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Les conséquences du changement climatique sur les caféiers sont difficiles à prévoir et dépendent du système de culture (allant de monocultures artificialisées à des associations agroforestières quasi naturelles), du sol et des ressources en eau. Ces conséquences se manifestent aussi sur les maladies et ravageurs. Les recherches portant sur l'adaptation au changement climatique concerne essentiellement les céréales, et peu d' efforts portent sur les cultures pérennes tropicales, chez lesquelles le stress peut affecter le comportement de la plante pendant plusieurs saisons. Certains parasites peuvent s'adapter plus vite que ne peut réagir la plante hôte pérenne et se répandre dans de nouveaux habitats à la faveur du changement climatique. L'objectif des travaux du Cirad en amélioration génétique du caféier est de disposer de cultures " en bonne santé ", c'est-à-dire plus résilientes et plus résistantes. Nous présentons des approches intégratives portant sur le fonctionnement du génome (transcriptomique, métabolomique, génomique, épigénétique) et de la plante entière et sur la réponse adaptative aux combinaisons de stress afin de proposer des cibles pour l'amélioration variétale appliquée à la résistance à la rouille du caféier, à la lutte contre les nématodes et à f adaptation à la sécheresse.

L'introduction de biodiversité végétale dans les agroécosystèmes peut modifier la structure des réseaux trophiques du sol et les fonctions écosystémiques qu'ils assurent. Cette thèse fixe les bases d'une démarche expérimentale pour sélectionner des espèces végétales à partir de différents traits fonctionnels et pour évaluer leurs effets sur les réseaux trophiques et le fonctionnement des sols. Nous avons plus particulièrement cherché à sélectionner des plantes de services pouvant induire la régulation des nématodes parasites du bananier Radopholus similis et Pratylenchus coffeae et favoriser la décomposition des matières organiques durant l'interculture dans les bananeraies antillaises. C'est à dire durant la période séparant la destruction d'une ancienne bananeraie et la replantation d'une nouvelle. Au cours de ce travail, les réseaux trophiques du sol ont été appréhendés par une analyse fonctionnelle des communautés de nématodes. Une étude Bibliographique nous a permis de montrer que les traits fonctionnels "statut d'hôtes" vis-à-vis des nématodes phytoparasites, "composition biochimique des litières" et "productivité primaire des espèces végétales" contribuent aux effets des plantes sur les réseaux trophiques du sol et sur les deux services écosystémiques étudiés. Nous avons donc effectué une typologie des plantes de services à partir de ces traits. Puis pour étudier les effets d'apports de litières de composition biochimique contrastée sur les communautés de nématodes du sol, nous avons sélectionné les espèces végétales Paspalum notatum, Crotalaria zanzibarica et Acacia auriculiformis dont les litières présentaient des teneurs variables en hémicellulose, cellulose, azote, et lignine. Une étude en microcosmes a montré que la composition biochimique des litières détermine les successions écologiques au sein des communautés de nématodes et stimule de manière contrastée les voies de décomposition de la matière organique dans les sols. Nous avons discuté des mécanismes de régulation des nématodes parasites du bananier induits par ces apports de litières. Nous avons également montré que la culture de ces trois espèces induit une diminution des populations de R. similis dans les sols. Enfin, nous avons évalué les effets au champ de couverts de P. notatum, de C. zanzibarica et d'un couvert associant ces deux espèces. Pour cela, nous avons cultivé ces couverts durant neuf mois avant de les détruire et de restituer leurs litières à la surface des sols. Nos résultats montrent que ces couverts végétaux influencent différemment l'abondance en nématodes phytoparasites et le potentiel infectieux du sol. Ils induisent également des régulations bottom-up et top down dans leurs communautés. Après la restitution des litières, nous avons observé de fortes abondances de nématodes liées à la décomposition des litières dans la couche de surface du sol. Celle-ci fournit les couches sous-jacentes du sol en azote minéral et favorise le développement des nématodes omnivores et prédateurs. Il en résulte la formation de communautés de nématodes structurées et diversifiées concomitantes à la réduction des populations de R. similis et P. coffeae. Ces résultats étaient plus marqués pour les couverts monospécifiques de C. zanzibarica et les couverts mixtes. Nos travaux confirment que les traits fonctionnels "statut d'hôte", "production primaire", "composition biochimique des litières" sont déterminant pour sélectionner des plantes de services pour l'interculture en bananeraies.

Dans un contexte de mutation rapide de l'agriculture, la conception de systèmes de culture répondants aux nouvelles exigences des agriculteurs et de la société est une nécessité. L'agriculture doit répondre au double enjeu : être productive et respecter l'environnement. La conception de systèmes de culture innovants repose à la fois sur i) des recherches cognitives, visant à comprendre les processus impliqués dans l'agroécosystème et ii) leur intégration dans des systèmes complexes et l'évaluation multicritère de ces systèmes. J'ai développé une approche de modélisation permettant d'intégrer les connaissances existantes sur le fonctionnement des agroécosystèmes à base de bananiers, d'identifier les connaissances manquantes, et de fournir des outils de pilotage afin de permettre la définition de systèmes de culture durables. Les outils de modélisation développés simulent le fonctionnement biophysique de l'agroécosystème, incluant certaines spécificités, comme la prise en compte d'un peuplement cultivé hétérogène (caractère semi-pérenne des bananiers) et la dynamique des bioagresseurs (nématodes phytoparasites et charançons). Ces modèles ont été couplés à des outils d'évaluation des risques environnementaux (risque de pollution par les pesticides), permettant in fine, d'évaluer systèmes de culture existants ou innovants sur la base de critères de performances agronomiques, économiques et environnementales. Afin d'assister le prototypage de systèmes de culture innovants, ces outils de modélisation ont été utilisés afin de tester un grand nombre de règles de décisions des agriculteurs et d'optimiser les combinaisons les plus prometteuses. Mon projet de recherche traite de la question du rôle de la diversité biologique dans la productivité et la stabilité des systèmes de culture. Je propose de mobiliser des modèles de réseaux trophiques afin de prendre en compte la complexification biologique des systèmes cultivés. Au niveau méthodologique, lier les modèles de culture utilisés par les agronomes, avec les modèles de réseaux trophiques utilisés par les écologues, représente un cadre adapté pour simuler le fonctionnement du continuum sol-plante-atmosphère, la régulation biologique des bioagresseurs, et les feedbacks des différentes communautés sur les propriétés du sol. Ce cadre devrait permettre de faire le lien entre les pratiques culturales des agriculteurs, incluant la composante économique et décisionnelle, avec les propriétés émergentes de ces systèmes complexes. La seconde partie de ce projet de recherche concerne l'étude de la dimension spatiale dans la régulation des bioagresseurs. Il s'agit notamment d'étudier comment l'hétérogénéité spatiale et la diversité des ressources influencent la dispersion et la régulation des bioagresseurs par prédation.

