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Exploring temporal databases with suitable data mining methods have been the subject of several studies. However, it often leads to an excessive volume of extracted information and the analysis is difficult for the user. We addressed this issue and we specically focused on methods that synthesize and filter extracted information. The objective is to provide interpretable results for humans. Thus, we relied on the notion of partially ordered sequence and we proposed (1) an algorithm that extracts the set of closed partially ordered patterns ; (2) a post-processing to filter some interesting patterns for the user and (3) an approach that extracts a partially ordered consensus as an alternative to pattern extraction. The proposed methods were applied for validation on hydrobiological data from the Fresqueau ANR project. In addition, they have been implemented in a visualization tool designed for hydrobiologists for water course quality analysis.; L'exploration des bases de données temporelles à l'aide de méthodes de fouille de données adaptées a fait l'objet de nombreux travaux de recherche. Cependant le volume d'informations extraites est souvent important et la tâche d'analyse reste alors difficile. Dans cette thèse, nous présentons des méthodes pour synthétiser et filtrer l'information extraite. L'objectif est de restituer des résultats qui soient interprétables. Pour cela, nous avons exploité la notion de séquence partiellement ordonnée et nous proposons (1) un algorithme qui extrait l'ensemble des motifs partiellement ordonnés clos; (2) un post-traitement pour filtrer un ensemble de motifs d'intérêt et(3) une approche qui extrait un consensus comme alternative à l'extraction de motifs. Les méthodes proposées ont été testées sur des données hydrobiologiques issues du projet ANR Fresqueau et elles ont été implantées dans un logiciel de visualisation destiné aux hydrobiologistes pour l'analyse de la qualité des cours d'eau.

Perrin Jean-François. Petite introduction à l'hydrobiologie / A short introduction to hydrobiology . In: Bulletin mensuel de la Société linnéenne de Lyon, hors-série numéro 4, 2014. Jubilé de l'hydrologie lyonnaise. pp. 11-14.

This computer information science PhD takes place in the framework of Formal Concept Analysis (FCA) or Galois lattices, which are tools based on mathematical operators called Galois connections allowing to generate concepts. A concept is composed with a set of objects sharing a set of attributes. These concepts are generated from a context which is a table of binary relations between these objects and these attributes. We are interested in complex contexts for which the complexity is based on two elements. On one hand, on many-valued context for which the attributes are divided into several modalities. On the other hand, it is based on fuzzy contexts for which the relation between objects and attributes is not binary. We define fuzzy many-valued contexts which inherit of both complexities and introduce two conversions for fuzzy many-valued data. The first conversion is a binarisation by a complete disjonctive operation allowing to use tools such as implications and to compare and combine lattices with statistical methods such as factorial analysis. The second conversion is issued from histogram scaling which we define and which converts attributes into histograms. To generate concepts from histograms, we propose new Galois connections based on a similarity measure between these histograms. These connections allow to obtain concepts where objects share attributes which are not equal but similar between the same minimum and maximum. We also propose to use thresholds to limit the number of generated concepts and decrease calculating time. We have tested and compared the performance of two algorithms : MinMaxNC and MinMaxC implementing this connection. This PhD is applied to the hydrobiological domain for which it is needed to select ecological traits allowing to caracterize ecological quality of water surfaces due to the behaviour of species in their environment. The selection of these traits is based on the search of groups of taxons sharing morphological and physiological (called biological traits) characteristics. These groups correspond to concepts in FCA and biological data can be considered as fuzzy many-valued context for which we show the efficency of our approach., Cette thèse en informatique se place dans le cadre de l'Analyse de Concepts Formels (ACF) ou les treillis de Galois. Ce sont des outils basés sur des opérateurs mathématiques appelés fermetures de Galois permettant de calculer des concepts. Un concept est formé d'un ensemble d'objets partageant tous un ensemble d'attributs communs. Ces concepts sont extraits à partir d'un contexte qui est une table de relation binaire entre ces objets et ces attributs. Nous nous intéressons à des contextes complexes dont la complexité repose sur deux axes. D'une part, les contextes multi-valués dont les attributs se divisent en plusieurs modalités. D'autre part, les contextes flous dont la relation entre objets et attributs n'est pas binaire. Nous définissons les contextes multi-valués flous qui héritent de ces deux complexités et présentons deux conversions des données multi-valuées floues. La première conversion est une binarisation par une disjonction totale des attributs permettant d'une part l'exploitation d'outils comme des implications et d'autre part de comparer et combiner les treillis avec des méthodes statistiques telles que l'analyse factorielle. La seconde conversion est issue de l'échelonnage histogramme que nous définissons et qui permet de convertir les attributs en histogrammes. Afin de générer les concepts à partir des histogrammes, nous proposons une nouvelle fermeture de Galois basée sur une mesure de similarité entre ces histogrammes. Cette fermeture permet d'obtenir des concepts pour lesquels les objets possèdent des attributs non plus égaux mais similaires compris entre un minimum et un maximum communs. Nous proposons également des mesures de seuillage pour limiter le nombre de concepts générés et diminuer les temps de calculs. Enfin, deux algorithmes ont été testés pour implémenter cette fermeture : MinMaxNC et MinMaxC, dont nous comparons les performances. Cette thèse trouve son application notamment dans le domaine hydrobiologique dont une problématique est la sélection de traits écologiques de taxons permettant de caractériser l'état écologique des cours d'eau par le comportement des espèces au sein de leur environnement. La sélection de ces traits s'appuie sur la recherche de groupes de taxons possédant des caractéristiques morphologiques et physiologiques (appelés traits biologiques) communes. Ces groupes correspondent à des concepts au sens de l'ACF et les données biologiques se présentent sous la forme d'un contexte multi-valué flou pour lequel nous montrons l'efficacité de notre approche.

