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In a general context of sustainable development, research on agroforestry takes on its full meaning by making plant-plant interactions intelligible in a potentially degraded environment. For several years now, data from field observations have been acquired in partnership with several categories of stakeholders (in particular foresters, farmers and breeders). It is now a question of opening these data and making them available from the web to other communities. Moreover, studies conducted in agroforestry require systemic approaches in order to better understand, for example, the resilience mechanisms of plants to climate change or soil pollution. It is also necessary to make the data linkable to other data sets related to climate and territories. The double challenge of sharing and linking data in agroforestry brings us closer to what is practiced today within the semantic web with different tools and methods to promote the sharing of open and linked data sources. Semantic web technologies provide standard mechanisms to describe and access resources on the web. The work of this thesis is part of this framework, we reuse standard formats of the semantic web and exploit a range of ontologies both frameworks, domains and terminologies to propose a knowledge model, open and flexible to account for the complexity of data already collected in agroforestry. This model is composed of a domain ontology named "Agroforestry". The importance is given to the publication of perfectly described data by privileging the ability to link these data to data already available on the web (climatic data, soil profiles, data on the functioning of plant communities, etc.). We have also built a terminological ontology dedicated to agroforestry called "AgroforestryVoc". Eventually, this ontology will be dedicated to the linguistic qualification of key concepts shared by the whole community and will be made public on the "AgroPortal" (http://agroportal.lirmm.fr/). The last parts of the thesis work focus on the interpretation of the results obtained from the data interconnection. The "Agroforestry" domain ontology, formalized in OWL 2, is built in such a way as to be able to reason about the integrated data set. The objective is therefore to highlight trends in associations between trees and crops in land use by applying inferential mechanisms on the ontology.; Dans un contexte général de développement durable, les recherches menées autour de l’agroforesterie prennent tout leur sens en rendant intelligibles les interactions plante-plante dans un environnement pouvant être dégradé.Depuis plusieurs années maintenant, des données issues d’observations sur le terrain sont acquises en partenariat avec plusieurs catégories d’acteurs (en particulier des forestiers, agriculteurs et éleveurs). Il s’agit maintenant d’ouvrir ces données et de les rendre disponibles depuis le web à d’autres communautés. De plus, les études menées en agroforesterie nécessitent des approches systémiques pour par exemple mieux comprendre les mécanismes de résilience des plantes face aux changements climatiques ou encore face à la pollution des sols. Il s’agit également de rendre les données liables à d’autres jeux de données relatifs au climat et aux territoires. Le double enjeu de partage et d’interconnexion des données en agroforesterie nous rapproche de ce qu’il se pratique aujourd’hui au sein du web sémantique avec différents outils et méthodes à même de promouvoir la mutualisation de sources de données ouvertes et liées. Les techno! logies du web sémantique fournissent les mécanismes standards pour décrire et accéder aux ressources présentes sur le Web.Le travail de thèse s’inscrit dans ce cadre, nous réutilisons les formats standards du web sémantique et exploitons un éventail d’ontologies à la fois cadres, de domaines et terminologiques afin de proposer un modèle de connaissances, ouvert et flexible à même de rendre compte de la complexité des données déjà collectées en agroforesterie. Ce modèle se compose d’une ontologie de domaine nommée "Agroforestry". L’importance est donnée à la publication de données parfaitement décrites en privilégiant la mise en capacité de lier ces données à des données déjà disponibles sur le web (données climatiques, profils pédologiques, données sur le fonctionnement de communautés végétales, etc.). Nous avons aussi construit une ontologie terminologique dédiée à l’agroforesterie nommée "AgroforestryVoc". A terme, cette ontologie se consacrera à la qualification linguistique des concepts clés partagés par toute la communauté et sera rendue pu! blique sur le portail "AgroPortal" (http://agroportal.lirmm.fr/).Les derniers volets du travail de thèse se concentrent sur l’interprétation des résultats dégagés sur la base de l’interconnexion des données. L’ontologie de domaine "Agroforestry", formalisée enOWL2, est construite de manière à pouvoir raisonner sur l’ensemble des données intégrées. L’objectif est donc de faire ressortir des tendances relatives aux associations entre arbres et plantes cultivées dans l’exploitation des terres par mise en application de mécanismes inférentiels sur l’ontologie.

On voudrait apprendre à "lire automatiquement". L'extraction d'information consiste à transformer des paragraphes de texte écrits en langue naturelle en une liste d'éléments d'information autosuffisants, de façon à pouvoir comparer et colliger l'information extraite de plusieurs sources. Les éléments d'information sont ici représentés comme des relations entre entités : (Athéna ; est la fille de ; Zeus). L'extraction d'information libre (EIL) est un paradigme récent, visant à extraire un grand nombre de relations contenues dans le texte analysé, découvertes au fur et à mesure, par opposition à un nombre restreint de relations prédéterminées comme il est plus courant. Cette thèse porte sur l'évaluation des méthodes d'EIL. Dans les deux premiers chapitres, on évalue automatiquement les extractions d'un système d'EIL, en les comparant à des références écrites à la main, mettant respectivement l'accent sur l'informativité de l'extraction, puis sur son exhaustivité. Dans les deux chapitres suivants, on étudie et propose des alternatives à la fonction de confiance, qui juge des productions d'un système. En particulier, on y analyse et remet en question les méthodologies suivant lesquelles cette fonction est évaluée : d'abord comme modèle de validation de requêtes, puis en comparaison du cadre bien établi de la complétion de bases de connaissances., Information extraction consists in the processing of natural language documents into a list of self-sufficient informational elements, which allows for cross collection into Knowledge Bases, and automatic processing. The facts that result from this process are in the form of relationships between entities : (Athena ; is the daughter of ; Zeus). Open Information Extraction (OIE) is a recent paradigm the purpose of which is to extract an order of magnitude more relations from the input corpus than classical IE methods, what is achieved by encoding or learning more general patterns, in a less supervised fashion. In this thesis, I study and propose new evaluation protocols for the task of Open Information Extraction, with links to that of Knowledge Base Completion. In the first two chapters, I propose to automatically score the output of an OIE system, against a manually established reference, with particular attention paid to the informativity and exhaustivity of the extractions. I then turn my focus to the confidence function that qualifies all extracted elements, to evaluate it in a variety of settings, and propose alternative models.

The Saône and the Rhône rivers have experienced and are still experiencing major floods which complicate the development of the neighbouring territories. The Plan Rhône managed by the Direction Régionale de l’Environnement, de l’Aménagement et du Logement Auvergne Rhône-Alpes (DREAL ARA), is an interregional contract whose one objective is to reduce vulnerability to flood risk. The construction of protection structures - also known as dikes - is the main way to protect against floods. Currently, the dispersion and heterogeneity of information relating to these structures between many stakeholders complicates the task of the DREAL's Pôle Plan Rhône, of which one of the objectives is to have an overall view of all these structures.This is why the DREAL ARA wanted to create a centralized knowledge base of the geographical data available on the dikes and include them into a computer tool that would allow to visualize the data and operate spatial analysis. The first results of an inventory and a preliminary critical analysis of the available GIS data, carried out by SEPIA Conseils, were essential for the data gathering, which is the real subject of this document.How, with the help of the results of the previous phases, to gather all the information from the available source databases by integrating both geometric objects and attribute information in an exhaustive way and without losing any information? How to ensure the reliability of this knowledge base in the short but also in the medium term? How to design this specific tool that would make it easy for users to use?The development of this database required the set up of specific methodologies combining semi-automatic processing and manual verification in order to deal with specific cases. Validation and control steps were implemented during the conception of the base, and during its finalization in order to make the base more reliable.The tool for visualizing and editing this knowledge base relies on a visualization interface in the free software QGIS (Long Term Release 3.4 version) and a PostgreSQL/PostGIS database. This tool allows the visualization, editing, modification and the production of customizable synthesis maps. It was created according to the needs identified, in order to be adapted and to ensure the durability of its use over time.In addition, a prioritized investigation plan has been drawn up in order to make the dike position more reliable. A financial report of these additional investigations and summary sheets of the selected sections allowed to study the financial and material feasibility in the short and medium term.Because of lack of information three of the eight tables could not be completed during this study. They should be completed in the future, by the DREAL ARA itself or by other users. This additional research will be essential to ensure the sustainability of the DREAL knowledge base and the associated tool.; Le Rhône et la Saône sont des fleuves qui ont connu et connaissent toujours des crues importantes, qui compliquent le développement des territoires qu’ils traversent. Le Plan Rhône, piloté par la DREAL Auvergne Rhône-Alpes, est un contrat interrégional dont un des objectifs est de réduire la vulnérabilité des territoires face au risque d’inondation. Un des moyens principaux pour se protéger contre les crues est la construction d’ouvrages de protection, appelés aussi plus communément digues. La dispersion et l’hétérogénéité des informations relatives à ces ouvrages entre de nombreux acteurs complexifie à l’heure actuelle la tâche du Pôle Plan Rhône de la DREAL, dont un des objectifs est d’avoir une vision globale de l’ensemble de ces ouvrages. C’est la raison pour laquelle la DREAL a souhaité la constitution d’une base de connaissances centralisée des données géographiques disponibles sur les digues et leur intégration dans un outil informatique permettant leur visualisation et la production d’analyses spatiales. Les premiers résultats d’un recensement et d’une analyse critique préliminaire des données SIG disponibles réalisés par SEPIA Conseils ont été indispensables à la centralisation des données, réel objet de ce mémoire.Comment, avec l’aide des résultats des phases précédentes, rassembler l’ensemble des informations des bases sources récupérées en intégrant à la fois les objets géométriques mais aussi les informations attributaires de manière exhaustive et sans perdre d’information ? Comment fiabiliser une telle base de connaissance à court mais aussi à moyen terme ? Comment concevoir cet outil spécifique qui permettrait de la rendre facilement exploitable pour les utilisateurs ?L’élaboration de cette base a nécessité de développer des méthodologies spécifiques couplant traitements semi-automatiques et vérification manuelles afin de traiter les cas particuliers. Des étapes de validation et de contrôle ont été mises en place au cours de la construction de la base, et lors de sa finalisation afin de fiabiliser la base.L’outil de visualisation et d’édition de cette base de données, s’appuie sur une architecture couplant une interface de visualisation dans le logiciel libre QGIS (version Long Term Release 3.4) et une base de données PostgreSQL/PostGIS. Cet outil permet la visualisation, la consultation, l’édition, la modification et la production de cartographies de synthèse personnalisables. Il a été créé selon les besoins identifiés afin d’être bien adapté et d’assurer la durabilité d’utilisation dans le temps.Un plan d’investigations priorisé a été élaboré en complément afin de fiabiliser le tracé et la connaissance de certains tronçons de digue. Un chiffrage de ces investigations complémentaires et des fiches synthèses des tronçons sélectionnés ont permis d’étudier la faisabilité financière et matérielle d’une telle fiabilisation à court et moyen terme. Les différentes tables qui n’ont pas pu être complétées lors de cette étude par manque d’information devront l’être a posteriori, par la DREAL elle-même ou d’autres utilisateurs. Ces recherches complémentaires seront indispensables pour pérenniser la base de connaissances et l’outil associé.

