizing endosymbiotic bacteria transmitted vertically through oocytes. In order to characterize the impact of Wolbachia endosymbiosis on the evolution of sex determination mechanisms, we used a combination of genomic, transcriptomic and gene expression approaches. First, the genome of the species Armadillidium nasatum (characterized by an XX/XY system) was generated and then structurally and functionally annotated. From this genome, a comparative genomic approach allowed us to characterize sequences Y-linked, in order to better understand the processes involved in the sex chromosome degeneration. In order to identify effectors potentially related to sex determination or differentiation, a candidate gene approach has been used to characterize DM-domain genes, known to be involved in the sex determination pathways of many species, and then to measure their expression over development. Finally, a Oniscidea phylogeny was generated in parallel with sex-reversal experiments in order to characterize the number and the direction of the transitions of heterogenetic systems during the terrestrial isopods evolution. This work emphasize the impact of endosymbiosis on the evolution of host sex determination mechanisms.; Les Oniscidea présentent une diversité remarquable de systèmes chromosomiques de déterminisme du sexe (hétérogamétie mâle XX/XY ou hétérogamétie femelle ZW/ZZ), dont l'origine reste encore largement inconnue à ce jour. Il a été proposé que ces différents systèmes puissent être le produit de la coévolution entre les isopodes terrestres et Wolbachia, une bactérie endosymbiotique féminisante transmise verticalement par voie ovocytaire. Dans le but de caractériser l'impact de l'endosymbiose à Wolbachia sur l'évolution des mécanismes de déterminisme du sexe, nous avons utilisé une combinaison d'approches génomique, transcriptomique et d'expression de gènes. Tout d'abord, le génome de l'espèce Armadillidium nasatum (caractérisée par un système XX/XY) a été généré et ensuite annoté structurellement et fonctionnellement. A partir de ce génome, des approches de génomique comparatives ont permis la caractérisation de séquences liées au chromosomes Y, afin de mieux comprendre les processus impliqués dans la dégénérescence des gonosomes. Afin d'identifier des effecteurs liés au déterminisme ou à la différenciation du sexe, une approche par gènes candidats a permis de caractériser des gènes à domaines DM, connus pour être impliqués dans le déterminisme du sexe de nombreuses espèces, et d'en mesurer l'expression au cours du temps. Enfin, une phylogénie des Oniscidea a été réalisée en parallèle d'expériences de réversion de sexe afin d'estimer le nombre et la direction des transitions de systèmes d'hétérogamétie au cours de l'évolution des isopodes terrestres. Ces travaux contribuent à illustrer l'impact de l'endosymbiose sur l'évolution des mécanismes de déterminisme du sexe de l'hôte.

Influence de la température d'élevage sur la détermination du sexe chez le tetra-cavernicole Astyanax mexicanus. 2. Journées des Installations Expérimentales LPGP

International audience; Cette note propose une réévaluation de la diagnose sexuelle et de la détermination de l'âge au décès de l'individu azilien Le Peyrat 5 (LP5) [Dordogne, France] daté directement à 11430 ± 150 BP (GifA-99117 ; 13566-13017 cal. BP) à partir de méthodes fiables appliquées à l'os coxal. Cette étude confirme que le squelette LP5 est celui d'un homme adulte vraisemblablement décédé entre 30 et 49 ans. La détermination fiable du sexe de vestiges du Paléolithique supérieur est notamment importante pour la construction d'un corpus de référence visant à mieux appréhender le dimorphisme sexuel extra-pelvien des individus de cette période. Mots clés Diagnose sexuelle • Os coxal • Épipaléolithique • Âge au décès • Méthode