Les producteurs de banane antillais sont engagés en partenariat avec l'Institut Technique Tropical et le CIRAD dans une démarche de réduction de l'emploi des intrants chimiques. Les innovations accompagnant cette démarche reposent principalement sur des techniques alternatives à la lutte chimique pour le contrôle des nématodes phyto-parasites et du charançon du bananier. Ces techniques font appel à l'intégration dans le système de culture de plantes de service afin de restaurer des mécanismes de régulation biologique des bio-agresseurs, à un contrôle de l'assainissement des parcelles par des tests biologiques, à l'utilisation de matériel végétal sain (vitroplants) pour la replantation des bananeraies et à la mise en place de pièges attractifs à phéromones pour la capture du charançon du bananier. Ces techniques sont intégrés dans des prototypes de systèmes de culture mis au point et testés en milieu réel dans le cadre d'une démarche de conception et d'évaluation participative impliquant les producteurs, les services techniques et la recherche.

Les nématodes parasites des plantes sont de minuscules vers qui vivent principalement dans le sol et les racines. Dans les cultures de bananiers, les espèces provoquant le plus de ravages passent la plus grande partie de leur cycle biologique dans les tissus racinaires et dans ceux du rhizome des bananiers. La prolifération de ces nématodes perturbe l'alimentation en eau et en nutriments, retarde la croissance et cause la verse des plants de bananiers parasités. Jusqu'à présent, la plupart des méthodes conventionnelles pour lutter contre les nématodes du bananier reposaient sur l'utilisation de nématicides chimiques. La plupart de ces produits ont progressivement été interdits en Europe. Ce guide passe en revue les principales étapes pour une gestion intégrée et alternative des nématodes parasites des bananiers aux Antilles. Cette démarche intègre i) des mesures d'assainissement du sol vis-à-vis des nématodes foreurs Radopholus similis telles que la mise en jachère améliorée, la création de fossés d'isolation hydrique permettant d'évacuer les eaux contaminées pour protéger les jachères et les parcelles assainies d'un risque de recontamination, ainsi que l'utilisation de culture de plantes non-hôtes incluant des cultures de rente, des graminées fourragères et des légumineuses. ii) un diagnostic de la qualité d'assainissement du sol vis-à-vis des nématodes avant la plantation de nouvelles cultures de bananiers. iii) l'utilisation de matériel de plantation sain, principalement des plants issus de culture in-vitro. iv) l'utilisation de variétés tolérantes aux nématodes et, à moyen terme, celles de variétés résistantes aux nématodes. v) une intégration plus poussée de ces stratégies et la réintroduction d'une plus grande biodiversité pour favoriser un contrôle durable de ces nématodes.

Au cours de mon expérience, je me suis intéressé à différents aspects de l'écologie des bioagresseurs allant de l'étude de leurs traits de vie jusqu'à leurs interactions avec l'agroécosystème. Les organismes que j'ai étudiés sont variés : depuis différentes espèces de mouches des fruits, d'aleurodes, de nématodes phytophages jusqu'au charançon du bananier. Deux axes principaux ont structuré mes recherches : un premier concernant la biodémographie et le comportement des bioagresseurs, et un second sur les interactions entre espèces en étudiant en particulier plusieurs espèces envahissantes. Dans le premier axe, j'ai conduit une série de travaux dans lesquels j'ai étudié les traits de vie de différentes espèces au laboratoire et mis en évidence sur le terrain leurs relations avec certains facteurs environnementaux (température, pluviosité, gamme et type de plantes hôtes, type de sol...). Une partie des travaux de ce premier axe a également porté sur la mise au point de systèmes de piégeage contre certains de ces bioagresseurs, et l'étude des biais en termes de structure en âge des populations capturées par ces systèmes. Enfin, des études sur les comportements liés à dispersion du charançon du bananier ont été menées. Dans le second axe, j'ai étudié le lien entre les traits de vie de ravageurs envahissants (mouches des fruits et biotypes d'aleurode) et leur aptitude à l'invasion dans une communauté résidente. Certains traits de vie comme une durée de vie plus longue, une plus grande taille des adultes et des oeufs, permettent une meilleure aptitude à la compétition interspécifique (par exploitation et interférence). L'étude de la distribution géographique de différentes espèces en compétition (mouches des fruits, aleurodes et nématodes phytophages) en fonction des différents facteurs environnementaux a permis de caractériser leurs niches écologiques. Celles-ci conditionnent les possibilités de coexistence des espèces, notamment pour les espèces de bioagresseurs envahissants introduits dans une communauté d'espèces déjà établies dans un environnement hétérogène. Deux nouveaux projets de recherche sont proposés dans la continuité de cette synthèse. Le premier projet porte sur la caractérisation de l'habitat, la dynamique et la dispersion des populations des bioagresseurs en milieux hétérogènes. Le deuxième projet s'intéresse à la caractérisation du réseau trophique du charançon du bananier, et à sa modification par les pratiques culturales. Il s'agit notamment d'identifier les liens trophiques entre espèces et la façon dont ils peuvent être modifiés en vue d'augmenter la régulation du bioagresseur.