National audience; More and more knowledge bases are being developed in the field of environment and life. The challenge of this work is to make knowledge accessible to users with various concerns. Our case study deals with a knowledge base containing 30 000 descriptions of plant use in Africa, that are alternatives to synthetic pesticide and antimicrobial. In this paper, we propose a system architecture to explore and navigate within knowledge using formal concept analysis and present a new algorithm that reveals a new plant use in a context different from the initial use.; De plus en plus de bases de connaissances sont développées dans le domaine de l'envi-ronnement et du vivant. L'enjeu de ce travail est de rendre ces connaissances accessibles à des utilisateurs ayant des préoccupations variées. Notre cas d'étude concerne une base de connais-sances rassemblant environ 30 000 descriptions d'usage de plantes en Afrique, à effet pesticide, antimicrobien et antiparasitaire de synthèse. Dans cet article, nous proposons une architecture de système pour explorer et naviguer dans les connaissances grâce à l'analyse de concepts for-mels et proposons un nouvel algorithme faisant émerger un nouveau contexte d'emploi d'une plante dans un cas d'utilisation.

International audience; Endogenous production of deductive rules in a lexical-semantic network With a lexical-semantic network, it is possible to discover rule inductively from known facts. These rules are instrumental in reducing missing information in the network. In order to minimize emergence of relations that could be erroneous, we approached the question of polysemy and a filtering on rules presenting exceptions is realized.; A partir d'un réseau lexico-sémantique, il est possible de générer des règles de façon inductive à partir des faits présents. Ces règles permettent de densifier le réseau et d'en réduire les silences. Afin de minimiser l'émergence de relations qui pourraient être erronées, la question de la polysémie est abordée et un filtrage sur les règles présentant des exceptions est réalisé.

International audience; Endogenous production of deductive rules in a lexical-semantic network With a lexical-semantic network, it is possible to discover rule inductively from known facts. These rules are instrumental in reducing missing information in the network. In order to minimize emergence of relations that could be erroneous, we approached the question of polysemy and a filtering on rules presenting exceptions is realized.; A partir d'un réseau lexico-sémantique, il est possible de générer des règles de façon inductive à partir des faits présents. Ces règles permettent de densifier le réseau et d'en réduire les silences. Afin de minimiser l'émergence de relations qui pourraient être erronées, la question de la polysémie est abordée et un filtrage sur les règles présentant des exceptions est réalisé.

L’extraction d’information ouverte permet la création de larges collections de triplets relationnels à partir de corpus de textes non structurés. Ces larges collections de triplets extraits contiennent souvent une grande quantité de triplets bruités n’apportant aucune information utile. Ces collections peuvent atteindre des tailles rendant la validation manuelle trop longue pour être réalisées par un petit groupe de personnes en un temps convenable et il serait dans bien des cas trop dispendieux pour ces équipes d’engager le personnel nécessaire pour cette tâche. L’utilisation de jeux à des fins de production participative a permis, lors de tâches similaires, de recueillir un grand ensemble de bénévoles. Nous nous sommes donc intéressés à inférer, à partir d’une de ces collections de triplets bruités qui fut précédemment générée à partir de techniques d’extraction d’information ouverte, un ensemble de connaissances potentiellement utiles et pertinentes et avons ensuite amorcé la validation de cette base de connaissances par l’intermédiaire d’une plateforme de jeux., Open information extraction techniques can generate a large amount of relation triplets from unstructured corpus of texts. These large collections of triplets often contain a good portion of noisy triplets that brings little to no usable information. These collections of triplets can become too large to be manually validated by most small teams in a reasonable amount of time and hiring the number of validators required for such task would be too costly for most teams. The use of games as a crowdsourcing tool has shown great success in acquiring a large pool of volunteer for the realization of similar tasks. We have therefore looked into the extraction of a set of useful knowledge from a rather large and noisy relation triplets collection that was previously extracted using an open information extraction tool. We have then started the process of validating the resulting knowledge base with the help of a games with a purpose platform.