Parasitic flatworms include more than 20.000 species that are mainly hermaphrodites. Among them, the hundred species of Schistosomatidae are intriguing because they are gonochoric. The acquisition of gonochorism in these species is supposed to provide genetic and functional advantages to adapt to their hosts: warm-blooded animals. Sex of schistosomes is genetically determined at the time of fertilization (i.e. ZW female heterogametic system). However, there is no phenotypic dimorphism through all the larval stages of its complex lifecycle: sexual dimorphism appears only in the definitive host. The molecular mechanisms triggering this late sexual differentiation remain unclear, and this is precisely the topic of our present work. We performed transcriptomic (RNA-Sequencing and quantitative-PCRs) and structural (ChIP-Sequencing) analyses at different stages of Schistosoma mansoni development. Here, we present data suggesting that the sexual differentiation relies on a combination of genetic and epigenetic factors. In a genetic point of view, we show a sex-associated expression of the DMRT genes (Double-sex and Mab-3 Related Transcription Factors) that are known to be involved in sex determination/differentiation through all the animal kingdom. In addition, we propose new potential sex-determining key genes and a pivotal role of host-pathogen interaction at the time of development. In a structural point of view, we highlight a dynamic status of dosage compensation in females and chromatin modifications in males. This intense remodeling reveals a specific transcriptomic strategy which optimizes male development and beyond that, schistosomes reproductive success.; Parmi plus de 20000 espèces de trématodes hermaphrodites, les Schistosomatidae ont un statut particulier car ils sont gonochoriques (i.e. deux sexes séparés). Le gonochorisme chez ces espèces, et leur dimorphisme sexuel, seraient en fait une stratégie d’adaptation à leur habitat : le système veineux des vertébrés à sang chaud, dont l’Homme. Malgré un mode chromosomique de déterminisme du sexe (i.e. hétérogamétie femelle ZW), les individus mâles et femelles demeurent phénotypiquement identiques durant tous les stades larvaires de leur cycle de vie hétéroxène. La différenciation sexuelle n’a lieu qu’après l’infestation de leur hôte définitif. Dans ce travail, nous nous sommes intéressés aux facteurs moléculaires déclenchant cette différenciation chez Schistosoma mansoni. Nous avons établi le profil d’expression sexe-dépendant de gènes conservés de la cascade de détermination/différenciation chez les animaux : les DMRT (Double-sex and Male-abnormal-3 Related Transcription Factors). Nous avons par ailleurs généré un transcriptome comparatif mâle/femelle (RNA-seq) sur 5 stades de développement in vivo, dont 3 stades « schistosomules » inédits. Cela nous a permis d’identifier de potentiels gènes « clés » de la différenciation sexuelle et de souligner l’importance de l’interaction hôte-parasite. Enfin, par la combinaison de cette approche transcriptomique et d’une analyse épigénomique (ChIP-seq), nous avons montré une dynamique de la compensation de dose génique au cours du cycle de vie chez les femelles ainsi que la mise en place d’une stratégie transcriptionnelle particulière chez les mâles, optimisant leur développement dans l’hôte et ainsi, leur succès reproducteur.

Genetically determined sex determination mechanisms, which are controlled by non-recombinant chromosome regions or sex chromosomes, have emerged independently and repeatedly across several eukaryotic lineages. Most of the knowledge acquired in this area has been obtained for a limited number of eukaryotic groups. The availability of a model organism for the brown algae, Ectocarpus, whose genome has been sequenced, allows the development of tools to study these mechanisms in a lineage that is phylogenetically distant from classically studied models. One of the first challenges was to identify the sex chromosomes in Ectocarpus and to carry out a comparative analysis of these genomic structures. Analysis of gene expression in males and females at different stages of the life cycle then allowed the identification of differentially expressed genes. The functions and molecular evolution of these sex-biased genes was then studied. The large amount of data generated during the course of these analyses allowed the establishment of a new version of the genome assembly and refined structural and functional annotation of both coding and non-coding genes in Ectocarpus. This work helped made a significant contribution to knowledge in the field of functional and evolutionary analysis of sex determination in brown algae and a significantly updated the genomic resources available for the model organism Ectocarpus.; Les mécanismes de détermination génétique du sexe, qui requièrent la présence de régions chromosomiques non recombinantes ou bien de chromosomes sexuels, ont émergé de manière indépendante et répétée au sein de plusieurs lignées d'eucaryotes. La plupart des connaissances acquises dans ce domaine portent sur un nombre limité de groupes d'eucaryotes. La disponibilité d'une espèce modèle pour le groupe des algues brunes, Ectocarpus siliculosus, dont le génome a été séquencé, permet de disposer des outils nécessaires pour étudier ces mécanismes au sein d'une lignée phylogénétiquement éloignée des modèles classiquement étudiés. L'un des premiers défis a été d'identifier les chromosomes sexuels dans le génome d'E. siliculosus et de réaliser l'analyse comparative de ces structures. Par la suite, l'analyse de l'expression des gènes entre individus mâles et femelles à différents stades du cycle de vie a permis d'identifier les gènes différentiellement exprimés, de caractériser leurs fonctions et d'analyser leur évolution moléculaire. Les nombreuses données générées afin de réaliser ces différentes analyses ont permis de proposer une nouvelle version de l'assemblage du génome et de l'annotation structurale et fonctionnelle de l'ensemble des gènes codants et non-codants d'E. siliculosus. Ces différents travaux ont permis d'apporter une importante contribution sur les connaissances dans le domaine de l'analyse fonctionnelle et évolutive du déterminisme sexuel chez les algues brunes ainsi qu'une importante actualisation des ressources génomiques du modèle Ectocarpus.