Introduction. This rearing technique is applicable to migratory nematodes (e.g., Pratylenchus spp. and Radopholus similis) for mass production of nematodes for experimen- tal purposes, conservation of nematodes, and direct studies of nematodes' multiplication or reproduction mechanisms. The principle of the method applied, key advantages, starting plant material and time required are presented. Materials and methods. Necessary labora- tory materials, and details of the nine steps required for the preparation of carrot discs, prepa- ration of nematodes, inoculation of nematodes and collection of nematodes out of petri dishes are described. Possible troubleshooting is explained. Results. Several thousands of nematodes can be extracted out of one carrot disc after 6-8 weeks of culture, depending on nematode species and geographical population. France (Guadeloupe) / Musa sp. / plant nematodes / methods / extraction / laboratory equipment / rearing systems

La formulation prête à l'emploi d'oxamyl Vydate® 24 L est l'un des trois derniers nématicides actuellement utilisé a la Martinique. Elle pose deux problèmes majeurs de sécurité: elle présente un profil toxicologique défavorable (classé très toxique) et est inflammable, donc dangereuse à stocker. Une nouvelle formulation à la fois déconcentrée et diluée dans un solvant non inflammable, a été mise au point. Nous présentons ici les résultats de l'évaluation de son efficacité contre les principaux nématodes parasites des bananiers à la Martinique, en particulier Radopholus similis, et contre le charançon du bananier Cosmopolites sordidus. Deux essais ont permis de comparer cette nouvelle formulation avec: la formulation habituelle d'oxamyl, un programme de référence (rotation de plusieurs nématicides: cadusafos, aldicarbe, fénamifos et fosthiazate) et un témoin non traité. Les deux formulations d'oxamyl ont assuré un contrôle temporaire comparable au traitement de référence (rotation de cadusafos, aldicarbe puis fosthiazate, fénamifos) vis-à-vis des nématodes Radopholus similis et Helicolylenchus mullicinctus et ont permis de limiter les pertes de rendement. Par contre, leur efficacité contre Cosmopolites sordidus s'est montré inférieure au pro-gramme de référence.

L'auteur est sélectionneur café en Amérique Centrale dans le cadre de la coopération Cirad / PROMECAFE / IICA. Il a effectué, en mars 2005, une visite au Brésil, et visité successivement le IAPAR (Parana) puis l'IAC (Sao Paolo). La culture du café dans ces deux états du Brésil se fait dans un contexte très différent de l'Amérique Centrale. La mécanisation y est relativement développée. Le gel (Parana) et la sécheresse (Sao Paolo) ont des incidences très fortes sur la productivité. Les attaques parasitaires sont importantes, comme celles du scolyte au Parana et de la mineuse au Sao Paolo. L'amélioration génétique y répond par la recherche et l'utilisation par croisement de sources de résistance dans les espèces non cultivées disponibles dans les collections. La biologie moléculaire café est assez avancée, tant au niveau des états qu'au niveau fédéral : Projet EST, études des gène impliqués dans la maturation (IAPAR/CIRAD), recherche de gènes de résistance aux aléas biotiques et abiotiques. Seul le Parana résiste, par ses lois, au développement des OGM. Si la recherche agronomique est propre à chaque état, elle repose aussi en partie sur l'organisation fédérale Embrapa, et sur le financement par un consortium national café, qui finance des projets de recherche communs. On constate une relative distance entre les améliorateurs ("chercheurs de terrain") et les chercheurs en biologie moléculaire ("chercheurs de labo"), ainsi qu'avec les chercheurs des autres disciplines. La coopération avec le Cirad (nématologiste à I'IAC, améliorateur au IAPAR) pourrait contribuer à les rapprocher.