The difficulty to manage risks in construction projects comes from their complexity. They are composed of many entities (activities, actors, contracts, resources, etc.) among which interactions exist at many levels and influence the system response. In turn, this response can influence the behaviour of some entities. In order to capture the complexity of the system, it is necessary to structure, model and share cross-disciplinary and interdisciplinary knowledge flows in a common and unifying framework. Because of this high complexity, the system response may appear as unpredictable. Uncertainties at all scales are source of risk for the construction project itself. Tackling this complexity could improve our grasp of the whole system, in order to provide more robust and efficient decision alternatives in risk management. It is then essential to propose conceptual approaches able to represent the behaviour and the interactions of system entities over the time.Different approaches and tools have been proposed to model and simulate risk of construction project as Risk Breakdown Structure, Bayesian networks, Network Theory, Monte Carlo Simulation, Analytical Network Process, etc. These tools and methods can be used to simulate the behaviour of the system, but they are inadequate for representing large and complex dynamical system because they are based on case-dependant model (i.e. a specific model has to be built for each studied construction project), the fragmented representation of knowledge, the lack of common vocabulary, the lack of generic character. Hence, an ontology paradigm is developed in order (a) to provide a common vocabulary able to represent the knowledge about construction projects and its risks, (b) to shape the structure (interrelations) between those identified database and (c) to represent construction project integrating as well technical, human, sustainability dimensions at different detailed levels of uncertainty.In this context, by coupling the advantages of ontology and Bayesian network, the framework of probabilistic relational model (PRM) will provide a practical mathematical formalism allowing to represent and simulate complex stochastic dynamical systems. PRMs extend the formalism of Bayesian networks by adding the notion of object paradigm where uncertainty attached to the system is then taken into account by quantifying probabilistic dependence between the properties of objects and other properties of related objects. To the best of our knowledge, this thesis report will be the first application in which PRM have been proposed to model and simulate construction project while accounting uncertainties.Therefore PRM is used to simulate the propagation of uncertainties existing in this complexdynamic and multi-scale system, which lead to construction project risk. A prototypal software framework has been developed to check the consistency and the viability of the concept. It will be shown how it can be used in order to predict the uncertain response of the system as well as to study how the overall response of the system is sensitive to local values or assumptions. Lastly, PRM will be applied for two case-studies (a road and bridge construction in Hue-Vietnam and another building project in France). Results show that the formalism of PRMs allows to (1) implement any kind of construction project, (2) to take uncertainty into account, (3) to simulate and predict the behaviour of system and (4) to derive information from partial knowledge., La gestion des risques est un enjeu majeur, mais difficile pour les projets de construction. La difficulté à gérer les risques dans les projets de construction vient de leur complexité. Ils sont composés de nombreuses entités (activités, acteurs, contrats, ressources, etc.) dont le comportement collectif influencent les comportements individuels. Afin de mieux appréhender et comprendre la complexité du système dans son ensemble, il est nécessaire de capitaliser et structurer la connaissance dans le but de proposer un modèle capable de décrire et simuler le comportement du système étudié. Cependant, la formalisation de tels modèles se confronte à de nombreuses difficultés : présence de facteurs humains, raretés de modèles, connaissances souvent expertes et qualitatives difficiles à formaliser, méconnaissance des mécanismes régissant certains processus, données parcellaires, hétérogènes et souvent imparfaites, échelles multiples, etc. L’objectif est de proposer des approches conceptuelles permettant d’assembler des morceaux de connaissances hétérogènes multi-sources et multi-échelles dans le but de proposer un modèle capable de réduire les incertitudes liées au fonctionnement, au devenir, à la conception et au pilotage des projets de construction.Différentes approches et outils ont été proposés pour modéliser et simuler les projets de construction : structure de répartition des risques, réseaux bayésiens, théorie des réseaux, simulation de Monte Carlo, réseau analytique, etc. Ces outils et méthodes sont utilisés pour simuler le comportement de systèmes, mais inadéquats pour représenter des systèmes complexes dynamiques à grandes échelles. Ils sont pour la plupart parcellaires et ne présentent pas ou peu de généricités. Dans ce contexte, les modèles relationnels probabilistes (MRPs) fourniront un formalisme mathématique pratique permettant de représenter et de simuler des systèmes dynamiques complexes entachés d’incertitudes. Les MRPs étendent le formalisme des réseaux bayésiens en ajoutant la notion de paradigme objet où l'incertitude attachée au système est alors prise en compte en quantifiant la dépendance probabiliste entre les propriétés des objets.Pour ce faire, une ontologie du domaine a été développée pour (a) fournir un vocabulaire commun capable de représenter les connaissances sur les projets de construction, (b) identifier les interconnections entre les différentes entités techniques, humaines, économiques à différents niveaux de description. Guidé par cette ontologie unMRP a été élaboré et utilisé pour simuler le comportement des projets de construction tout en prenant en compte les incertitudes. On montrera comment il peut être utilisé pour prédire la réponse incertaine du système ainsi que pour étudier comment la réponse globale du système est sensible aux valeurs ou hypothèses locales. Enfin, le MRP sera utilisé pour deux études de cas (la construction de routes et de ponts à Hue-Vietnam et d’un bâtiment en France). Les résultats montrent que le formalisme des MRPs permet (1) d’instancier tout type de projets de construction, (2) de prendre en compte l'incertitude, (3) de simuler et prédire le comportement du système et (4) d’extraire de la connaissance à partir d’informations partielles.

Controlled Natural Languages (CNL) are artificial languages that use a subset of the vocabulary, morphological forms and syntactical constructions of a natural language while eliminating its polysemy. In a way, they constitute the bridge between formal languages and natural languages. Therefore, they perform the communicative function of the textual mode while being precise and computable by the machine without any ambiguity. In particular, they can be used to facilitate the population or update of knowledge bases within the framework of a human-machine interface.Since 1971, the French Marine Hydrographic and Oceanographic Service (SHOM) issues the French Coast Pilot Books Instructions nautiques , collections of general, nautical and statutory information, intended for use by sailors. These publications aim to supplement charts, in the sense that they provide the mariner with supplemental information not in the chart. They are mandatory for fishing and commercial ships. On the other hand, the International Hydrographic Organization (IHO) issued standards providing information about navigational data exchange. Among these standards, one of a particular interest is the universal model of hydrographic data (S-100 standard, January, 2010).This thesis analyses the use of a CNL to represent knowledge contained in the Instructions nautiques. This CNL purpose is to act as a pivot between the writing of the text by the dedicated operator, the production of the printed or online publication, and the interaction with knowledge bases and navigational aid tools. We will focus especially on the interaction between the Instructions nautiques Controlled Natural Language and the corresponding Electronic Navigational Charts (ENC).More generally, this thesis asks the question of the evolution of a CNL and the underlying ontologies involved in the Instructions nautiques project. Instructions nautiques have the particularity of combining both strictness (numerical data, electronic charts, legislation) and a certain amount of flexibility (text writing by human operators, unpredictability of the knowledge to be included due to the evolution of sailors¿ practices and needs). We define in this thesis a dynamic CNL in the same way that dynamic ontologies are defined in particular domains. The language described in this thesis is intended as an interesting contribution for the community involved in CNL. Indeed, it addresses the creation of a CNL for the unexploited domain of maritime navigation, but its hybrid aspects as well through the exploration of the multiple modalities (textual and visual) coexisting in a corpus comprising ENC and their companion texts. The mechanisms of the CNL presented in this thesis, although developed for the domain of the maritime navigation, have the potential to be adapted to other domains using multimodal corpuses. Finally, the benefits in the future of a controlled hybrid language are undeniable: the use of the different modalities in their full potential can be used in many different applications (for example, the exploitation of the visual modality for a 3D extension).; Les langages contrôlés sont des langages artificiellement définis utilisant un sous-ensemble du vocabulaire, des formes morphologiques, des constructions syntaxiques d'une langue naturelle tout en en éliminant la polysémie. En quelque sorte, ils constituent le pont entre les langages formels et les langues naturelles. De ce fait, ils remplissent la fonction de communication du médium texte tout en étant rigoureux et analysables par la machine sans ambiguïté. En particulier, ils peuvent être utilisés pour faciliter l'alimentation de bases de connaissances, dans le cadre d'une interface homme-machine.Le Service Hydrographique et Océanographique de la Marine (SHOM) publie depuis 1971 les Instructions nautiques, des recueils de renseignements généraux, nautiques et réglementaires, destinés aux navigateurs. Ces ouvrages complètent les cartes marines. Elles sont obligatoires à bord des navires de commerce et de pêche. D'autre part, l'Organisation Hydrographique Internationale (OHI) a publié des normes spécifiant l'échange de données liées à la navigation et notamment un modèle universel de données hydrographiques (norme S-100, janvier 2010). Cette thèse se propose d'étudier l'utilisation d'un langage contrôlé pour représenter des connaissances contenues dans les Instructions nautiques, dans le but de servir de pivot entre la rédaction du texte par l'opérateur dédié, la production de l'ouvrage imprimé ou en ligne, et l'interaction avec des bases de connaissances et des outils d'aide à la navigation. En particulier on étudiera l'interaction entre le langage contrôlé des Instructions nautiques et les cartes électroniques correspondantes. Plus généralement, cette thèse se pose la question de l'évolution d'un langage contrôlé et des ontologies sous-jacentes dans le cadre d'une application comme les Instructions nautiques, qui ont la particularité d'avoir des aspects rigides (données numériques, cartes électroniques, législation) et des aspects nécessitant une certaine flexibilité (rédaction du texte par des opérateurs humains, imprévisibilité du type de connaissance à inclure par l'évolution des usages et des besoins des navigants). De manière similaire aux ontologies dynamiques que l'on rencontre dans certains domaines de connaissance, on définit ici un langage contrôlé dynamique. Le langage contrôlé décrit dans cette thèse constitue une contribution intéressante pour la communauté concernée puisqu'il touche au domaine maritime, domaine encore inexploité dans l'étude des langages contrôlés, mais aussi parce qu'il présente un aspect hybride, prenant en compte les multiples modes (textuel et visuel) présents dans le corpus constitué par les Instructions nautiques et les documents qu'elles accompagnent. Bien que créé pour le domaine de la navigation maritime, les mécanismes du langage contrôlé présentés dans cette thèse ont le potentiel pour être adaptés à d'autres domaines utilisant des corpus multimodaux. Enfin, les perspectives d'évolution pour un langage contrôlé hybride sont importantes puisqu'elles peuvent exploiter les différents avantages des modes en présence (par exemple, une exploitation de l'aspect visuel pour une extension 3D).