Seasonnality and variability in rainfall is the principal attribute of Mediterranean-type climate. As a consequence, Mediterranean-type streams exhibit strong seasonnal variability which can lead to extreme conditions of flooding and drying. Large areas of karst geology occur in the Mediterranean region, consequently large amounts of water may be stored in subterranean aquifers ; so, many karstic streams occur in Mediterranean-climate areas. Karstic streams are lotic habitats supplied from underground water in contrast to surface run-off, and this gives them some characteristics quite different from those of other true Mediterranean streams ; mainly, water conditions are more regular and uniform. Karstic streams, vary little in flow volume and temperature all year round (the temperature fluctuates by only a few degrees, even in areas with cold winters and warm summers ; summer temperatures seldom exceed 20 °C). Moreover, water issuing from sedimentary rocks, such as limestones, contains large amount of dissolved salts, notably calcium bicarbonate ; these streams are liable to deposit calcium carbonate (tufa concretions). The present paper concerns four karstic watercourses in Provence (South-East France) ; it relates the influence of the ground water supplying on hydrology, ecology and hydrobiology of streams issuing from limestone formations. The peculiarities of these streams and the specificities of their animal community, analized through the knowledge of their macroinvertebrate fauna, are pointed out. In the studied karstic streams, the invertebrate community is dominated in numbers by taxa (Crustacea Gammarus, Coleoptera Elmidae, Gasteropod) regularly found in strongly mineralized water-courses with high Ca contents ; these taxa have always been found associated. In addition to that, two species of Diptera Simuliids, Simulium xanthinum and S. galloprovinciale, occur on tufa (from Spain to Libanon). One of the most noteworthy faunal peculiarity, common to karstic hydrologic regime watercourses, is the occcurence of a lot of coldstenothermous invertebrates which usually live at higher altitudes in mountain streams and in springs. Their occurrence in Mediterranean streams at middle and low altitudes is atypic. This peculiarity is correlated with thermal regime of the karstic streams which appear as cold enclaves in the Mediterranean region. The ecology of 11 cold-stenothermous species (1 Planarian, 3 Ephemeroptera, 2 Plecoptera, 4 Trichoptera, 1 Blepharicerid) which are both inhabitants of karstic and of non-karstic streams in the same mediterranean region (South-East France) is compared. The invertebrate community of karstic streams also contains some endemic species. The most worthy of note is Rhyacophila vallisclausae, a caddisfly (Trichoptera) which lives in the upper reach of the river Sorgue. This species, belonging to the European group of R. vulgaris, is clearly distinguished from all species in this group by the strongly marked brachyptery of specimens ; it appears to be a relic remnant of an ice age fauna which could survive in an aquatic environment characterized by its remarquable cold stenothermy., Les cours d’eau à régime karstique sont alimentés par des aquifères souterrains. Leurs caractéristiques physico-chimiques sont : – la faible variabilité des débits, car les apports d’eau souterraine assurent des débits réguliers avec des étiages peu marqués et des crues modérées ; – la température de l’eau, basse et constante sur la totalité ou sur une partie importante du cours ; – la minéralisation élevée des eaux de surface, avec de fortes teneurs en calcium. Ces caractéristiques confèrent aux cours d’eau karstiques des spécificités écologiques et faunistiques originales, atypiques dans le contexte régional méditerranéen. Le présent article porte sur quatre cours d’eau à régime karstique : l’Argens (Var), la Siagne et le Loup (Alpes-Maritimes), les Sorgues (Vaucluse). Il met en évidence leur originalité hydroécologique et surtout les particularités de leur peuplement analysées à travers la faune de macroinvertébrés. La communauté des invertébrés de ces cours d’eau karstiques est dominée en effectifs par des taxons qui nécessitent une concentration importante en calcium (Crustacés Gammaridae, Coléoptères Elmidae, Gastéropodes). Une des particularités faunistiques les plus remarquables, commune à ces cours d’eau, est la présence d’espèces sténothermes d’eau froide qui vivent habituellement dans le crénal et le rhithral des cours d’eau de montagne, à des altitudes bien supérieures à celles où elles ont été récoltées dans les cours d’eau karstiques. Une analyse comparative du statut écologique de 11 espèces sténothermes, que l’on trouve à la fois dans les cours d’eau de régime karstique et dans les cours d’eau de type méditerranéen, a été réalisée. De plus, les cours d’eau recevant les apports des systèmes karstiques hébergent des populations qui, du fait de leur caractère sténotherme, se sont trouvées isolées par rapport aux cours d’eau méditerranéens adjacents. Ceci explique la présence d’espèces endémiques. En définitive, les cours d’eau de régime karstique, bien qu’ils soient assez nombreux, sont atypiques dans la région méditerranéenne. On y trouve des conditions hydrologiques, thermiques et des peuplements (ripisylves, biocénoses, populations) qui sont habituellement présents dans des cours d’eau de montagne et dans des cours d’eau médio-européens., Giudicelli Jean, Olivari Georges. Les cours d’eau méditerranéens à régime de soutien karstique. Spécificités écologiques et hydrobiologiques. In: Ecologia mediterranea, tome 36 n°1, 2010. pp. 25-44.