Jury composé de:Harry OZIER-LAFONTAINE (Directeur de Recherche INRA - Rapporteur)Serge SAVARY (Directeur de Recherche IRD - Rapporteur)Thierry DORE (Professeur INA-PG - Examinateur)Eric MALEZIEUX (Directeur adjoint UMR System CIRAD - Examinateur)Walter ROSSING (Professor Wageningen University - Examinateur)Jacques WERY (Professeur AGRO-M - Directeur de thèse); Guadeloupe banana cropping systems are threatened by agronomic (low yield due to phytoparasitic nematode development), environmental (pesticide leaching to water, particularly important in a fragile insular setting) and economic (seasonal variations in fruit prices, manpower costs) unsustainability. New systems have to be designed to solve both economic and environmental problems. Rotations with other crops or fallows, biodiversity restoration, pesticide management are some current investigated solutions.Modelling tools have been developed to combine practices, explore and optimise such systems. Banana cropping systems have some characteristics that cannot be taken into account by generic crop models; a specific model called SIMBA has been developed. The evolution of the banana population structure over time is a key point; it is simulated by SIMBA-POP, a cohort population model. Parasitism dynamics mainly due to phytoparasitic nematodes lower cropping sustainability and lead to massive use of pesticides; this is simulated by the dynamic SIMBA-NEM module. SIMBA also simulates plant growth, the soil cover and structure or water balance. Cropping practices are taken into account by decision rules that give rise to realistic technical recommendations. Qualitative, integrated and dynamic indicators are linked to biophysical modules and allow evaluation of the pesticide leaching risk, erosion risk and soil fertility. SIMBA provides agronomic (yield), environmental and economic (profit margin) outputs for multicriteria evaluation of the simulated system based on different viewpoints.An original 2-step method has been used to prototype new cropping systems with SIMBA (first a global exploration then a specific optimisation). Some interesting cropping systems have thus been highlighted and should be tested in the field. This scientific approach permits to develop some significant progress in the banana modelling by aggregating the existing knowledge and highlight the missing ones.; Aujourd'hui, la culture bananière aux Antilles est confrontée à d'importants problèmes agronomiques (rendements faibles à cause du développement important de pathogènes), environnementaux (transport de pesticides et de sol vers les eaux de surface, dans un contexte écologique insulaire fragile) et économiques (variation du prix de vente des fruits et coût de la main d'œuvre élevé) susceptibles de remettre en cause la pérennité de la filière. Dans ce contexte, des systèmes de culture innovants répondant à un nouveau cahier des charges économique et environnemental doivent être mis au point. Plusieurs voies sont explorées qui, au delà d'un mode de conduite raisonné, visent à l'intégration de jachères, de rotations ou de plantes associées. L'évaluation et la conception de tels systèmes de culture innovants nécessitent l'utilisation d'outils de modélisation spécifiques qui rendent compte des caractéristiques particulières du système. Un modèle spécifique appelé SIMBA à été développé dans ce sens. SIMBA simule l'évolution de la structure du peuplement de bananiers au cours des cycles de culture, point clé qui conditionne l'ensemble de la dynamique du système. La composante parasitaire, qui influe sur la pérennité de la bananeraie et conditionne l'emploi des produits phytosanitaires est également prise en compte. Le parasitisme des nématodes phytoparasites est simulé, en interaction avec la croissance et la structure du peuplement, l'état du sol et l'emploi de nématicides. SIMBA simule également la croissance des bananiers et leur productivité, la structure du sol, la couverture du sol et le bilan hydrique. Des indicateurs qualitatifs et intégrateurs, conçus spécifiquement, permettent, couplés à ces modules biophysiques, l'évaluation au cours du temps de risques environnementaux comme le risque de pollution des eaux par les produits phytosanitaires et le risque d'érosion. Les pratiques culturales sont prises en compte à travers des règles de décision qu'il est ainsi possible d'évaluer. Le modèle SIMBA, en fournissant des sorties agronomiques, environnementales et économiques (marge brute), permet ainsi l'évaluation multicritère de systèmes de culture simulés selon plusieurs points de vue.SIMBA a ensuite été utilisé selon une méthode originale de prototypage en deux étapes (exploration globale puis optimisation spécifique). Les résultats obtenus ont permis d'identifier certains systèmes de culture qu'il conviendra de tester ‘au champ'. Cette approche systémique et fonctionnelle, qui a permis des avancées significatives au niveau de la modélisation des systèmes bananiers, constitue un outil performant pour la conception de systèmes de culture durables.

Aux Antilles françaises, la culture bananière occupe une place importante dans l'économie régionale. La libération du marché mondial de la banane en 2006 risque de causer beaucoup de tort à la production antillaise, peu concurrentielle face aux multinationales américaines. Le développement d'un produit labellisé est une alternative qui permettrait à la banane insulaire d'occuper une place de choix sur le marché international. La mise sur pied de ce label implique une référence tant au terroir, notamment dans ses dimensions pédologiques et climatiques, qu'aux pratiques culturales. Elle requiert aussi l'appréhension des conséquences de la production sur l'environnement dans la recherche d'un label respectant celui-ci. L'objectif de ce travail est double. Dans un premier temps, il est d'aborder la perception des sols de la bananeraie guadeloupéenne sous l'angle d'un nouveau concept "la qualité des sols", en traitant des données acquises antérieurement et en comparant les caractéristiques physico-chimiques des sols de bananeraies pérennes et mécanisées. Ensuite, il s'agit de déterminer la réceptivité de ces sols à Radopholus similis, nématode phytoparasite du bananier, dont le contrôle nécessite des apports massifs de pesticides. Les données antérieures ont été traitées par analyses multivariées. Elles ont mis en évidence le caractère discriminant des teneurs en matière organique, et en potassium et en phosphore disponibles dans la variabilité des sols cultivés. Le développement d'un système de culture pérenne semble favoriser l'aération du sol en développant sa frange macroporale et en augmentant la vitesse d'infiltration de l'eau en conditions saturées. De hauts potentiels de production peuvent être atteints en système pérenne, tout particulièrement dans les sols volcaniques situés en côte sous le vent. Les sols manifestent des degrés de réceptivité divers pour le nématode Radopholus similis, confirmant ainsi l'intérêt de ce type d'études jusqu'ici limitées aux champignons pathogènes. Il apparaît que les dégâts racinaires dus à ce nématode sont moindres sur les sols bruns andiques. Il apparaît d'autre part que le taux de matière organique des sols ou leurs caractéristiques minéralogiques puissent conditionner l'activité et la virulence du nématode. L'apport du concept de "qualité des sols" semble mince si l'on se limite aux caractéristiques physico-chimiques et physiques: il apparaît en effet comme une simple superposition de celles-ci. Dans la démarche des initiateurs du concept, intégrer les processus actuels semble constituer une gageure sur le plan expérimental compte tenu des batteries de tests et de mesures à mettre en place. Par contre, un développement intéressant du concept pourrait s'appuyer sur une intégration plus poussée des caractérisations physiques, physico-chimiques et autres minéralogiques aux mesures à caractère biologique. A cet égard, les tests de mesure de réceptivité des sols aux parasites telluriques et une étude plus poussée des stocks de carbone microbien et d'autres bio-indicateurs de la macro-faune devraient s'avérer très intéressants. Ces approches combinées pourraient mener à développer une gestion de la pression parasitaire plus respectueuse de l'environnement ce qui améliorerait l'image du fruit guadeloupéen. Ce passage paraît obligé pour inscrire la production guadeloupéenne de banane dans un modèle agricole durable impliquant une bonne gestion de leurs terres.