The energy transition is a decisive issue of the XXIth century, particularly in relation to the reduction of the harmful consequences of the climatic changes. However, this transition is subjected to several hazards : economic, geologic, social, environmental and geopolitical ones. In order to evaluate the vulnerability and the conditions of feasibility of the energy transition scenarios it is necessary to be able to evaluate the supply chain of the technologies related to the energy system, in the technological and but also geographical dimensions.The current studies such as the life cycle assessments (LCA) allow to take into account the supply chain in the technological dimension, but these studies do not provide or only few information about the geographical dimension. At the opposite, the Input-Output Analysis (IOA), particularly the multiregional ones (MRIO) provide an information about the regional exchanges by categories of products, but are very aggregated. The nomenclatures of the economical activities and the categories of products taken into account are restricted. The works realized within this thesis aim to exploit the best of each tool, i.e. the technological information from the LCA and the geographical information from the MRIO. A new methodology is proposed to regionalize the LCA inventory with the MRIO data. This methodology allows to use the geographical information of the LCA data when it exists or otherwise use the geographical information from MRIO to estimate it. A particular attention is paid to get a realistic model, i.e. to match the activities and the products with real geographical data.The tools produced in this thesis are the first step to evaluate the energy transition scenarios. Particularly, they allow to realize regionalized LCA inventories to evaluate the needs and impacts of the technologies involved in the energy transition. However, additional works are necessary to take into account the temporal dimension of the energy transition scenarios.The new method needs to manipulate a lot of different data from different sources. In order to manage these data a new collaborative web platform has been set up. It allows to manipulate the data through a web interface as well as uses them in calculation frameworks. In order to facilitate the evolution of the tools and the manipulation of the data, a work about how to structure and manipulate the information was realized. A new semantic architecture — called computer ontology — has been developed to facilitate the management of the knowledges but also the maintenance and the integration of new knowledges. The collaborative framework can fit the specifications for a one person usage or a community., La transition énergétique est un enjeu crucial du XXIème siècle, en particulier pour réduire les conséquences néfastes du changement climatique. Cependant, cette transition est sujette à de nombreux risques : économiques, géologiques, sociaux, environnementaux et géopolitiques. Afin de pouvoir évaluer la vulnérabilité et les conditions de faisabilité des scénarios de transition énergétique, il est nécessaire de pouvoir évaluer la chaine de valeur technologique et géographique des technologies impliquées dans le système énergétique.Les outils actuels tels que les analyses de cycle de vie (ACV) permettent de prendre en compte la chaine de valeur technologique, mais les données relatives aux ACV ne fournissent pas ou peu d’information sur la chaine de valeur géographique. Les modèle d’entrées-sorties économiques (IOA), en particulier ceux mutlirégionaux (MRIO), s’ils fournissent des données sur les échanges économiques bilatéraux, donc une estimation des échanges régionalisés, sont des modèles très agrégés. Les nomenclatures des activités économiques et des catégories de produits prisent en compte sont restreintes. Le travail réalisé au sein de cette thèse vise à exploiter les informations des outils ACV et MRIO, profitant des avantages de chacun, c’est à dire l’information technologique des premiers et l’information régionalisée des seconds. Une nouvelle méthodologie est proposée pour régionaliser les inventaires de cycle de vie d’ACV à partir des données MRIO. Cette méthodologie permet, à partir d’une base de données ACV de processus industriels, d’exploiter l’information géographique des processus lorsqu’elle existe et d’exploiter les informations d’échanges économiques bilatéraux des MRIO pour estimer cette information lorsqu’elle n’existe pas. Un soin particulier est pris afin de faire correspondre les activités et les produits selon leurs géographies.Les outils qui découlent de ces travaux sont la première étape à l’évaluation des scénarios de la transition énergétique. En particulier, ils permettent de réaliser des inventaires de cycle de vie régionalisés pour évaluer les besoins et les impacts des technologies impliquées dans la transition énergétique. Cependant, des travaux supplémentaires sont nécessaires pour prendre en compte la dimension temporelle des scénarios de transition énergétique.Cette nouvelle méthode nécessite l’usage de nombreuses données de sources différentes. Afin de gérer ces données, une plateforme internet collaborative a été mise en place, qui permet de dissocier la gestion des données de leur usage. Une réflexion sur la gestion de la donnée a amené à penser de manière différente la structure des données relatives à l’écologie industrielle. Une nouvelle architecture sémantique, aussi appelée ontologie, a été développée pour faciliter la gestion des données, mais aussi leur maintient et leur évolution dans le temps, que ce soit pour un utilisateur unique, ou dans le cadre d’une gestion collaborative.

National audience; With the digital transition, the evolution of arrangements for the dissemination of journals in Social Sciences and Humanities (SSH) leads to changes in the methods and tools used by librarians on how to report online access and to face the vast and scattered amount of information available as well as the diverse business models and the question of open access. The need to control the metadata operated and to acquire specific skills has led to the establishment of the Mir@bel project. This library and information network produces a shared knowledge base, gateway to journals, which includes commercial packages such as open access journals. Information on access available online (full text, abstracts, tables of contents) is enriched with additional external links. The partners share the intelligence on journals and control the flow of data aggregated automatically from the four main french language platforms (Cairn.info, Érudit, Persée, Revues.org). The development and organization of the network, its international openness and diversification of partnerships, such as changes in working practices, are other significant results of the project. Mir@bel sketches what could be an information tool for journals, extended to all facets of their digital presence.; Liée à la transition numérique, l'évolution des modalités de diffusion des revues en Sciences humaines et sociales (SHS) entraîne une évolution des méthodes et outils mis en œuvre par les professionnels de l'information pour signaler les accès en ligne et faire face à la très grande quantité d'information disponible, à sa dispersion, aux modèles économiques variés et à la question de l'accès ouvert. La nécessité de maîtriser les métadonnées opérées et d'acquérir des compétences spécifiques a conduit à la mise en place du projet Mir@bel. Ce réseau documentaire produit une base de connaissance mutualisée, porte d'entrée sur les revues, qui intègre les bouquets commerciaux comme les revues en libre accès. L'information sur les accès en ligne disponibles (texte intégral, résumés, sommaires) est enrichie de liens rebonds complémentaires. Les partenaires se partagent la veille sur les revues et contrôlent les flux de données agrégés automatiquement depuis les quatre principaux portails francophones (Cairn.info, Érudit, Persée, Revues.org). Le développement et l'organisation du réseau, son ouverture internationale et la diversification des partenariats, comme l'évolution des pratiques professionnelles, sont d'autres acquis significatifs du projet. Mir@bel esquisse ce que pourrait être un outil documentaire pour les revues, étendu à toutes les facettes de leur présence numérique.

With the digital transition, the evolution of arrangements for the dissemination of journals in Social Sciences and Humanities (SSH) leads to changes in the methods and tools used by librarians on how to report online access and to face the vast and scattered amount of information available as well as the diverse business models and the question of open access. The need to control the metadata operated and to acquire specific skills has led to the establishment of the Mir@bel project. This library and information network produces a shared knowledge base, gateway to journals, which includes commercial packages such as open access journals. Information on access available online (full text, abstracts, tables of contents) is enriched with additional external links. The partners share the intelligence on journals and control the flow of data aggregated automatically from the four main french language platforms (Cairn.info, Érudit, Persée, Revues.org). The development and organization of the network, its international openness and diversification of partnerships, such as changes in working practices, are other significant results of the project. Mir@bel sketches what could be an information tool for journals, extended to all facets of their digital presence., Liée à la transition numérique, l'évolution des modalités de diffusion des revues en Sciences humaines et sociales (SHS) entraîne une évolution des méthodes et outils mis en œuvre par les professionnels de l'information pour signaler les accès en ligne et faire face à la très grande quantité d'information disponible, à sa dispersion, aux modèles économiques variés et à la question de l'accès ouvert. La nécessité de maîtriser les métadonnées opérées et d'acquérir des compétences spécifiques a conduit à la mise en place du projet Mir@bel. Ce réseau documentaire produit une base de connaissance mutualisée, porte d'entrée sur les revues, qui intègre les bouquets commerciaux comme les revues en libre accès. L'information sur les accès en ligne disponibles (texte intégral, résumés, sommaires) est enrichie de liens rebonds complémentaires. Les partenaires se partagent la veille sur les revues et contrôlent les flux de données agrégés automatiquement depuis les quatre principaux portails francophones (Cairn.info, Érudit, Persée, Revues.org). Le développement et l'organisation du réseau, son ouverture internationale et la diversification des partenariats, comme l'évolution des pratiques professionnelles, sont d'autres acquis significatifs du projet. Mir@bel esquisse ce que pourrait être un outil documentaire pour les revues, étendu à toutes les facettes de leur présence numérique.

Effective management of large amounts of information has become a challenge increasinglyimportant for information systems. Everyday, new information sources emerge on the web. Someonecan easily find what he wants if (s)he seeks an article, a video or a specific artist. However,it becomes quite difficult, even impossible, to have an exploratory approach to discover newcontent. Recommender systems are software tools that aim to assist humans to deal withinformation overload. The work presented in this Phd thesis proposes an architecture for efficientrecommendation of news. In this document, we propose an architecture for efficient recommendationof news articles. Our ontological approach relies on a model for precise characterization of itemsbased on a controlled vocabulary. The ontology contains a formal vocabulary modeling a view on thedomain knowledge. Carried out in collaboration with the company Actualis SARL, this work has ledto the marketing of a new highly competitive product, FristECO Pro’fil., La gestion efficace de grandes quantités d’informations est devenue un défi de plus en plus importantpour les systèmes d’information. Tous les jours, de nouvelles sources d’informations émergent surle web. Un humain peut assez facilement retrouver ce qu’il cherche, lorsqu’il s’agit d’un article,d’une vidéo, d’un artiste précis. En revanche, il devient assez difficile, voire impossible, d’avoir unedémarche exploratoire pour découvrir de nouveaux contenus. Les systèmes de recommandationsont des outils logiciels ayant pour objectif d’assister l’humain afin de répondre au problème desurcharge d’informations. Les travaux présentés dans ce document proposent une architecturepour la recommandation efficace d’articles d’actualité. L’approche ontologique utilisée repose surun modèle permettant une qualification précise des items sur la base d’un vocabulaire contrôlé.Contenu dans une ontologie, ce vocabulaire constitue une modélisation formelle de la vue métier surle domaine traité. Réalisés en collaboration avec la société Actualis SARL, ces travaux ont permis lacommercialisation d’un nouveau produit hautement compétitif, FristECO Pro’fil.

