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Winter home ranges of chamois (Rupicapra rupicapra) were censused, cartographied, and described in four montainous massifs situated in Isère (France). Based on 1 700 points characterized by 7 environmental parameters, 73 areas were studied. A statistical analysis (logistic linear model) showed that snow-cover, vegetation, exposition, and relief were the most reliable variables characteristic of chamois winter habitat. Altitude and slope were less significant. The first four variables were thus retained to characterize chamois winter habitat according to the biogeographical unit of each massif : Northern Prealps, outer crystalline massifs, Southern Prealps. Importance of snow-cover varied according to the massif : Northern Prealps winter habitat was characterized by a long lasting snow-cover whereas in the massifs, snow-cover disappeared more rapidly. Most commonly the chamois selected forests, and also rather uniforme reliefs. Winter habitats tended to be North-facing in the Prealps, and South-facing in inner massifs., Le recensement, la cartographie puis la description des zones d’hivernage utilisées par le Chamois (Rupicapra rupicapra), ont été réalisés sur quatre massifs montagneux du département de l’Isère. Au total 73 zones ont été étudiées sur la base d’un carroyage de plus de 1 700 points caractérisés par 7 paramètres descriptifs du milieu Un traitement statistique (modèle logistique linéaire) a mis en évidence que l’enneigement, le milieu végétal, l’exposition et le relief étaient les paramètres les plus pertinents pour caractériser les milieux utilisés par le Chamois. L’altitude et la pente se sont en revanche révélées moins significatives. A partir des 4 premières variables sélectionnées, une typologie des milieux caractérisant une zone d’hivernage a été élaborée. Celle-ci tient compte de l’appartenance du massif aux grandes unités biogéographiques alpines : les Préalpes du Nord, les massifs cristallins externes, les Préalpes du Sud. L’importance de l’enneigement varie selon les massifs ; les zones d’hivernage situées dans les Préalpes du Nord sont caractérisées par une longue durée d’enneigement alors que pour les massifs plus internes le manteau neigeux disparaît plus rapidement Pour le milieu, ce sont en règle générale, les forêts (mixtes, feuillus, résineux) que le Chamois occupe le plus souvent. Il affectionne également les reliefs plutôt uniformes. Quant aux expositions, les zones d’hivernage ont tendance à être exposées au nord dans les massifs préalpins et au sud dans les massifs plus internes., Michallet Jacques,Gaillard Jean-michel,Toigo Carole,Yoccoz Gilles Nigel. Sélection des quartiers d’hivernage par le Chamois, Rupicapra rupicapra, dans les massifs montagnards de l’Isère (France). In: Revue d'Écologie (La Terre et La Vie), tome 54, n°4, 1999. pp. 351-363.

Growth of human populations and economy causes human societies to be more and more dependent on ecosystem services. Understand the mechanisms underlying the response of biological systems to global changes is thus a scientific and social issue. This research was thank and realized when developing a long term monitoring scheme for mountain birds with different research teams and conservation stakeholders. In this long term monitoring, birds are used as indicators of the effects of global changes on biodiversity. Mountain massifs of France are exposed to climate change, and land use evolution, as livestock grazing is dependent on raw material prices and public support. Mountains are interesting, but contingent, ecological contexts to study the effects of global changes on biodiversity, due to the sharp bioclimatic gradients and facet landscapes. My main objective was to characterize and quantify the respective effects of temperature, vegetation structure, and livestock grazing activities on this bird community, to better predict the consequences of major climate and land use changes. Elevation gradient have been mostly studied in isolated sites and large elevation gradients. Following our main objective, in the first chapter, we chose the opposite approach, by multiplying study sites in a standardized habitat (open grasslands, 1100 point counts in Alps and Pyrenees). Our results show that primary productivity, temperature and habitat structure all influence the bird community. Also 5 out of the 8 most common species seemed to be favorited by livestock grazing activities. In the second chapter, I tested the effect of the strong seasonality typical from temperate mountains’ climate, by testing it’s effect on the survival of individuals in a population of alpine Choughs Pyrrhocorax graculus. I relied on the CMR survey of more than 1000 individuals carried out by Anne Delestrade during 30 years. Choughs show the highest survival known in corvids, with a seasonal pattern, in interaction with individuals’ states like sex group. Adult females also showed lower spring survival after warm winters. In third chapter I speculated on the ability of insectivorous passerines to get benefit from the presence of large domestic herbivorous