Les départements de la Guadeloupe et de la Martinique sont dominés par deux cultures pivots principales: le bananier et la canne à sucre. Alors que la pression parasitaire sur la canne à sucre est relativement faible, le bananier est soumis à de fortes pressions parasitaires qui nécessitent le recours à une lutte chimique dont l'impact sur l'environnement n'est pas négligeable. Afin de réduire l'usage des pesticides, les orientations prises actuellement, dans une logique d'agriculture raisonnée, intègrent fortement des pratiques de rotations culturales et de combinaisons variétales. On assiste donc à une transition d'un système monocultural à des systèmes de cultures associées qui modifieraient à la fois les systèmes d'exploitation agricole, le paysage, la biodiversité naturelle et cultivée avec des effets extrêmement bénéfiques sur l'environnement et la durabilité des systèmes de culture. Deux composantes majeures marquent cette évolution. En premier lieu, la pratique de rotations culturales associée à l'utilisation d'un matériel de plantation sain permet de contrôler efficacement les populations de nématodes dans le sol et ainsi de réduire considérablement les traitements nématicides polluants et coûteux. La canne à sucre, l'ananas, les plantes fourragères constituent des rotations à la fois efficaces, valorisables économiquement et bénéfiques au plan environnemental. En deuxième lieu, des menaces importantes liées à l'extension importante de la Maladie des Raies Noires (#Mycosphaerella figiensis#) dans tout l'arc Caraïbes incitent à rechercher des techniques alternatives à la seule lutte chimique actuellement utilisée contre l'espèce #Mycosphaerella musicola# (Cercosporiose jaune), seule présente aux Antilles. Le recours à des variétés tolérantes, issues des programmes d'amélioration génétique en cours, constitue une des voies les plus prometteuses, qui devra s'appuyer sur une combinaison judicieuse des variétés sensibles et plus ou moins résistantes, au niveau de la parcelle, de l'exploitation ou du bassin versant. (Texte intégral)

The specific characterization of nematodes, like all other plant pests, is a major stake to develop efficient and durable control strategies. Recent studies showed that P. coffeae, causing important damages on banana and coffee plants in the neotropical region, in fact regrouped a specie complex very difficult to identify by classical taxonomy tools. Studies have been undertaken on some isolates of Pratylenchus spp. taken on these two crops, to precise their pathogenicity and try to define some characterization tools as acurrate as possible. A biochemical approach has been undertaken by the study of esterase diversity with the isoelectric focusing technique. This study has allowed to reveal an important diversity between isolates but still stay insufficient at this steps to clarify their taxonomic status. Studies in planta confirmed an important negative correlation between the nematode population development in roots (agressivity) and the amount damage (roots weight), on banana as well as coffee plant. Chlorophyll rate in banana leaves was also negatively correlated to the nematode number. On the other hand, this parameter was not considered on coffee plant, the plantlets, too young, presenting not sufficient chlorophyllian pigments. Isolates showed a large range of agressivity, and therefore, damage on studied plants. Moreover, the isolates taken on coffee plant were not able to develop on banana plant. In contrast, isolates taken on banana plant were able to develop on coffee plant. This result is not in agreement with the use of banana and coffee plant as intercrop on some countries. Isolates take on plantain were not able to develop neither on banana nor coffee plant. All results confirmed the important diversity between all Pratylenchus isolates. These data also showed the complexity of traditional populations regrouped under the name P. coffeae. They supported the necessity to find acurrate tools to clarify this specific complex and to adapt pest control. Among those, the varietal resistance could play a major part. Preliminary tests on Coffea canephora material screening, already know for these numerous resistances, outlet on the demonstration of a variety which were resistant to the complex “P. coffeae”, This variety belongs to the subgroup SG2 in the “Congolais” goup. However, following hardiness observations on this plant, this group is since a long time used like rootstock in many countries. Few studies have been carried out on the resistance of this plant material. It now appears necessary to encourage this way to find some efficient control strategie against this parasitic complex.

La légumineuse #Arachis pintoi# L. (perennial peanut ou arachide sauvage) est utilisée depuis de nombreuses années comme plante de couverture dans divers pays de la zone intertropicale, notamment en Amérique centrale (Kerridge 1993). Son comportement vis-à-vis des nématodes est encore peu documenté. La possible résistance du cv. Amarillo vis-à-vis de #Meloidogyne# spp. est mentionnée en Australie (Cook etal. 1990). Au Mexique une réduction sensible des attaques de #Meloidogyne# sur tomates a été observée dans un essai de cultures associées (Marban Mendoza et al. 1992). Au Costa Rica, une expérimentation au champ a montré qu'#Arachis pintoi# serait un bon hôte de #Radopholus similis# (Cobb 1893, Thorne 1949) avec une infestation concomitante moyenne d'environ 30 individus par g de racine (Araya 1996). Au Costa Rica encore, des essais conduits en culture de bananiers et de bananiers plantain auraient montré une incidence positive de l'arachide sauvage utilisée comme plante de couverture en réduisant la densité de #Radopholus similis# dans les bananiers adjacents (Vargas 1998). Enfin en 1999, Jonathan et al. ont montré après un essai d'inoculation artificielle que la légumineuse #Arachis pintoi# n'était pas hôte de différentes espèces de #Meloidogyne# Goeldi 1892 (#M. incognita#, #M. arenaria#, #M. javanica#) ni de #Rotylenchulus reniformis# Lindford & Oliveira 1940. Avant d'expérimenter et peut-être de recommander l'emploi d'#Arachis pintoi# comme éventuelle plante de couverture en bananeraie, nous avons voulu vérifier son comportement vis-à-vis des nématodes du bananier à la Martinique. Un essai d'inoculations contrôlées des principales espèces présentes (#Radopholus similis#, #Pratylenchus coffeae#, #Hoplolaimus seinhorsti#, #Meloidogyne incognita#) ainsi que de #Meloidogyne mayaguensis#, une espèce très pathogène à la Martinique bien que non encore observée sur bananier, a donc été conduit en chambre climatique au laboratoire de Nématologie de l'IRD en préalable à toute expérimentation au champ.