National audience; Main scientific interest, principles and procedures of organisation of numerized ‘data-base’ as 'source of knowledges' were critically described in the special issue of « Cellulose Chemistry and Technology, 2006, 40 (9-10) : 685-690 » focussed on lignin and plant cell walls chemistry and technology, outlined by some glance on the emergence of scientific concepts in the cases of cellulose, lignin and plants cell wall chemistry. A free public acces of this paper in Prodinra, is paper is freely at « http://prodinra.inra.fr/record/32691 ». The corresponding practical organisation of the related sets of electronic files as ‘documentary recollection’, named ReDoc for ‘Recueil documentaire’ in French, developed at INRA are illustrated here in one of the complete four specific domains 'C', biological chemistry, of the ReDoc data base.

International audience; 3 Université d'Aix-Marseille-LSIS 4 Kware {vincent.bouvier, patrice.bellot}@lsis.org RÉSUMÉ. La tâche de désambiguïsation des entités nommées consiste à lier une mention ambiguë d'une entité dans un document à l'entité correspondante dans une base de connaissances. Dans ce travail, nous nous plaçons dans un cadre applicatif "inverse" et nous ajoutons une contrainte temporelle : nous souhaitons surveiller un flux de nouveaux documents Web et déterminer quels sont ceux mentionnant une entité donnée tout en mesurant l'importance de l'information conte-nue. Une telle approche peut servir à recommander des documents à des contributeurs si une information mérite d'être ajoutée dans la base de connaissances cible. Notre approche repose sur l'utilisation de deux classifieurs prenant en compte, pour déterminer l'intérêt d'un document du flux, des indices comme la fréquence de mentions de l'entité dans le temps ou dans le document, sa position ou encore la présence d'entités liées connues. Notre approche et l'impact des paramètres utilisés ont été évalués via une participation à la tâche "Knowledge Base Acce-leration" de TREC 2012 et a positionné notre équipe au rang 3 sur 11 (Bonnefoy et al., 2012). ABSTRACT. Name entity disambiguation is the task of linking an ambiguous name in a document to the unique real-world entity in a kwnoledge base (KB) its represents. We took the opposite problem and add a time constraint : we monitor a data stream to detect in real-time documents about an entity from a KB and determine to what extent the information in those documents matter. It could be used to reduce time lag between the moment a new important information about an entity shows up and the moment it is added to the knowledge base. We used Random Forests combined with time-related features (eg. count of mentions in time) and document and related entities centric features to tackle this problem. The effectiveness and impact of the features used have been evaluated through our participation to the "Knowledge Base Acceleration" task at TREC 2012 and positionned our team rank 3 on 11 (Bonnefoy et al., 2012). MOTS-CLÉS : entité nommée, base de connaissances, kba, trec, flux

Knowledge Engineering (KE) provides resources to build a conceptual model from experts’ knowledge which is sometimes deficient to interpret the input data flow coming from a concrete process. On the other hand, data mining techniques in a process of Knowledge Discovery in Databases (KDD) can be used in order to obtain representative patterns of data which could allow to improve the model to be constructed. However, interpreting these patterns is difficult due to the gap which exists between the expert’s conceptual universe and that of the process instrumentation. This chapter proposes then a global approach which combines KE with KDD in order to allow the construction of Knowledge Models for Knowledge Based Systems from expert knowledge and knowledge discovered in data. This approach is grounded in the Theory of Timed Observations on which both a KE methodology and a KDD process are based, so that the resulting models can be compared.

This thesis is part of a multidisciplinary project, the DRAMA project, which attempts to generate 3D virtual scenes from the descriptions which are obtained from theatrical text. This project aims to simplify, as soon as possible, the tasks of the end-users by providing simple, fast, and effective tools. Thus, the technique used in this study is focused on the declarative modeling of virtual environments that is based on three phases (description, generation and management of knowledge). The description phase allows the designer to describe the environment from a set of properties, interpreted as a set of constraints for a generation system which produces one or several virtual environments solutions. This project, new tagging methods have been proposed to detect essential for the creation of scene, including information on the placement of objects. In addition, users can also run queries in the text from these tags. Placement properties are translated into spatial constraints with the data originally stored in a knowledge base that uses XML. A technique adopting the method of metaheuristics is then used for solving constraints. The object physical properties (collision, gravity, friction) were also managed from a physics engine. At the end, the finals scenes solutions were be proposed to the user, using a 3D rendering engine., Cette thèse s'inscrit dans le cadre d'un projet pluridisciplinaire, le projet DRAMA, qui consiste à générer des scènes virtuelles 3D à partir des descriptions contenues dans les textes théâtraux. L'un des objectifs de ce projet consiste à simplifier au maximum la tâche des utilisateurs finaux en leur offrant un outil simple, rapide, et efficace. Ainsi, la technique adoptée dans cette étude est axée sur la modélisation déclarative d'environnements virtuels qui s'appuie sur trois phases (description, génération et prise de connaissances). La phase de description permet au concepteur de décrire l'environnement à partir d'un ensemble de propriétés, interprétées en un ensemble de contraintes destinées à un système de génération qui produit un ou plusieurs environnements virtuels solutions.Dans le cadre de ce projet DRAMA, des nouvelles méthodes de balisage ont été proposées afin de détecter les éléments essentiels pour la création d'une pièce théâtrale, notamment les informations sur les placements d'objets. Par ailleurs, les utilisateurs peuvent, aussi, lancer des requêtes au niveau du texte à partir de ces balises. Les propriétés sur les placements seront traduites en contraintes spatiales grâce aux données initialement stockées dans une base de connaissance qui utilise le langage XML. Une technique adoptant la méthode des métaheuristiques est ensuite utilisée pour la résolution des contraintes de placements obtenues précédemment. La gestion des propriétés physiques des objets (collision, gravité, friction) a été aussi gérée à partir d'un moteur physique. À la fin, les scènes solutions finales seront proposées à l'utilisateur, en utilisant un moteur de rendu 3D.

The documentary heritage of firms has often been accumulated without that they could adapt to the pace of ICT developments. Collective memory that never stops being produced sees its mass growing, becomes scattered and heterogeneous, and many companies today face transverse problems struggle to mobilize their knowledge operationally. We present here the specific case of the Nuclear Engineering Division of EDF France and the need to upgrade its information heritage. We explain why a job of contextualization is essential these cases, to locate the operating mode of the information system in a largest structural problem, technical aspects having to be quickly overwhelmed in order to consider the organization as a whole. In this context, where micro and macro issues mingle, the core business of the company emerges as the basis for any reflection. Documentation produced and used, vehicles the technical knowledge of the company, which is expressed by specific business core's concepts. Their terminology is the key to knowledge enhancement and a better management of the documentary heritage through which they pass. Through the example of the DIN, we present our approach resolutely empirical and qualitative, to evolve the system to a knowledge base centered on the "business core meaning" of the company., Le patrimoine documentaire des entreprises s'est souvent accumulé sans que ces dernières puissent s'adapter au rythme des évolutions des TIC. La mémoire collective qui ne cesse d'être produite voit sa masse croître, est devenue éparse et hétérogène et nombre d'entreprises aujourd'hui confrontées à des problématiques transverses ont du mal à mobiliser leurs connaissances de façon opérationnelle. Nous présentons ici le cas de la Division Ingénierie Nucléaire (DIN) d'EDF et la nécessité de valoriser son patrimoine informationnel. Nous exposons pourquoi un travail amont de contextualisation est essentiel dans des cas comme celui-ci, afin de situer le mode de fonctionnement du système d'information dans une problématique structurelle, les aspects techniques devant être rapidement dépassés pour prendre en compte l'organisation dans sa globalité. Dans ce contexte où problématiques micro et macro se confondent, les métiers cœurs de l'entreprise s'imposent comme la base de toute réflexion. La documentation qu'ils produisent et utilisent véhicule les connaissances techniques de l'entreprise, qui y sont exprimées par des concepts propres aux métiers. Leur terminologie est la clé permettant de valoriser les connaissances et de mieux gérer le patrimoine documentaire par lequel elles transitent. A travers l'exemple de la DIN, nous présentons notre approche résolument empirique et qualitative, pour faire évoluer le système existant vers une base de connaissances centrée sur le " sens métier " de l'organisation. Mots-clés : patrimoine documentaire, document technique, gestion des connaissances, base de connaissances, ontologie, terminologie.