mammals, by eating coprophagous insects. I measured the stable nitrogen isotopic ratios in the feces of most common birds to provide an estimation of the trophic level of birds’ preys, and thus test my hypothesis and eventually quantify the mechanism. We observed, in both mountain massif, a shift from herbivorous from higher trophic level insects catched by birds, from locations with low grazing intensity to those with high grazing intensity. The last chapter present an evaluation of the potential of adaptive niche based sampling to increase the ability to find rare species in new localities. This study includes simulations and field test in the Pyrenees mountains on two alpine bird species, Snowfinch Montifringilla nivalis and rock Thrush Monticolla saxatilis. Results show the strong potential of the method in the field, and its limit, with an increase in specificity at the cost of omissions that also increase. As a general discussion, I develop research perspective to generalize the strong link found between birds’ diet and large mammalian herbivores, and to better understand the phenology of populations facing unpredictable snow cover during breeding period.; Du fait de la croissance démographique et économique de la population humaine, nos sociétés sont de plus en plus dépendantes de la nature, et plus précisément de certains processus biologiques regroupés sous le terme services écosystémiques. Comprendre les mécanismes de réponse des systèmes biologiques face aux changements globaux que nos activités induisent à plusieurs échelles est donc un enjeu scientifique et de société. Cette thèse a été pensée et réalisée en interaction avec plusieurs équipes de recherche et gestionnaires d’espaces naturels dans le cadre du développement d’un suivi temporel des oiseaux de montagne comme indicateurs des conséquences des changements globaux sur la biodiversité. Les massifs montagneux de France sont en effet exposés aux changements de climat et à l’évolution de l’élevage des grands herbivores, une activité exposée aux fluctuations des prix des matières premières et des aides publiques. Les forts gradients bioclimatiques « en facettes » (selon l’exposition) qui caractérisent des massifs montagneux font de ces espaces des modèles d’étude particulièrement intéressants pour étudier les effets des changements globaux sur la biodiversité, mais aussi fortement contingents. L’objet général de ma thèse est d’identifier et de quantifier le rôle respectif de la température, de la structure de la végétation, et des activités d’élevage, sur cette communauté d’oiseaux, afin de mieux comprendre quelles pourraient être les conséquences de changements majeurs de climat et d’usage des terres. Les gradients altitudinaux ont été historiquement étudiés de façon isolée et dans de grandes diversités d’habitats. Suivant les objectifs généraux de la thèse nous avons choisi d’adopter l’approche inverse dans le premier chapitre, en multipliant les sites d’études dans un habitat standardisé (1100 points d’écoute réalisés dans les Alpes et les Pyrénées). Nos résultats montrent que la ressource, la température et la structure de l’habitat influent fortement sur la communauté. De plus 5 des 8 espèces étudiées semblent favorisées par le pâturage. Dans le second chapitre, j’ai testé l’effet de la forte saisonnalité qui caractérise le climat des massifs montagneux tempérés, en testant son effet sur la survie individuelle dans une population de Chocards à bec jaune Pyrrhocorax graculus. Je me suis appuyé pour cela sur un suivi individuel (CMR) d’un millier d’individus mené pendant 30 ans par Anne Delestrade. Les Chocards présentent une survie forte et un patron saisonnier, en interaction avec le sexe des individus, avec une survie plus basse pour les femelles après les hivers et printemps chauds. J’ai ensuite présumé que les passereaux insectivores savent profiter des troupeaux en consommant des insectes coprophages. J’ai mesuré les ratios isotopiques stables de l’azote présents dans les fèces des oiseaux les plus communs pour estimer le niveau trophique de leurs proies, et ainsi tester cette hypothèse et quantifier le mécanisme. On observe dans les deux massifs un décalage très marqué vers le prélèvement d’insectes non-herbivores quand l’intensité de pâturage augmente. Le dernier chapitre évalue le potentiel d’échantillonnages itératifs basés sur des modèles de répartition d’espèces pour augmenter la probabilité de contacter une espèce rare dans de nouvelles localités. Cette étude comprend des simulations et un test de terrain dans les Pyrénées sur la Niverolle alpine Montifringilla nivalis et le Monticole de roche Monticolla saxatilis. Les résultats montrent le fort potentiel de la méthode en pratique, et ses limites, avec une augmentation de la spécificité au détriment d’une augmentation des omissions. En discussion générale, je propose des perspectives de recherche visant à généraliser le lien fort entre régime alimentaire des oiseaux de montagne et troupeaux de mammifères herbivores, et à mieux comprendre la phénologie des populations des pelouses d’altitude en fonction de l’enneigement.