Une approche raisonnée des pratiques, basée sur une interaction forte entre la recherche et les producteurs, doit permettre une meilleure prise en compte des enjeux commerciaux et environnementaux, auxquels sont de plus en plus confrontés les productions bananières. L'examen de trois domaines d'action de la culture de la banane permet d'en donner une illustration. Le premier domaine concerne le contrôle phytosanitaire des cercosporioses, maladies fongiques attaquant les feuilles du bananier. Une stratégie de lutte basée sur des méthodes d'avertissement permet de minimiser les coûts de production, de réduire l'impact sur l'environnement et de limiter le risque d'apparition de races du champignon résistantes aux fongicides. Le deuxième domaine relève d'une approche raisonnée du contrôle du parasitisme tellurique, des nématodes en particulier. Le couplage de l'assainissement du sol par jachère ou rotation culturale et de l'utilisation de matériel végétal sain lors des replantations constitue une des voies incontournables pour aller dans le sens d'une moindre utilisation des nématicides qui représentent une importante source de pollution. Le troisième domaine est celui de la maîtrise des critères de qualité du fruit qui fait appel à une méthode de prévision du stade de récolte à partir des données climatiques. Une meilleure maîtrise de l'ensemble des pratiques culturales selon la même logique, incluant le travail du sol, la fertilisation, l'irrigation, la lutte contre le charançon ou le traitement des fruits après récolte, constitue un gage de compétitivité pour les producteurs face aux nouveaux enjeux.

En culture intensive de bananiers, la lutte contre les nématodes (essentiellement #Radopholus similis# Cobb, 1893) est basée sur l'application de 2 à 4 traitements nématicides par an. Ces pesticides posent de nombreux problèmes, notamment de toxicité pour les applicateurs et pour l'environnement. Au cours des dix dernières années, un système de culture alternatif, basé sur l'assainissement des parcelles infestées après jachère ou rotation culturale et suivi de replantation avec des vitro-plants indemnes de nématodes a été mis au point. Néanmoins, la jachère ne permet pas systématiquement d'assainir correctement une parcelle. Plusieurs facteurs entrent en jeu, dont le mode de destruction de la vielle bananeraie et l'évolution de la flore adventice. Sont exposés ici les résultats d'une étude comparant un mode de destruction chimique (injection de glyphosate dans les pseudo-troncs) contre le mode de destruction mécanique habituellement utilisé (destruction au décompacteur ou à la roto-bêche). L'injection de glyphosate dans les pseudo-troncs permet une meilleure destruction du système souterrain des bananiers et retarde l'établissement de certaines plantes potentiellement hôtes de #R. similis# ; le développement de cette technique améliore ainsi la qualité de l'assainissement par jachère et retarde l'infestation progressive de l'ensemble de la plantation par #R. similis#.

Des maladies de toute nature sont transmises ou favorisées par les insectes. Ils sont indispensables dans le cas de maladies à agents pathogènes intraphloémiques : les phytoplasmes, certains virus, les bactéries et les trypanosomides. Les insectes peuvent jouer un rôle dans la vection ou dans le développement d'autres organismes tels que les nématodes, voire les champignons. La mise en évidence puis l'étude de ces divers vecteurs sont d'une grande importance car, dans la majorité des cas, ils entrent dans la politique générale de lutte contre les maladies. La lutte peut se faire de différentes manières grâce à des traitements chimiques bien ciblés et souvent par des moyens strictement biologiques à l'aide de parasitoïdes. Des techniques culturales peuvent permettre de réduire, voire d'éliminer, un vecteur. Le piégeage des insectes vecteurs peut contribuer également pour une large part à la réduction de l'impact d'une maladie

L'objectif des travaux est d'analyser, dans une zone sahélo-soudanienne fortement peuplée du Sénégal, les effets de jachères naturelles, d'âge et de gestion différents, sur les caractéristiques physico-chimiques et biologiques des sols. Avec une protection totale contre le pâturage et l'exploitation du bois, 15 ans de jachère permettent d'accroître les teneurs en matière organique de 50%. La porosité totale de l'horizon de surface est multipliée par deux, l'abondance des macro-agrégats s'accroît de 50 à 70% et la biomasse microbienne totale de 30%. Quinze années de jachère protégée ne provoquent pas une baisse de la densité globale d'infestation en nématodes phytoparasites, mais modifient la composition spécifique du peuplement. Les jachères anciennes soumises à une forte pression d'exploitation présentent les mêmes tendances, mais montrent des teneurs en matière organique du sol inférieures d'environ 20% à celles de parcelles protégées. Sur les jachères jeunes (3 années), le temps de culture précédant l'abandon cultural n'a pas d'influence significative sur les paramètres mesurés. Même si elle était réalisable, la jachère naturelle de longue durée ne possède plus les potentialités nécessaires à la restauration de la fertilité du milieu. Il faut s'orienter vers des pratiques de jachères améliorées ou de substitution, en introduisant des ligneux et des graminées pérennes à forte biomasse racinaire et à croissance rapide, qui ont un fort impact sur les caractéristiques biologiques et physiques des sols. (Résumé d'auteur)

Quatrième et dernier rapport technique sur l'avancement du projet d'évaluation et de sélection de germoplasme de caféier pour la résistance aux principaux nématodes en Amérique centrale. Financé par la Coopération Scientifique internationale ce projet associe trois partenaires : le CATIE au Costa Rica, PROMECAFE au Guatemala et le CIRAD en France. Les objectifs du projet sont de trois ordres : identifier et caractériser les nématodes du caféier, évaluer la résistance et la tolérance de cultivars de caféier à l'égard de chacune des espèces de nématodes et créer du matériel végétal résistant ou tolérant aux divers nématodes. Les derniers travaux du projet au Guatemala ont porté sur des évaluations de résistance à la Meloidogyne sp réalisées sur du germoplasme de Coffea canephora. Cette étude a été réalisée pour étudier l'héritabilité de résistance chez les descendances de deux génotypes déjà identifiés comme résistants et, rechercher d'autres sources de résistances