Genetically determined sex determination mechanisms, which are controlled by non-recombinant chromosome regions or sex chromosomes, have emerged independently and repeatedly across several eukaryotic lineages. Most of the knowledge acquired in this area has been obtained for a limited number of eukaryotic groups. The availability of a model organism for the brown algae, Ectocarpus, whose genome has been sequenced, allows the development of tools to study these mechanisms in a lineage that is phylogenetically distant from classically studied models. One of the first challenges was to identify the sex chromosomes in Ectocarpus and to carry out a comparative analysis of these genomic structures. Analysis of gene expression in males and females at different stages of the life cycle then allowed the identification of differentially expressed genes. The functions and molecular evolution of these sex-biased genes was then studied. The large amount of data generated during the course of these analyses allowed the establishment of a new version of the genome assembly and refined structural and functional annotation of both coding and non-coding genes in Ectocarpus. This work helped made a significant contribution to knowledge in the field of functional and evolutionary analysis of sex determination in brown algae and a significantly updated the genomic resources available for the model organism Ectocarpus.; Les mécanismes de détermination génétique du sexe, qui requièrent la présence de régions chromosomiques non recombinantes ou bien de chromosomes sexuels, ont émergé de manière indépendante et répétée au sein de plusieurs lignées d'eucaryotes. La plupart des connaissances acquises dans ce domaine portent sur un nombre limité de groupes d'eucaryotes. La disponibilité d'une espèce modèle pour le groupe des algues brunes, Ectocarpus siliculosus, dont le génome a été séquencé, permet de disposer des outils nécessaires pour étudier ces mécanismes au sein d'une lignée phylogénétiquement éloignée des modèles classiquement étudiés. L'un des premiers défis a été d'identifier les chromosomes sexuels dans le génome d'E. siliculosus et de réaliser l'analyse comparative de ces structures. Par la suite, l'analyse de l'expression des gènes entre individus mâles et femelles à différents stades du cycle de vie a permis d'identifier les gènes différentiellement exprimés, de caractériser leurs fonctions et d'analyser leur évolution moléculaire. Les nombreuses données générées afin de réaliser ces différentes analyses ont permis de proposer une nouvelle version de l'assemblage du génome et de l'annotation structurale et fonctionnelle de l'ensemble des gènes codants et non-codants d'E. siliculosus. Ces différents travaux ont permis d'apporter une importante contribution sur les connaissances dans le domaine de l'analyse fonctionnelle et évolutive du déterminisme sexuel chez les algues brunes ainsi qu'une importante actualisation des ressources génomiques du modèle Ectocarpus.