Growth of human populations and economy causes human societies to be more and more dependent on ecosystem services. Understand the mechanisms underlying the response of biological systems to global changes is thus a scientific and social issue. This research was thank and realized when developing a long term monitoring scheme for mountain birds with different research teams and conservation stakeholders. In this long term monitoring, birds are used as indicators of the effects of global changes on biodiversity. Mountain massifs of France are exposed to climate change, and land use evolution, as livestock grazing is dependent on raw material prices and public support. Mountains are interesting, but contingent, ecological contexts to study the effects of global changes on biodiversity, due to the sharp bioclimatic gradients and facet landscapes. My main objective was to characterize and quantify the respective effects of temperature, vegetation structure, and livestock grazing activities on this bird community, to better predict the consequences of major climate and land use changes. Elevation gradient have been mostly studied in isolated sites and large elevation gradients. Following our main objective, in the first chapter, we chose the opposite approach, by multiplying study sites in a standardized habitat (open grasslands, 1100 point counts in Alps and Pyrenees). Our results show that primary productivity, temperature and habitat structure all influence the bird community. Also 5 out of the 8 most common species seemed to be favorited by livestock grazing activities. In the second chapter, I tested the effect of the strong seasonality typical from temperate mountains’ climate, by testing it’s effect on the survival of individuals in a population of alpine Choughs Pyrrhocorax graculus. I relied on the CMR survey of more than 1000 individuals carried out by Anne Delestrade during 30 years. Choughs show the highest survival known in corvids, with a seasonal pattern, in interaction with individuals’ states like sex group. Adult females also showed lower spring survival after warm winters. In third chapter I speculated on the ability of insectivorous passerines to get benefit from the presence of large domestic herbivorous mammals, by eating coprophagous insects. I measured the stable nitrogen isotopic ratios in the feces of most common birds to provide an estimation of the trophic level of birds’ preys, and thus test my hypothesis and eventually quantify the mechanism. We observed, in both mountain massif, a shift from herbivorous from higher trophic level insects catched by birds, from locations with low grazing intensity to those with high grazing intensity. The last chapter present an evaluation of the potential of adaptive niche based sampling to increase the ability to find rare species in new localities. This study includes simulations and field test in the Pyrenees mountains on two alpine bird species, Snowfinch Montifringilla nivalis and rock Thrush Monticolla saxatilis. Results show the strong potential of the method in the field, and its limit, with an increase in specificity at the cost of omissions that also increase. As a general discussion, I develop research perspective to generalize the strong link found between birds’ diet and large mammalian herbivores, and to better understand the phenology of populations facing unpredictable snow cover during breeding period.; Du fait de la croissance démographique et économique de la population humaine, nos sociétés sont de plus en plus dépendantes de la nature, et plus précisément de certains processus biologiques regroupés sous le terme services écosystémiques. Comprendre les mécanismes de réponse des systèmes biologiques face aux changements globaux que nos activités induisent à plusieurs échelles est donc un enjeu scientifique et de société. Cette thèse a été pensée et réalisée en interaction avec plusieurs équipes de recherche et gestionnaires d’espaces naturels dans le cadre du développement d’un suivi temporel des oiseaux de montagne comme indicateurs des conséquences des changements globaux sur la biodiversité. Les massifs montagneux de France sont en effet exposés aux changements de climat et à l’évolution de l’élevage des grands herbivores, une activité exposée aux fluctuations des prix des matières premières et des aides publiques. Les forts gradients bioclimatiques « en facettes » (selon l’exposition) qui caractérisent des massifs montagneux font de ces espaces des modèles d’étude particulièrement intéressants pour étudier les effets des changements globaux sur la biodiversité, mais aussi fortement contingents. L’objet général de ma thèse est d’identifier et de quantifier le rôle respectif de la température, de la structure de la végétation, et des activités d’élevage, sur cette communauté d’oiseaux, afin de mieux comprendre quelles pourraient être les conséquences de changements majeurs de climat et d’usage des terres. Les gradients altitudinaux ont été historiquement étudiés de façon isolée et dans de grandes diversités d’habitats. Suivant les objectifs généraux de la thèse nous avons choisi d’adopter l’approche inverse dans le premier chapitre, en multipliant les sites d’études dans un habitat standardisé (1100 points d’écoute réalisés dans les Alpes et les Pyrénées). Nos résultats montrent que la ressource, la température et la structure de l’habitat influent fortement sur la communauté. De plus 5 des 8 espèces étudiées semblent favorisées par le pâturage. Dans le second chapitre, j’ai testé l’effet de la forte saisonnalité qui caractérise le climat des massifs montagneux tempérés, en testant son effet sur la survie individuelle dans une population de Chocards à bec jaune Pyrrhocorax graculus. Je me suis appuyé pour cela sur un suivi individuel (CMR) d’un millier d’individus mené pendant 30 ans par Anne Delestrade. Les Chocards présentent une survie forte et un patron saisonnier, en interaction avec le sexe des individus, avec une survie plus basse pour les femelles après les hivers et printemps chauds. J’ai ensuite présumé que les passereaux insectivores savent profiter des troupeaux en consommant des insectes coprophages. J’ai mesuré les ratios isotopiques stables de l’azote présents dans les fèces des oiseaux les plus communs pour estimer le niveau trophique de leurs proies, et ainsi tester cette hypothèse et quantifier le mécanisme. On observe dans les deux massifs un décalage très marqué vers le prélèvement d’insectes non-herbivores quand l’intensité de pâturage augmente. Le dernier chapitre évalue le potentiel d’échantillonnages itératifs basés sur des modèles de répartition d’espèces pour augmenter la probabilité de contacter une espèce rare dans de nouvelles localités. Cette étude comprend des simulations et un test de terrain dans les Pyrénées sur la Niverolle alpine Montifringilla nivalis et le Monticole de roche Monticolla saxatilis. Les résultats montrent le fort potentiel de la méthode en pratique, et ses limites, avec une augmentation de la spécificité au détriment d’une augmentation des omissions. En discussion générale, je propose des perspectives de recherche visant à généraliser le lien fort entre régime alimentaire des oiseaux de montagne et troupeaux de mammifères herbivores, et à mieux comprendre la phénologie des populations des pelouses d’altitude en fonction de l’enneigement.