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National audience

National audience; The polymorphism of caseins, α-lactalbumin and ß-lactoglobulin was investigated in African Bos taurus (N’Dama, Baoulé, Kuri) and Bos indicus (Shuwa Arab, Sudanese Fulani) populations. The respective frequencies of alleles αs1-CnB and αs1-CnC in the N’Dama (0.89 and 0.11) and Baoulé (0.92 and 0.08) breeds were almost opposite to those found in the Shuwa Arab zebu (0.22 and 0.78), a true zebu, which confirms a phenomenon already documented in the literature. Because the αs1-CnB, ß-CnA1, К-CnB haplotype was strongly predominant in N’Dama and Baoulé (0.56 and 0.60), as compared to the αs1-CnC, ß-CnA2, К-CnA haplotype in the Shuwa Arab zebu (0.63), an opposite trend in frequencies was also observed between taurines and zebus at the ß-Cn and К-Cn loci. These results confirm that the polymorphism of caseins provides an efficient marker system to discriminate Bos taurus from Bos indicus origins. The Kuri was at an intermediate position, since, in this population, the αs1-CnB allele predominated as in taurines, while the αs1-CnC, ß-CnA2, К-CnA. The polymorphism of caseins, α-lactalbumin and ß-lactoglobulin was investigated in African Bos taurus (N’Dama, Baoulé, Kuri) and Bos indicus (Shuwa Arab, Sudanese Fulani) populations. The respective frequencies of alleles αs1-CnB and αs1-CnC in the N’Dama (0.89 and 0.11) and Baoulé (0.92 and 0.08) breeds were almost opposite to those found in the Shuwa Arab zebu (0.22 and 0.78), a true zebu, which confirms a phenomenon already documented in the literature. Because the αs1-CnB, ß-CnA1, К-CnB haplotype was strongly predominant in N’Dama and Baoulé (0.56 and 0.60), as compared to the αs1-CnC, ß-CnA2, К-CnA haplotype was the most frequent, as in zebus. This may be interpreted as revealing intercrossings with zebus in the previous history of this cattle type. Conversely, but to a lesser degree, the polymorphism of the Sudanese Fulani zebu indicates a taurine influence, in accordance with what is accepted about the origins of this cattle type. No polymorphism of αs2-casein could be identified, while α-lactalbumin was polymorphic in all populations. Two additional variants, probably specific to African cattle, were observed. Variant H of αs1-casein, found in kuri, is characterized by the deletion of the eight amino acid residues (51-58) coded by exon 8, a probable consequence of exon skipping. Allele αs1-CnH is derived from αs1-CnB. Variant J of К-casein, found in Baoulé, is derived from variant B by the substitution of Ser 155 (B) - Arg (J). The existence of at least another allele of αs1-casein was suggested. (see attached document); Caractérisation des variants αs1-Cn H et К-Cn J. Le polymorphisme des caséines, de l’α-lactalbumine et de la ß-lactoglobuline a été analysé dans des populations bovines africaines de type taurin (N’Dama, Baoulé, Kouri) et zébu (Choa, Peuhl). Les fréquences respectives des allèles αs1-CnB et αs1- CnC chez les taurins N’Dama (0,89 et 0,11) et Baoulé (0,92 et 0,08) tendent à être inverses de celles trouvées chez le zébu Choa, un zébu vrai (0,22 et 0,78), ce qui confirme un phénomène déjà signalé dans la littérature. L’haplotype αs1-CnB, ß-CnA1, К-CnB prédominant nettement chez ces taurins (0,56 et 0,60), par contraste à l’haplotype αs1-CnC, ß-CnA2, К-CnA chez le zébu Choa (0,63), l’inversion des fréquences entre taurins et zébus s’observe également aux loci ß-Cn and К-Cn. Ces résultats confirment que le groupe des gènes des caséines fait partie des marqueurs de choix pour discriminer entre des origines de type Bos taurus et Bos indicus. Le Kouri occupe une position intermédiaire puisque l’allèle αs1-CnB prédomine comme chez les taurins, alors que l’haplotype le plus fréquent est αs1-CnC, ß-CnA2, К-CnA comme chez les zébus. Ces particularités peuvent être interprétées comme révélant des pratiques de métissage plus ou moins anciennes avec des zébus. Inversement, mais à un bien moindre degré, le polymorphisme du zébu Peuhl révèle une influence taurine, en accord avec ce qui est admis sur les antécédents de ce type de bovin. Aucun polymorphisme de la caséine αs2 n’a pu être identifié, alors que l’α-lactalbumine est polymorphe dans toutes les populations. Deux variants supplémentaires, probablement spécifiques des populations africaines, ont été identifiés. Le variant H de la caséine αs1, trouvé chez le Kouri, se caractérise par la délétion de la séquence de huit résidus d’acides aminés (51-58) codée par l’exon 8,conséquence vraisemblable d’une anomalie d’épissage de l’ARN messager, l’allèle αs1-CnH dérivant de l’allèle αs1-CnB. Le variant J de la caséine К, trouvé chez le Baoulé, dérive du variant B par la substitution Ser 155 (B) -Arg (J). L’existence d’au moins un autre allèle de la caséine αs1 est suggérée. ( Formule document ci-joint)