FOXL2 is a transcription factor which is crucial for the ovary. In humans, heterozygous mutations are responsible for the BPES syndrome characterized by eyelid anomalies and premature ovarian failure. Similarly in mice, Foxl2 invalidation leads to complete folliculogenesis disruption and female infertility. In the goat, the Polled Intersex Syndrome mutation is responsible for the transcriptional silencing of FOXL2 in XX PIS-/- gonads that leads to female-to-male sex reversal and the differentiation of testes instead of ovaries in genetically female animals homozygous for the mutation. Thus, FOXL2 is determining for ovarian differentiation early during development in goats, whereas it is involved in fertility tardily in mice and women. In order to understand these species-specific differences, we searched for the genes and pathways regulated by FOXL2 in early goat ovaries. Thanks to RNA-sequencing of goat XY testes, XX ovaries and XX PIS-/- gonads (lacking FOXL2) at the beginning of their differentiation, we were able to (i) better characterize the role of FOXL2 in goat ovaries and show that it acts mainly as an anti-testis factor, and (ii) highlight new pro-ovarian genes like DMXL2, and study its putative role during ovarian development using functional experiments in the mouse.; FOXL2 est un facteur de transcription crucial pour la fonction ovarienne. Dans l'espèce humaine, des mutations hétérozygotes de ce gène sont responsables de la survenue d'un syndrome associant des malformations des paupières à une insuffisance ovarienne prématurée. De même chez la souris, l'invalidation totale de Foxl2 conduit à un blocage de la folliculogenèse et donc à une infertilité femelle. Chez la chèvre, la mutation Polled Intersex Syndrome (PIS) engendre le silence transcriptionnel de FOXL2 dans les gonades XX PIS-/- ce qui conduit à une inversion sexuelle et à la différenciation de testicules à la place d'ovaires chez les animaux génétiquement femelles homozygotes pour la mutation (inversion sexuelle de type mâle XX). FOXL2 est donc déterminant pour la différenciation ovarienne très précocement au cours du développement dans l'espèce caprine, alors qu'il ne semble impliqué que plus tardivement dans l'établissement de la fertilité chez la souris et la femme. Afin de comprendre ces différences entre espèces, nous avons recherché quels étaient les gènes et les voies de signalisation régulés par FOXL2 dans l'ovaire de chèvre au début de sa différenciation. Grâce à un séquençage à haut-débit des transcrits présents dans trois types de gonades caprines (testicules XY, ovaires XX et gonades XX PIS-/- (qui n'expriment pas FOXL2)) au début de leur différenciation, nous avons pu (i) mieux caractériser le rôle de FOXL2 dans l'ovaire caprin et montrer qu'il y agit avant tout comme un facteur anti-testiculaire, et (ii) mettre en évidence de nouveaux gènes pro-ovariens comme DMXL2 et étudier son rôle putatif dans la fonction ovarienne grâce à des expériences fonctionnelles chez la souris.