A multi approach study, using geophysics, tracing tests, water balance, geology, hydrogeology and statistics analyses on physico-chemicals data, shows (1) leachate's infiltrations between 31 and 43% accross a shaly natural interface and superior to 45% accross an artificial geomembrane interface and (2) a localized physico-chemical impact on the existing piezometer network. Collected leachates are treated by a natural lagooning system. After the suspension of waste deposits, biodegradation activity reduces and generates a decrease in leachates noxiousness, thus changing the lagoons hydrobiologic mechanisms. We note a diversification of all the microbial loop components allowing the re-use of the organic material. The new trophic pyramid organization allowed to attain a viable ecosystem for fish fauna, in the last lagoon. Treated leachates undergo a second purification by natural attenuation in the receiving stream. A bacteriological approach on leachates, lagoons and groundwater quality allowed to assess presence and survival of faecal bacteria in these various environments. This landfill doesn't represent an important source of faecal bacteria. This studied site, where landfill's leachates and septic tank sewage are mixed together, confirms the use of Escherichia coli and Entoroccocus as markers of recent faecal contaminations. The shaly aquifer resembles more in a fractured area than in an impervious zone, with a preferential circulation along cracks and fractures which doesn't assure the natural filtration and lead to a vulnerable aquifer to bacterial contaminations.; L'utilisation couplée de la géophysique, de traçages d'essais, de bilan hydrique, de la géologie, de l'hydrogéologie, et d'analyse statistique sur les données physico-chimiques a permis de mettre en évidence -des infiltrations de lixiviats comprises entre 31 et 43% à travers une interface naturelle shisteuse, et > à 45% à travers une barrière artificielle géomembranaire, -et un impact localisé sur le réseau piézométrique existant. Les lixiviats récoltés sont traités par lagunage naturel. Suite à l'arrêt des dépôts, l'activité de biodégradation diminue et engendre une baisse de la nocivité des lixiviats bruts, modifiant ainsi le fonctionnement hydrobiologique des lagunes. On note une diversification de l'ensemble des composants de la boucle microbienne assurant le recyclage de la matière. La structuration de la pyramide trophique a permis d'atteindre en dernière lagune, un écosystème viable pour la faune piscicole. Les lixiviats traités subissent une seconde épuration naturelle dans le ruisseau récepteur. Une approche bactériologique des lixiviats, des lagunes et des eaux souterraines a permis d'évaluer la survie des bactéries fécales dans ces différents milieux. Cette décharge ne constitue pas une source importante de bactéries fécales. L'étude de ce site où lixiviats de décharge et apports de fosse septique se mélangent confirme le rôle d'Escherichia coli et des Entérocoques comme marqueurs de contamination fécale assez récente. L'aquifère schisteux s'apparente plus à un aquifère fracturé qu'à une zone imperméable, avec une circulation préférentielle le long de fractures qui n'assure pas une filtration et en font un aquifère vulnérable aux contaminations bactériennes.