Ce rapport présente les activité de recherche du CRBP en 1997 : création et sélection de variétés de bananiers pour les consommations locales, évaluation et sélection des hybrides et cultivars pour la diversification, la recherche agronomique en appui à la production, l'observatoire de la filière en appui à la recherche et au développement. Les activités de coopération du CRBP sont ensuite passées en revue au niveau national, régional et international. Les aspects Ressources humaines, Formation, information et documentation ainsi que le bilan financier pour 1997 sont développés. Trois annexes complètent ce document : étude du complexe parasitaire #Radopholus similis# et #Cylindrocladium#, l'annonce du symposium international sur les productions bananières de Douala, 10-14 novemabre 1998, ainsi qu'une fiche technique sur l'utilisation de la farine de plantain

Dans les trois zones de culture du bananier (Mohéli, Anjouan et Grande Comore), le paysan comorien est confronté aux contraintes phytosanitaires (maladies foliaires, parasitisme tellurique et ravageurs). Ce document fait le point des dégâts causés par ces maladies et ravageurs. Leur distribution naturelle et les risques de propagation dans les zones saines sont discutés en tenant compte des conditions climatiques et édaphiques. Des méthodes de lutte sont proposées en fonction de l'importance de la contrainte phytosanitaire

Quatrième et dernier rapport technique sur l'avancement du projet d'évaluation et de sélection de germoplasme de caféier pour la résistance aux principaux nématodes en Amérique centrale. Financé par la Coopération Scientifique internationale ce projet associe trois partenaires : le CATIE au Costa Rica, PROMECAFE au Guatemala et le CIRAD en France. Les objectifs du projet sont de trois ordres : identifier et caractériser les nématodes du caféier, évaluer la résistance et la tolérance de cultivars de caféier à l'égard de chacune des espèces de nématodes et créer du matériel végétal résistant ou tolérant aux divers nématodes. Les derniers travaux au Costa Rica ont porté sur l'évaluation du pouvoir pathogène de deux populations de nématodes Meloidogyne et d'une population de Pratylenchus en conditions contrôlées et au champ, vis-à-vis de différents types de caféiers. Une étude au champ du complexe Pratylenchus/Meloidogyne a été menée afin d'estimer les risques liés à la diffusion de matériel végétal uniquement résistant à Meloidogyne. La multiplication massive de la variété "Nemaya" a été entreprise

Rapport technique final sur le projet d'évaluation et de sélection de germoplasme pour la résistance aux principaux nématodes en Amérique centrale. Le rapport fait d'abord le point sur la caractérisation des populations de Meloidogyne et la capacité reproductrice des nématodes sur caféiers. Il donne ensuite le bilan des travaux réalisés au Guatemala et au Costa Rica sur la résistance de la Meloidogyne, du Pratylenchus sp et de la "corchiosis". Ces travaux ont été à l'origine de la création et la diffusion de la variété de porte-greffe hybride dénommée "Nemaya". L'évaluation de résistance génétique de germoplasme de café et les études du pouvoir pathogène montrent clairement la nécessité de disposer de matériel végétal ayant un niveau de résistance génétique élevé. Toutefois la grande diversité de l'espèce du genre Meloidogyne complique l'approche de l'amélioration variétale. La voie du micro greffage sur C. canephora semble plus prometteuse que la voie d'amélioration directe de C. arabica

Ce document regroupe l'ensemble des observations et analyses réalisées sur une parcelle représentative de la bananeraie PSA. Un commentaire est établi, basé exclusivement sur les propriétés du sol, l'analyse des feuilles, le comptage des nématodes et des attaques de charançons. Les principales caractéristiques de la parcelle, les mensurations des bananiers et les appréciations agronomiques sont notées

Quatrième et dernier rapport technique sur l'avancement du projet d'évaluation et de sélection de germoplasme de caféier pour la résistance aux principaux nématodes en Amérique centrale. Financé par la Coopération Scientifique internationale ce projet associe trois partenaires : le CATIE au Costa Rica, PROMECAFE au Guatemala et le CIRAD en France. Les objectifs du projet sont de trois ordres : identifier et caractériser les nématodes du caféier, évaluer la résistance et la tolérance de cultivars de caféier à l'égard de chacune des espèces de nématodes et créer du matériel végétal résistant ou tolérant aux divers nématodes. Les travaux effectués à Montpellier ont porté sur la caractérisation de population du genre Meloidogyne originaire d'Amérique central et du Brésil. Ces caractérisations ont été réalisées par l'étude de quatre systèmes isoenzymatique mais aussi par des observations morphologiques et caryologiques, ainsi que par l'étude du pouvoir pathogène sur diverses variétés de caféiers des principaux types ou espèces mis en évidence

Des données biologiques, pédologiques et phytosanitaires ont été recueillies dans des parcelles représentatives des bananeraies Peracchi. Les informations collectées ont permis de présenter une vue objective de la culture bananière dans le contexte actuel. Elles sont aussi utilisées pour la définition des améliorations à mettre en oeuvre afin d'obtenir une productivité satisfaisante sur le plan de la qualité et de la rentabilité économique. La fertilisation, le drainage et l'irrigation, le contrôle des parasites et les soins apportés aux fruits ont été diagnostiqués

Le comportement variétal est étudié sur les cultures maraîchères afin d'apprécier les caractéristiques commerciales et agronomiques des variétés utilisées en zones subtropicales. En fonction de l'entretien du sol, des pratiques culturales et du prétraitement des semis, les résultats varient de façon plus ou moins nette. La lutte antiravageur et le contrôle de l'enherbement montrent que l'emploi des pesticides est souvent abusif chez les agriculteurs et augmente ainsi les coûts de production. L'emploi des intrants peut être minimisé par un bon choix variétal et une alternance des cultures. Les cultures étudiées sont : oignon, squash, haricots à grains secs, tomate, melon, courgette, poivron, aubergine et chou

