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Innovations Agronomiques; International audience; The fungus Diplocarpon rosaeis the causal agent of black spot disease on rose, a widespread and devastating disease in the outdoor landscape. In this study, a collection of 77 monoconidial fungal strains collected on cultivated roses(50 strains from Europe and Asia) and wild roses (27 strains from Kazakhstan) was established.Twostrains of D. rosaewere sequenced by using Illumina® technology. Based on nucleotide polymorphism of the two fungal strains, 27 polymorphic microsatellite markers were identified. Polymorphism analysis of the 77 strains revealed a strong genetic differentiation between strains from cultivated roses and those from wild roses. A pathogenicity assay in controlled conditions (greenhouse) was developed using 10 French fungal strains and 19 rose cultivars. Using this assay, new rose cultivars were evaluated for their resistance against these 10 fungal strains. Good correlation observed between resistance scoring in greenhouse conditions and in field indicates that pathogenicity assays in controlled conditions could be very useful in the near future to rapidly characterise the resistance of new rose varieties to black spot disease; Le champignon Diplocarpon rosae est l'agent causal de la maladie des taches noires du rosier qui touche une grande proportion de rosiers de jardin. Dans cette étude, une collection de 77 souches monoconidiales du champignon, issues de rosiers cultivés (50 souches prélevées en Europe et en Asie) et de rosiers sauvages (27 souches prélevées au Kazakhstan) a été établie. Deux souches de D. rosae ont été séquencées par la technique Illumina®, et l'analyse comparative des séquences génomiques de ces deux souches a permis de développer 27 marqueurs microsatellites. L'analyse moléculaire des 77 souches a révélé une forte différenciation génétique entre les souches provenant du compartiment cultivé et celles provenant du compartiment sauvage. Un test de pathogénicité en conditions contrôlées (serres) a permis de définir le niveau d'agressivité de 10 souches fongiques d'origine française sur 19 cultivars de rosiers. Ce test a ensuite été appliqué pour définir le niveau de résistance/sensibilité de nouvelles variétés de rosier non commercialisées vis-à-vis de ces 10 souches fongiques. Une bonne corrélation entre le test en conditions contrôlées et les notes obtenues en plein champ permet d'envisager ce test pour une caractérisation rapide et fiable du niveau de résistance de nouvelles variétés de rosier.

Le rosier est une des plus importantes espèces ornementales de par le monde. Sa valeur esthétique est dépendante d’un niveau de sensibilité aux maladies notamment foliaires dont les plus fréquentes sont la maladie des taches noires et l’oïdium. Les obtenteurs, pépiniéristes et consommateurs s’orientent de plus en plus vers l’utilisation de variétés résistantes à ces maladies. Ainsi, afin de mieux comprendre ces maladies et de développer des outils de sélection, des tests d’infection en conditions contrôlées et des études de déterminisme génétique de la résistance/sensibilité sont nécessaires. Les essais en conditions contrôlées sur oïdium ont été difficiles à conduire du fait des difficultés à multiplier et à conserver le champignon (Podosphaera pannosa) alors que plusieurs essais sur la maladie des taches noires (Diplocarpon rosae) ont été mis en place. Des études génétiques ont été menées sur une population interspécifique permettant de mettre en évidence l’existence de trois QTLs potentiels pour la résistance à la maladie des taches noires et un QTL majeur pour la résistance à l’oïdium. L’obtention récente de la séquence du génome du rosier devrait permettre d’identifier l’existence de gènes de résistance au niveau de ces QTLs. Toutefois, des analyses plus approfondies devront être menées afin d’identifier le(s) gène et/ou la(es) séquence(s) responsable(s) des interactions mises en évidence dans ce projet., Roses are one of the most important ornamental crops in the world. Its esthetical value is closely linked with the resistance against the major foliar diseases, i.e. black spot disease and powdery mildew. As the cosmetic appearance of an ornamental plant is key to its marketability and consumer acceptance, a high degree of pest/disease resistance is required for the rose. To aim to understand the genetic control of disease resistance and to develop breeding tools, development of assays under controlled conditions and genetic determinism studies of the resistance/susceptibility are necessary. The assays on powdery mildew have been challenging to conduct due to the difficulty to preserve and produce the pathogen (Podosphaera pannosa) while the same tests were successfully developed for the black spot disease (Diplocarpon rosae). The interspecific population genetic studies made it possible to identify three QTLs governing the black spot resistance and one for powdery mildew resistance. The recent available rose genome could be an opportunity to identify genes under the QTLs. Nevertheless, some comprehensive studies have to be conducted to clearly detect the identified genes under these QTLs.