Monotoring n° 27 of the BLAYAIS nuclear power plant takes into account studies conducted between March and November 2004. Physicochemistry, Hydrobiology, Bacteriology, Zooplankton, Benthic macrofauna, Bathymetry, are reported., L'étude de surveillance n° 27 du site électronucléaire du BLAYAIS (département de la Gironde) concerne la période de mars à novembre 2004. Les domaines pélagique et benthique sont étudiés (physico-chimie, hydrobiologie, bactériologie, zooplancton, macrofaune benthique, bathymétrie).

The total standing stock of bivalves cultured in Thau Lagoon (France) that is mainly constituted of the Pacific oyster, Crassostrea gigas, and the Mediterranean mussel, Mytilus galloprovincialis, vary between 14,000 and 20,000 tons within a year. These variations were attributed to the rearing cycle of molluscs in the lagoon but also to their growth performances. Oysters cultured in the Thau Lagoon presented the best growth rate ever reported whereas trophic conditions are low : mean concentrations in organic particulate matter and total chlorophyll a averaged 1 mg.l-1 and 1.2 µg.l-1, respectively. The development of a growth model shows that temporal pattern (i.e. seasonality) of bivalve growth is explained by water temperature and spatial pattern is governed by concentration in organic particulate matter. Quantitative and qualitative variations of bivalve standing stocks are simulated and the marketable production is estimated with a deterministic population dynamics model. This model takes into account rearing strategies of farmers by including for instance seeding and harvesting timetables. Rearing strategies were studied through interviews of oyster and mussel farmers. A technical diagnostic of the production system used in Thau Lagoon and a typology of shellfish farms were also realised. The population dynamics model was calibrated on standing stock and distribution data recorded in 2000 and 2001. The marketable production of oysters was assessed at ca. 17,900 tons between March 2000 and March 2001, implying a ratio of 1.73 between production and biomass (P/B). For mussels, the production was estimated at 5,400 tons at equilibrium for a P/B ratio of 1.38. Cultured bivalves support large quantities of epibiota, among which solitary ascidians. Their biomass varied between 1,200 and 3,600 tons between 2000 and 2001. A growth model that was developed for the species Ascidiella aspersa (more abundant species observed in 2000-2001) and a stochastic model to represent the recruitment of ascidians on oysters were linked with the oyster population dynamics model to derive ascidian standing stock and production over time. The marketable production was assessed at 2,900 tons only for ascidians associated to « collées » oysters (i.e. corresponding to one culture method used in the lagoon). Population dynamics of filter-feeders were also coupled with ecophysiological equations to evaluate their relative impact on the ecosystem of Thau Lagoon. The higher impact comes from oysters at the scale of the basin but mussels have a high impact at the local scale of rearing structures., Le stock total de bivalves en élevage dans la lagune de Thau (France), constitué par l'huître creuse, Crassostrea gigas et la moule de Méditerranée, Mytilus galloprovincialis, varie entre 14 000 et 20 000 tonnes au cours d'une année. Ces variations sont attribuées au cycle d'élevage des mollusques dans le bassin mais également à leurs performances de croissance. En effet, les huîtres élevées dans la lagune de Thau présentent les meilleurs taux de croissance jamais rapportés alors que les conditions trophiques sont faibles : les concentrations moyennes en matière organique particulaire et chlorophylle a totale avoisinent respectivement 1 mg.l-1 et 1,2 µg.l-1. L'élaboration d'un modèle de croissance montre que la variabilité temporelle (i.e. saisonnalité) de la croissance des bivalves est expliquée par la température de l'eau tandis que la variabilité spatiale est gouvernée par la concentration en matière organique particulaire. Les variations temporelles quantitatives et qualitatives (i.e. structure en taille) des stocks de mollusques sont reconstituées et la production commercialisable est estimée à l'aide d'un modèle déterministe de dynamique de population. Ce modèle prend en compte les stratégies d'élevage des conchyliculteurs en incluant notamment les calendriers de mise en élevage et de récolte. Les stratégies d'élevage ont été étudiées par enquêtes, réalisées auprès des conchyliculteurs. Outre l'obtention de données permettant de paramétrer le modèle de dynamique de population, les enquêtes ont également permis de réaliser un diagnostic technique du système de production conchylicole utilisé à Thau ainsi qu'une typologie des exploitations conchylicoles en fonction des stratégies d'élevage. Calibré sur des données d'estimation et de distribution des stocks mesurées en 2000 et 2001, le modèle de dynamique de population évalue la production commercialisable d'huîtres à environ 17 900 tonnes entre mars 2000 et mars 2001, impliquant un ratio entre la production et la biomasse (P/B) de 1,73. Pour les moules, la production à l'équilibre est estimée à 5 400 tonnes pour un ratio P/B d'environ 1,38. Les bivalves supportent une quantité importante d'épibiontes, parmi lesquels les ascidies solitaires dont la biomasse varie entre 1 200 et 3 600 tonnes entre mars 2000 et mars 2001. Le couplage d'un modèle de croissance individuel développé pour l'espèce Ascidiella aspersa (espèce la plus abondante observée en 2000-2001) et d'un modèle stochastique, pour représenter la fixation des ascidies sur les huîtres, avec l'équation de dynamique des populations d'huîtres permet de simuler l'évolution des stocks et de la production d'ascidies associées aux huîtres. A l'équilibre, cette production est estimée à 2 900 tonnes pour les seules ascidies associées aux huîtres « collées » (i.e. correspondant à une des deux techniques d'élevage de l'huître utilisée dans la lagune). Enfin, le couplage de la dynamique de population avec des équations d'écophysiologie permet d'estimer la pression relative des différentes catégories de filtreurs. A l'échelle du bassin, il en résulte une pression intense des huîtres alors qu'à l'échelle locale des structures d'élevage, les moules exercent la plus forte pression.