National audience; The influence of the αs1-casein polymorphism on dairy performance was studied on 883 lactations of Alpine goats at the Station caprine de Moissac in France. Genotype effects, heritabilities and genetic correlations were estimated using an animal model which included the effects of kidding date, year, lactation number,αs1-casein genotype (AA, AE, AF, EE, EF, FF), permanent environment and additive genetic value. The strong allele A affected significantly (P < 0.01) the true protein content (AA > AE, AF > EE, EF > FF) and the fat content (AA, AE, AF > EF and FF). AA goats produced less milk yield than AE, AF, EE and EF goats (P < 0.01). Genotypes AA, AE, AF and EE produced more protein yield than FF (P < 0.01). Heritabilities of protein content with and without including the αs1-casein genotype in the model, were 0.34 and 0.66, respectively. Including the αs1-casein genotype in the model also modified the genetic correlations between protein yield and protein content (-0.22 vs 0.09) and protein and fat contents (0.35 vs 0.45). This study confirms that the strong allele A is beneficial for improving goat milk quaLity. Moreover, previous results indicate that A is associated with higher casein/protein ratio and beneficial physico-chemical characteristics for cheese-making. We thus recommend use of αs1-casein polymorphism in goat selection.; L’influence du polymorphisme de la caséine αs1 sur les performances laitières et sur les paramètres génétiques a été étudiée sur 883 lactations de chèvres Alpine à la station caprine de Moissac. Les différences entre génotypes, les héritabilités et corrélations génétiques ont été estimées avec un modèle animal, en considérant les effets fixés de la date de mise bas, de la campagne, du numéro de lactation, du génotype caséine αs1 (AA, AE, AF, EE, EF, FF), et les effets aléatoires de l’environnement permanent et de la valeur génétique additive. L’allèle fort A a un effet significativement favorable (P < 0,01) sur le taux de protéines vraies (AA > AE, AF > EE, EF > Ff) et le taux butyreux (AA, AE, AF > EF et FF). Les chèvres AA ont significativement moins de lait que les chèvres AE, AF, EE et EF. Les chèvres AA, AE, AF et EE ont plus de matière protéique (P < 0,01) que les chèvres FF qui ont les quantités les plus faibles. Le taux de protéines a une héritabilité totale de 0,66 et une héritabilité résiduelle de 0,34 après prise en compte du génotype de la caséine αs1. La correction pour l’effet moyen du génotype de la caséine αs1 augmente la corrélation génétique négative entre quantité de matière protéique et taux de protéines (-0,22 vs 0,09), alors qu’elle diminue la corrélation entre les 2 taux (0,35 vs 0,45). Cette étude confirme que l’allèle fort est bien un allèle favorable pour améliorer les aptitudes fromagères des laits de chèvres, sachant par ailleurs que cet allèle augmente aussi le rapport caséine/protéines et les qualités physico-chimiques des laits. On peut donc maintenant recommander la prise en compte des allèles de caséine αs1 en sélection caprine.

Les effets sur les performances laitières des 5 principaux allèles du locus de la caséine (formule, voir document attaché) (appelés respectivement A, B, C, E, F), qui contrôlent le polymorphisme à effet quantitatif de cette lactoprotéine, ont été analysés dans la descendance de 5 boucs hétérozygotes de race Alpine. Ce polymorphisme n’a pas d’effets sur la quantité de lait. Par rapport à l’allèle «faible» (F), les allèles «forts» A et C ont, en revanche, un effet significatif sur le taux de protéines vraies (+2,5, +2,6 et 1,8 g/kg pour les 3 familles étudiées), le taux butyreux (+1,5, +2,2 et +1,1 g/kg) et la quantité de matière protéique vraie (+2,3, +2,0 et +1,5 kg). Par rapport à l’allèle «moyen» (E), l’allèle fort A a un effet significatif sur le taux de protéines vraies (+2,0 g/kg) et le taux butyreux (+2,6 g/kg). Les résultats obtenus sur le taux de protéines vraies sont en accord avec les estimations antérieures des effets de ces allèles sur le taux de caséine., The effects of the main alleles at the goat (formula, see attached document) called A, B, C, E, F) on milk production traits were estimated via a within-sire analysis of the progeny of 5 Alpine bucks. This polymorphism had no effect on milk yield. On the other hand, compared with the weak F allele, the strong alleles A and C had a significant effect on the true protein content (+2.5, +2.6 and +1.8 g/kg for 3 families), the fat content (+1.5, +2.2 and +1.1 g/kg) and the true protein yield (+2.3, +2.0 and +1.5 kg). Compared with the intermediate E allele, the strong A allele had a significant effect on the true protein content (+2.0 g/kg) and the fat content (+2.6 g/kg). The results on the true protein content were in agreement with previous estimates of the effects of the same alleles on the casein content of milk.