Cette mission avait essentiellement pour but de coordonner les actions de recherche entre le Guatemala et le Costa Rica, sur les nématodes pathogènes du caféier. Les deux principaux genres mis en cause sont Meloidogyne et Pratylenchus. Le rapport met côte à côte les résultats issus des deux pays sur la distribution géographique des espèces, leur pouvoir pathogène respectif, leur compétition biologique, l'évolution de leur population dans le temps. Les sujets de publications d'articles sont présentés, sur la dynamique de pénétration de Pratylenchus (Guatemala), l'influence de la température sur sa capacité de reproduction et sur les intérêts du greffage. Une prospective des activités de Luc Villain est énumérée pour après sa thèse

De nouveaux systèmes de culture qui permettent à la fois d'améliorer la productivité des bananeraies et de réduire l'utilisation de pesticides peuvent être proposés aux planteurs. Ces systèmes supposent l'interruption de la monoculture soit par jachère, soit par rotations culturales (contribuant à éliminer les parasites inféodés au bananier), ainsi que la plantation d'un matériel végétal sain constitué par des vitroplants. Un contrôle technique régulier est nécessaire pour valoriser au mieux l'assainissement et l'amélioration de la fertilité des sols apportés par ces nouveaux systèmes de culture. Il porte sur le suivi de l'évolution des caractéristiques physico-chimiques des sols et sur l'analyse de la réinfestation, par les parasites, des parcelles assainies. Ce rapport présente les résultats de travaux de contrôle d'un système de culture similaire établi en Guadeloupe

Troisième rapport technique sur l'avancement du projet d'évaluation et de sélection de germoplasme de caféier pour la résistance aux principaux nématodes en Amérique centrale. Financé par la Coopération Scientifique internationale ce projet associe trois partenaires : le CATIE au Costa Rica, PROMECAFE au Guatemala et le CIRAD en France. Les objectifs du projet sont de trois ordres : identifier et caractériser les nématodes du caféier, évaluer la résistance et la tolérance de cultivars de caféier à l'égard de chacune des espèces de nématodes et créer du matériel végétal résistant ou tolérant aux divers nématodes. Le rapport rassemble les travaux conduits par les différents laboratoires participant au projet. Le CATIE est chargé de la création variétale, de la mise au point des méthodes de test avec Meloidogyne spp.; PROMECAFE se charge de l'évaluation de ce matériel vis à vis des populations du nématode Pratylenchus sp, et d'une population de Meloidogyne sp.; le CIRAD assure l'identification et la caractérisation des nématodes

Le modèle expérimental développé permet de quantifier la dynamique de pénétration et d'infestation de R. similis après inoculation et coloration in situ à la fuscine acide. Cette technique est donc utilisable pour déterminer les cultivars sensibles et le pouvoir pathogène des nématodes. L'influence à long terme de l'acidification liée à la nutrition azotée et l'impact des nématodes sur la croissance des plants restent à préciser. (Photos en couleurs)

L'endomycorhization du caféier Arabica a des effets bénéfiques en pépinière (augmentation de la croissance et donc raccourcissement du temps de résidence) et au champ (gains importants de production). Elle favorise également l'acclimatation des vitroplants (croissance améliorée et quantité d'engrais phosphaté nécessaire diminuée). Enfin, la tolérance aux nématodes est nettement augmentée par la mycorhization précoce (4 à 6 mois avant l'addition des nématodes au milieu de culture) des plants

Les nématodes s'attaquant aux parties souterraines des plantes cultivées perturbent la nutrition hydrique et minérale avec des répercussions importantes sur la production. En milieu tropical humide, le milieu et les peuplements de parasites sont généralement complexes et très variables d'une région à l'autre. Les cycles biologiques sont également plus courts et les conditions favorables toute l'année. L'élaboration de stratégies de lutte efficaces en est d'autant plus compliquée. Les systèmes de production intensifs représentent des écosystèmes simplifiés où les problèmes parasitaires sont exacerbés. Toutefois ils peuvent être maîtrisés relativement facilement et efficacement bien que cela soit souvent au prix fort (coûts, pollution...). Dans les systèmes de production traditionnels, écologiquement plus complexes, les problèmes sont plus diffus et moins faciles à mettre en évidence. Ils nécessitent une bonne connaissance du milieu pour élaborer des stratégies originales de lutte. Si le poids de la lutte chimique est encore très fort dans les grands systèmes de production intensive, l'élargissement de l'éventail des techniques possibles de lutte permet de plus en plus une approche intégrée plus respectueuse des équilibres naturels et mieux transposable aux systèmes traditionnels

Présentation du séminaire organisé par l'INIBAP sur l'amélioration de la résistance des bananiers aux nématodes, à la fusariose et à la Sigatoka en Asie, dans le Pacifique et en Océanie. En présence des délégations des pays membres du réseau INIBAP, les équipes de recherches exposent les axes et l'état des recherches sur la protection des bananiers

La mission a commencé au Salvador avec pour principales activités : prise de contact avec la Direction de PROCAFE, à la suite de l'affectation d'un entomologiste du CIRAD-CP dans cette institution en décembre 1994, au sein du réseau PROMECAFE; - évaluation et suivi du programme de recherches de cet entomologiste et propositions d'actions; - propositions de coopération entre le CIRAD-CP et PROCAFE en matière de défense des cultures. Au Guatemala, la mission s'est poursuivie par : - une évaluation et un suivi du programme de recherches du nématologiste du CIRAD-CP, en poste à ANACAFE, et des propositions d'actions; - l'organisation et l'animation d'un atelier sur l'évaluation des caféiers pour leur résistance aux nématodes phytopathogènes (participation du CIRAD, IICA, UNICAFE, PROCAFE, ANACAFE et INIFAP)