L'huître perlière, Pinctada margaritifera (Linné, 1758) var. cumingi (Reeve), productrice de perles noires, fait l' objet d'une aquaculture florissante en Polynésie Française. Afin de pérenniser cette activité, un programme de recherche (le PGRN) a été lancé, en 1990, sur l' atoll de Takapoto. L' un des thèmes de ce programme réside dans l'étude de la capacité trophique d'un lagon soumis à une activité de perliculture. A cet égard, un modèle déterministe expliquant la croissance et la reproduction de P. margaritifera à partir des paramètres du milieu (notamment la nourriture disponible) a été mis au point. La construction de ce modèle a impliqué : ( 1) l'analyse de l'hydrobiologie du lagon; (2) l'étude de la physiologie de P. margaritifera; (3) le sui vi temporel de la croissance et de la reproduction afin de valider les simulations du modèle. L'analyse de l'hydrobiologie du lagon montre une variabilité spatio-temporelle faible et une teneur en matière organique particulaire (POM, mg l-1), i.e. nourriture potentielle pour les élevages, peu concentrée (~ 0.40 mg l-1). L' étude de la physiologie met en évidence une adaptation exemplaire de P. margaritifera à la pauvreté ambiante du milieu : ses capacités de filtration sont décuplées par rapport aux autres bivalves couramment étudiés dans la littérature (~ 400 l j-1 g-1). Le reste de la physiologie (rétention, biodéposition, respiration et excrétion) est banal. L' ensemble de ces processus a ensuite été intégré dans un modèle déterministe décroissance. La concordance entre simulation et observation est satisfaisante, ce qui permet de valider le modèle. Ses applications sont multiples. Sur le plan scientifique, ce modèle valide l' ensemble des acquis sur la physiologie, la croissance et la reproduction. Sur le plan de la perliculture, ce modèle fournit des éléments sur le temps de formation de la perle, le collectage, les densités locales, le choix des zones d'élevage, et la capacité trophique globale d'un lagon.

A hydrobiological study coupled with the evolution of the production of cupped oysters Crassostrea gigas has been carried out from March 1990 to March 1991 on two oyster culture areas (North and South) of the Bay of Bourgneuf. - The northern area is characterized by an environment which is variable though time and composed of a high nutritive and mineral load. This high particular load (average value = 154 mg.l- 1) is linked to meteorological conditions and especially to the wind speed and direction. The individual growth of cultivated oysters is low (i.e.: 58.8 g). - The southern area shows homogenous hydrobiological characteristics throughout the year. The average phytoplanktonic biomass is 4.4 µg.l-l of chlorophyll and the particular load is low (average value = 34 mg.l- 1). In this case, the individual growth of cultivated oysters is higher, (i.e.: 67.2 g). The study of the oyster/environment relationship in the Bay of Bourgneuf showed that oysters' growth seems more correlated to the quality of the food ("mineral matter/total matter" ratio) than to the total available quantity. This tendency could be the consequence, in the presence of a high particular load, of a "dilution" of the food by the mineral part of the suspended matter and of the activation of the "sorting" function, which is energy consuming in the cupped oyster., Une étude hydrobiologique couplée à l'évolution de la production d'huîtres creuses Crassostrea gigas a été menée de mars 1990 à mars 1991 sur deux secteurs ostréicoles (Nord et Sud), de la baie de Bourgneuf. - Le secteur nord est caractérisé par un milieu variable au cours du temps composé à la fois d'une charge nutritive et minérale élevée. Cette forte charge particulaire (valeur moyenne = 154 mg.l- 1) est liée aux conditions météorologiques et plus particulièrement à la direction et à la vitesse du vent. La croissance individuelle des huîtres en élevage est faible, (i.e: 58,8g). - Le secteur sud possède des caractéristiques hydrobiologiques homogènes au cours de l'année. La biomasse phytoplanctonique moyenne est de 4,4 µg.l-l de chlorophylle a et la charge particulaire est faible (valeur moyenne=34 mg.l- 1). Dans ce cas la croissance individuelle des huîtres en élevage est plus élevée, (i.e: 67,2 g). L'étude de la relation huître/milieu dans la baie de Bourgneuf a mis en évidence que la croissance des huîtres semble plus corrélée à la qualité de la nourriture (rapport "matière minérale/matière totale") qu'à la quantité totale disponible. Cette tendance pourrait être la conséquence, en présence d'une forte charge particulaire, d'une "dilution" de la nourriture par la part minérale de la matière en suspension et de l'activation de la fonction de tri, consommatrice d'énergie chez l'huître creuse.