In vertebrates, before sexual differentiation, future gonads, also called genital ridges, are bipotential.Differentiation leads ta either ovary or testis formation. In males, presence of the testis-determining factor,SRY gene, induces testis differentiation of genital ridges. In its absence or if SRY protein is not functional,ovaries are formed. This work is about early sexual differentiation and is divided into two parts dealing with(1) female or (2) male pathway.(1) For a long time, the female sexual differentiation pathway has been considered as a default pathway.However, recent studies prove the existence of pro-ovarian genes. Their invalidations may lead to sexreversai(XX male). This study focuses on the role of two genes, Fox!2 and Rspondin-l (Rspol) . In XXmice, invalidation of these genes leads for Fox!2 to infertility, for Rspol to ovo-testis formation. Toelucidate the relationship between these two genes and their complementarities in early female gonadaldifferentiation, we performed the double invalidation of Fox!2 and Rspol. Our immunohistological studiesshow masculinization of XX Fox!2-'ï Rspol"- gonads in mice. According to our results, this phenotype isdue to the presence of active steroidogenic cells in foetal gonad, which also could explain the genital tractmasculinization. Our results suggest that Fox!2 and Rspol belong to two distinct signalling pathways thatsuppress the male differentiation, via for example, inhibition of foetal steroidogenesis in female.(2) Despite its key role in testicular differentiation, SRY gene is not well conserved between mammalianspecies. However, with masculinization of XX mice transgenic for exogenous SRY gene (human or goat), aninter-species phylogenetic conservation of SR Y protein was established. Our study characterizes transgenicmouse lines for SRY goat (SRY",), but also studies its regulation. Indeed, in all mammals' species, SRY geneis expressed during sexual differentiation, until adulthood, except in mice where expression rapidly switchesoff. A SOX9 binding site localised on porcine SRY promoter has been described as inducing SRY geneexpression in vitro. Thanks to new SRY", transgenic mouse lines studies, whose SOX9 binding site wasdeleted, our results do not demonstrate any crucial regulatory effect ofthis binding site on SRYg expression.Therefore, this SOX9 binding site is not responsible al one for continuous expression of the gene SRYg.; Chez les vertébrés, avant la différenciation sexuelle, les futures gonades ou crêtes génitales, sont (\bipotentielles. Leur différenciation engendre la formation soit d'un ovaire, soit d'un testicule. Chez le mâle,la présence du gène SRY, induit la différenciation de ces crêtes génitales en testicules. En absence de celuici,ou si sa protéine est non fonctionnelle, des ovaires se forment. Ce travail traite de la différenciationsexuelle précoce et se divise en deux parties, traitant respectivement de la voie (1) femelle et (2) mâle.(1) La voie de différenciation sexuelle femelle a longtemps été considérée comme une voie par défaut.Cependant de récentes études prouvent l'existence de gènes « pro-ovariens)). Leurs invalidations peuventengendrer jusqu'à des inversions sexuelles (mâle XX). Cette étude se focalise sur le rôle de deux de cesgènes: Fox!2 et Rspondin-l (Rspol). Chez des souris XX, l'invalidation de ces gènes aboutit pour Fox!2 àune infertilité, pour Rspol à la formation d'ovo-testicules. Afin d'élucider le lien existant entre ces deuxgènes, ainsi que leur complémentarité dans la différenciation gonadique femelle précoce, nous avons réaliséla double invalidation de Fox!2 et RspoJ. Nos études immunohistologiques montrent une masculinisationdes gonades XX Fox!T'-IRspor'-. Selon nos résultats, ce phénotype serait dû à la présence de cellulesstéroïdogènes foetales actives, expliquant également la masculinisation du tractus génital. Nos résultatstendent à conclure que Fox!2 et Rspol appartiennent à deux voies de signalisation distinctes, qui réprimentla différenciation mâle, via entre autre, l' inhibition de la stéroïdogénèse foetale.(2) Malgré son rôle clef lors de la différenciation testiculaire, le gène SRYest très peu conservé entre lesdifférentes espèces. Cependant, grâce à la masculinisation de souris XX transgéniques pour un gène SRYexogène (humain ou caprin), une conservation phylogénétique inter-espèce de la protéine a été établit. Notreétude a permis de caractériser les lignées de souris transgéniques pour SRY caprin, mais également d'enétudier la régulation. En effet, le gène SRY est exprimé dès la différenciation sexuelle puis tout au long de lavie chez toutes les espèces de mammifères, excepté chez la souris où son expression s'éteint rapidement.Sur le promoteur SRY porcin, un site de fixation de la protéine SOX9 a été décrit comme induisant in vitroson expression. Grâce à l'étude de nouvelles lignées de souris transgéniques pour SRYg, dont le site SOX9 aété muté, nos résultats démontrent que ce site n' est pas le seul responsable de l'expression continue du gèneSRYg.

Au cours de notre étude, nous avons collecté 2284 spécimens de Pomadasys jubelini dont 1406 mâles et femelles. Le sex-ratio est en faveur des mâles avec 1 mâle pour 0,82 femelle, 1 mâle pour 0,63 femelle et 1 mâle pour 0,56 femelle respectivement en lagune de Grand-Lahou, Ebrié et Aby. C.R.O. Published