Documentary heritage of firms has often accumulated without that they can adapt to the pace of information technologies' developments. Collective memory ever to be produced sees its mass growing and becomes scattered and heterogeneous. Like many companies, cross-cutting issues today impose the EDF Nuclear Engineering Division (DIN) being able to mobilize its knowledge operationally. But the valuation of its information heritage goes far beyond technical aspects to take into account the organization as a whole. These are indeed the core business of the company which are the starting point of our reflection. In this engineering context the technical knowledge pass through the documentation and is expressed by specific business concepts. The terminology of trades is the key to valorize the knowledge and better manage the patrimony of the DIN. It allows us to go towards an explicit representation, in a knowledge base centered on the "business sense" of the organization. Our approach resolutely empirical and qualitative results in a method of constructing a trades' knowledge base applied to a delimited area of the EDF Nuclear Engineering Division., Le patrimoine documentaire des entreprises s'est souvent accumulé sans que ces dernières puissent s'adapter au rythme des évolutions des technologies de l'information. La mémoire collective qui ne cesse d'être produite voit sa masse croître et est devenue éparse et hétérogène. Comme nombre d'entreprises, des problématiques transverses imposent aujourd'hui à la Division Ingénierie Nucléaire (DIN) d'EDF d'être capable de mobiliser ses connaissances de façon opérationnelle. Mais la valorisation de son patrimoine informationnel dépasse largement les aspects techniques pour prendre en compte l'organisation dans sa globalité. Ce sont en effet les métiers cœurs de l'entreprise qui sont le point de départ de notre réflexion. Dans ce contexte d'ingénierie c'est par la documentation que les connaissances techniques transitent et sont exprimées par des concepts propres aux métiers. La terminologie métiers est la clé permettant de valoriser les connaissances et de mieux gérer le patrimoine de la DIN. Elle nous permet d'aller vers une représentation explicite, au sein d'une base de connaissances centrée sur le " sens métier " de l'organisation. Notre approche résolument empirique et qualitative aboutit à une méthode de construction d'une base de connaissances métiers appliquée à un domaine délimité de la Division Ingénierie Nucléaire d'EDF.

The domain of the machine translation does not offer perfect tools, but they can be useful to understand the general sense of a text. They are generally more successful when texts deal with a specific domain. The knowledge bases of Semantia are designed for a predefined domain. We are wondering how to adapt a knowledge base to the other languages. Two solutions were envisaged and are going to be tested. We can arrange several knowledge bases and each of them will correspond to a language, or we can use a machine translation system with a single knowledge base., Le domaine de la traduction automatique ne propose pas d'outils parfaits, mais ils se révèlent utiles pour saisir le sens général d'un texte. Ils sont généralement plus performants lorsque les textes traitent d'un domaine en particulier. Les bases de connaissances de Semantia sont justement créées pour un domaine prédéfini. Nous nous sommes interrogée sur la façon d'adapter une base de connaissances Semantia à d'autres langues. Deux solutions ont été envisagées et vont être évaluées. Nous pouvons disposer de plusieurs bases de connaissances et à chacune d'entre elles correspondra une langue, ou nous pouvons utiliser un système de traduction automatique avec une seule base de connaissances.

This paper presents the linguistic data processing sequence built for a tourism web portal. The first steps of this sequence are the detection and the annotation of the temporal expressions found in the web pages. These tasks are performed using linguistic patterns. They lead to many questions which we try to answer, such as the definition of information to detect, annotation format and constraints. In the next step this annotated data is used to populate a tourism ontology. We present the acquisition rules which are necessary to enrich the portal knowledge base. Then we present an evaluation of our annotation system. This evaluation is able to judge the detection of the temporal expressions and their annotation., Cet article présente la chaîne de traitement linguistique réalisée pour la mise en place d'une plateforme touristique sur Internet. Les premières étapes de cette chaîne sont le repérage et l'annotation des expressions temporelles présentes dans des pages Web. Ces deux tâches sont effectuées à l'aide de patrons linguistiques. Elles soulèvent de nombreux questionnements auxquels nous tentons de répondre, notamment au sujet de la définition des informations à extraire, du format d'annotation et des contraintes. L'étape suivante consiste en l'exploitation des données annotées pour le peuplement d'une ontologie du tourisme. Nous présentons les règles d'acquisition nécessaires pour alimenter la base de connaissance du projet. Enfin, nous exposons une évaluation du système d'annotation. Cette évaluation permet de juger aussi bien le repérage des expressions temporelles que leur annotation.

In this work, we were interested in automatic feeding of a knowledge base for innovation aid. This process relies on domain ontology. The knowledge base is organized around innovation operators. It is initialized by an expert who must define the operators and their associated innovation resources. Then the automatic feeding system allows the enrichment of this base by examples of inventive problemsolving from natural language texts. This system implements a new information extraction approach. This approach is not specific to the innovation domain and can be adapted to other problems for extracting information in other domains., Dans ce travail nous nous sommes intéressés à l'alimentation automatique d'une base de connaissances pour l'aide à l'innovation. Ce processus s'appuie sur une ontologie du domaine. La base de connaissances est organisée autour des opérateurs d'innovation. Cette base est initialisée par un expert qui doit définir les opérateurs concernés et les ressources associées. Le système d'alimentation automatique permet alors l'enrichissement de cette base par des exemples de résolution de problèmes d'innovation à partir de textes en langue naturelle. Ce système met en oeuvre une nouvelle approche pour l'extraction automatique d'informations. Cette approche n'est pas spécifique à l'innovation et peut être adaptée à d'autres problèmes d'extraction d'informations dans d'autres domaines.

This thesis studies the use of ontology and knowledge base for guiding various steps of the Knowledge Discovery in Databases (KDD) process in the domain of pharmacogenomics.Data related to this domain are heterogeneous, complex, and disseminated through several data sources. Consequently, the preliminary step that consists in the preparation and the integration of data is crucial. For guiding this step, an original approach is proposed, based on a knowledge representation of the domain within two ontologies in description logics: SNP-Ontology and SO-Pharm. This approach has been implemented using semantic Web technologies and leads finally to populating a pharmacogenomic knowledge base. As a result, data to analyze are represented in the knowledge base, which is a benefit for guiding following steps of the knowledge discovery process. Firstly, I study this benefit for feature selection by illustrating how the knowledge base can be used for this purpose. Secondly, I describe and apply to pharmacogenomics a new method named Role Assertion Analysis (or RAA) that enables knowledge discovery directly from knowledge bases. This method uses data mining algorithms over assertions of our pharmacogenomic knowledge base and results in the discovery of new and relevant knowledge., Cette thèse porte sur l'utilisation d'ontologies et de bases de connaissances pour guider différentes étapes du processus d'Extraction de Connaissances à partir de Bases de Données (ECBD) et sur une application en pharmacogénomique. Les données relatives à ce domaine sont hétérogènes, complexes, et distribuées dans diverses bases de données, ce qui rend cruciale l'étape préliminaire de préparation et d'intégration des données à fouiller. Je propose pour guider cette étape une approche originale d'intégration de données qui s'appuie sur une représentation des connaissances du domaine sous forme de deux ontologies en logiques de description : SNP-Ontology et SO-Pharm. Cette approche a été implémentée grâce aux technologies du Web sémantique et conduit au peuplement d'une base de connaissances pharmacogénomique. Le fait que les données à fouiller soient alors disponibles dans une base de connaissances entraîne de nouvelles potentialités pour le processus d'extraction de connaissances. Je me suis d'abord intéressé au problème de la sélection des données les plus pertinentes à fouiller en montrant comment la base de connaissances peut être exploitée dans ce but. Ensuite j'ai décrit et appliqué à la pharmacogénomique, une méthode qui permet l'extraction de connaissances directement à partir d'une base de connaissances. Cette méthode appelée Analyse des Assertions de Rôles (ou AAR) permet d'utiliser des algorithmes de fouille de données sur un ensemble d'assertions de la base de connaissances pharmacogénomique et d'expliciter des connaissances nouvelles et pertinentes qui y étaient enfouies.