Life cycles of Rhyacophila fasciata Hagen and R. nubila Zettersdedt are studied. The first species is found in Qab Ilias, a small river on the east side of Mount Lebanon, the second one lives in Yahfufah on the west side of the Anti Lebanon. Length and width of the head were measured. The average size for larvae in the fifth instar are 1.81 and 1.4 mm and 1.58 and 1.17 mm respectively. Flying periods, laying eggs and hatching occur the year round with a resting period in winter. The first species needs more than one year to accomplish its life cycle and the second one less than one year., Les cycles de vie de Rhyacophila fasciata Hagen et R. nubila Zettersdedt sont étudiés. La première espèce colonise la rivière Qab Ilias (versant est du mont Liban) et la seconde colonise la rivière Yahfufah (versant ouest de l’Anti Liban). Ces deux cours d’eau appartiennent au haut bassin du Litani. Les dimensions moyennes, longueur et largeur, de la capsule céphalique du 5ème stade larvaire sont de 1,81 et 1,4 mm et de 1,58 et 1,17 mm respectivement. Les périodes de vol, de ponte et d’éclosion s’observent toute l’année avec un repos hivernal. R. fasciata est une espèce printanière et a besoin de plus d’une année pour accomplir son cycle biologique. R. nubila a une période de vol printanière précoce et une autre estivo-automnale et parachève son cycle en moins d’une année., Alouf Nicolas J. Cycle de développement de deux Rhyacophila (Insecta : Trichoptera) au Liban. In: Ecologia mediterranea, tome 17,1991. pp. 11-17.

Published observations hydrologiques

Surface temperature was measured by remote sensing through Cape Lopez (Gulf of Guinea) frontal region during the fishing season in June and July 1972 and 1974. Twelve typical situations are analysed through four main directions: surface situation, tendency, hydrobiological structure and availability to fisheries. The tuna behavior is analysed in relation with the frontal zone movements and a mechanism which tends to aggregate important shoals of tunas is presented.

Four seasonal compaigns providing a sampling of 15 stations each followed during half a tide cycle, i.e. 120 water samples permit the definition of the main hydrobiological features of Marennes-Oleron Bay: salinity and turbidity, phytoplanktonic biomasses, ATP concentrations. The authors suggest that a new way of adapted sampling to their objectives, will work out in the future by sampling during tidal cycles but as frequently as possible., Les grandes caractéristiques hydrobiologiques du bassin de Marennes-Oléron sont définies par quatre campagnes saisonnières de 120 prélèvements chacune effectuée-, en 15 stations en demi-cycle de marée. Les salinités y fluctuent de 10 '/rr. et ce secteur peut donc être assimilé à un vaste estuaire contrôlé principalement par les apports fluviaux de la Charente. La turbidité reste élevée souvent supérieure à 100 mg.I"', les teneurs en oxygène dissous montrent un déficit en amont de la Charente et de la Seudre de 4 mg.L1 tandis que les sels nutritifs sont apportés par la Charente pour les nitrates, phosphates et silicates. Ces derniers suivent les courbes de dilution théorique excepté lors des poussées phytoplanctoniques et lors des crues hivernales. Lors de ces crues, les nitrates semblent soit apportés par la Gironde, soit dus à une minéralisation organique. Au même moment, les phosphates pourraient être absorbés sur les particules et être piégés dans les sédiments. Les biomasses phytoplanctoniques exprimées par les teneurs en chlorophylle a sont supésieures à 30 f^-g.1 ' en amont des estuaires au printemps avec des teneurs en phéopigmenls pouvants dépasser 200 IUJ.1 . par contre, dans le bassin, les teneurs ne dépassent guère 10 fig.l ''. Les concentrations en ATP montrent que peu de phytoplancton est physiologiquement actif en particulier dans les estuaires, tandis que les dosages de protéines permettent de quantifier la part des apports allochtone - par rapport à la production autochtone des estuaires. Line analyse factorielle des correspondances définit le schéma général hydrobiologique du bassin estuarien en précisant que 'e rôle de la Charente ne se limite pas à l'apport en sels minéraux azotés et phosphatés, mais aussi à l'apport d'une biomasse phytoplanctonique d'eau douce en voie de dégénérescence. Les auteurs proposent qu'une nouvelle stratégie d'échantillonnage, mieux adaptée aux objectifs recherchés, soit suivie ultérieurement en assurant des prélèvements en cycle de marée mais avec une périodicité la plus élevée possible.