Iterative method of sex determination and sex dimorphism of post-cranial skeletal remains from late eneolithic and bronze age population from bohemia Summary. — Currently, the study of sexual dimorphism of ancient populations depends primarily on the right determination of the sex of the skeletons from specific archaeological cultures. These archaeological cultures cluster the skeletal remains into chronologically and geographically determined groups, or archaeologically defined populations. To approach the study of sexual dimorphism in some ancient "archaeological" populations, we applied the iterative method of primary and secondary sex diagnosis as an alternative to the direct sex determinations method which usually focuses also on the analysis of cranial traits. The first step was to determinate the sex of the skeletons which had innominates, using metrical and morphological pelvic traits. The pelvis has been shown to exhibit a maximal degree of sexual dimorphism among the all of the bones of the human skeleton. It has been suggested also that the sexual dimorphism of this bone is diachronically stable. This is the reason we chose this part of the skeleton a primary indicator of sex. Subsequently, based on other measurements of the skeletons for which sex has been determined by our primary pelvic diagnosis, we computed the relevant discriminant functions to be used in the secondary diagnosis of those skeletons without a pelvis. We have determined the sex using several discrimination functions only in these cases with the average posterior probability of association of particular skeleton with one or other sexual category is higher than 90% (clearly defined cases). The sex estimation was carried out also in those cases with the average posterior probability between 80 and 90% (the skeletons determined with a question mark). The sex determined by this iterative method was then compared with the direct determination of sex considering also with the pelvis the cranial traits. This revealed that differences were found only in those skeletons previously evaluated as males, now determined to be females by our iterative method. These differences between the results of the methods were noted mainly for the skeletons from the Unetice culture, which chronologically appear in the latest period of our sample. This raises the question if this difference can be explained by a morphological change of craniofacial features or "degracilisation" previously observed to be associated with the end of the third millennium ВС in Europe. The direct method of sexing skeletons considering cranial robusticity would lead to a relatively higher degree of errors. We have also studied the relationships between anthropological sex determination and archaeological characteristics of the Late Eneolithic burials (2900-2300 ВС) that belong to the two great cultural complexes in Europe: Corded Ware Culture and Bell Beakers Culture. We have distinguished two basic cultural elements based on the archaeological evidence: orientation of the grave and the original position of the skeleton. Both of these elements correlate highly with our iterative method of the sex determination. The skeletons for which assigned sex differs depending on the method employed, or whose orientation and position in the grave would also suggest a different sex determination, should be sexed by molecular methods. In the Corded Ware and Bell Beakers funerary practices, specifically in cemeteries containing single burials, great attention was paid to the symbolic expression of identity, as it is expressed by categories of uniform funerary practices for age and sex groups. Evident is the expression of an individual's association with a particular social category (such as gender), rather than special skills or status achieved within that persons life. Funerary practices in the Corded Ware Culture, as well as the Bell Beaker Culture, can be assumed to be a reflection of the social division of labour within the community and can also reflect the contrasting social roles of men and women in the prehistoric periods under study. The individuality expressed within the context of a single burial can also reflect the association of the deceased with a particular, Résumé. — Des sujets appartenant aux groupes archéologiques du Chalcolithique récent, cultures à Céramique Cordée (2 900-2 500 avant J.-C.) et des Gobelets Campaniformes (2 900-2 200 avant J.-C), et du Bronze ancien, culture Unetice (2200-1 500 avant J.-C.) de la Bohème ont été soumis à la détermination sexuelle par la méthode itérative se composant d'une diagnose primaire et secondaire des variables post-crâniennes. Pour tenir compte du dimorphisme sexuel dans notre série, nous avons d'abord effectué une diagnose sexuelle primaire que pour les squelettes, dont les coxaux ont été bien conservés. D'une part, cet os exprime le degré maximal de dimorphisme sexuel parmi les différents os du squelette humain et d'autre part, il est stable quant à l'évolution séculaire dans sa complexité. Ensuite pour déterminer le sexe des squelettes sans les os coxaux, nous avons élaboré des fonctions discriminantes à partir de dimensions extrapelviennes des squelettes déterminés par la diagnose primaire. Nous avons attribué le sexe en fonction de la probabilité de classifications a posteriori. Pour une probabilité supérieure à 0,90 le sexe est considéré comme déterminé de façon fiable; entre 0,80 et 0,90 il est déterminé avec un point d'interrogation. Les squelettes déterminés par ce procédé ont été comparés avec les déterminations précédentes effectuées par les méthodes directes, pour les rapports de fouilles. Nous pouvons constater que l'on a abouti à une relativement bonne concordance de résultats. Néanmoins, il faut signaler que des résultats discordants apparaissent dans 12 (9,8%) cas quand on considère les sujets déterminés d'une manière fiable. Les différences se trouvent avant tout dans le groupe Unetice donc au Bronze ancien. Sauf dans un seul cas, il s'agit de sujets déterminés comme hommes par les méthodes directes, alors que notre méthode itérative par l'analyse discriminante leur a attribué le sexe féminin. Nous trouvons important que ce changement de méthode de détermination sexuelle, d'une part, diminue la variabilité biologique et, d'autre part, augmente parfois les moyennes des caractères étudiés dans le groupe masculin d'une manière statistiquement significative. Les différences dans les déterminations des sujets du Bronze ancien peuvent être expliquées par la dégracilisation crânienne s'effectuant au tournant de IIIe et IIe millénaires avant J.-C. en Europe, si les méthodes directes anciennes ont privilégié les caractères crâniens. Nous pouvons constater aussi que des pratiques funéraires de groupes du Chalcolithique récent correspondent d'une manière très nette au sexe déterminé. En effet, une corrélation hautement significative existe entre l'orientation de la sépulture, la position originale du squelette et la détermination sexuelle effectuée par la méthode itérative du squelette postcrânien. Le rite funéraire du Chalcolithique récent reflète très probablement les éléments de la division sexuelle du travail et, dans le cadre de la famille préhistorique, des différents rôles sociaux entre l'homme et la femme., Cerny Viktor, Houët Francis, Turek Jan. Détermination du sexe par la méthode itérative et le dimorphisme sexuel du squelette post-cranien d'une population du Chalcolithique récent et du Bronze ancien de la Bohème. In: Bulletins et Mémoires de la Société d'anthropologie de Paris, Nouvelle Série. Tome 11 fascicule 3-4, 1999. pp. 383-404.