Methods of the knowledge structuring in mechanical design, based on functional approaches are analysed and compared. A semantic analysis conducted in conjunction with functional analysis has showed that it is difficult to carry out a database if the diversity of verbs used is not reduced or limited. We propose an energy approach based on the Law of System discrete direct differentiation method, Completeness. The achievement of a function goes through the transformation of an energy converter, this energy is transmitted by a transmitter and used by the operator to perform the action, and the operator can only be a transmitter or a converter. Thus, we reduce the system to 3 entities plus the entity of Control/Order. Moreover, we note that we limit, as first level, action verbs to two verbs such as convert and transmit. This first level will be followed by the one which includes more accurate synonyms verbs associated with supplements that are directly associated with identified components. Thus we can define a taxonomy that allows you to build a knowledge base of components based on energy, transformation and transmission. It is associated with an organic structure systematic and repeatable at each level of analysis. A preliminary design method is developed from the use of a aforesaid database. The energy analysis of the implementation of the action allows building a technical flowchart particular technical and to choose in the database of components such as converters and transmitters. Then, we proceed to the arrangement of these components and select the standard interaction components basing on logics, similar to the mechanisms theory. The next phase consists to recover the associated physical models (law of the energy conservation) in the database and select the produced effects and then induced effects in order to achieve a global model system for use in preliminary design. The result of simulation can calculate variables related to the assessment criteria of functional requirement that give the elements of a decision support. The study of a wind turbine system, particularly the design of the gearbox (transmitter) and its cooling system (controlling induced effects) serves as an example of the use of the database and the associated design method.; Résume : Les méthodes de structuration de la connaissance en conception, basées sur des visions fonctionnelles sont analysées et comparées. On procède à une analyse sémantique en liaison avec l'analyse fonctionnelle et on conclut qu'il est difficile de réaliser une base de données s'il on ne réduit pas la diversité des verbes utilisés. Nous proposons une vision énergétique à partir de la loi dite d'intégralité des parties qui décompose un système en entités particulières. La réalisation d'une fonction passe par la transformation d'une énergie par un convertisseur, cette énergie est transmise par un transmetteur et utilisée par l'opérateur pour exercer l'action, l'opérateur ne peut être qu'un transmetteur ou un convertisseur. Ainsi nous réduisons le système à 3 entités auxquelles s'ajoute l'entité de contrôle /commande. De surcroît, nous remarquons que nous limitons, au premier niveau, les verbes d'action à 2 verbes, convertir et transmettre. Ce premier niveau sera suivi de niveau auxquels comprenant des verbes synonymes plus précis associés à des compléments directement associés à des composants identifiés. Ainsi on peut définir une taxonomie qui permet de construire une base de connaissances de composants basée sur l'énergie, sa transformation et sa transmission. Cette base est associée à une structuration organique systématique et reproductible à chaque niveau d'analyse. Une méthode de conception préliminaire est élaborée à partir de l'utilisation de cette base. L'analyse énergétique de la réalisation de l'action permet de construire un organigramme technique particulier et de choisir dans la base des composants les convertisseurs et transmetteurs. Ensuite on procède à l'agencement de ces composants et on sélectionne les composants d'interaction standard à partir de logiques proche de la théorie des mécanismes. La phase suivante consiste à récupérer les modèles physiques associés (loi de conservation de l'énergie) dans la base et de sélectionner les effets produits puis induits afin de réaliser un modèle global du système utilisable en conception préliminaire. Les résultats de simulation permettent de calculer les variables liées aux critères d'appréciation de CdCF qui donnent les éléments d'aide à la décision. L'étude d'un système éolien, en particulier la conception du multiplicateur (transmetteur) et de son système de refroidissement (maîtrise des effets induits) sert d'exemple d'utilisation de la base et de la méthode de conception associée.

This thesis approaches the issues related to semantic annotation and ontology population within the framework defined by the Semantic Web. The explicit representation of the contents of the Web resources is possible thanks to domain ontologies. They model the concepts, their attributes and the relations used to annotate the contents of the documents. And the knowledge base, associated with the ontology, must contain the instances to be used for semantic annotation. The idea suggested here is to combine the Information Extraction tools (IE) with the WS knowledge representation ones for the tasks of annotation and population. But there is currently a gap between the formats of representation used by these tools. This thesis proposes to fill this gap by designing a mediator able to transform the tags generated by the IE tools into a more formal representation, being the semantic annotations or the ontology instances., Cette thèse aborde les problématiques liées à l'annotation sémantique et au peuplement d'ontologies dans le cadre défini par le Web Sémantique. La représentation explicite des contenus des ressources du Web est possible grâce aux ontologies. Elles modélisent les concepts, leurs attributs et les relations utilisées pour annoter le contenu des documents. Et la base de connaissance, associée à cette ontologie, doit contenir les instances à utiliser pour l'annotation sémantique. L'idée proposée ici est de combiner les outils d'extraction d'information (EI) avec les outils de représentation des connaissances du WS pour les tâches d'annotation et de peuplement. Mais il existe actuellement un fossé entre les formats de représentation utilisés par chacun de ces outils. Cette thèse propose de combler ce fossé en concevant un médiateur capable de transformer les étiquettes générées par les outils d'EI en une représentation plus formelle, que ce soit sous la forme des annotations sémantiques ou des instances d'une ontologie.

The purpose of this paper is to sketch a survey on how relations and structures are taken into account in various knowledge representation formalisms and tools: description logics, object-based knowledge representation systems, conceptual graphs, semantic web languages. We focus on the representation of relation properties, on the representation of relation-based inference rules, on the representation and classification of structures and composite objects. The paper ends with a discussion on the advantages of the various systems and a proposition of research issues and possible solutions.

Colloque avec actes et comité de lecture. internationale.; International audience; La capture, la mise en forme et l'exploitation de connaissances sur l'expertise ou les compétences d'un "objet" (comme un partenaire industriel, une personne, voire un composant logiciel) sont des problèmes cruciaux dans plusieurs types d'applications et particulièrement dans des applications distribuées coopératives ou des applications de type affaires électroniques (e-business) ou commerce électronique (e-commerce). Le travail décrit ici entre dans ce cadre. Il traite de la publication des capacités ou savoir-faire (que nous appellerons compétences) d'un "objet". Ces compétences sont organisées et structurées afin d'être exploitées pour la recherche d'objets pouvant satisfaire un objectif ou répondant à un besoin. En outre, nous nous fondons sur une représentation des connaissances par objets, utilisant les logiques de descriptions et sur un modèle d'architecture à base de médiateurs (traders) distribués et coopérants. Une des originalités de ce travail est la nature des réponses rendues lors d'une recherche. En effet, les réponses ne sont pas du type Oui/Non, mais elles peuvent être coopératives dans le sens où si aucun "objet" ne satisfait à lui tout seul une demande, on essaie de déterminer quels ensembles d'objets réunis la satisfont, chaque objet de l'ensemble ne la satisfaisant que partiellement. || The capture, the structuring and the exploitation of the expertise or the capabilities of an "object" (like an industrial partner, a person or a software component) are crucial problems in many types of applications, especially in cooperative and distribu

For major scientific and technical domains, traditional media (e.g. paper) are insufficient to handle the increasing volume and complexity of knowledge. Computers may offer efficient alternatives for the modelling, management and exploitation of knowledge. Such solutions are known as knowledge bases. In most domains, knowledge is not static and complete but rather evolving and being discovered. Consequently, a knowledge base must be built incrementally over time. Incremental means that we start with a small base, which grows with the acquisition of new knowledge. Many people may need to work together to build the knowledge base. This thesis studies the version management problem in the context of knowledge bases. It offers two main contributions. Firstly, we design and implement a version management system for knowledge bases. By definition, a version is a state of the base at a precise moment. Versions help to maintain a history of changes. They also allow decisions to be reversed and alternative hypotheses to be investigated. Secondly, we contribute to the design of an environment for incremental and concur- rent knowledge base building. We point out how our version system can be integrated into this environment., Dans de nombreux domaines scientifiques ou techniques, la quantité et la complexité croissantes des connaissances manipulées rendent inadéquate l'utilisation de supports classiques tels que le papier. L'informatique peut apporter une réponse en proposant un cadre pour modéliser, gérer et exploiter ces connaissances : on parle alors de bases de connaissances. Pour la plupart des domaines, la connaissance n'est pas statique et immédiatement disponible mais est au contraire en constante évolution au fur et à mesure des découvertes. Dés lors, une base de connaissances est construite de manière incrémentale. Incrémentale veut dire que l'on commence par construire une petite base qui est enrichie petit à petit par l'acquisition de nouvelles connaissances. Cette construction est partagée puisque plusieurs personnes doivent pouvoir travailler simultanément sur cette base afin de la bâtir. Cette thèse aborde la problématique de la gestion des versions pour les bases de connaissances. Ses apports sont de deux ordres. Nous avons tout d'abord conçu et réalisé un système de gestion de versions de bases de connaissances. Par définition, une version reflète un état de l'évolution de la base, c'est-à-dire de l'ensemble des structures et des valeurs des connaissances contenues dans celle-ci (à un moment donné). Les versions aident ainsi à contrôler l'historique des changements effectués au cours de la construction de la base. Elles permettent également un éventuel retour en arrière. Finalement, les versions permettent la formulation de différentes hypothèses de recherche et la gestion de leur évolution parallèle au cours du temps. Nous avons également contribué à la conception de l'environnement de construction incrémentale et partagée de bases de connaissances et montré comment notre système de versions s'intègre au sein de cet environnement.