Published température de l'eau Baie du lévrier conditions thermiques

Czechoslovakia has a remarkable organization for natural hydrobiological research. On a surface four times smaller than that of France, it produces 15,000 t fish and over 20,000 t poultry. Education brings an essential support to this production which employs 3,700 persons on the whole. The University produces specialized engineers and veterinary surgeons, The Vodnany Fisheries School trains technicians. Vodnany is also a Research Center of 60 persons. Researches deal mainly with aquatic ecosystems of ponds (standard and littoral ones). The State Fisheries ensure technical support to fish hatcheries and exploitation of research results, La pisciculture d'eau douce est très développée en Tchécoslovaquie où la production de poissons d'étang (carpe principalement) atteint 13 000 tonnes par an et où les pêcheurs amateurs (au nombre de 185 000 si l'on compte les jeunes) capturent environ 2 500 tonnes de poissons, dont la plupart ont été élevées en pisciculture avant d'être relâchés comme sujets de repeuplement de 1 an. Pour un pays dont la population est de 15 millions d'habitants et la surface 4 fois plus petite que celle de la France, cette production est considérable et atteint des rendements à l'hectare élevés (414 kg pour les étangs et 52 et 85 kg pour les rivières et plans d'eau à salmonidés et non salmonidés respectivement). A cela s'ajoute une production de près de 20 000 Tonnes de canards ou oies produits sur les étangs, ce qui améliore de 5 à 10 % la productivité des étangs. On est en présence d'un remarquable système de production des ressources hydrobiologiques naturelles, fondé sur une longue tradition d'élevage du poisson d'étang et d'exploitation des plans d'eau. Outre cette tradition qui remonte au 14è siècle, il est intéressant d'examiner l'appui que l'enseignement et la recherche-développement apportent à cette production animale dans ce pays.

Quantitative relationships between nitrate distribution, chlorophyll and primary integrated values have been used to evaluate the phytoplankton abundance in the Gulf of Guinea. Data of Guinee I cruise (May-July 1968) of the R.V. Jean Charcot have been used. They show a large oligotrophic convergence area (< 250 mg C/m2/J). A relationship previously found between the depth of the nitracline (first level where the nitrate appears) and the depth of the thermal maximum gradient is confirmed. From a practical point of view, this relationship is very useful since it allows, when the biological or chemical data are not available, a rough estimation of phytoplankton integrated biomass and production in the water column, from a temperature profile.