Une méthode de détermination externe du sexe basée sur le dimorphisme sexuel de la longueur relative de la mâchoire supérieure est appliquée chez le Saumon Atlantique (Salmo salar L.). 78 adultes capturés en juin et juillet 1990 dans trois rivières des Asturies (Nord de l'Espagne) sont étudiés. L'Analyse Linéaire Discriminante sur un échantillon de 63 poissons donne un pourcentage d'erreurs de moins de 10 %. Les résultats sont comparés à ceux obtenus sur d'autres cours d'eaux d e l'aire de répartition du Saumon atlantique et sont discutés en fonction de la composition de l'échantillon.

A study of the sexual physiology of penaeid prawns essentially based upon Penaeus japonicus is performed in both descriptive and experimental ways, using the controlled rearings conducted at the Centre Oceanologique de Bretagne (CNEXO-COB), Brest. Sexual morphogenesis is described. This preliminary study enables definition of simple criteria for determination of the stage of genital development of the prawns during their growth. The neuroendocrine control of the genital system development is studied, using eyestalks ablations and male eyestalks extracts injection in prawns belonging to the same sex. A biochemical criterion as a test of the effect of eyestalks extract injections on the genital system development is discussed. The evolution of the specific activity of aspartate transcarbamylase (ATC) has been followed and results are discussed., L'étude de la physiologie sexuelle des crevettes Penaeides réalisée essentiellement sur l'espèce Penaeus japonicus, est abordée sous l'angle descriptif et expérimental à partir des élevages contrôlés réalisés au Centre Océanologique de Bretagne (CNEXO-COB) à Brest. Dans la première partie du travail, une étude de la morphogénèse sexuelle a été réalisfo. Cette étude préliminaire a permis d'obtenir des critères simples de détermination de l'état du développement génital des crevettes au cours de leur croissance. Dans une deuxième partie, l'étude du contrôle neuroendocrine du développement de l'appareil génital a été abordée par des ablations de pédonculaires oculaires et par des injections d'extraits pédonculaires de mâles sur des crevettes épédoncul.ées de même sexe. Enfin, dans une troisième partie, nous avons recherché un critère biochimique permettant d'éprouver l'action d'extraits pédonculaires sur la croissance de l'appareil génital. L'évolution de 1'activité spécifique de 1'aspartate transcarbamylase (ATCs) a été suivie et discutée.