International audience

This work presents the development of an expert system to aid the resumption of service of an electrical transmission network after a generalized incident.After an analysis of the service recovery problem and current solutions, a network model and the extracted knowledge are presented.The network model brings together in the form of an object-oriented database the data and behavior of a network in operation.The knowledge necessary for the system comes from the constraints imposed by driving, and from electrotechnical common sense rules.The study resulted in the creation of a prototype allowing the testing of different strategies developed from the extracted knowledge., Ce travail présente l'élaboration d'un système expert d'aide à la reprise de service d'un réseau électrique de transport après un incident généralisé.Après une analyse du problème de reprise de service et des solutions actuelles, un modèle de réseau et les connaissances extraites sont présentées.Le modèle de réseau regroupe sous la forme d'une base de données orientée objets les données et les comportements d'un réseau en conduite.Les connaissances nécessaires au système proviennent des contraintes imposées par la conduite, et de règles de bon sens électrotechniques.L'étude a abouti à la réalisation d'un prototype permettant le test de stratégies différentes élaborées à partir des connaissances extraites.

The paper puts forward a specification model for Decision Support Knowledge Bases. That model is intended for end-users as well as for professional developers. Specifications in this model must be easily mapped into widespread decision support tools such as spreadsheet processors, data managers and small rule-based systems. The knowledge base is split into a data base and a rule base. The data base is described through its E/R conceptual schema, while the rule base consists of a set of variables and a set of rules that tell how to derive the values of the variables from external data (e.g. from the data base). The paper concentrates on expressing the rule base. It develops simple variables and their defining rules, then dimensioned variables, which are indexed with simple variable(s), and finally variables which take their values in the data base. A specification language is suggested as well. The text is not an axiomatic presentation of abstract concepts but follows a pedagogical structure that best matches the experience of end-users.

The doctoral thesis concerns the development and validation of the SYNOP expert system for the ergonomic evaluation and improvement of graphic views used in control rooms of industrial processes SYNOP uses a first-order inference engine and the concepts of frame and semantic network for knowledge representation. It is written in LISP language. Its knowledge bases contain ergonomic concepts for information presentation on graphic screens. Its evaluation module, as well as its expert and user interfaces, are detailed. The principles for developing and validating its ergonomic knowledge bases are explained. The thesis also describes the contribution of the SYNOP expert system to the evaluation and improvement of a graphical user interface in an industrial context. The thesis ends with several research perspectives.; La thèse concerne le développement et la validation du système expert SYNOP pour l'évaluation ergonomique et l’amélioration de vues graphiques exploitées dans les salles de contrôle de procédés industriels. SYNOP utilise un moteur d'inférence du premier ordre et les notions de frame et de réseau sémantique pour la représentation des connaissances. Il est écrit en langage LISP. Ses bases contiennent des concepts ergonomiques de présentation d'information sur écran graphique. Le module d'évaluation de SYNOP, ainsi que ses interfaces expert et utilisateur, sont détaillés. Les principes d'élaboration et de validation des bases de connaissances ergonomiques de SYNOP sont expliqués. Le mémoire décrit également la contribution du système expert SYNOP à l’évaluation et l’amélioration d'une interface graphique dans un contexte industriel. Le mémoire se termine par des perspectives d'évolution de SYNOP.

The doctoral thesis concerns the development and validation of the SYNOP expert system for the ergonomic evaluation and improvement of graphic views used in control rooms of industrial processes SYNOP uses a first-order inference engine and the concepts of frame and semantic network for knowledge representation. It is written in LISP language. Its knowledge bases contain ergonomic concepts for information presentation on graphic screens. Its evaluation module, as well as its expert and user interfaces, are detailed. The principles for developing and validating its ergonomic knowledge bases are explained. The thesis also describes the contribution of the SYNOP expert system to the evaluation and improvement of a graphical user interface in an industrial context. The thesis ends with several research perspectives.; La thèse concerne le développement et la validation du système expert SYNOP pour l'évaluation ergonomique et l’amélioration de vues graphiques exploitées dans les salles de contrôle de procédés industriels. SYNOP utilise un moteur d'inférence du premier ordre et les notions de frame et de réseau sémantique pour la représentation des connaissances. Il est écrit en langage LISP. Ses bases contiennent des concepts ergonomiques de présentation d'information sur écran graphique. Le module d'évaluation de SYNOP, ainsi que ses interfaces expert et utilisateur, sont détaillés. Les principes d'élaboration et de validation des bases de connaissances ergonomiques de SYNOP sont expliqués. Le mémoire décrit également la contribution du système expert SYNOP à l’évaluation et l’amélioration d'une interface graphique dans un contexte industriel. Le mémoire se termine par des perspectives d'évolution de SYNOP.

Cette thèse présente une méthode, et sa formalisation, pour fournir des informations supplémentaires intéressantes en réponse à des requêtes posées à une base de données relationnelle. Ces informations intéressantes sont définies en utilisant une base de connaissances contenant des règles représentant le savoir-faire d’un expert habitué à fournir des réponses à des utilisateurs occasionnels. Cette base de connaissances contient également une description de la base de données. Cette description de haut niveau utilise les notions d’entité, d’attributs d’entité, de relation et de "thème". Les thèmes sont associés aux attributs et aux relations et permettent de regrouper les informations de la base de données qui appartiennent à un même champ sémantique. Les bases de données et de connaissances sont toutes deux formalisées en logique du premier ordre. Il y a toutefois deux niveaux différents de formalisme : un niveau objet pour représenter la base de données elle-même, et un méta-niveau pour représenter la base de connaissances utilisée pour transformer les requêtes. Ces requêtes transformées définissent les informations supplémentaires à fournir à l’utilisateur. Elles sont obtenues en utilisant un mécanisme de déduction classique. Pour réaliser cette transformation, il est important de tenir compte des caractéristiques de chaque utilisateur. Dans cette thèse, seul l’aspect sémantique de l'information a été considéré, et l’on ne s’est pas intéressé aux aspects linguistiques, tel que la représentation en langue naturelle. Il faut également signaler qu’un premier prototype implanté en PROLOG fonctionne à l'heure actuelle. This thesis presents a method, and its formalization, to provide interesting additional information to users asking queries to a Relational Data Base. The interesting information is defined using a Knowledge Base containing rules which represent the expertise of a person having a long experience in providing information to casual users. This Knowledge Base also contains a high level description of the Data Base content. This description uses the concepts of entity, attribute of entity, relationship and topic. The topics are related to attributes and relationships in order to be able to characterize all the information in the Data Base which belongs to a given semantic field. The Data Base and Knowledge Base are both formalized in First Order Logic. There are two different formalization levels: object level to represent the Data Base itself, and meta level to represent the Knowledge Base which is used to transform queries. The transformed queries define the additional information which is provided to users. They can be obtained with a standard deduction mechanism. To perform this transformation, it is important to take into account significant user's characteristics. In this thesis, only the semantic aspect of the information is considered and we are not interested on linguistic aspects, such as natural language representation. We have also to notice that a first prototype implemented in Prolog is running.

L’implantation d’un grand nombre de relations sémantiques (RS) dans des dictionnaires spécialisés multilingues ouvre une voie nouvelle en terminographie, facilitée par les immenses possibilités de traitement de corpus offertes par les technologies de l’information. Les outils terminologiques favorisant l’organisation des connaissances sont privilégiés par les traducteurs et les apprenants des langues de spécialité. Allant dans cette voie, cet article présente deux projets dictionnairiques exploitant les RS, l’un dans le domaine du commerce de détail et l’autre dans le domaine de la mondialisation économique. Il discute les modèles de RS, les moyens de les implanter dans des dictionnaires en ligne et les contraintes liées au choix des techniques et des logiciels. Les ouvrages présentés illustrent l’idée selon laquelle les classes de relations sémantiques peuvent servir à reproduire la structure conceptuelle d’un domaine. Si certaines classes de relations sont communes à tous les domaines (les relations de générique, spécifique, partie, tout, agent), nombre d’autres sont spécifiques au domaine. L’objectif de cet article est de montrer comment la structure sémantique du dictionnaire peut aider l’utilisateur à organiser ses connaissances et faciliter l’extraction de l’information contenue dans les fiches, en fonction de ses besoins particuliers., The inclusion of a large number of semantic relations (SRs) in specialized multilingual dictionaries, facilitated by leveraging the huge capabilities of information technologies for corpus processing, is a new avenue in terminography. Terminological tools that help users acquire and organize knowledge are appreciated by both translators and language learners in specialized fields. This contribution discusses the integration of complex SRs into two multilingual dictionaries, one in the field of retail sales, and the other in global economy. It describes the SR models used, how to integrate them into online dictionaries, and constraints resulting from the choice of techniques and software. The dictionaries discussed illustrate the idea that classes of SRs can reflect the conceptual structure of a given field. Whereas some classes are canonical and common to all fields (relations of generic, specific, part/whole, agent), many are domain-specific. The aim of this contribution is to show how the dictionary’s semantic structure can help users manage their knowledge and facilitate the retrieval of information according to their own needs.