study of the experimental growth of the oyster Crassostrea gigas was undertaken of 1985 to 1988, parallel to a follow-up hydrobiologic of the medium, in three sites of the basin of Arcachon. - The characteristics of growth of the studied sites proved very stable during various years ; they are also very different from one site to another, the performances being able to vary the simple one with the double of the center of the basin towards the exit on the ocean. It is during the summer and of the autumn that the difference is established between the sectors, the spring growths being similar. The hierarchy observed is associated a more or less great precocity of the laying. - A gradient influences continental oceanic-influence is observed, resulting in more extreme conditions in the internal zones of the basin for the parameters temperature and salinity. There is not, on the other hand, of gradient net of phytoplanctonic richness. The seasonal structure is very marked and strongly dominant on the geographical and interannual structures, in spite of very contrasted years and heterogeneous sites as for the water masses which bathe them and with the performances of growth of molluscs in breeding in these sectors. The worse growth of the internal sectors could comparison with their conditions of medium more unstable and more extremes, which would cause an energy demand of molluscs quite higher than that of the best zones. In period of not very abundant food, it would result a limitation from it from the growth., Une étude de la croissance expérimentale de l'huître Crassostrea gigas a été menée de 1985 à 1988, parallèlement à un suivi hydrobiologique du milieu, en trois sites du bassin d'Arcachon. - Les caractéristiques de croissance des sites étudiés se sont avérées très stables au cours des différentes années; elles sont aussi très différentes d'un site à l'autre, les performances pouvant varier du simple au double du centre du bassin vers la sortie sur l'océan. C'est au cours de l'été et de l'automne que la différence s'établit entre les secteurs, les croissances printanières étant similaires. La hiérarchie observée est associée à une plus ou moins grande précocité de la ponte. - Un gradient influence océanique-influence continentale est observé, se traduisant par des conditions plus extrêmes dans les zones internes du bassin pour les paramètres température et salinité. Il n'y a pas, en revanche, de gradient net de richesse phytoplanctonique. La structure saisonnière est très marquée et fortement dominante sur les structures géographiques et interannuelles, malgré des années très contrastées et des sites hétérogènes quant aux masses d'eaux qui les baignent et aux performances de croissance des mollusques en élevage dans ces secteurs. La moins bonne croissance des secteurs internes pourrait être mise en relation avec leurs conditions de milieu plus instables et plus extrêmes, qui provoqueraient une demande énergétique des mollusques bien supérieure à celle des meilleures zones. En période de nourriture peu abondante, il en résulterait une limitation de la croissance.

Extensive data have been obtained on oyster-bearing sediments and interstitial and overlying waters in the Bassin des Chasses, les Sables d'Olonne, which will enable a scale of suitability of waters for oyster-culture to be compiled. The studies concerned: I. Hydrology, including fresh water inflow: II. Salinity; alkaline reserve; Na, K, Ca and Mg levels: III. Circulation and distribution of nitrogenous substances: IV. The N sub(2) cycle: V.P. Nitrogenous and phosphorus nutrients are regenerated continuously in the sediments and replenish the free water.

Cette étude a pour but la caractérisation hydrobiologique d’une lagune méditerranéenne (lagune de Bizerte, nord de la Tunisie) sur la base de dix campagnes de mesures réalisées à une fréquence mensuelle durant l’année 2004, de janvier à décembre. Deux parmi ces dix campagnes ont fait l’objet d’un maillage fin avec 118 stations en mai et 40 stations en septembre. Le reste n’a couvert que 10 stations seulement. Pendant ces campagnes, des paramètres physicochimiques ont été mesurés (Température, Salinité, Oxygène dissous). Des mesures de paramètres chimiques et biologiques ont été effectuées au laboratoire (Ammonium, Nitrates, Phosphates, Azote total, Phosphore total, Chlorophylle a et Phéopigment).Une analyse multivariée des données collectées a permis de distinguer deux principaux modes de fonctionnement de la lagune. Le premier mode, expliquant 26,3 % de la variance totale, montre un contraste nord-sud et reflète l’effet relatif de la Méditerranée et du bassin versant de la lagune, alors que le second mode, expliquant 18,2 % de la variance totale, montre un contraste est-ouest qui traduit l’effet du lac Ichkeul. Les paramètres qui contribuent significativement au premier mode sont la température, la salinité, la transparence absolue et relative. Ceux qui contribuent au second mode sont la transparence absolue et relative ainsi que la chlorophylle a et le phéopigment. Cependant, les paramètres dont les poids moyens sont non significatifs ont montré des oscillations spatiales importantes en fonction des saisons qui sont en liaison avec les rejets terrestres., The purpose of this study was the hydrobiological characterization of a Mediterranean lagoon (Bizerte Lagoon, North Tunisia) based on ten sampling campaigns carried out during the year 2004, from January to December, on a roughly monthly frequency. Two of these ten campaigns were subject to a high spatial coverage with 118 stations in May and 40 stations in September; the eight remaining campaigns covered only ten stations. During these campaigns, physicochemical parameters were measured (temperature, salinity, dissolved oxygen) and laboratory analyses were performed for chemical and biological parameters (ammonium, nitrate, phosphate, total nitrogen, total phosphorus, chlorophyll-a and pheopigments). A multivariate analysis distinguished two principal functioning hydrobiologic modes. The first mode, explaining 26.3% of the total variance, shows a North-South contrast reflecting the relative effect of the Mediterranean Sea and the catchment area. The second mode, explaining 18.2% of the total variance, shows an East-West contrast that reflects the effect of Lake Ichkeul. The parameters that contribute significantly to the first mode are temperature, salinity, absolute and relative transparency, whereas those that contribute to the second mode are absolute and relative transparency as well as chlorophyll-a and pheopigments. However, parameters for which the average weights were not significant showed important spatial oscillations according to seasons, in relation with terrestrial discharges.