National audience; The use of plasma concentrations of 11-ketotestosterone for determining sex has been studied in various species of salmonids (O. kisutch, S. salar, S. gairdneri, S. trutta) at different stages of their sexual development. Radioimmunological titrations were performed; though they are less sensitive than filtrations with an extraction by organic solvents, they are quicker to use. The percentage of error in sex determination is low (5%) in animals that have developing gonads or that are still in prepuberty, but is much higher in immature animals. A single injection of total pituitary extract (equivalent to 100 ng of s-GtH per gram) will reduce this error to 2% by stimulating 11-ketotestosterone secretion.; L'identification du sexe à partir de la mesure des concentrations plasmatiques de 11-cétotestostérone a été tentée chez différentes espèces de salmonidés (Oncorhynchus kisutch, Salmo salar, Salmo gairdneri, Salmo trutta) et à différents stades du développement sexuel. Un dosage radioimmunologique, moins sensible qu'un dosage comportant une extraction en phase organique, mais de mise en œuvre plus rapide, a pu être utilisé. Les pourcentages d'erreur de sexage chez les animaux dont les gonades se développent ou chez les animaux prépubères sont faibles (< 5%), alors qu'ils sont beaucoup plus importants chez les immatures. Une seule injection à de jeunes truitelles immatures d'un extrait hypophysaire total (équivalent à 100 ng de gonadotropine purifiée par gramme de poisson) permet, en stimulant la sécrétion de 11-cétotestostérone, de réduire cette erreur à 2%.

La production de truites stériles par voie génétique

Using monosex populations may increase the economical profitability, when the reproductive dissemination is too rapid (extensive fish culture in tropical countries), or in the case of species in which one sex is more advantageous (better growth rate or later maturation time). In this paper, we analyzed four methods expecting to produce monosex populations. If hormonal sex reversal or induced gynogenesis (in case of female homogamety) seem to be not directly usable, promising results could be attempted with genetical sex determination which combines these two methods. Interspecific hybridization may lead as well to monosexual progeny in some particular cases.; L'utilisation de populations monosexes peut permettre d'accroître la rentabilité économique, lorsque la reproduction est trop rapide (aquaculture extensive dans les pays tropicaux) ou dans le cas d'espèces où l'un des sexes est plus avantageux (meilleure vitesse de croissance ou maturation plus tardive). Nous avons analysé dans ce papier quatre méthodes permettant la production de populations monosexes. Si l'inversion sexuelle par traitement hormonal ou (a gynogenèse induite (dans le cas d'une homogamétie femelle) ne semblent pas directement exploitables, on peut attendre du sexage génétique qui combine ces deux méthodes, des résultats prometteurs. L'hybridation interspécifique peut également conduire à une descendance monosexe dans des cas particuliers.

Une technique d'identification externe du sexe chez le Saumon atlantique (Salmo salar) est proposée. Deux cent quatorze individus capturés en juillet et août 1986 dans cinq rivières québécoises et à un site en eau salée ont été étudiés. Pour l'ensemble de l'échantillon, le dimorphisme sexuel de la longueur relative de la mâchoire supérieure a permis une identification exacte du sexe dans 88% des cas., A technique to determine the sex of the Atlantic salmon (Salmo salar ) from external features is proposed. A total of 214 individuals caught in July and August 1986 in five rivers in Quebec and at a salt water location have been studied. Overall, the sexual dimorphism of the relative length of the upper jaw bone allowed us to sex the fishes with 88% success.

L'hypothèse d'une hétérogamétie mâle chez Tilapia nilotica et d'une hétérogamétie femelle chez Tilapia macrochir permet d'expliquer que les hybrides issus du croisement mâle maerochir X femelle nilotica sont tous mâles, alors que les hybrides issus du croisement réciproque ont une sex-ratio de trois mâles pour une femelle. La présente étude se proposait de vérifier la validité de cette hypothèse en comparant ses conséquences théoriques avec les résultats expérimentaux relatifs à la sex-ratio des alevins de tous les rétrocroisements possibles : hybrides de première génération x parents. Certaines contradictions dans ces résultats (concernant les 2 croisements réciproques : hybrides (6' nilotica x 9 macrochir) x (nilotica) n'impliquent pas que l'hypothèse de départ soit fausse, mais obligent à faire quelques réserves sur la notion d'hétérochromosomes dans ces espèces.